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REPLICACIÓN DEL
 DNA Y SÍNTESIS
   PROTEÍNAS
Mg. Vania Mallqui Brito
Características replicación
1. Semiconservativa:síntesis de las nuevas cadenas
utilizan cada hebra parental como molde
2. El DNA se replica de manera ordenada y secuencial




Bidireccional, simultaneo al
desenrrollamiento hebras, 5’ – 3’, adición de
nucleótidos, usando desoxirribonucleótidos 5
´trifosfatos (dNTP)) al extremo 3´OH en
dependencia del nucleótido correspondiente
según el apareamiento de bases con la cadena
molde.
3. Proceso controlado: Las células antes de dividirse deben
duplicar su genoma y acoplado a la división celular. El control a dos
niveles:
• En la iniciación donde el DNA se replica en un momento
determinado.
• En el bloqueo de la reiniciación lo que impide que una vez iniciada
una ronda de replicación no comience otra.

4. Discontinuo
-Fragmentos
-Cadena líder 5’ – 3’,
avance horquilla
-Cadena retardada, por
fragmentos y en sentido     DNA polimerasa (procariontes I, II, III)
contrario “Fragmentos
Okasaki”                        Protagonista replicación y poder
                                        autrocorrector
Cambios en el DNA
•Errores en la replicación que escapen a la actividad correctora
•Lesiones ocurridas en el DNA por agentes mutagénicos.
•Recombinación (introduce la mayor taza de cambios).



Replicón
Contiene un origen donde comienza la replicación y un final donde
se detiene y contiene todos los elementos de control necesarios para
la replicación.
Procariontes un único replicón, eucariontes múltiples replicones
Etapas Replicación
1. Iniciación: reconocimiento origen replicación, acompañado
   complejo proteínas “primosomas” (E. coli)

2. Alargamiento: síntesis DNA “replisoma” aparece asociado
   horquilla replicación
3. Terminación: al final del replicón es necesaria una reacción de
   unión y/o terminación.

   DNA polimerasa, no inicia la
   síntesis si no está presente un
  cebador (primer) que provea el
  extremo 3` OH libre que pueda
    ser extendido por adición de
             nucleótidos.
Replicación procariotas
Iniciación   Características
Dna B        Helicasa 5’-3’, componente esencial replicón Ori C,
             activación Dna G
SSB          Une al DNA simple (reensamblaje), función cooperativa,
             protege ataque nucleasas
Dna C        Actúa con Dna B

Dna G        Actividad primasa (síntesis cebador), RNA polimerasa se
             une primosoma, activada Dna B e inicia síntesis primer
Dna A        ATP separa hebras doble hélice

RNA        Actúa Dna A formación horquilla
polimerasa
Girasa       Libera estrés torcional generada por el desenrollamiento
             del DNA al introducir superenrollamientos.
Alargamiento
                                  DNA polimerasa:
                                  síntesis una nueva cadena
                                  de DNA a partir de la hebra
                                  molde, tanto en procariotas
                                  como eucariotas, presenta
                                  una actividad enzimática
                                  múltiple, llamada replicasa.



DNA naciente siempre en sentido 5’→3’, el nucleótido que se
agrega une su a-fosfato al grupo 3’-OH libre de la cadena,
enlace entre las pentosas que componen los nucleótidos.
Replicación en E. coli
1. Proteínas iniciadoras reconocen y abren duplex forman “horquilla
   replicadora” (Ori C)
2. Primasa ó RNA polimerasa enzima que inicia la síntesis de DNA.
   Actúa en la forma de primosoma, unido a una DNA helicasa.
  El producto se llama "primer" u oligonucleótido iniciador. Este
  primer se sintetiza con la polaridad de 5' a 3' (proceso llamado
  "priming") y debe quedar antiparalelo con el templado. En la horquilla
  replicadora, ambas hebras son antiparalelas, un primer se sintetiza
  desde el punto de bifurcación de la horquilla hacia abajo, y el otro
  desde la base de ésta hacia arriba.
3. La DNA polimerasa III continúa con la replicación del DNA hasta
que se termina el templado y se forma una nueva horquilla
replicadora.


