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Dra. Adriana Cibele de Mesquita Dantas
Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia
      UERGS, Bento Gonçalves, RS
Taxonomia e evolução
•classificação de organismos é um aspecto fundamental de biologia
• noção consistente que um esquema de classificação deveria refletir a ‘ordem natural '
• inicialmente era considerado que Deus era o princípio de ordenação
• Darwin enfatizou que o princípio de ordenação deveria ser compartilhado descida de
    antepassados comuns

Species Plantarum - 1753

                           Carl Linnaeus introduziu
                            o binômio
                           (gênero-espécies)
                           sistema de classificação-

                           “ad majorem Dei gloriam”
                           (para a maior glória de
                           Deus)

                           Classificação de planta
                           baseado
                           somente em órgãos
                           sexuais
                                                                    Origin of Species - 1859
DARWIN
O Tamanho das células
Formas e Funções
Célula animal
Célula vegetal




                 Célula bacteriana
Genética Mendeliana

• Gregor Mendel (1822-1884), monge
  austríaco, é considerado o “pai da
  genética”.
• Desenvolveu seus trabalhos com
  plantas de ervilha (Pisun sativum)
  observando a transmissão
  hereditária de várias características.
• Em 1865 publicou o artigo
  "Experiments with Plant Hybrids"
  que foi ignorado.
• A partir de 1900 vários
  pesquisadores confirmaram seus
  resultados.
• Suas duas leis ainda hoje são base
  para os estudos genéticos.
Por que ervilhas?

• Fácil cultivo em canteiros.
• Várias características contrastantes
  e de fácil observação.
• Ciclo vital curto e grande número de
  descendentes (sementes).
• Predomina reprodução por
  autofecundação, portanto linhagens
  naturais são puras.
1a Lei de Mendel
“Pureza dos Gametas”



        “As     características  dos
        indivíduos são condicionadas
        por pares de fatores (genes),
        que se separam durante a
        formação dos gametas, indo
        apenas um fator do par para
        cada gameta”.
Versuche über
Pflanzen Hybriden

Anotações de Resultados
G. Mendel
As características herdadas dos
pais não se fundem, mas são
herdadas     como      unidades
discretas de informação que se
mantêm íntegras ao longo das
gerações
                  Gene
Unidade de informação que transmite
as características hereditárias de uma
geração para a seguinte
Conceito Gerais
• Gene: fragmento de DNA que pode ser
  transcrito na síntese de proteínas.

• Locus (Loco): local, no cromossomo, onde
  se encontra o gene.

• Alelos: genes que ocupam o mesmo locus
  em cromossomos homólogos.

• Homólogos: cromossomos que possuem
  genes para as mesmas características.
•Genótipo: conjunto de genes de um
indivíduo.


•Fenótipo: características observáveis de
uma espécie, que são determinadas por genes
e que podem ser alteradas pelo ambiente


•Gene Letal: com efeito mortal.
•Gene Dominante: aquele que sempre que está
presente se manifesta.


•Gene Recessivo: aquele que só se manifesta na
ausência do dominante.


•Homozigoto ou Puro: indivíduo que apresenta
alelos iguais para um ou mais caracteres.


•Heterozigoto ou Híbrido: indivíduo que apresenta
alelos diferentes para um ou mais caracteres.
• Os caracteres biológicos são determinados
  por GENES ou FATORES ( segundo Mendel )
  existentes nos CROMOSSOMOS e são
  transmitidos de uma geração para outra
  por meio dos GAMETAS durante a
  reprodução.

• Os genes que o indivíduo possui para uma
  determinada característica constituem o
  GENÓTIPO, e o referido CARÁTER em
  interação com o meio constitui o
  FENÓTIPO.
MODELO DO DNA:

• Watson e Crick propuseram, em
  1953, um modelo de molécula de
  DNA, que seria em DUPLA HÉLICE
  e em ESPIRAL, com duas cadeias
  de nucleotídeos ligados por
  PONTES DE HIDROGÊNIO.
Informações disponíveis, quais eram:
1- a molécula de DNA era grande, longa, fina e composta de nucleotídeos:
   adenina; guanina; timina e citosina;
2- Os estudos de difração de raios X, realizados por Maurice King e
   Rosalind Franklin sugeriam a forma helicoidal;
3- Linus Pauling (1950), descreveu a estrutura helicoidal com um
   filamento mantida por pontes de hidrogênio em proteínas e sugeriu
   que o mesmo pudesse ocorrer com o DNA;
4- Erwin Chargaff havia demonstrado que a proporção entre os
   nucleotídeos A e T era de 1:1, o mesmo acontecendo entre G e C.
Difração de Raios-X   Estrutura Molecular




