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Estructura del DNA
Estructura del DNA
Estructura del DNA




Adenina se aparea con Timina
Guanina se aparea con Citosina
Implicaciones del Diámetro
      constante
Uniones entre bases
Bases Físicas de la Herencia

Procariotes
HU y H




                   Eucariotes
                   • Histonas
                   • No histonas
Bases Físicas de la Herencia
Table 12-2   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
Bases Físicas de la Herencia
Bases Físicas de la Herencia
Bases Físicas de la Herencia
Bases Físicas de la Herencia
Bases Físicas de la Herencia
Bases Físicas de la Herencia
Bases Físicas de la Herencia
Bases Físicas de la Herencia

            Eucromatina


Cromatina                     Constitutiva

            Heterocromatina

                              Facultativa
Bases Físicas de la Herencia
DNA          Centrómeros   Flia alfoide
Altamente                  170 pb-106 pb
Repetitivo
5%           Telómeros      Tandem

DNA        Sec dispersas    SINE
Moderadam.                  LINE
Repetitivo
30%                          RNAr
           Sec repetidas     VNTR
                             STR
Replicación del DNA
Replicación del DNA
Cumple el DNA las condiciones
  del material hereditario?

       Condiciones            Componente del DNA
Tiene información biológica   Código Genético: 3 bases
para las proteínas            codifican para 1 aminoácido
                              (proteína)
Replicarse fielmente y        Las bases complementarias
transmitirse a la             son fieles; se encuentran en
descendencia                  las células germinales
Debe ser estable en un        Uniones covalentes; puentes
organismo vivo                de hidrógeno
Capaz de incorporar cambios Las bases pueden cambiar
estables                    por mecanismos conocidos
Replicación del DNA
La Replicación del DNA es simple, pero requiere un
gran grupo de enzimas y proteínas:

  La Helicasa desenrolla la molécula

  Las proteínas de unión a cadena sencilla estabilizan el

   ssDNA

  La Primasa inicia la replicación con RNA

  La DNA polimerasa extiende el nuevo DNA

  La segunda DNA polimerasa remueve el RNA

  La DNA ligasa une todos los fragmentos
Replicación del DNA
Replicación del DNA
Replicación del DNA
•Enzimas que sintetizan (replican) el DNA
   •E. coli
       •DNA polimerasa I (rellena huecos y repara)
       •DNA polimerasa II y III (función principal en la síntesis)
              •Añade bases en ambas cadenas en la dirección 5’ → 3’
              •Requiere un 3’ OH final
   •Eucariotes
       •5 polimerasas
              ∀α y β principal en replicación
              ∀δ, ε y γ exonucleasas
   •Corrección de pruebas: actividad 3’ → 5’ exonucleotídica.
   Sustituye bases mal emparejadas por correctas
Acción Autocatalítica
      del DNA
Proteínas principales replicación
• Topoisomerasas: rompen una hebra y la tensión del
  enrrollamiento de la hélice se relaja

• Helicasas: completan el desenrrollamiento
• ADN polimerasas: complejos agregados de diferentes
  proteínas.

• Primasas: sintetizan los iniciadores de ARN que se
  necesitan para iniciar la replicación

• Ligasas: sellan las lagunas dejadas por las ribonucleasas
  cuando remueven los primers, catalizan la unión
  fosfodiester entre nucleótidos adyacentes.

• Proteinas de unión a la hebra sencilla del ADN:
  estabilizan la horquilla de replicación.
Replicación del DNA
Replicación del DNA
 •Replicación: continua (cadena adelantada) y discontinua
 (cadena retrasada)
•Discontinua
      •Cebador (pequeño RNA 2-60 nucleótidos añadido
      por la primasa o RNA pol que provee 3’ OH)
      •Fragmento de Okazaki por DNA pol III (1500 bp
      en procariotas y 150 en eucariotas)
      •Pol I elimina cebador 3’ -> 5’ y llena huecos (gap)
      •Ligación (DNA ligasa, enlace fosfodiéster)
Replicación del DNA
Existen las dos formas de
              replicación:
En general, es Bidireccional:
•    genomas bacterianos
•    cromosomas de células eucariotas


  En algunos casos es Unidireccional, ej:
  •     en el ADN mitocondrial
  •     en algunos virus
Replicación del DNA
Replicación del DNA
Replicación del DNA
Replicación del DNA
Replicación del DNA
Replicación del DNA
•Enzimas que sintetizan (replican) el DNA
   •E. coli
       •DNA polimerasa I (rellena huecos y repara)
       •DNA polimerasa II y III (función principal en la síntesis)
              •Añade bases en ambas cadenas en la dirección 5’ → 3’
              •Requiere un 3’ OH final
   •Eucariotes
       •5 polimerasas
              ∀α y β principal en replicación
              ∀δ, ε y γ exonucleasas
   •Corrección de pruebas: actividad 3’ → 5’ exonucleotídica.
   Sustituye bases mal emparejadas por correctas
Telomerasa
• Ribonucleoproteína específica de los telómeros

• Tiene actividad transcriptasa reversa

• Añade unidades sencillas de la repetición a los
  extremos de los telómeros previniendo el
  acortamiento de los cromosomas

• Contiene un molde de ARN que sirve para
  sintetizar el ADN y la subunidad catalítica que
  actúa como transcriptasa reversa.