4. Una de las hebras de la horquilla se replicará en forma continua
presentando la DNA pol. III una alta procesividad. Esta hebra
templado se llama hebra conductora.
La otra hebra se replicará forma discontinua, se requiere de la
síntesis de un nuevo primer.
Templado recibe el nombre de hebra retrasada y dará origen a los
fragmentos de Okazaki, una sola enzima DNA pol.III para replicar
la hebra retrasada completa.
El replisoma actúa con el primosoma.
Enzimas tipo DNA topoisomerasas mantienen la topología normal
del DNA.
5.DNA pol.I , exonucleasa de 5’ a 3’ elimina los primers
6. La misma DNA pol. I con capacidad de polimerizar de 5’ a 3’
restituye con deoxinucleótidos la secuencia del primer; si se
incorpora una base incorrecta, esta es eliminada inmediatamente
por la polimerasa actividad exonucleasa (proceso es
autocorrector).


7. DNA ligasa une los fragmentos de Okasaki, producto de la
síntesis discontinua

                           Terminación
             Tus: esta proteína promueve la detención
             de la horquilla de replicación al proveer
             una actividad contra-helicasa. (Terminus
             Utilization Substance
REPLICACIÓN DNA- procariontes
INICIACIÓN
REPLICACIÓN DNA
Replicación DNA eucariontes
-Existen algunas diferencias, dada la mayor complejidad y tamaño del
genoma eucariótico.
-Debido a la existencia de múltiples replicones en el genoma
eucariótico existen tantos orígenes como replicones hay
-No existen rondas de replicación solapadas la división celular tiene
lugar una vez que el DNA se ha replicado, durante la fase S del ciclo
celular.
-Los fragmentos de Okazaki son mas cortos.
El control es mucho más complejo.
-Los cebadores están compuestos por RNA (aproximadamente 10
bases) y DNA (iDNA, aproximadamente 20-30 bases).
Enzimas
involucradas
en el proceso
Los genes y como trabajan
Archibald Garrod, 1902, primero en sugerir, la relación entre
enfermedad y metabolismo a través de su estudio de la alcaptonuria,
(elimina por la orina una gran cantidad de ácido homogentísico).
Razonó que individuos sanos el ácido homogentísico se debía
metabolizar a otros productos, razón por la cual no aparecía en orina.
Sospechó existencia de bloqueo en la vía metabólicas y propuso era
debido a "un error innato del metabolismo”.
Descubrió que la alcaptonuria se heredaba como recesivo.
George Beadle y Edward Tatum 30 – 40s , conexión entre genes y
metabolismo propusieron la hipótesis "un gen una enzima",premio
Nobel 1958.
Dado que un gen codifica para la producción de una proteína. "Un
gen una enzima" ha sido modificado a "un gen un polipéptido"
DOGMA
La información fluye (con la excepción de la transcripción reversa)
ADN           ARN, proceso llamado TRANSCRIPCIÓN
PROTEÍNA por el proceso TRADUCCIÓN


Transcripción es el proceso de fabricación ARN usando el ADN
                           como molde.


 Traducción es la construcción de una secuencia de aminoácidos
 (polipéptido) con la información proporcionada por la molécula de
                               ARN.
(ARNm) es el molde para la construcción de la proteína.


(ARNr) se encuentra en el sitio donde se construye la proteína:
el ribosoma.


(ARNt) es el transportador que coloca el aminoácido apropiado
en el sitio correspondiente.


El ARN tiene una sola hebra, el ARNt puede formar una
estructura de forma de trébol debido a la complementariedad de
sus pares de bases.
La ARN polimerasa abre la parte del ADN a ser transcripta. Solo
una de las hebras del ADN (la hebra codificante ) se transcribe. Los
  nucleótidos de ARN se encuentran disponibles en la región de la
cromatina (este proceso solo ocurre en la interfase) y se unen en un
              proceso de síntesis similar al del ADN.
La síntesis proteica consta de 3 etapas:
        iniciación, elongación y terminación
1.INICIACIÓN: RNA, ribosomas, factores iniciación IF-1, IF-2 y
   IF-3. Unión RNAm a subunidad menor, mediada por IF-3 Codón
   AUG y GUG, codones iniciación.