                      34A
DNA ou ADN
    O Ácido
    Desoxirribonucléico é um
    polinucleotídeo formado
    por duas “fitas” ou hélices
    ligadas entre si por pontes
    de hidrogênio entre as bases
    nitrogenadas.
    O pareamento das bases
    sempre segue a mesma
    ordem: Adenina com Timina
    e Guanina com Citosina.
Ligações entre Nucleotídeos
                         Polímero longo:
                Base
                   1     1. A ligação entre a base
               Pentose   nitrogenada e a pentose é
                         feita covalentemente através
                         de uma ligação N-glicosídica
                         com a hidroxila ligada ao
                         carbono-1 da pentose.
       4       1
           2
       2                 •2. Os nucleotídeos são
                         unidos por ligações
                         fosfodiéster covalentes que
                         ligar o carbono 5´de um grupo
                         desoxirribose (pentose + base)
                         ao carbono 3´do próximo
• James Watson e
  Francis Crick (1953)
• um modelo de
  molécula de DNA, que
  seria em DUPLA
  HÉLICE e em ESPIRAL,
  com duas cadeias de
  nucleotídeos ligados
  por PONTES DE
  HIDROGÊNIO.
Portanto:
                               :
            1)    ÁCIDOS      NUCLEICOS        são
            compostos por nucleotídeos ligados
            entre si através de ligação covalente.


            2) NUCLEOTÍDEOS são as unidades
            fundamentais dos ácidos nucleicos.
            Cada nucleotídeo é constituído por
            um grupo fosfato, uma pentose e uma
            base.


                       Purinas: Adenina, Guanina
               BASES

DNA ≠ RNA               Pirimidinas: Citosina, Timina, Uracila
Bases Nitrogenadas



      Adenina                 Guanina

                  Purinas




Citosina          Timina                Uracil


                Pirimidinas
A Importância do DNA
-Transportar muita informação, de célula para célula e de geração
para geração;
-Capacidade de produzir cópias exatas de si mesmo, pois os
cromossomos são copiados em cada divisão celular;
-Capacidade de “replicar erros” de cópia, como se fossem o gene
original;
-Apresenta mecanismo de decodificação da informação
armazenada, traduzindo-as através da produção de
enzimas/proteínas;
-O DNA é chamado de “molécula da vida” pois contém o código
pra construção das proteínas em todos os seres vivos;
-Nos eucariontes, o DNA é encontrado no núcleo celular formando
os cromossomos e também nas mitocôndrias e nos cloroplastos;
-Nos procariontes encontra-se uma molécula de DNA circular
(cromossomo bacteriano) e outras moléculas circulares chamadas
plasmídeos;
DNA




RNA
O RNA ou ARN
O Ácido Ribonucléico é um polinucleotídeo que difere do DNA
em três aspectos básicos:

            DNA
                             • O açúcar é uma
                               Ribose;
            A-T
            T-A              • É formado, geralmente,
            G-C
            C-G                por uma fita simples
                               que pode enrolar-se;
                             • Não existe a base
                               pirimídica Timina e no
            RNA
                               seu lugar se encontra a
            A-U
                               base Uracila.
            U-A              • Os pareamentos
            G-C
            C-G                seguem a ordem A-U e
                               G-C).
Tipos de RNA
• RNAm  O RNA mensageiro é formado no núcleo e
  contém a “mensagem” - o código transcrito a partir do
  DNA - para a síntese das proteínas. Cada conjunto de três
  nucleotídeos no RNAm é chamado de CÓDON.
• RNAt  O RNA transportador está presente no
  citoplasma e é responsável pelo transporte dos
  aminoácidos até os ribossomos para a síntese protéica.
  No RNAt existe uma seqüência de nucleotídeos
  correspondente ao códon chamada de ANTI-CÓDON.
• RNAr  O RNA ribossômico ou ribossomal faz parte da
  estrutura dos ribossomos e participa do processo de
  tradução dos códons para construção das proteínas.
Wilkins, Perutz, Crick, Steinbeck, Watson, Kendrew
Proteínas
Estruturais
Transporte
Enzimas
Hormônios
Anticorpos
Receptores
Fatores de crescimento
Mediadores inflamatórios
Aminoácidos
Glicina       Cisteína       Glutamina
Alanina       Serina         Asparagina
Leucina       Tirosina       Fenilalanina
Isoleucina    Metionina      Triptofano
Valina        Treonina       Ac. Aspártico
Histidina     Lisina         Ac. Glutâmico
Prolina       Arginina