• Las mayoría de las células somáticas normales del
  ser humano son TELOMERASA-NEGATIVAS
•    Se ha detectado actividad telomerasa en:

1.   Células hematopoyéticas: estimulación de los
     linfocitos T con algún mitógeno eleva los niveles de
     telomerasa 500-1000 veces.

2.   Queratinocitos basales

3.   Células epiteliales del endometrio, mamas, esófago,
     próstata y páncreas.
•    La actividad telomerasa es mayor en mujeres con
     ciclo menstrual activo y es casi nula en la menopausia
•    El epitelio lobular de las mamas tiene más actividad
     telomerasa durante el embarazo
•    La actividad telomerasa baja cuando las células se
     especializan y dejan de dividirse.
TRANSCRIPCION
• El proceso mediante el cual la información
  almacenada en el DNA se recupera
  mediante la síntesis de RNA dependiente
  de un molde.
REPLICACION Y
            TRANSCRIPCION
SIMILITUDES
• Se utilizan nucleótidos trifosfatados

•   El crecimiento de la cadena va en dirección
    5’3’

DIFERENCIAS
• Solo se transcribe una hebra de DNA

•   Solo una pequeña fracción del genoma es
    transcito
RNA
          (Acido Ribonucleico)
• Tipos mas importantes:

  – mRNA  Se sintetiza a partir de DNA y se utiliza
    como molde para la síntesis proteica en
    ribosomas

  – rRNA  Compone los ribosomas que se encargan de
    la síntesis de proteínas

  – tRNA  Se une a los aminoácidos y los transporta al
    ribosoma para la síntesis de proteínas
RNA POLIMERASA
• Es la enzima que cataliza el proceso de
  trascripción:
                   Mg2+
                   DNA
 n(ATP+CTP+GTP+UTP) ═ (AMP-CMP-GMP-UMP)n + nPPi


• El producto de la rxn es una copia
  complementaria del DNA molde
RNA POLIMERASA
• En procariotes una sola RNA pol cataliza la síntesis de
  las tres clases de RNA

• La RNA pol cataliza la reacción de transcripción a una
  velocidad aprox. 50 nucleótidos/s

• En E. coli hay aprox. 3000 moléculas de RNA pol

• Una vez la RNA pol se une a un molde de DNA e inicia
  la transcripción rara vez se disocia hasta que llega a una
  señal de terminación
RNA POLIMERASA
MECANISMO DE LA
           TRANSCRIPCION

• INICIACION  Interacción con los promotores

• ELONGACION  Incorporación de los
  ribonucleótidos

• TERMINACION  Finalización de la
  trascripción dependiente o independiente del
  factor
La Estructura del
      RNA
Transcripción
• Se abre una pequeña sección de DNA


• Solo se usa una de las hebras de DNA para
  la transcripción (3’ - 5’).


• Esta sirve de molde para formar el mRNA


• El mRNA se sintetiza de nucleótidos libres
  en la célula
Figure 13-9   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
Figure 13-9a   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
Figure 13-9b   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
Figure 13-9c   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
Transcripción
• E. coli: TTGACA (–35) y TATAAT (–10).
•Terminación directa debida a la formacion de
bucle the RNA.

•In some cases, termination depends on the
rho (ρ) termination factor
TERMINACION INDEPENDIENTE DEL
           FACTOR
TERMINACION DEPENDIENTE DEL
          FACTOR
DIFERENCIAS IMPORTANTES ENTRE
             PROCARIOTES Y EUCARIOTES
       PROCARIOTES                     EUCARIOTES
Todo el DNA contenido en una    Genoma dividido en varios o
única molécula                  muchos cromosomas (1-190)
El cromosoma bacteriano se      Los cromosomas se
encuentra libre en el citosol   encuentran dentro del núcleo
                                formando la cromatina (DNA-
                                proteína)
Haploides (una sola copia del   Mayoría diploides (dos copias
material genético)              de un cromosoma)
Transcripción y traducción      Transcripción dentro del núcleo
acopladas                       y traducción en el citoplasma
No tienen intrones              Intrones y exones
Que son los genes




   Los genes son secuencias de nucleótidos que
    codifican información para crear proteínas.

Su tamaño varia desde menos de 100 pares de bases
      hasta varios millones de pares de bases.
• Todos los organismos eucariotes (organismo con
  células nucleadas, contrario a las bacterias que no
  poseen núcleo y se llaman procariotes) poseen
  genes que están divididos en exones e intrones. El
  significado biológico de esta segmentación no
  se conoce claramente.

• La mayoría de los genes humanos están divididos
  en exones e intrones, excepto los genes
  mitocondriales y algunos genes del núcleo.

• Durante la expresión génica tanto los exones como
  los intrones son transcritos para formar el pre-
  ARNm.
• El proceso de “splicing” del ARN elimina los
  intrones y produce una molécula de ARNm
  madura que codifica por un polipéptido.

• Los exones se definen como secuencias que
  están representadas en el ARNm maduro.

