SlideShare une entreprise Scribd logo
1  sur  115
ENZIMAS
Las enzimas son proteínas
   Catalizan reacciones químicas necesarias
    para la sobrevivencia celular
   Sin las enzimas los procesos biológicos
    serían tan lentos que las células no podrían
    existir.
   Las enzimas pueden actuar dentro de la
    célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo.

           E + S ES EP  E + P

                E        E        E        E
La enzima disminuye la energía de
activación
                             Sin enzima
                             Con enzima


                               • La Ea de la hidrólisis de la urea
                                 baja de 30 a 11 kcal/mol con la
   E+S                           acción de las enzimas, acelerando
                                 la reacción 1014 x
                               • El aumento de temperatura
                                 necesario para producir la reacción
                     E+P         no catalizada seria de 529ºC
     Tiempo de la reacción
Enzima - Catalizador
   Tanto la enzima como el catalizador
    aceleran la velocidad de una reacción
    química.
   Una enzima puede transformar 1000
    moléculas de sustrato/ segundo
   Las enzimas tienen 3 propiedades que los
    catalizadores NO tienen
    •   Especificidad por el sustrato
    •   Se inactivan por desnaturación
    •   Pueden ser reguladas
   Las enzimas se unen a los reactivos
    (sustratos) reduciendo la energía de
    activación

   Cada enzima tiene una forma única
    con un sitio o centro activo en el que
    se une al sustrato

   Después de la reacción, enzimas y
    productos se separan.

   Las moléculas enzimáticas no han
    cambiado después de participar en la
    reacción
Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a:
• Fijación estereoquímicamente complementaria
  del substrato
• Transformación catalítica del mismo

En ambas funciones participan:

• Cadenas laterales de los aminoácidos
• Grupos o moléculas no proteicas:
       Grupos prostéticos
       Iones metálicos
       Cofactores
Los siguientes hechos:
 Especificidad de la reacción enzimática
 Carácter heterogéneo de la catálisis enzimática




Nos llevan a postular la existencia de un Centro
Activo en la molécula de enzima, capaz de:

 Fijar específicamente al substrato
 Transformarlo catalíticamente.
Enzima


                Sustrato

 Sitio activo
La unión del sustrato es muy
             específica

   Complementariedad geométrica
   Complementariedad     de   cargas,   uniones
    iónicas
   Modelos:
       Encaje inducido
       Llave – cerradura.
       Estado de transición
Teorías de la acción enzimática, 1
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)

Substrato y enzima se acoplan de forma estereospecífica,
de la misma manera que una llave se ajusta a su
cerradura.

Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se
considera insuficiente al no explicar algunos fenómenos
de la inhibición enzimática
Teorías de la acción enzimática, 2
Modelo de Ajuste Inducido (Koshland)


Tanto la enzima como el substrato sufren una
alteración en su estructura por el hecho físico de la
unión.

Está mucho más de acuerdo con todos los datos
experimentales conocidos hasta el momento.
Teorías de la acción enzimática, 3
Estabilización del Estado de Transición


La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad
definiendo la acción enzimática como

Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad
complementario no al substrato o al producto, sino al
estado de transición entre ambos.
Una enzima puede unir dos sustratos
         en su sitio activo
Clasificación y
nomenclatura de enzimas
Clasificación y nomenclatura
Nombre sistemático:     Grupo transferido


   ATP: hexosa fosfotransferasa
Donador   Aceptor      Tipo de reacción catalizada

                                                     Grupos
              Número Enzyme Commission:
                                                     químicos
                       Enzyme       EC 2.7.1.1        Enzimas
                      Comission                Subgrupo
                                   Grupo

  Nombre común (sustrato+”asa”): Hexokinasa
Clasificación y nomenclatura

Clasificación de enzimas por Grupos

    EC 1.x ⇒ Oxidorreductasas
    EC 2.x ⇒ Transferasas
    EC 3.x ⇒ Hidrolasas
    EC 4.x ⇒ Liasas
    EC 5.x ⇒ Isomerasas
    EC 6.x ⇒ Ligasas
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
 Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de
 oxigeno ó hidrogeno son trasladados entre moléculas:

      Ared + Box                  Aox + Bred

      AH2 + B                     A + BH2

 En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a
 la vez el aceptor y el dador electrónico.
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas

     Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa

   β-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa   EC 1.1.3.4
   Dador      Aceptor


                              Nombre común:
                                   Glucosa oxidasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
  Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas:
                      EC 1.1.x -    Deshidrogenasas
                      EC 1.2.x -    Oxidasas
                      EC 1.3.x -    Peroxidasas
                      EC 1.4.x -    Oxigenasas
                      EC 1.5.x -    Hidroxilasas
                      EC 1.6.x -    Reductasas
                      etc.
Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa
               Deslignificación ó Bioblanqueamiento
Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
  Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó
  grupo de átomos entre moléculas:

        A-X + B                       A + B-X

 Dador: Aceptor Grupo transferido - transferasa

 ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa                EC 2.7.1.1
               Nombre común: hexokinasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
 Clasificación de subgrupo de las transferasas:
               EC 2.1.x    -   Grupos monocarbonados
               EC 2.2.x    -   Grupos aldehido o ceto
               EC 2.3.x    -   Aciltransferasas
               EC 2.4.x    -   Glicosiltransferasas
               EC 2.5.x    -   Alquil- o Ariltransferasas
               EC 2.6.x    -   Grupos nitrogenados
               EC 2.7.x    -   Grupos fosfato
               EC 2.8.x    -   Grupos sulfato
               EC 2.9.x    -   Grupos selenio
 Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos
Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
 Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son
 las más comunes en el dominio de la tecnología enzimática:

     A-B + H2O                        A-OH + H-B

       No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las
       hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre
       Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4.
Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Clasificación de las hidrolasas:
  3.1.-.-   Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas)
  3.2.-.-   Glicosidasas
  3.3.-.-   Éter hidrolasas
  3.4.-.-   Péptido hidrolasas
  3.5.-.-   Acil anhídrido hidrolasas
  etc.
Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos
               Proteasas → Fabrico de quesos
               Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de aromas en los
                              vinos; aplicaciones textiles
Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Caso particular ⇒ Péptido hidrolasas: clasificación común (no
                  sistemática)

    I. Según la situación del enlace atacado:
           - Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas)
           - Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas)
    II. Según el mecanismo catalítico:
           - Serin proteinasas
           - Tiol proteinasas
           - Aspartil proteinasas
           - Metaloproteinasas
Clasificación y nomenclatura
 Grupo 4: Liasas
     Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de
     átomos del sustrato (este grupo no incluye las hidrolasas):

                  A-B                      A+B
Ejemplo
Nombre sistemático:
    Histidina amonio-liasa (EC 4.3.1.3)

Nombre común:
   Histidasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Clasificación de las liasas:
     4.1.x - Actúan sobre enlaces C-C
     4.2.x - Actúan sobre enlaces C-O
     4.3.x - Actúan sobre enlaces C-N
     4.4.x - Actúan sobre enlaces C-S
     4.5.x - Actúan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-)
     4.6.x - Actúan sobre enlaces P-O
     4.99.x - Otras liases
Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables (ceras,
pectinas, proteínas) en fibras en la industria textil – “bioscouring”
Clasificación y nomenclatura
 Grupo 5: Isomerasas
       Catalizan reacciones de isomerización moleculares

                 A                      B
Ejemplo:
Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)
Clasificación y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Clasificación de las isomerasas:

         5.1.x - Rasemasas y Epimerasas
         5.2.x - cis-Trans-Isomerasas
         5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular
         5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases)
         5.5.x - Liasas Intramoleculares
         5.99.x - Otras Isomerasas
Clasificación y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
    Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas
    de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.).