                  Proteína
aa   aa      aa    aa   aa    aa   aa   aa
Genes




Características físicas ou
bioquímicas observáveis
Genes




Estrutura das proteínas


Características físicas ou
bioquímicas observáveis
Genes


Seqüência de aminoácidos
     nas proteínas


 Estrutura das proteínas


Características físicas ou
bioquímicas observáveis
REPLICAÇÃO
             TRANSCRIÇÃO




             TRADUÇÃO
DOGMA CENTRAL

    genes      ambiente         FENÓTIPO




DNA armazena    RNA transfere    Proteína executa
a informação     a informação     a função
DUPLICAÇÃO EUCARIOTOS(= Replicação = DNA → DNA)

      5´ 3´




                              (Delta)



                                          3´
                                          5´




 3´
5´
                    (Alfa)
Forquilha de replicação
TRANSCRIÇÃO

 Promotor: Região que sinaliza o início da transcrição
  (Sequências específicas do DNA reconhecidas pelos fatores de
  transcrição (proteínas) e pela RNA polimerase)




                 “Sequência consenso”
ORGANIZAÇÃO GENÔMICA DE EUCARIONTES

                 cromossomo de 1,5 x 108 pb, contendo ~ 3.000 genes


               0,5% do cromossomo, contém ~ 15 genes



                          1 gene de 105 pb



Seqüência regulatória
                                                          Transcrição DNA



                  Transcrito de RNA primário                                 Seqüência de
                                                                                intron
                                                               Seqüência de exon
ORGANIZAÇÃO GENÔMICA DE PROCARIONTES E
                  EUCARIONTES

PROCARIONTES     Archaebacteria
                 Eubacteria
                 Cianobactérias

EUCARIONTES    Protistas
               Fungos
               Vegetais
               Animais

                    VÍRUS         DNA Vírus
                                  RNA Vírus
ORGANIZAÇÃO GENÔMICA DE EUCARIONTES


   -Envoltório Nuclear (Carioteca)

   -Cromatina (Eucromatina, heterocromatina)

   - Vários cromossomos diplóides

   -DNA linear, dupla fita

   -Complexado com proteínas (Histonas e não histonas)

   - Grande parte do DNA não é codificado (íntrons e éxons)


                                     Funções:
                                     - condensação,
                                     -pode influenciar   na   atividade
                                     celular
ORGANIZAÇÃO GENÔMICA DE PROCARIONTES

    Escherichia coli -   1 cromossomo (DNA circular, dupla fita)

    Elementos genéticos móveis (plasmídeo, bacteriófagos, transposons)


-    Cromossomo e Plasmídeo            possuem
     replicação independente

-    Organização genômica mais         simples,
     compactação com proteínas

-     Quase todo o DNA é codificante

-     Os genes são organizados em “Operons”

-     Os genes de um operon são transcritos
     em um único RNAm (policistrônico)
Síntese de DNA em Procariontes
Origem da replicação



Forquilhas
    de
replicação
                             O ponto de origem da
                             replicação é denominado oriC.
 Fitas novas


Fitas velhas

                             A replicação é bidirecional:
                             as duas fitas se separam na
                             origem, sendo, a partir daí,
                             copiadas simultaneamente em
                             direções opostas.
TRANSCRIÇÃO : EUCARIOTO X PROCARIOTO

EUCARIOTOS              PROCARIOTOS
DNA
CTC ATT GTG CTT GAA TTT TTG GTG


               mRNA
GAG UAA CAC GAA CUU AAA AAC CAC


           Proteína
aa   aa   aa   aa   aa   aa   aa   aa
O que são os cromossomos e o que eles contém?




