Une bibliographie Zotero en Médecine

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Support pour une formation de 2h sur Zotero à destination des internes de Médecine de Brest. mise à jour juillet 2012

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  • Avant toute formation, - vérifier que tous les postes de la salle de formation sont équipés de la dernière version de Firefox (3.5) et d'Open Office (3.1) - vérifier que le module d'import Zotero dans Open Office est bien installé sur tous les postes - vérifier que Zotero est bien désinstallé sur tous les postes, sauf celui du formateur.
  • Le principe est d'abord de montrer rapidement l'avantage du logiciel et son intérêt, avant de le faire installer puis de faire travailler les stagiaires sur une série d'exercices. Les compétences à acquérir sont les suivantes : - comprendre l'intérêt du logiciel Zotero - savoir l'installer sur son propre poste - savoir importer une référence - savoir ajouter une note à une référence - savoir gérer ses références dans des dossiers ou avec des mots-clefs - savoir exporter une ou plusieurs références sous forme de bibliographie dans un document texte - savoir sauvegarder sa bibliothèque Zotero pour la réimporter éventuellement plus tard.
  • En fonction du temps disponible, choisir de montrer soi-même un exemple d'importation puis d'exportation de référence ou bien montrer la vidéo (3 minutes). Problème : si le son ne marche pas, il faudra commenter soi-même la vidéo. La démonstration peut se faire en deux temps : - import d'une référence d'ouvrage depuis le sudoc - depuis un document Open Office texte, écrire « citation » et montrer un ajout de note de bas de page avec lien vers l'ouvrage précédemment importé.
  • Zotero récupère les données bibliographiques sur internet et les enregistre dans un format de description bibliographique (Zotero RDF). Il peut ensuite les réexporter en format texte en respectant plusieurs styles de présentation préparamétrés.
  • La question de la gratuité conduit tout droit aux avantages et inconvénients de Zotero.
  • L'installation de Zotero correspond à une installation classique de module complémentaire sur Firefox. Ceux qui connaissent déjà cet outil iront très vite pour l'installer, tandis que d'autres peuvent être un peu déboussolés par cette interface qu'il ne connaissent pas du tout (surtout s'ils ont l'habitude de travailler avec Explorer).
  • Cette étape permet de vérifier que les stagiaires connaissent le Sudoc et sinon, de le leur faire découvrir. Ne pas hésiter si le catalogue leur est totalement inconnu à faire un petit apparté sur le rebond « localisation » qui permet de savoir si l'ouvrage est disponible dans les bilbiothèques de l'enseignement supérieur de France... Et rappeler que depuis une requête Google Books, on peut rebondir dans Amazon mais aussi dans le Sudoc.
  • Astuce : pour que vos références aillent directement dans votre dossier « Sevrage tabagique », il vous suffit de créer le dossier d'abord et de le séléctionner avant d'importer vos références. Les références sont alors automatiquement importées dans le dossier qui est déjà « ouvert » par Zotero.
  • C'est la première option qui est la plus intéressante, à condition d'avoir la place sur son disque dur ou sa clef USB de stocker une copie de ces fichiers;
  • Rappel : si aucune icône n'apparaît, il faut alors entrer manuellement la notice ou bien importer la page web en se servant de la barre d'outil. ___________________________________ Dans le cas d'un titre de chapitre , il faut télécharger la référence du livre, puis changer ensuite le type de notice dans le menu déroulant de l'onglet « info » pour choisir « chapitre de livre ». Puis il faudra corriger pour ajouter le titre et l'auteur du chapitre.
  • Rappeler aux stagiaires qu'il faut dans tous les cas vérifier que la référence importée est bien complète (auteur, titre, date, au minimum).> sinon, la modifier.
  • Présenter successivement les 3 colonnes 1) colonne de classement Classer les références dans des collections facilite le travail. Il est possible de renommer les collections, les déplacer (pour les transformer en sous-dossier). Attention, les sous-collections ne sont pas prise en compte lors de la création de bibliographie à partir du dossier parent. Ma bibliothèque contient l’ensemble des références réparties dans les collections ainsi que les références non classées. 2) Colonne de liste des références On voit dans cette colonne, en fonction du dossier sélectionné, la liste des références avec leur titre et une icône qui précise le type de référence. 3) Colonne de description d'une référence La colonne de droite propose plusieurs onglets délivrant des détails sur l’élément sélectionné dans la colonne du milieu et permettant d’y associer des informations complémentaires.
