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Master Ingénieurs, ESIR, ISTIC

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Master Ingénieurs, ESIR, ISTIC

  1. 1. Gérer ses références bibliographiques avec Zotero Masters Informatique, électronique, sciences de l'ingénieur 2017-2018 •
  2. 2. 2 PLAN 1.Démarrer avec Zotero : installation, importation 2.Gérer ses références : manipuler, organiser 3.Sauvegarder sa bibliothèque : créer un compte 4.Produire une bibliographie dans un traitement de texte 5.Partager ses références : création de groupe 6.Utiliser le gestionnaire de flux RSS Les logiciels de gestion bibliographique : introduction
  3. 3. 3 Les outils de gestion bibliographique Utilité des logiciels de gestion des références bibliographiques • Pouvoir importer automatiquement des références résultant de recherches documentaires (bases de données ou pages web) • Pouvoir exploiter facilement de gros corpus de références • Pouvoir récupérer des références lors de l’écriture d’un texte et pour établir sa bibliographie • Pouvoir formater automatiquement des références selon les normes d’écriture et conventions en vigueur • Faire une saisie unique des données
  4. 4. 4 1. Qu’est-ce que Zotero ? Open source • Logiciel libre et gratuit • Lancé en 2006 par le Centre for History and New Media de l’Université George Mason (USA) Simple d’utilisation Une application indépendante du navigateur (standalone) => utilisation possible avec Firefox, Chrome ou Safari ou Opera
  5. 5. 5 Que peut-on faire avec Zotero ? Pages web biblio en ligne, groupes Base Zotero de références et pdf Bibliographie 1__________2__ ________3_____ _____4________ __5__________ Bibliographie 1__________2__ ________3_____ _____4________ __5__________ Article avec citations et bibliographie
  6. 6. 6 1.1 Installer Zotero Il est téléchargeable à l'adresse : http://www.zotero.org Cliquez sur Download .
  7. 7. 7 1.2 Importer et créer des références 1. Import automatique direct 2. Récupération des références à partir d’un identifiant (ISBN, DOI, PMID) 3. Création d’une référence à partir d’une page web (signet) 4. Récupération des références d’un document pdf 5. Création manuelle d’une référence
  8. 8. 8 1.2 Importer les références Récupération automatique des données par lot Attention : Zotero doit impérativement être ouvert pour permettre l’import de références bibliographique
  9. 9. 9 1.2 Importer les références Sélectionner les documents
  10. 10. 10 Récupérer les références dans Zotero 1.2 Importer les références Vérifier qu’elles soient complètes Joindre le pdf si disponible*
  11. 11. 11 1.2 Importer des références d’un pdf Paramétrer Zotero pour joindre automatiquement des fichiers PDF Dans la colonne du milieu, cliquez sur le bouton « Édition/» puis sélectionnez «Préférences », et choisissez l’onglet «Générales» Cochez la case «Joindre automatiquement les fichiers PDF associés lors de l’enregistrement d’un document »
  12. 12. 12 1.2 Importez des références Sites Zotero compatibles : • ScienceDirect, SpringerLink, Wiley online Library, Google Scholar et Books, PubMed, Amazon, ACS, Cairn, Europress, Sudoc, Supernova... • Voir la liste non exhaustive à : http://www.zotero.org/translators • Repère =
  13. 13. 13 1.2 Importer des références Sites non Zotero compatibles : l'exemple des Techniques de l'ingénieur Récupérer un ensemble de références en cliquant sur « exporter les références sélectionnées »
  14. 14. 14 1.2 Importer des références Sites non Zotero compatibles : l'exemple des Techniques de l'ingénieur Récupérer un ensemble de références en cliquant sur « exporter les références sélectionnées »
  15. 15. 15 1.2 Importer des références Sites non Zotero compatibles : l'exemple des Techniques de l'ingénieur
  16. 16. 16 1.2 Importer des références Vérifier si le PDF est présent sous la référence
  17. 17. 17 1.2 Importer des références Autres possibilités d’import : • Récupération par l’ISBN pour un livre, le DOI pour un article, le PMID pour un document indexé dans Pubmed • Création d’une référence à partir d’une page web • Récupération des métadonnées d’un fichier pdf • Création manuelle de la référence (en dernier recours)
