OPEN ACCESS (OA)
Les revues électroniques et l’OA : le meilleur et le pire
Hervé Maisonneuve
www.redactionmedicale.fr
Liens d’intérêts, H Maisonneuve
• Rédacteur de www.redactionmedicale.fr
• Rédacteur adjoint de
• Consultant en rédaction e...
Depuis les années 90s, instabilité du
système des revues scientifiques
• Après 200 ans de progrès réguliers, les années 90...
Les revues biomédicales
4Open Access RITME juin 2014
Les revues biomédicales
Open Access RITME juin 2014 5
http://www.articleofthefuture.com/
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Les revues ont changé
www.protocol-online.org
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Rése...
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Web 2.0
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Où sont les revues ?
Open access:
plus de 50 % de la science en 2014 ?
Open Access RITME juin 2014 9
Historique de l’Open Access
Ce mouvement n’est pas spécifique à la science
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Open access : progrès ou dangers
Deux stratégies complémentaires :
1. Self-archiving : Open archives
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Green?
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Opaque?
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• Le meilleur : je veux tout,
tout de suite et
gratuitement…
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n’importe où, et gratuitement…
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Registres de données sources (8/04/14)
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Directory of
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Repositories
DOAR
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Notebook: OpenWetWare
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Google maps : épidémiologie,
géographie, géologie,…
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Des modèles
pour
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pdf ? Et
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date’
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F1000 Research
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ORCID HM 0000-0001-8365-7558
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ResearcherID
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Lancet Oncology, 2013;14:583-589
Open Access RITME juin 2014 30
Open Access RITME juin 2014 31
Open Access RITME juin 2014 32
Open Access RITME juin 2014 33
SHERPA FACT
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• Le meilleur : je veux tout,
tout de suite et
gratuitement…
• Le pire : que d’eau, que
d’eau mais je n’ai rien à
boire…
•...
Des accidents ?
• Disparition de données, de liens hypertexte,… 404
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• Manipulation d’articles après publication
• Ma...
Gross manipulation of blots.
Rossner M, Yamada K. JCB 2004;166:11-15
© 2004 Rockefeller University Press
Open Access RITME...
Misrepresentation of immunogold data.
Rossner M, Yamada K. JCB 2004;166:11-15
© 2004 Rockefeller University Press
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Volume de l’information !
Logiciels anti-plagiat !
Open Access RITME juin 2014 39
Modèle économique en construction
• From ‘reader-pay’ to ‘author-pay’ : un progrès?
• Tout est ‘gratuit’ comme eLife, ou p...
Lancet : un modèle hybride, avec APC
‘facultatif’ de 5000 £…
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Autres ressources
• Publicitaires :
– Quel transfert des publicités du
papier à l’écran
– Mais la publicité ciblée devient...
Que payent les institutions ?
• « Double dipping » : est-ce que les institutions
ne payent pas 2 fois ?
– Abonnements
– AP...
• Le meilleur : je veux tout,
tout de suite et
gratuitement…
• Le pire : que d’eau, que
d’eau mais je n’ai rien à
boire…
•...
Peer review et électronique !
Est-il plus rapide grâce aux
nouvelles technologies ?
A-t-on plus de reviewers ?
Sont-ils ex...
Climate of the past
Open Access RITME juin 2014 46
Que penser de PLOS ONE ?
Acceptation de 70 % des articles
soumis pour PLOS ONE
APCs de 1350 $
Groupe PLOS : 32 000 article...
Où va PLOS ONE ?
Open Access RITME juin 2014 48
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10 000 revues OA
Open Access RITME juin 2014 50
Croissance articles OA chez les
éditeurs majeurs
Open Access RITME juin 2014 51
Développement gold AO
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Facteur d’impact et SIGAPS
• Impact factor : un indicateur créé dans les
années 60 pour évaluer la notoriété des
revues, a...
Nombre de citations en 2013 des articles citables en 2011 et 2012
Nombre d’articles citables en 2011 et en 2012
Tout dépen...
Facteur d’impact, SIGAPS
http://thomsonreuters.com/products_services/science/free/essays/impact_factor/
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Article Level Metrics
• ALM ou Almetrics : indicateurs au niveau des articles plutôt que
notoriété de la revue
• Compétiti...