 Contem o DNA que é constituído por nucleotídeos
C
                                  T
                                  G
                                  G
                                  A
                                  C
                                  T

CCTGATGGATCGCGTACGTTGTACGCACAGTGTCGAAAAAG
CATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCACGGCGTCGATTTT
GACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAGTGAGTGACACACAGTG
CAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
CCTGATGGATCGCGTACGCCATATTTGTACGCACAGTG
TCGAAAAAGCATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCAC
GGCGTCGATTTTATAATGCACGTGTCAGTGCGATGAGT
GAGTGACACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAA
GTATGTGTGGATGGATCGCGGCAGTTGTACGCACAGTG
TCGAACAAGCATACGGGGACTGCACCCCGATGTAGCAC
GGCGTCGATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCT
GAGTGAAGGATCAGTGCAGCGTGGAGCGCGCATGAAAA
CACACATTGTATCGACAGTTGTACGCACAGTGTCGAGG
GCGACTACGGGGACTGCACCCCGAAATAGCACGGCGTC
GCATGATACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCTGAGTGA
AGGATCAGTGCAGCGGGCAGATGTAATATATATGATTT
GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAGTGAGTGA
CACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
Homem
CCTGATGGATCGCGTACGTTGTACGCACAGTGTCGAAA
AAGCATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCACGGCGTC
GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAGTGAGTGA
CACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
              Bactéria
GTGGATGGATCGCGGCAGTTGTACGCACAGTGTCGAAC
AAGCATACGGGGACTGCACCCCGATGTAGCACGGCGTC
GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCTGAGTGA
AGGATCAGTGCAGCGTGGAGCGCGCATGAAAAATAGGA
               Vírus
CACACATTGTATCGACAGTTGTACGCACAGTGTCGAGG
GCGACTACGGGGACTGCACCCCGAAATAGCACGGCGTC
GCATGATACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCTGAGTGA
AGGATCAGTGCAGCGGGCAGATGTAATATATATGATTT
TAMANHO DO GENOMA

Homem           3.200.000.000 bases
Rato            3.000.000.000 bases
Drosophila        160.000.000 bases
Arabidopsis       135.000.000 bases
S. cerevisae       13.000.000 bases
X. fastidiosa       2.679.572 bases
H. influenzae       1.830.000 bases
M. pneumoniae         810.000 bases
HTLV-II                 8.952 bases
300 kb




                             0,5 kb

 CCTCGACTTCAGGGAT      GGGATCATTTATTCAGGGAT

AACCCTCGACTTCAGGGAT      CATTTATTCAGGGAT
CCTCGACTTCAGGGAT

GGGATCATTTATTCAGGGAT
CCTCGACTTCAGGGAT
           GGGATCATTTATTCAGGGAT
CCTCGACTTCAGGGAT
           GGGATCATTTATTCAGGGAT
AACCCTCGACTTCAGGGAT
   CCTCGACTTCAGGGAT
              GGGATCATTTATTCAGGGAT
AACCCTCGACTTCAGGGAT
   CCTCGACTTCAGGGAT
              GGGATCATTTATTCAGGGAT
                      CATTTATTCAGGGAT


 AACCCTCGACTTCAGGGATCATTTATTCAGGGAT
CCTGATGGATCGCGTACGCCATATTTGTACGCACAGTG
TCGAAAAAGCATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCAC
GGCGTCGATTTTATAATGCACGTGTCAGTGCGATGAGT
GAGTGACACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAA
GTATGTGTGGATGGATCGCGGCAGTTGTACGCACAGTG
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GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAGTGAGTGA
CACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
mRNA


