CC

1. Guia d’ús avançat
Duració del tutorial: 30’
22/11/2010

2. Què és?
● PUBMED permet l’accés gratuït a bases de dades
bibliogràfiques de ciències de la salut com
MEDLINE, de la National Library of Medicine dels
MEDLINE
Estats Units.
● MEDLINE está format per uns 17 milions de
referències d’articles de revistes publicades des
de 1948 fins a l’actualitat, el 92% en anglès.
● My NCBI Permet personalitzar l’ús de PUBMED
gravant perfils d’interés i agregar al·lertes al
nostre correu-e per seguir temes actuals.

3. Cerca simple

4. Autocompletat
Quan escrivim a la finestra de cerca el
sistema ens suggereix múltiples
propostes d’autoescriptura. Triem la que
més s’ajusta amb el punter.

5. Cerca simple d’un tema / 1
Introduïm el terme o la frase al quadre de cerca i premem SEARCH

6. Cerca simple d’un tema / 2
PubMed traduirà de forma automàtica el nostre plantejament en els
descriptors pels quals s’indexaria formalment l’article i en altres
etiquetes, en tots els sinònims associats (Entry term mappings), els
autors, els títols de les revistes, etc.

7. Cerca simple d’un tema / 3
El botó URL ens permet generar un localitzador
d’internet per poder guardar-lo i reproduir una
cerca idèntica en el futur:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%28%22silicosis%22[MeSH%20Terms]%20OR
%20%22silicosis%22[All%20Fields]%29%20AND%20%28%22lung%20neoplasms%22[MeSH%20Terms]
%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND%20%22neoplasms%22[All%20Fields]%29%20OR
%20%22lung%20neoplasms%22[All%20Fields]%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND
%20%22cancer%22[All%20Fields]%29%20OR%20%22lung%20cancer%22[All%20Fields]
%29&cmd=DetailsSearch

8. Cerca simple d’un tema / 4
Podem fer servir operadors lògics (AND, OR, NOT), en
majúscules sempre, per orientar la cerca:
percutaneous transluminal angioplasty AND (renal OR kidney)

9. Cerca amb límits / 1
PubMed preveu la cerca
d’articles fent servir uns
límits que són molt
habituals.

10. Cerca amb límits / 2
La cerca d’articles pot
limitar-se a un gènere,
una llengua, una franja
d’edat, un sector de
publicacions, una
espècie, etc.
En aquesta cerca amb
límits busquem el terme
gonarthrosis en les
revistes Core (són 120
revistes del total, a prop
de 5.500)

11. Cerca avançada

12. Camps de Pubmed
Els registres de Pubmed estan formats per uns
camps característics que són directament
interrogables.
Camps
característics
de PubMed

13. Cerca avançada
• Cerca per autors, revistes, etc.
(camps concrets)
concrets
• Cerca a través dels descriptors
MeSH (Medical Subject Headings)
Me

14. Search Builder / 1
A la finestra Search builder
podem obtenir amb el
desplegable tots els noms dels
camps i consultar l’Index de
cadascun dels camps.

15. Search Builder / 2
L’ Index s’obre per la paraula o
frase més aproximada a la frase
que hem escrit al Search Builder

16. Search Builder / 3
Tal i com anem trobant etiquetes amb el Search
Builder i l’índex les podem anar incorporant amb el
botó a la finestra de cerca (Search
Box), on es combinen:

17. Resultats

18. Medical Subject Headings (MeSH) / 1
Me MeSH
Una cerca a través dels descriptors MeSH ens
permet capturar informació d’una forma:
b) més consistent,
c) més metòdica; i,
d) més rigorosa.

19. Medical Subject Headings (MeSH) / 2
Me MeSH
1) Introduïm el terme pathologic fracture a la finestra
d’interrogació,
2) MeSH tradueix automàticament pathologic fracture
al descriptor Fractures, spontaneous,
3) Ens permet limitar la cerca p.e. als articles sobre
rehabilitació, i
4) Aquests dos elements es combinen al menú
desplegable en l’opció “Search Box with AND”

20. Resultats

21. Visualització
de resultats

22. Visualització de resultats / 1
Articles del
domini públic (2)

23. Visualització de resultats / 2
L’Hospital està
suscrit
S’obté el text
complet
clicant el logo
de l’Hospital

24. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?holding=ieshvadhlib
Aquest enllaç per accedir a
Pubmed ens identifica com a
usuaris de la Biblioteca. Quan
Biblioteca
visionem un registre de
Pubmed ens diu si hi tenim
accés mostrant el logo de
l’Hospital.

