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Informática Aplicada a Radiologia



Apostila:
            Imagem Digital – parte I

            Prof. Rubens Freire Rosa
Imagem na forma digital
• A representação de Imagens na forma digital
  nos permite capturar, armazenar e processar
  imagens na forma eletrônica assim como
  processamos um texto em um computador,por
  exemplo


• Enquanto uma imagem gravada em um filme
  pode ser representada eletrônicamente por uma
  onda analógica contínua, a imagem digital é
  representada por valores digitais obtidos a partir
  de amostras da forma analógica
Analógico x Digital
• Os valores Analógicos são
  contínuos

• Os valores Digitais são
  discretos e representados
  por pulsos traduzidos por
  uma seqüência de números
  na forma binária
A imagem no computador
• Imagens podem ser armazenadas em duas
  formas básicas
  – Vetorial
     • A forma vetorial é normalmente utilizada por programas de
       desenho e os objetos que formam a imagem são
       representados na forma de lista indicando as figura, suas
       dimensões e posicionamento
  – Bit-map
     • São as imagens produzidas por Scanners e máquinas
       digitais
     • Os pontos são amostrados e representados bit a bit
     • Estaremos tratando deste tipo de imagem daqui em diante
A imagem no computador
A imagem no computador
• Enquanto uma imagem na forma vetorial
  pode ser armazenada através de alguns
  Kilobytes, a imagem bit-mapped pode
  requerer muito mais espaço para ser
  armazenada
• Por outro lado a imagem vetorial é apenas
  útil para a representação de imagens
  criadas no computador na forma de
  figuras como linhas, arcos, círculos, etc.
Formação da Imagem Digital: Pixel
• Uma imagem digital pode ser
  representada por um conjunto de
  elementos chamados de
  – “Pixel” – Elemento de Tela ou
    Picture Element

• Cada Pixel é armazenado e
  juntos formam um mapa de bits
  “bit-map”:
  – Mapeamento de bit serve para
    reproduzir a imagem digitalmente
Formação da Imagem Digital: Pixel
• Uma imagem monocromática é uma
  função de intensidade de luz
  bidimensional f(x,y)
• x,y denotam coordenadas espaciais
• O valor de f no ponto x,y é proporcional ao
  brilho ou nível de cinza da imagem
• Veja a seguir uma fotografia e os eixos x,y
  ao longo da mesma
Imagem no espaço
Amostra e Quantização
• Para gerar uma imagem digital, f(x,y) deve
  ser digitalizada ao longo de x,y
• Juntos, os pontos amostrados, geram uma
  matriz de amostragem de tamanho NxM
• Cada ponto na Matriz NxM é representado
  por seu nível de cinza que denotaremos
  pela letra L
Representação de uma imagem
    Monocromática Digital
Representação de uma imagem
      Monocromática Digital
• Cada elemento (quadrado) que aparece na
  imagem acima é um Pixel
• No eixo x podemos denotar cada ponto p(x,y)
  variando de x= 0 a M-1 (Matriz)
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  variando de y= 0 a N-1 (Matriz)
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  eixo x e N pixels no eixo y
• A cada ponto p(x,y) da matriz temos associado
  um nível de cinza
Representação de uma imagem
    Monocromática Digital
Uma boa imagem Digital
• Considerando que o processo para
  geração de imagem digital está
  diretamente associado a Amostras
  (Número de Pixels) e Quantização (Nível
  de Cinza), pergunta-se:
  – Quantas amostras são necessárias para se
    gerar uma boa imagem digital?
  – Quantos níveis cinza são necessários para
    representar cada Pixel?
Resolução da Imagem Digital
• Note que as perguntas se referem a 2 aspectos
  diferentes:
  1- Quantidade de Pixels ao longo de cada eixo x,y :
     Este parâmetro está associado ao espaçamento
    Físico entre amostras. Logicamente quanto mais
    pontos conseguirmos amostrar para formar nossa
    imagem digital, melhor será a formação da imagem

  Chamaremos esta grandeza de Resolução Espacial
Resolução da Imagem Digital
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   Está associado ao brilho da imagem em cada Pixel.

