2. Fosfoinositol 3-quinasa (PI3Ks) cataliza la
fosforilación del grupo 3-OH del fosfatidil
mio-inositol creando segundos
mensajeros
Esta encima juega un importante papel
en procesos biológicos como la
supervivencia celular y
proliferación, movimiento, adesión
citoesqueletical y trafico de vesiculas
3. Hay tres clases: I, II y III
Dentro de la clase I hay dos
subclases, diferenciados por su subunidad
reguladora: A (α,β y δ) y B (PI3Kγ), la cual es
la responsable de formar PIP3
La via de señales del PI3Kγ no solo
involucra procesos de cancer, también
resistencia a la quimioterapia y a terapia
de irradiación γ
Estos hechos sugieren que puede ser una
molecula importante en el cancer y los
tratamientos inflamatorios
4. Se utiliza el programa Autodock y Grid22
para probar diferentes conformaciones
PI3Kλ-ligando y encontrar el estado de
minima energía
Se utilizan diferentes variantes de los 4
inhibidores conocidos
(benzopirano, quinazolina, quinolina y
cafeina)para poder encontrar un nuevo
inhibidor potente selectivo y soluble en
agua
5. Mediante la utilización de programas
informaticos encontrar un nuevo
inhibidor de la PI3Kλ que sea
potente, selectivo y soluble en agua
6. Preparación de la enzima
› La estructura cristalina del PI3Kλ se consigue
de una base de datos y se define el sitio de
unión al ligando
Preparación del ligando
› Se utilizan 29 variantes de los inhibidores
antes mencionados, sus estructuras 3D
fueron construidos con el software Accelrys
Cerius2 versión 4.8
7. Unión
› Se utilizó el programa Autodock 3.0 para las
uniones. Todas las uniones rotables posibles
fueron consideradas para encontrar la
conformación inhibitoria adecuada
Red
› Se utilizó el programa Grid22 para calcular la
energía de las uniones
Analisis de los resultados
› Todos los resultados fueron visualizados y
analizados con el software Swiss-
PdbViewer, i.e. Deep View
8. La fexibilidad de las pequeñas
moleculas es considerado muy
profundamnete por el programa pero
no el de la proteina. Por lo
tanto, diferentes programas darán
diferentes resultados
9. Para validar que el programa utilizado
funciona se utilizan 5 inhibidores
(quercetina, miricetina, wortmanina,
estaurosporina y Ly290042) cuyas
estructuras son sabidas, dando un
resultado satisfactorio
Se hacen mas pruebas con las mismas
conclusiones
10. Derivados de la quinazolina
› Son los mayores inhibidores
› El modo de unión nos da información de
como actua
› El atomo N1 del D010 se une a la Lys 833 y
otro entre la cetona y el carboxilo del Asp
964
› El D010 se encuentra en una región
hidrofóbica (sitio de unión). Este sitio es
diferente a las demas PI3K
11. Derivados de la quinazolina
› El D022 tiene uniones de hidrógenos con su
el atomo N9 del resto de purina y la cadena
lateral del residuo Lys 833 y tambien con el
grupo carboxilo del Asp 950
› La D 022 estaba mas cerca de los
aminoacidos hidrofóbicos
12. La Ly293646 y Ly293684 son dos
inhibidores sinteticos
La Ly293646 hace dos uniones de
hidrógeno
La Ly293646 se junta mas con los aa
hidrofóbicos, resultando un mejor
inhibidor que la Ly293684, ya que su
composición le permite ser mas flexible
13. Utilizando los inhibidores de pueden
crear inhibidores específicos
Tienen tres regiones importantes: la
region hidrofóbica (amarillo), la región
hidrofílica I (azul) y II (rojo)
14. Relación actividad-estructura
› Estudiando los derivados de la quinazolina
se sabe que algunos grupos hidrofóbicos son
muy importantes para su actividad
› Los carbonos 1 y 3 del grupo fenil le dan
selectividad
› Utilizando el Grid22 se pueden saber las
energian de las uniones y mediante esta
herramienta y basados en el anillo de la
quinazolina, se proponen 8 inhibidores y se
predice su actividad
15. Se examinaron distintos modos de union
de los inhibidores de la PI3Kλ con
Autodock
La energía de las uniones fue utilizado
para construir nuevos inhibidores y
predecir su actividad
Estos resultados pueden ayudar a crear
un nuevo inhividor potente, selectivo y
soluble en agua
