7. Σα τυχαία (?) λάκθ ςτθν αντιγραφι του DNA είναι πθγι
τθσ εξζλιξθσ των ηωντανϊν οργανιςμϊν πάνω ςτθ γθ
Είναι όμωσ και πθγι αςκενειϊν για τον άνκρωπο, τα
ηϊα και τα φυτά
Ποιεσ είναι αυτζσ οι γενετικζσ αςκζνειεσ, πωσ κάνουμε
τθ διάγνωςθ τουσ και πωσ τισ προλαβαίνουμε;
8. Γονίδια και λειτουργία τθσ γενετικισ πλθροφορίασ
Σα γονίδια είναι το
εγχειρίδιο λειτουργίασ
του ανκρϊπινου ςϊματοσ
Επθρεάηουν τθν εμφάνιςθ
μασ, τθν υγεία μασ και
φυςικά κακορίηουν τον
τρόπο λειτουργίασ του
οργανιςμοφ μασ
Ότι είμαςτε όμωσ δεν το
οφείλουμε μόνο ςτα
γονίδια μασ
9. Γονίδια και κοινά χαρακτθριςτικά
Σο χρϊμα των ματιϊν, το φψοσ,
το χρϊμα των μαλλιϊν και αν
κάποιοσ είναι καραφλόσ ι όχι,
εξαρτάται κατά ζνα μζροσ από τα
γονίδια μασ
10. Γονίδια + Περιβάλλον = Άνκρωποσ
Θεωροφμε ότι το περιβάλλον που
ηοφμε αλλά και τα γονίδια μασ είναι
παράγοντεσ που παίηουν ςθμαντικό
ρόλο ςτθ δθμιουργία ενόσ ανκρϊπου
Είμαςτε το αποτζλεςμα τθσ
αλλθλεπίδραςθσ μεταξφ των
γονιδίων μασ και του περιβάλλοντοσ.
Και τα δφο είναι εξίςου ςθμαντικά
για τθ λειτουργία του οργανιςμοφ
12. Γονίδια και κλθρονομικότθτα
Σο γονιδίωμα κάκε
ανκρϊπου είναι μοναδικό –
εκτόσ τθσ περίπτωςθσ των
γενετικά ταυτόςθμων
διδφμων.
Σα μιςά γονίδια είναι
πατρικισ προζλευςθσ και τα
άλλα μιςά είναι μθτρικισ.
13. Γενετικι
Η επιςτιμθ των γονιδίων, τθσ κλθρονομικότθτασ και τθσ
ποικιλομορφίασ των οργανιςμϊν
Η κλθρονομικότθτα αναφζρεται ςτον τρόπο με τον οποίο ζνα
ςυγκεκριμζνο γενετικό γνϊριςμα ι ανωμαλία εκφράηεται και
μεταφζρεται από γενιά ςε γενιά
14. Γενετικά νοςιματα
Οι γενετικζσ αςκζνειεσ προκαλοφνται από
κλθρονομικζσ μεταβολζσ ςτο DNA μασ και
δθμιουργοφν αλλαγζσ (μεταλλάξεισ) ςτα
γονίδια μασ και κατ’ επζκταςθ ςτον τρόπο
λειτουργίασ του οργανιςμοφ μασ
Τπάρχουν >7000 διαφορετικζσ γενετικζσ
αςκζνειεσ π.χ. κυςτικι ίνωςθ, μεςογειακι
και δρεπανοκυτταρικι αναιμία κ.α..