• Estos pueden o no codificar una proteína:
  algunos exones localizados en los extremos 3’ y
  5’ del ARNm pueden no ser traducidos a
  proteínas.
Estructura del gen eucariotico

• Exón: secuencia codificante
• Intrón: secuencia no codificante entre dos exones
TRANSCRIPCION EN EUCARIOTAS
• Es un proceso de mucha discriminación (según el tejido
  o etapa del desarrollo serán los genes que se van a
  transcribir)

• La maquinaria de la transcripción debe tener en cuenta
  la compleja estructura de la cromatina eucariota

• Requiere de varios tipos de RNA polimerasas

• La RNA polimerasa requiere de factores adicionales
  llamados factores de transcripción para iniciar la
  transcripción

• Tiene que haber un procesamiento complejo del mRNA
  que permita escindir los intrones del mensaje y
  transportar la molécula al citoplasma
Figure 13-10   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
RNA POLIMERASAS
POLIMERASA      LOCALIZACION    RNA SINTETIZADOS

      I            Núcleo      pre – rRNA (excepto la
                               subunidad 5S)
     II            Núcleo      pre – mRNA, RNA
                               nucleares pequeños
                               (snRNA)
     III           Núcleo      pre – tRNA, rRNA 5S,
                               otros snRNA
Mitocondrial     Mitocondria   Mitocondrial

Cloroplástica    Cloroplasto   Cloroplástico
RNA POLIMERA III
• TRANSCRIBE LOS PRINCIPALES GENES DE
  RNA DE TRANSFERENCIA, RNA RIBOSOMAL
  5S Y RNA PEQUEÑOS

• Contiene 14 subunidades

• Requiere varios tipos de factores de
  transcripción como TFIIIA, TFIIIB y TFIIIC
RNA POLIMERASA I
• TRANSCRIBE LOS PRINCIPALES GENES DE RNA
  RIBOSOMICO

• Contiene 13 subunidades

• Necesita al menos 2 factores de transcripción para
  iniciar el proceso

• El ribosoma eucariota contiene 4 moleculas de rRNA
   – Subunidad pequeña: 18S
   – Subunidad grande: 28S, 5.8S y 5S (no transcrito por esta
     RNApol)
RNA POLIMERASA II
• TRANCRIBE LOS GENES ESTRUCTURALES, ES
  DECIR, LOS QUE SE TRADUCEN A PROTEINAS

• Contiene múltiples subunidades

• Intervienen al menos 7 factores de transcripción: TFIIA,
  TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH y TFIIJ

• El factor critico es TFIID que se une a la caja TATA que
  es el equivalente eucariota a la región -10
FACTOR DE       FUNCION
TRANSCRIPCION
TFIID           Reconoce la caja TATA
TFIIA           Estabiliza el complejo entre
                TFIID y el DNA
TFIIB           Recluta a la RNApol II y
                TFIIF
TFIIF           Ayuda a que la pol II
                reconozca el promotor
RNA pol II      Cataliza la síntesis de RNA,
                recluta a TFIIE
TFIIE           Recluta a TFIIH y regula la
                actividad helicasa de TFIIH
TFIIH           Desenrolla la región
                promotora
Transcripción
•
Procesamiento del RNA
Transcripción Procariotes
Procesamiento del RNA
Transcripción Eucariotes
FORMACION COMPLEJO
      TRANSCRIPCION RNA pol II
•La caja TATA se une al factor de transcripción
TFIID, determina el sitio de inicio (aprox 10
subunidades)
•Incluye una prot de union a TATA (TBP) se une
especificamente a TATA y a otros factores
asociados a TBP (TAFs)
•El TBP se une a un segundo factor transcripcional
(TFIIB) formando complejo TBP – TFIIB en el
promotor.
• EL TFIIB sirve de puente para que la RNA
  pol II se una al complejo TBP – TFIIB en
  asociacion con un tercer factor TFIIF.
• Luego se requiere la union de dos factores
  adicionales para iniciar la transcripción:
  TFIIE, TFIIH.
• TFIIH multisubunidad: 2 subunidades
  tienen funcion helicasa, otra subunudad
  tiene funcion quinasa
•
• Potenciadores: rio arriba, dentro o rio
  abajo del gen y modulan la transcripción
• Terminacion
• hnRNA es procesado: 5' cap, poli-A y
  splicing
Transcripción
Transcripción
Tipos de RNA

• mRNA (mensajero)

• tRNA (transferencia)

• rRNA (ribosomal)


• miRNA (micro RNA)
mRNA
• Cadenas de largo tamaño con estructura
  primaria.

• Se llama mensajero porque transporta la
  información para síntesis proteica.

• La información de cada mRNA sintetiza una
  proteína determinada.

• Su vida media es corta.
mRNA
• Contiene codones (grupo de 3 nucleótidos
  que codifica para un a.a. en la cadena de
  polipéptidos). Señala el comienzo y el final
  de la cadena polipéptida.

• En procariotas el extremo 5’ posee un
  grupo trifosfato

• En eucariotas el extremo 5’ posee un grupo
  metil-guanosina (cap) unido al trifosfato, y
  el extremo 3´posee una cola de poli-A
tRNA
• Tiene forma    de   hoja   de
  trébol

• Tiene una cola C-C-A       3’,
  donde se pega el A.A.

• Contiene el anticodón (grupos
  de       3        nucleótidos
  complementarios al codón.)

• Su misión es unirse a un
  aminoácidos y transportarlo
  hasta     el   ARNm   para
  sintetizar proteínas.
tRNA
rRNA

• Es más estable.

