GENOMIC FEATURES AND INSIGHTS INTO THE BIOLOGY OF MYCOPLASMA MELEAGRIDIS AND MYCOPLASMA GALLINARUM THROUGH COMPARATIVE GENOMIC ANALYSIS WITH OTHER AVIAN MYCOPLASMAS Communication de Elhem Yacoub, doctorante à l''IPT, Colloque Jeunes Chercheurs de l'IPT (8-9 décembre 2016) Introduction and objectives: Mycoplasma meleagridis and Mycoplasma gallinarum are avian mycoplasma species often ignored and underestimated. We have previously reported that M. meleagridis has broken the barrier of its turkey specific host since it was isolated from chicken. As for M. gallinarum, usually considered avirulent, a pathogenic role was attributed to some of its strains. Few genomic data are hitherto available for these avian mycoplasmas and little is known regarding their host range and virulence determinants. By sequencing two Tunisian field strains of M. meleagridis (MM_26B8_IPT) and M. gallinarum (Mgn_IPT), isolated from chickens, and by comparison of their genomic sequences with those of M. meleagridis ATCC strain (MM_ATCC) and six other avian mycoplasmas, we attempted to unravel the genetic factors ruling M. meleagridis transfer from turkey to chicken and to determine the pathogenicity potential of M. gallinarum in chicken. Materials and Methods: Genome sequencing of the three strains was achieved using MiSeq sequencer (Illumina). De novo assembly was performed using CLC and ABySS softwares. Automatic annotation was fulfilled by Rapid Annotation Subsystem Technology (RAST) and improved by additional manual inspection. Genomic analysis was achieved using tools available in RAST and Molligen databases. Results: M. meleagridis inter-strains whole genome comparison revealed that host transfer from turkey to chicken is probably generated by genomic differences consisting in new DNA acquisition from Bacillus coagulans and repetition of existing DNA, detected in MM_26B8_IPT. These differences, which their sequence size is about 24 kb, have probably changed the proteomic landscape structure of M. meleagridis field strain and allowed it to conquer a new host environment. Comparative genomic analyses based on virulence factors have shown that MM_ATCC, MM_26B8_IPT, and Mgn_IPT are not armed with adhesins and hemagglutinins as the most virulent avian mycoplasmas. It seems that they are rather relying on nucleases and proteases to be harmful. Interestingly, Mgn_IPT was found to harbor additional genetic determinants such as transposases, licD and lpd genes for which the involvement in virulence was previously reported and proved. Conclusion: Overall, this genomic comparative study had advanced biological knowledge

1. Caractéristiques biologiques
de Mycoplasma meleagridis
et Mycoplasma gallinarum
à travers des analyses génomiques
comparatives
Elhem YACOUB
Pr. Boutheina MARDASSI
Présenté par :
Encadré par :
Colloque Jeunes Chercheurs – 08 et 09 Décembre 2016

2. Les mycoplasmes
 Sont ni des virus ni des champignons
 Sont des BACTÉRIES
 Ubiquitaires, infectant l’homme,
les animaux, les insectes, les plantes …
x x

3. Mycoplasma meleagridis
Mycoplasma gallinarum
Deux mycoplasmes aviaires
 Sous-estimation de la prévalence des infections
 Études limitées aux aspects phénotypique et antigénique
 Manque / absence de séquences génomiques
Les mycoplasmes d’intérêt

4. Historique & problématique
output

5. Poule
Isolement atypique d’une
dizaine de souches locales de
Mycoplasma meleagridis
dans un élevage de poules
montrant des signes cliniques
Hôte inhabituel
Historique & problématique

6. Dinde
Poule
Isolement atypique d’une
dizaine de souches locales de
Mycoplasma meleagridis
dans un élevage de poules
montrant des signes cliniques
Hôte inhabituelHôte principal
Souche de référence de
Mycoplasma meleagridis
Historique & problématique