  18. 18. 18 1.2 Importer des références à partir d’un identifiant 1- Copier le DOI Ne pas oublier de récupérer le pdf s’il existe
  19. 19. 19 1.2 Importer des références à partir de la page web
  20. 20. 20 . 1.2 Importer des références d’un pdf- Récupérer les métadonnées des fichiers PDF La première fois : Installer les outils pdftotext et pdfinfo dans les Préférences
  21. 21. 21 1.2 Importer des références manuellement Si l’import automatique ne marche pas : • Pas d’icône dans la barre d’adresse • En cas d’échec de l’enregistrement Cliquer sur nouveau document Sélectionner le type de document à ajouter Remplir les champs manuellement
  22. 22. 22 2. Gérer ses références : classer, organiser • Gestion de la base personnelle - Modification de références - Recherche dans la base - Classement des références - Ajout de notes de lecture - Ajout de tags (marqueurs) - Lien de deux notices
  23. 23. 23 Bibliothèque et ses collections Liste des références Une référence • Interface de travail : 3 parties distinctes 2. Gérer ses références
  24. 24. 24 2. Gérer ses références • La barre d’outils - Créer une collection - Créer un groupe / nouveau flux - Nouveau document : créer manuellement une référence et faire le lien vers le texte intégral - Ajouter un document par son identifiant - Ajouter une note - Joindre un lien vers un fichier - Recherche avancée - Recherche dans la base Localiser le fichier, afficher en ligne - Synchroniser les données avec le serveur Zotero
  25. 25. 25 2. Gérer ses références • Modifier une référence Ajouter des données supplémentaires Modifier une référence
  26. 26. 26 2. Gérer ses références • Enrichir ses références : mots-clés, notes Cliquer sur l’onglet Note Marqueur, Connexe Saisir la note dans l’éditeur de texte Ajouter le marqueur La fonction Connexe permet de faire le lien avec une autre référence
  27. 27. 27 2. Gérer ses références Fonction Localiser Afficher / Localiser le document selon son statut : PDF, capture, lien vers la page en ligne …
  28. 28. 28 • Fusionner les doublons 2. Gérer ses références Afficher les doublons Sélectionner les doublons Fusionner les doublons
  29. 29. 29 2. Gérer ses références : classer, organiser Recherche dans la bibliothèque de références Fenêtre de recherche avancée, accessible par l'onglet Edition Possibilité d’enregistrer la recherche
  30. 30. 30 Accéder à ses références par les marqueurs / tags 2. Gérer ses références : classer, organiser Possibilité de filtrer les références en sélectionnant des mots clés Zone des marqueurs dans la colonne de gauche de Zotero
  31. 31. 31 2. Gérer ses références : classer, organiser : Distinguer visuellement une référence :
  32. 32. 32 2. Gérer ses références : classer, organiser : Distinguer visuellement une référence : Faites apparaître le nuage de marqueurs de la collection en cliquant en bas dans la colonne de gauche Validez la proposition par «Définir la couleur ».Un carré de couleur apparaît à gauche de la référence concernée
  33. 33. 33 3. Sauvegarder sa bibliothèque Synchroniser l’ensemble de ses données avec le serveur Zotero Cela permet de : • Copier votre bibliothèque sur le serveur distant → Accès à My library gratuit jusqu’à 300 Mo • Permet la sauvegarde de vos données → il est souhaitable aussi de sauvegarder sur un 3e support (clé usb) • Consulter votre bibliothèque de n’importe quel ordinateur → après avoir installé Zotero et entré vos identifiants
  34. 34. 34 3. Sauvegarder sa bibliothèque Zotero en ligne https://www.zotero.org/user/register/
  35. 35. 35 3. Sauvegarder sa bibliothèque Autre solution : Exporter sa bibliothèque
  36. 36. 36 3. Sauvegarder sa bibliothèque C’est ce répertoire Zotero complet qu’il convient de sauvegarder. En cas de problème avec le dossier «Ma bibliothèque », il vous suffira de substituer le répertoire Zotero en cours par le répertoire Zotero sauvegardé.
