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Recherche documentaire et Information Scientifique et Technique (IST) enjeux, principaux outils - Master SIB Enssib 2023

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Recherche documentaire et Information Scientifique et Technique (IST) enjeux, principaux outils - Master SIB Enssib 2023

  • 1. Recherche documentaire et Information Scientifique et Technique (IST) : enjeux, principaux outils Master SIB - ENSSIB Sauf mention explicite ce support est placé sous licence CC BY 4.0 Alain Marois - 19 octobre 2023 “Graphic allegory of the search for scientific information in large bibliographic databases on the web,” image generated by OpenAI’s DALL·E 2, 18 oct. 2023.
  • 2. Qui suis-je ? (et d’où je parle) • Documentaliste chargé de science ouverte - Ing. d’Étude BAP F laboratoire CIHAM UMR 5648 / DRED Université Lumière Lyon 2 • Formation biologie + gestion de l’IST & Veille • Diverses expériences : • Direction centrale de l’IST d’un EPST (Cemagref) • Cellule documentation numérique d’une BU (Clermont-Ferrand) • Numérisation, projets numériques et community management dans en BU d’une école d’ingénieur (EC Lyon) • Formateur en SCD (Lyon 2) • Formations et accompagnement de chercheurs en labos de SHS • Membre de : CoSO Coll. Compétences, Renatis, CasuHAL, Blog Zotero.fr Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023
  • 3. Plan : pour une boîte à outils bien rangée • IST ? Introduction, déconstruction(s) • Définition • Enjeux actuels • Panorama des outils et ressources de l’IST • Catalogues • Moteurs de recherche académiques • Littérature grise : les thèses • Archives ouvertes et HAL • Grandes bases bibliographiques : Web of Science, Scopus & concurrents • Outils émergents « mapping tools » • Problématique de l’accès et outils Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 CC BY NC SA Leboiseuxdumorvan
  • 5. L‘Information Scientifique & Technique (IST) Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 MESR, 15.11.2013
  • 6. L‘Information Scientifique & Technique (IST) Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Différence entre information généraliste et information scientifique et technique | Enssib
  • 7. L‘Information Scientifique & Technique (IST) Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Différence entre information généraliste et information scientifique et technique | Enssib
  • 8. L‘Information Scientifique & Technique (IST) Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 L'information scientifique et technique (IST) est au cœur de l'activité de recherche. D'une part l'accès aux documents scientifiques est indispensable à la conduite des recherches, d'autre part ces recherches font l'objet de publications qu'il convient de rendre visibles et largement accessibles. L'I.S.T. regroupe ainsi l'ensemble des informations produites par la recherche et nécessaires à l'activité scientifique et intervient donc en amont et en aval dans tout le cycle de production de nouveaux contenus scientifiques quelle que soit leur forme : articles, données, ouvrages, archives ouvertes, etc MESR, 10.02.2020 « »
  • 9. IST et communication scientifique Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Pochet, 2018 (2015), Fig.3.1
  • 10. Publication scientifique, et IST : les revues Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Boukacem-Zeghmouri, 2014 « La revue scientifique est née au XVIIe siècle avec le Journal des Sçavans à Paris et le Philosophical Transactions à Londres. Elle a jeté les bases de ce qui deviendra un modèle de diffusion de la science. Elle est devenue un support privilégié pour la publication des résultats de la recherche dans les domaines des sciences, des techniques et de la santé […] STM » Rappel : les quatre fonctions fondamentales de la revue sont : • enregistrement • évaluation (certification) • diffusion • archivage Guédon, 2001 Boukacem-Zeghmouri, 2015 « + de 30 000 revues scientifiques, à comité de lecture » Boukacem-Zeghmouri, 2021
  • 11. Une IST de plus en plus en ligne Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Khabsa M, Giles CL. The Number of Scholarly Documents on the Public Web. PLoS ONE. 9 mai 2014;9(5):e93949. DOI:10.1371/journal.pone.0093949 By scholarly documents, we mean journal and conference papers, dissertations and masters theses, books, technical reports and working papers. Patents are excluded. The web has become a standard resource for such documents because individual authors, academic and research publishers, and repositories have made their documents available online, with some open to the public and others limited to subscribers. « »
  • 12. Toujours plus de revues, d’articles Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Hanson MA, Barreiro PG, Crosetto P, Brockington D. The strain on scientific publishing [Internet]. arXiv; 2023. URL:http://arxiv.org/abs/2309.15884 De 2016 à 2022, le nombre d’articles scientifiques publiés dans le monde est passé d'environ 1,9 millions par an à 2,8 millions, soit une augmentation de 47 %, alors que le nombre de chercheurs n'a guère évolué. Inrae, 2023 « »