Metrics ?
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Metrics ?
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Disparition du facteur d’impact ? Oui mais pour
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Open Access RITME juin 2014 61
Green, gold, hybrid ou ?
• Confusion des systèmes par les chercheurs qui ne
comprennent pas
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Science, October 4, 2013
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Methods
• The paper took this form: Molecule X from lichen
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Results : 255 réponses
• The final list of targets came to 304 open-access
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Des articles ont été publiés
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Qu’en conclure ? Rien ?
• ‘Science’ a été critiqué :
– L’article de Bohannon n’a pas été reviewé
– Les méthodes sont très ...
• Le meilleur : je veux tout,
tout de suite et
gratuitement…
• Le pire : que d’eau, que
d’eau mais je n’ai rien à
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Tout devient possible
• Un auteur devient ‘maison d’édition’… il
peut mettre ses données sur de nombreux
sites, avant même...
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Le meilleur, le pire ?
L’électronique ne résoudra pas les problèmes de la
science en général
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Une solution : la transparence ?
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Open Access de P Suber, MIT Press 2012
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Les revues électroniques en Open Access

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Open access: Le meilleur et le pire
- Les nouvelles fonctionnalités : je veux tout, gratuitement et tout de suite !
- Les modèles économiques font disparaître l'abonnement
- Les prédateurs et autres malveillances
- Le peer-review et le facteur d'impact souffrent !

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Les revues électroniques en Open Access

  1. 1. OPEN ACCESS (OA) Les revues électroniques et l’OA : le meilleur et le pire Hervé Maisonneuve www.redactionmedicale.fr
  2. 2. Liens d’intérêts, H Maisonneuve • Rédacteur de www.redactionmedicale.fr • Rédacteur adjoint de • Consultant en rédaction et en formation professionnelle • Membre commission HAS sur la qualité des revues (2010-2013) • Comité de rédaction de • Auteur de ‘La rédaction médicale’, Doin, 2010 • Rédacteur de ‘Science Editors’ Handbook’, EASE 2013 Open Access RITME juin 2014 2
  3. 3. Depuis les années 90s, instabilité du système des revues scientifiques • Après 200 ans de progrès réguliers, les années 90s ont apporté des changements majeurs • « L’électronique » a débuté par des pdf en ligne et en 2014 les limites entre revues, sites, blogs deviennent floues • « L’électronique » a apporté l’Open Access et avec cela le meilleur, le pire et des truands Open Access RITME juin 2014 3
  4. 4. Les revues biomédicales 4Open Access RITME juin 2014
  5. 5. Les revues biomédicales Open Access RITME juin 2014 5
  6. 6. http://www.articleofthefuture.com/ Open Access RITME juin 2014 6
  7. 7. Les revues ont changé www.protocol-online.org http://datadryad.org/ www.openwetware.org Open Access RITME juin 2014 7 Réseaux sociaux Facebook, ….. Podcasts, videos, crossref, crossmark
  8. 8. 14.1 Web 2.0 Open Access RITME juin 2014 8 Où sont les revues ?