  Para representar mais níveis de cinza, logicamente
  iremos necessitar de mais bits para cada ponto. Veja
  alguns exemplos:
      2 níveis = 1 bit (imagem Preto e Branco)
      256 níveis = 8 bits
      512 níveis = 9 bits
     1024 níveis = 10 bits

   Chamaremos esta grandeza de Profundidade da Imagem
Resolução da Imagem Digital
Resolução da Imagem Digital
Resolução Espacial
• Vejamos a diferença na definição de uma
  imagem digital quando aplicamos diferentes
  resoluções espaciais:
  – Nas 3 fotos a seguir a Profundidade da Imagem
    permanece a mesma com 256 níveis de cinza
  – Foto (a): apresenta uma R.E. de 256x 256 pixels
  – Foto (b): R.E. de 128x128
  – Foto (c): R.E. de 64x64
  – Devido a perda de resolução espacial nota-se uma
    degradação que aparece na forma quadrículada,
    especialmente quando baixamos para 64x64 pixels.
Resolução Espacial
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• Aqui a Resolução Espacial foi mantida em
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  profundidade da imagem da seguinte forma:
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  – Pergunta-se: Quando bits são necessários para cada
    representação de profundidade?
• Note nas imagens que os detalhes da imagem
  original aparecem como formas homogeneas
  nas imagens de menor profundidade
Profundidade da Imagem
Uma boa imagem Digital
• Agora podemos responder a pergunta inicial:
     • Quantas amostras são necessárias para se gerar uma boa
       imagem digital?
     • Quantos níveis cinza são necessários para representar cada
       Pixel?
• Obviamente, quanto mais amostras e mais
  níveis de cinza aplicarmos ao nosso esquema
  de digitalização, melhor será a qualidade de
  nossa imagem representada!
• Pergunta:
  – No que essa quantidade informação vai ajudar?
  – Até que ponto tanto detalhe pode ser útil?
  – Em que momento deve-se parar?
Resolução e Tamanho da Imagem
• Primeiramente:
  – Mais Detalhes = Mais Bytes
  – Mais Bytes = Mais memória, mais disco

  – Se você deseja transmitir a imagem, significa mais
    consumo de banda do seu meio de transmissão, ou
    mais tempo para enviar todos os bits
• Claramente precisamos definir algum limite
Resolução e Tamanho da Imagem
Resolução e Transmissão da
         Imagem Digital
• Se eu tenho uma conexão que me permite
  transmitir 56000 bps, isto significa que
  precisamos de quanto tempo para
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    • Capacidade em Bytes por Segundo da minha
      conexão 56000/8= 7000 bytes por segundo

    • Então precisamos de 60000 bytes / 7000 bytes/s
       – ~8.6 segundos de transmissão
Série de Exercícios
•   2ª Série de Exercícios – Informática Aplicada a Radiologia

•   1-Defina Resolução Espacial e Profundidade de Imagem em detalhes com suas palavras.

•   2-Diferencie Imagem Vetorial e Bitmap.

•   3-Quantos bits são necessários para representar 200,1000,2000 e 3000 níveis na profundidade
    de uma imagem monocromática.

•   4-Um Scanner varre uma imagem de papel no formato A4 (21 cm x 29,7 cm) com uma resolução
    espacial de 100 pixels/cm2.
    Pede-se:
     – O desenho de 1 cm2 da imagem
     – Quantos pixels tem a imagem no total quando digitalizada por este Scanner?
     – Qual será o tamanho da matriz NxM
     – Se a Profundidade de imagem é de 256 níveis, quantos bits terá cada imagem após ser
        digitalizada?
     – Se diminuirmos para 4 níveis, qual será o novo tamanho da imagem?
     – Se temos uma conexão de 1 Mbps, quanto tempo será necessário para a transmissão desta
        imagem em sua forma digital sem aplicar qualquer esquema de compressão?
     – Diminua a taxa para 1000 bps e refaça os cálculos do item f
Imagem Multibanda
• Em uma imagem digital monocromática, o
  valor do pixel é um escalar entre 0 e L .
  Imagens multibandas podem ser vistas
  como imagens nas quais cada pixel tem
  associado um valor vetorial – vários
  valores associados ao mesmo pixel
  – P(x,y) = (l1,l2,...,ln) 0<=li<=Li-1, i=1,2,...,n
        – N=número de bandas
Imagem Multibanda
• Uma outra forma de
  representar uma
  imagem multibanda é
  como uma sequência
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Imagem Colorida
• Uma imagem colorida é uma imagem
  multibanda, onde a cor em cada ponto (x,y) é
  definida através de três grandezas: luminância,
  matiz e saturação.
• A luminância está associada com o brilho da luz