  A + B + ATP                          A-B + ADP + Pi
Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6.2.2.3)

Nombre sistémico:
G-L-glutamilo-L-cisteina:glicina ligase
Clasificación y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Clasificación de las ligasas:

          6.1.x   - Forman enlaces C-O
          6.2.x   - Forman enlaces C-S
          6.3.x   - Forman enlaces C-N
          6.4.x   - Forman enlaces C-C
          6.5.x   - Forman enlaces ésteres fosfóricos
          6.6.x   - Actúan sobre enlaces N-metal
Cinética Enzimática
Cinética Enzimática
 La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de
  cada uno de los factores que intervienen en la actividad
  enzimática, que se evalúa a través de la velocidad de la
  reacción catalizada.
 Las variables más importantes son:
            • Concentración de enzima, sustratos y productos
              (incluyendo inhibidores y/o activadores)
            • pH
            • Temperatura
   Ella está basada en la medición de la velocidad de reacción. Así en la reacción:

                                       E
                               S              P

   Se tendrá:
                           dp    ds
                        v=    =−
                           dt    dt
   Como se observa en la figura, la velocidad de reacción (pendiente) disminuye
    continuamente a partir de un valor máximo inicial. Esto se puede deber a:
                Desaturación de la enzima con sustrato, por disminución de la
                 concentración del sustrato
                Inactivación de la enzima por su inherente inestabilidad
                Inhibición por el producto
                Desplazamiento del equilibrio, si la reacción es reversible
Baja
concentración
de sustrato




ALTA
concentración
de sustrato
SATURACION
. . .
            Efecto de la concentración de substrato

v
                    . .
             .
        .
    .
                                                 [s]
Concepto de velocidad inicial

              d[P]
[ ]       v = dt , t   0
                                      p




                                      s

                                          t
Una cinética hiperbólica implica un proceso saturante:

 Hay un número limitado de sitios en la enzima
 para fijar substrato; una vez que están ocupados
 todos, por mucho que aumente la concentración
 de substrato, la velocidad permanecerá constante
 tendiendo a un valor asintótico


                 k+1                k+2
   E+S                     ES                E+P
                 k-1
El sistema de ecuaciones diferenciales que describe la dinámica
del sistema
                 k+1               k+2
  E+S                     ES                 E+P
                 k-1

Sistema No admite solución analítica.

       - Simulaciones numéricas
       - Hipótesis que lo simplifiquen
Hipótesis de Michaelis - Menten
                   k+1              k+2
    E+S                    ES               E+P
                   k-1
- La primera parte del mecanismo,

                  k+1
   E+S                    ES
                  k-1
 Tiene lugar mucho más rápidamente que la segunda:

            k+2
   ES                    E+P
Hipótesis de
Michaelis-Menten
                               [ E ][ S ] e s ( e 0 − x ) s
                          Km =           =   =
Equilibrio rápido                [E S ]    x         x

      e0s
x =
    K m + s
                              V m ax s
 v = k        x          v =
                             K m + s
         +2

    k +2 e 0 s
v =
    K m + s

  k +2 e 0 = V    m ax
Hipótesis de estado estacionario
Según veíamos en la simulación numérica, hay un tiempo
relativamente prolongado en el curso de la reacción en el
que la variación de complejo [ES] es prácticamente igual
a cero:
          dx/dt = k+1es - (k-1 + k+2) x = 0


A partir de esta expresión podemos llegar a obtener una
expresión que nos da la velocidad para la concentración
de substrato
dx
   = 0 = k +1e s − (k                     −1   + k   +2   )x
dt

k +1e s = k             +1   (e   0   − x )s = (k         −1   + k   +2   )x

                    e0s                     e0s
x =
                   + k +2
                                         =                                         V m ax s
      k   −1
                                  + s
                                           Km + s
                                                                               v =
               k   +1
                                                                                   Km + s
          v = k          +2   x                                                     Hipótesis de
                                                                                estado estacionario

      k +2 e 0 = V                m ax
A partir de las suposiciones de Michaelis-Menten y
      Estado estacionario, llegamos a la ecuación


                          Vmax * s
                  v=
                         Km + s

La única diferencia radica en el significado de Km:

        Km = k-1/k+1 en mecanismo de M.M.

        Km = (k-1 + k+2)/k+1 en mecanismo de E.E.
Significado de la constante Km
   1. Constante de equilibrio de disociación del complejo ES
      (en condiciones de equilibrio rápido)

   2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato
      (en condiciones de equilibrio rápido)

   3. Mide la función de fijación (en cond.de equilibrio rápido)

   4. Concentración de substrato para la que la velocidad se hace
      igual a la mitad de la máxima (s0.5)

   5. Se define para una pareja enzima-substrato

   6. Se mide en unidades de concentración
Significado de la constante Vmax = k+2 e0

1. Velocidad asintótica para s

2. Directamente proporcional a la concentración de
   enzima (hoy se prefiere caracterizar a la enzima
   por k+2)

3. Mide función de transformación catalítica

4. Se expresa en unidades de velocidad
Relación entre Km y Vmax
                                             Michaelis y Menten
  Velocidad de la reacción (v)   Vmax




                                 Vmax/2




                                           Km   Concentración de Sustrato [S]



La Km es la concentración de sustrato
donde se obtiene la mitad de la Vmax
Vmax

     Velocidad de la reacción (v)


                                    Vmax/2




                                             Km   Concentración de Sustrato [S]




A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato
A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato
Representación directa


v
    100
                                                                               Vmax
    80



    60
                                                                 V          s
                                                      v =                m x
    40                                                       K       m     + s

    20

                                                                  s
     0
          0        20     40        60           80         100




              Km
Representación Lineweaver-Burke




  1/Vmax
                      1   Km 1   1
-1/Km                   =    ⋅ +
                      v V mx s V mx
Representación Hanes




                   x
                 ma
           1/V
                       s   1        K m
                         =    ⋅s +
-Km                    v V mx      V mx
Representación de Eadie-Hofstee
   Vmax


                                     v
                       v = −K   m   ⋅ +V   m x
             -K                      s
              m
Métodos de linealización para determinación
          parámetros cinéticos

Método        Eje Y   Eje X   Intercepto   Intercepto   Pendiente
                                 Eje Y        Eje x

Lineweaver-    1/v     1/s       1/V         -1/K         K/V
Burke

Hanes          s/v     s         K/V          -K          1/V


Eadie-         v       v/s        V           V/K          -K
Hofstee
Definición Actividad Enzimática

   Es el número de moles de sustrato que
    reaccionan para formar producto, por mol de
    enzima y por unidad de tiempo. Esto supone
    que la enzima está plenamente saturada con
    sustrato y por tanto que la reacción se efectúa
    con su máxima rapidez
   El índice de recambio muestra la eficiencia
    impresionante de la catálisis enzimática
 A fin de normalizar la medición de la actividad, se ocupa el valor de
  la velocidad inicial de reacción, donde eses factores son
  despreciables. Así,

                              dp       ds 
               a = vt →0   =   = − 
                              dt t →0  dt t →0

 Esta velocidad inicial no se espera que sea observada en un
  proceso enzimático donde, debido a los elevados tiempos de
  operación, es razonable suponer que esos factores ejercerán su
  influencia.
Cálculo de Actividad Enzimática

   La velocidad de reacción catalizada por 0,1ml
    de una dilución 1:100 de Fosfatasa Alcalina es
    0,3umoles / min. de producto. ¿Cuál es su
    actividad enzimática?
   0,1ml-------- 0,3umoles producto / min.