Proteína
Exons   Introns
CCTGATGGATCGCGTACGCCATATTTGTACGCACAGTG
TCGAAAAAGCATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCAC
GGCGTCGATTTTATAATGCACGTGTCAGTGCGATGAGT
GAGTGACACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAA
GTATGTGTGGATGGATCGCGGCAGTTGTACGCACAGTG
TCGAACAAGCATACGGGGACTGCACCCCGATGTAGCAC
GGCGTCGATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCT
GAGTGAAGGATCAGTGCAGCGTGGAGCGCGCATGAAAA
CACACATTGTATCGACAGTTGTACGCACAGTGTCGAGG
GCGACTACGGGGACTGCACCCCGAAATAGCACGGCGTC
GCATGATACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCTGAGTGA
AGGATCAGTGCAGCGGGCAGATGTAATATATATGATTT
GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAGTGAGTGA
CACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
CCTGATGGATCGCGTACGCCATATTTGTACGCACAGTG
TCGAAAAAGCATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCAC
GGCGTCGATTTTATAATGCACGTGTCAGTGCGATGAGT
GAGTGACACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAA
GTATGTGTGGATGGATCGCGGCAGTTGTACGCACAGTG
TCGAACAAGCATACGGGGACTGCACCCCGATGTAGCAC
GGCGTCGATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCT
GAGTGAAGGATCAGTGCAGCGTGGAGCGCGCATGAAAA
CACACATTGTATCGACAGTTGTACGCACAGTGTCGAGG
GCGACTACGGGGACTGCACCCCGAAATAGCACGGCGTC
GCATGATACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCTGAGTGA
AGGATCAGTGCAGCGGGCAGATGTAATATATATGATTT
GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAGTGAGTGA
CACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
CCTGATGGATCGCGTACGCCATATTTGTACGCACAGTG
TCGAAAAAGCATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCAC
GGCGTCGATTTTATAATGCACGTGTCAGTGCGATGAGT
GAGTGACACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAA
GTATGTGTGGATGGATCGCGGCAGTTGTACGCACAGTG
TCGAACAAGCATACGGGGACTGCACCCCGATGTAGCAC
GGCGTCGATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCT
GAGTGAAGGATCAGTGCAGCGTGGAGCGCGCATGAAAA
CACACATTGTATCGACAGTTGTACGCACAGTGTCGAGG
GCGACTACGGGGACTGCACCCCGAAATAGCACGGCGTC
GCATGATACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCTGAGTGA
AGGATCAGTGCAGCGGGCAGATGTAATATATATGATTT
GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAGTGAGTGA
CACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
CCTGATGGATCGCGTACGCCATATTTGTACGCACAGTG
TCGAAAAAGCATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCAC
GGCGTCGATTTTATAATGCACGTGTCAGTGCGATGAGT
GAGTGACACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAA
GTATGTGTGGATGGATCGCGGCAGTTGTACGCACAGTG
TCGAACAAGCATACGGGGACTGCACCCCGATGTAGCAC
GGCGTCGATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCT
GAGTGAAGGATCAGTGCAGCGTGGAGCGCGCATGAAAA
CACACATTGTATCGACAGTTGTACGCACAGTGTCGAGG
GCGACTACGGGGACTGCACCCCGAAATAGCACGGCGTC
GCATGATACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCTGAGTGA
AGGATCAGTGCAGCGGGCAGATGTAATATATATGATTT
GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAGTGAGTGA
CACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
CCTGATGGATCGCGTACGCCATATTTGTACGCACAGTG
TCGAAAAAGCATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCAC
GGCGTCGATTTTATAATGCACGTGTCAGTGCGATGAGT
GAGTGACACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAA
GTATGTGTGGATGGATCGCGGCAGTTGTACGCACAGTG
TCGAACAAGCATACGGGGACTGCACCCCGATGTAGCAC
GGCGTCGATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCT
GAGTGAAGGATCAGTAGGTCGTGGAGCGCGCATGAAAA
CACACATTGTATCGACAGTTGTACGCACAGTGTCGAGG
GCGACTACGGGGACTGCACCCCGAAATAGCACGGCGTC
GCATGATACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCTGAGTGA
AGGATCAGTGCAGCGGGCAGATGTAATATATATGATTT
GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAAGGAGTGA
CACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
CCTGATGGATCGCGTACGCCATATTTGTACGCACAGTG
TCGAAAAAGCATACGGGGACTGCACGTACACGTAGCAC
GGCGTCGATTTTATAATGCACGTGTCAGTGCGATGAGT
GAGTGACACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAA
GTATGTGTGGATGGATCGCGGCAGTTGTACGCACAGTG
TCGAACAAGCATACGGGGACTGCACCCCGATGTAGCAC
GGCGTCGATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCT
GAGTGAAGGATCAGTAGGTCGTGGAGCGCGCATGAAAA
CACACATTGTATCGACAGTTGTACGCACAGTGTCGAGG
GCGACTACGGGGACTGCACCCCGAAATAGCACGGCGTC
GCATGATACGTGCACGTGTCAGTGCGAAATCTGAGTGA
AGGATCAGTGCAGCGGGCAGATGTAATATATATGATTT
GATTTTGACGTGCACGTGTCAGTGCGATGAAGGAGTGA
CACACAGTGCAGCGTGTGTACCCATGCGCGAAGTATGT
Síntese Protéica
                 A Tradução
         • O RNAm transcrito no núcleo
           chega ao citoplasma e se liga
           a um ou mais ribossomos.
         • O ribossomo “lê” o primeiro
           códon e um RNAt com o
           anticódon correspondente
           transporta um aminoácido e
           se liga ao códon.
         • O ribossomo se desloca, no
           sentido 5’3’ e lê o próximo
           códon.
         • Os aminoácidos são unidos
           por ligações peptídicas.
         • Ao final da tradução o
           polipeptídeo se desliga e se
           constituí na proteína.
Transcrição