7. Facteurs et circonstances de ce
changement d’hôte
Dinde
Poule
Isolement atypique d’une
dizaine de souches locales de
Mycoplasma meleagridis
dans un élevage de poules
montrant des signes cliniques
Hôte inhabituelHôte principal
Souche de référence de
Mycoplasma meleagridis
Historique & problématique

8. Facteurs et circonstances de ce
changement d’hôte
Dinde
Poule
Isolement atypique d’une
dizaine de souches locales de
Mycoplasma meleagridis
dans un élevage de poules
montrant des signes cliniques
Hôte inhabituelHôte principal
Isolement d’une souche de
Mycoplasma gallinarum
Souche de référence de
Mycoplasma meleagridis
Historique & problématique

9. Facteurs et circonstances de ce
changement d’hôte
Dinde
Poule
Isolement atypique d’une
dizaine de souches locales de
Mycoplasma meleagridis
dans un élevage de poules
montrant des signes cliniques
Hôte inhabituelHôte principal
 Large spectre d’hôtes
 Apathogénie vs Pathogénie
Isolement d’une souche de
Mycoplasma gallinarum
Souche de référence de
Mycoplasma meleagridis
Historique & problématique

10. Facteurs et circonstances de ce
changement d’hôte
Dinde
Poule
Isolement atypique d’une
dizaine de souches locales de
Mycoplasma meleagridis
dans un élevage de poules
montrant des signes cliniques
Hôte inhabituelHôte principal
 Large spectre d’hôtes
 Apathogénie vs Pathogénie
Isolement d’une souche de
Mycoplasma gallinarum
Souche de référence de
Mycoplasma meleagridis
Historique & problématique
Degré d’incrimination dans la pathologie ??

11. Poule
Isolement atypique d’une
dizaine de souches locales de
Mycoplasma meleagridis
dans un élevage de poules
montrant des signes cliniques
Isolement d’une souche de
Mycoplasma gallinarum
Historique & problématique
Infection individuelle par le
mycoplasme aviaire
pathogène M. meleagridis
??

12. Poule
Isolement atypique d’une
dizaine de souches locales de
Mycoplasma meleagridis
dans un élevage de poules
montrant des signes cliniques
Isolement d’une souche de
Mycoplasma gallinarum
Historique & problématique
Infection individuelle par le
mycoplasme aviaire
pathogène M. meleagridis
??
Résultante de l’infection
mixte par les deux
mycoplasmes ensemble
??

13. Compréhension de la biologie de
M. meleagridis et de M. gallinarum
et la caractérisation générale
de leurs génomes
Objectif principal

14. Objectif principal
 Démêlage des facteurs génétiques gouvernant
le changement d’hôte de M. meleagridis
 Détermination du vrai potentiel pathogénique
de M. gallinarum
Objectifs ciblés

15. Analyse génomique comparative
M. synoviae
Isolat de terrain MS53
M. anatis
Souche de référence 1340, ATCC 25524
M. iwoae
Souche de référence 695, ATCC 33552
M. gallisepticum
3 isolats de terrain: Rhigh, Rlow, F
M. meleagridis
Souche de référence ATCC 25294 (dinde)
Isolat de terrain MM_26B8_IPT (poule)
M. gallinarum
Isolat de terrain Mgn_IPT (poule)
9 souches de
mycoplasmes aviaires
3
souches
6
souchesv
v
v

16. Analyse génomique comparative
M. synoviae
Isolat de terrain MS53
M. anatis
Souche de référence 1340, ATCC 25524
M. iwoae
Souche de référence 695, ATCC 33552
M. gallisepticum
3 isolats de terrain: Rhigh, Rlow, F
M. meleagridis
Souche de référence ATCC 25294 (dinde)
Isolat de terrain MM_26B8_IPT (poule)
M. gallinarum
Isolat de terrain Mgn_IPT (poule)
9 souches de
mycoplasmes aviaires
3
souches
6
souchesv
v