• A matiz com o comprimento de onda dominante
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Imagem Colorida
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  humano pode ser representada como uma
  combinação de três cores primárias:
  vermelho (R), verde (G) e azul (B). Assim,
  uma representação comum para uma
  imagem colorida utiliza três bandas R, G,
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Resolução da imagem colorida
Quantas Cores podemos
     representar?
Exercícios-p2
•   Um Scanner varre uma imagem colorida em papel no formato
    A4 (21 cm x 29,7 cm) com uma resolução espacial de 225 pixels/cm2.
    Pede-se:
     – O desenho de 1 cm2 da imagem
     – Quantos pixels tem a imagem no total quando digitalizada por este
        Scanner?
     – Qual será o tamanho da matriz NxM e quantas matrizes teremos
     – Se a cada cor primária é representada por 16 níveis, quantos bits terá
        cada imagem após ser digitalizada? Quantas cores poderão ser
        representadas?
     – Se aumentarmos para 128 níveis, qual será o novo tamanho da
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     – Se temos uma conexão de 2 Mbps, quanto tempo será necessário para
        a transmissão desta imagem em sua forma digital sem aplicar qualquer
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     – Diminua a taxa para 2000 bps e refaça os cálculos do item anterior
Imagens Tri-dimensionais
•   Até o momento, discutimos os casos de amostragem e quantização
    no espaço 2D. Portanto, o que comumente chamamos imagem é
    uma imagem digital bidimensional. Se a amostragem e a
    quantização envolvessem apenas uma direção do espaço teríamos
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•   Iimagens digitais tridimensionais são uma extensão dos conceitos
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•   Isto é o mesmo que dizer que a amostragem e a quantização
    podem ocorrer em x,y,z ou x,y, t , onde z ou t representam o
    espaço e o tempo. Portanto, uma imagem digital 3D será
    representada como uma seqüência de imagens monocromáticas ou
    multibandas ao longo do eixo espacial ou do eixo temporal .
Imagens Tomográficos
• Equipamentos tomográficos, (e.g. tomógrafos de raios-
  X, ressonância magnética) geram imagens
  monocromáticas de cortes (ou fatias) normalmente
  paralelos e uniformemente espaçados em uma dada
  região 3D
• Em medicina, por exemplo, estes cortes são
  normalmente longitudinais cobrindo uma dada região do
  corpo do paciente que contém um dado órgão/fenômeno
  em estudo.
• Considerando as dimensões pxp de um pixel nestas
  imagens e o espaçamento d entre os cortes, a extensão
  do pixel em 3D forma um pequeno paralelepípedo de
  dimensões que é chamado voxel
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Imagens Tomográficas
• O centro dos voxels coincide com o centro
  dos pixels. Os voxels representam pontos
  de amostragem de algum fenômeno físico
  e são usados para reconstruir no
  computador a forma ou função de
  estruturas tridimensionais. Neste caso, a
  imagem pode ser representada como uma
  matriz 3D como ilustrado na Figura a
  seguir.
Voxel
Imagem Tomográfica
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  normalmente 256x256 ou 512x512
  pixels e profundidade de 1 ou 2 bytes por
  pixel. A Figura a seguir, por exemplo,
  mostra três fatias de ressonância
  magnética de resolução espacial
  256x256 pixels e profundidade 2 bytes por
  pixel
Imagem Tomográfica
Imagem Tomográfica
• Como foi dito anteriormente, os voxels são
  usados para reconstruir a forma ou função
  de estruturas 3D. A Figura a seguir ilustra
  uma reconstrução de um crânio a partir de
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Imagens 4D
• A título de curiosidade, tomógrafos
  também geram imagens digitais 4D,
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Informática Aplicada Radiologia

