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Institut für Wasserchemie
                  und
  Lehrstuhl für Analytische Chemie




•www.ws.chemie.tu-muenchen.de
Mykotoxine –
die Gifte der Schimmelpilze
Spurenanalytische Techniken:

                   Bioanalytik I

             Dietmar Knopp
  Lehrstuhl für Analytische Chemie,
    Institut für Wasserchemie und
       Chemische Balneologie
   Technische Universität München
               Marchioninistr. 17
               D-81377 München
           Dietmar.Knopp@ch.tum.de
 http://www.ws.chemie.tu-muenchen.de/groups/bioanalytic.html
Was ist "Bioanalytik"?
Nicht eindeutig definiert!
• Definition 1: Analytik in
  biologischen Matrices
  (Bsp. Pharmakokinetik)
Was ist "Bioanalytik"?
Nicht eindeutig definiert!
• Definition 1: Analytik in biologischen
  Matrices
  (Bsp. Pharmakokinetik)
• Definition 2: Bioindikation und Biotests
  (Suborganismische und organismische
  Tests)
DEFINITION 2
  a) Bioindikation
    Biologisches Verfahren zur
  qualitativen und quantitativen
Ermittlung von anthropogenen und
 natürlichen Umwelteinflüssen mit
 geeigneten Indikatororganismen
     (integrierende Anzeige).
a) Bioindikation
       Flechten (Indikator für Luftverschmutzung)




                               Bartflechten, Alpen

                                                     immissiongeschädigt
Mosaik aus Gesteinsflechten,
           Alpen
b) Biotests (suborganismische und
organismische Tests)
    Zielorganismen aus verschiedenen Biotopbereichen:

•   Fische
•   Kleinkrebse (Daphnien)
•   Mikroorganismen
    (Ps. putida, Vibrio fischeri)                                Daphnien
                                          Goldorfe




Vornehmlich für die Gewässer- und Einleiterkontrolle (Konzentrationsreihen
   suspekter Abwasser- und Wasserproben; Integration der Wirkung des
   „Chemikaliencocktails“); ja/nein-Antwort (akut toxische Wirkung)
Was ist "Bioanalytik"?
Nicht eindeutig definiert!
• Definition 1: Analytik in biologischen
  Matrices
  (Bsp. Pharmakokinetik)
• Definition 2: Biotests
  (Suborganismische und organismische
  Tests)
• Definition 3: Analytik von Biomolekülen
  (Analytische Methoden in den
  Biowissenschaften)
DEFINITION 3      Analytik von Biomolekülen
(Analytische Methoden in den Biowissenschaften)
Was ist "Bioanalytik"?
Nicht eindeutig definiert!
• Definition 1: Analytik in biologischen Matrices
  (Bsp. Pharmakokinetik)
• Definition 2: Biotests
  (Suborganismische und organismische Tests)
• Definition 3: Analytik von Biomolekülen
  (Analytische Methoden in den
  Biowissenschaften)
• Definition 4: Analytik mit Hilfe von
  Biomolekülen
  (Biochemische und molekularbiologische
  Analysenverfahren)
DEFINITION 4
                    Analytik mit Hilfe von Biomolekülen
                 (Biochemische und molekularbiologische
                            Analysenverfahren)

Reaktionen auf molekularer Ebene (molekulare Erkennung
und daraus resultierende hohe Spezifität)

Proteine:               - Enzym-Substrat-Wechselwirkung
                        (Enzymologie)

                        - Antigen-Antikörper Wechselwirkung
                        (Immunologie)

Nukleinsäuren:          Gensonden-Techniken

Übergeordnet:           Biosensoren
Themen
1.     Analytik von Biomolekülen
1.1.   Kohlenhydrate
1.2.   Nukleinsäuren
1.3.   Aminosäuren, Peptide, Proteine

2.     Analytik mit Biomolekülen
2.1.   Immunologische Methoden (Immuntests)
       (-      Immunsystem, Antikörper, Herstellung von
               anti-Hapten Antikörpern,
       -       Immunoassays, Matrix-Interferenzen,
               Validierung, Schnelltests
       -       Immunaffinitätschromatographie, Sorbentien,
               Immobilisierung, Elution)
2.2.   Microarrays/Blots
Literatur
1. Analytik von
  Biomolekülen