17. Analyse génomique comparative
M. synoviae
Isolat de terrain MS53
M. anatis
Souche de référence 1340, ATCC 25524
M. iwoae
Souche de référence 695, ATCC 33552
M. gallisepticum
3 isolats de terrain: Rhigh, Rlow, F
M. meleagridis
Souche de référence ATCC 25294 (dinde)
Isolat de terrain MM_26B8_IPT (poule)
M. gallinarum
Isolat de terrain Mgn_IPT (poule)
9 souches de
mycoplasmes aviaires
3
souches
6
souchesv
v

18. Analyse génomique comparative
M. synoviae
Isolat de terrain MS53
M. anatis
Souche de référence 1340, ATCC 25524
M. iwoae
Souche de référence 695, ATCC 33552
M. gallisepticum
3 isolats de terrain: Rhigh, Rlow, F
M. meleagridis
Souche de référence ATCC 25294 (dinde)
Isolat de terrain MM_26B8_IPT (poule)
M. gallinarum
Isolat de terrain Mgn_IPT (poule)
9 souches de
mycoplasmes aviaires
3
souches
6
souches
v

19. Analyse génomique comparative
M. synoviae
Isolat de terrain MS53
M. anatis
Souche de référence 1340, ATCC 25524
M. iwoae
Souche de référence 695, ATCC 33552
M. gallisepticum
3 isolats de terrain: Rhigh, Rlow, F
M. meleagridis
Souche de référence ATCC 25294 (dinde)
Isolat de terrain MM_26B8_IPT (poule)
M. gallinarum
Isolat de terrain Mgn_IPT (poule)
9 souches de
mycoplasmes aviaires
3
souches
6
souches

20. Méthodologie
Méthode classique phénol/chloroforme
Bonne qualité
Quantité suffisante
Clonage: homogéniésation / Ø Contamination

21. Méthodologie
Méthode classique phénol/chloroforme
Bonne qualité
Quantité suffisante
Clonage: homogéniésation / Ø Contamination
Centre de Génomique
Fonctionnelle - Bordeaux (cgfb)
Séquenceur: Illumina Miseq
Type: Paired-end et Mate-pair

22. Méthodologie
Méthode classique phénol/chloroforme
Bonne qualité
Quantité suffisante
Clonage: homogéniésation / Ø Contamination
Centre de Génomique
Fonctionnelle - Bordeaux (cgfb)
Séquenceur: Illumina Miseq
Type: Paired-end et Mate-pair
Centre de Bioninformatique de Bordeaux (CBiB)
Logiciels utilisés: CLC et ABySS
Serveur utilisé: RAST/SEED
Vérification manuelle
Outils dans les bases de données: RAST/SEED,
Molligen, NCBI
Autres logiciels: Bioedit/PSIPRED/VISTA/MBGD …

23. Résultats

24. Partie 1
Analyse génomique
comparative entre nos 3 souches
de mycoplasmes aviaires
Résultats

25. Génomes des 3 souches de
mycoplasmes aviaires
67 scaffolds32 scaffolds7 scaffolds

26. Génomes des 3 souches de
mycoplasmes aviaires
67 scaffolds32 scaffolds7 scaffolds

27. Génomes des 3 souches de
mycoplasmes aviaires
67 scaffolds32 scaffolds7 scaffolds

28. M. meleagridis M. gallinarum
Souche Référence
17529 (ATCC 25294)
Isolat
MM_26B8_IPT
Ioslat
Mgn_IPT
Numéro d’accès JZXN00000000 LVWO00000000 LVLH00000000
Hôte Dinde Poule Poule
Groupe
phylogénétique
Hominis Hominis Hominis
Taille du génome (pb) 643,182 658,083 800,663
Nombre de scaffolds 27 32 67
Taux en GC (%) 25,02 26,30 26,05
CDSs 505 539 601
Codage (%) 91,94 90,44 87,40
Taille moyenne des
protéines (aa)
376 374 386
ARNr 4 3 2
ARNt 32 33 33
Caractéristiques génomiques
de nos 3 souches de mycoplasmes aviaires