  37. 37. 37 3. Sauvegarder sa bibliothèque
  38. 38. 38 Importer votre bibliothèque dans zotero A l’inverse, pour importer votre bibliothèque dans votre Zotero : 1. Cliquez sur «Fichier» 2. Sélectionnez «Importer», puis choisissez le fichier concerné et validez 3. Le dossier s’importera automatiquement dans la bibliothèque créant une collection Intitulée « Ma bibliothèque» avec tous les sous - dossiers.
  39. 39. 39 4- Produire une bibliographie • Création d’une bibliographie – À partir d’une collection donnée – Formatage dans un style donné • Passerelle avec les traitements de texte – Word (Microsoft) et Writer (OpenOffice ou LibreOffice) – Insertion de citations pendant la rédaction sans avoir à réécrire les références
  40. 40. 40 4- Produire une bibliographie Préférences / Citer / Styles 12 styles par défaut Pour chercher d’autres styles Cliquer sur Obtenir des styles supplémentaires • Formater la bibliographie – Utilisation des styles fournis par Zotero
  41. 41. 41 5- Exploiter les références à l’aide d’un logiciel de traitement de texte Insérer / Éditer et modifier une référence Créer /Éditer et modifier la bibliographie Modifier les préférences du document Rafraîchir l’affichage Supprimer le lien entre Zotero et le document
  42. 42. 42 5- Exploiter les références à l’aide d’un logiciel de traitement de texte 5- Exploiter les références à l’aide d’un logiciel de traitement de texte Corriger les anomalies de la bibliographie en utilisant le traitement de texte Attention : Ces corrections manuelles seront écrasées dès la moindre modification de la bibliographie (ajout, suppression, modification d’une référence ou changement de style). C’est la raison pour laquelle ce nettoyage doit être effectué à la toute fin de votre travail.
  43. 43. 43 5- Partager ses références Paramétrage du groupe - Public ou privé Définition du groupe - Nom et description - Statut - Disciplines concernées - etc. Gestion des membres - propriétaire, éditeur • Outil collaboratif : Créer un groupe • Réalisation de bibliographies collectives
  44. 44. 44 6. Utiliser le gestionnaire de flux RSS Avantage : Avec Zotero, vous disposez d’un outil unique pour l’ensemble des étapes de votre bibliographie : mettre en place une veille, collecter des références, générer une bibliographie selon un style prédéfini
  45. 45. 45 A partir de la base de données, sélectionner la fonction permettant de générer un flux RSS à partir d’une équation de recherc he.
  46. 46. 46 Ressources Tutoriel : http://guides-formadoct.u-bretagneloire.fr/friendly.php?s=zotero Blog francophone : http://zotero.hypotheses.org/ Contacts : catherine.derennes@univ-rennes1.fr marc.lemarchand@univ-rennes1.fr

Notes de l'éditeur

  • Lors d’une recherche bibliographique dans un catalogue (type SUDOC) ou une base de données (PubMed par ex.), Zotero repère automatiquement les références :
    Sur la page d’affichage des résultats, une icône apparaît dans la barre d’outils du navigateur.
  • Recherche Google Scholar : mot clé : PERSEUS
  • En cliquant sur cette icône, Zotero ouvre une fenêtre affichant les résultats présents sur la page. Il suffit alors de sélectionner tout ou une partie de la liste, puis de cliquer sur «Ok» pour importer les références.
