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Quelques rappels sur la BU 
• Belle-Beille : 
— Lettres, langues, sciences, sciences humaines 
— 8h30-20h du lundi au jeudi 
— 8h30-18h le vendredi et le samedi 
• Saint-Serge : 
— Droit, économie, gestion, médecine, tourisme, patrimoine 
— 8h30-22h30 du lundi au samedi 
• Le site de la BU : http://bu.univ-angers.fr/
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Plan de la formation 
I. Trouver un document à partir d'une référence 
précise / Rappels sur la bibliographie 
II. Trouver un document sur un sujet 
— Dans le catalogue de la BU 
— Dans les bases d'articles en ligne 
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III. Evaluer ses résultats 
IV. Citer
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Trouver un document à partir 
d'une référence précise
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Dans le catalogue de la BU 
• Ce qu'on trouve dans les catalogues : 
— Une description des livres /revues présents dans la 
bibliothèque (titre, auteur, etc...) et où les trouver = c'est 
une notice 
• Ce qu'on ne trouve pas dans le catalogue : 
— Le détail ou le texte intégral de chaque article pour les 
périodiques. Recherche uniquement par titre de revue.
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Petit exercice de recherche dans le 
catalogue (1) 
Vous cherchez ces documents dans le 
catalogue de la bibliothèque... 
Biologie végétale / J-C. Laberche, Paris : Dunod, 2010 
V. Chassany, Mini-manuel de biologie végétale : cours + QCM, 
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J. Molinier, G. Ries, C. Zipfel, et B. Hohn. « Transgeneration 
Memory of Stress in Plants ». Nature 442, nᵒ 7106 (31 août 
2006) 
ALKHALFIOUI F, RENARD M, MONTRICHARD F. (2007). Unique 
properties of NADPthioredoxin reductase C in legume. J. Exp. 
Bot. 58, 969-978.
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La troncature 
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Techniques de l'Ingénieur 
• Comment y accéder ? 
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Techniques de l'Ingénieur
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Techniques de l'Ingénieur 
• La recherche avancée 
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• Visualiser et récupérer les résultats 
— Accès au sommaire, à une fiche documentaire, au 
texte intégral en format PDF
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Techniques de l'Ingénieur 
• Vous avez la recherche suivante à mener 
dans les TI : 
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engrais minéraux à base d'azote
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Web of Science 
• Onglet Bases en ligne > Biologie et santé. 
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pas toujours accès au texte intégral. Plus de 9 200 
journaux, disponibles dans plus de 45 langues. 
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Lettres. Comprend aussi les bases Index Chemicus 
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Web of Science 
• Si recherche uniquement sur Web of 
Science 
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surtout des sources en anglais) 
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Web of Science 
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Recherche dans GreenFILE 
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Recherche dans GreenFILE 
• Limiter sa recherche : 
— Encadré « Ciblez vos résultats » 
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Recherche dans GreenFILE
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Recherche dans GreenFILE 
• Dans GreenFile, vous avez à mener une 
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contamination par des métaux lourds
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PubMed 
• Advanced Search 
— Permet de combiner des critères de recherche 
• MeSH database : 
— Accès via la page d'accueil de PubMed 
— Permet de faire une recherche plus ciblée en utilisant des mots-clés précis 
— Taper un terme de recherche, cocher l'entrée qui convient, puis cliquer sur 
« Add to Search builder » puis sur « Search PubMed »
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PubMed et le NCBI 
• NCBI : National Center for Biotechnology 
Information 
— http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 
— un site de référence, propose de nombreuses banques de 
données sur la génétique du végétal. 
— De nombreuses banques de données développées par le 
NCBI (Nucleotides, Protein, PubMed, ...). 
— All databases : permet d'interroger toutes les banques 
en une seule fois. Les données d'une banque peuvent 
être reliées à celles d'une autre banque (ex : séquences 
nucléiques contenant un gène et protéines codées par 
ces gènes)
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PubMed 
• PubMed : 
— La partie « Articles » du NCBI 
— Accès préférable via le site de la BU : Bases en ligne > 
Biologie & santé > PubMed car lien vers le texte en ligne 
quand la BU est abonnée. 
— Références d'articles dans tous les domaines 
biomédicaux (biochimie, biologie...), depuis 1966 
jusqu'à aujourd'hui. 
