Características generales de las enzimas

1. Enzimas

3. COO - C-H H-C COO - COO - H 3 + N-C-H C-H 2 COO - COO - C-H C-H COO - + N H 3 + Fumarato (= ,trans) Aspartasa L-Aspartato D-Aspartato Maleato (= ,cis) COO - H-C- NH 3 + C-H 2 COO -

5. Pepsina 1.5 Tripsina 7.7 Catalasa 7.6 Arginasa 9.7 Fumarasa 7.8 Ribonucleasa 7.8 Enzima pH óptimo

6. Mamíferos 37 Bacterias y algas aprox . 100 Bacterias Árticas aprox. 0 Enzima Temp. Ópt. ( o C) Bacterias en muestra de hielo antigua

12. Enzima (gr). : fermento Vitalistas Mecanicistas 1926, James B. Summer Ureasa 1930´s Pepsina Tripsina Quimotripsina Carboxipeptidasa Enzima Amarillo viejo (flavoproteína NADPH) 1800´s fermentación del azúcar por levaduras

13. Transformación de Alimentos Fermentaciones Quesos Vinos Medicina Transaminasas Industria Química Penicilina Agricultura Rhyzobium

15. Orgánico: Coenzimas NAD, FAD, CoASH. E: PM 100000, 7 nm Ø S: PM 250, 0.8 nm Ø Cofactor Inorgánico: Fe 2+ , Mn 2+ , Zn 2+ ,etc. Grupo Prostético

16. Apoenzima Holoenzima

17. Enzimas que requieren elementos inorgánicos Citocromo oxidasa Catalasa, peroxidasa Fe 2+ , Fe + , Citocromo oxidasa Cu 2+ DNA polimerasa Anhídrasa carbónica Alcohol deshidrogensa Zn 2+ Hexoquinasa Glucosa 6-fosfatasa Mg 2+ Arginasa Mn 2+ Piruvato quinasa K + , Mg 2+ Ureasa Ni 2+ Nitrato reductasa Mo 2+

18. Coenzimas: Actúan como transportadores eventuales de átomos específicos o de grupos funcionales Coenzimas Entidad transferida Pirofosfato de tiamina . Dinucleótido de flavina y adenina . Dinucleótido de nicotinamida y de adenina Coenzima A . Fosfato de Piridoxal . 5’-Desoxicobalamina (Coenzima B12) Biocitina . Tetrahidrofolato . Aldehídos Átomos de hidrógeno Ion hidruro (H - ) Grupos acilo Grupos amino Átomos de H y grupos alquilo CO 2 Otros grupos monocarbonados

20. Coenzimas Adenosine Triphosphate (ATP) Coenzyme A (CoA) Flavin Adenine Dinucleotide (FAD) Nicotinamide Adenine Dinucleotide (NAD + ) Nicotinamide Adenine Dinucleotide Phosphate (NADP + )

22. Enzima Substrato Urea Arginina Ureasa Arginasa Lis, Arg Pepsina Tripsina Amilasa rec A Proteína de choque térmico Rec A HSP70 gen Caract. Comité de la Unión Internacional de Bioq. y Biol. Mol. (IUBMB) http://www.enzyme-database.org/ http://us.expasy.org/enzyme/ http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/

23. EC 1.1.1.2 Accepted name: alcohol dehydrogenase (NADP + ) Reaction: an alcohol + NADP + = an aldehyde + NADPH + H + Other name(s): aldehyde reductase (NADPH 2 ); NADP-alcohol dehydrogenase; NADP + -aldehyde reductase; NADP + -dependent aldehyde reductase; NADPH-aldehyde reductase; NADPH-dependent aldehyde reductase; nonspecific succinic semialdehyde reductase; ALR 1; low- K m aldehyde reductase; high- K m aldehyde reductase; alcohol dehydrogenase (NADP + ) Systematic name: alcohol:NADP + oxidoreductase Comments: A zinc protein. Some members of this group oxidize only primary alcohols; others act also on secondary alcohols. May be identical with EC 1.1.1.19 (L-glucuronate reductase), EC 1.1.1.33 [mevaldate reductase (NADPH)] and EC 1.1.1.55 [lactaldehyde reductase (NADPH)]. A-specific with respect to NADPH. Links to other databases: BRENDA , ERGO , EXPASY , IUBMB , KEGG , PDB , CAS registry number: 9028-12-0