2. ELONGACIÓN: el segundo tRNA, determinado por la
   secuencia, se une dependiendo de los factores de elongación. Se
   produce una unión peptídica y el dipéptido queda en el sitio A, el
   tRNA queda en P; ocurre la translocación, donde el tRNA solo
   pasa al sitio A (el tRNA que sale puede ir a cargar otro
   aminoácido) y el dipéptido al sitio P. Cada vez que ocurre esto se
   libera GDP y factores de elongación, por lo que es un proceso
   caro.
3. TERMINACIÓN aparece un codón sin sentido, se libera la
   proteína y se separan las subunidades.
El Código Genético: Traducción del ARN en
                              proteína
-Astrónomo George Gamow señaló que el código que representa a
los aminoácidos debía consistir en grupos de al menos tres de las
cuatro bases del ADN
-los 20 aminoácidos están representados en el código genético por la
agrupación de tres letras (triplete).

- Si uno considera las posibilidades de arreglo de cuatro letras
agrupadas de a tres (43) resulta que tenemos 64 posibilidades de
palabras a codificar, o 64 posibles codones (secuencia de tres bases
en el ARNm que codifica para un aminoácido específico o una
secuencia de control).
El código genético consiste 61 codones para aminoácidos y 3
codones de terminación, que detienen el proceso de traducción. El
código genético es por lo tanto redundante, en el sentido que tiene
          varios codones para un mismo aminoácido.


Por ejemplo, la glicina es codificada por los codones GGU, GGC,
GGA, y GGG. Si un codón muta por ejemplo de GGU a GGC, se
                 especifica el mismo aminoácido.
Síntesis Proteica
La regulación de los genes de los procariotas difiere a eucariotas.
Los promotores son secuencias de ADN que comienzan señales
para la transcripción del ARN. Los terminadores son señales de
detención. La molécula de ARNm puede tener de 500 a 10.000
nucleótidos.
*La subunidad liviana tiene el sitio para que se pegue el ARNm.
Tiene un rol crucial en la decodificación del ARN pues monitorea el
apareamiento de bases entre el codón del ARNm y el anticodón de
ARNt.
*La subunidad pesada tiene dos sitios para el ARNt. Cataliza la
formación de la unión peptídica.
*El ARNt forma de trébol y lleva el
aminoácido apropiado al ribosoma
cuando el codón lo "llama".
*En la parte terminal del brazo mas
largo del ARNt se encuentran tres
bases, el anticodón que son
complementarias con el codón.
*Existen 61 ARNt diferentes, cada
uno posee un sitio diferente para
pegar el aminoácido y un anticodón
diferente.
*Para el codón UUU, el codón
anticomplementario es AAA.
•La unión del aminoácido apropiado al ARNt esta controlado por
una enzima: la aminoacil-ARNt sintetasa.
•La energía para la unión del aminoácido al ARNt proviene de la
conversión de ATP a AMP (adenosín-monofosfato).
•La traducción es el proceso de convertir las secuencias del ARNm
en una secuencia de aminoácidos.
•El código de iniciación es AUG codifica para el aminoácido
metionina (Met). La traducción no ocurre si no está el codón
AUG, por lo tanto la metionina (formil-metionina, f-Met ) es
siempre el primer aminoácido de la cadena polipeptídica, y
frecuentemente se elimina al final del proceso.


•El complejo formado por ARNt/ARNm/subunidad ribosómica
pequeña es llamado "complejo de iniciación". La subunidad
grande se pega al complejo de iniciación. Luego de esta fase el
mensaje progresa durante la elongación de la cadena
polipeptídica.
•Un nuevo ARNt lleva otro aminoácido al sitio P vacío del
complejo ribosoma /ARNm y posteriormente se forma un
enlace peptídico con el aminoácido del sitio ocupado.

