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GBIF Jeudist IRD_20190418

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Le GBIF (Système Mondial d'Information sur la Biodiversité) est un programme international, fondé à l’initiative de l’OCDE en 2001, dont le but est l'accès libre et ouvert aux données de biodiversité.
A ce jour, plus d'un milliard de données sont disponibles et téléchargeables librement via le portail GBIF.
Outre le portail et ses outils, les activités du point nodal français et ses actions au Sud ont été présentées jeudi 18/05/2019 à Montpellier dans le cadre des Jeud'IST de l'IRD par Eric Chenin.
Eric Chenin (IRD) est impliqué dans le GBIF depuis 2003 : créateur du point nodal France en 2006, responsable du GBIF France jusqu'en 2013, chef de la délégation française au Conseil d'Administration.

Publié dans : Sciences
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GBIF Jeudist IRD_20190418

  1. 1. GBIF (Global Biodiversity Information Facility) gbif@gbif.fr www.gbif.org / www.gbif.fr
  2. 2. Qu’est-ce que le GBIF ? Fonctionnement portail Focus France Avantages publier données
  3. 3. Qu’est-ce que le GBIF ?
  4. 4. Qu’est‐ce que le GBIF? • Coopération intergouvernementale • Fondé en 2001, recommandation OCDE • Grand équipement mondial, « CERN biodiversité » : • Observatoire mondial impossible • Accès données existantes possible • Promeut et facilite l’accès libre et ouvert aux données sur la biodiversité • 59 pays participants, 38 organisations • Secrétariat basé à Copenhague coordonne réseau et infrastructure informatique globale
  5. 5. Map of GBIF Country Participants 97  participants : 38 organisations : associations, ONGs, consortiums…59 pays &
  6. 6. Toutes les données sur la biodiversité reliées via le GBIF Référentiel taxonomique Nom scientifique Scien….. name Scien….. name Scien….. name Scien….. name Scien….. name Scien….. name Scien….. name Génétique Ethnobotanique Ecosystème Physiologie Interaction Interspécifique Bois Statut IUCN Agronomie Pathogène / hôte / vecteur Traits fonctionnels Anatomie Niche Ecol.
  7. 7. • Référentiel taxonomique • Occurrences • Echantillonnage • … Traits fonctionnels Types de données partagées via le GBIF
  8. 8. Enquêtes de terrain, suivi, états des lieux, études impact Muséums, herbiers collections Observations de science citoyenne Données tirées de la littérature Types de données partagées via le GBIF
  9. 9. GBIF EN CHIFFRES 1.301.136.208 occurrences 43.956 jeux de données 1.389 institutions 3.595 articles comité lecture • http://www.gbif.org  | 06 JUN 2016
  10. 10. Données par pays participant Nombre total ‘occurrences publiées — 10 premiers pays (au 7 Avril 2019) 1. Etats-Unis 482.632.243 6. Pays-Bas 57.755.600 2. Royaume Uni 99.231.355 7. Allemagne 46,830.680 3. Suède 82.833.551 8. Norvège 32.694.164 4. Australie 81.639.181 9. Espagne 30.923.698 5. France 65.632.902 10. Danemark 30.369.327
  11. 11. www.gbif.org
  12. 12. www.gbif.org
  13. 13. Exemples d’utilisation selon les cibles d’Aichi
  14. 14. GBIF & CBD : aide à mettre en oeuvre le  plan stratégique 2011‐2020 pour la  biodiversité  => Cibles d’Aichi Connaissance améliorée, partagée et appliquée Extinction évitée Aires protégées augmentées et améliorées Espèces envahissantes contrôlées
  15. 15. 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600 650 700 Occurrences (millions) Données publiées via GBIF.org
  16. 16. 200 300 400 500 600 700 800 900 Fournisseurs de données Nombre d’institutions enregistrées comme fournisseurs de données via le GBIF
  17. 17. Cas en santé publique : pathologies et vecteurs  moustique tigre (Aedes Albopictus)
  18. 18. Aedes albopictus Skuse, 1894
  19. 19. Cas en santé publique : pathologies et vecteurs  moustique tigre (Aedes Albopictus)
  20. 20. Cas en santé publique : pathologies et vecteurs  moustique tigre (Aedes Albopictus)
  21. 21. Cas en santé publique : pathologies et vecteurs  moustique tigre (Aedes Albopictus)
  22. 22. Les données aident à établir les priorités pour les nouvelles aires protégées, en s’appuyant sur la prédiction des distributions d’espèces Soutien à la migration, Création de  corridors biologiques Aires marines protégées (toutes catégories) dans les eaux Françaises