29. M. meleagridis M. gallinarum
Souche Référence
17529 (ATCC 25294)
Isolat
MM_26B8_IPT
Ioslat
Mgn_IPT
Numéro d’accès JZXN00000000 LVWO00000000 LVLH00000000
Hôte Dinde Poule Poule
Groupe
phylogénétique
Hominis Hominis Hominis
Taille du génome (pb) 643,182 658,083 800,663
Nombre de scaffolds 27 32 67
Taux en GC (%) 25,02 26,30 26,05
CDSs 505 539 601
Codage (%) 91,94 90,44 87,40
Taille moyenne des
protéines (aa)
376 374 386
ARNr 4 3 2
ARNt 32 33 33
Caractéristiques génomiques
de nos 3 souches de mycoplasmes aviaires

30. Comparaison de la distribution
des fonctions des CDSs chez nos 3 souches
de mycoplasmes aviaires
MM_ATCC MM_26B8_IPT Mgn_IPT

31. Statistique de l’annotation
MM
26B8_IPT
Mgn_IPT
MM
ATCC 25294

32. 109
161
110
Métabolisme des protéines
MM
26B8_IPT
Mgn_IPT
MM
ATCC 25294

33. 43
59
42
109
161
110
Métabolisme de l’ADN
MM
26B8_IPT
Mgn_IPT
MM
ATCC 25294

34. 27
40
42
109
161
110
43
59
42
MM
26B8_IPT
Mgn_IPT
MM
ATCC 25294
Métabolisme de l’ARN

35. Métabolisme du glucose
109
161
110
43
59
42
44
26
26
MM
26B8_IPT
Mgn_IPT
MM
ATCC 25294
27
40
42
!!!

36. M. meleagridis et M. gallinarum sont deux espèces qui
hydrolysent l’arginine pour générer de l’énergie (ATP)

37. M. meleagridis et M. gallinarum sont deux espèces qui
hydrolysent l’arginine pour générer de l’énergie (ATP)
arcA
arcC
Perméase
Carbamate kinase
Arginine déiminase
Ornithine carbamoyl transférase
arcB

38. Comparaison de le synténie du locus de l’opéron
arcABC entre nos trois souches
de mycoplasmes aviaires
arcA arcB arcC perméase

39. Comparaison de le synténie du locus de l’opéron
arcABC entre nos trois souches
de mycoplasmes aviaires
arcA arcB arcC perméase

40. RecD-like DNA
helicase
Chromosomal replication
initiator protein
DNA polymerase III
beta subunit
Nos
souches
c
Comparaison de le synténie du locus de l’origine de
réplication entre les mycoplasmes aviaires

41. Nos
souches
Comparaison de le synténie du locus de l’origine de
réplication entre les mycoplasmes aviaires
OriC

42. Nos
souches
Comparaison de le synténie du locus de l’origine de
réplication entre les mycoplasmes aviaires
OriC

43. Nos
souches
Comparaison de le synténie du locus de l’origine de
réplication entre les mycoplasmes aviaires
OriC

44. Nos
souches
Comparaison de le synténie du locus de l’origine de
réplication entre les mycoplasmes aviaires
OriC

45. Partie 2
Analyse génomique
comparative intra-espèce de
Mycoplasma meleagridis
(MM_ATCC v/s MM_26B8_IPT)
Résultats

46. Isolat de terrain
MM_26B8_IPT
Souche de référence
MM_ATCC
Comparaison génomique des
deux souches de Mycoplasma meleagridis

47. Comparaison génomique des
deux souches de Mycoplasma meleagridis

48. Comparaison génomique des
deux souches de Mycoplasma meleagridis
24 Kb
ADN en excès
Localisation ?
Contenu ?

49. 7 scaffolds 32 scaffolds
Comparaison génomique des
deux souches de Mycoplasma meleagridis
ADN en excès
Localisation ?
Contenu ?
24 Kb