•El complejo se mueve a lo largo del ARNm hasta el
próximo triplete, liberando el sitio A

•Cuando el codón es un codón de terminación, un factor de
liberación se pega al sitio, parando la traducción y liberando
al complejo ribosómico del ARNm.
SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
SÍNTESIS DE
PROTEÍNAS




  A)PROCARIOTAS
  B) EUCARIOTAS
INICIACIÓN



             ELONGACIÓN
TERMINACIÓN
REPLICACIÓN DNA Y SÍNTESIS PROTEÍNAS

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REPLICACIÓN DNA Y SÍNTESIS PROTEÍNAS

  • 1. REPLICACIÓN DEL DNA Y SÍNTESIS PROTEÍNAS Mg. Vania Mallqui Brito
  • 2. Características replicación 1. Semiconservativa:síntesis de las nuevas cadenas utilizan cada hebra parental como molde 2. El DNA se replica de manera ordenada y secuencial Bidireccional, simultaneo al desenrrollamiento hebras, 5’ – 3’, adición de nucleótidos, usando desoxirribonucleótidos 5 ´trifosfatos (dNTP)) al extremo 3´OH en dependencia del nucleótido correspondiente según el apareamiento de bases con la cadena molde.
  • 3. 3. Proceso controlado: Las células antes de dividirse deben duplicar su genoma y acoplado a la división celular. El control a dos niveles: • En la iniciación donde el DNA se replica en un momento determinado. • En el bloqueo de la reiniciación lo que impide que una vez iniciada una ronda de replicación no comience otra. 4. Discontinuo -Fragmentos -Cadena líder 5’ – 3’, avance horquilla -Cadena retardada, por fragmentos y en sentido DNA polimerasa (procariontes I, II, III) contrario “Fragmentos Okasaki” Protagonista replicación y poder autrocorrector
  • 4. Cambios en el DNA •Errores en la replicación que escapen a la actividad correctora •Lesiones ocurridas en el DNA por agentes mutagénicos. •Recombinación (introduce la mayor taza de cambios). Replicón Contiene un origen donde comienza la replicación y un final donde se detiene y contiene todos los elementos de control necesarios para la replicación. Procariontes un único replicón, eucariontes múltiples replicones
  • 5. Etapas Replicación 1. Iniciación: reconocimiento origen replicación, acompañado complejo proteínas “primosomas” (E. coli) 2. Alargamiento: síntesis DNA “replisoma” aparece asociado horquilla replicación 3. Terminación: al final del replicón es necesaria una reacción de unión y/o terminación. DNA polimerasa, no inicia la síntesis si no está presente un cebador (primer) que provea el extremo 3` OH libre que pueda ser extendido por adición de nucleótidos.
  • 6. Replicación procariotas Iniciación Características Dna B Helicasa 5’-3’, componente esencial replicón Ori C, activación Dna G SSB Une al DNA simple (reensamblaje), función cooperativa, protege ataque nucleasas Dna C Actúa con Dna B Dna G Actividad primasa (síntesis cebador), RNA polimerasa se une primosoma, activada Dna B e inicia síntesis primer Dna A ATP separa hebras doble hélice RNA Actúa Dna A formación horquilla polimerasa Girasa Libera estrés torcional generada por el desenrollamiento del DNA al introducir superenrollamientos.
  • 7. Alargamiento DNA polimerasa: síntesis una nueva cadena de DNA a partir de la hebra molde, tanto en procariotas como eucariotas, presenta una actividad enzimática múltiple, llamada replicasa. DNA naciente siempre en sentido 5’→3’, el nucleótido que se agrega une su a-fosfato al grupo 3’-OH libre de la cadena, enlace entre las pentosas que componen los nucleótidos.
  • 8. Replicación en E. coli 1. Proteínas iniciadoras reconocen y abren duplex forman “horquilla replicadora” (Ori C) 2. Primasa ó RNA polimerasa enzima que inicia la síntesis de DNA. Actúa en la forma de primosoma, unido a una DNA helicasa. El producto se llama "primer" u oligonucleótido iniciador. Este primer se sintetiza con la polaridad de 5' a 3' (proceso llamado "priming") y debe quedar antiparalelo con el templado. En la horquilla replicadora, ambas hebras son antiparalelas, un primer se sintetiza desde el punto de bifurcación de la horquilla hacia abajo, y el otro desde la base de ésta hacia arriba.