— Recherche en anglais
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PubMed
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PubMed
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PubMed 
• Accès aux résultats : 
— Cliquer sur le titre de l'article pour avoir accès au 
résumé, aux mots-clés MeSH, aux liens 
— Puis onglet BUA+ pour obtenir le lien vers le texte en 
ligne si la BU est abonnée
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Les autres bases du NCBI 
• Possibilité de lancer une recherche sur les 
autres bases directement à partir de PubMed
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Les autres bases du NCBI 
• Quelques autres bases du NCBI : 
— BLAST : permet de repérer les similitudes entre les 
séquences en les comparant à des bases de données 
— GENE : base de données de séquences génétiques 
— Protein : bases de données de protéines 
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auxquelles appartient un organisme 
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PubMed 
• Lancez une recherche sur la production de 
protéines LEA chez les plants de riz.
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Évaluer les résultats
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Évaluer ses résultats 
• Pour une recherche sur le feu bactérien chez 
le pommier, observez les résultats sur la 
diapo suivante. 
— Classez-les selon qu'ils vous semblent pertinents ou pas à 
utiliser dans un travail de type universitaire. 
— Indiquez quels critères vous ont permis de faire votre 
choix.
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Evaluer ses résultats 
— http://www.bacteriologie.wikibis.com/feu_bacterien.php 
— http://www.cliniquedesplantes.fr/fiches/le-feu-bacterien-du-pommier/vo 
ir.html 
— http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00482385/fr/ 
— http://bu.univ-angers.fr/rechercher/description?notice=000152442 
— http://jacqueshenry.wordpress.com/2012/05/17/bonne-nouvelle-le-gene-de 
-resistance-a-erwinia-amylovora-identifie-mots-cle-feu-bacterien-strep 
tomycine-genie-genetique/ 
— http://link.springer.com/article/10.1007/s11105-011-0334-1 
— http://prodinra.inra.fr/?locale=fr#!ConsultNotice:13665
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45 
Evaluer les résultats 
• Évaluer la pertinence des résultats, en 
particulier sur le web, en appliquant quelques 
critères d'évaluation. 
— La source (l'auteur) 
— La date (création, mise à jour) 
— L'adresse Url (privilégier les .gouv.fr = site 
gouvernemental, .edu = écoles et universités, exclure 
les .com = site commercial...) 
— Les objectifs du site (commerciaux, politiques, 
polémiques....) 
— L'existence d'un comité de lecture
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Google Scholar 
•Utiliser Google Scholar http://scholar.google.fr/ 
— Recherche uniquement sur des travaux universitaires 
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— Possibilité de paramétrer Google Scholar pour que tous les 
articles en ligne auxquels la BU est abonnée apparaissent 
en lien (dans « Paramètres »)
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Citer
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Citation et plagiat 
Citer ses sources : 
— Appuie votre argumentation par des références validées 
— Respecter le droit d'auteur : pas de plagiat / de copier-coller 
— Citations : toujours mentionner l'auteur et l'ouvrage /l'article (en 
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entre guillemets. Si vous reprenez les idées en paraphrasant, citer 
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— Proposer une bibliographie à la fin de son travail – par ordre 
alphabétique d'auteur en général. Normes APA disponibles sur 
Zotero. 
— Se tester : http://prezi.com/bdhvxdlzp6o8/comment-utiliser-les-documents- 
trouves-eviter-le-plagiat/
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Zotero 
• Zotero : logiciel libre, un plugin de Mozilla Firefox 
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— Télécharger Zotero : http://www.zotero.org/ 
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•Pour créer une bibliographie : 
— Sélectionner les notices ou le fichier, clic droit, créer une 
bibliographie. Choisir ensuite le style de citation et le 
format d'enregistrement (RTF conseillé) 
• 
• + d'informations : 
— http://bu.univ-angers.fr/formation/zotero
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  • 1. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 1 FORMATION M1 BTV RECHERCHE DOCUMENTAIRE
  • 2. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 2 Quelques rappels sur la BU • Belle-Beille : — Lettres, langues, sciences, sciences humaines — 8h30-20h du lundi au jeudi — 8h30-18h le vendredi et le samedi • Saint-Serge : — Droit, économie, gestion, médecine, tourisme, patrimoine — 8h30-22h30 du lundi au samedi • Le site de la BU : http://bu.univ-angers.fr/
  • 3. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 3 Plan de la formation I. Trouver un document à partir d'une référence précise / Rappels sur la bibliographie II. Trouver un document sur un sujet — Dans le catalogue de la BU — Dans les bases d'articles en ligne — Sur le web III. Evaluer ses résultats IV. Citer
  • 4. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 4 Trouver un document à partir d'une référence précise
  • 5. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 5 Dans le catalogue de la BU • Ce qu'on trouve dans les catalogues : — Une description des livres /revues présents dans la bibliothèque (titre, auteur, etc...) et où les trouver = c'est une notice • Ce qu'on ne trouve pas dans le catalogue : — Le détail ou le texte intégral de chaque article pour les périodiques. Recherche uniquement par titre de revue.
