O documento celebra o Dia Mundial da Estatística de 2015 e resume eventos relacionados à data em Portugal. O Departamento de Estatística da Universidade de Lisboa irá expor trabalhos de alunos e professores e ter palestras de ex-alunos. O Instituto Nacional de Estatística terá palestras sobre as novas metas de desenvolvimento sustentável da ONU. A newsletter fornece um resumo inicial dos membros da Rede de Bioestatísticos Portugueses com base em um questionário respondido por 43 membros.
1. Rede de (Bio)estatísticos Portugueses
1ª Newsletter
Dia Mundial da Estatística 2015
Celebra-se hoje mais um dia Mundial da Estatística
No dia 20 de Outubro de 2010 celebrou-se
pela primeira vez o Dia Mundial da
Estatística, cuio objectivo é reconhecer o
serviço prestado à sociedade pelos
estatísticos e realçar a importância da
estatística no nosso dia-a-dia.
Vários eventos assinalam este dia e
celebram o papel da estatística e todo o Mundo.
Em Portugal, destacamos o Departamento de
Estatística e Investigação Operacional da
Faculdade de Ciências da Universidade de
Lisboa que irá expor trabalhos de alunos e
professores, e terá uma série de palestras feitas
por antigos alunos do departamento. O
Instituto Nacional de Estatística terá palestras
focadas na nova agenda lançada em Setembro
na Assembleia Geral das Nações Unidas – The
Sustainable Development Goals. Esta agenda
corresponde a 17 metas com mais de 300
indicadores que monitorizam progresso. Mais
detalhes sobre estas metas podem ser
encontrados aqui:
https://sustainabledevelopment.un.org/?menu
=1300.
Notícias e Destaques
A estatística dos nossos
membros. Quantos somos?
Quais os nossos interesses?
Págs 1 e 2
Perfis dos nossos
membros
Para começarmos a conhecer
os nossos membros.
Pág. 3 e 4
Divulgação Científica
Ask for Evidence
Shiny - O R como ambiente
gráfico e aplicação web
Pág. 4
1ª Newsletter 20 de Outubro de 2015
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Notícias e Destaques
O retrato da Rede de (Bio)estatísticos Portugueses
Até ao lançamento desta newsletter recebemos
43 respostas!
Muito obrigado pelo feedback que recebemos.
Esperemos que nos próximos tempos a
interacção entre os membros e a participação
nesta newsletter aumente.
O primeiro retrato “selfie” da Rede
A maioria dos participantes, 30, da Rede de
Bioestatísticos são mulheres. Em termos da
ocupação actual, 16 são estudantes pós-
graduados, seguido de 10 profissionais na área
de bioestatística, 7 profissionais noutra área, 5
investigadores/pós-doutorados, 4 professores, 2
estudantes pré-graduados, 1 bolseiro de
investigação e 1 desempregado.
A maioria dos nossos membros encontra-se
atualmente em Portugal. Temos 5 membros da
Rede de Bioestatísticos no Reino Unido, 1
membro na Alemanha e outro na Suécia.
Metade dos membros está afiliada ou exerce
função numa Universidade. Entre as
Universidades portuguesas o destaque vai para
a Faculdade de Ciências da Universidade de
Lisboa com 11 membros. A Universidade
Atlântica, Universidade de Aveiro,
Universidade Nova de Lisboa, o Instituto
Superior Técnico de Lisboa e o ISCTE
possuem um membro cada. Fora do País temos
membros no Imperial College London, na
London School of Hygiene and Tropical
Medicine, na Newcastle University, University
of Aberdeen e Lund University.
Três dos nossos membros exercem atividade no
Instituto Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge,
dois no Instituto Gulbenkian de Ciência e a
Associação Nacional das Farmácias, a
Sociedade Portuguesa de Reumatologia e o
Centro de Investigação Sobre Economia
Portuguesa contam cada um com um membro.
Dos membros que trabalham em empresas
temos um membro na Blueclinical, um no
Grupo Actuarial, um na Novartis Pharma e
outro na Parexel International GmhB. Alguns
membros trabalham num hospital, centro de
cuidados de saúde ou centro de investigação.
Existe um membro no Hospital da Luz, no
Hospital Santa Maria, no Agrupamento de
Centros de Saúde de Lisboa Central, no
Instituto Português de Oncologia e no Royal
Alexandra Children's Hospital.
Em termos de interesses, 34 dos membros tem
interesse em epidemiologia, 27 em análise de
sobrevivência e modelos lineares generalizados,
23 em ensaios clínicos, 21 em análise de dados
longitudinais, 18 em estatística bayesiana, 16
em Big Data, 13 em data mining e
bioinformática e 12 em estatística aplicada a
genética e biologia molecular. De realçar que
dois membros revelaram também ter interesse
em meta-análise e estatística aplicada à
economia de saúde.
Caso conheçam mais alguém interessado nesta
iniciativa, agradecemos que reencaminhem a
newsletter, o questionário e/ou o nosso
contacto: redebiostat@gmail.com.