  • 1. Informática Aplicada a Radiologia Apostila: Imagem Digital – parte I Prof. Rubens Freire Rosa
  • 2. Imagem na forma digital • A representação de Imagens na forma digital nos permite capturar, armazenar e processar imagens na forma eletrônica assim como processamos um texto em um computador,por exemplo • Enquanto uma imagem gravada em um filme pode ser representada eletrônicamente por uma onda analógica contínua, a imagem digital é representada por valores digitais obtidos a partir de amostras da forma analógica
  • 3. Analógico x Digital • Os valores Analógicos são contínuos • Os valores Digitais são discretos e representados por pulsos traduzidos por uma seqüência de números na forma binária
  • 4. A imagem no computador • Imagens podem ser armazenadas em duas formas básicas – Vetorial • A forma vetorial é normalmente utilizada por programas de desenho e os objetos que formam a imagem são representados na forma de lista indicando as figura, suas dimensões e posicionamento – Bit-map • São as imagens produzidas por Scanners e máquinas digitais • Os pontos são amostrados e representados bit a bit • Estaremos tratando deste tipo de imagem daqui em diante
  • 5. A imagem no computador
  • 6. A imagem no computador • Enquanto uma imagem na forma vetorial pode ser armazenada através de alguns Kilobytes, a imagem bit-mapped pode requerer muito mais espaço para ser armazenada • Por outro lado a imagem vetorial é apenas útil para a representação de imagens criadas no computador na forma de figuras como linhas, arcos, círculos, etc.
  • 7. Formação da Imagem Digital: Pixel • Uma imagem digital pode ser representada por um conjunto de elementos chamados de – “Pixel” – Elemento de Tela ou Picture Element • Cada Pixel é armazenado e juntos formam um mapa de bits “bit-map”: – Mapeamento de bit serve para reproduzir a imagem digitalmente
  • 8. Formação da Imagem Digital: Pixel • Uma imagem monocromática é uma função de intensidade de luz bidimensional f(x,y) • x,y denotam coordenadas espaciais • O valor de f no ponto x,y é proporcional ao brilho ou nível de cinza da imagem • Veja a seguir uma fotografia e os eixos x,y ao longo da mesma
  • 10. Amostra e Quantização • Para gerar uma imagem digital, f(x,y) deve ser digitalizada ao longo de x,y • Juntos, os pontos amostrados, geram uma matriz de amostragem de tamanho NxM • Cada ponto na Matriz NxM é representado por seu nível de cinza que denotaremos pela letra L
  • 11. Representação de uma imagem Monocromática Digital
  • 12. Representação de uma imagem Monocromática Digital • Cada elemento (quadrado) que aparece na imagem acima é um Pixel • No eixo x podemos denotar cada ponto p(x,y) variando de x= 0 a M-1 (Matriz) • No eixo y podemos denotar cada ponto p(x,y) variando de y= 0 a N-1 (Matriz) • Dizemos então que a imagem tem M pixels no eixo x e N pixels no eixo y • A cada ponto p(x,y) da matriz temos associado um nível de cinza
  • 13. Representação de uma imagem Monocromática Digital
  • 14. Uma boa imagem Digital • Considerando que o processo para geração de imagem digital está diretamente associado a Amostras (Número de Pixels) e Quantização (Nível de Cinza), pergunta-se: – Quantas amostras são necessárias para se gerar uma boa imagem digital? – Quantos níveis cinza são necessários para representar cada Pixel?
  • 15. Resolução da Imagem Digital • Note que as perguntas se referem a 2 aspectos diferentes: 1- Quantidade de Pixels ao longo de cada eixo x,y : Este parâmetro está associado ao espaçamento Físico entre amostras. Logicamente quanto mais pontos conseguirmos amostrar para formar nossa imagem digital, melhor será a formação da imagem Chamaremos esta grandeza de Resolução Espacial
  • 16. Resolução da Imagem Digital 2- Níveis de Cinza Está associado ao brilho da imagem em cada Pixel. Para representar mais níveis de cinza, logicamente iremos necessitar de mais bits para cada ponto. Veja alguns exemplos: 2 níveis = 1 bit (imagem Preto e Branco) 256 níveis = 8 bits 512 níveis = 9 bits 1024 níveis = 10 bits Chamaremos esta grandeza de Profundidade da Imagem
