1. Rcpp を使って動的もしくは共有ライブラリ
(dylib, so ファイル) を用いた関数（パッ
ケージ）を作る
S.M.
October 26, 2013

2. Rcpp with Rstudio でビルドする際に、自作でもなんでもよい
が, 共有ライブラリをリンクさせる方法. コンパイルオプション
をどこで指定したらよいかが分からなかったのでまとめておく.
ちなみに, パッケージでなく関数単位で簡易にやりたいと当初思っ
たが, どうもパッケージを作るのが簡易な方法のようである.
動作確認環境は, Rstudio 0.97.248, Rcpp 0.10.5
libhelloworld.dylib と helloworld.h を用意しておく.
内容は察して下さい.
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3. [取りあえずやってみる]
1. RStudio の Package with Rcpp を作成
2. llibhelloworld.dylib をパッケージディレクトリ直下に配置
3. src/Makevars を編集
PKG_LIBS = -lhelloworld -L..
‘$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()"‘
後はいつも通りでよい.
コンパイル時のディレクトリがパッケージ直下の src なので, -L..
とすることになる.
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4. [他の場所にあるライブラリを使いたい]
共有ライブラリをパッケージディレクトリ直下以外に置くとビル
ドできない.
例えば src に置いて, PKG_LIBS の -L.. を -L. に変えてビルド
してみるとダメ.
ビルド実行結果ログをよく見ると,
-L でライブラリの位置を正しく指定していれば, コンパイルは成
功するのだが, その後に実行される動作確認的な library() 実行
時に, 共有ライブラリにパスが通っていないためにロード出来ず, エ
ラーとなっているということが分かる.
従って, 環境変数を設定しておけばいい.
パッケージ直下にライブラリを置く方法も, パッケージ直下のディ
レクトリ外で実行すると失敗することになる.
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5. [まとめ:動的または共有ライブラリを使う方法]
1. Makevars ファイルでコンパイルオプション、特にヘッダファイ
ルの指定に PKG_CPPFLAGS を使い, ライブラリパスと名前を PKG_LIBS
で指定する.
2. 動的もしくは共有ライブラリへの実行時の参照を可能にするた
め, OS X であれば DYLD_LIBRARY_PATH を動的ライブラリの保存
場所に設定しておく. Linux なら LD_LIBRARY_PATH になる.
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6. ※参考: Writing R Extentions
http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.pdf
の Makevars ファイルに関する説明の抜粋
The most common use of a‘Makevars’file is to set additional preprocessor options (for
example include paths) for C/C++ files via PKG_CPPFLAGS, and additional compiler flags by
setting PKG_CFLAGS, PKG_CXXFLAGS, PKG_FFLAGS or PKG_FCFLAGS, for C, C++, FORTRAN
or Fortran 9x respectively (see Section 5.5 [Creating shared objects], page 101).
NB: Include paths are preprocessor options, not compiler options, and must be set in
PKG_CPPFLAGS as otherwise platform-specific paths (e.g.‘-I/usr/local/include’ will take
)
precedence.
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