Pubmed internes de Brest 2012

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Présentation de la recherche sur l'interface Pubmed (MESH, My NCBI)

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Pubmed internes de Brest 2012

  1. 1. Georges Beuzet, Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBOBU Santé Medline via l’interface Pubmed Internes de médecine – 21 mai 2012 mai 2012 1
  2. 2. Objectifs de la séance Connaître les principes de constitution de la base Medline Se repérer dans Pubmed Savoir effectuer une requête pertinente dans la base Savoir mettre en place des alertes sur un thème
  3. 3. Pour suivre les exercices Support de cours et informations complémentaires sur http://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine
  4. 4. Ne pas confondre Medline ≠ Pubmed Le contenu Linterface(la base de données) dinterrogation
  5. 5. Bases de données  Un éditeur privé ou un organisme institutionnel  Un référencement humain  Un thésaurus organisé  Une interface dinterrogation
  6. 6. Medline Qui? National Library of Medicine Etats-Unis) 20 M de références Quoi? darticles biomédicaux, issues de 5200 périodiques depuis 1948 Thésaurus MESH Interface PUBMED (il en existe dautres)
  7. 7. Sil te plaît, dessine-moi... Vocabulaire normalisé Descripteurs Hiérarchie...un thésaurus
  8. 8. Le thésaurus de Medline : le MeSHMedical Subject Headings Mots-clefs uniquement en anglaishttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh
  9. 9. Le MESH : MEdical Subject Headings liste de termes normalisés dans le domaine biomédical outil à utiliser en priorité pour une recherche pertinente
  10. 10. Le MESH Descripteurs (>25 000) Qualificatifs (83) « Laffiliation Descripteur / Qualificatif est la clé de linterrogation de Medline »**(citation de Philippe Eveillard dans « Comment faire ses premiers pas sur Pubmed » La Revue du praticien. Médecine générale A. 2007, n° 766-67, pp. 411-412)
  11. 11. Recherche sans les mots-clefs MESHLes facteurs environnementaux de la sclérose en plaques multiple sclerosis environmental factors
  12. 12. Recherche avec les mots-clefs MESH Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques Environnement ET sclérose en plaques /étiologie
  13. 13. Correspondances Mesh français – Mesh anglais => « Mesh bilingue  de l’INSERM » : http://mesh.inserm.fr/mesh/ ou => « Portail terminologique de santé »(CISMEF) http://pts.chu-rouen.fr/
  14. 14. Exercices 1- Rechercher les affiliations descripteurs/qualificatifs correspondant :  à la chirurgie de l’ostéochondrite de hanche à l’épidémiologie de la maladie de Crohn Limiter la recherche aux 2 dernières années
  15. 15. Réponses 1- Rechercher les affiliations descripteurs/qualificatifs correspondant : à la chirurgie de l’ostéochondrite de hanche "Legg-Perthes Disease/surgery"[Mesh] à l’épidémiologie de la maladie de Crohn "Crohn Disease/epidemiology"[Mesh]
  16. 16. Adresse de la base Medline (via l’interface Pubmed)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
  17. 17. Ne pas confondre
  18. 18. ExerciceTrouver des articles en français et enanglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné publiés dans les 10 dernières années
  19. 19. Articles en français et en anglais sur letoucher dans la relation soignant-soigné publiés les 10 dernières années"Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient Relations"[Mesh] + Filters activated : English, French, published in the last 10 years
  20. 20. Les opérateurs booléens.
  21. 21. Affichage des résultatsNotice darticle affichée en mode « summary »
  22. 22. Notice affichée en mode « abstract »
  23. 23. 3 façons de trouver les bonsmots-clefs MESH En naviguant dans larborescence  cf. sur le Mesh bilingue de lINSERM À partir dun moteur de recherche  Mesh anglais de linterface Pubmed  PTS du Cismef À partir des mots-clefs déjà attribués à un article qui nous intéresse
  24. 24. 3 façons dentrer unerequête dans Pubmed 1) Directement dans la barre de recherche simple
  25. 25. 3 façons dentrer unerequête dans Pubmed2)À partir dun mots-clef MESH ( boîtedéquation de recherche et rebond)
  26. 26. 3 façons dentrer unerequête dans Pubmed 3) À partir du moteur de recherche avancée (« Advanced »)
  27. 27. My NCBI : votre Pubmedpersonnalisé Ouvrir un compte sur My NCBI  « Sign in »  « Register for an account »
  28. 28.  Paramétrer dans votre compte les filtres suivants  Anglais  Français  Texte intégral gratuit  Universite de Bretagne Occidentale Service commun de documentation
  29. 29. Exercices 2 - Saignement de nez et hypertensionRecherche de références à partir des mots MESH et sauvegarder des références dans MY NCBI
  30. 30. Réponses 2 - Saignement de nez et hypertension"Epistaxis"[Mesh] AND "Hypertension"[Mesh]
  31. 31. Exercices3 - Les traitements du syndrome coronarien aigu. Exclure les traitements médicamenteux et la chirurgie. Limiter aux publications des deux dernières années Créer une alerte dans My NCBI
  32. 32. Réponse 3 - Les traitements du syndrome coronarien aigu. Exclure les traitements médicamenteux et la chirurgie. Limiter aux publications des deux dernières années("Acute Coronary Syndrome/therapy"[Mesh]) NOT ( "Acute Coronary Syndrome/drug therapy"[Mesh] OR "Acute Coronary Syndrome/surgery"[Mesh] ) Alerte My NCBI : cliquer sur « Save Search »
  33. 33. Des mots MESH ?. Ne contient pas de mots MESH Contient des mots MESH
  34. 34. Pubmed advanced search Interrogation sur un champ en particulier Historique de la recherche Relancer et combiner les recherches
  35. 35. Pubmed avanced search Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques Recherche dans les champs titres et résumés et exclusion des notices comportant des mots clés Multiple sclerosis [tiab] AND environment* [tiab] NOT medline [sb]
  36. 36. Exercices 2 - Saignement de nez et hypertensionRecherche de références à partir des mots du titre et du résumé dans le module « Advanced search » en excluant les références indexées et sauvegarde de la stratégie complète avec veille mensuelle dans MY NCBI
  37. 37. Réponse(epistaxis [tiab] OR nasal bleeding[tiab] OR nosebleed [tiab] OR nosebleed [tiab]) AND (hypertension [tiab]OR high blood pressure [tiab]) NOTmedline [sb]
  38. 38. Recherche d’informations sur les essais cliniques et la médecine fondée sur les preuvesL’outil « Clinical queries » permet de retrouver :  Questions cliniques  Revues systématiques  Etudes en génétique médicale
  39. 39. Recherche d’informations sur les essais cliniques et la médecine fondée sur les preuves
  40. 40. Memo Pubmed1) trouver les bons mots-clefs MESHet la bonne équation de recherche2) limiter et filtrer les résultats enfonction de ses besoins3) accéder au texte intégral via lefiltre BU Santé4) paramétrer des alertesautomatiques par courriel
  41. 41. Merci de votre attentionRetrouver le diaporama de la formation et les informations sur les autres séances http://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine Nous contacter 02 98 01 64 77 bu-sante@univ-brest.fr http://facebook.com/busantebrest
  42. 42. Les autres formations proposéespar la BU Santé- autres ressources en Santé (parce quil ny a pas quePubmed dans la vie...) :  Cochrane Library  Pascal  BDSP  Cismef  EM-Premium  etc...- outils bibliographiques : norme Vancouver et logicielsZotero/EndNotehttp://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine

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