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bibliographiques médicale en français (BDBfr) 
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Terminologie 
Descripteurs 
Qualificatifs 
Affiliation 
Deux séquences
CISMeF affiche 
les documents 
dans leur 
intégralité 
Sans titre par Hamed Saber Licence CC BY
CISMeF 
Terminologie 
Un thesaurus est un 
ensemble de termes 
ayant entre eux des 
relations 
hiérarchiques. 
Le thesauru...
CISMeF 
Descripteurs 
Rhumatismes 
Arthrose 
Coxarthrose 
Gonarthrose 
Ostéo-arthrite vertébrale 
L’arborescence des 
term...
CISMeF 
Qualificatifs 
Pour les maladies : 
étiologie, 
épidémiologie, 
diagnostic, thérapie, 
complications, 
chirurgie, ...
Organisation et administration 
Economie 
Physiologie 
Génétique 
Immunologie 
Métabolisme 
Enzymologie 
LCR 
Sang 
Urine ...
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descripteur/qualificatif est au 
coeur des requêtes dans CISMeF 
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CISMeF 
L’affiliation descripteur/qualificatif 
Arthrose/diagnostic 
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CISMeF 
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CISMeF 
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Les 3 plans de la séquence 1 
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La BDBfr est une 
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bibliographiques 
en français 
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University of Salford 
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S'informer sur une maladie avec une tablette

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L'information santé pour tous (patients et professionnels de santé) recherchée dans le Catalogue et index des sites médicaux francophones (CISMeF) et dans la Banque de données bibliographiques en français (BDBfr).

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S'informer sur une maladie avec une tablette

  1. 1. S’informer sur une maladie avec une tablette Philippe Eveillard phe@club-internet.fr Pour le téléchargement voir page suivante Version décembre 2014
  2. 2. COMMENT TÉLÉCHARGER SUR VOTRE TABLETTE LA PRÉSENTATION « S’INFORMER SUR UNE MALADIE » • Inscrivez-vous sur Slideshare, le site de stockage des présentations PowerPoint. • Téléchargez sur votre tablette l’application Slideshare Presentation App (Google Play) ou devenez béta-testeur de l’application iOS (si environnement Apple). http://bit.ly/1uWUS1D • Téléchargez sur votre tablette le PowerPoint « s’informer sur une maladie »
  3. 3. Présentation Objectif 01 02 03 L’information pour tous La levée des obstacles Les outils CISMeF BDBfr Les maladies dans CISMeF Terminologie Descripteur Affiliation Séquence (1) Séquence (2 Les maladies dans la BDBfr Requêtes Résultats Séquence (1) Séquence (2)
  4. 4. Salford Business School launches unique open access online course par university of Salford Licence CC BY Objectif: s’informer en santé en simplifiant les requêtes et en sélectionnant les sources
  5. 5. Objectif L’information pour tous En leur temps, CISMeF (1995) et PubMed (1997) ont été les 2 premières initiatives marquantes pour explorer le Web santé. Les obstacles rencontrés avec ces 2 outils de recherche (langage et syntaxe) ont laissé le champ libre à Google (1999) pour monopoliser l’attention des internautes. Aujourd’hui, il convient d’aider les patients à dépasser le stade Google-Doctissimo-Wikipédia et les professionnels de santé à sortir de la stricte spécificité de leur profession (infirmière, dentiste, pharmacien, médecin…) Au projet d’information pour tous répond le souhait d’un tronc commun de formation initiale pour tous les professionnels de santé apprendre à travailler ensemble en formation initiale http://bit.ly/1xKBowr
  6. 6. L’information pour tous impose un niveau de littératie* adapté Children Reading Pratham Books and Akshara par Pratham Books Licence CC BY *Littératie = aptitude à comprendre l’information écrite
  7. 7. Objectif La levée des obstacles Plusieurs obstacles sont levés par l’utilisation de 2 outils de recherche : - CISMeF pour les patients et les professionnels, - et la BDBfr pour les professionnels. La langue anglaise et la syntaxe des outils de recherche sont les 2 obstacles à franchir. Pour cela, la solution passe par la recherche d’un niveau de littératie adapté à chaque cible. Cela suppose de limiter le champ d’exploration aux sources francophones et de choisir dans les outils de recherche les procédures les plus simples… sans mégoter sur la qualité du résultat. On se croit par fois dans « Mission impossible », mais l’objectif peut être atteint si l’on y croit suffisamment.