• Se divide en sub-
  unidades
Propiedades del código
             genético

• Unidireccional – lee 5’ - 3’
• No     es     superponible     -     codón
  independiente, (lee de tres en tres)
• Colineal  –   la   secuencia    de  a.a.
  corresponde a una ubicación de la
  secuencia de cada tres nucleótidos.
• Redundante – la mayoría de los a.a.
  pueden ser codificados por varios
  codones.
Propiedades del código
           genético

• Universal – el mismo código se cumple
  para todos los seres vivos.

• Señal iniciadora – AUG corresponde a
  formil-metionina.

• Señal de terminación – UAA, UAG, UGA,
  tripletes sin sentido.
Síntesis de proteínas
• Transcripción

• Traducción
  Iniciación
  Elongación
  Terminación
Traducción: (iniciación)
 • Envuelve la unión entre el tRNA con el
   primer codón del mRNA.

 • El primer codón es AUG (metionina)


 • El primer tRNA que llega se coloca en
   el lugar P (peptidil) del ribosoma.
INICIACION EN EUCARIOTES

• El eIF1, y eIF3: Subunidad 40 s
• eIF2 (GTP): RNAT met a la sub 40s
• La cap 5’ reconocida eIF4F, eIF4A, eIF4B
  acoplan RNAm y ribosoma
• La sub 40s + RNAT met y el eIF5 dirigen
  mensajero para identificar AUG de inicio
• Al ser reconocido el eIF5 produce
  hidrólisis de GTP, los IF salen y sub 60s
  (eIF6) se une a 40s
Traducción: (elongación)
• Formación de la cadena de a.a. para
  formar la proteína

• Llega el segundo tRNA cargado y se
  coloca en el lugar A (aceptador) para
  formar el enlace péptidico, mediante la
  enzima peptidyltransferasa, esto se
  conoce como transpeptidación.
Traducción: (elongación)
 • La translocación se lleva a cabo cuando
   el primer tRNA (met) se mueve del
   lugar P al lugar E (“exit”).

 • El tRNA que estaba en el lugar A se
   mueve al P

 • El mRNA se mueve al siguiente codón
   para ser reconocido por el tRNA en el
   lugar A.
ELONGACION EUCARIOTES


• eEF1α (GTP) = EF-Tu de bacterias


• eEF2 (GTP) = EF- G de bacterias


• eEF1β (GTP) recicla (GTP) eEF1α
Traducción: (terminación)

• Luego de haberse formado la cadena de
  polipéptidos (elongación), se va colocar un
  codón de terminación (UAA, UAG, UGA)

• Cuando el tRNA llega no reconoce el
  codón y detiene el proceso de elongación
  y se termina con la síntesis de proteína
TERMINACION EN EUCARIOTES

• Solo un factor de liberación (RF)
• 10 millones ribosomas /célula
• 18 residuos de aa/ seg (20 aa
  diferentes)
• DNA pol 10 N/seg.
• RNA pol 55 N/seg
• Síntesis proteínas 200M/ enlaces/ seg
1865
                   Beadle & Tatum - 1941
La hipótesis un gen – una enzima

                                        ¿Cómo funciona el genoma
                                           para manifestar sus
                                             características?



                   Gen 1        Gen 2       Gen 3

                                                     Producto
       Precursor    Enz 1   A   Enz 2   B    Enz 3
                                                     final
1865
                  Beadle & Tatum - 1941
La hipótesis un gen – una enzima

       Neurospora crassa
Figure 14-11a   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
Figure 14-11b   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
Figure 14-11c   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
Figure 14-11   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
1865
                         Beadle & Tatum - 1941
    La hipótesis un gen – una enzima
                               Ascosporas en medio completo
          Neurospora crassa
Rayos X
                              Mínimo +                                                    Todos
                              amino ácidos                                                crecen



                                                                                           medio
                                                                                           mínimo

                                                               No crecen los mutantes




                                                                     Mutantes deficientes en la
                                                                     síntesis de arginina.
                                    Cys      Glu   Arg   Lys   His
1865
                                          Beadle & Tatum - 1941

                      + Ornithine

                                    + Citruline
            Minimal




                                                  + Arginine
            Medium                                                         Gene A               Gene B               Gene C


Tipo                                                           Precursor Enz A      Ornithine Enz B      Citruline Enz C      Arginine
normal

                                                                           BLOQUEO
Mutantes
                                                               Precursor            Ornithine Enz B      Citruline Enz C      Arginine
clase I



Mutantes
clase II                                                       Precursor Enz A      Ornithine            Citruline Enz C      Arginine




Mutantes
clase III                                                      Precursor Enz A      Ornithine Enz B      Citruline            Arginine
Figure 14-10   Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.

