Guía visual para usuarios no expertos de la base de datos bibliográfica de la National Library of Medicine, Pubmed

1. Guía de uso avanzado vr. 2
Duración del tutorial: 29’
22/06/2013

2. ¿Qué es?
PUBMED permite el acceso gratuito a bases de dades
bibliográficas de ciencias de la salud como MEDLINE, de
la National Library of Medicine de los Estados Unidos.
MEDLINE está formado por unos 19 millones de
referencias de artículos de revistas publicadas desde
1946 hasta la actualidad, el 91% en inglés.
My NCBI permite personalizar el uso de PUBMED
grabando perfiles de interés y agregar alertas a nuestro
correo-e para seguir temas actuales.
La lista con los resultados de PubMed no incluye el texto
completo del artículo. Sin embargo la vista Abstract
muestra enlaces al texto completo del editor o el
distribuidor de las revistas.
El acceso al texto completo puede requerir una
subscripción. Algunas revistas se ofrecen en acceso libre.

3. Recomendamos usar el
navegador de Mozilla
Firefox para obtener un
pleno rendimiento de
todas las funciones de la
base de datos.

4. Búsqueda simple

5. Autocompletado
Cuando escribimos en el cuadro de
búsqueda el sistema mapea y nos
sugiere múltiples propuestas de
autoescritura. Elegimos la que más se
ajusta con el puntero.

6. Búsqueda simple de un tema / 1
Introducimos el término o la frase en el cuadro de búsqueda y
presionamos el botón SEARCH

7. Búsqueda simple de un tema / 2
PubMed traducirá de forma automática nuestro planteamiento en los
descriptores por los cuales se indizaría formalmente el artículo y en otras
etiquetas, en todos los sinónimos asociados (Entry term mappings), los
autores, los títulos de las revistas, etc.

8. Búsqueda simple de un tema / 3
El botón URL nos permite generar un
localizador de internet para poder guardarlo y
reproducir una búsqueda idéntica en el futuro:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%28%22silicosis%22%5BMeSH%20Terms%5D
%20OR%20%22silicosis%22%5BAll%20Fields%5D%29%20AND%20%28%22lung%20neo
plasms%22%5BMeSH%20Terms%5D%20OR%20%28%22lung%22%5BAll%20Fields%5D
%20AND%20%22neoplasms%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22lung%20neopl
asms%22%5BAll%20Fields%5D%20OR%20%28%22lung%22%5BAll%20Fields%5D%20A
ND%20%22cancer%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22lung%20cancer%22%5
BAll%20Fields%5D%29&cmd=DetailsSearch

9. Búsqueda simple de un tema / 4
Podemos usar operadores lógicos (AND, OR, NOT), en
mayúsculas siempre, para orientar la búsqueda:
percutaneous transluminal angioplasty AND (renal OR kidney)

10. Búsqueda con filtros / 1
PubMed prevé la búsqueda de
artículos usando filtros que son
muy habituales.

11. Búsqueda avanzada

12. Campos de Pubmed
Los registros de Pubmed están de forma
latente formados por unos campos
característicos que son directamente
interrogables.
Campos
característicos
de PubMed

13. Búsqueda avanzada
◘ Búsqueda por autores, revistas,
etc. (campos concretos)
◘ Búsqueda a través de los
descriptores MeSH (Medical
Subject Headings)
◘ Otras fuentes para búsquedas
muy orientadas.

14. Search builder / 1
En la ventana de Search builder
podemos obtener con los menús
desplegables todos los nombres
de los campos y consultar el
Index de cada campo.

15. Search builder / 2

16. Search builder / 3
El Index se abre por la palabra o frase más aproximada a
lo que hemos tecleado en el Search Builder. En 5210
registros aparece la secuencia “vall d’hebron”. Con el
cursor podemos marcarla y apretando el botón “Search”
conseguiríamos visualizar una lista con los resultados.

17. Search builder / 4
Mediante el Search Builder y el índice las
podemos ir incorporando varios
elementos a la ventana de búsqueda y
combinarlos. Después el botón Search
nos lleva a los resultados.