  8. 8. Les outils de recherche CISMeF BDBfr 01
  9. 9. Physician taking temperature of young patient Courtesy of the U.S National Library of Medicine, Bethesda, Maryland L’information sur les maladies est recherchée dans CISMeF et dans la BDBfr
  10. 10. Les outils CISMeF Le catalogue et index des sites médicaux francophones (CISMeF) est le principal outil de recherche des documents médicaux disponibles en texte intégral sur le Web francophone. La fiabilité des documents est vérifiée avant leur intégration dans le catalogue. Depuis 1995, CISMeF n’a cessé d’enrichir son contenu (près de 110 000 sites et documents en octobre 2014). Les atouts • Texte intégral • Diversité des documents • Sélection des sources • Options Patient Recommandation Enseignement
  11. 11. Les outils BDBfr Le projet d’une base de données bibliographiques médicale en français (BDBfr) est porté par CISMeF. Cette base de données est « consultable gratuitement sur l’Internet » et rassemble « les principaux contenus scientifiques de santé en français ». Il s’agite essentiellement d’articles de la presse médicale francophone. L’accès au texte intégral n’est pas toujours possible. Quand il l’est, il est soit payant (texte intégral sur abonnement), soit gratuit (texte intégral gratuit). La base.de données contient des références d’articles en provenance : - des périodiques francophones indexés dans PubMed/MEDLINE ; - des publications de l’éditeur Masson-Elsevier.
  12. 12. Les maladies dans CISMeF 02 Terminologie Descripteurs Qualificatifs Affiliation Deux séquences
  13. 13. CISMeF affiche les documents dans leur intégralité Sans titre par Hamed Saber Licence CC BY
  14. 14. CISMeF Terminologie Un thesaurus est un ensemble de termes ayant entre eux des relations hiérarchiques. Le thesaurus de CISMeF (version française de celui de PubMed) rassemble les Medical Subject Headings (d’où l’acronyme MeSH) CISMeF est interrogé de préférence avec les termes du thesaurus MeSH. C’est avec ces termes que les documents de CISMeF sont indexés. Il est donc logique et fortement conseillé de les utiliser pour explorer le catalogue. Le Portail terminologique de santé de CISMeF traduit les mots clés du langage courant en termes du langage MeSH*, utilisés pour interroger CISMeF. * Un grand nombre de termes MeSH (version française) sont identiques aux mots clés du langage courant, mais certains ne le sont pas…
  15. 15. CISMeF Descripteurs Rhumatismes Arthrose Coxarthrose Gonarthrose Ostéo-arthrite vertébrale L’arborescence des termes MeSH relatifs à l’arthrose (osteoarthritis). Les descripteurs sont les termes du thesaurus MeSH Il y a 27 149 descripteurs dans le thesaurus MeSH 2014. Ces descripteurs ont, entre eux, des relations hiérarchiques présentées sous la forme d’une arborescence de termes (v. encadré). Cet « arbre » comporte 16 branches maitresses dont une rassemble toutes les maladies (branche Diseases). Les qualificatifs « complètent le tableau » du langage MeSH. Ces qualificatifs, au nombre de 83, précisent le sens des descripteurs.