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2 estructura y replicacion del dna 1 (1)

  • 3. Estructura del DNA Adenina se aparea con Timina Guanina se aparea con Citosina
  • 6. Bases Físicas de la Herencia Procariotes HU y H Eucariotes • Histonas • No histonas
  • 7.
  • 8.
  • 9. Bases Físicas de la Herencia
  • 10. Table 12-2 Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 11. Bases Físicas de la Herencia
  • 12. Bases Físicas de la Herencia
  • 13. Bases Físicas de la Herencia
  • 14. Bases Físicas de la Herencia
  • 15. Bases Físicas de la Herencia
  • 16. Bases Físicas de la Herencia
  • 17. Bases Físicas de la Herencia
  • 18. Bases Físicas de la Herencia Eucromatina Cromatina Constitutiva Heterocromatina Facultativa
  • 19. Bases Físicas de la Herencia DNA Centrómeros Flia alfoide Altamente 170 pb-106 pb Repetitivo 5% Telómeros Tandem DNA Sec dispersas SINE Moderadam. LINE Repetitivo 30% RNAr Sec repetidas VNTR STR
  • 21.
  • 22.
  • 23.
  • 25. Cumple el DNA las condiciones del material hereditario? Condiciones Componente del DNA Tiene información biológica Código Genético: 3 bases para las proteínas codifican para 1 aminoácido (proteína) Replicarse fielmente y Las bases complementarias transmitirse a la son fieles; se encuentran en descendencia las células germinales Debe ser estable en un Uniones covalentes; puentes organismo vivo de hidrógeno Capaz de incorporar cambios Las bases pueden cambiar estables por mecanismos conocidos
  • 26. Replicación del DNA La Replicación del DNA es simple, pero requiere un gran grupo de enzimas y proteínas:  La Helicasa desenrolla la molécula  Las proteínas de unión a cadena sencilla estabilizan el ssDNA  La Primasa inicia la replicación con RNA  La DNA polimerasa extiende el nuevo DNA  La segunda DNA polimerasa remueve el RNA  La DNA ligasa une todos los fragmentos
  • 29. Replicación del DNA •Enzimas que sintetizan (replican) el DNA •E. coli •DNA polimerasa I (rellena huecos y repara) •DNA polimerasa II y III (función principal en la síntesis) •Añade bases en ambas cadenas en la dirección 5’ → 3’ •Requiere un 3’ OH final •Eucariotes •5 polimerasas ∀α y β principal en replicación ∀δ, ε y γ exonucleasas •Corrección de pruebas: actividad 3’ → 5’ exonucleotídica. Sustituye bases mal emparejadas por correctas
  • 30.
  • 32. Proteínas principales replicación • Topoisomerasas: rompen una hebra y la tensión del enrrollamiento de la hélice se relaja • Helicasas: completan el desenrrollamiento • ADN polimerasas: complejos agregados de diferentes proteínas. • Primasas: sintetizan los iniciadores de ARN que se necesitan para iniciar la replicación • Ligasas: sellan las lagunas dejadas por las ribonucleasas cuando remueven los primers, catalizan la unión fosfodiester entre nucleótidos adyacentes. • Proteinas de unión a la hebra sencilla del ADN: estabilizan la horquilla de replicación.
  • 34.
  • 35. Replicación del DNA •Replicación: continua (cadena adelantada) y discontinua (cadena retrasada) •Discontinua •Cebador (pequeño RNA 2-60 nucleótidos añadido por la primasa o RNA pol que provee 3’ OH) •Fragmento de Okazaki por DNA pol III (1500 bp en procariotas y 150 en eucariotas) •Pol I elimina cebador 3’ -> 5’ y llena huecos (gap) •Ligación (DNA ligasa, enlace fosfodiéster)
  • 36.
  • 37.
  • 39. Existen las dos formas de replicación: En general, es Bidireccional: • genomas bacterianos • cromosomas de células eucariotas En algunos casos es Unidireccional, ej: • en el ADN mitocondrial • en algunos virus
  • 40.
  • 46. Replicación del DNA •Enzimas que sintetizan (replican) el DNA •E. coli •DNA polimerasa I (rellena huecos y repara) •DNA polimerasa II y III (función principal en la síntesis) •Añade bases en ambas cadenas en la dirección 5’ → 3’ •Requiere un 3’ OH final •Eucariotes •5 polimerasas ∀α y β principal en replicación ∀δ, ε y γ exonucleasas •Corrección de pruebas: actividad 3’ → 5’ exonucleotídica. Sustituye bases mal emparejadas por correctas
  • 47.
  • 48. Telomerasa • Ribonucleoproteína específica de los telómeros • Tiene actividad transcriptasa reversa • Añade unidades sencillas de la repetición a los extremos de los telómeros previniendo el acortamiento de los cromosomas • Contiene un molde de ARN que sirve para sintetizar el ADN y la subunidad catalítica que actúa como transcriptasa reversa. • Las mayoría de las células somáticas normales del ser humano son TELOMERASA-NEGATIVAS
  • 49. Se ha detectado actividad telomerasa en: 1. Células hematopoyéticas: estimulación de los linfocitos T con algún mitógeno eleva los niveles de telomerasa 500-1000 veces. 2. Queratinocitos basales 3. Células epiteliales del endometrio, mamas, esófago, próstata y páncreas. • La actividad telomerasa es mayor en mujeres con ciclo menstrual activo y es casi nula en la menopausia • El epitelio lobular de las mamas tiene más actividad telomerasa durante el embarazo • La actividad telomerasa baja cuando las células se especializan y dejan de dividirse.
  • 50.
  • 51.
  • 52.
  • 53.
  • 54. TRANSCRIPCION • El proceso mediante el cual la información almacenada en el DNA se recupera mediante la síntesis de RNA dependiente de un molde.
  • 55. REPLICACION Y TRANSCRIPCION SIMILITUDES • Se utilizan nucleótidos trifosfatados • El crecimiento de la cadena va en dirección 5’3’ DIFERENCIAS • Solo se transcribe una hebra de DNA • Solo una pequeña fracción del genoma es transcito
  • 56. RNA (Acido Ribonucleico) • Tipos mas importantes: – mRNA  Se sintetiza a partir de DNA y se utiliza como molde para la síntesis proteica en ribosomas – rRNA  Compone los ribosomas que se encargan de la síntesis de proteínas – tRNA  Se une a los aminoácidos y los transporta al ribosoma para la síntesis de proteínas