  • 19. Resolução Espacial • Vejamos a diferença na definição de uma imagem digital quando aplicamos diferentes resoluções espaciais: – Nas 3 fotos a seguir a Profundidade da Imagem permanece a mesma com 256 níveis de cinza – Foto (a): apresenta uma R.E. de 256x 256 pixels – Foto (b): R.E. de 128x128 – Foto (c): R.E. de 64x64 – Devido a perda de resolução espacial nota-se uma degradação que aparece na forma quadrículada, especialmente quando baixamos para 64x64 pixels.
  • 21. Profundidade da Imagem • Aqui a Resolução Espacial foi mantida em 256x256, enquanto que variou-se a profundidade da imagem da seguinte forma: • Foto (a): 16 níveis de cinza • Foto (b): 8 níveis de cinza • Foto (c): 2 níveis de cinza – Pergunta-se: Quando bits são necessários para cada representação de profundidade? • Note nas imagens que os detalhes da imagem original aparecem como formas homogeneas nas imagens de menor profundidade
  • 23. Uma boa imagem Digital • Agora podemos responder a pergunta inicial: • Quantas amostras são necessárias para se gerar uma boa imagem digital? • Quantos níveis cinza são necessários para representar cada Pixel? • Obviamente, quanto mais amostras e mais níveis de cinza aplicarmos ao nosso esquema de digitalização, melhor será a qualidade de nossa imagem representada! • Pergunta: – No que essa quantidade informação vai ajudar? – Até que ponto tanto detalhe pode ser útil? – Em que momento deve-se parar?
  • 24. Resolução e Tamanho da Imagem • Primeiramente: – Mais Detalhes = Mais Bytes – Mais Bytes = Mais memória, mais disco – Se você deseja transmitir a imagem, significa mais consumo de banda do seu meio de transmissão, ou mais tempo para enviar todos os bits • Claramente precisamos definir algum limite
  • 26. Resolução e Transmissão da Imagem Digital • Se eu tenho uma conexão que me permite transmitir 56000 bps, isto significa que precisamos de quanto tempo para transmiti-la? • Capacidade em Bytes por Segundo da minha conexão 56000/8= 7000 bytes por segundo • Então precisamos de 60000 bytes / 7000 bytes/s – ~8.6 segundos de transmissão
  • 27. Série de Exercícios • 2ª Série de Exercícios – Informática Aplicada a Radiologia • 1-Defina Resolução Espacial e Profundidade de Imagem em detalhes com suas palavras. • 2-Diferencie Imagem Vetorial e Bitmap. • 3-Quantos bits são necessários para representar 200,1000,2000 e 3000 níveis na profundidade de uma imagem monocromática. • 4-Um Scanner varre uma imagem de papel no formato A4 (21 cm x 29,7 cm) com uma resolução espacial de 100 pixels/cm2. Pede-se: – O desenho de 1 cm2 da imagem – Quantos pixels tem a imagem no total quando digitalizada por este Scanner? – Qual será o tamanho da matriz NxM – Se a Profundidade de imagem é de 256 níveis, quantos bits terá cada imagem após ser digitalizada? – Se diminuirmos para 4 níveis, qual será o novo tamanho da imagem? – Se temos uma conexão de 1 Mbps, quanto tempo será necessário para a transmissão desta imagem em sua forma digital sem aplicar qualquer esquema de compressão? – Diminua a taxa para 1000 bps e refaça os cálculos do item f
  • 28. Imagem Multibanda • Em uma imagem digital monocromática, o valor do pixel é um escalar entre 0 e L . Imagens multibandas podem ser vistas como imagens nas quais cada pixel tem associado um valor vetorial – vários valores associados ao mesmo pixel – P(x,y) = (l1,l2,...,ln) 0<=li<=Li-1, i=1,2,...,n – N=número de bandas
  • 29. Imagem Multibanda • Uma outra forma de representar uma imagem multibanda é como uma sequência de imagens monocromáticas
  • 30. Imagem Colorida • Uma imagem colorida é uma imagem multibanda, onde a cor em cada ponto (x,y) é definida através de três grandezas: luminância, matiz e saturação. • A luminância está associada com o brilho da luz • A matiz com o comprimento de onda dominante • A saturação com o grau de pureza (ou intensidade) da matiz.