18. Medical Subject Headings (MeSH) / 1
Una búsqueda a través de los descriptores MeSH nos
permite capturar información de una manera más
consistente, más metódica y más rigurosa.
El thesaurus de MeSH contiene unos 26.000 términos
y se actualiza cada año.
Podemos consultar la base de datos de MeSH y los
detalles en torno a cada descriptor o bien usar el
índice directamente

19. Medical Subject Headings (MeSH) / 2
Un MeSH Major Topic es un MeSH Term que está
marcado con un asterisco (*) y que se considera un
tema principal del artículo. En el ejemplo vemos
que “Asthma” es un Major Topic y que además lleva
el MeSH subheading “Rehabilitation”

20. Medical Subject Headings (MeSH) / 3
También podemos hacer la
misma búsqueda desde
MeSH Database

21. Medical Subject Headings (MeSH) / 4

22. Visualización
de resultados

23. Visualización de resultados / 1
Artículos de libre
acceso (15)

24. Visualización de resultados / 2
Si nuestro centro de trabajo tiene acceso
a determinadas suscripciones o licencias
de uso, esa información también nos la
puede proporcionar PubMed

25. Visualización de resultados / 3
Vista “Abstract”
Texto completo
Captura de
registros

26. My NCBI

27. ¿Qué es My NCBI?
El instrumento My NCBI en
PubMed permite registrarse y
así retener la información
recogida por un usuario y sus
preferencias.

28. Registro en My NCBI / 1
Podemos abrir gratuitamente una cuenta en
My NCBI

29. Registro en My NCBI / 2
Existe la opción de usar nuestra cuenta de
Google si no queremos crear una cuenta
nueva.

30. Función Collections / 1
Cuando queremos guardar un conjunto de
registros bibliográficos en PubMed podemos
hacerlo con la función Clipboard, que solo nos deja
retener hasta 500 registros y solo se pierden si
estamos inactivos 8 horas seguidas.
La función Collections es por el contrario para
usuarios que se han registrado a My NCBI y
permite conservar indefinidamente una o varias
colecciones de registros, y además compartirlos,
marcar favoritos, etc. No hay límite de colecciones.

31. Función Collections / 2
Podemos compartir una colección de registros
configurándola como “pública” y proporcionando
la URL o enlace directo a colaboradores nuestros.
Podemos ver que se puede generar un archivo de
texto o de base de datos (csv); también podemos
depurar registros, añadir, etc.

32. Función Save search / 1
Tener una cuenta en My
NCBI también nos permite
grabar una búsqueda (su
estrategia) para poderla
ejecutar en el futuro.
La función Save Search genera un formulario
donde podemos inscribir nuestras preferencias
para recibir continuadamente los resultados
que se vayan incorporando a PubMed sobre
nuestro tema en un correo-e personal.

33. Función My Bibliography /1
Por último, otra función de My NCBI útil es My
Bibliography, diseñada específicamente para
guardar registros de un autor y editarlos en listas

34. Captura
de registros

35. Podemos capturar los resultados de la búsqueda,
sea a partir de la lista total, sea haciendo una
selección de la lista marcando los botones de
selección

36. Cuando enviamos registros a una
dirección de correu-e no podemos enviar
más de 200 registros por mensaje, pero se
pueden enviar por fracciones, de 200 en
200.

37. Importar registros
a

38. Zotero y Pubmed / 1
El icono de documento en la barra de las direcciones nos
indica que Zotero ha detectado los “metadatos” de un
artículo en Pubmed

39. Zotero y Pubmed / 2
Abrimos Zotero clicando su botón en la barra.
En la columna izquierda elegimos la carpeta donde grabaremos un registro.
Clicamos el icono que aparece en la barra de direcciones para incorporarlo.

40. Guía de uso completa de Zotero
http://variumhabere.blogspot.com.es/2013/03/zotero-guia-de-
uso-vr-2.html

41. Otras funciones

42. Enlace permanente a un artículo
Una forma de crear un enlace permanente a un
registro es con un URL que contenga la expresión
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ y el número
PMID. P.e.:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19010894

43. Función Images
En octubre de 2010
PubMed ha incorporado
imágenes en los
artículos que pertenecen
a las publicaciones de
Pubmed Central, de libre
acceso

44. Agregadores RSS
PubMed ofrece diversos canales RSS para obtener
fácilmente informació continuada sobre un tema, etc.

45. Elaborado por: Marta-R. Domínguez Senra
La propiedad intelectual de esta guía está amparada bajo una
licencia SafeCreative *1306285338050