  16. 16. CISMeF Qualificatifs Pour les maladies : étiologie, épidémiologie, diagnostic, thérapie, complications, chirurgie, radiothérapie… Dans la page suivante sont énumérés les qualificatifs compatibles avec les descripteurs de la catégorie « maladies ». En effet, parmi les 83 qualificatifs, certains correspondent aux maladies, d’autres aux médicaments, d’autres aux investigations diagnostiques. En fait, chaque catégorie du thesaurus a son « lot » de qualificatifs. Comme les descripteurs, les qualificatifs ont, entre eux, des relations hiérarchiques. Celles des qualificatifs de la catégorie maladie sont indiqués dans la liste.
  17. 17. Organisation et administration Economie Physiologie Génétique Immunologie Métabolisme Enzymologie LCR Sang Urine Physiopathologie Statistiques et données numériques Epidémiologie Ethnologie Mortalité Thérapie Chirurgie Diétothérapie Prévention et contrôle Radiothérapie Rééducation et réadaptation Soins infirmiers Classification Psychologie Analyse LCR Sang Urine Anatomie et histologie Cytologie Anatomie pathologique Embryologie Diagnostic Anatomie pathologique Echographie Radiographie Scintigraphie Etiologie Complications Congénital Embryologie Génétique Immunologie Induit chimiquement Microbiologie Virologie Parasitologie Médecine Vétérinaire
  18. 18. L’affiliation descripteur/qualificatif est au coeur des requêtes dans CISMeF Mother and daughter par dr_tr Licence CC BY
  19. 19. CISMeF L’affiliation descripteur/qualificatif Arthrose/diagnostic Arthrose/radiographie Diagnostic par imagerie Imagerie par résonance magnétique Indexation d’un article de la Revue médicale suisse intitulé « Imagerie et arthrose ». Cette indexation comporte 2 affiliations. Chaque document de CISMeF est indexé avec une ou plusieurs affiliations descripteur/qualificatif (v. encadré) Une affiliations descripteur/qualificatif est un mariage entre un descripteur et un qualificatif (v. les pages précédentes). Dans une affiliation, le descripteur et le qualificatif sont accolés, simplement séparés par un slash. Exemples : asthme/diagnostic ; tumeurs colorectales/chirurgie ; arthrose/radiographie
  20. 20. CISMeF Deux séquences Dans la première séquence, la requête est limitée aux documents concernant les patients. Dans la seconde, la requête comporte une affiliation et une option (recommandation ou enseignement). L’information pour tous nécessite de simplifier (schématiser) les procédures et d’afficher à l’écran des documents aisément compréhensibles C’est la raison pour laquelle deux séquences de recherche sont proposées. La première est destinée aux patients et la seconde l’est aux professionnels de santé, en sachant que rien n’empêche les patients d’accomplir le parcours de cette deuxième séquence.
  21. 21. Chaque séquence est découpée en 3 plans Filming par JohnSeb Licence CC BY
  22. 22. CISMeF Action ! La première action consiste à traduire le mot-clé en descripteur MeSH en sollicitant le Portail terminologique de santé (page d’accueil de CISMeF). L’action suivante se passe dans la page de résultat de la traduction (Portail HeTOP). Il s’agit d’activer : - soit le bouton CISMeF pour afficher une nouvelle page ; - soit l’onglet PubMed/Doc’CISMeF pour sélectionner un qualificatif et une ressource La dernière action finalise les 2 précédentes : - en sélectionnant (case à cocher) une ressource (éventualité nouvelle page), - ou en activant le bouton CISMeF BP ou UMVF selon la ressource (éventualité sélection qualificatif et ressource).
  23. 23. CISMeF Séquence 1 (patient) L’accès au Portail terminologique de santé se fait par la fenêtre du Portail dans la page d’accueil de CISMeF. Dans la première séquence, la requête est limitée à un descripteur et aux documents destinés aux patients. La démarche consiste à traduire le mot clé en descripteur MeSH et à sélectionner le type de ressource information patient et grand public. La traduction se fait dans le portail terminologique de santé (accessible depuis la page d’accueil de CISMeF) et la sélection dans la page de résultat.
