SlideShare une entreprise Scribd logo
1  sur  20
fMOST — fluorescence Mirco-Optical Sectioning
Tomography
фМОСТ — флуоресцентная Микро-Оптическая
Секционная Томография

Получение полной структуры мозга мыши с одномикронным
разрешением и трассировка аксонов по всему мозгу.
Micro-Optical Sectioning Tomography to Obtain a
High-Resolution Atlas of the Mouse Brain
Anan Li, Hui Gong, Bin Zhang, Qingdi Wang, Cheng Yan

Development of a Plastic Embedding Method for
Large-Volume and Fluorescent-ProteinExpressing Tissues
Zhongqin Yang, Bihe Hu, Yuhui Zhang, Qingming Luo, Hui Gong

Continuously tracing brain-wide long-distance
axonal projections in mice at a one-micron voxel
resolution
Hui Gong, Shaoqun Zeng, Cheng Yan, Xiaohua Lv, Zhongqin Yang
MOST — разработка метода
Пробоподготовка
●

Крашение по
Гольжи-Коксу:
K2Cr2O7

●

К2CrO4

●

●

●

HgCl2

180 дней
Пробоподготовка
●

●

●

Дегитратация
Градиент ацетона и
спирта
Фиксация в
полимере
●

ERL-4221, DER763, NSA, DMAE
Процессинг изображений
●

Удаление периодического шума

●

Нормализация интенсивности

●

Калибровка
Статистика
●

36 млн. изображений (1390 x 1500 px x 8 bit)

●

15400 срезов

●

8 терабайт сырых данных

●

240 часов работы

●

3,6 мм3/час — скорость работы

●

●

После реконструкции структуры:

1 x 0,33 x 0,33 мкм — размер вокселя
fMOST — модификация MOST
●

●

●

●

Отказ от длительного
прокрашивания всего
мозга

●

Отказ от серийного
крашения срезов
Выбор селективного
флуоресцентного мечения
нейронов
Выбор трансгенных
мышей, селективно
экспрессирующих XFP

●

Отсутствие методик
фиксации
флуоресцентных
образцов большого
объѐма
Падение
интенсивности
флуоресценции при
фиксации

Объект — мыши с eYFP-H под контролем промотора Thy1.
Выбранные полимеры
GMA — 2-гидроксиметил-метакрилат

●

LR white — полигидрокибисфенол-Адиметакрилат

●

HPMA — гидроксипропил-метакрилат

●

Unicryl — метилметакрилат + стирен
Отрабатываемые параметры

●

Падение интенсивности флуоресценции

●

Время пропитки целого мозга

●
Оптимизация
●

Падение
флуоресценции

●

Полнота пропитки
25

200%

20

150%

15

100%

10

Дни

250%

50%

5

0%

0
HPMA

GMA

Unicryl

LR White

HPMA

GMA

GMA

Unicryl

LR White
Оптимизация GMA
●

●

Понижение
температуры
полимеризации с
60º до 55º
Коррекция pH 0,1%
V этаноламина.

●

Удаление
ингибитора 4метоксифенола
(тушитель)
fMOST – применение метода
Объекты:

Параметры и статистика:

 Мозг взрослой мыши
Thy1-GFP-M

o Ширина среза для GFP
и 14 дн. YFP 300 мкм

 Мозг взрослой мыши
Thy1-eYFP-H

o Воксель 0,5x0,5x2 мкм

 Мозг мыши 14 дн.
Thy1-eYFP-H

o Ширина для взрослой
YFP 150 мкм

o Воксель 1x0,8x2 мкм
Трассировка аксонов
Пересчѐт существующей
аннотаций мозга:
 FPMA взросл.

 MRI 14 дн.
 MRI взросл.
 fMOST 14 дн.
fMOST

Contenu connexe

Plus de Sergey Evfratov (7)

CyTOF
CyTOFCyTOF
CyTOF
 
Report chair
Report chairReport chair
Report chair
 
DI common translate
DI common translateDI common translate
DI common translate
 
Diploma Work
Diploma WorkDiploma Work
Diploma Work
 
Immunology
ImmunologyImmunology
Immunology
 
Pre - Diploma Work
Pre - Diploma WorkPre - Diploma Work
Pre - Diploma Work
 
Di common
Di commonDi common
Di common
 

fMOST