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Acesso aberto e métricas
alternativas
Atila Iamarino
atila@usp.br
@oatila
Laboratório de Evolução Molecular e Bioinformática - LEMB
Quem é dono do nosso trabalho e
como somos avaliados?
Papel dos primeiros periódicos
Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014
Philosophical Transactions (of the Royal
Society of London):
• Inaugura o conceito de peer-review
• Estabelece prioridade de descoberta
• Cientista:
– resultados
• Periódicos:
– revisão
– edição
– distribuição
– arquivamento
Arquivo das edições mais antigas:
http://onlinebooks.library.upenn.edu/webbin/serial?id=philtransactions
Com a distribuição digital
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• Cientista:
– resultados
• Periódicos:
– revisão (email)
– edição (automatizada)
– distribuição (grátis)
– arquivamento (digital)
No entanto
Association of Research Libraries
http://www.arl.org/bm~doc/monser04.pdf Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014
• Cientista:
– resultados
• Periódicos:
– revisão (email)
– edição (automatizada)
– distribuição (grátis)
– arquivamento (digital)
No entanto
http://poeticeconomics.blogspot.ca /2012/01/enormous-profits-of-stm-scholarly.html
http://poeticeconomics.blogspot. com.br/2014/03/elsevier-stm-publishing-profits-
rise-to.html Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014
• Elsevier (2014): £826 milhões, lucro de 39%
• Springer (2010): € 294 milhões, lucro de 33,9%
• Wiley & Sons (2011): $106 milhões, lucro de 42%
Por que não discutimos
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• Acesso à artigos em 2013: $ 93.872.151,111
– ~$32 milhões à Elsevier2
• ~$1,60 por artigo (desde 2005)3
[1] http://www.capes.gov.br/images/stories/download/Contas_Publicas/Relatorio-de-Gestao-2013.pdf
[2] https://gowers.wordpress.com/2014/04/24/elsevier-journals-some-facts/
[3] Almeida, E. C. E. de, Guimarães, J. A., & Alves, I. T. G. (2011). Dez anos do Portal de Periódicos da Capes: histórico,
evolução e utilização. Revista Brasileira de Pós-Graduação, 7(13).
Alternativa: Open Access
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• Green (Science e Nature):
– 6 meses a um ano para arquivamento próprio do manuscrito
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• Gold (PLoS e PeerJ):
– Disponível imediatamente
eLife: grátis
PLoS: de $1350 (ONE) a $2900 (Medicine)
PNAS: $1700 (artigo) + 1350 (acesso aberto)
Nature Communication: $4800
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Custo médio estimado de um artigo científico: $50001
• Preprints e repositórios
– http://arxiv.org/; https://peerj.com/preprints/;
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[1] - http://blog.scielo.org/blog/2013/09/18/quanto-
custa-publicar-em-acesso-aberto/
Acesso Grátis vs Acesso Aberto
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Atribuição (by)
Atribuição - Compartilhamento pela mesma Licença (by-sa)
Atribuição - Não a Obras Derivadas (by-nd)
Atribuição - Uso Não Comercial (by-nc)
http://creativecommons.org.br/
Vantagens: Acesso ao Público
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Fausto, S., Machado, F. A., Bento, L. F. J., Iamarino, A., Nahas, T. R., & Munger, D. S. (2012). Research Blogging: Indexing and
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Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014
Eysenbach, G. (2006). Citation advantage of open access articles. PLoS biology, 4(5), e157.
doi:10.1371/journal.pbio.0040157
Para a PNAS, artigos OA:
• Citado antes
• Mais chances de sere citados pelo menos 1 vez
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Desvantagens: Periódicos Predatórios
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– Journal of Metabolomics and Systems Biology
– Journal of Computer Science & Systems Biology
– Journal of AIDS & Clinical Research
– Journal of Molecular and Genetic Medicine
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http://www.nature.com/news/investigating-journals-the-dark-side-
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Desvantagens: Periódicos Predatórios
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http://scholarlyoa.com/2014/11/20/bogus-journal-accepts-profanity-laced-anti-spam-paper/
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• Predatório ≠ Open Access
– Em comum: article processing charge (APC)
• Acontece em revistas pagas
• O que fazer:
– Lista de questionáveis: http://scholarlyoa.com/publishers/
– Lista de confiáveis: http://doaj.org/
Como medir o valor do periódico
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• Eugene Garfield propõe em 1955 a contagem de citações
• Em 1961 começa o Science Citation Index proposto por Garfield
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Artigos de 2014 Artigos de 2013 Artigos de 2012
FI 2014 FI 2013 FI 2012
Garfield, E. (2006). The history and meaning of the journal impact factor. JAMA : the journal of the American
Medical Association, 295(1), 90–3.