   Gene ativo                          RNA polimerase

     5’               T G CA C         3’
                    A      3’
      ATGGC                        A
                    AU
      TACCG                GC A    T
                    TA
     3’                   C G T      5’
     5’
                C



          AU GG          DNA - Fita molde


Molécula de RNA nascente complementar a fita molde
•Fita única
•No lugar da Timina haverá uma Uracila
Tradução
           Cada códon é traduzido num AA específico
                                                         AA livre
           Ribossomo                                   His

                                                Gly
                                         Phe
                                  Glu
Proteína                  Asp
           Met
           Ala     Cys
                                        tRNA
    5’                                                        3’
     AUGGCAUGCGACGAAUUCGGACACAUA


Molécula de mRNA
                                                      codon

     Direção do avanço do ribossomo
Gly   His
                             Phe
                       Glu
                 Asp
     Met
     Ala   Cys

5’                                             3’
 AUGGCAUGCGACGAAUUCGGACACAUA
Ile
            Met               His
            Ala         Gly
            Cys
            Asp
            Glu
                  Phe

5’                                        3’
 AUGGCAUGCGACGAAUUCGGACACAUA
Met
                      Ala
                      Cys
                      Asp
                      Glu          Asn
                      Phe
                      Gly
                      His
                       Ile
                      Lys
                      Leu    Met

5’                                 3’
 GACGAAUUCGGACACAUAAAAUUAAUG
Ala Cys Asp Glu Phe
                 Met               Gly
                                   His
                                    Ile
                                   Lys
                                Leu
                               Met
                             Asn
                           Pro
                         Gln


5’                                   STOP   3’
     AUAAAAUUAAUGAACCCACAAUAATAC
Ala Cys Asp Glu Phe
                    Met                Gly
                                     His
                                    Ile
                        Gln       Lys
                         Pro    Leu
                         Asn Met




5’                                           3’
     AUAAAAUUAAUGAACCCACAAUAATAC




        RNAm será degradado
Ala Cys Asp Glu Phe
   Met                Gly
                    His
                   Ile
       Gln       Lys
        Pro    Leu
        Asn Met




PROTEÍNA NORMAL
Exemplo hipotético de uma mutação pontual
 Gene Normal = Proteína Normal
                   5’               T G CA C         3’
                           ATGGC A                  A
                           TACCG T                  T
                                   A C G T
                        3’                           5’                   3’
 5’
           AUGGCAUGCGACGAAUUCGGACACAUA
                                                                      mRNA
              Alanina



Gene Mutado =Proteína Anormal - G               T
                         5’          T G CA C         3’
                                   A
                          ATGGA                     A
                          TACCT   TA                T
                         3’             C G T        5’
      5’                                                                  3’
            AUGGAAUGCGACGAAUUCGGACACAUA
                                                                      mRNA
             Acido Glutâmico
Ala Cys Asp Glu Phe
   Met                Gly
                    His
                   Ile
       Gln       Lys
        Pro    Leu
        Asn Met