  • Présentation de la barre d'outil qui se trouve au-dessus des trois colonnes.
  • Il y a deux façons possibles d'organiser sa bibliothèque - par dossiers et sous-dossiers (conseillé) - par mots-clefs (marqueurs ou tags) : attention, sur de nombreux sites des mots-clefs sont importés en même temps que la notice.
  • Les médecins auront normalement abordé HAL durant le cours précédent avec Catherine Bertignac.
  • Astuce : cette thèse n'est pas encore référencée dans le Sudoc (elle n'a sans doute pas encore été soutenue et corrigée). Dans le cas où la thèse est présente dans le Sudoc, il vaut mieux importer la référence depuis le sudoc avant d'y ajouter le fichier pdf téléchargé dans HAL Le bouton « afficer le fichier » de gauche permet de lire le fichier dans son navigateur Firefox. Le bouton « afficher le fichier » de droite permet de voir le fichier dans son contexte / emplacement sur l'ordinateur.
  • Il faudra trouver une adresse plus courte pour que l'import du document soit plus facile.
  • Dans le cas du style Vancouver, l'insertion d'une référence dans un texte en cours de rédaction se fait en deux étapes 1) insertion du numéro de la référence 2) insertion, à la fin du document, de la bibliographie complète. L'étudiant est dans ce cas invité à éditer sa bibliographie seulement à la toute fin de son travail.
  • Une bibliographie Zotero en Médecine

    1. 1. Votre bibliographie facileavec ZoteroFormation – internes de médecine BrestSCD UBO – juillet 2012
    2. 2. Au programme Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie Partager Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 2
    3. 3. 1. Découverte Démonstration en direct ou visionnage de la vidéo.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 3
    4. 4. Comment ça marche?Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 4
    5. 5. Les logiciels pour éditer des bibliographiesMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 5
    6. 6. En quoi Zotero peut mêtre utile? Gestion de références Veille Sauvegarde de référencesPartage de références Édition de bibliographies Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 6
    7. 7. Présentation du logiciel Une extension de Firefox, gratuite Existe aussi en logiciel indépendant « Zotero StandAlone » (compatible avec les navigateurs Chrome et Safari)Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 7
    8. 8. DécouvrirInstallerImporter une référenceOrganiserExporter une bibliographiePartager Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 8
    9. 9. Exercice Installer Zotero sur FirefoxMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 9
    10. 10. Installer Zotero http://www.zotero.orgMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 10
    11. 11. Installation terminée!Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 11
    12. 12. Exercice Affichez puis masquez Zotero dans votre navigateur.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 12
    13. 13. Zotero affichéMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 13
    14. 14. Zotero masquéMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 14
    15. 15. Zotero en pleine pageMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 15
    16. 16. Exercice Créez votre compte personnel sur http://www.zotero.org [clic sur « register »]Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 16
    17. 17. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 17
    18. 18. Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie PartagerMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 18
    19. 19. Importation de références bibliographiques depuis le webMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 19
    20. 20. Exercice http://portail-scd.univ-brest.fr Trouvez dans le catalogue des BU de Brest la notice de louvrage suivantHuas D, Rueff B. Abord clinique des malades de lalcool en médecine générale. Paris: Springer; 2005.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 20
    21. 21. Exercice Importez cette notice dans votre liste de références Zotero.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 21
    22. 22. CorrectionMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 22
    23. 23. Correction (suite)Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 23
    24. 24. Exercice 3 Trouvez et importez depuis le catalogue dans Zotero trois références douvrages sur le sevrage tabagique.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 24
    25. 25. Correction (2) On peut importer dans sa bibliothèque Zotero une liste de plusieurs ouvrages à la fois.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 25
    26. 26. Correction (3)Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 26
    27. 27. Correction (4)Cochez les trois ouvrages que vous souhaitez importer... Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 27
    28. 28. Correction (5) Remarque : dans cet exemple, une des références importées est une thèse Les thèses sont représentées par une icône spécifiqueMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 28
    29. 29. Exercice Trouvez puis importez depuis la base PubMed la référence suivante Dubar G. et al. « French Experience of 2009 A/H1N1v Influenza in Pregnant Women ». PLoS One [En ligne]. 2010, Vol. 5, n°10. .Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 29
    30. 30. Correction Quand on importe un article, licône à droite de la barre dadresse est cette fois non pas un livre, mais une petite feuille.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 30