    Toutes les références importées dans Zotero
    Sont enregistrées par défaut dans «Ma bibliothèque
    ». Celle -ci ne peut être ni supprimée, ni renommée
    .A noter : si un dossier de la bibliothèque
    Est sélectionné avant l’import, les références seront
    directement classées à l’intérieur de celui-ci.
  • Si dans le paramétrage dans les Préférences générales, le choix suivant est décoché :
    Joindre automatiquement les fichiers pdf associés lors de l’enregistrement des références
    Il est possible de le faire manuellement
    Attention aux inconvénients
    .
  • Récupérer un ensemble de références en cliquant sur « exporter les références sélectionnées 
    Récupérer un ensemble de références en cliquant sur « exporter les références sélectionnées 
    Recherche avec le mot clé MIMO  (Système d'émission et de réception radioélectrique en diversité ) = Multiple Input - Multiple Output
    La technique d’antennes avancées MIMO
    Attention filtrer par titre de contenu
    Les sytèmes multi-entrées multi-sorties, qui font l’objet de ce premier séminaire, sont une avancée de première importance pour les systèmes de communications. Ils permettent d’optimiser la bande passante en améliorant la qualité de transmission et en augmentant le débit. Leur généralisation dans les sytèmes de communications du futur est un enjeu industriel majeur.
  • 10.1088/1741-2552/aa714a
  • Il est parfois possible de formater automatiquement une référence issue d’un fichier PDF importé dans Zotero : cette opération va consister à «Récupérer les métadonnées du PDF».
    Lors de la 1ère utilisation de cette fonctionnalité, vous devrez accepter de télécharger deux applications nécessaires à Zotero.
    Sélectionnez le fichier PDF que vous souhaitez reformater, puis faites
    un clic droit et choisissez «Récupérer les métadonnées du PDF » dans le
    menu déroulant
  • A gauche : structure de la base Zotero
    «Ma bibliothèque» contient l’ensemble des références.
    Des collections, soit des dossiers et des sous dossiers,
    permettent de classer les références 
    Contient un dossier « Non classés » pour les éférences
    non classées, un dossier «Doublons» dédié à la gestion
    des références importées plusieurs fois et une corbeille
    Le dossier «Mes publications » permet de créer une liste contenant vos travaux et de la partager sur la page de votre profil sur zotero.org
  • Possibilité de rechercher dans le full texte des articles pdf
    Enregistrer la requête => la requête se trouve dans la bibliothèque (dossier avec loupe)
    Permet de faire une requête dynamique
  • Lorsqu’une référence est sélectionnée, il est possible de faire apparaître dans la colonne de droite les marqueurs associés à ce elle - c’est a dire des mots clés appliqués à une référence. Les marqueurs sont importés directement avec la référence. Il est possible de les supprimer, en cliquant sur le bouton et d’en créer soi même en cliquant sur le bouton .
    Pour afficher l’ensemble des marqueurs de la collection, il suffit de cliquer sur les points encadrés de flèches, en bas dans la colonne de gauche
    l est possible de paramétrer son compte pour choisir
    d’importer ou non les marqueurs, dans l’onglet dans les
    «Préférences» du bouton «Édition »
  • Vous pouvez attribuer un code couleur à une référence que vous jugez importante ou digne d’intérêt (à lire, à citer, etc.).
    1. Dans la colonne de droite de la référence concernée, cliquez sur l'onglet «Marqueurs» puis sur le bouton « Ajouter »
  • Zotero en ligne
    La bibliothèque Zotero est liée au poste de travail sur lequel elle a été installée. Pour pouvoir retrouver votre bibliothèque sur d’autres ordinateurs, il est donc nécessaire d’utiliser Zoteroen ligne
    Zotero propose de stocker votre bibliothèque sur un serveur accessible à distance à partir de n’importe quel poste disposant
    d’une connexion internet.
    Il faut pour cela créer un compte à l’adresse suivante :
    https://www.zotero.org/user/register
    Possibilité de travailler en ligne permet d'éviter d'installer un zotero local
    3. Sauvegarder sa bibliothèque
  • 1
    : Par sécurité, il est souhaitable de sauvegarder régulièrement sa bibliothèque, soit en synchronisant le compte sur le serveur Zotero, soit en exportant la bibliothèque sur un autre support (clé USB, disque dur externe,...).