                                                       e
                                             p Glu   Ph G ly
                                       As
                                        s
PROTEÍNA NORMAL                       Cy                  His
                                Glu
                                                           I le
                                      t                       Lys
                                 Me
                                                       Leu
                                      G ln
                                                      t
                                               ro
                                              P sn Me
                                                A


                            PROTEÍNA DEFEITUOSA
Genoma Vegetal
Os vegetais são constituídos de três genomas:
                                      genomas

- O genoma do cloroplasto tem uma estrutura muito conservada 120-217kb
  que inclui 110-113 gene;

- O genoma da mitocondria é maior de 300-600kb e contêm perto de 60 genes,
   é um genoma muito dinâmico já que ganha e perde facilmente seqüências
   nucleares e do cloroplasto.


                     5 1

                                         genoma nuclear

                                         genoma cloroplasto

                                         genoma mitocondrial

                           90
Genoma nuclear
Paradoxo do valor C (DNA haplóide) = pares de base


- Não existe correlação entre o tamanho do nuDNA e o número
  de genes;


- Angiospermas – 80% do nuDNA é DNA repetitivo;


- Correlação positiva entre a quantidade de seqüências de DNA
   repetitiva em um genoma e sua quantidade de DNA.
O tamanho do DNA nuclear
Plantas superiores - 1,1 x 106 pb a 1,1 x 1011pb
Angiospermas – 3 x 108 a 1 x 1011pb
Ocorre um incremento na escala evolutiva
- RNA associado a cromatina (RNA nascentes, presos a fita
   molde) representa 3% de sua composição

O genoma nuclear de Arabidopsis thaliana tem 135Mb = 25.500 gens.
Do arroz (Oryza sativa) tem se seqüenciado duas variedades e seu genoma
é quase 4 vezes maior que o de A. thaliana e compreendem de 32.000 a
55.615 genes.
Para o milho (Zea mays), embora não seqüenciado, se conhece muita
informação estima-se que 60 a 80% de seu genoma nuclear esta constituído
por elementos móveis
Organização do genoma nuclear
ORGANIZAÇÃO E EVOLUÇÃO DAS SEQÜÊNCIAS
                  REPETITIVAS
Três graus de repetição:


Cópia única – cada seqüência de nucleotídeo só se encontra uma vez por
genoma haplóide, pertence a > dos genes que codificam proteínas. É abundante
cerca de 58% no genoma dos mamíferos e 33% em células vegetais
Mediamente repetitivos – apresenta seqüências nucleotídecas que se repetem
um moderado número de vezes. É menos abundante que os de cópia única e a
sua proporção aumenta na escala evolutiva – são genes que codificam o RNA
ribossômico e histonas – encontrado mais de 100 cópias por genoma haplóide
de genes do RNA ribossômico (rRNA)
Altamente repetitivos – seqüências nucleotídecas altamente redundantes,
acima de 10.000 cópias de cada gene, seqüências curtas e restritas a regiões
específicas do genoma constituem o chamada DNA satélite
DNA SATÉLITE
(PROPORÇÃO SEPARÁVEL INCOMUM DE NUCLEOTÍDEOS)


O DNA satélite foi descoberto em 1960.
- banda principal contendo genes;
-bandas secundárias, bandas satélites. seqüências de DNA repetidas;
- Representa a maioria das famílias de seqüências altamente repetitivas nos
genomas eucarióticos;
-Composta por fragmentos DNA repetitivos cerca de 150 a 500 pb
-Encontrada próximo ao telômero e centrômeros vegetais



      Função:
      Recombinação – rearranjos no genoma (expandir-se ou contrair-se)
      Sem função – sujeitas a seleção neutra
DNA ribossomal (rDNA)
- Outra porção do DNA repetitivo encontrado no
  encontrado no nuDNA;
- Constituida de três genes: 18S, 5,8S e 26 S;
- Rearranjados em tandem e as unidades ribossomais
  (rDNA) também é repetido em tandem;
- Estas unidades estão associadas às regiões organizadoras
  do nucléolo (NORs)

NORs: porções de fibras cromatínicas onde estão os genes
                que codificam os rRNAs