       1,0ml------------3,0umoles producto / min.
                               dil 1:100-------------
    300umoles producto / min.
                           Respuesta: 300U/ml
Número o Índice de
Recambio
   Es útil definir una constante de velocidad más
    general, k cat , para describir la velocidad
    limitante de cualquier reacción enzimática a
    saturación
   kcat x Et= Vmáx
   V0 = k cat x Et x [S] / KM + [S];
   Kcat es una constante de velocidad de 1er orden
    con unidades de tiempo-1, también llamada
    Número de Recambio
Efecto del pH en la ENZIMA




Cada enzima tiene un pH óptimo para su actividad
El pH afecta las interacciones iónicas
Efecto del pH


 1. Sobre la fijación del substrato al centro activo:
        - Grupos disociables de la enzima
        - Grupos disociables del substrato

 2. Sobre la transformación catalítica del substrato

 3. Sobre la estructura de la proteína enzimática
En el efecto de la temperatura hay dos componentes:



    1. Aceleración de la reacción según la ecuación
       de Arrhenius

                   k = A exp (-Ea/RT)

    2. Desnaturalización térmica de la proteína
Efecto de la temperatura en la ENZIMA
              Aumento de la   Desnaturación
                velocidad       por calor




                   15º        40º      75º

                  Temperatura

  Cada enzima tiene una temperatura óptima.
ORGANISMOS TERMÓFILOS

   Son organismos que viven a altas tº y realizan
    sus reacciones enzimáticas a estas altas tº
   Ejemplos son los que viven en las aguas
    termales
   Es tema de investigación el aislamiento de las
    enzimas de estos organismos para desarrollar
    procesos industriales en condiciones más
    extremas
Coenzimas
 Las coenzimas son pequeñas moléculas
  orgánicas, que se unen a la enzima.
 Las coenzimas colaboran en la reacción
  enzimática recibiendo transitoriamente
  algún grupo químico: H+ , OH, CH3 .
 Laenzima sin la coenzima recibe el nombre
 de APOENZIMA
El NAD es una coenzima aceptora de H




                     Sustrato
                     oxidado
Algunas enzimas requieren metales
para mejorar su actividad
Isoenzimas o Isozimas
   Son formas moleculares diferentes de una
    misma enzima
   Catalizan la misma reacción
   Ejemplo: Lactato deshidrogenasa
   Lactato + NAD ==== Piruvato + NADH
   M4, M3H1, M2H2, M1H3 y H4
   Se diferencian por su movilidad electroforética
   Usadas en clínica: sueros normales y sueros
    con alguna patología
 Así esta actividad corresponde al máximo potencial
  catalítico que las enzimas poseen para un determinado
  conjunto de condiciones ambientales. Luego, estas
  deben ser consideradas en las expresiones matemáticas
  representativas del proceso enzimático.
 Existen situaciones (sustratos heterogéneos) donde la
  velocidad inicial de reacción no es representativa del real
  potencial catalítico de la enzima.
 Se asume que la velocidad inicial de reacción es
  proporcional a la concentración de proteína enzimática.
Inhibición enzimática
Inhibidor:
Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de
interacciones con el centro activo u otros centros específicos
(alostéricos).

Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a
la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática

De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:

       I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo

       II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la
           molécula, causando un cambio conformacional con
           repercusión negativa en la actividad enzimática.
Inhibición enzimática
      isostérica
Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos:



1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,
con el complejo enzima-substrato o con ambos:

                  E+I                EI

                 ES + I              ESI


 2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima:
                 E+I                 E’
Inhibición reversible

(a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre,
    impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva

(b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo
    haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la
    fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción
    catalítica: Inhibición No Competitiva

(c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato
    una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo
    se conoce como Inhibición Anticompetitiva
Inhibición Competitiva
Inhibidores Competitivos

 Compiten    con el sustrato por el sitio
  activo de la enzima
 Se une solo a la enzima libre

V
    máx no se altera y K M cambia
Inhibición competitiva



Al aumentar la cantidad
de      SUSTRATO       el
inhibidor competitivo es
desplazado y se forma
producto
S
       E             ES         E+P
I
                Se define una constante de            [E] [I]
                equilibrio de disociación del    Ki =
                                                       [EI]
      EI        inhibidor:

    Características:
    - Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas
    - A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibición
    - Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del
      substrato.
    - El inhibidor es tan específico como el substrato
En condiciones de equilibrio rápido, llamando y a la concentración
del complejo EI, para la inhibición competitiva obtenemos el siste-
ma de ecuaciones

         (e0 − x − y )s
  K m =
                 x                   De donde
        (e0 − x − y )i
  Ki =
               y                                    V
                                                    s
                                       v =              m x

Que resuelto para x nos da                         i 
             e0s                           K m 1 +    + s
 x =                                               Ki
               i 
       K m 1 +    + s
               Ki
Por tanto, en la inhibición competitiva,



  1. El efecto cinético del inhibidor es el aumento aparente de la
     Km, que aparece multiplicada por el factor (1 + i/Ki)

  2. La Vmax no aparece modificada; para concentraciones muy
     altas del substrato, v = Vmax, igual que en ausencia de inhibidor

  3. Cuanto más pequeño sea el valor de Ki mayor será la potencia
     del inhibidor competitivo.
Sin inhibidor



                       Con inhibidor


                        El inhibidor competitivo
                        aumenta la Km


   Km        Km
   Sin       con
inhibidor inhibidor
Inhibición competitiva - Representación recíproca doble



                         0.07
                 1/v
                         0.06


                         0.05


                         0.04


                         0.03
                                      1/Vmax
                         0.02

    -1/Km                0.01

                                                                 1/s
                         0.00
   -0.3   -0.2    -0.1          0.0    0.1   0.2   0.3   0.4   0.5   0.6




                         -1/(Km(1 + i/Ki))
Ejemplo Inhibidor Competitivo

 Ácidosuccínico + FAD == ácido
 fumárico + FADH2
 El inhibidor competitivo es el ácido
  malónico
 Es un análogo estructuralmente parecido
  al ácido succínico
Ácido Fólico y Sulfanilamida
 La sulfanilamida es un análogo estructural
  del ácido p - aminobenzoico (PABA)
 PABA es el punto de partida para la síntesis
  de ácido fólico en las bacterias
 El ácido fólico es una vitamina esencial para
  la proliferación (división) bacteriana
 Sulfanilamida se usa en el tratamiento
  algunas infecciones
Metotrexato y Dihidrofolato
 El ácido fólico en sus formas de dihidro y
  tetrahidrofolato es coenzima de la reacción
  catalizada por la dihidrofolato reductasa
 Esta reacción es parte del metabolismo de
  los nucleótidos para la síntesis de DNA
 Metotrexato se usa en la terapia de algunos
  cánceres, inhibiendo la síntesis de DNA
Inhibidor competitivo
su estructura es similar a la del sustrato




                            No se forma producto
Inhibición No Competitiva
Inhibidor No Competitivo

 Se  une a un lugar diferente del sitio
  activo la enzima
 Se une a la enzima libre y también al
  complejo enzima-sustrato
 Por acción del inhibidor disminuye la V
                                          m
  pero el valor de Km no se altera
Inhibición NO competitiva
Inhibidor NO competitivo
El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un
             sitio diferente del sitio activo
S
           E              ES         E+P
      I               I           Inhibición
                S               No Competitiva

           EI             ESI

El inhibidor se fija indistintamente a la enzima libre E
y al complejo enzima-substrato ES; ni el complejo EI
ni el complejo ESI son productivos
Inhibición Anticompetitiva
      o Incompetitiva
Inhibidor Incompetitivo
En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro
activo pero solo después de que el sustrato lo haya hecho y,
por tanto, inhibidor y sustrato no compiten. De esta manera,
aunque todo el sustrato esté saturando la enzima y toda la
enzima esté como complejo ES, el inhibidor puede
enlazarse produciendo un complejo inactivo ESI.