  23. 23. Inscription GBIF contexte international 1. Biodiversity Indicators Partnership (BIP): partner 2. Encyclopedia of Life (EOL): council 3. Eye on Earth Biodiversity Special Initiative: partner 4. Global Genome Biodiversity Network (GGBN): steering committee member 5. Global Invasive Alien Species Information Partnership (GIASIP): partner 6. Global Partnership for Plant Conservation (GPPC): partner 7. Group on Earth Observations (GEO): participant 8. Group on Earth Observations Biodiversity Observation Network (GEO-BON): steering committee member 9. European Biodiversity Observation Network (EU BON): participant 10. LifeWatch Policy & Science Board: member 11. Convention on Biological Diversity (CBD): observer 12. Intergovernmental Platform on Biodiversity & Ecosystem Services (IPBES): observer 13. Biodiversity Knowledge Network for the European Union (KNEU): member of dialogue group. 14. Convention on Migratory Species Strategic Plan Working Group: observer
  24. 24. Support plan ODD Engagements Biodiversité Evaluations Biodiversité Modèles Biodiversité Données Biodiversité
  25. 25. 1. Sensibilisation & formation : décideurs, opérateurs privés et publics, entreprises 2. Entreprises (impactant ou exploitant) : données pour : atténuation impact, restauration, compensation, identification et sécurisation ressource, exploitation durable 3. Opérateurs (gestion ou réglementation) : données pour : lutte contre envahissantes ; conception, gestion, éval. aires protégées ; réglementation accès, exploit. 4. Concertation nationale ou régionale politique biodiversité 5. Organiser réseaux nationaux biodiversité 6. Combler manques : identifier manques et priorités selon enjeux : envahissantes, évaluation changement climatique et impact, services écosystémiques, EBV 7. FAIR GBIF & Développement Sud
  26. 26. Portail GBIF
  27. 27. GBIF on Brazil and Amazon
  28. 28. GBIF on Brazil and Amazon
  29. 29. GBIF on Brazil and Amazon
  30. 30. GBIF on Brazil and Amazon
  31. 31. GBIF on Brazil and Amazon
  32. 32. GBIF on Brazil and Amazon
  33. 33. GBIF on Brazil and Amazon
  34. 34. GBIF on Brazil and Amazon
  35. 35. GBIF on Brazil and Amazon
  36. 36. GBIF on Brazil and Amazon
  37. 37. GBIF Qualité, biais, manques
  38. 38. Qualité des données : détection des  erreurs de géoréférencement Avant 2011 En 2011 Depuis 2013
  39. 39. Priorité 3 – Combler les manques de données
  40. 40. GBIF France
  41. 41. Living Atlases community Community https://living-atlases.gbif.org living-atlases.gbif.org
  42. 42. D’où viennent les données ? And even more…. Associations and conservatories collections Research Institutes Universities Herbiers universitaires de Clermont-Ferrand Agregators
  43. 43. Programme de Renforcement  des capacités  (CESP GBIF) 2016-2017: Guinée 2010-2011 2018-2019: Togo 2011-2012: Centrafrique – GBIF Cameroun et GBIF France 2015-2016: Madagascar2017-2018: Bénin 2018-2019: Bénin-Nigéria
  44. 44. Plateforme de e-learning Plateforme e-learning
  45. 45. Data papers Une incitation à la publication des  données de biodiversité
  46. 46. Data Paper : qu’est‐ce que c’est? Une publication scientifique dont le but principal est de décrire un ensemble de données ou un groupe d'ensembles de données, plutôt que de rendre compte d’analyses et de résultats de recherche.
  47. 47. Une proposition concrète récente Depuis le développement des BD et des projets  d’informatisation, la mauvaise valorisation du  temps passé à informatiser des données et des  connaissances est dénoncée par les scientifiques . => Une réflexion conjointe du GBIF et de l’éditeur de revues PENSOFT a abouti à une proposition en 2011 :  Le Data Paper
  48. 48. Data Paper : avantages Reconnaissance des éditeurs de données via une publication scientifique Décrit les données sous forme structurée et lisible par un humain Promouvoir et faire connaître les données DOI : indexation et citation - indexés par Web of Knowledge (ISI), PubMedCentral, Scopus, Zoological Record, Google Scholar, CAB Abstracts, DOAJ, EBSCO.
  49. 49. Pages Jeux de données
  50. 50. GBIF (Global Biodiversity Information Facility) gbif@gbif.fr www.gbif.org / www.gbif.fr

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