  • 6. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 6 Petit exercice de recherche dans le catalogue (1) Vous cherchez ces documents dans le catalogue de la bibliothèque... Biologie végétale / J-C. Laberche, Paris : Dunod, 2010 V. Chassany, Mini-manuel de biologie végétale : cours + QCM, Paris : Dunod, 2014. J. Molinier, G. Ries, C. Zipfel, et B. Hohn. « Transgeneration Memory of Stress in Plants ». Nature 442, nᵒ 7106 (31 août 2006) ALKHALFIOUI F, RENARD M, MONTRICHARD F. (2007). Unique properties of NADPthioredoxin reductase C in legume. J. Exp. Bot. 58, 969-978.
  • 7. > Filtre permettant de limiter la recherche aux revues 28/11/14 Service commun de la documentation 7 Chercher une revue / un article > Des revues sous forme papier et /ou en ligne
  • 8. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 8 Aller plus loin... • La BU possède-t-elle ces documents ? Comment les trouver ? — Soyer, Jessica, sous la direction de Christophe Bertsch. « Caracterisation de la regulation de l’expression des genes codant des effecteurs chez Leptosphaeria maculans ». Université de Haute-Alsace, 2013. — Kawamura, Koji, et al. « Kernel methods for phenotyping complex plant architecture » (mai 2013).
  • 9. 28/11/14 Service commun de la documentation 9 Le Sudoc > C'est un catalogue qui permet de trouver les notices des ouvrages présents dans toutes les BU de France. - Pour trouver une référence - Pour faire une demande de PEB > Préférez la recherche avancée
  • 10. 28/11/14 Service commun de la documentation 10 Le Sudoc
  • 11. 28/11/14 Service commun de la documentation 11 Archives Ouvertes • Pour rechercher une référence précise qu'on ne trouve pas dans les catalogues : — On peut utiliser Google ou Google Scholar pour la localiser — Certains documents peuvent se trouver sur des Archives Ouvertes ( articles de recherche sur des plates-formes à la disposition de tous sur le web)
  • 12. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 12 Trouver un document sur un sujet dans un catalogue
  • 13. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 13 Chercher des documents sur un sujet • Pour commencer une recherche : — Wikipedia, encyclopédie collaborative en ligne Pour prendre connaissance d'un sujet, mais vérifier la fiabilité des informations (historique, bandeaux d'avertissement, comparer avec d'autres sources, aller voir les sources primaires) — Encyclopédies, manuels
  • 14. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 14 Chercher par sujet à la BU • Vous cherchez, dans le catalogue, des documents sur les processus de transgénèse végétale. • Vous cherchez des documents sur les bio-agresseurs des végétaux.
  • 15. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 15 Les rebonds dans le catalogue
  • 16. semences 28/11/14 Service Commun de la Documentation 16 Quelques astuces de recherche •« Tous les mots suivants» : ET (correspond aux 2 critères). = documents sur les céréale semences de céréales s •« Cette expression exacte » : recherche non pas une combinaison de termes mais une expression exacte (ex : « développement durable »)
  • 17. semences graines 28/11/14 Service Commun de la Documentation 17 Quelques astuces de recherche •« Au moins un des mots suivants » : OU (correspond à au moins un des critères, élargit la recherche) = documents comprenant le mot semences, ou graines, ou les 2 •« Aucun des mots suivants » : SAUF (exclut un critère, restreint la recherche) semences céréales = documents sur les semences mais pas de céréales
  • 18. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 18 La troncature • La troncature : Taper * pour remplacer une ou plusieurs lettres d'un mot — Permet de faire une recherche large (ex : végéta* cherche végétal, végétaux, végétation, végétalisé...) ou si on hésite sur l'orthographe d'un mot
  • 19. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 19 Trouver des références d'articles sur un sujet
  • 20. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 20 Techniques de l'Ingénieur • Comment y accéder ? — Onglet Bases de données > Technologie — LA base de références sur les sciences de l'ingénieur, des références sur les bioprocédés (notamment chimiques) et l'environnement • Tutoriel vidéo : — Cliquer sur le + en face du nom de la base, puis sur « Tutoriel vidéo »
  • 21. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 21 Techniques de l'Ingénieur
  • 22. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 22 Techniques de l'Ingénieur • La recherche avancée — Utiliser les opérateurs booléens — Sélectionner une thématique ou une base — Trier par date, nom d'auteur, mots clés... • Visualiser et récupérer les résultats — Accès au sommaire, à une fiche documentaire, au texte intégral en format PDF
  • 23. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 23 Techniques de l'Ingénieur • Vous avez la recherche suivante à mener dans les TI : — Vous faites une recherche sur l'utilisation des engrais minéraux à base d'azote