Como I solo se une a ES estimula la formación de ES y, por
tanto, incrementa la unión del sustrato a la enzima,
disminuyendo Km . Sin embargo, el complejo ESI no
conduce a productos y Vm disminuye.
Inhibidor Incompetitivo

 Se  une a un lugar diferente del sitio
  activo de la enzima
 Se une sólo al complejo enzima-sustrato

 Los efectos que tiene: disminuye el valor
  de Km y también el de Vmáx
S
E           ES       E+P
        I
                      Inhibición
                    Anticompetitiva
            ESI

El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES;
       el complejo ESI no es productivo
Determinación de parámetros cinéticos de
                   inhibición


Modelo                 Kap             Vap

Inh comp            Km(1+i/Ki)         Vm

Inh no comp total      Km           Vm/(1+i/Ki)

Inh anticomp        Km/(1+i/Ki)     Vm/(1+i/Ki)
Inhibición Irreversible
  - Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo
    químico de la enzima, modificándola covalentemente

  - Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki,
   sino por una constante de velocidad ki:
                 E+I                  E’
  - A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los
    inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación
    del inhibidor.

  - Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente
    tóxicos.
Inhibidores Irreversibles

 Producen   inactivación permanente de la
  actividad enzimática
 Se interfiere con el normal desarrollo de
  una reacción o vía metabólica
 Ejemplos:         p-cloromercuribenzoato,
  yodoacetato, diisopropilfluorfosfato
Algunos tipos de inhibidores irreversibles


        1. Reactivos de grupos -SH

        2. Organofosfóricos

        3. Ligandos de metales

        4. Metales pesados
Inhibición enzimática
      alosterica
Enzimas Alostéricas
   Son enzimas cuya estructura proteica está formada
    de varias subunidades
   No se rigen por la cinética de M - M
   Además del sitio o centro activo tienen sitios
    alostéricos o de regulación
   Sitio activo/sustratos;
   Sitio alostérico/moduladores o reguladores
   La relación entre la velocidad de reacción y la
    concentración de sustrato sigue cinética sigmoídea
Enzimas alostéricas
   Las enzimas alostéricas
    presentan        estructura
    cuaternaria.
   Tienen diferentes sitios
    activos, unen mas de una
    molécula de sustrato
   La unión del sustrato es
    cooperativa
   la curva de velocidad
    presenta     una     forma
    sigmoidal
Concepto de Cooperatividad
 La unión de los sustratos al sitio activo de
  una subunidad produce un cambio
  conformacional que por contacto físico se
  transmite a las subunidades vecinas,
  facilitando las interacciones
 Modelos de unión: secuencial y concertado

 Ejemplos: unión Hb-O , enzimas alostéricas y
                          2
  sus sustratos
Moduladores Alostéricos

 También   reciben el nombre de efectores
  y pueden ser positivos o negativos
 Se unen al sitio alostérico que puede
  estar en la misma subunidad que tiene al
  sitio activo o en las subunidades
  regulatorias
 Su     unión    produce    un      cambio
  conformacional que afecta al sitio activo
Aspartato Transcarbamilasa

 Ác  L-asp + Carbamil-P === Carbamil-
  asp + Pi . Primera reacción en la síntesis
  de pirimidinas
 Efector positivo: CTP
     Efector negativo: ATP
 Tiene dos subunidades catalíticas para
  los sustratos y tres subunidades
  regulatorias para los efectores
RESUMEN

 Las  enzimas son proteínas que catalizan
  las reacciones biológicas
 Presentan especificidad por su sustrato

 Cada enzima presenta dos parámetros
  importantes Vmax (saturación de la
  enzima) y la Km (medida de la afinidad
  por el sustrato)
RESUMEN

 La    actividad enzimática puede ser
  inhibida, por inhibidores competitivos
  (similares al sustrato) o por inhibidores
  no competitivos.
 La temperatura y el pH afectan a la
  enzima en su actividad catalítica.
 Algunas       enzimas    requieren     de
  coenzimas y/o cofactores para su
  actividad.
Enzimas: catalizadores de la vidaDOCUMENTOENZIMASLas enzimas son proteínas   Catalizan reacciones químicas necesarias    para la sobrevivencia celular    Sin las enzimas los procesos biológicos    serían tan lentos que las células no podrían    existir.   Las enzimas pueden actuar dentro de la    célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo.E + S ES

Contenu connexe

Tendances (20)

Regulación alostérica
Regulación alostéricaRegulación alostérica
Regulación alostérica
 
Identificacion de lipidos
Identificacion de lipidosIdentificacion de lipidos
Identificacion de lipidos
 
5.2 clasificación de las enzimas
5.2 clasificación de las enzimas5.2 clasificación de las enzimas
5.2 clasificación de las enzimas
 
Presentación de aminoácidos
Presentación de aminoácidosPresentación de aminoácidos
Presentación de aminoácidos
 
19. metabolismo del glucogeno
19.  metabolismo del glucogeno19.  metabolismo del glucogeno
19. metabolismo del glucogeno
 
Enzimas
EnzimasEnzimas
Enzimas
 
Rutas del metabolismo carbohidratos
Rutas del metabolismo carbohidratosRutas del metabolismo carbohidratos
Rutas del metabolismo carbohidratos
 
Glucogenolisis expo.
Glucogenolisis expo.Glucogenolisis expo.
Glucogenolisis expo.
 
Metabolismo.de.purinas.857553965
Metabolismo.de.purinas.857553965Metabolismo.de.purinas.857553965
Metabolismo.de.purinas.857553965
 
Lipoproteínas, composición, función, tipos y su transporte.
Lipoproteínas, composición, función, tipos y su transporte.Lipoproteínas, composición, función, tipos y su transporte.
Lipoproteínas, composición, función, tipos y su transporte.
 
Bioenergetica y glucolosis
Bioenergetica y glucolosisBioenergetica y glucolosis
Bioenergetica y glucolosis
 
UAS Enzimas
UAS EnzimasUAS Enzimas
UAS Enzimas
 
Mapa metabolico
Mapa metabolico Mapa metabolico
Mapa metabolico
 
Mitocondria y Cadena Respiratoria
Mitocondria y Cadena RespiratoriaMitocondria y Cadena Respiratoria
Mitocondria y Cadena Respiratoria
 
Ciclo de krebs
Ciclo de krebsCiclo de krebs
Ciclo de krebs
 
Curso Bioquímica 14-Glicólisis
Curso Bioquímica 14-GlicólisisCurso Bioquímica 14-Glicólisis
Curso Bioquímica 14-Glicólisis
 
Enzimas
EnzimasEnzimas
Enzimas
 
Enzimas 3
Enzimas 3Enzimas 3
Enzimas 3
 
Regulacion enzimatica
Regulacion enzimaticaRegulacion enzimatica
Regulacion enzimatica
 
Grupos prostéticos asociados a proteínas
Grupos prostéticos asociados a proteínasGrupos prostéticos asociados a proteínas
Grupos prostéticos asociados a proteínas
 

En vedette

Inocuidad y contaminacion alimentaria
Inocuidad y contaminacion alimentariaInocuidad y contaminacion alimentaria
Inocuidad y contaminacion alimentariaAna Dominguez
 
06 cinética enzimática
06 cinética enzimática06 cinética enzimática
06 cinética enzimáticasoletik
 
Alimentos. Cadena Alimenticia. Contaminación.
Alimentos. Cadena Alimenticia. Contaminación.Alimentos. Cadena Alimenticia. Contaminación.
Alimentos. Cadena Alimenticia. Contaminación.Cynthia0609
 
Enzimas
EnzimasEnzimas
Enzimasu.una
 
Reacciones enzimaticas
Reacciones enzimaticasReacciones enzimaticas
Reacciones enzimaticasrenomberto
 
Agua en alimentos iagi 10 2
Agua en alimentos iagi 10 2Agua en alimentos iagi 10 2
Agua en alimentos iagi 10 2Man Fenix
 
