1) O documento introduz conceitos básicos de taxonomia e classificação de microrganismos, incluindo bactérias, fungos, protozoários e vírus. 2) São descritos os diferentes reinos dos microrganismos de acordo com diferentes sistemas de classificação, incluindo os sete níveis taxonômicos. 3) Exemplos de classificação científica são dados para alguns gêneros de bactérias como Staphylococcus, Streptococcus e Escherichia coli.

1. INTRODUÇÃO À
MICROBIOLOGIA E
CONCEITOS EM
TAXONOMIA
Profª. Zilka Nanes Lima
FARMÁCIA - UEPB
zilkananeslima@gmail.com

2. CONCEITOS EM TAXONOMIA - Profa. Zilka Nanes Lima
• Aula predominantemente
retirada das seguintes referências:
• NEVES, D.P. – Parasitologia Humana . 12ª edição. Editora Atheneu,
2011. São Paulo – SP.
• KONEMAN – Diagnóstico Microbiológico – Texto e Atlas Colorido.
6ª edição. Editora Guanabara Koogan, 2008. Rio de Janeiro – RJ.
(Capítulos 6,12 e13)
• LEVINSON, W. – Microbiologia Médica e Imunologia. 13ª edição.
Editora ArtMed, 2016. Porto Alegre – RS.
• Classificação dos microrganismos - David Bergey's Manual -
http://www.microbiologyprocedure.com/bacterial-classification/

3. INTRODUÇÃO À MICROBIOLOGIA - Profa. Zilka Nanes Lima
Reino Micro-organismos
patogênicos
Tipo celular
Animal Helmintos Eucariótico
Vegetal Nenhum Eucariótico
Protista Protozoários
Fungos
Eucariótico
Eucariótico
Procariótico Bactérias Procariótico
Vírus Acelular
Relações biológicas entre micro-organismos patogênicos.
(Fonte: Levinson, 2010)

4. INTRODUÇÃO À MICROBIOLOGIA - Profa. Zilka Nanes Lima
Característica Vírus Bactérias Fungos Protozoários
e Helmintos
Células Ausentes Presentes Presentes Presentes
Diâmetro aproximado
(µm)
0,02-0,2 1-5 3-10 (leveduras) 15-25 (trofozoítos)
Ácido nucléico DNA ou RNA Tanto DNA como RNA Tanto DNA como RNA Tanto DNA como RNA
Tipo do núcleo Ausente Procariótico Eucariótico Eucariótico
Ribossomos Ausentes 70 S 80 S 80 S
Mitocôndrias Ausentes Ausentes Presentes Presentes
Natureza da superfície
externa
Capsídeo proteíco e
envelope lipoproteico
Parede rígida, contendo
peptidioglicano.
Parede rígida,
contendo quitina
Membrana flexível
Motilidade Nenhum Algumas Nenhum A maioria
Método de replicação Não por fissão binária Fissão binária Brotamento
(leveduras) ou Mitose
(bolores)
Mitose

5. CONCEITOS EM TAXONOMIA - Profa. Zilka Nanes Lima
• CLASSIFICAÇÃO: “É a ordenação dos
seres vivos em classes, baseando-se no
parentesco, semelhança ou ambos.”
(Simpson).
• NOMENCLATURA: “É a aplicação de
nomes distintos a cada uma das classes
reconhecidas numa dada classificação.”
(Simpson)

6. CONCEITOS EM TAXONOMIA - Profa. Zilka Nanes Lima
• TAXONOMIA: “É o estudo teórico da
classificação, incluindo as respectivas bases,
princípios, normas e regras.” (Simpson).
Reconhece, classifica e identifica os seres
vivos
• SISTEMÁTICA: “É o estudo científico das
formas de organismo, sua diversidade e toda e
qualquer relação entre elas.” (Simpson) .
Estuda as características físicas, fisiológicas
ou comportamentais para permitir a
classificação.

7. CONCEITOS EM TAXONOMIA - Profa. Zilka Nanes Lima
• A unidade taxonômica (unidade, grupo etc.)
denomina-se táxon (plural taxa), que pode
corresponder a diversos níveis de
classificação ou categoria taxonômica, que
em Microbiologia são sete:
1. Reino, 2. Filo, 3. Classe,
4.Ordem, 5. Família,
6.Genêro, 7. Espécie.