Αυτζσ και μερικζσ άλλεσ δθμιουργοφν
ςοβαρά προβλιματα ςτθν υγεία του
ανκρϊπου που τισ κλθρονομεί
18. Κλινικι γενετικι και ςυμβουλευτικι
τόχοσ:
θ γενετικι αιτία τθσ νόςου – ςυμβολι ςτθ διάγνωςθ
επεξιγθςθ κινδφνου
άλλεσ ιατρικζσ επιπτϊςεισ και πικανζσ κεραπείεσ
ςτρατθγικζσ αναπαραγωγισ (επόμενα παιδιά)
επιπτϊςεισ ςε άλλα μζλθ τθσ οικογζνειασ
βοθκά τα μζλθ τθσ οικογζνειασ να πάρουν τισ κατάλλθλεσ
γι αυτοφσ αποφάςεισ
Ομαδικι προςζγγιςθ και ςυνεργαςία του ειδικοφ κλινικοφ
με τον κλινικό γενετιςτι κι άλλουσ (π.χ. ψυχολόγοσ)
Πλιρθσ ενθμζρωςθ πριν τον γενετικό ζλεγχο αλλά και μετά
19. Γενετικά νοςιματα που
ελζγχονται
με βάςθ το φαινότυπο
1. β-μεςογειακι αναιμία
2. Ινοκυςτικι νόςοσ
3. Huntington
4. Αιμοχρωμάτωςθ, κλπ.
θ διερεφνθςθ γίνεται
επιτυχϊσ με ‘κλαςςικζσ’
γενετικζσ τεχνικζσ
Γενετικά νοςιματα που
ελζγχονται
με βάςθ το φαινότυπο, με
ςθμαντικι αλλθλεπικάλυψθ
1. Μυϊκι δυςτροφία
2. Charcot-Marie-Tooth
3. Φυλοςφνδετθ ΔΚ
4. Αταξίεσ, κλπ.
θ διερεφνθςθ γίνεται ατελϊσ
με ‘κλαςςικζσ’ γενετικζσ
τεχνικζσ
~40%
20. Γενετικά νοςιματα
…… γρίφοι
1. φνδομο Goldenhar
2. φνδρομο Hallermann-Streiff
3. Διανοθτικι κακυςτζρθςθ, αυτιςμόσ
4. Διάφορα ακατάτακτα, κλπ.
~60%
θ διερεφνθςθ ΔΕΝ είναι εφικτι με κλαςςικζσ γενετικζσ τεχνικζσ …
26. τάδια του exome sequencing
1. υλλογι των πρωτογενϊν ςτοιχείων – αλλθλουχία DNA
καταςκευι ‘βιβλιοκικθσ’
εμπλουτιςμόσ των εξονίων
ανάγνωςθ τθσ αλλθλουχίασ του DNA ςτον αναλυτι
υνολικόσ χρόνοσ 15-30 θμζρεσ
2. Επεξεργαςία των πρωτογενϊν δεδομζνων – bioinformatics
για τθν ταυτοποίθςθ των variants, φιλτράριςμα και
αποκάλυψθ πακολογικϊν μεταλλάξεων
υνολικόσ χρόνοσ 1-3 μινεσ ?
27. Σο exome = το γονιδίωμα που κωδικοποιεί
για όλεσ τισ πρωτεΐνεσ = όλα τα γονίδια
περιλαμβάνει ~22.000 γονίδια, > 160.000 εξόνια
καλφπτει ~40-50 Mb, που διαβάηονται >30 φορζσ θ κάκε βάςθ
περιλαμβάνει περιοχζσ ςυρραφισ ιντρονίων-εξονίων (splice sites)
περιλαμβάνει όλα τα miRNAs
ΔΕΝ περιλαμβάνει (υποχρεωτικά) 5’ και 3ϋ UTR’s (untranslated)
35. ζλεγχοσ μεταλλάξεων/αλλαγϊν που υπάρχουν ςε όλα
τα κφτταρα του ςϊματοσ κι υπάρχουν από το ςτάδιο
τθσ ςφλλθψθσ (constitutional), π.χ. μεςογειακι αναιμία
ζλεγχοσ μεταλλάξεων/αλλαγϊν που υπάρχουν ςε
οριςμζνα μόνο κφτταρα/ιςτοφσ και δθμιουργικθκαν
αργότερα ςτθ ηωι (επίκτθτα), π.χ. πολλζσ μορφζσ
καρκίνου-όγκων
Βαςικζσ κατθγορίεσ γενωμικοφ ελζγχου
36. The Beery family - Joe, Retta and
their children Zach, Noah and
Alexis - is an example of a whole
genome sequencing success
story.