  9. 9. Open access: plus de 50 % de la science en 2014 ? Open Access RITME juin 2014 9
  10. 10. Historique de l’Open Access Ce mouvement n’est pas spécifique à la science • 1994 : BMJ avec ELPS, Electronic Long Paper Short • 1995 : HighWire Press (Stanford University) • 1997 : Medline devient libre en tant que PubMed • 1999 : PubMed Central • 1999 : Open archives initiatives • 2000 : BioMed Central • 2001 : création de ‘Public Library of Science’, PLOS • 2001 / 2002 OMS Hinari • Des déclarations : Budapest 2002, Bethesda 2003 puis Berlin 2003,… Open Access RITME juin 2014 10
  11. 11. Open access : progrès ou dangers Deux stratégies complémentaires : 1. Self-archiving : Open archives initiative 2. Open-access journals Quel modèle économique ? Pouvez-vous définir les 3 modèles : green, gold and hybrid? Open Access RITME juin 2014 11
  12. 12. Gold? Green? Hybrid? Opaque? Open Access RITME juin 2014 12 http://www.lemonde.fr/sciences/article/2013/02/28 /a-qui-appartient-le-savoir_1840797_1650684.html
  13. 13. • Le meilleur : je veux tout, tout de suite et gratuitement… • Le pire : que d’eau, que d’eau mais je n’ai rien à boire… • Le meilleur et le pire : peer-review et almetrics • Les truands : les prédateurs peuvent tout se permettre Open Access RITME juin 2014 13
  14. 14. Le meilleur : je veux tout, tout de suite, n’importe où, et gratuitement… L’article du futur : le pdf n’aura plus d’intérêt…. clips vidéos et/ou logiciels dans les illustrations, croisement des références et tous liens sans fin… tout ceci est bientôt du passé Mais que vont faire les autres développements ? – Registres de protocoles – Registres de données sources – Registres d’archives ouvertes – Notebooks – Google maps, google scholar – les modèles type eLife ou F1000 research – ORCID – Les réseaux sociaux… Open Access RITME juin 2014 14
  15. 15. www.protocolonline.org Open Access RITME juin 2014 15
  16. 16. Registres de données sources (8/04/14) Open Access RITME juin 2014 16
  17. 17. Directory of Open Access Repositories DOAR http://www.opendoar.org/ Open Access RITME juin 2014 17
  18. 18. Notebook: OpenWetWare Open Access RITME juin 2014 18
  19. 19. Notebook: eNovalys Open Access RITME juin 2014 19
  20. 20. Open Access RITME juin 2014 20 http://www.myopennotes.org/
  21. 21. Google maps : épidémiologie, géographie, géologie,… Open Access RITME juin 2014 21 Effects of land use changes on badland erosion in clayey drainage basins, Radicofani, Central Italy
  22. 22. Revues créées par des fondations Open Access RITME juin 2014 22
  23. 23. Des modèles pour déposer ses pdf ? Et ‘prendre date’ Open Access RITME juin 2014 23
  24. 24. F1000 Research Open Access RITME juin 2014 25
  25. 25. ORCID HM 0000-0001-8365-7558 Open Access RITME juin 2014 26
  26. 26. ResearcherID Open Access RITME juin 2014 27
  27. 27. Lancet Oncology, 2013;14:583-589 Open Access RITME juin 2014 30
  28. 28. Open Access RITME juin 2014 31
  29. 29. Open Access RITME juin 2014 32
  30. 30. Open Access RITME juin 2014 33
  31. 31. SHERPA FACT Open Access RITME juin 2014 34
  32. 32. • Le meilleur : je veux tout, tout de suite et gratuitement… • Le pire : que d’eau, que d’eau mais je n’ai rien à boire… • Le meilleur et le pire : peer-review et almetrics • Les truands : les prédateurs peuvent tout se permettre Open Access RITME juin 2014 35
  33. 33. Des accidents ? • Disparition de données, de liens hypertexte,… 404 error • Manipulation d’articles après publication • Manipulation d’images en biochimie, chirurgie plastique, histologie, etc… Un plagiat sans limites, voire non dénoncé par les institutions…… Open Access RITME juin 2014 36
  34. 34. Gross manipulation of blots. Rossner M, Yamada K. JCB 2004;166:11-15 © 2004 Rockefeller University Press Open Access RITME juin 2014 37
  35. 35. Misrepresentation of immunogold data. Rossner M, Yamada K. JCB 2004;166:11-15 © 2004 Rockefeller University Press Open Access RITME juin 2014 38
  36. 36. Volume de l’information ! Logiciels anti-plagiat ! Open Access RITME juin 2014 39