  • 9. 3. La DNA polimerasa III continúa con la replicación del DNA hasta que se termina el templado y se forma una nueva horquilla replicadora. 4. Una de las hebras de la horquilla se replicará en forma continua presentando la DNA pol. III una alta procesividad. Esta hebra templado se llama hebra conductora. La otra hebra se replicará forma discontinua, se requiere de la síntesis de un nuevo primer. Templado recibe el nombre de hebra retrasada y dará origen a los fragmentos de Okazaki, una sola enzima DNA pol.III para replicar la hebra retrasada completa. El replisoma actúa con el primosoma. Enzimas tipo DNA topoisomerasas mantienen la topología normal del DNA.
  • 10. 5.DNA pol.I , exonucleasa de 5’ a 3’ elimina los primers 6. La misma DNA pol. I con capacidad de polimerizar de 5’ a 3’ restituye con deoxinucleótidos la secuencia del primer; si se incorpora una base incorrecta, esta es eliminada inmediatamente por la polimerasa actividad exonucleasa (proceso es autocorrector). 7. DNA ligasa une los fragmentos de Okasaki, producto de la síntesis discontinua Terminación Tus: esta proteína promueve la detención de la horquilla de replicación al proveer una actividad contra-helicasa. (Terminus Utilization Substance
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  • 15. Replicación DNA eucariontes -Existen algunas diferencias, dada la mayor complejidad y tamaño del genoma eucariótico. -Debido a la existencia de múltiples replicones en el genoma eucariótico existen tantos orígenes como replicones hay -No existen rondas de replicación solapadas la división celular tiene lugar una vez que el DNA se ha replicado, durante la fase S del ciclo celular. -Los fragmentos de Okazaki son mas cortos. El control es mucho más complejo. -Los cebadores están compuestos por RNA (aproximadamente 10 bases) y DNA (iDNA, aproximadamente 20-30 bases).
  • 17. Los genes y como trabajan Archibald Garrod, 1902, primero en sugerir, la relación entre enfermedad y metabolismo a través de su estudio de la alcaptonuria, (elimina por la orina una gran cantidad de ácido homogentísico). Razonó que individuos sanos el ácido homogentísico se debía metabolizar a otros productos, razón por la cual no aparecía en orina. Sospechó existencia de bloqueo en la vía metabólicas y propuso era debido a "un error innato del metabolismo”. Descubrió que la alcaptonuria se heredaba como recesivo. George Beadle y Edward Tatum 30 – 40s , conexión entre genes y metabolismo propusieron la hipótesis "un gen una enzima",premio Nobel 1958. Dado que un gen codifica para la producción de una proteína. "Un gen una enzima" ha sido modificado a "un gen un polipéptido"
  • 18. DOGMA La información fluye (con la excepción de la transcripción reversa) ADN ARN, proceso llamado TRANSCRIPCIÓN PROTEÍNA por el proceso TRADUCCIÓN Transcripción es el proceso de fabricación ARN usando el ADN como molde. Traducción es la construcción de una secuencia de aminoácidos (polipéptido) con la información proporcionada por la molécula de ARN.
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  • 20. (ARNm) es el molde para la construcción de la proteína. (ARNr) se encuentra en el sitio donde se construye la proteína: el ribosoma. (ARNt) es el transportador que coloca el aminoácido apropiado en el sitio correspondiente. El ARN tiene una sola hebra, el ARNt puede formar una estructura de forma de trébol debido a la complementariedad de sus pares de bases.
  • 21. La ARN polimerasa abre la parte del ADN a ser transcripta. Solo una de las hebras del ADN (la hebra codificante ) se transcribe. Los nucleótidos de ARN se encuentran disponibles en la región de la cromatina (este proceso solo ocurre en la interfase) y se unen en un proceso de síntesis similar al del ADN.