1.1. Kohlenhydrate
Kohlenhydrate
• C, H, O
• Aldehyde oder Ketone
• Mono-, Di, Oligo- und Polysaccharide
• Energiespeicherung, strukturelle Komponenten,
  Signal- und Informationsträger
• Bestandteile der Erbsubstanz
Nachweismethoden
(Hydrolyse der Kohlenhydrate)

• Colorimetrie

• Chromatographie (DC, HPLC, GC)

• Isoelektrische Fokussierung (IEF)

• NMR
1. Analytik von
   Biomolekülen

1.2. Nukleinsäuren
Nukleobasen
A    C            U




G     T
Nukleoside / Nukleotide / DNA,
             RNA
Gesamt DNA
Vorbehandlung:
DNA aus Probe isolieren (präzipitieren);
anschließend Depurinierung (Spaltung der N-glykosidischen
Bindung von Purinbasen und Desoxyribose);
anschließend Umsetzung mit Reaktionsprodukt

Colorimetrisch
• Diaminobenzoesäure-Methode (420 nm)
• Diphenylamin (595 nm)
Gesamt DNA
Fluoreszenz
1.   Analytik von Biomolekülen

1.3. Aminosäuren / Peptide /
     Proteine
Proteinogene (kanonische) Aminosäuren
Radiomarkierung
von Proteinen
Protein-Tests I
Protein-Tests II
Aminosäure-Analyse: Spaltung v. Proteinen




• Saure Hydrolyse (6 N HCl, 24 h, 110 °C), häufigste Methode
   Verluste bei Serin, Threonin, Methionin,
   Cystein, Tryptophan, Asparagin, Glutamin


• Alkalische Hydrolyse (4 M BaOH, NaOH oder LiOH), selten
    Bessere Tryptophanausbeute


• Enzymatische Hydrolyse (mehrere Enzyme notwendig), selten
    Asparagin, Glutamin, sulfatierte oder phosphorylierte Aminosäuren
Aminosäure-Analyse: Derivatisierung
Aminosäure-Analyse: Ninhydrin-Reaktion
Ionenaustausch-Chromatographie +
Nachsäulenderivatisierung (Ninhydrin)
RP-Chromatographie +
Vorsäulenderivatisierung (OPA)
Andere Vorsäulenderivatisierungen (PITC und FMOC)
Chirale Aminosäureanalyse
Peptidanalytik I




 Standardmethode:
 HPLC (RP-18/C18-Phase), Acetonitril/Wasser/Trifluoressigsäure (0.1%),
 Gradientenelution, UV-Detektion (ca. 220 nm) bzw. Photodiodenarray (PDA)
Peptidanalytik II




                    Weitere Methoden:

                    • LC-MS
                    • LC-MS/MS
                    • Immunoassays

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Spurenanalytik2010 knopp1

  • 1. Institut für Wasserchemie und Lehrstuhl für Analytische Chemie •www.ws.chemie.tu-muenchen.de
  • 2.
  • 3. Mykotoxine – die Gifte der Schimmelpilze
  • 4. Spurenanalytische Techniken: Bioanalytik I Dietmar Knopp Lehrstuhl für Analytische Chemie, Institut für Wasserchemie und Chemische Balneologie Technische Universität München Marchioninistr. 17 D-81377 München Dietmar.Knopp@ch.tum.de http://www.ws.chemie.tu-muenchen.de/groups/bioanalytic.html
  • 5. Was ist "Bioanalytik"? Nicht eindeutig definiert! • Definition 1: Analytik in biologischen Matrices (Bsp. Pharmakokinetik)
  • 6. Was ist "Bioanalytik"? Nicht eindeutig definiert! • Definition 1: Analytik in biologischen Matrices (Bsp. Pharmakokinetik) • Definition 2: Bioindikation und Biotests (Suborganismische und organismische Tests)
  • 7. DEFINITION 2 a) Bioindikation Biologisches Verfahren zur qualitativen und quantitativen Ermittlung von anthropogenen und natürlichen Umwelteinflüssen mit geeigneten Indikatororganismen (integrierende Anzeige).
  • 8. a) Bioindikation Flechten (Indikator für Luftverschmutzung) Bartflechten, Alpen immissiongeschädigt Mosaik aus Gesteinsflechten, Alpen
  • 9.
  • 10. b) Biotests (suborganismische und organismische Tests) Zielorganismen aus verschiedenen Biotopbereichen: • Fische • Kleinkrebse (Daphnien) • Mikroorganismen (Ps. putida, Vibrio fischeri) Daphnien Goldorfe Vornehmlich für die Gewässer- und Einleiterkontrolle (Konzentrationsreihen suspekter Abwasser- und Wasserproben; Integration der Wirkung des „Chemikaliencocktails“); ja/nein-Antwort (akut toxische Wirkung)
  • 11. Was ist "Bioanalytik"? Nicht eindeutig definiert! • Definition 1: Analytik in biologischen Matrices (Bsp. Pharmakokinetik) • Definition 2: Biotests (Suborganismische und organismische Tests) • Definition 3: Analytik von Biomolekülen (Analytische Methoden in den Biowissenschaften)
  • 12. DEFINITION 3 Analytik von Biomolekülen (Analytische Methoden in den Biowissenschaften)
  • 13. Was ist "Bioanalytik"? Nicht eindeutig definiert! • Definition 1: Analytik in biologischen Matrices (Bsp. Pharmakokinetik) • Definition 2: Biotests (Suborganismische und organismische Tests) • Definition 3: Analytik von Biomolekülen (Analytische Methoden in den Biowissenschaften) • Definition 4: Analytik mit Hilfe von Biomolekülen (Biochemische und molekularbiologische Analysenverfahren)
  • 14. DEFINITION 4 Analytik mit Hilfe von Biomolekülen (Biochemische und molekularbiologische Analysenverfahren) Reaktionen auf molekularer Ebene (molekulare Erkennung und daraus resultierende hohe Spezifität) Proteine: - Enzym-Substrat-Wechselwirkung (Enzymologie) - Antigen-Antikörper Wechselwirkung (Immunologie) Nukleinsäuren: Gensonden-Techniken Übergeordnet: Biosensoren
  • 15. Themen 1. Analytik von Biomolekülen 1.1. Kohlenhydrate 1.2. Nukleinsäuren 1.3. Aminosäuren, Peptide, Proteine 2. Analytik mit Biomolekülen 2.1. Immunologische Methoden (Immuntests) (- Immunsystem, Antikörper, Herstellung von anti-Hapten Antikörpern, - Immunoassays, Matrix-Interferenzen, Validierung, Schnelltests - Immunaffinitätschromatographie, Sorbentien, Immobilisierung, Elution) 2.2. Microarrays/Blots
  • 17.
  • 18. 1. Analytik von Biomolekülen 1.1. Kohlenhydrate
  • 19. Kohlenhydrate • C, H, O • Aldehyde oder Ketone • Mono-, Di, Oligo- und Polysaccharide • Energiespeicherung, strukturelle Komponenten, Signal- und Informationsträger • Bestandteile der Erbsubstanz
  • 20.
  • 21. Nachweismethoden (Hydrolyse der Kohlenhydrate) • Colorimetrie • Chromatographie (DC, HPLC, GC) • Isoelektrische Fokussierung (IEF) • NMR
  • 22. 1. Analytik von Biomolekülen 1.2. Nukleinsäuren
  • 23. Nukleobasen A C U G T
  • 25. Gesamt DNA Vorbehandlung: DNA aus Probe isolieren (präzipitieren); anschließend Depurinierung (Spaltung der N-glykosidischen Bindung von Purinbasen und Desoxyribose); anschließend Umsetzung mit Reaktionsprodukt Colorimetrisch • Diaminobenzoesäure-Methode (420 nm) • Diphenylamin (595 nm)
  • 27. 1. Analytik von Biomolekülen 1.3. Aminosäuren / Peptide / Proteine
  • 29.
  • 30.
  • 31.
  • 32.
  • 33.
  • 34.
  • 38. Aminosäure-Analyse: Spaltung v. Proteinen • Saure Hydrolyse (6 N HCl, 24 h, 110 °C), häufigste Methode Verluste bei Serin, Threonin, Methionin, Cystein, Tryptophan, Asparagin, Glutamin • Alkalische Hydrolyse (4 M BaOH, NaOH oder LiOH), selten Bessere Tryptophanausbeute • Enzymatische Hydrolyse (mehrere Enzyme notwendig), selten Asparagin, Glutamin, sulfatierte oder phosphorylierte Aminosäuren
  • 45. Peptidanalytik I Standardmethode: HPLC (RP-18/C18-Phase), Acetonitril/Wasser/Trifluoressigsäure (0.1%), Gradientenelution, UV-Detektion (ca. 220 nm) bzw. Photodiodenarray (PDA)
  • 46. Peptidanalytik II Weitere Methoden: • LC-MS • LC-MS/MS • Immunoassays