  37. 37. Modèle économique en construction • From ‘reader-pay’ to ‘author-pay’ : un progrès? • Tout est ‘gratuit’ comme eLife, ou pas cher comme PeerJ (un droit à vie de 100 à 300 $) • APCs: Article Processing Charges de 500 à 9000 $ par article • Tous les modèles existent : payment en une ou plusieurs fois (soumission, acceptation, nombre de pages, illustrations,…) • Est-ce que le modèle APC influence le taux d’acceptation des articles ? Open Access RITME juin 2014 40
  38. 38. Lancet : un modèle hybride, avec APC ‘facultatif’ de 5000 £… Open Access RITME juin 2014 41
  39. 39. Autres ressources • Publicitaires : – Quel transfert des publicités du papier à l’écran – Mais la publicité ciblée devient efficace et probablement redoutable • Tirés à part : ont-ils disparu ? • Des institutions payent des droits d’accès pour les chercheurs (modèle BioMedCentral par exemple) Open Access RITME juin 2014 42
  40. 40. Que payent les institutions ? • « Double dipping » : est-ce que les institutions ne payent pas 2 fois ? – Abonnements – APCs • Ressources pour des archives ouvertes : réallocation de ressources ou nouveaux budgets ? Open Access RITME juin 2014 43
  41. 41. • Le meilleur : je veux tout, tout de suite et gratuitement… • Le pire : que d’eau, que d’eau mais je n’ai rien à boire… • Le meilleur et le pire : peer-review et altmetrics • Les truands : les prédateurs peuvent tout se permettre Open Access RITME juin 2014 44
  42. 42. Peer review et électronique ! Est-il plus rapide grâce aux nouvelles technologies ? A-t-on plus de reviewers ? Sont-ils exaspérés par les relances par les emails ? Peer-review portable (PLOS, BMJ, eLife et BMC ont un accord) Le ‘post-publication’ peer- review: un système qui ne marche pas bien Open Access RITME juin 2014 45
  43. 43. Climate of the past Open Access RITME juin 2014 46
  44. 44. Que penser de PLOS ONE ? Acceptation de 70 % des articles soumis pour PLOS ONE APCs de 1350 $ Groupe PLOS : 32 000 articles en 2013 Groupe PLOS 2012 (million $) Publication fees 36,9 Membership fee 0,3 Advertising 1,6 Total expenses 31,6 Open Access RITME juin 2014 47
  45. 45. Où va PLOS ONE ? Open Access RITME juin 2014 48
  46. 46. Open Access RITME juin 2014 49
  47. 47. 10 000 revues OA Open Access RITME juin 2014 50
  48. 48. Croissance articles OA chez les éditeurs majeurs Open Access RITME juin 2014 51
  49. 49. Développement gold AO Open Access RITME juin 2014 52
  50. 50. Facteur d’impact et SIGAPS • Impact factor : un indicateur créé dans les années 60 pour évaluer la notoriété des revues, afin d’orienter les publicités : ISI, Institute for Scientific Information (Philadelphie, USA) acheté par Thomson Reuters ; une base de données de 8000 revues scientifiques, surtout américaines • SIGAPS : Système d’Interrogation, de Gestion et d’Analyse des Publications Scientifiques, créé en 2002 au CHU de Lille, généralisé en 2008, utilisant la base MedLine (PubMed) qui contient 6000 revues de biomédecine (22 millions d’articles) 53 Open Access RITME juin 2014
  51. 51. Nombre de citations en 2013 des articles citables en 2011 et 2012 Nombre d’articles citables en 2011 et en 2012 Tout dépend de ce qui est pris en compte dans les articles « citables » ; de très nombreuses ‘manipulations’ de la part des revues Revues classées en 6 catégories : A, B, C, D, E, NC et les praticiens doivent valider leurs publications dans SIGAPS, puis agrégation par service, pôle, hôpital 54 Open Access RITME juin 2014
  52. 52. Facteur d’impact, SIGAPS http://thomsonreuters.com/products_services/science/free/essays/impact_factor/ www.sigaps.fr Des sites accessibles avec des codes 55 Open Access RITME juin 2014
  53. 53. http://altmetrics.org/manifesto/ Open Access RITME juin 2014 56
  54. 54. http://www.plosbiology.org/article/info:d oi/10.1371/journal.pbio.1001687 Open Access RITME juin 2014 57
  55. 55. Article Level Metrics • ALM ou Almetrics : indicateurs au niveau des articles plutôt que notoriété de la revue • Compétition entre plusieurs ‘systèmes’ ; BMC et PLOS contre les autres ? Open Access RITME juin 2014 58