Problemas com o IF
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• Nem todas áreas concentram citações em 2 a 3 anos
– Nature: sim Ecology: 7 a 8 anos*
• É tão acurado quanto a base de dados (Web of Science)
– 25 a 35% das citações contém erros*
• Fechado e não reprodutível
• Pune áreas de interesse específicas
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*Vanclay, J. K. (2011). Impact factor: outdated artefact or stepping-stone to journal certification?
Scientometrics, 92(2), 211–238.
Problemas com o IF
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Fang, F. C., & Casadevall, A. (2011). Retracted science and the retraction index. Infection and immunity,
79(10), 3855-9. doi:10.1128/IAI.05661-11
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Konkiel, S., Piwowar, H. A., & Priem, J. (2014). The Imperative for Open Altmetrics. The Journal of Electronic
Publishing, 17(3).
Métricas por artigo: bom para algumas
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Métricas por artigo: ruim para outras
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Lariviere, V., Lozano, G. A., & Gingras, Y. (2013). Are elite journals declining?, 12. Digital
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Problemas com os periódicos
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[1] http://www.nature.com/news/retraction-challenges-
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“Why the sudden pulse of Nature retractions in 2013
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Acesso aberto e métricas alternativas: Quem é dono do nosso trabalho e como somos avaliados?

  • 1. Acesso aberto e métricas alternativas Atila Iamarino atila@usp.br @oatila Laboratório de Evolução Molecular e Bioinformática - LEMB Quem é dono do nosso trabalho e como somos avaliados?
  • 2. Papel dos primeiros periódicos Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 Philosophical Transactions (of the Royal Society of London): • Inaugura o conceito de peer-review • Estabelece prioridade de descoberta • Cientista: – resultados • Periódicos: – revisão – edição – distribuição – arquivamento Arquivo das edições mais antigas: http://onlinebooks.library.upenn.edu/webbin/serial?id=philtransactions
  • 3. Com a distribuição digital Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 • Cientista: – resultados • Periódicos: – revisão (email) – edição (automatizada) – distribuição (grátis) – arquivamento (digital)
  • 4. No entanto Association of Research Libraries http://www.arl.org/bm~doc/monser04.pdf Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 • Cientista: – resultados • Periódicos: – revisão (email) – edição (automatizada) – distribuição (grátis) – arquivamento (digital)
  • 5. No entanto http://poeticeconomics.blogspot.ca /2012/01/enormous-profits-of-stm-scholarly.html http://poeticeconomics.blogspot. com.br/2014/03/elsevier-stm-publishing-profits- rise-to.html Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 • Elsevier (2014): £826 milhões, lucro de 39% • Springer (2010): € 294 milhões, lucro de 33,9% • Wiley & Sons (2011): $106 milhões, lucro de 42%
  • 6. Por que não discutimos Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 • Acesso à artigos em 2013: $ 93.872.151,111 – ~$32 milhões à Elsevier2 • ~$1,60 por artigo (desde 2005)3 [1] http://www.capes.gov.br/images/stories/download/Contas_Publicas/Relatorio-de-Gestao-2013.pdf [2] https://gowers.wordpress.com/2014/04/24/elsevier-journals-some-facts/ [3] Almeida, E. C. E. de, Guimarães, J. A., & Alves, I. T. G. (2011). Dez anos do Portal de Periódicos da Capes: histórico, evolução e utilização. Revista Brasileira de Pós-Graduação, 7(13).