  • 31. Imagem Colorida • A maioria das cores visíveis pelo olho humano pode ser representada como uma combinação de três cores primárias: vermelho (R), verde (G) e azul (B). Assim, uma representação comum para uma imagem colorida utiliza três bandas R, G, e B com profundidade byte por pixel (ou considerando a primeira forma de representação, temos uma imagem com profundidade 24 bits por pixel).
  • 33. Quantas Cores podemos representar?
  • 34. Exercícios-p2 • Um Scanner varre uma imagem colorida em papel no formato A4 (21 cm x 29,7 cm) com uma resolução espacial de 225 pixels/cm2. Pede-se: – O desenho de 1 cm2 da imagem – Quantos pixels tem a imagem no total quando digitalizada por este Scanner? – Qual será o tamanho da matriz NxM e quantas matrizes teremos – Se a cada cor primária é representada por 16 níveis, quantos bits terá cada imagem após ser digitalizada? Quantas cores poderão ser representadas? – Se aumentarmos para 128 níveis, qual será o novo tamanho da imagem? Quantas cores poderemos representar agora? – Se temos uma conexão de 2 Mbps, quanto tempo será necessário para a transmissão desta imagem em sua forma digital sem aplicar qualquer esquema de compressão? – Diminua a taxa para 2000 bps e refaça os cálculos do item anterior
  • 35. Imagens Tri-dimensionais • Até o momento, discutimos os casos de amostragem e quantização no espaço 2D. Portanto, o que comumente chamamos imagem é uma imagem digital bidimensional. Se a amostragem e a quantização envolvessem apenas uma direção do espaço teríamos o caso particular de uma imagem digital unidimensional com tratamento similar ao dado para sinais digitais. • Iimagens digitais tridimensionais são uma extensão dos conceitos de imagem digital monocromática e multibanda para uma terceira dimensão que pode ser espaço ou tempo. • Isto é o mesmo que dizer que a amostragem e a quantização podem ocorrer em x,y,z ou x,y, t , onde z ou t representam o espaço e o tempo. Portanto, uma imagem digital 3D será representada como uma seqüência de imagens monocromáticas ou multibandas ao longo do eixo espacial ou do eixo temporal .
  • 36. Imagens Tomográficos • Equipamentos tomográficos, (e.g. tomógrafos de raios- X, ressonância magnética) geram imagens monocromáticas de cortes (ou fatias) normalmente paralelos e uniformemente espaçados em uma dada região 3D • Em medicina, por exemplo, estes cortes são normalmente longitudinais cobrindo uma dada região do corpo do paciente que contém um dado órgão/fenômeno em estudo. • Considerando as dimensões pxp de um pixel nestas imagens e o espaçamento d entre os cortes, a extensão do pixel em 3D forma um pequeno paralelepípedo de dimensões que é chamado voxel volume element
  • 37. Imagens Tomográficas • O centro dos voxels coincide com o centro dos pixels. Os voxels representam pontos de amostragem de algum fenômeno físico e são usados para reconstruir no computador a forma ou função de estruturas tridimensionais. Neste caso, a imagem pode ser representada como uma matriz 3D como ilustrado na Figura a seguir.
  • 38. Voxel
  • 39. Imagem Tomográfica • Imagens tomográficas possuem normalmente 256x256 ou 512x512 pixels e profundidade de 1 ou 2 bytes por pixel. A Figura a seguir, por exemplo, mostra três fatias de ressonância magnética de resolução espacial 256x256 pixels e profundidade 2 bytes por pixel
  • 41. Imagem Tomográfica • Como foi dito anteriormente, os voxels são usados para reconstruir a forma ou função de estruturas 3D. A Figura a seguir ilustra uma reconstrução de um crânio a partir de imagens de tomografia de raios-X.
  • 43. Imagens 4D • A título de curiosidade, tomógrafos também geram imagens digitais 4D, fazendo amostragem e quantização em . Este é o caso de imagens tomográficas de um coração batendo, onde as três primeiras coordenadas são espaciais e a quarta coordenada é temporal.