    31. 31. Exercice : import dune page web Importez dans votre bibliothèque Zotero larticle de blog suivant Flahaut, Antoine. « Grippe, la France Sentinelle de lEurope? » in Le Blog dAntoine Flahaut, 24 septembre 2009.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 31
    32. 32. Correction Même sans icône dans la barre dadresse, il est toujours possible de capturer une page webMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 32
    33. 33. Correction Ici, il faudra cependant corriger la notice importée pour indiquer quil sagit dun billet de blog et non pas dune page web classiqueMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 33
    34. 34. Nota BeneIl est toujours possible dans Zotero de créer manuellement une notice. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 34
    35. 35. Récapitulatif des icônes dimportation Importation dune référence douvrage Importation simultanée dune liste de références douvrages ou darticles Importation dune référence de thèse Importation dune référence darticle Importation dune page webMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 35
    36. 36. Quelques sites Zotero-compatibles http://www.zotero.org/translatorsSites compatibles Partiellement compatiblesCatalogue UBO UbodocCatalogue BIUM SudocMedline Cochrane LibraryEbscoHost (Pascal) HAL (archives ouvertes CNRS)Science Direct Incompatible CisMef Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 36
    37. 37. Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie 6. PartagerMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 37
    38. 38. Interface : les trois panneaux 1 : L a bibliothèque (possibilité d’organiser en dossiers et sous-dossier, 2 : Liste des notices du dossier sélectionné, 3 : La fiche de l’élément (article, ouvrage, page Internet etc.) sélectionné. Source : Mathieu PoujolMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 38
    39. 39. La barre doutils Saisir manuellement une noticedossier ou un sous-dossier Joindre un Faire une recherche dans les éléments d fichier à une référenceer une bibliothèque, réglage des préférences etc... Créer une Annoter votre bibliothèque ou vos dossiers ou sous-dossiers notice à partir de la page web en cours Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 39
    40. 40. Organiser sa bibliothèque Par dossiers Par marqueurs/mots-clefs Source : Mathieu PoujolMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 40
    41. 41. Exercice Enregistrez vos références sur le sevrage tabagique dans - un sous-dossier intitulé « sevrage tabagique » - qui se trouvera lui-même dans un nouveau dossier de la bibliothèque intitulé : « Tabacologie ».Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 41
    42. 42. CorrectionMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 42
    43. 43. Correction (2)Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 43
    44. 44. Correction (3)Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 44
    45. 45. Exercice A louvrage « Abord clinique des malades de lalcool en médecine générale » (déjà dans votre bibliothèque Zotero) … ajoutez le mot-clef « thèse2012 »Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 45
    46. 46. Exercice - Ajoutez le mot-clef « thèse 2012 » à 3 références de votre bibliothèque Zotero - Affichez ensuite tous les documents qui contiennent le mot- clef « thèse 2012 »Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 46
    47. 47. CorrectionMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 47
    48. 48. Associer un fichier à une référence On peut joindre un lien ou une copie dun fichier en ligneOn peut joindre un lien ou une copie dun fichierqui se trouve sur lordinateur Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 48
    49. 49. Exercice http://hal.archives-ouvertes.fr Dans larchive ouverte HAL, trouvez et importez dans Zotero la référence de la thèse suivante Abtey, Catherine. La confiance chez les femmes primipares de la grossesse au post-partum. [Thèse] Université de Nantes, 2008.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 49
    50. 50. Exercice (suite) Associez à la référence importée le fichier PDF du document (texte intégral de la thèse – version 1).Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 50
    51. 51. Correction Afficher le pdf dans Firefox Sélectionner la référence du document dans Zotero Cliquer sur « capture de la page » (menu Zotero > trombone)Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 51
    52. 52. Correction 2. On enregistre le pdf qui1. On est affichésélectionne dansla référence Firefoxdabord Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 52
    53. 53. Correction Il sera possible, même sans connexion internet, de retrouver et de lire ce fichier.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 53
    54. 54. Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie PartagerMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 54
    55. 55. Exportation dune bibliographie dans un document texte Bibliographie simple Bibliographie intégrée (dans le traitement de texte)Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 55
    56. 56. Exercice Exportez lensemble de vos références traitant du sevrage tabagique sous forme de bibliographie dans un document texte avec le style « Vancouver » Bibliographie simpleMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 56
    57. 57. CorrectionBibliographie simple Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 57
    58. 58. Correction (2)Bibliographie simple Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 58