  56. 56. Metrics ? 59Open Access RITME juin 2014
  57. 57. Metrics ? Open Access RITME juin 2014 60
  58. 58. Disparition du facteur d’impact ? Oui mais pour quels indicateurs Open Access RITME juin 2014 61
  59. 59. Green, gold, hybrid ou ? • Confusion des systèmes par les chercheurs qui ne comprennent pas • Est-ce que le gold est l’avenir ? • À moins que les archives ouvertes ne dominent les publications ? Mise en cause du peer-review, de l’open access ou du bruit pour rien dans Science en octobre 2013 ? Open Access RITME juin 2014 62
  60. 60. Science, October 4, 2013 Open Access RITME juin 2014 63
  61. 61. Methods • The paper took this form: Molecule X from lichen species Y inhibits the growth of cancer cell Z. To substitute for those variables, I created a database of molecules, lichens, and cancer cell lines and wrote a computer program to generate hundreds of unique papers. Other than those differences, the scientific content of each paper is identical. • Author: Ocorrafoo Cobange, Wassee Institute of Medicine, Asmara Open Access RITME juin 2014 64
  62. 62. Results : 255 réponses • The final list of targets came to 304 open-access publishers: 167 from the DOAJ, 121 from Beall’s list, and 16 that were listed by both. • By the time Science went to press, 157 of the journals had accepted the paper and 98 had rejected it. Of the remaining 49 journals, 29 seem to be derelict: websites abandoned by their creators. Editors from the other 20 had e-mailed the fictitious corresponding authors stating that the paper was still under review… Open Access RITME juin 2014 65
  63. 63. Des articles ont été publiés Open Access RITME juin 2014 66
  64. 64. Qu’en conclure ? Rien ? • ‘Science’ a été critiqué : – L’article de Bohannon n’a pas été reviewé – Les méthodes sont très mauvaises : pas de comparaison, mauvaises données,… • La communauté serait innocente ! – Est-ce un problème d’open access ? – Est-ce que le peer-review ne sert à rien ? – Comment travaillent les revues scientifiques ? – Peut-on améliorer le système ? Open Access RITME juin 2014 67
  65. 65. • Le meilleur : je veux tout, tout de suite et gratuitement… • Le pire : que d’eau, que d’eau mais je n’ai rien à boire… • Le meilleur et le pire : peer-review et almetrics • Les truands : les prédateurs peuvent tout se permettre Open Access RITME juin 2014 68
  66. 66. Tout devient possible • Un auteur devient ‘maison d’édition’… il peut mettre ses données sur de nombreux sites, avant même d’être reviewé.. • Des auteurs payent pour soumettre des articles à des revues dont la pérennité n’est pas assurée • Bentham, OMICS, Hindawi, etc….liste de Jeffrey Beall, Denver Open Access RITME juin 2014 69
  67. 67. Open Access RITME juin 2014 70
  68. 68. Le meilleur, le pire ? L’électronique ne résoudra pas les problèmes de la science en général • Distorsion de la science car les études positives sont publiées plusieurs fois et les études négatives peu publiées • La reproductibilité des publications n’est pas assez étudiée • 50 % des publications seraient embellies : à vérifier • Les batailles entre auteurs qui ont un effet délétère sur la sérénité des équipes de recherche continueront • Conflits d’intérêts, plagiats, mauvaises pratiques…. Open Access RITME juin 2014 71
  69. 69. Une solution : la transparence ? Open Access RITME juin 2014 72
  70. 70. Open Access de P Suber, MIT Press 2012 My honest belief from experience in the trenches is that the largest obstacle to OA is misunderstanding The largest cause of misunderstanding is lack of familiarity, and the largest cause of unfamiliarity is preoccupation Everyone is busy Open Access RITME juin 2014 73
  71. 71. Les revues ont changé www.protocol-online.org http://datadryad.org/ www.openwetware.org Open Access RITME juin 2014 74 Réseaux sociaux Facebook, ….. Podcasts, videos, crossref, crossmark
  72. 72. www.ritme.com Nicolas au 0142469874 Questions ? Open Access RITME juin 2014 75

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