Twins Noah and Alexis, who were
diagnosed as toddlers with dopa-
responsive dystonia, became
mysteriously ill when they were
12.
The mystery illness was solved by
whole genome sequencing, which
found both had a serotonin
deficiency.
The 16-year-old twins now
appear on such programs as the
"Today Show," "Good Morning
America" and "NOVA," and at
speaking engagements to bring
hope to many suffering with rare
and undiagnosed ailments.
Από τθ διάγνωςθ … ςτθ κεραπεία
48. Σι μάκαμε από τθν εμπειρία μασ
Από τα 18 περιςτατικά που ζχουμε αναλφςει μζχρι ςιμερα:
1. Επιτυχι διάγνωςθ τθσ γενετικισ αιτιολογίασ είχαμε ςε 12 από τα
18 (2/3, 66%)
2. ε 4 περιςτατικά (~1/4, 22%) δεν αποκαλφφκθκε γενετικι βλάβθ
(παιδί με ανοφκαλμία, ζμβρυο με λαγϊχειλο – λυκόςτομα, παιδί
με επιλθπτικι εγκεφαλοπάκεια, ζμβρυο με αγενεςία νεφρϊν)
3. Δυο περιςτατικά βρίςκονται ςτο ςτάδιο τθσ αξιολόγθςθσ
Αναδείχκθκε θ ανάγκθ πλθρζςτερθσ κλινικισ πλθροφορίασ
Απαιτείται καλφτερθ ενθμζρωςθ και πλθροφόρθςθ των
εξεταηομζνων ςχετικά με τουσ περιοριςμοφσ και τα πικανά
αποτελζςματα
Ο χρόνοσ απάντθςθσ δεν είναι δυνατό να προςδιοριςκεί με
ακρίβεια (4 ± 1-2 μινεσ ??)
49. Γιατί λοιπόν… exome sequencing ..??
ΕΙΝΑΙ χριςιμο:
1. για τθν αποκάλυψθ πακολογικϊν μεταλλάξεων, για ςπάνια
(ι ςφνκετα) γενετικά νοςιματα
2. για τθν αποκάλυψθ πακολογικϊν μεταλλάξεων, για κοινά
γενετικά νοςιματα, π.χ. καρκίνοι, αυτιςμόσ, ΔΚ
3. για τθν αποκάλυψθ ςωματικϊν μεταλλάξεων (μωςαϊκιςμόσ)
ΌΧΙ χριςιμο:
1. για αποκάλυψθ κοινϊν πολυμορφιςμϊν
2. για προςωπικό γενωμικό ‘προφίλ’, για προδιακζςεισ-κίνδυνο για
κοινά ‘νοςιματα’ (lifestyle genetics)
3. Εξάλλου, τα παραπάνω ΔΕΝ είναι ιατρικά χριςιμα
50. Περιοριςμοί:
τεχνικοί – πϊσ και πόςο μποροφμε να ελζγξουμε (best practice guidelines)
κλινικοί – διαγνωςτικά χριςιμθ πλθροφορία ? (genotype-phenotype, residual risks)
οικονομικοί (ακριβζσ εξετάςεισ, αντιφάςεισ και ςυμβιβαςμοί)
Επιφυλάξεισ:
ςφάλματα (τεχνικά – διαγνωςτικά) - reference materials
αποκάλυψθ κι ανακοίνωςθ άλλων αποτελεςμάτων
εξωτερικόσ ποιοτικόσ ζλεγχοσ – EQA
ηθτιματα θκικισ και δεοντολογίασ - κοινωνία
Όλα τα παραπάνω είναι απαραίτθτο να τα γνωρίηει ο/θ εξεταηόμενοσ/θ κι
αποτελοφν βαςικά ςυςτατικά τθσ γενετικισ ςυμβουλευτικισ πριν αλλά και
μετά τον ζλεγχο.