  • 22. La síntesis proteica consta de 3 etapas: iniciación, elongación y terminación 1.INICIACIÓN: RNA, ribosomas, factores iniciación IF-1, IF-2 y IF-3. Unión RNAm a subunidad menor, mediada por IF-3 Codón AUG y GUG, codones iniciación. 2. ELONGACIÓN: el segundo tRNA, determinado por la secuencia, se une dependiendo de los factores de elongación. Se produce una unión peptídica y el dipéptido queda en el sitio A, el tRNA queda en P; ocurre la translocación, donde el tRNA solo pasa al sitio A (el tRNA que sale puede ir a cargar otro aminoácido) y el dipéptido al sitio P. Cada vez que ocurre esto se libera GDP y factores de elongación, por lo que es un proceso caro. 3. TERMINACIÓN aparece un codón sin sentido, se libera la proteína y se separan las subunidades.
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  • 24. El Código Genético: Traducción del ARN en proteína -Astrónomo George Gamow señaló que el código que representa a los aminoácidos debía consistir en grupos de al menos tres de las cuatro bases del ADN -los 20 aminoácidos están representados en el código genético por la agrupación de tres letras (triplete). - Si uno considera las posibilidades de arreglo de cuatro letras agrupadas de a tres (43) resulta que tenemos 64 posibilidades de palabras a codificar, o 64 posibles codones (secuencia de tres bases en el ARNm que codifica para un aminoácido específico o una secuencia de control).
  • 25. El código genético consiste 61 codones para aminoácidos y 3 codones de terminación, que detienen el proceso de traducción. El código genético es por lo tanto redundante, en el sentido que tiene varios codones para un mismo aminoácido. Por ejemplo, la glicina es codificada por los codones GGU, GGC, GGA, y GGG. Si un codón muta por ejemplo de GGU a GGC, se especifica el mismo aminoácido.
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  • 27. Síntesis Proteica La regulación de los genes de los procariotas difiere a eucariotas. Los promotores son secuencias de ADN que comienzan señales para la transcripción del ARN. Los terminadores son señales de detención. La molécula de ARNm puede tener de 500 a 10.000 nucleótidos. *La subunidad liviana tiene el sitio para que se pegue el ARNm. Tiene un rol crucial en la decodificación del ARN pues monitorea el apareamiento de bases entre el codón del ARNm y el anticodón de ARNt. *La subunidad pesada tiene dos sitios para el ARNt. Cataliza la formación de la unión peptídica.
  • 28. *El ARNt forma de trébol y lleva el aminoácido apropiado al ribosoma cuando el codón lo "llama". *En la parte terminal del brazo mas largo del ARNt se encuentran tres bases, el anticodón que son complementarias con el codón. *Existen 61 ARNt diferentes, cada uno posee un sitio diferente para pegar el aminoácido y un anticodón diferente. *Para el codón UUU, el codón anticomplementario es AAA.
  • 29. •La unión del aminoácido apropiado al ARNt esta controlado por una enzima: la aminoacil-ARNt sintetasa. •La energía para la unión del aminoácido al ARNt proviene de la conversión de ATP a AMP (adenosín-monofosfato). •La traducción es el proceso de convertir las secuencias del ARNm en una secuencia de aminoácidos.
  • 30. •El código de iniciación es AUG codifica para el aminoácido metionina (Met). La traducción no ocurre si no está el codón AUG, por lo tanto la metionina (formil-metionina, f-Met ) es siempre el primer aminoácido de la cadena polipeptídica, y frecuentemente se elimina al final del proceso. •El complejo formado por ARNt/ARNm/subunidad ribosómica pequeña es llamado "complejo de iniciación". La subunidad grande se pega al complejo de iniciación. Luego de esta fase el mensaje progresa durante la elongación de la cadena polipeptídica.
  • 31. •Un nuevo ARNt lleva otro aminoácido al sitio P vacío del complejo ribosoma /ARNm y posteriormente se forma un enlace peptídico con el aminoácido del sitio ocupado. •El complejo se mueve a lo largo del ARNm hasta el próximo triplete, liberando el sitio A •Cuando el codón es un codón de terminación, un factor de liberación se pega al sitio, parando la traducción y liberando al complejo ribosómico del ARNm.
  • 34. SÍNTESIS DE PROTEÍNAS A)PROCARIOTAS B) EUCARIOTAS
  • 35. INICIACIÓN ELONGACIÓN