1ª Newsletter 20 de Outubro de 2015
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Perfis dos nossos membros
Beatriz Goulão
Trabalho como estatista na Health Services Research Unit, Universidade
de Aberdeen, maioritariamente em desenho e análise de ensaios clínicos e
em síntese de evidência. Sou aluna de primeiro ano de doutoramento na
mesma universidade, sob o tema metodologias de desenho, condução e
analise de ensaios clínicos em obesidade e como melhorá-las. Estou
envolvida em dois projetos no Instituto de Medicina Preventiva e Saúde
Publica, da Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa, ligados ao
estado nutricional dos idosos e a composição nutricional do leite materno.
Sou ainda embaixadora do projeto Ask For Evidence.
As áreas de investigação que me interessam mais são desenho de ensaios
clínicos, análise de compliance e de mediação e moderação, analise de ensaios clínicos aleatorizados
com clusters, limitações de ensaios clínicos em obesidade, network meta-analise e epidemiologia,
em particular, construção de questionários e epidemiologia nutricional. Tenho também muito
interesse na comunicação de investigação em saúde para o publico em geral. (e-mail; LinkedIn;
ResearchGate)
1ª Newsletter 20 de Outubro de 2015
Quem somos? O que fazemos? Quais são os nossos interesses?
Patrícia Soares
Comecei o doutoramento o ano passado em Brighton e passo os dias a
trabalhar no hospital pediátrico. O meu doutoramento foca-se em
medicina personalizada, isto é em perceber se os factores genéticos
influenciam a resposta ao tratamento em crianças com asma. Para isso
uso análise de dados longitudinais e estatística aplicada à genética. Ao
mesmo tempo, mantenho uma colaboração com o Instituto de Medicina
Preventiva e Saúde Pública cujo objectivo passa pela identificação de
fenótipos de asma em Portugal.
Os meus interesses são principalmente em estatística aplicada à genómica e bioinformática. Tenho
também interesse em usar base de dados já existentes e utilizar de maneira mais pro-eficiente os
dados que nos rodeiam, seja através de análise de dados longitudinais, epidemiologia, ensaios
clínicos e análise de sobrevivência. (e-mail; LinkedIn; ResearchGate)
Miguel Pereira
Sou estudante de doutoramento no Imperial College London e estou a
trabalhar na área da estatística aplicada à genética, nomeadamente em
Epidemiologia Genética. O meu trabalho atual baseia-se na integração de
informação obtida a partir de bases de dados de genómica em modelos
bayesianos para melhorar a detecção de variantes genéticas (SNPs)
associadas a doenças no âmbito dos Genome-Wide Association Studies
(GWAS). Concomitantemente, colaboro em projetos de investigação clínica
Tenho particular interesse em estatística bayesiana e na aplicação desta
abordagem em casos de “big data” nomeadamente na áreas da genómica e
restantes ‘omics. Tenho ainda um interesse mais geral na aplicação da
estatística em epidemiologia e na utilização de bases de dados de instituições de saúde para
realização de estudos epidemiológicos. (e-mail; LinkedIn)
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Perfis dos nossos membros (cont.)
1ª Newsletter 20 de Outubro de 2015
Quem somos? O que fazemos? Quais são os nossos interesses?
Pretendemos apresentar 2 a 3 membros da Rede em cada edição da newsletter para começarmos a
conhecer-nos. Por favor, enviem-nos um pequeno resumo sobre quem são e quais são os vossos
interesses (~100-200 palavras) e uma fotografia (opcional) para dinamizarmos o contacto e o
“networking” na nossa rede.
Adicionalmente, podem enviar-nos tópicos ou textos para incluirmos na nossa Newsletter. Este é um
espaço de divulgação que pode servir para divulgar as vossas ideias e trabalho e, quiçá criar
colaborações frutíferas com outros membros.
E-mail de contacto para envio de perfis/tópicos/textos/ideias/etc: redebiostat@gmail.com
Divulgação Científica
A nossa colega Beatriz Goulão tornou-se embaixadora do Ask for Evidence e conta-nos um
pouco sobre esta iniciativa e os seus objetivos
Por Beatriz Goulão
O Ask for Evidence é uma campanha que
pretende informar e estimular as pessoas a
perguntar qual a evidência que sustenta
alegações feitas por jornais, políticos ou
campanhas publicitarias, entre outros. É uma
campanha que se foca nos consumidores e que
pretende também ajudar a filtrar evidência
robusta de evidência fraca ou inexistente.
Somos constantemente bombardeados com
informação. Muita desta informação é boa e
credível, mas nem sempre é esse o caso. Ter a
vontade e a coragem de perguntar qual a
evidência e a capacidade de perceber a
qualidade da mesma, torna-nos autónomos nas
decisões que tomamos acerca da nossa saúde,
família e vida.
Enquanto investigadora, acredito que é
importante passar esta mensagem e garantir que
as pessoas sentem confiança para fazer
perguntas e vontade de perceber as respostas.
Creio que esta alteração de mentalidade levará
a uma sociedade mais esclarecida, mais
interessada em ciência e mais exigente na
informação que lhe é transmitida. Por estes
motivos, sou uma das embaixadoras 2016 do
Ask For Evidence.