  • 24. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 24 Web of Science • Onglet Bases en ligne > Biologie et santé. W.O.K. donne accès à : — Web of science : Base de données bibliographiques, pas toujours accès au texte intégral. Plus de 9 200 journaux, disponibles dans plus de 45 langues. Domaines : sciences, sciences sociales, Arts et Lettres. Comprend aussi les bases Index Chemicus et Conference proceedings — Medline — Journal of citation reports
  • 25. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 25 Web of Science • Si recherche uniquement sur Web of Science — Cliquer sur « Select a database » ou sur onglet « Web of science » • Langue d'interrogation : anglais (et surtout des sources en anglais) • Tutoriel vidéo : — Cliquer sur le + en face du nom de la base, puis sur « Tutoriel vidéo »
  • 26. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 26 Web of Science • Affiner la recherche / étudier les résultats: — Refine results pour restreindre la recherche — Analyze results : Permet de repérer des auteurs, des institutions ou des journaux par rapport à une problématique. — Create citation report : tableau statistique des citations (combien de fois un article est cité, et par qui) • Visualiser les résultats — Bouton BUA + : texte intégral ou services complémentaires
  • 27. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 27 Exercice d'application • Exercice d'application : (pensez à traduire les termes de recherche en anglais) — Cherchez des articles sur les traitements fongicides de la tavelure du pommier utilisables en agriculture biologique.
  • 28. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 28 GreenFILE • Pour y accéder : — Onglet Bases en ligne > Biologie et santé • Des références bibliographiques : — Sur tout ce qui concerne l'environnement et l'écologie, avec des ramifications vers le droit, la santé... — avec pour la plupart un résumé. Souvent accès au texte intégral mais pas toujours.
  • 29. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 29 Recherche dans GreenFILE • Recherche en anglais • Utiliser la recherche avancée (apparaît par défaut) — Opérateurs booléens AND / OR / NOT — Champs de recherche : ALL TXT pour une recherche générale, SUBJECTS TERMS pour un mot-clé sujet.
  • 30. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 30 Recherche dans GreenFILE • Limiter sa recherche : — Encadré « Ciblez vos résultats » — « Options de recherche » pour affiner davantage • Utilisation de l'index et du thesaurus : — Pour vérifier ses termes de recherche
  • 31. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 31 Recherche dans GreenFILE
  • 32. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 32 Recherche dans GreenFILE • Dans GreenFile, vous avez à mener une recherche sur le thème suivant (pensez à traduire vos termes de recherche en anglais) : — Les réactions adaptatives des plantes à la contamination par des métaux lourds
  • 33. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 33 PubMed • Advanced Search — Permet de combiner des critères de recherche • MeSH database : — Accès via la page d'accueil de PubMed — Permet de faire une recherche plus ciblée en utilisant des mots-clés précis — Taper un terme de recherche, cocher l'entrée qui convient, puis cliquer sur « Add to Search builder » puis sur « Search PubMed »
  • 34. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 34 PubMed et le NCBI • NCBI : National Center for Biotechnology Information — http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ — un site de référence, propose de nombreuses banques de données sur la génétique du végétal. — De nombreuses banques de données développées par le NCBI (Nucleotides, Protein, PubMed, ...). — All databases : permet d'interroger toutes les banques en une seule fois. Les données d'une banque peuvent être reliées à celles d'une autre banque (ex : séquences nucléiques contenant un gène et protéines codées par ces gènes)
  • 35. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 35 PubMed • PubMed : — La partie « Articles » du NCBI — Accès préférable via le site de la BU : Bases en ligne > Biologie & santé > PubMed car lien vers le texte en ligne quand la BU est abonnée. — Références d'articles dans tous les domaines biomédicaux (biochimie, biologie...), depuis 1966 jusqu'à aujourd'hui. — Recherche en anglais
  • 36. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 36 PubMed
  • 37. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 37 PubMed
  • 38. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 38 PubMed • Accès aux résultats : — Cliquer sur le titre de l'article pour avoir accès au résumé, aux mots-clés MeSH, aux liens — Puis onglet BUA+ pour obtenir le lien vers le texte en ligne si la BU est abonnée
  • 39. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 39 Les autres bases du NCBI • Possibilité de lancer une recherche sur les autres bases directement à partir de PubMed
  • 40. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 40 Les autres bases du NCBI • Quelques autres bases du NCBI : — BLAST : permet de repérer les similitudes entre les séquences en les comparant à des bases de données — GENE : base de données de séquences génétiques — Protein : bases de données de protéines — Taxonomy : permet de retrouver les catégories auxquelles appartient un organisme — Et beaucoup d'autres...