25. Visualització de resultats / 3
Text complet
Vista “Abstract”
Captura de
registres

26. My NCBI

27. Què és My NCBI?
 L’eina My NCBI en PubMed
permet registrar-se i així retenir
la informació recollida per un
usuari i les seves preferències.

28. Registre a My NCBI
Podem obrir gratuïtament un compte a My
NCBI o bé fer servir p.e. el de Google o Gmail

29. Funció Collections / 1
Quan volem guardar un conjunt de registres
bibliogràfics en PubMed podem fer-ho amb la
funció Clipboard, que només ens deixa retenir fins
Clipboard
a 500 registres i només es conserven si no estem
inactius 8 hores seguides.
La funció Collections és altrament pels usuaris que
s’han registrat a My NCBI i permet conservar fins a
5000 registres indefinidament, i a més a més
compartir-los.

30. Funció Collections / 2
Per compartir una col·lecció de registres la
configurarem com a “pública” i a més a
més proporcionarem la URL o enllaç directe
a col·laboradors nostres.

31. Funció Save search / 1
Tenir compte en My NCBI també ens permet
gravar una cerca (la seva estratègia) per poder-la
executar en el futur.

32. Funció Save search / 2
La funció Save Search genera un formulari
on podem inscriure les nostres preferències
per rebre continuadament els resultats que
es vagin incorporant a PubMed sobre el
nostre tema al correu-e personal.

33. Funció My Bibliography /1
Per últim, una altra funció de My NCBI útil és My
Bibliography, dissenyada específicament per
Bibliography
guardar registres d’un autor i editar-los en llistes

34. Funció My Bibliography /2
Botons d’edició de My Bibliography

35. Captura
de registres

36. Podem capturar els resultats de la
cerca, sigui a partir de la llista total,
sigui fent una selecció de la llista
clicant els botons de selecció

37. Quan enviem registres a una adreça de
correu-e no podem enviar més de 200
registres per missatge, però es poden
enviar fraccionats.

38. Importar registres
a

39. Podem importar un arxiu extret de Pubmed
Amb el registre o registres seleccionats cliquem SEND TO,
TO
triem la opció FILE i el format MEDLINE

40. Des del submenú IMPORT REFERENCES d’ EndNoteWeb
podem pujar l’arxiu generat per la recerca anterior
(pubmed_result.txt) aplicant el filtre PUBMED (NLM)

41. Registre a la llista
Registre en detall

42. Guia d’ús completa d’ EndnoteWeb
Cliqueu:

43. Importar registres
a

44. La icona de document en la barra de les adreces ens
indica que Zotero ha detectat les “metadades” d’un article
en Pubmed

45. 3
2
• Obrim Zotero clicant el seu botó a la barra.
• A la columna esquerra activem la carpeta on volem gravar un registre.
• Cliquem la icona que apareix a la barra d’adreces per incorporar-lo.
1

46. Guia d’ús completa de Zotero
Cliqueu:

47. Altres funcions

48. Enllaç permanent d’un article
Una forma de crear un enllaç permanent a un registre
és amb un URL que contingui l’expressió
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ i el número
PMID (PubMed Identifier). P.e.:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19010894

49. SOD (Servei d’obtenció de documents) de la
Biblioteca l’Hospital
El PMID identifica cada
article i serveix per invocar
en molts formularis (com
el del SOD) tota la
referència bibliogràfica
sense haver d’escriure-la.
Si escrivim només el PMID
el formulari busca l’article i
inscriu la referència
completa.

50. Funció Images
L’octubre de 2010 PubMed
ha incorporat imatges en
els articles que pertanyen a
les publicacions de Pubmed
Central, de lliure accés

51. Agregadors RSS
PubMed ofereix diversos canals RSS per obtenir
fàcilment informació continuada sobre un tema, etc.
Més informació a la Guia
d’ús de RSS. Cliqueu:

52. Elaborat per: Marta-R. Domínguez Senra (mrdoming@vhebron.net)