8. REINOS DOS MICRO-ORGANISMOS - Profa. Zilka Nanes Lima
• Robert Whittaker incluiu os fungos no reino Fungi ficando
3 reinos para organismos multicelulares:
Plantae Reino das Plantas
Fungi - Reino dos fungos (como leveduras e bolores)
Animalia - Reino dos animais (helmintos)
E mais dois reinos para os organismos unicelulares
ou coloniais:
Protista - Reino das Algas Unicelulares e dos Protozoários
Monera - Reino das Bactérias e Cianobactérias (ou algas
azuis)

9. REINOS DOS MICRO-ORGANISMOS - Profa. Zilka Nanes Lima
• Um outro sistema foi proposto para incluir os vírus, com seis reinos, divididos por
três super-reinos e o grupo supremo, o Super-domínio Biota:
• Super-domínio: Biota - Todos os organismos vivos, sem nenhuma exceção.
– Super-reino: Acytota - organismos acelulares (também chamado "império"
ou domínio Aphanobionta)
• Reino: Vírus - os vírus e agentes sub-virais
– Super-reino: Prokaryota - organismos sem núcleo celular organizado
• Reino: Monera - as bactérias
– Super-reino: Eukaryota - organismos com núcleo celular organizado
• Reino: Fungi - os fungos
• Reino: Metaphyta - as plantas "superiores"
• Reino: Metazoa - os animais
• Reino: Protista - os protozoários e algas unicelulares

10. REINOS DOS MICRO-ORGANISMOS - Profa. Zilka Nanes Lima
Recentemente, no entanto, novas investigações sobre
a filogenia dos organismos levaram a um novo sistema de
classificação, a cladística (sistema filogenético). A mais
importante foi a descoberta de Carl Woese, em 1977, de que
os procariotas compreendiam dois grupos distintos, a que ele
chamou Eubacteria e Archaebacteria que foram
denominadas mais tarde, por ele, como Bacteria e Archaea.
Esta descoberta levou ao sistema de
classificação cladístico dos organismos em três Domínios,
que se pretendia que fossem um substituto dos Reinos, mas
que acabou por ser usado como um "super-reino" (se bem que
ainda possa ser utilizada a proposta dos super-reinos, pois no
reino Monera os domínios Bacteria e Archaea são sub-
reinos).

11. CONCEITOS EM TAXONOMIA - Profa. Zilka Nanes Lima
• GENÊRO: Quando várias espécies
apresentam caracteres comuns para reuni-
las num grupo, dá-se a esse grupo o nome
de genêro. Dessa forma vemos que,
frequentemente, um genêro pode possuir
várias espécies ou subespécies.
• ESPÉCIE: É definida como sendo uma
coleção de indivíduos que se assemelham
tanto entre si como os seus ascendentes e
descendentes.

12. CONCEITOS EM TAXONOMIA - Profa. Zilka Nanes Lima
• SUB-ESPÉCIE: Dá-se esse nome quando
alguns indivíduos de determinada espécie
destacam-se do resto do grupo por possuírem
uma característica excepcional ou um
conjunto de pequenas diferenças da forma
específica típica, que se perpetuam nas
gerações seguintes.
• VARIEDADE : Quando a diferença é
fisiológica ou de hospedeiro.

13. CONCEITOS EM TAXONOMIA - Profa. Zilka Nanes Lima
• A nomenclatura das espécies deve ser
latina e binomial, ou seja, a espécie é
designada por duas palavras: a primeira
representa o Genêro (deve ser escrita
com a primeira letra em maiúscula); a
segunda a espécie considerada (deve ser
escrita com letra minúscula, mesmo
quando for nome de pessoa. Estas
palavras devem ser sempre sublinhadas
ou escritas em itálico.