  • 41. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 41 PubMed • Lancez une recherche sur la production de protéines LEA chez les plants de riz.
  • 42. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 42 Évaluer les résultats
  • 43. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 43 Évaluer ses résultats • Pour une recherche sur le feu bactérien chez le pommier, observez les résultats sur la diapo suivante. — Classez-les selon qu'ils vous semblent pertinents ou pas à utiliser dans un travail de type universitaire. — Indiquez quels critères vous ont permis de faire votre choix.
  • 44. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 44 Evaluer ses résultats — http://www.bacteriologie.wikibis.com/feu_bacterien.php — http://www.cliniquedesplantes.fr/fiches/le-feu-bacterien-du-pommier/vo ir.html — http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00482385/fr/ — http://bu.univ-angers.fr/rechercher/description?notice=000152442 — http://jacqueshenry.wordpress.com/2012/05/17/bonne-nouvelle-le-gene-de -resistance-a-erwinia-amylovora-identifie-mots-cle-feu-bacterien-strep tomycine-genie-genetique/ — http://link.springer.com/article/10.1007/s11105-011-0334-1 — http://prodinra.inra.fr/?locale=fr#!ConsultNotice:13665
  • 45. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 45 Evaluer les résultats • Évaluer la pertinence des résultats, en particulier sur le web, en appliquant quelques critères d'évaluation. — La source (l'auteur) — La date (création, mise à jour) — L'adresse Url (privilégier les .gouv.fr = site gouvernemental, .edu = écoles et universités, exclure les .com = site commercial...) — Les objectifs du site (commerciaux, politiques, polémiques....) — L'existence d'un comité de lecture
  • 46. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 46 Google Scholar •Utiliser Google Scholar http://scholar.google.fr/ — Recherche uniquement sur des travaux universitaires — Utiliser la recherche avancée — Possibilité de paramétrer Google Scholar pour que tous les articles en ligne auxquels la BU est abonnée apparaissent en lien (dans « Paramètres »)
  • 47. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 47 Citer
  • 48. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 48 Citation et plagiat Citer ses sources : — Appuie votre argumentation par des références validées — Respecter le droit d'auteur : pas de plagiat / de copier-coller — Citations : toujours mentionner l'auteur et l'ouvrage /l'article (en note, par ex). Si vous reprenez une phrase à l'identique, la mettre entre guillemets. Si vous reprenez les idées en paraphrasant, citer la source également. — Proposer une bibliographie à la fin de son travail – par ordre alphabétique d'auteur en général. Normes APA disponibles sur Zotero. — Se tester : http://prezi.com/bdhvxdlzp6o8/comment-utiliser-les-documents- trouves-eviter-le-plagiat/
  • 49. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 49 Zotero • Zotero : logiciel libre, un plugin de Mozilla Firefox — Enregistrer toujours sur la même machine, ou créez-vous un compte — Télécharger Zotero : http://www.zotero.org/ — Importer des références : icône dans la barre d'adresses ou manuellement — Possibilité d'organiser ses références par fichiers, d'y ajouter des mots-clés (marqueurs), des notes... — Possibilité d'intégrer un plugin directement dans votre traitement de texte pour y intégrer des notes : http://www.zotero.org/support/word_processor_plugin_installation_for_zotero_2.1
  • 50. Cliquer sur l'icône pour enregistrer la référence 28/11/14 Service Commun de la Documentation 50 Zotero Possibilité de classer sa bibliothèque par fichiers
  • 51. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 51 Zotero Capturer page courante
  • 52. 28/11/14 Service Commun de la Documentation 52 Zotero •Pour créer une bibliographie : — Sélectionner les notices ou le fichier, clic droit, créer une bibliographie. Choisir ensuite le style de citation et le format d'enregistrement (RTF conseillé) • • + d'informations : — http://bu.univ-angers.fr/formation/zotero
  • 53. Pour retrouver la présentation 28/11/14 Service Commun de la Documentation 53 Vous pouvez retrouver cette présentation en ligne :