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Clermont'ech API Hour #15 - ASAIM : Traitement "Big Data" en Biologie
Le document traite du traitement des 'big data' en biologie, en se concentrant sur la génomique et la métagénomique. Il présente des outils et des solutions pour gérer des données massives, notamment un pipeline de traitement évolutif, tout en soulignant les défis liés à la gestion des workflows et des mises à jour des outils. Enfin, il aborde le projet CPER Auvergne en relation avec ces technologies.
![[2013.09.27] extracting genomes from metagenomes](https://cdn.slidesharecdn.com/ss_thumbnails/2013-130927034103-phpapp01-thumbnail.jpg?width=640&height=640&fit=bounds)
![Atlas fotográfico de anatomia del cuerpo humano [3era edicion]](https://cdn.slidesharecdn.com/ss_thumbnails/anon-atlasfotograficodeanatomiadelcuerpohumano3eraedicion-140215224329-phpapp01-thumbnail.jpg?width=640&height=640&fit=bounds)
Clermont'ech API Hour #15 - ASAIM : Traitement "Big Data" en Biologie
- 1. ASAIM Traitement “Big Data”en Biologie Bérénice Batut Post-doctorante - EA CIDAM Yuta Onada
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- 11. Solution idéale Facilité d’utilisationpar les biologistes 11
- 12. Solution idéale Facilité d’utilisationpar les biologistes Gestion de données massives et complexes 12
- 13. Solution idéale Facilité d’utilisationpar les biologistes Gestion de données massives et complexes Traitement rapide et complet des données 13
- 14. Solution idéale Facilité d’utilisationpar les biologistes Gestion de données massives et complexes Traitement rapide et complet des données Modularité 14
- 15. Solution proposée Connection Raw readupload Pipeline, parameters and metadata definitions File and data saving Pipeline job submission Computer cluster Waiting job interrogation and execution Result sending and formating Email sending with a link toward result webpage Users Web interface Pipeline interface 15
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- 18. Principaux verrous Gestion duworkflow modulaire Gestion et stockage des données massives Durée des traitements et des analyses Choix outils à utiliser pour chaque étape Gestion des mises à jours des outils et bases de données utilisés Tests automatiques des sorties Nombreuses librairies à installer Gestion du flux d’utilisateurs 18
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- 20. Principaux verrous Gestion duworkflow modulaire Gestion et stockage des données massives Durée des traitements et des analyses Choix outils à utiliser pour chaque étape Gestion des mises à jours des outils et bases de données utilisés Tests automatiques des sorties Nombreuses librairies à installer Gestion du flux d’utilisateurs 20