14. Cocos Gram-positivos
• Staphylococcus
• Micrococcus
• Peptococcus
* Fonte: Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology
• Streptococcus
• Peptostreptococcus
• Enterococcus

15. ESTUDO DOS COCOS GRAM-POSITIVOS - Profa. Zilka Nanes Lima
Staphylococcus spp.
TAXONOMIA*
Reino : Bacteria
Filo : Firmicutes
Classe III: Bacilli
Ordem I: Bacillales
Família V: Staphylococcaceae
Gênero : Staphylococcus
Rosenbach 1884
* Fonte: Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology

16. ESTUDO DOS COCOS GRAM-POSITIVOS - Profa. Zilka Nanes Lima
Staphylococcus spp.
• Há mais de 30 espécies com importância clínica humana
• S. arlettae, S. aureus, S. auricularis, S. capitis, S. caprae, S. carnosus
• S. chromogenes, S. cohnii, S. condimenti, S. croceolyticus, S. delphini ,
• S. devriesei, S. epidermidis, S. equorum, S. felis, S. fleurettii, S. gallinarum,
• S. haemolyticus, S. hominis, S. hyicus, S. intermedius, S. kloosii,
• S. leei, S. lentus, S. lugdunensis, S. lutrae, S. lyticans, S. massiliensis,
• S. microti, S. muscae, S. nepalensis, S. pasteuri, S. pettenkoferi,
• S. piscifermentans, S. pseudintermedius, S. pulvereri, S. rostri
• S. saccharolyticus, S. saprophyticus, S. schleiferi, S. sciuri, S. simiae
• S. simulans, S. stepanovicii, S. succinus, S. vitulinus, S. warneri, S. xylosus
* Fonte: Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology

17. ESTUDO DOS COCOS GRAM-POSITIVOS - Profa. Zilka Nanes Lima
Streptococcus ssp.
TAXONOMIA*
Reino : Bacteria
Filo : Firmicutes
Classe : Bacilli
Ordem : Lactobacillales
Família : Streptococcacea
Gênero :Streptococcus
Rosenbach, 1884
* Fonte: Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology

18. ESTUDO DOS BASTONETES GRAM-NEGATIVOS
- Profa. Zilka Nanes Lima
Escherichia coli
TAXONOMIA*
Reino : Bacteria
Filo : Firmicutes
Classe : Bacilli
Ordem : Lactobacillales
Família : Enterobacteriaceae
Tribo: Escherichieae (Tribo I)
Gênero : Escherichia
Espécie: Escherichia coli
Rosenbach, 1884

19. CLASSIFICAÇÃO DOS
MICRO-ORGANISMOS
(BACTÉRIAS, FUNGOS, VÍRUS)
Classificação dos Micro-organismos
Professora Zilka Nanes Lima| Universidade Estadual da Paraíba
Fungos

20. CLASSIFICAÇÃO DAS BACTÉRIAS
• Baseia-se em semelhanças ou relações entre propriedades bioquímicas,
fisiológicas, genéticas e morfológicas.
• A CLASSIFICAÇÃO faz parte da Taxonomia Bacteriana assim como a
nomenclatura e a identificação dos mais variados tipos de células.
• A nomenclatura é baseada em regras internacionais e a identificação se dá
através do isolamento e uso prático de um esquema de classificação.
• Manual de Bergey de Bacteriologia Sistemática (Publicação que
auxilia a identificação das bactérias que têm sido descritas e cultivadas.
Classifica as bactérias conhecidas e torna as informações acessíveis na
forma de chaves. )
Fonte:http://www.medcenter.com/medscape/content.aspx?id=25779&langType=1046

21. CLASSIFICAÇÃO DOS FUNGOS
• Baseia-se em semelhanças ou relações entre pigmentação, temperaturas de crescimento, padrão de
conidiogênese ou esporogênese, aparência de estruturas microscópicas., entre outros fatores.
• A CLASSIFICAÇÃO faz parte da Taxonomia Fúngica assim como a nomenclatura e a identificação dos mais
variados tipos de células.
• A nomenclatura é baseada em regras internacionais e a identificação se dá através do isolamento e uso de
um esquema de classificação.
• “Estamos ainda longe de um acordo sobre uma forma definitiva de nosso esquema taxonômico (e sobre a
nomenclatura com o qual expressá-lo.)...Os fatos, por si mesmos, não criam um sistema para nós...Deve,
ainda...haver lugar para a intuição nascida da experiência. As constantes idéias divergentes expostas neste
livro mostram que o enfado decorrente da unanimidade e da uniformidade ainda não se estabeleceu entre os
micologistas.
• International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants
(Melbourne Code)
• Fonte: Fisher; Cook – Micologia, fundamentos e diagnóstico.

