![Le projet bioinformatique ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7)
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Analyse Retrospective Des DonnéEs De Biopuces
- 1. Analyse rétrospective de données de biopuces Etudiants Pierre MARGUERITE Isabelle PHILIP Etude de l’expression des gènes du tissu placentaire dans les grossesses diabétiques avec macrosomies par la technique des « Microarrays ». Tuteurs Pierre-Marie DANZE Arnaud SCHLOESING DESS Bioinformatique – Lille Plate-forme de génomique fonctionnelle Projet Bioinformatique
- 7. Normalisation Logiciel Jaguar Logiciel MIDAS Triplicates Données normalisées 1920 gènes 50-60 % 100% X 5 Lowess Par bloc Bruit de fond Flags
- 10. Confrontation des profils de patientes T2 DM DSM T2 DM DSM S = 0,5 => 58 gènes S = 1 => 6 gènes Confrontation - Profils d’expression des gènes Rejet Rejet 4 confrontations différentes
- 13. Synthèse ? ?
Notes de l'éditeur
- La prévalence de la macrosomie ou croissance fœtale accélérée reste plus élevée lors des grossesses associées au diabète de type 1 par rapport aux grossesses normales même après correction des troubles métaboliques et exclusion des autres facteurs maternels influençant la croissance fœtale. Les ARN extraits de 5 échantillons placentaires recueillis lors de la délivrance (1 témoin, 2 diabétiques macrosomes, 2 diabétiques non macrosomes) sont testés versus un ARN standard commun issus d’un deuxième placenta témoin. . L’étude et l’analyse de l’expression placentaire à terme au niveau du transcriptome par la technique des « Microarrays » cherche à déterminer les gènes modulés différentiellement entre placentas de fœtus macrosomes et non macrosomes issus de grossesses diabétiques de type 1 équilibrées sur le plan métabolique. déterminer les gènes modulés différentiellement entre placentas de fœtus macrosomes et non macrosomes issus de grossesses diabétiques de type 1 équilibrées sur le plan métabolique. DM1: excés diffus d’aes nucléuires syncitiotrophoblastique DM2: placenta daspect avant terme avec thromboses sous choriales DSM1 : placenta immature pour le terme avec infarctus sur 10 % de la surface DSM2
- F001 637 spots 11% F002 437 spots 7% F003 1304 spots 23% F004 1240 spots 22% F005 553 spots 10% F001 1700 spots 30% F002 1727 spots 30% F003 1921 spots 33% F004 1910 spots 33% F005 1570 spots 27%
- Selection 72 gènes communs Selection sevère : 6 gènes communs
- 8% à 17 % -> 58 gènes communs soit 3% 1% à 2% environ -> 6 gènes en commun soit 0,3 %
- NM_000457 NM_003840 NM_014517