  24. 24. CISMeF Les 3 plans de la séquence 1 Traduction du mot clé en descripteur MeSH grâce au Portail terminologique de santé. Activation du bouton CISMeF (en bas de la page) après affichage de la traduction dans HeTOP Sélection du type de ressource information patient et grand public dans la page de résultat 1 2 3
  25. 25. CISMeF Séquence 2 (professionnel de santé) Par rapport à la séquence 1, la séquence 2 est d’un niveau de complexité plus grand, concernant aussi bien les procédures que les textes Dans la 2è séquence, la requête comporte une affiliation descripteur/qualificatif. Un type de ressource peut y être associé : enseignement ou recommandations La « construction » de l’affiliation comprend 2 temps : un temps traduction du mot clé en descripteur MeSH et un temps affiliation d’un qualificatif au descripteur. La sélection de la ressource est faite en même temps que celle du qualificatif.
  26. 26. CISMeF Les 3 plans de la séquence 2 Traduction du mot clé en descripteur MeSH grâce au Portail terminologique de santé. Affichage des qualificatifs par activation de l’onglet PubMed/Doc’CISMeF dans le Portail HeTOP Sélection du qualificatif et de la ressource (sous les qualificatifs). Activation du bouton adhoc. 1 2 3
  27. 27. Les maladies dans la BDBfr 03 Requêtes Pages de résultat Deux séquences
  28. 28. La BDBfr est une base de données bibliographiques en français destinée à l’information des professionnels de santé Nurse wearing uniform from British Honduras Courtesy of the US National Library of Medicine, Bethesda, Maryland
  29. 29. BDBfr La formulation des requêtes Comme dans PubMed, un champ indique la nature ou la localisation d’un mot clé. Ainsi, une maladie peut être : - un descripteur (.mc) - un mot du titre (.ti) - un mot de tous les champs (.tc). Sous la fenêtre d’interrogation de la BDBfr figurent deux mentions. L’une concerne le langage MeSH, l’autre les champs. C’est l’indication que la BDBfr. est interrogée avec les mêmes descripteurs (et les mêmes affiliations descripteur/qualificatif) que CISMeF… mais que, en plus, leur nature (mot clé) est spécifiée par un champ. Ce champ est .mc Exemples : asthme.mc ; asthme/diagnostic.mc ; gonarthrose/chirurgie.mc; bronchite/complications.mc
  30. 30. BDBfr Le contenu de la page de résultats La base de données bibliographiques médicale en français rassemble : - les références des articles de la presse médicale francophone indexés dans PubMed ; - les références des articles de l’éditeur Masson/Elsevier. Dans la page de résultats de la BDBfr sont rassemblés des références, des informations et des liens en rapport avec des articles. Pour chaque référence, les informations concernent le(s) type(s) de ressources et l’accès au texte intégral (gratuit ou sur abonnement). Les liens intéressent : - le site EMC|consulte quand la référence est celle d’un article de l’éditeur Masson/Elsevier ; - la référence de l’article dans PubMed.
  31. 31. Deux séquences destinées aux professionnels de santé : entre sensibilité et précision Banlancing act par tanakawho Licence CC BY
  32. 32. BDBfr Deux séquences Attention ! : Le filtre ajouté après l’affichage du résultat de l’équation de recherche restreint le champ de la requête qu’elle soit (au départ) sensible ou précise. Le degré de restriction dépend du filtre. L’information des professionnels de santé peut être envisagée de deux façons : sensible (large) ou précise (restreinte). C’est la raison pour laquelle deux requêtes sont programmées : l’une avec un descripteur correspondant à une maladie (information sensible), l’autre avec une affiliation descripteur/qualificatif dans laquelle un qualificatif précise le sens du descripteur (information précise).