La actividad de agua (aw) y el deterioro de los alimentos
La actividad de agua (aw) y el deterioro de los alimentosLa actividad de agua (aw) y el deterioro de los alimentos
La actividad de agua (aw) y el deterioro de los alimentosLabFerrer LabFerrer
 
Diapositiva contaminacion cruzada
Diapositiva contaminacion cruzadaDiapositiva contaminacion cruzada
Diapositiva contaminacion cruzadaBill Morales
 
3. Balance De EnergíA
3.  Balance De EnergíA3.  Balance De EnergíA
3. Balance De EnergíAHeinz Lopez
 
Banco de preguntas de biología 1
Banco de preguntas de biología 1Banco de preguntas de biología 1
Banco de preguntas de biología 1William Duque
 

En vedette (20)

Bases inter fr
Bases inter frBases inter fr
Bases inter fr
 
Descubrimiento de las celulas
Descubrimiento de las celulasDescubrimiento de las celulas
Descubrimiento de las celulas
 
Inocuidad y contaminacion alimentaria
Inocuidad y contaminacion alimentariaInocuidad y contaminacion alimentaria
Inocuidad y contaminacion alimentaria
 
06 cinética enzimática
06 cinética enzimática06 cinética enzimática
06 cinética enzimática
 
Teoria celular
Teoria celularTeoria celular
Teoria celular
 
Etas 3
Etas 3Etas 3
Etas 3
 
Celula y sus Organelos
Celula y sus OrganelosCelula y sus Organelos
Celula y sus Organelos
 
Caries y saliva
Caries y salivaCaries y saliva
Caries y saliva
 
Bromatologia 2012
Bromatologia 2012Bromatologia 2012
Bromatologia 2012
 
Alimentos. Cadena Alimenticia. Contaminación.
Alimentos. Cadena Alimenticia. Contaminación.Alimentos. Cadena Alimenticia. Contaminación.
Alimentos. Cadena Alimenticia. Contaminación.
 
Enzimas
EnzimasEnzimas
Enzimas
 
Reacciones enzimaticas
Reacciones enzimaticasReacciones enzimaticas
Reacciones enzimaticas
 
Enzimas y actividad enzimatica
Enzimas y actividad enzimaticaEnzimas y actividad enzimatica
Enzimas y actividad enzimatica
 
Agua en alimentos iagi 10 2
Agua en alimentos iagi 10 2Agua en alimentos iagi 10 2
Agua en alimentos iagi 10 2
 
La actividad de agua (aw) y el deterioro de los alimentos
La actividad de agua (aw) y el deterioro de los alimentosLa actividad de agua (aw) y el deterioro de los alimentos
La actividad de agua (aw) y el deterioro de los alimentos
 
Balance de Energia - Introduccion
Balance de Energia - IntroduccionBalance de Energia - Introduccion
Balance de Energia - Introduccion
 
Diapositiva contaminacion cruzada
Diapositiva contaminacion cruzadaDiapositiva contaminacion cruzada
Diapositiva contaminacion cruzada
 
3. Balance De EnergíA
3.  Balance De EnergíA3.  Balance De EnergíA
3. Balance De EnergíA
 
Clase de termoquimica
Clase de termoquimicaClase de termoquimica
Clase de termoquimica
 
Banco de preguntas de biología 1
Banco de preguntas de biología 1Banco de preguntas de biología 1
Banco de preguntas de biología 1
 

Similaire à Enzimas: catalizadores de la vidaDOCUMENTOENZIMASLas enzimas son proteínas Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia celular  Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las células no podrían existir. Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo.E + S ES

Similaire à Enzimas: catalizadores de la vidaDOCUMENTOENZIMASLas enzimas son proteínas Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia celular  Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las células no podrían existir. Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo.E + S ES (20)

enzimas.ppt
enzimas.pptenzimas.ppt
enzimas.ppt
 
Enzimas
EnzimasEnzimas
Enzimas
 
Clase 5 enzimas
Clase 5 enzimasClase 5 enzimas
Clase 5 enzimas
 
enzimas enf.ppt
enzimas enf.pptenzimas enf.ppt
enzimas enf.ppt
 
Enzimas
EnzimasEnzimas
Enzimas
 
Enzimas 2012 1
Enzimas 2012 1Enzimas 2012 1
Enzimas 2012 1
 
ENZIMAS PRINCIPALES EN EL SER HUMANO/ BIOQUÍMICA
ENZIMAS  PRINCIPALES EN EL SER HUMANO/ BIOQUÍMICAENZIMAS  PRINCIPALES EN EL SER HUMANO/ BIOQUÍMICA
ENZIMAS PRINCIPALES EN EL SER HUMANO/ BIOQUÍMICA
 
ENZIMAS PRINCIPALES EN EL SER HUMANO/ BIOQUÍMICA
ENZIMAS  PRINCIPALES EN EL SER HUMANO/ BIOQUÍMICAENZIMAS  PRINCIPALES EN EL SER HUMANO/ BIOQUÍMICA
ENZIMAS PRINCIPALES EN EL SER HUMANO/ BIOQUÍMICA
 
enzimología clínica
enzimología clínicaenzimología clínica
enzimología clínica
 
Cinetica enzimatica 2 2011
Cinetica enzimatica 2 2011Cinetica enzimatica 2 2011
Cinetica enzimatica 2 2011
 
Enzimas 1
Enzimas 1Enzimas 1
Enzimas 1
 
Enzimas.pptx
Enzimas.pptxEnzimas.pptx
Enzimas.pptx
 
Introducción al metabolismo
Introducción al metabolismoIntroducción al metabolismo
Introducción al metabolismo
 
Aminoacidos 15 i
Aminoacidos 15 iAminoacidos 15 i
Aminoacidos 15 i
 
Aminoacidos 15 i
Aminoacidos 15 iAminoacidos 15 i
Aminoacidos 15 i
 
Unidad III cinetica enzimatica
Unidad III cinetica enzimaticaUnidad III cinetica enzimatica
Unidad III cinetica enzimatica
 
Enzimas.pptx
Enzimas.pptxEnzimas.pptx
Enzimas.pptx
 
Enzimas
EnzimasEnzimas
Enzimas
 
Filosofia de la salud Conociendo a las enzimas
Filosofia de la salud  Conociendo a las enzimasFilosofia de la salud  Conociendo a las enzimas
Filosofia de la salud Conociendo a las enzimas
 
Enzimología (Parte 1)
Enzimología (Parte 1)Enzimología (Parte 1)
Enzimología (Parte 1)
 

Enzimas: catalizadores de la vidaDOCUMENTOENZIMASLas enzimas son proteínas Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia celular  Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las células no podrían existir. Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo.E + S ES