50. Changement d’hôte de M. meleagridis
Dinde
Poule
 Acquisition d’un nouveau matériel génétique
à partir de Bacillus coagulans
 Répétition de quelques locus existant déjà chez
la souche de référence
Comparaison génomique des
deux souches de Mycoplasma meleagridis

51.  Acquisition d’un nouveau matériel génétique
à partir de Bacillus coagulans
 Répétition de quelques locus existant déjà chez
la souche de référence
Hypothèse: Il serait possible que ces différences
génomiques aient changé le profil antigénique de la
souche de terrain de M. meleagridis et lui ont permis
par conséquent de conquérir un nouvel hôte (la poule)
Comparaison génomique des
deux souches de Mycoplasma meleagridis
Changement d’hôte de M. meleagridis
Dinde
Poule

52. Analyse BDBH entre les deux souches de
Mycoplasma meleagridis
MM_ATCC
505 CDSs
MM_26B8_IPT
539 CDSs

53. Analyse BDBH entre les deux souches de
Mycoplasma meleagridis
495 CDSs
Core genome
Gènes essentiels codant pour des
protéines assurant les fonctions
indispensables pour assurer la survie
MM_ATCC
505 CDSs
MM_26B8_IPT
539 CDSs

54. Analyse BDBH entre les deux souches de
Mycoplasma meleagridis
495 CDSs
Core genome
Gènes essentiels codant pour des
protéines assurant les fonctions
indispensables pour assurer la survie
MM_ATCC
505 CDSs
MM_26B8_IPT
539 CDSs
10
CDSs spécifiques
de MM_ATCC

55. Analyse BDBH entre les deux souches de
Mycoplasma meleagridis
495 CDSs
Core genome
Gènes essentiels codant pour des
protéines assurant les fonctions
indispensables pour assurer la survie
MM_ATCC
505 CDSs
MM_26B8_IPT
539 CDSs
10
CDSs spécifiques
de MM_ATCC 44
CDSs spécifiques
de MM_26B8_IPT

56. Analyse BDBH entre les deux souches de
Mycoplasma meleagridis
495 CDSs
Core genome10
CDSs spécifiques
de MM_ATCC
Gènes essentiels codant pour des
protéines assurant les fonctions
indispensables pour assurer la survie
MM_ATCC
505 CDSs
MM_26B8_IPT
539 CDSs
28
16
Nouvelles CDSs
CDSs répétées

57. Partie 3
Comparaison des facteurs de
virulence chez les
mycoplasmes aviaires
Résultats

58. M. meleagridis M. gallinarum M. anatis M. synoviae M. iowae M. gallisepticum
ATCC
25294
Isolat
26B8_IPT
Isolat
Mgn_IPT
ATCC
1340
Isolat
53
ATCC
695
Isolat
Rlow
Isolat
RHigh
Isolat
F
Nucléases 13 13 14 19 10 12 7 14 14
Systèmes R-M 6 9 7 3 1 2 - 4 5
Protéases/Peptidases 12 12 13 17 10 16 3 23 22
NEAC
Ǝ gène nanH
Ǝ gène nanA
-
-
-
-
-
-
-
-
1
1
-
-
1
-
1
-
1
-
Cytadhésines
Ǝ gène gapA
Ǝ gène crmA
Ǝ gène plpA
Ǝ gène hlp3
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
1
1
-
-
1
1
1
1
1
1
1
1
Hémagglutinines
Ǝ gène vlhA - - - - 69 - 38 59 28
Famille des gènes licD - - 2 2 - - - - -
Voies métaboliques
Ǝ gène lpd - - 2 1 1 1 1 1 1
Transposases - - 5 12 6 5 8 18 15
Toxines - - - - - 3 - - -
Comparaison des facteurs de
virulence chez les mycoplasmes aviaires
Facteurs
de virulence
Souche