    59. 59. Correction (3) Coller le presse-papier dans un document texte. 1. Tanguy C. Addiction et sevrage tabagique. 2008 ;1 vol. (125 f.-X-10l.en coul. 2. Metzger-Flock A. Particularités de laide au sevrage tabagique en médecine générale : à propos dune enquête réalisée auprès des médecins généralistes de la région mulhousienne. 2005 ;89 f. 3. Perriot J., Llorca P., Boussiron D, Schwan R. Tabacologie et sevrage tabagique. Montrouge: J. Libbey Eurotext; 2003.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 59
    60. 60. Exercice Installer le plug-in Zotero pour Word depuis le site Zotero.orgBibliographie intégréeMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 60
    61. 61. CorrectionZotero.org > Support > Word Processor Integration > Installation > Word pour Windows plug-in Bibliographie intégrée Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 61
    62. 62. Loutil de citation (avec Word ou Open Office) Bibliographie intégrée Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 62Source : Daniel Bourrion
    63. 63. Bibliographie intégrée : 2 étapesInsérer des citations – références Insérer la bibliographie complète Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 63
    64. 64. Exercice Dans un nouveau document Word, insérez trois références de votre bibliothèque Zotero sous forme de citations avec le style « Vancouver »Insérer des citations – références Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 64
    65. 65. CorrectionInsérer des citations – références Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 65
    66. 66. Loutil de citation (avec Word ou Open Office) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 66Source : Daniel Bourrion
    67. 67. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 67
    68. 68. Exercice Insérer la bibliographie complète des références déjà ajoutées en citation.Insérer la bibliographie complète Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 68
    69. 69. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 69
    70. 70. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 70
    71. 71. Exercice Ajouter à cette bibliographie une référence qui ne fait pas partie des citations du document.Insérer la bibliographie complète Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 71
    72. 72. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 72
    73. 73. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 73
    74. 74. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 74
    75. 75. De nombreux styles sur Zotero.org http://www.zotero.org/stylesMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 75
    76. 76. Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie PartagerMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 76
    77. 77. Sauvegarde de données On peut sauvegarder manuellement sa bibliothèque Zotero sur un disque dur Pour lutiliser plus tard sur un autre ordinateur avec Zotero Pour limporter dans un autre logiciel de gestion bibliographique si on décide den changer : EndNote, Mendeley etcMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 77
    78. 78. Sauvegarde de données (2) Il est aussi possible de sauvegarder sa bibliothèque Zotero automatiquement par synchronisation avec son compte Zotero en ligne.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 78
    79. 79. Exercice Depuis votre boîte mail, activez votre compte personnel Zotero en ligne (créé en début de séance)Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 79
    80. 80. Exercice (suite) Dans les préférences de Zotero, entrez les paramètres de votre compte Zotero pour la synchronisation de vos références avec votre compte en ligneMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 80
    81. 81. CorrectionMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 81
    82. 82. CorrectionMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 82
    83. 83. Exercice Synchronisez votre Zotero local avec votre profil Zotero en ligneMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 83
    84. 84. Correction Vous avez dorénavant 2 bibliothèques Zotero Une bibliothèque locale Une bibliothèque « en ligne » Ces 2 bibliothèques sont synchronisées.Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 84
    85. 85. Ma bibliothèque Zotero (Library) en ligne Synchronisation Ma bibliothèque Zotero localeMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 85
    86. 86. Exercice - Connectez vous sur le site de Zotero (« login ») afin de pouvoir visualiser et gérer votre bibliothèque Zotero en ligne. - Modifiez les paramètres de visibilité de votre page selon votre convenanceMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 86
    87. 87. Paramètres de confidentialité : un exempleMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 87
    88. 88. De votre bibliographie personnelle à la veille collaborative... Retrouvez dautres chercheurs en ligne! Zotero PeopleMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 88
    89. 89. Merci de votre attention! Ce diaporama est visible et téléchargeable sur http://slideshare.com/phelly Avant de partir : pensez à nettoyer votre session Zotero Et en particulier à effacer les informations de synchronisation!Pour toute question sur Zotero Pour aller plus loinperrine.hellyATuniv-brest.fr http://delicious.com/phelly/zotero Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 89
    90. 90. Crédits photographiques Nasa Images Pdimension.net Boris sur Flickr Xtof sur Flickr Pascal Lemaire sur Picasa Caroline & Laurent sur PicasaMàj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 90

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