  33. 33. and… action par Latin Snake Licence Cc BY Action ! L’action se déroule en 3 temps : dans CISMeF, puis dans la fenêtre d’interrogation de la BDBfr, enfin dans la page de résultat de la BDBfr
  34. 34. BDBfr Séquence 1 (descripteur) La sélection de l’option « texte intégral gratuit » restreint sensiblement le champ de la recherche. En effet, en moyenne, moins de 10% des articles sont disponibles en texte intégral. Dans cette séquence, la requête est formulée avec le descripteur correspondant à la maladie et le filtre texte intégral gratuit. Le descripteur est accompagné du champ .mc Dans la page de résultats le filtre est sélectionné en cochant la case correspondante. Cette séquence doit permettre au professionnel de santé de prendre connaissance des articles en rapport avec la maladie sans avoir besoin de se déplacer dans une bibliothèque universitaire ou de payer l’article à l’éditeur.
  35. 35. BDBfr Les 3 plans de la séquence 1 Traduction du mot clé en descripteur MeSH grâce au Portail terminologique de santé. Entrée du descripteur MeSH avec son champ .mc dans la fenêtre d’interrogation de la BDBfr Sélection de l’option texte intégral gratuit dans la page de résultats. 1 2 3
  36. 36. BDBfr Séquence 2 (affiliation) Pour obtenir le texte intégral dont l’accès n’est pas gratuit dans la BDBfr, il faut le récupérer dans une B.U ou l’acheter à l’éditeur : - par le lien avec cet éditeur, - ou par le lien avec PubMed. La requête est formulée avec une affiliation et le filtre revue de la littérature, afin d’obtenir une information synthétique. L’affiliation descripteur/qualificatif est accompagnée du champ .mc Dans la page de résultats le filtre est sélectionné en cochant la case correspondante. Cette séquence affiche des références d’articles dont un grand nombre ne sont pas disponibles gratuitement en texte intégral.
  37. 37. BDBfr Les 3 plans de la séquence 2 Traduction du mot clé en descripteur MeSH grâce au Portail terminologique de santé et vérification des qualificatifs pouvant lui être affiliés (onglet PubMed/CISMeF de HeTOP) Entrée de l’affiliation accompagnée du champ .mc dans la fenêtre d’interrogation de la BDBfr. Sélection de l’option revue de la littérature dans la page de résultats. 1 2 3
  38. 38. Aux photographes qui ont illustré ce slidedoc : University of Salford https://www.flickr.com/photos/32104790@N02/9718507502 Pratham Books https://www.flickr.com/photos/prathambooks/3292434390/ U.S National Library of Medicine https://www.flickr.com/photos/nlmhmd/4644489973/ Hamed Saber https://www.flickr.com/photos/44124425616@N01/512309138/ dr_tr https://www.flickr.com/photos/dr_tr/4780145333/ John Seb https://www.flickr.com/photos/johnseb/6948503978/ U.S National Library of Medicine https://www.flickr.com/photos/nlmhmd/8616715370/ tanakawho https://www.flickr.com/photos/28481088@N00/1504252690/ Latin Snake https://www.flickr.com/photos/34807320@N00/5614033198/ A Nancy Duarte qui a créé les slidedocs et les modèles de maquette qui permettent de participer à l’aventure de ces « présentations à lire ». http://www.duarte.com/fr/slidedocs/ http://docedu.fr/WordPress/archives/1285 MERCI Aux blogueuses Farfadoc, docteurmilie, docteur Gécé et Géluile MD qui ont publié le 16 octobre 2014 sur leurs blogs respectifs un billet sur le thème de la pédagogie médicale. Elles y ont exprimé leur soutien à l’initiative « apprendre à travailler ensemble » de l’Afdet. L’objectif du slidedoc « S’informer sur une maladie » est de donner (sur certains thèmes) à tous les professionnels de santé le même type d’information. http://www.afdet.net/AFDET_fichup/archive-686.pdf A Patrick Balouet (Collège des hautes études en médecine) qui m’a sollicité pour animer une formation pluri professionnelle sur les référentiels en médecine. Cette sollicitation est à l’origine de ce slidedoc.

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