  • 2. Las enzimas son proteínas  Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia celular  Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las células no podrían existir.  Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo. E + S ES EP  E + P E E E E
  • 3. La enzima disminuye la energía de activación Sin enzima Con enzima • La Ea de la hidrólisis de la urea baja de 30 a 11 kcal/mol con la E+S acción de las enzimas, acelerando la reacción 1014 x • El aumento de temperatura necesario para producir la reacción E+P no catalizada seria de 529ºC Tiempo de la reacción
  • 4. Enzima - Catalizador  Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una reacción química.  Una enzima puede transformar 1000 moléculas de sustrato/ segundo  Las enzimas tienen 3 propiedades que los catalizadores NO tienen • Especificidad por el sustrato • Se inactivan por desnaturación • Pueden ser reguladas
  • 5.
  • 6. Las enzimas se unen a los reactivos (sustratos) reduciendo la energía de activación  Cada enzima tiene una forma única con un sitio o centro activo en el que se une al sustrato  Después de la reacción, enzimas y productos se separan.  Las moléculas enzimáticas no han cambiado después de participar en la reacción
  • 7. Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a: • Fijación estereoquímicamente complementaria del substrato • Transformación catalítica del mismo En ambas funciones participan: • Cadenas laterales de los aminoácidos • Grupos o moléculas no proteicas:  Grupos prostéticos  Iones metálicos  Cofactores
  • 8. Los siguientes hechos:  Especificidad de la reacción enzimática  Carácter heterogéneo de la catálisis enzimática Nos llevan a postular la existencia de un Centro Activo en la molécula de enzima, capaz de:  Fijar específicamente al substrato  Transformarlo catalíticamente.
  • 9. Enzima Sustrato Sitio activo
  • 10. La unión del sustrato es muy específica  Complementariedad geométrica  Complementariedad de cargas, uniones iónicas  Modelos:  Encaje inducido  Llave – cerradura.  Estado de transición
  • 11. Teorías de la acción enzimática, 1 Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer) Substrato y enzima se acoplan de forma estereospecífica, de la misma manera que una llave se ajusta a su cerradura. Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se considera insuficiente al no explicar algunos fenómenos de la inhibición enzimática
  • 12. Teorías de la acción enzimática, 2 Modelo de Ajuste Inducido (Koshland) Tanto la enzima como el substrato sufren una alteración en su estructura por el hecho físico de la unión. Está mucho más de acuerdo con todos los datos experimentales conocidos hasta el momento.
  • 13. Teorías de la acción enzimática, 3 Estabilización del Estado de Transición La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad definiendo la acción enzimática como Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad complementario no al substrato o al producto, sino al estado de transición entre ambos.
  • 14. Una enzima puede unir dos sustratos en su sitio activo
  • 16. Clasificación y nomenclatura Nombre sistemático: Grupo transferido ATP: hexosa fosfotransferasa Donador Aceptor Tipo de reacción catalizada Grupos Número Enzyme Commission: químicos Enzyme EC 2.7.1.1 Enzimas Comission Subgrupo Grupo Nombre común (sustrato+”asa”): Hexokinasa
  • 17. Clasificación y nomenclatura Clasificación de enzimas por Grupos EC 1.x ⇒ Oxidorreductasas EC 2.x ⇒ Transferasas EC 3.x ⇒ Hidrolasas EC 4.x ⇒ Liasas EC 5.x ⇒ Isomerasas EC 6.x ⇒ Ligasas
  • 18. Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de oxigeno ó hidrogeno son trasladados entre moléculas: Ared + Box Aox + Bred AH2 + B A + BH2 En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez el aceptor y el dador electrónico.
  • 19. Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa β-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa EC 1.1.3.4 Dador Aceptor Nombre común: Glucosa oxidasa
  • 20. Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas: EC 1.1.x - Deshidrogenasas EC 1.2.x - Oxidasas EC 1.3.x - Peroxidasas EC 1.4.x - Oxigenasas EC 1.5.x - Hidroxilasas EC 1.6.x - Reductasas etc. Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa Deslignificación ó Bioblanqueamiento
  • 21. Clasificación y nomenclatura Grupo 2: Transferasas Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó grupo de átomos entre moléculas: A-X + B A + B-X Dador: Aceptor Grupo transferido - transferasa ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa EC 2.7.1.1 Nombre común: hexokinasa
  • 22. Clasificación y nomenclatura Grupo 2: Transferasas Clasificación de subgrupo de las transferasas: EC 2.1.x - Grupos monocarbonados EC 2.2.x - Grupos aldehido o ceto EC 2.3.x - Aciltransferasas EC 2.4.x - Glicosiltransferasas EC 2.5.x - Alquil- o Ariltransferasas EC 2.6.x - Grupos nitrogenados EC 2.7.x - Grupos fosfato EC 2.8.x - Grupos sulfato EC 2.9.x - Grupos selenio Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos
  • 23. Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son las más comunes en el dominio de la tecnología enzimática: A-B + H2O A-OH + H-B No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4.
  • 24. Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Clasificación de las hidrolasas: 3.1.-.- Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas) 3.2.-.- Glicosidasas 3.3.-.- Éter hidrolasas 3.4.-.- Péptido hidrolasas 3.5.-.- Acil anhídrido hidrolasas etc. Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos Proteasas → Fabrico de quesos Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de aromas en los vinos; aplicaciones textiles
  • 25. Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Caso particular ⇒ Péptido hidrolasas: clasificación común (no sistemática) I. Según la situación del enlace atacado: - Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas) - Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas) II. Según el mecanismo catalítico: - Serin proteinasas - Tiol proteinasas - Aspartil proteinasas - Metaloproteinasas
  • 26. Clasificación y nomenclatura Grupo 4: Liasas Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de átomos del sustrato (este grupo no incluye las hidrolasas): A-B A+B Ejemplo Nombre sistemático: Histidina amonio-liasa (EC 4.3.1.3) Nombre común: Histidasa
  • 27. Clasificación y nomenclatura Grupo 4: Liasas Clasificación de las liasas: 4.1.x - Actúan sobre enlaces C-C 4.2.x - Actúan sobre enlaces C-O 4.3.x - Actúan sobre enlaces C-N 4.4.x - Actúan sobre enlaces C-S 4.5.x - Actúan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-) 4.6.x - Actúan sobre enlaces P-O 4.99.x - Otras liases Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables (ceras, pectinas, proteínas) en fibras en la industria textil – “bioscouring”
  • 28. Clasificación y nomenclatura Grupo 5: Isomerasas Catalizan reacciones de isomerización moleculares A B Ejemplo: Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)
  • 29. Clasificación y nomenclatura Grupo 5: Isomerasas Clasificación de las isomerasas: 5.1.x - Rasemasas y Epimerasas 5.2.x - cis-Trans-Isomerasas 5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular 5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases) 5.5.x - Liasas Intramoleculares 5.99.x - Otras Isomerasas
  • 30. Clasificación y nomenclatura Grupo 6: Ligasas Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.). A + B + ATP A-B + ADP + Pi Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6.2.2.3) Nombre sistémico: G-L-glutamilo-L-cisteina:glicina ligase
  • 31. Clasificación y nomenclatura Grupo 6: Ligasas Clasificación de las ligasas: 6.1.x - Forman enlaces C-O 6.2.x - Forman enlaces C-S 6.3.x - Forman enlaces C-N 6.4.x - Forman enlaces C-C 6.5.x - Forman enlaces ésteres fosfóricos 6.6.x - Actúan sobre enlaces N-metal
  • 33. Cinética Enzimática  La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de cada uno de los factores que intervienen en la actividad enzimática, que se evalúa a través de la velocidad de la reacción catalizada.  Las variables más importantes son: • Concentración de enzima, sustratos y productos (incluyendo inhibidores y/o activadores) • pH • Temperatura