Επίςθσ, πλθροφορίεσ για τα παραπάνω πρζπει να αναγράφονται ςυνοπτικά
ςτθν ζκκεςθ αποτελεςμάτων
Περιοριςμοί κι επιφυλάξεισ γενωμικοφ ελζγχου
52. Σα οφζλθ από τθ γνϊςθ του
ανκρϊπινου γονιδιϊματοσ
υςχζτιςθ γονιδίων με νοςιματα, με ςτόχο τθ διάγνωςθ όλων των
γενετικϊν νοςθμάτων του ανκρϊπου
Κατανόθςθ πολφπλοκων πολυ-παραγοντικϊν αςκενειϊν, π.χ.
διαβιτθσ, καρδιαγγειακά, αυτιςμόσ, ςχιηοφρζνεια, κ.α.
Κατανόθςθ τθσ καρκινογζνεςθσ κι άλλων πακογόνων μθχανιςμϊν
Σελειοποίθςθ διαγνωςτικϊν μεκόδων και γενετικισ κακοδιγθςθσ
Προςδιοριςμόσ γενετικϊν προδιακζςεων και πικανοτιτων νόςθςθσ
Νζεσ φαρμακευτικζσ ι γονιδιακζσ κεραπείεσ
Εξατομίκευςθ των κεραπευτικϊν ςχθμάτων
53. Προβλιματα δεοντολογίασ ςτισ γενετικζσ εξετάςεισ
Ενθμζρωςθ και ςυναίνεςθ του εξεταηόμενου
Απόρρθτο γενετικϊν πλθροφοριϊν
Ανακοίνωςθ των γενετικϊν δεδομζνων
Κοινωνικόσ ςτιγματιςμόσ
Ευγονικζσ πρακτικζσ
54. Ο γενωμικόσ ζλεγχοσ επιφζρει ανατροπζσ
ςτθν κλινικι διάγνωςθ
Για πρώτθ φορά, οι εξεταηόμενοι καλοφνται να
επιλζξουν από πριν ποια αποτελζςματα
επιθυμοφν να γνωρίηουν και ποια δεν θζλουν να
γνωρίηουν….
55. Ενθμζρωςθ και διλωςθ ςυναίνεςθσ ςτο γενωμικό
ζλεγχο: οι επιλογζσ του εξεταηόμενου
Γνϊςθ ΟΛΩΝ των πλθροφοριϊν?
τοχευμζνθ γνϊςθ, που ςχετίηεται ΜΟΝΟ με τθ
βαςικι αιτία ελζγχου
Γνϊςθ πλθροφοριϊν που ζχουν άμεςθ πρακτικι
ιατρικι αξία ςε ςχζςθ με τθν θλικία του εξεταηόμενου
Γνϊςθ πλθροφοριϊν που ζχουν ιατρικι αξία και για το
μζλλον
Γνϊςθ πλθροφοριϊν που ζχουν ιατρικι αξία για τουσ
ςυγγενείσ
56. Ηκικά και δεοντολογικά διλλιματα του
γενωμικοφ ελζγχου
Αποκάλυψθ “off-target” μεταλλάξεων
Μεγάλοσ αρικμόσ νζων μεταλλάξεων – είναι όλεσ πακολογικζσ ??
Πολλά αποκαλυπτόμενα νοςιματα δεν ζχουν πρόλθψθ ι
κεραπεία
Πικανι αποκάλυψθ μθ-πατρότθτασ, ενδογαμία, αιμομειξία
Πικανι χριςθ των πλθροφοριϊν για ‘εγκλθματολογικοφσ’
ςκοποφσ
Αποκικευςθ και διαφφλαξθ προςωπικϊν δεδομζνων
Προςφορά του ελζγχου χωρίσ τθ μεςολάβθςθ ιατροφ – εμπορικι
εκμετάλλευςθ κι εξετάςεισ direct-to-consumer (DTC)
57. Που και πότε κα εφαρμόηουμε γενωμικό ζλεγχο ?