59. M. meleagridis M. gallinarum M. anatis M. synoviae M. iowae M. gallisepticum
ATCC
25294
Isolat
26B8_IPT
Isolat
Mgn_IPT
ATCC
1340
Isolat
53
ATCC
695
Isolat
Rlow
Isolat
RHigh
Isolat
F
Nucléases 13 13 14 19 10 12 7 14 14
Systèmes R-M 6 9 7 3 1 2 - 4 5
Protéases/Peptidases 12 12 13 17 10 16 3 23 22
NEAC
Ǝ gène nanH
Ǝ gène nanA
-
-
-
-
-
-
-
-
1
1
-
-
1
-
1
-
1
-
Cytadhésines
Ǝ gène gapA
Ǝ gène crmA
Ǝ gène plpA
Ǝ gène hlp3
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
1
1
-
-
1
1
1
1
1
1
1
1
Hémagglutinines
Ǝ gène vlhA - - - - 69 - 38 59 28
Famille des gènes licD - - 2 2 - - - - -
Voies métaboliques
Ǝ gène lpd - - 2 1 1 1 1 1 1
Transposases - - 5 12 6 5 8 18 15
Toxines - - - - - 3 - - -
Facteurs
de virulence
Souche
Comparaison des facteurs de
virulence chez les mycoplasmes aviaires

60. M. meleagridis M. gallinarum M. anatis M. synoviae M. iowae M. gallisepticum
ATCC
25294
Isolat
26B8_IPT
Isolat
Mgn_IPT
ATCC
1340
Isolat
53
ATCC
695
Isolat
Rlow
Isolat
RHigh
Isolat
F
Nucléases 13 13 14 19 10 12 7 14 14
Systèmes R-M 6 9 7 3 1 2 - 4 5
Protéases/Peptidases 12 12 13 17 10 16 3 23 22
NEAC
Ǝ gène nanH
Ǝ gène nanA
-
-
-
-
-
-
-
-
1
1
-
-
1
-
1
-
1
-
Cytadhésines
Ǝ gène gapA
Ǝ gène crmA
Ǝ gène plpA
Ǝ gène hlp3
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
1
1
-
-
1
1
1
1
1
1
1
1
Hémagglutinines
Ǝ gène vlhA - - - - 69 - 38 59 28
Famille des gènes licD - - 2 2 - - - - -
Voies métaboliques
Ǝ gène lpd - - 2 1 1 1 1 1 1
Transposases - - 5 12 6 5 8 18 15
Toxines - - - - - 3 - - -
Facteurs
de virulence
Souche
Comparaison des facteurs de
virulence chez les mycoplasmes aviaires

61. M. meleagridis M. gallinarum M. anatis M. synoviae M. iowae M. gallisepticum
ATCC
25294
Isolat
26B8_IPT
Isolat
Mgn_IPT
ATCC
1340
Isolat
53
ATCC
695
Isolat
Rlow
Isolat
RHigh
Isolat
F
Nucléases 13 13 14 19 10 12 7 14 14
Systèmes R-M 6 9 7 3 1 2 - 4 5
Protéases/Peptidases 12 12 13 17 10 16 3 23 22
NEAC
Ǝ gène nanH
Ǝ gène nanA
-
-
-
-
-
-
-
-
1
1
-
-
1
-
1
-
1
-
Cytadhésines
Ǝ gène gapA
Ǝ gène crmA
Ǝ gène plpA
Ǝ gène hlp3
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
1
1
-
-
1
1
1
1
1
1
1
1
Hémagglutinines
Ǝ gène vlhA - - - - 69 - 38 59 28
Famille des gènes licD - - 2 2 - - - - -
Voies métaboliques
Ǝ gène lpd - - 2 1 1 1 1 1 1
Transposases - - 5 12 6 5 8 18 15
Toxines - - - - - 3 - - -
Facteurs
de virulence
Souche
Comparaison des facteurs de
virulence chez les mycoplasmes aviaires

62. Analyse génomique comparative entre les mycoplasmes
aviaires, basée sur la recherche de facteurs de virulence
Comparaison des facteurs de
virulence chez les mycoplasmes aviaires