  • 34. Ella está basada en la medición de la velocidad de reacción. Así en la reacción: E S P  Se tendrá: dp ds v= =− dt dt  Como se observa en la figura, la velocidad de reacción (pendiente) disminuye continuamente a partir de un valor máximo inicial. Esto se puede deber a:  Desaturación de la enzima con sustrato, por disminución de la concentración del sustrato  Inactivación de la enzima por su inherente inestabilidad  Inhibición por el producto  Desplazamiento del equilibrio, si la reacción es reversible
  • 36. . . . Efecto de la concentración de substrato v . . . . . [s]
  • 37. Concepto de velocidad inicial d[P] [ ] v = dt , t 0 p s t
  • 38. Una cinética hiperbólica implica un proceso saturante: Hay un número limitado de sitios en la enzima para fijar substrato; una vez que están ocupados todos, por mucho que aumente la concentración de substrato, la velocidad permanecerá constante tendiendo a un valor asintótico k+1 k+2 E+S ES E+P k-1
  • 39. El sistema de ecuaciones diferenciales que describe la dinámica del sistema k+1 k+2 E+S ES E+P k-1 Sistema No admite solución analítica. - Simulaciones numéricas - Hipótesis que lo simplifiquen
  • 40. Hipótesis de Michaelis - Menten k+1 k+2 E+S ES E+P k-1 - La primera parte del mecanismo, k+1 E+S ES k-1 Tiene lugar mucho más rápidamente que la segunda: k+2 ES E+P
  • 41. Hipótesis de Michaelis-Menten [ E ][ S ] e s ( e 0 − x ) s Km = = = Equilibrio rápido [E S ] x x e0s x = K m + s V m ax s v = k x v = K m + s +2 k +2 e 0 s v = K m + s k +2 e 0 = V m ax
  • 42. Hipótesis de estado estacionario Según veíamos en la simulación numérica, hay un tiempo relativamente prolongado en el curso de la reacción en el que la variación de complejo [ES] es prácticamente igual a cero: dx/dt = k+1es - (k-1 + k+2) x = 0 A partir de esta expresión podemos llegar a obtener una expresión que nos da la velocidad para la concentración de substrato
  • 43. dx = 0 = k +1e s − (k −1 + k +2 )x dt k +1e s = k +1 (e 0 − x )s = (k −1 + k +2 )x e0s e0s x = + k +2 = V m ax s k −1 + s Km + s v = k +1 Km + s v = k +2 x Hipótesis de estado estacionario k +2 e 0 = V m ax
  • 44. A partir de las suposiciones de Michaelis-Menten y Estado estacionario, llegamos a la ecuación Vmax * s v= Km + s La única diferencia radica en el significado de Km: Km = k-1/k+1 en mecanismo de M.M. Km = (k-1 + k+2)/k+1 en mecanismo de E.E.
  • 45. Significado de la constante Km 1. Constante de equilibrio de disociación del complejo ES (en condiciones de equilibrio rápido) 2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato (en condiciones de equilibrio rápido) 3. Mide la función de fijación (en cond.de equilibrio rápido) 4. Concentración de substrato para la que la velocidad se hace igual a la mitad de la máxima (s0.5) 5. Se define para una pareja enzima-substrato 6. Se mide en unidades de concentración
  • 46. Significado de la constante Vmax = k+2 e0 1. Velocidad asintótica para s 2. Directamente proporcional a la concentración de enzima (hoy se prefiere caracterizar a la enzima por k+2) 3. Mide función de transformación catalítica 4. Se expresa en unidades de velocidad
  • 47. Relación entre Km y Vmax Michaelis y Menten Velocidad de la reacción (v) Vmax Vmax/2 Km Concentración de Sustrato [S] La Km es la concentración de sustrato donde se obtiene la mitad de la Vmax
  • 48. Vmax Velocidad de la reacción (v) Vmax/2 Km Concentración de Sustrato [S] A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato
  • 49.
  • 50. Representación directa v 100 Vmax 80 60 V s v = m x 40 K m + s 20 s 0 0 20 40 60 80 100 Km
  • 51. Representación Lineweaver-Burke 1/Vmax 1 Km 1 1 -1/Km = ⋅ + v V mx s V mx
  • 52. Representación Hanes x ma 1/V s 1 K m = ⋅s + -Km v V mx V mx
  • 53. Representación de Eadie-Hofstee Vmax v v = −K m ⋅ +V m x -K s m
  • 54. Métodos de linealización para determinación parámetros cinéticos Método Eje Y Eje X Intercepto Intercepto Pendiente Eje Y Eje x Lineweaver- 1/v 1/s 1/V -1/K K/V Burke Hanes s/v s K/V -K 1/V Eadie- v v/s V V/K -K Hofstee
  • 55. Definición Actividad Enzimática  Es el número de moles de sustrato que reaccionan para formar producto, por mol de enzima y por unidad de tiempo. Esto supone que la enzima está plenamente saturada con sustrato y por tanto que la reacción se efectúa con su máxima rapidez  El índice de recambio muestra la eficiencia impresionante de la catálisis enzimática
  • 56.  A fin de normalizar la medición de la actividad, se ocupa el valor de la velocidad inicial de reacción, donde eses factores son despreciables. Así,  dp   ds  a = vt →0 =   = −   dt t →0  dt t →0  Esta velocidad inicial no se espera que sea observada en un proceso enzimático donde, debido a los elevados tiempos de operación, es razonable suponer que esos factores ejercerán su influencia.
  • 57. Cálculo de Actividad Enzimática  La velocidad de reacción catalizada por 0,1ml de una dilución 1:100 de Fosfatasa Alcalina es 0,3umoles / min. de producto. ¿Cuál es su actividad enzimática?  0,1ml-------- 0,3umoles producto / min. 1,0ml------------3,0umoles producto / min. dil 1:100------------- 300umoles producto / min. Respuesta: 300U/ml
  • 58. Número o Índice de Recambio  Es útil definir una constante de velocidad más general, k cat , para describir la velocidad limitante de cualquier reacción enzimática a saturación  kcat x Et= Vmáx  V0 = k cat x Et x [S] / KM + [S];  Kcat es una constante de velocidad de 1er orden con unidades de tiempo-1, también llamada Número de Recambio
  • 59. Efecto del pH en la ENZIMA Cada enzima tiene un pH óptimo para su actividad El pH afecta las interacciones iónicas
  • 60. Efecto del pH 1. Sobre la fijación del substrato al centro activo: - Grupos disociables de la enzima - Grupos disociables del substrato 2. Sobre la transformación catalítica del substrato 3. Sobre la estructura de la proteína enzimática
  • 61. En el efecto de la temperatura hay dos componentes: 1. Aceleración de la reacción según la ecuación de Arrhenius k = A exp (-Ea/RT) 2. Desnaturalización térmica de la proteína
  • 62. Efecto de la temperatura en la ENZIMA Aumento de la Desnaturación velocidad por calor 15º 40º 75º Temperatura Cada enzima tiene una temperatura óptima.
  • 63. ORGANISMOS TERMÓFILOS  Son organismos que viven a altas tº y realizan sus reacciones enzimáticas a estas altas tº  Ejemplos son los que viven en las aguas termales  Es tema de investigación el aislamiento de las enzimas de estos organismos para desarrollar procesos industriales en condiciones más extremas
  • 64. Coenzimas  Las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas, que se unen a la enzima.  Las coenzimas colaboran en la reacción enzimática recibiendo transitoriamente algún grupo químico: H+ , OH, CH3 .  Laenzima sin la coenzima recibe el nombre de APOENZIMA
  • 65. El NAD es una coenzima aceptora de H Sustrato oxidado
  • 66. Algunas enzimas requieren metales para mejorar su actividad
  • 67.
  • 68. Isoenzimas o Isozimas  Son formas moleculares diferentes de una misma enzima  Catalizan la misma reacción  Ejemplo: Lactato deshidrogenasa  Lactato + NAD ==== Piruvato + NADH  M4, M3H1, M2H2, M1H3 y H4  Se diferencian por su movilidad electroforética  Usadas en clínica: sueros normales y sueros con alguna patología
  • 69.  Así esta actividad corresponde al máximo potencial catalítico que las enzimas poseen para un determinado conjunto de condiciones ambientales. Luego, estas deben ser consideradas en las expresiones matemáticas representativas del proceso enzimático.  Existen situaciones (sustratos heterogéneos) donde la velocidad inicial de reacción no es representativa del real potencial catalítico de la enzima.  Se asume que la velocidad inicial de reacción es proporcional a la concentración de proteína enzimática.
  • 71. Inhibidor: Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de interacciones con el centro activo u otros centros específicos (alostéricos). Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores: I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula, causando un cambio conformacional con repercusión negativa en la actividad enzimática.