  • 57. RNA POLIMERASA • Es la enzima que cataliza el proceso de trascripción: Mg2+ DNA n(ATP+CTP+GTP+UTP) ═ (AMP-CMP-GMP-UMP)n + nPPi • El producto de la rxn es una copia complementaria del DNA molde
  • 58. RNA POLIMERASA • En procariotes una sola RNA pol cataliza la síntesis de las tres clases de RNA • La RNA pol cataliza la reacción de transcripción a una velocidad aprox. 50 nucleótidos/s • En E. coli hay aprox. 3000 moléculas de RNA pol • Una vez la RNA pol se une a un molde de DNA e inicia la transcripción rara vez se disocia hasta que llega a una señal de terminación
  • 60. MECANISMO DE LA TRANSCRIPCION • INICIACION  Interacción con los promotores • ELONGACION  Incorporación de los ribonucleótidos • TERMINACION  Finalización de la trascripción dependiente o independiente del factor
  • 62. Transcripción • Se abre una pequeña sección de DNA • Solo se usa una de las hebras de DNA para la transcripción (3’ - 5’). • Esta sirve de molde para formar el mRNA • El mRNA se sintetiza de nucleótidos libres en la célula
  • 63. Figure 13-9 Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 64. Figure 13-9a Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 65. Figure 13-9b Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 66. Figure 13-9c Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 67.
  • 68. Transcripción • E. coli: TTGACA (–35) y TATAAT (–10). •Terminación directa debida a la formacion de bucle the RNA. •In some cases, termination depends on the rho (ρ) termination factor
  • 71. DIFERENCIAS IMPORTANTES ENTRE PROCARIOTES Y EUCARIOTES PROCARIOTES EUCARIOTES Todo el DNA contenido en una Genoma dividido en varios o única molécula muchos cromosomas (1-190) El cromosoma bacteriano se Los cromosomas se encuentra libre en el citosol encuentran dentro del núcleo formando la cromatina (DNA- proteína) Haploides (una sola copia del Mayoría diploides (dos copias material genético) de un cromosoma) Transcripción y traducción Transcripción dentro del núcleo acopladas y traducción en el citoplasma No tienen intrones Intrones y exones
  • 72. Que son los genes Los genes son secuencias de nucleótidos que codifican información para crear proteínas. Su tamaño varia desde menos de 100 pares de bases hasta varios millones de pares de bases.
  • 73. • Todos los organismos eucariotes (organismo con células nucleadas, contrario a las bacterias que no poseen núcleo y se llaman procariotes) poseen genes que están divididos en exones e intrones. El significado biológico de esta segmentación no se conoce claramente. • La mayoría de los genes humanos están divididos en exones e intrones, excepto los genes mitocondriales y algunos genes del núcleo. • Durante la expresión génica tanto los exones como los intrones son transcritos para formar el pre- ARNm.
  • 74. • El proceso de “splicing” del ARN elimina los intrones y produce una molécula de ARNm madura que codifica por un polipéptido. • Los exones se definen como secuencias que están representadas en el ARNm maduro. • Estos pueden o no codificar una proteína: algunos exones localizados en los extremos 3’ y 5’ del ARNm pueden no ser traducidos a proteínas.
  • 75. Estructura del gen eucariotico • Exón: secuencia codificante • Intrón: secuencia no codificante entre dos exones
  • 76. TRANSCRIPCION EN EUCARIOTAS • Es un proceso de mucha discriminación (según el tejido o etapa del desarrollo serán los genes que se van a transcribir) • La maquinaria de la transcripción debe tener en cuenta la compleja estructura de la cromatina eucariota • Requiere de varios tipos de RNA polimerasas • La RNA polimerasa requiere de factores adicionales llamados factores de transcripción para iniciar la transcripción • Tiene que haber un procesamiento complejo del mRNA que permita escindir los intrones del mensaje y transportar la molécula al citoplasma
  • 77. Figure 13-10 Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 78. RNA POLIMERASAS POLIMERASA LOCALIZACION RNA SINTETIZADOS I Núcleo pre – rRNA (excepto la subunidad 5S) II Núcleo pre – mRNA, RNA nucleares pequeños (snRNA) III Núcleo pre – tRNA, rRNA 5S, otros snRNA Mitocondrial Mitocondria Mitocondrial Cloroplástica Cloroplasto Cloroplástico
  • 79. RNA POLIMERA III • TRANSCRIBE LOS PRINCIPALES GENES DE RNA DE TRANSFERENCIA, RNA RIBOSOMAL 5S Y RNA PEQUEÑOS • Contiene 14 subunidades • Requiere varios tipos de factores de transcripción como TFIIIA, TFIIIB y TFIIIC
  • 80. RNA POLIMERASA I • TRANSCRIBE LOS PRINCIPALES GENES DE RNA RIBOSOMICO • Contiene 13 subunidades • Necesita al menos 2 factores de transcripción para iniciar el proceso • El ribosoma eucariota contiene 4 moleculas de rRNA – Subunidad pequeña: 18S – Subunidad grande: 28S, 5.8S y 5S (no transcrito por esta RNApol)
  • 81. RNA POLIMERASA II • TRANCRIBE LOS GENES ESTRUCTURALES, ES DECIR, LOS QUE SE TRADUCEN A PROTEINAS • Contiene múltiples subunidades • Intervienen al menos 7 factores de transcripción: TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH y TFIIJ • El factor critico es TFIID que se une a la caja TATA que es el equivalente eucariota a la región -10
  • 82. FACTOR DE FUNCION TRANSCRIPCION TFIID Reconoce la caja TATA TFIIA Estabiliza el complejo entre TFIID y el DNA TFIIB Recluta a la RNApol II y TFIIF TFIIF Ayuda a que la pol II reconozca el promotor RNA pol II Cataliza la síntesis de RNA, recluta a TFIIE TFIIE Recluta a TFIIH y regula la actividad helicasa de TFIIH TFIIH Desenrolla la región promotora