63. Nos trois mycoplasmes
Sont dépourvus d’adhésines et d’hémagglutinines
Il semble que leur pathogénie est plutôt assurée par la
multitude de nucléases et de protéases qu’ils contiennent
Analyse génomique comparative entre les mycoplasmes
aviaires, basée sur la recherche de facteurs de virulence
Comparaison des facteurs de
virulence chez les mycoplasmes aviaires

64. Nos trois mycoplasmes
Sont dépourvus d’adhésines et d’hémagglutinines
Il semble que leur pathogénie est plutôt assurée par la
multitude de nucléases et de protéases qu’ils contiennent
Chez Mgn_IPT
Autres gènes de virulence (lpd, licD et transposases)
Analyse génomique comparative entre les mycoplasmes
aviaires, basée sur la recherche de facteurs de virulence
Caractère apathogène de cette espèce≠ !!!
Comparaison des facteurs de
virulence chez les mycoplasmes aviaires

65. MM_ATCC
genome
MM_26B8_IPT
genome
Mgn_IPT genome
Genome Library
Participation à l’enrichissement des bases de données
internationales (GenBank, Molligen )
- La souche de référence de M. meleagridis (ATCC 25294)
- Deux isolats locaux de mycoplasmes aviaires
Conclusion

66. MM_ATCC
genome
MM_26B8_IPT
genome
Mgn_IPT genome
Genome Library
Participation à l’enrichissement des bases de données
internationales (GenBank, Molligen )
- La souche de référence de M. meleagridis (ATCC 25294)
- Deux isolats locaux de mycoplasmes aviaires
Conclusion

67. MM_ATCC
genome
MM_26B8_IPT
genome
Mgn_IPT genome
Genome Library
Participation à l’enrichissement des bases de données
internationales (GenBank, Molligen )
- La souche de référence de M. meleagridis (ATCC 25294)
- Deux isolats locaux de mycoplasmes aviaires
Conclusion

68. MM_ATCC
genome
MM_26B8_IPT
genome
Mgn_IPT genome
Genome Library
Participation à l’enrichissement des bases de données
internationales (GenBank, Molligen )
- La souche de référence de M. meleagridis (ATCC 25294)
- Deux isolats locaux de mycoplasmes aviaires
Conclusion
Avancer les connaissances biologiques sur M. meleagridis
et M. gallinarum, spécificité d’hôte et la pathogénicité

69. Perspectives
Compréhension des mécanismes des interactions
entre M. meleagridis et son nouvel hôte
Évaluation réelle du vrai potentiel pathogénique de
M. gallinarum

70. Perspectives
Compréhension des mécanismes des interactions
entre M. meleagridis et son nouvel hôte
Évaluation réelle du vrai potentiel pathogénique de
M. gallinarum

71. Perspectives
Expression et/ou la délétion des gènes
Compréhension des mécanismes des interactions
entre M. meleagridis et son nouvel hôte
Évaluation réelle du vrai potentiel pathogénique de
M. gallinarum

72. Perspectives
Passer à la
GÉNÉTIQUE FONCTIONNELLE
Expression et/ou la délétion des gènes
Compréhension des mécanismes des interactions
entre M. meleagridis et son nouvel hôte
Évaluation réelle du vrai potentiel pathogénique de
M. gallinarum

73. Les analyses génomiques comparatives basées sur la
recherche des facteurs de virulence ont montré que
MM_ATCC, MM_26B8_IPT et Mgn_IPT sont, contrairement
aux mycoplasmes aviaires les plus redoutables, dépourvus
d’adhésines et d’hémagglutinines.
Il semble que la pathogénie de ces trois souches est plutôt
assurée par la multitude de nucléases et de protéases qu’elles
contiennent.
De plus, d’autres déterminants génétiques tels que les
transposases, les gènes licD et lpd dont l’incrimination dans la
virulence est antérieurement prouvée, ont été détectés chez
Mgn_IPT. Cette trouvaille semble contrarier la littérature
souvent rapportant le caractère avirulent de cette espèce.
Merci
de votre attention