τον προγεννθτικό ζλεγχο ?
τα νεογνά ?
Θα ελζγχουμε όλα τα ηευγάρια ?
Θα ελζγχουμε τον πλθκυςμό ?
58. Προβλθματιςμοί από τθ γνϊςθ του γονιδιϊματοσ
Γενετικόσ διαχωριςμόσ και διάκριςθ των ανκρϊπων
ςτθν εργαςία
ςτθν οικογζνεια
ςτθν εξζλιξθ
Παρεμβολι ςτθν ατομικότθτα και ςτισ ιδιωτικζσ υποκζςεισ
“Θεραπευτικό χάςμα”
Πικανότθτα επικυμίασ γενετικισ “ωραιοποίθςθσ”
Ανάγκθ προςταςίασ και αποδοχισ των γενετικά μειονεκτικϊν
Επιλογι και χριςθ τθσ πρόβλεψθσ
60. Genetic testing to identify alleged risk factors that
have no proven corrective measures is simply a
waste of money. As noted by Helen
Wallace, Ph.D., Deputy Director of GeneWatch
UK: "For most people, tailoring your diet to your
genetic make-up is about as scientific as tailoring
your diet to your star sign."
61. ΑΝΑΚΟΙΝΩΗ ΣΟΤ ΙΓΕ ΓΙΑ ΣΙ “Διαφθμιηόμενεσ Γενετικζσ Εξετάςεισ”
… Ώσ επιςτθμονικόσ φορζασ των Ιατρικϊν Γενετιςτϊν τθσ χϊρασ μασ είμαςτε
αντίκετοι ςε αυτι τθν πρωτόγνωρθ πρακτικι θ οποία ςε επιςτθμονικό και
κοινωνικό επίπεδο κα μποροφςε να χαρακτθριςτεί ωσ ατόπθμα.
62. Ο ρόλοσ των εργαςτθρίων κι ιδιωτικϊν εταιριϊν
Η κζςπιςθ ςυγκεκριμζνων οδθγιϊν (guidelines) και
προδιαγραφϊν λειτουργίασ
Ποιά νοςιματα και πότε τα ελζγχουμε (κατάλλθλοσ χρόνοσ)
Αςφαλιςτικζσ εταιρίεσ - το απόρρθτο τθσ γενετικισ πλθροφορίασ
Εργαςιακά κζματα
Προςωπικζσ και δια-προςωπικζσ ςχζςεισ
Πολιτικι υγείασ (μείωςθ τθσ ςυχνότθτασ αλλά και του ‘βάρουσ’
των γενετικϊν νοςθμάτων
κι όλα αυτά
ςε αντιςτάκμιςθ με τθν αυτονομία του ανκρϊπου
υνοψίςεισ
63.
64.
65. Πότε κα πετφχουμε τθν επικυμθτι ιςορροπία
ςτο γενωμικό ζλεγχο ??
Όταν ζχουμε πλιρθ ςτοιχεία για
genomic variation ςε ‘φυςιολογικά’
άτομα – ‘1000 genomes project’ κ.α.
Όταν το κόςτοσ για exome
sequencing είναι ~ €1000
Όταν ζχουμε κεςπίςει τισ
απαραίτθτεσ πολιτικζσ κι οδθγίεσ για
τθ χριςθ και φφλαξθ των
προςωπικϊν γενετικϊν δεδομζνων
Όταν ζχουμε τθ δυνατότθτα αλλά
και τθ ςυναίνεςθ να ερμθνεφουμε
τα γενωμικά δεδομζνα για πράξεισ
που ςχετίηονται με τθν υγεία
Κςωσ ςε μερικά χρόνια?
2012, 2013, 2014, 2015, 2016, 2017….
66. «Γενεηική Επιλογή»
ή «Γενεηική Ελεσθερία»;
Οι πρόοδοι ηης Γενεηικής καηαρρίπηοσν
παραδοζιακές νοοηροπίες
Πραγμαηικοί θόβοι για μία
«θεηική» εσγονική πολιηική ;