  • 88. FORMACION COMPLEJO TRANSCRIPCION RNA pol II •La caja TATA se une al factor de transcripción TFIID, determina el sitio de inicio (aprox 10 subunidades) •Incluye una prot de union a TATA (TBP) se une especificamente a TATA y a otros factores asociados a TBP (TAFs) •El TBP se une a un segundo factor transcripcional (TFIIB) formando complejo TBP – TFIIB en el promotor.
  • 89. • EL TFIIB sirve de puente para que la RNA pol II se una al complejo TBP – TFIIB en asociacion con un tercer factor TFIIF. • Luego se requiere la union de dos factores adicionales para iniciar la transcripción: TFIIE, TFIIH. • TFIIH multisubunidad: 2 subunidades tienen funcion helicasa, otra subunudad tiene funcion quinasa •
  • 90. • Potenciadores: rio arriba, dentro o rio abajo del gen y modulan la transcripción • Terminacion • hnRNA es procesado: 5' cap, poli-A y splicing
  • 92. Transcripción Tipos de RNA • mRNA (mensajero) • tRNA (transferencia) • rRNA (ribosomal) • miRNA (micro RNA)
  • 93. mRNA • Cadenas de largo tamaño con estructura primaria. • Se llama mensajero porque transporta la información para síntesis proteica. • La información de cada mRNA sintetiza una proteína determinada. • Su vida media es corta.
  • 94. mRNA • Contiene codones (grupo de 3 nucleótidos que codifica para un a.a. en la cadena de polipéptidos). Señala el comienzo y el final de la cadena polipéptida. • En procariotas el extremo 5’ posee un grupo trifosfato • En eucariotas el extremo 5’ posee un grupo metil-guanosina (cap) unido al trifosfato, y el extremo 3´posee una cola de poli-A
  • 95. tRNA • Tiene forma de hoja de trébol • Tiene una cola C-C-A 3’, donde se pega el A.A. • Contiene el anticodón (grupos de 3 nucleótidos complementarios al codón.) • Su misión es unirse a un aminoácidos y transportarlo hasta el ARNm  para sintetizar proteínas.
  • 96. tRNA
  • 97. rRNA • Es más estable. • Se divide en sub- unidades
  • 98. Propiedades del código genético • Unidireccional – lee 5’ - 3’ • No es superponible - codón independiente, (lee de tres en tres) • Colineal – la secuencia de a.a. corresponde a una ubicación de la secuencia de cada tres nucleótidos. • Redundante – la mayoría de los a.a. pueden ser codificados por varios codones.
  • 99. Propiedades del código genético • Universal – el mismo código se cumple para todos los seres vivos. • Señal iniciadora – AUG corresponde a formil-metionina. • Señal de terminación – UAA, UAG, UGA, tripletes sin sentido.
  • 100.
  • 101. Síntesis de proteínas • Transcripción • Traducción Iniciación Elongación Terminación
  • 102. Traducción: (iniciación) • Envuelve la unión entre el tRNA con el primer codón del mRNA. • El primer codón es AUG (metionina) • El primer tRNA que llega se coloca en el lugar P (peptidil) del ribosoma.
  • 103.
  • 104. INICIACION EN EUCARIOTES • El eIF1, y eIF3: Subunidad 40 s • eIF2 (GTP): RNAT met a la sub 40s • La cap 5’ reconocida eIF4F, eIF4A, eIF4B acoplan RNAm y ribosoma • La sub 40s + RNAT met y el eIF5 dirigen mensajero para identificar AUG de inicio • Al ser reconocido el eIF5 produce hidrólisis de GTP, los IF salen y sub 60s (eIF6) se une a 40s
  • 105. Traducción: (elongación) • Formación de la cadena de a.a. para formar la proteína • Llega el segundo tRNA cargado y se coloca en el lugar A (aceptador) para formar el enlace péptidico, mediante la enzima peptidyltransferasa, esto se conoce como transpeptidación.
  • 106. Traducción: (elongación) • La translocación se lleva a cabo cuando el primer tRNA (met) se mueve del lugar P al lugar E (“exit”). • El tRNA que estaba en el lugar A se mueve al P • El mRNA se mueve al siguiente codón para ser reconocido por el tRNA en el lugar A.
  • 107. ELONGACION EUCARIOTES • eEF1α (GTP) = EF-Tu de bacterias • eEF2 (GTP) = EF- G de bacterias • eEF1β (GTP) recicla (GTP) eEF1α
  • 108.
  • 109. Traducción: (terminación) • Luego de haberse formado la cadena de polipéptidos (elongación), se va colocar un codón de terminación (UAA, UAG, UGA) • Cuando el tRNA llega no reconoce el codón y detiene el proceso de elongación y se termina con la síntesis de proteína
  • 110. TERMINACION EN EUCARIOTES • Solo un factor de liberación (RF) • 10 millones ribosomas /célula • 18 residuos de aa/ seg (20 aa diferentes) • DNA pol 10 N/seg. • RNA pol 55 N/seg • Síntesis proteínas 200M/ enlaces/ seg
  • 111.
  • 112. 1865 Beadle & Tatum - 1941 La hipótesis un gen – una enzima ¿Cómo funciona el genoma para manifestar sus características? Gen 1 Gen 2 Gen 3 Producto Precursor Enz 1 A Enz 2 B Enz 3 final
  • 113. 1865 Beadle & Tatum - 1941 La hipótesis un gen – una enzima Neurospora crassa
  • 114. Figure 14-11a Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 115. Figure 14-11b Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 116. Figure 14-11c Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 117. Figure 14-11 Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.
  • 118. 1865 Beadle & Tatum - 1941 La hipótesis un gen – una enzima Ascosporas en medio completo Neurospora crassa Rayos X Mínimo + Todos amino ácidos crecen medio mínimo No crecen los mutantes Mutantes deficientes en la síntesis de arginina. Cys Glu Arg Lys His
  • 119. 1865 Beadle & Tatum - 1941 + Ornithine + Citruline Minimal + Arginine Medium Gene A Gene B Gene C Tipo Precursor Enz A Ornithine Enz B Citruline Enz C Arginine normal BLOQUEO Mutantes Precursor Ornithine Enz B Citruline Enz C Arginine clase I Mutantes clase II Precursor Enz A Ornithine Citruline Enz C Arginine Mutantes clase III Precursor Enz A Ornithine Enz B Citruline Arginine
  • 120. Figure 14-10 Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.