  • 72. Inhibición enzimática isostérica
  • 73. Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos: 1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre, con el complejo enzima-substrato o con ambos: E+I EI ES + I ESI 2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima: E+I E’
  • 74. Inhibición reversible (a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre, impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva (b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción catalítica: Inhibición No Competitiva (c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se conoce como Inhibición Anticompetitiva
  • 76. Inhibidores Competitivos  Compiten con el sustrato por el sitio activo de la enzima  Se une solo a la enzima libre V máx no se altera y K M cambia
  • 77. Inhibición competitiva Al aumentar la cantidad de SUSTRATO el inhibidor competitivo es desplazado y se forma producto
  • 78.
  • 79. S E ES E+P I Se define una constante de [E] [I] equilibrio de disociación del Ki = [EI] EI inhibidor: Características: - Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas - A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibición - Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del substrato. - El inhibidor es tan específico como el substrato
  • 80. En condiciones de equilibrio rápido, llamando y a la concentración del complejo EI, para la inhibición competitiva obtenemos el siste- ma de ecuaciones (e0 − x − y )s K m = x De donde (e0 − x − y )i Ki = y V s v = m x Que resuelto para x nos da  i  e0s K m 1 +  + s x =  Ki  i  K m 1 +  + s  Ki
  • 81. Por tanto, en la inhibición competitiva, 1. El efecto cinético del inhibidor es el aumento aparente de la Km, que aparece multiplicada por el factor (1 + i/Ki) 2. La Vmax no aparece modificada; para concentraciones muy altas del substrato, v = Vmax, igual que en ausencia de inhibidor 3. Cuanto más pequeño sea el valor de Ki mayor será la potencia del inhibidor competitivo.
  • 82. Sin inhibidor Con inhibidor El inhibidor competitivo aumenta la Km Km Km Sin con inhibidor inhibidor
  • 83. Inhibición competitiva - Representación recíproca doble 0.07 1/v 0.06 0.05 0.04 0.03 1/Vmax 0.02 -1/Km 0.01 1/s 0.00 -0.3 -0.2 -0.1 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 -1/(Km(1 + i/Ki))
  • 84. Ejemplo Inhibidor Competitivo  Ácidosuccínico + FAD == ácido fumárico + FADH2  El inhibidor competitivo es el ácido malónico  Es un análogo estructuralmente parecido al ácido succínico
  • 85. Ácido Fólico y Sulfanilamida  La sulfanilamida es un análogo estructural del ácido p - aminobenzoico (PABA)  PABA es el punto de partida para la síntesis de ácido fólico en las bacterias  El ácido fólico es una vitamina esencial para la proliferación (división) bacteriana  Sulfanilamida se usa en el tratamiento algunas infecciones
  • 86. Metotrexato y Dihidrofolato  El ácido fólico en sus formas de dihidro y tetrahidrofolato es coenzima de la reacción catalizada por la dihidrofolato reductasa  Esta reacción es parte del metabolismo de los nucleótidos para la síntesis de DNA  Metotrexato se usa en la terapia de algunos cánceres, inhibiendo la síntesis de DNA
  • 87. Inhibidor competitivo su estructura es similar a la del sustrato No se forma producto
  • 88.
  • 89.
  • 91. Inhibidor No Competitivo  Se une a un lugar diferente del sitio activo la enzima  Se une a la enzima libre y también al complejo enzima-sustrato  Por acción del inhibidor disminuye la V m pero el valor de Km no se altera
  • 93. Inhibidor NO competitivo El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un sitio diferente del sitio activo
  • 94.
  • 95. S E ES E+P I I Inhibición S No Competitiva EI ESI El inhibidor se fija indistintamente a la enzima libre E y al complejo enzima-substrato ES; ni el complejo EI ni el complejo ESI son productivos
  • 96.
  • 97. Inhibición Anticompetitiva o Incompetitiva
  • 98. Inhibidor Incompetitivo En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro activo pero solo después de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto, inhibidor y sustrato no compiten. De esta manera, aunque todo el sustrato esté saturando la enzima y toda la enzima esté como complejo ES, el inhibidor puede enlazarse produciendo un complejo inactivo ESI. Como I solo se une a ES estimula la formación de ES y, por tanto, incrementa la unión del sustrato a la enzima, disminuyendo Km . Sin embargo, el complejo ESI no conduce a productos y Vm disminuye.
  • 99. Inhibidor Incompetitivo  Se une a un lugar diferente del sitio activo de la enzima  Se une sólo al complejo enzima-sustrato  Los efectos que tiene: disminuye el valor de Km y también el de Vmáx
  • 100. S E ES E+P I Inhibición Anticompetitiva ESI El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES; el complejo ESI no es productivo
  • 101. Determinación de parámetros cinéticos de inhibición Modelo Kap Vap Inh comp Km(1+i/Ki) Vm Inh no comp total Km Vm/(1+i/Ki) Inh anticomp Km/(1+i/Ki) Vm/(1+i/Ki)
  • 102. Inhibición Irreversible - Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo químico de la enzima, modificándola covalentemente - Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki, sino por una constante de velocidad ki: E+I E’ - A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación del inhibidor. - Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente tóxicos.
  • 103. Inhibidores Irreversibles  Producen inactivación permanente de la actividad enzimática  Se interfiere con el normal desarrollo de una reacción o vía metabólica  Ejemplos: p-cloromercuribenzoato, yodoacetato, diisopropilfluorfosfato
  • 104. Algunos tipos de inhibidores irreversibles 1. Reactivos de grupos -SH 2. Organofosfóricos 3. Ligandos de metales 4. Metales pesados
  • 105. Inhibición enzimática alosterica
  • 106. Enzimas Alostéricas  Son enzimas cuya estructura proteica está formada de varias subunidades  No se rigen por la cinética de M - M  Además del sitio o centro activo tienen sitios alostéricos o de regulación  Sitio activo/sustratos;  Sitio alostérico/moduladores o reguladores  La relación entre la velocidad de reacción y la concentración de sustrato sigue cinética sigmoídea
  • 107. Enzimas alostéricas  Las enzimas alostéricas presentan estructura cuaternaria.  Tienen diferentes sitios activos, unen mas de una molécula de sustrato  La unión del sustrato es cooperativa  la curva de velocidad presenta una forma sigmoidal
  • 108.
  • 109. Concepto de Cooperatividad  La unión de los sustratos al sitio activo de una subunidad produce un cambio conformacional que por contacto físico se transmite a las subunidades vecinas, facilitando las interacciones  Modelos de unión: secuencial y concertado  Ejemplos: unión Hb-O , enzimas alostéricas y 2 sus sustratos
  • 110. Moduladores Alostéricos  También reciben el nombre de efectores y pueden ser positivos o negativos  Se unen al sitio alostérico que puede estar en la misma subunidad que tiene al sitio activo o en las subunidades regulatorias  Su unión produce un cambio conformacional que afecta al sitio activo
  • 111. Aspartato Transcarbamilasa  Ác L-asp + Carbamil-P === Carbamil- asp + Pi . Primera reacción en la síntesis de pirimidinas  Efector positivo: CTP Efector negativo: ATP  Tiene dos subunidades catalíticas para los sustratos y tres subunidades regulatorias para los efectores
  • 112.
  • 113. RESUMEN  Las enzimas son proteínas que catalizan las reacciones biológicas  Presentan especificidad por su sustrato  Cada enzima presenta dos parámetros importantes Vmax (saturación de la enzima) y la Km (medida de la afinidad por el sustrato)
  • 114. RESUMEN  La actividad enzimática puede ser inhibida, por inhibidores competitivos (similares al sustrato) o por inhibidores no competitivos.  La temperatura y el pH afectan a la enzima en su actividad catalítica.  Algunas enzimas requieren de coenzimas y/o cofactores para su actividad.

Notes de l'éditeur

  1. Clase
  2. Clase
  3. 03_25_enzyme’s performance.jpg
  4. 03_25_enzyme’s performance.jpg