26. EC 1.2 Acting on the aldehyde or oxo group of donors EC 1.2.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor EC 1.2.1.1 deleted, replaced by EC 1.1.1.284 and EC 4.4.1.22 EC 1.2.1.2 formate dehydrogenase EC 1.2.2 With a cytochrome as acceptor EC 1.2.2.1 formate dehydrogenase (cytochrome) EC 1.2.2.2 pyruvate dehydrogenase (cytochrome) EC 1.2.3 With oxygen as acceptor EC 1.2.3.1 aldehyde oxidase EC 1.3 Acting on the CH-CH group of donors EC 1.3.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor EC 1.3.1.1 dihydrouracil dehydrogenase (NAD+) EC 1.3.2 With a cytochrome as acceptor EC 1.3.2.1 now EC 1.3.99.2 EC 1.3.2.2 now EC 1.3.99.3 EC 1.3.3 With oxygen as acceptor EC 1.3.3.1 dihydroorotate oxidase EC 1.3.3.2 now EC 1.14.21.6

28. Enzimas: Reducción: ganancia de electrones (hidrógeno o pérdida de oxígeno) Oxidación: pérdida de electrones (hidrógeno o ganancia de oxígeno). La Oxidación y la Reducción son reacciones acopladas (REDOX) No. Clase Tipo de reacción que catalizan Ejemplo 1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de e-) Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas

29. Si una mol é cula se reduce, tiene que haber otra que se oxide 1. O xido-reductasas ( Reacciones de oxido-reducci ó n).

30. Enzimas: No. Clase Tipo de reacción que catalizan Ejemplo 1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de e-) Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas 2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas Transaminasas

32. Enzimas: No. Clase Tipo de reacción que catalizan Ejemplo 1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de e-) Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas 2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas Transaminasas 3 Hidrolasas Hidrólisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa

34. Enzimas: No. Clase Tipo de reacción que catalizan Ejemplo 1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de e-) Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas 2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas Transaminasas 3 Hidrolasas Hidrólisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa 4 Liasas Lisis de un substrato, generando un doble enlace, o Adición de un substrato a un doble enlace de un 2o. substrato (Sintasas) Descarboxilasa pirúvica

36. Enzimas: No. Clase Tipo de reacción que catalizan Ejemplo 1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de e-) Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas 2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas Transaminasas 3 Hidrolasas Hidrólisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa 4 Liasas Lisis de un substrato, generando un doble enlace, o Adición de un substrato a un doble enlace de un 2o. substrato (Sintasa) (Sintasas) Descarboxilasa pirúvica 5 Isomerasas Transferencia de grupos en el interior de las moléculas para dar formas isómeras Mutasas Epimerasas Racemasas

37. 5. Isomerasas (Reacciones de isomerizaci ó n)

38. Enzimas: No. Clase Tipo de reacción que catalizan Ejemplo 1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de e-) Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas 2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas Transaminasas 3 Hidrolasas Hidrólisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa 4 Liasas Lisis de un substrato, generando un doble enlace, o Adición de un substrato a un doble enlace de un 2o. substrato (Sintasa) (Sintasas) Descarboxilasa pirúvica 5 Isomerasas Transferencia de grupos en el interior de las moléculas para dar formas isómeras Mutasas Epimerasas Racemasas 6 Ligasas Formación de enlaces C-C, C-S, C-O y C-N. Mediante reacciones de condensación, acopladas a la ruptura del ATP Sintetasas

40. E + S SE E + P

42. Es la cantidad que transforma 1.0  M (10 -6 M) de S /min a 25 o C, en las condiciones de medida óptima. 1.0 Unidad de Actividad Enzimática Es el no. de U de enzima / mg de proteína. Es una medida de la pureza de la enzima. La Actividad Específica Catalasa de Aspergillius niger 4000-8000 U/mg de prot. 100 mg $ 209.80 USD. Catalasa de Hígado de bisonte 2000-5000 U/mg de prot. 1 g $ 768.50 USD.