    Il est possible de sauvegarder l’intégralité de votre base Zotero : les références seront enregistrées et cette manipulation
    conservera l’architecture des dossiers et sous
    -
    dossiers éventuels.
    Pour conserver les dossiers, les sous
    -
    dossiers et leur contenu, vous pouvez sauvegarder intégralement le répertoire
    Cliquer sur Edition puis préférence, Sélectionnez l’onglet
    «Avancées» puis l’onglet «Fichiers et dossiers» Cliquez sur «
    Ouvrir le répertoire de données » pour ouvrir le répertoire
    de stockage Zotero
  • Il est également possible de sauvegarder l’intégralité du dossier «Ma bibliothèque» en conservant l’arbores-cence des dossiers et sous -dossiers en suivant la procédure suivante
    Faites un clic droit sur «Ma bibliothèque»2.Sélectionnez «
    Exporter la bibliothèque» 3 Choisissez le format RDF, possibilité de cocher «Exporter les notes» et/ou «
    Exportez les fichiers»4.OK Le dossier s’enregistrera sur l' ordinateur, à l’emplacement que vous aurez chois
    Il est également possible de sauvegarder uniquement certains dossiers ou sous -dossiers. Cette procédure permettra aussi d’exporter vos références vers un autre logiciel de gestion des références bibliographiquei
  • Attention
    : la bibliographie est générée automatiquement à partir
    des éléments du dossier sélectionné, y compris des fichiers liés
    s’ils sont affichés dans la colonne centrale. Exemple : si vous avez lié une note à une référence, et que cette note est « dépliée », Zotero créera automatiquement une entrée correspondant à cette note dans la bibliographie.
  • Attention : Zotero doit impérativement être ouvert pour communiquer avec le logiciel de traitement de texte.
    Pour faire apparaître la barre d’outils Zotero, cliquer sur le menu «Zotero» de Word, sur le menu «Scripts» si vous utilisez un Mac.
    Lors du premier import, sélectionner la norme de présentation des références bibliographiques.Pour insérer une référence dans votre texte, placez le curseur à l’endroit où vous souhaitez insérer la citation.Puis cliquez sur le bouton «Add/Edit citation»
    Zotero ouvre alors une fenêtre dans laquelle vous pourrez saisir un ou plusieurs termes (nom d’auteur, titre, mot-clé...) permettant de sélectionner la référence à insérer.
  • Créer un groupe vous permet de partager des références bibliographiques avec d’autres utilisateurs de Zotero. Pour pouvoir utiliser la fonction «Zotero Groups», chaque membre doit disposer d’un compte en ligne individuel. Pour créer un nouveau groupe, cliquez sur le bouton «Nouvelle bibliothèque » puis «Nouveau groupe » dans la
    barre d’outil de Zotero
    Zotero se connecte alors sur le site zotero.org et vous invite à entrer le login et le mot de passe de votre compte. Choisissez ensuite le nom du groupe à créer et déterminez l’accessibilité
    Public, Open Membership
    » : votre groupe est visible par tous les internautes qui peuvent le rejoindre librement.
    2.«Public, Closed Membership » : votre groupe est visible par tous les internautes, mais l’adhésion au groupe se fait sur demande ou invitation.
    3.«Private Membership » : votre groupe est visible uniquement par les membres qui le composent. L’adhésion se fait sur invitation exclusivement:
  • Un flux (ou fil) RSS («Really Simple Syndication ») est un fichier texte au format XML comprenant un titre, une description et une URL, généré à chaque nouveauté sur un site Web ou une base de donnée.
    De nombreuses bases de données et revues en ligne proposent de s’abonner à un flux RSS permettant d’enregistrer une équation de recherche, en vue de mettre en place une veille sur un sujet

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