Notes de l'éditeur

  1. Table 12-2 Categories and Properties of Histone Proteins
  2. Figure 13-9 The early stages of transcription in prokaryotes, showing (a) the components of the process; (b) template binding at the site involving the sigma subunit of RNA polymerase and subsequent initiation of RNA synthesis; and (c) chain elongation, after the sigma subunit has dissociated from the transcription complex and the enzyme moves along the DNA template.
  3. Figure 13-9a The early stages of transcription in prokaryotes, showing (a) the components of the process; (b) template binding at the site involving the sigma subunit of RNA polymerase and subsequent initiation of RNA synthesis; and (c) chain elongation, after the sigma subunit has dissociated from the transcription complex and the enzyme moves along the DNA template.
  4. Figure 13-9b The early stages of transcription in prokaryotes, showing (a) the components of the process; (b) template binding at the site involving the sigma subunit of RNA polymerase and subsequent initiation of RNA synthesis; and (c) chain elongation, after the sigma subunit has dissociated from the transcription complex and the enzyme moves along the DNA template.
  5. Figure 13-9c The early stages of transcription in prokaryotes, showing (a) the components of the process; (b) template binding at the site involving the sigma subunit of RNA polymerase and subsequent initiation of RNA synthesis; and (c) chain elongation, after the sigma subunit has dissociated from the transcription complex and the enzyme moves along the DNA template.
  6. Figure 13-10 Posttranscriptional RNA processing in eukaryotes. Heterogeneous nuclear RNA (hnRNA) is converted to messenger (mRNA), which contains a cap and a -poly-A tail, which then has introns spliced out.
  7. Figure 14-11a Induction, isolation, and characterization of a nutritional auxotrophic mutation in Neurospora. In (a), most conidia are not affected, but one conidium (shown in red) contains such a mutation. In (b) and (c), the precise nature of the mutation is determined to involve the biosynthesis of tyrosine.
  8. Figure 14-11b Induction, isolation, and characterization of a nutritional auxotrophic mutation in Neurospora. In (a), most conidia are not affected, but one conidium (shown in red) contains such a mutation. In (b) and (c), the precise nature of the mutation is determined to involve the biosynthesis of tyrosine.
  9. Figure 14-11c Induction, isolation, and characterization of a nutritional auxotrophic mutation in Neurospora. In (a), most conidia are not affected, but one conidium (shown in red) contains such a mutation. In (b) and (c), the precise nature of the mutation is determined to involve the biosynthesis of tyrosine.
  10. Figure 14-11 Induction, isolation, and characterization of a nutritional auxotrophic mutation in Neurospora. In (a), most conidia are not affected, but one conidium (shown in red) contains such a mutation. In (b) and (c), the precise nature of the mutation is determined to involve the biosynthesis of tyrosine.
  11. Figure 14-10 Metabolic pathway involving phenylalanine and tyrosine. Various metabolic blocks resulting from mutations lead to the disorders phenylketonuria, alkaptonuria, albinism, and tyrosinemia.