  • 7. Alternativa: Open Access Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 • Green (Science e Nature): – 6 meses a um ano para arquivamento próprio do manuscrito submetido • Gold (PLoS e PeerJ): – Disponível imediatamente eLife: grátis PLoS: de $1350 (ONE) a $2900 (Medicine) PNAS: $1700 (artigo) + 1350 (acesso aberto) Nature Communication: $4800 Revista de Saúde Pública: $900 Custo médio estimado de um artigo científico: $50001 • Preprints e repositórios – http://arxiv.org/; https://peerj.com/preprints/; http://biorxiv.org/ [1] - http://blog.scielo.org/blog/2013/09/18/quanto- custa-publicar-em-acesso-aberto/
  • 8. Acesso Grátis vs Acesso Aberto Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 Atribuição (by) Atribuição - Compartilhamento pela mesma Licença (by-sa) Atribuição - Não a Obras Derivadas (by-nd) Atribuição - Uso Não Comercial (by-nc) http://creativecommons.org.br/
  • 9. Vantagens: Acesso ao Público Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 Fausto, S., Machado, F. A., Bento, L. F. J., Iamarino, A., Nahas, T. R., & Munger, D. S. (2012). Research Blogging: Indexing and Registering the Change in Science 2.0. PLoS ONE, 7(12)
  • 10. Vantagens: Citações Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 Eysenbach, G. (2006). Citation advantage of open access articles. PLoS biology, 4(5), e157. doi:10.1371/journal.pbio.0040157 Para a PNAS, artigos OA: • Citado antes • Mais chances de sere citados pelo menos 1 vez • Mais citações
  • 11. Desvantagens: Periódicos Predatórios Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 – Journal of Metabolomics and Systems Biology – Journal of Computer Science & Systems Biology – Journal of AIDS & Clinical Research – Journal of Molecular and Genetic Medicine – Current Synthetic & Systems Biology – Journal of Molecular Biology http://www.nature.com/news/investigating-journals-the-dark-side- of-publishing-1.12666
  • 12. Desvantagens: Periódicos Predatórios Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 http://scholarlyoa.com/2014/11/20/bogus-journal-accepts-profanity-laced-anti-spam-paper/ http://www.scs.stanford.edu/~dm/home/papers/remove.pdf
  • 13. Mas: Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 • Predatório ≠ Open Access – Em comum: article processing charge (APC) • Acontece em revistas pagas • O que fazer: – Lista de questionáveis: http://scholarlyoa.com/publishers/ – Lista de confiáveis: http://doaj.org/
  • 14. Como medir o valor do periódico Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 • Eugene Garfield propõe em 1955 a contagem de citações • Em 1961 começa o Science Citation Index proposto por Garfield e Irving H. Sher Artigos de 2014 Artigos de 2013 Artigos de 2012 FI 2014 FI 2013 FI 2012 Garfield, E. (2006). The history and meaning of the journal impact factor. JAMA : the journal of the American Medical Association, 295(1), 90–3.
  • 15. Problemas com o IF Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 • Nem todas áreas concentram citações em 2 a 3 anos – Nature: sim Ecology: 7 a 8 anos* • É tão acurado quanto a base de dados (Web of Science) – 25 a 35% das citações contém erros* • Fechado e não reprodutível • Pune áreas de interesse específicas • Se aplica à revista, não ao artigo *Vanclay, J. K. (2011). Impact factor: outdated artefact or stepping-stone to journal certification? Scientometrics, 92(2), 211–238.
  • 16. Problemas com o IF Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 Fang, F. C., & Casadevall, A. (2011). Retracted science and the retraction index. Infection and immunity, 79(10), 3855-9. doi:10.1128/IAI.05661-11
  • 17. Métricas alternativas Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 Konkiel, S., Piwowar, H. A., & Priem, J. (2014). The Imperative for Open Altmetrics. The Journal of Electronic Publishing, 17(3).
  • 18. Métricas por artigo: bom para algumas Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014
  • 19. Métricas por artigo: ruim para outras Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 Lariviere, V., Lozano, G. A., & Gingras, Y. (2013). Are elite journals declining?, 12. Digital Libraries. Retrieved from http://arxiv.org/abs/1304.6460
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  • 21. Problemas com os periódicos Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 [1] http://www.nature.com/news/retraction-challenges- 1.16023?WT.ec_id=NATURE-20141002 “Why the sudden pulse of Nature retractions in 2013 and 2014? […] We can only speculate.“1
  • 22. Problemas com os periódicos Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014 http://veja.abril.com.br/noticia/ciencia/uma-praga-da-ciencia- brasileira-os-artigos-de-segunda
  • 23. Métricas do pesquisador Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014http://impactstory.org/
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  • 25. Atila Iamarino | ICB-BMM Dezembro 2014