22. CLASSIFICAÇÃO DOS VÍRUS
• Baseia-se em semelhanças ou relações entre propriedades físico-químicas,
bioquímicas, propriedades antigênicas e biológicas, genéticas, e
morfológicas.
• A CLASSIFICAÇÃO faz parte da Taxonomia Viral assim como a nomenclatura
e a identificação dos mais variados tipos de partículas virais.
• A nomenclatura é baseada em regras internacionais e a identificação se dá
através do isolamento e uso prático de um esquema de classificação.
• Internacional Committee on Taxonomy of Viruses - ICTV
(Organizam os vírus em níveis hierárquicos de ordem, família, subfamília,
gênero e espécie, além de níveis mais baixos na hierarquia, como
subespécies, estirpes, variantes, grupos e subgrupos.)
Fonte: Santos; Romanos; Wigg – Introdução à Virologia Humana – Segunda edição.

24. ALGUMAS DEFINIÇÕES IMPORTANTES
PARA ENTENDER CLASSIFICAÇÃO
• SISTEMÁTICA: estuda a diversidade biológica denominando e
classificando os organismos segundo sua história evolutiva.
• TAXONOMIA: É a "arte" de identificar, denominar e classificar
grupos de organismos. A identificação é o reconhecimento de
que um grupo de organismos é idêntico ou semelhante a outro
já conhecido.

25. ALGUMAS DEFINIÇÕES IMPORTANTES
PARA ENTENDER CLASSIFICAÇÃO
•DOMÍNIO: é a designação dada em microbiologia ao taxon de nível mais
elevado utilizado para agrupar os organismos numa classificação científica.
•REINO: É a categoria hierárquica alta de classificação científica
dos microrganismos.
•FILO: Os filos são os agrupamentos que levam em consideração os seus
traços evolutivos dos microrganismos , a sua estrutura e ancestralidade.
•CLASSE: É o sistema taxonômico de maior hierarquia mais utilizado na
microbiologia básica.
•ORDEM: Agrupa famílias constituídas por espécies que apresentam entre si
um elevado grau de semelhança morfofuncional.

26. ALGUMAS DEFINIÇÕES IMPORTANTES PARA ENTENDER
CLASSIFICAÇÃO
•FAMÍLIA: A família agrupa um conjunto de gêneros, ou de sub-famílias, e
está incluída em ordens.
•TRIBO: Quando uma clade, que é um grupo de organismos originados de um
único ancestral comum exclusivo, precisa de mais subdivisão na taxonomia.
•GÊNERO: Agrupa um conjunto de espécies que partilham um conjunto muito
alargado de características morfológicas e funcionais, um genoma com
elevadíssimo grau de comunalidade e uma proximidade filogenética muito
grande, refletida pela existência de ancestrais comuns muito próximos.
•ESPÉCIE: Constituição de agrupamentos de indivíduos com profundas
semelhanças estruturais e funcionais recíprocas, resultantes da partilha de
um genoma idêntico, que lhes confere acentuada uniformidade bioquímica.

27. REINOS
• Fungi - Reino dos fungos (como leveduras e bolores)
• Animalia - Reino dos animais
• Protista - Reino das Algas Unicelulares e dos Protozoários
• Monera - Reino das Bactérias e Cianobactérias (ou algas azuis)
• Vírus - os vírus e agentes sub-virais

28. ÁRVORE FILOGENÉTICA DE BACTÉRIAS E “MACRÓBIOS”

29. MUNDO PROCARIÓTICO
• O mundo procariótico é dividido em dois Domínios – Archaea e Eubacteria
• O genoma da Eubacteria pode ser até três vezes maior que o da Archaea
• Os Archaea têm paredes celulares constituídas principalmente de
proteínas carecem do peptidioglicano mureína encontrado nas Eubacteria
• Em suma, Archaea compreendem bactérias que são “extremófilos”
ambientais, não contém patógenos humanos. Exemplos: bactérias
metanogênicas, redutoras de sulfato, aeróbicas halofílicas (que
necessitam de sal), termoacidofílas (crescem entre 50-60 graus celsius a
pH<5), anaeróbias hipertermófilicas, heterotróficas ou aeróbias
redutores de enxofre capazes de oxidar enxofre ou outros substratos
inorgânicos e orgânicos.

30. TAXONOMIA