Mais informações ou para participar nesta
campanha encontram-se neste link:
http://www.askforevidence.org/index.
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PANDAS – Análise de dados
utilizando python
Por Patrícia Soares
Actualmente, existem vários softwares
estatísticos disponíveis para análise de dados.
No entanto, muitas vezes os dados não
aparecem num formato próprio para análise e
muitas vezes temos de efectuar “acrobacias”
computacionais para obter a informação que
desejamos no formato necessário. Dependendo
da confiança a programar e da necessidade
alguns softwares serão mais adequados que
outros. O pandas (http://pandas.pydata.org/) é
um package em Python desenhado para análise
de dados. Para quem desconhece, Python é uma
linguagem de programação orientada a objectos,
tal como o R. Python é uma excelente (e é dizer
pouco) linguagem para manipulação e
preparação de dados. No entanto, não possuía
capacidade de analisar dados como, por
exemplo, o R. pandas preenche essa lacuna, ao
fornecer semelhantes funcionalidades e
algumas extra como alignamento de dados
automático e indexação hierárchica. A
popularidade nota-se no StackOverflow
(http://stackoverflow.com/ - uma plataforma
de questões e respostas relacionadas com
programação). Apesar de ser um package
recente, pandas já possui 16 623 tags. O R tem
obviamente mais tags, 110 451, mas é mais
antigo que o pandas. Se alguém já usou pandas
e quer partilhar a sua experiência gostariamos
de saber mais!
Bolsa de Doutoramento - Universidade de
Heidelberg
We are looking for a highly motivated, well
qualified PhD student with background in
biostatistics or health sciences, ideally with
practical experience in SAS and/or R. The
candidate should have good analytical
and communication skills, and be interested in
working in an interdisciplinary team at the
forefront of cancer research and biostats.
Applications including a cover letter, CV and
two references should be submitted as one
single PDF to (lorenzo@imbi.uni-
heidelberg.de). A brief description of the
research activities of the Statistical Genetics
research group can be found at:
http://www.biometrie.uni-
heidelberg.de/StatisticalGenetics
Posição Investigador Associado - Northern
Institute for Cancer Research
Vacancy. Research Associate: Statistical
Genetics/Genetic Epidemiology. Research
Associate Grade: F. Vacancy Ref: A 26078R
A Bloodwise funded Research Associate is
required to work with Professor James Allan at the
Northern Institute for Cancer Research (NICR)
based at the Paul O'Gorman Building. The
successful applicant will have the opportunity to
take part in cutting-edge research investigating the
genetic susceptibility and prognostication of acute
leukaemia, using large genome-wide association
and next generation sequencing data sets. There
will also be the opportunity to write manuscripts
reporting findings arising from this work.
For additional details about this vacancy and
essential information on how to apply, visit our
Job Vacancies web page at
http://www.ncl.ac.uk/vacancies/
Emprego/Bolsas
1ª Newsletter 20 de Outubro de 2015
Divulgação Científica (cont.)
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A subscrição e-student (e-student membership) da
Royal Statistical Society destina-se a
estudantes da área da estatística em todas as
fases de formação a partir do ensino
secundário (inclusivé). Esta é uma subscriçao
gratuita e dá acesso aos seus membros à revista
Significance (inclui acesso nas Apps para
iPhone e Android), às rubricas “Having a
Voice”, a encontros e reuniões gratuitos
organizados pela RSS e várias atividades
formativas online.
Para mais informações e subscrever:
http://www.rss.org.uk/estudent
NOTA: A edição comemorativa da
Revista Significance alusiva ao Dia
Mundial da Estatística (gratuita) pode ser
acedida aqui:
http://www.statslife.org.uk/significance/
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Subscrição e-student da Royal Statistical Society -
Gratuita
Shiny – O R como ambiente gráfico
e aplicação web
Por Miguel Pereira
O shiny é um pacote do R produzido pelo
RStudio® que permite implementar uma
interface gráfica utilizando apenas comandos
em R. Este pacote permite assim aos utilizadores
de R disponibilizar programas da Web sem ter
que recorrer ao HTML, CSS ou JavaScript,
linguagens habitualmente utilizadas no
desenvolvimento de ferramentas para a web.
A implementação deste pacote tem várias
potencialidades sendo de destacar a maior
facilidade de implementação de ferramentas
estatísticas complexas em plataformas que
podem ser utilizadas por “não-estatísticos”,
permitindo uma maior utilização de novos e
melhores métodos de análise.
A programação com o shiny implica a
utilização do R através do RStudio® que se
encontra preparado para disponibilizar a
visualização imediata dos comandos gráficos
implementados. O pacote shiny está
disponível no CRAN e é instalado de forma
idêntica à dos outros pacotes do R.
Mais informações sobre o shiny bem como
tutoriais para aprender a utilizer esta
plataforma podem ser encontrados aqui:
http://shiny.rstudio.com. Existe ainda um
grupo no Google dedicado à discussão de
aspectos do shiny:
https://groups.google.com/group/shiny-
discuss
Divulgação Científica (cont.)
1ª Newsletter 20 de Outubro de 2015