     O número de NORs varia de espécie para espécie
Tamanho da unidade ribossomal
- Com espaços intergênicos, varia de 7,8 kb a 18,5 kb, com numero de cópias
   que pode variar de 600 a 8500/ genoma haplóide




- A unidade ribossomal é constituída pelos genes 18S, 5,8S e 28S e dos
  espaçadores transcritos internos (ITS) que intercalam os genes;
- A sigla IGS indica o espaço intergênico, separa as unidades ribossomais;

- RNA ribossomal 5S (5S rDNA); 140 a 900pb, cada unidade de repetição
  pode variar de 1 mil a 50 mil cópias por genoma haplóide;

- Em plantas as seqüências ITS variam em comprimento de ≈ 500-700pb em
  angiospermas e 1500-3700pb em algumas gimnospermas
Genoma Extranuclear
- Os cromossomos das mitocôndrias e dos cloroplastos apresentam padrão de
    organização e herança bem diferente dos cromossomos nucleares;

- Os genes extranucleares também chamados genes citoplasmáticos;

-     A maioria das proteínas das mitocôndrias e dos
      cloroplastos são codificadas pelo DNA nuclear e
      importados do citosol para s organelas;

-     O tráfego das proteínas do citosol para as
      organelas é unidirecional;

-     O DNA das organelas celulares são circulares;

-     São relativamente pequenas e simples;

-     Não ocorre recombinação (somente mutação);

-     Herança não-mendedliana (citoplasmática,
      herança da mãe) Marcador de linhagem materna.
O genoma cloroplasto
           •   Sequencia no genoma varia
               de 70kb - 201kb
           •   100-250 genes:
               – Gene expressos
               – Fotossíntese – 20 genes
               – Metabolismo


               Sequenciamento completo:
               Tabaco - 155,844 pb;
               Arroz -134,525 pb
O Genoma do cloroplasto codifica várias proteínas
  e RNAs
• Cloroplastos apresentam DNA com tamanho variado:
  120-190 kb
• codifica todos os rRNAs e tRNAs necessários para a síntese
  protéica, e aproximadamente 50 proteínas
• os genes da organela podem ser transcritos e traduzidos
  pelo aparato da mesma
GENOMA MITOCONDRIAL
• mitocondrias mostram tamanhos variados de genoma
  – o número de genes codificadores de proteínas é
     pequeno
  – a maior parte é codificadora de componentes das
     subunidades dos complexos da respiração I-IV
  – genes codificadores de RNA
• Genoma mitocondrial apresenta introns, exceto nos
  mamíferos
• Tamanho   do mtDNA

  •Humanos e outrros vertebrados       ~16 kb
     (todos genes mtDNA codificam produtos)

  •Leveduras                            ~80 kb
  •Plantas                              ~100 kb to 2
  Mb
      (muitos genes mtDNA não codificam produtos)


                             Aplicação:

                             • Análise maternal
                             • Filogenia Sistemática
                             •Genética de populações
                             •Teste forensi (maternal ID)
Marchantia polymorpha – 121Kb
136 genes: 4 rRNA, 29tRNA
90 genes codificadores de proteínas - destes 20 estão envolvidas no
transporte de elétrons durante a fotossíntese
Genômica?
• Genomica é estudo de todos os genes em um organismo……..

• Proteomics é estudo de todas as proteínas…..

• Metabolomics isé o estudo de todas as vias metabólicas…
Plantas Modelos
      • Arabidiopsis thaliana
         --modelo florescimento e
         dicotiledônea

      • Oryza sativa (rice)
         --modelo monocotiledônea


      • Medicago truncatula (barrel medic)
         --modelo leguminosas


      • Lycopersicon esculentum (tomato)
          --modelo de frutificação


Também, milho, tabaco, trigo, etc.…
Arabidopsis thaliana
Modelo de genoma em plantas

Rapido crescimento

Brassicaceae

Genome: 125 Mb ( muito pequeno )

Cromossomos: 5

Genes: 25,498
Website: http://www.arabidopsis.org
Oryza sativa



Genome: 430 Mb (1/8 do genoma humano)

Um dos menores genomas de gramíneas

Cromossomos: 12

Genes: ~ 50,000 (mais do que genoma
humano)

http://www.usricegenome.org
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