  • 13. L’IST de plus en plus accessible (ouverte) ? Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Le mouvement de l’accès ouvert (open science) est désormais une politique institutionnalisée à l’échelle nationale, européenne et internationale, accompagnant et donnant lieu à une reconfiguration des acteurs, pratiques et productions scientifiques (le cycle de la communication scientifique !), donc impactant directement l’IST. Exemple ici de la Note Flash n°2023-03 de la SIES* sur le Baromètre de la science Ouverte français : *Sous-direction des systèmes d'information et des études statistiques - Service de la coordination des stratégies de l'enseignement supérieur et de la recherche
  • 14. L’IST et l’open science : un long chemin Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 https://youtu.be/WnxqoP-c0ZE?si=xWSa0LWB119_22oM
  • 15. Objets de l’IST : fragmentation et diversité Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 « Une recherche sans publication est une recherche non aboutie. Partant de la question de recherche, le processus de recherche [….] passe par différentes étapes pour aboutir à l'exploitation des résultats et la communication de ces résultats sous différentes formes. Cette communication apporte une réponse à la question de recherche, alimente la littérature scientifique et fait progresser la science » Pochet, 2018 (2015), p. 5
  • 16. Objets de l’IST : fragmentation et diversité Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 « Investir une niche inexplorée de la publication scientifique (CBZ, 2015) Prendre en compte les régimes de valeurs de la donnée pour le chercheur (Rebouillat, 2019) Reconnaissance sociale et symbolique Diversifier les registres de la reconnaissance Investir de nouvelles sources de collaboration » jeux de données Codes et logiciels vidéos protocoles data paper DMP Boukacem-Zeghmouri, 2020
  • 17. IST, industrialisation & données (1/3) Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Posada A, Chen G. Inequality in Knowledge Production: The Integration of Academic Infrastructure by Big Publishers. In: Chan L, Mounier P, éditeurs. ELPUB 2018, Toronto, Canada; 2018 hal-01816707 « Le diagramme suivant développe l'analyse d'Elsevier pour examiner comment l'acquisition de services universitaires apparaît dans le cycle de vie de la production de connaissances universitaires. Cette analyse nécessite une compréhension des différentes étapes du processus de production des connaissances. La figure 4 présente une représentation simplifiée des différentes étapes du processus de production des connaissances universitaires. Nous l'avons divisé en trois sections liées : le processus de recherche, le processus de publication et le processus d'évaluation de la recherche. »
  • 18. IST, industrialisation & données (2/3) Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 « Cette restructuration n'est pas qu'un enjeu de gouvernance interne mais marque une évolution profonde de la stratégie d'Elsevier : la convergence de l'édition scientifique et la gestion de données et métriques (business analytics). […] Les métriques scientifiques constituent peut-être le principal relais de croissance d'Elsevier, d'autant qu'elles s'inscrivent pleinement dans la dynamique de convergence entre la branche scientifique et la branche business analytics de RELX. Elles peuvent tirer parti de toutes les données accumulées par les autres services : publications (Scopus), dépôts (SSRN et Bepress), pratiques de recherche (Mendeley), et interactions sociales via des partenariats avec les réseaux sociaux académiques» Analyse I/IST-n°27-Avril 2018 Posada A, Chen G. Inequality in Knowledge Production: The Integration of Academic Infrastructure by Big Publishers. In: Chan L, Mounier P, éditeurs. ELPUB 2018, Toronto, Canada; 2018 hal-01816707
  • 19. IST, industrialisation & données (3/3) Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Breeding Marshall, Clarivate completes the acquisition of ProQuest, Library Technology Newsletter [January 2022]
  • 20. Clarivate… Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023
  • 21. Panorama des outils et ressources de l’IST Master SIB - ENSSIB
  • 22. Les sources : comment s’y retrouver ? https://bib.cnrs.fr/
  • 23. Cartographie ? Slide : Codet Florence, Alain Marois, Formations Isidoc’t 2023
  • 25. Les catalogues (de bibliothèques) Le Système Universitaire de Documentation est le catalogue collectif français réalisé par les bibliothèques et centres de documentation de l'enseignement supérieur et de la recherche. Le catalogue collectif de France localise quelques 40 millions de documents conservés dans les bibliothèques françaises et donne accès au Répertoire CCFr des bibliothèques et des fonds documentaires Géré par OCLC (Online Computer Library Center), le WorldCat regroupe via des partenariats les catalogues de plus de 15000 de bibliothèques au niveau mondial Les catalogues de bibliothèques universitaires, écoles, centre de recherche spécialisés (quelques fois collectifs !), etc. Ex : Enssib, BU Lyon 2, Frantiq, Smultidoc Les catalogues de bibliothèques municipales (certaines ont des fonds spécialisés; à ne pas négliger). Ex : la BM de Lyon Intégration (théorique) - +
  • 26. Littérature grise : ça se complique « La littérature grise correspond à tout type de document produit par le gouvernement, l’administration, l’enseignement et la recherche, le commerce et l’industrie, en format papier ou numérique, protégé par les droits de propriété intellectuelle, de qualité suffisante pour être collecté et conservé par une bibliothèque ou une archive institutionnelle, et qui n’est pas contrôlé par l’édition commerciale. » • rapports techniques et de recherche • rapports d'évaluation des technologies • résumés et actes de conférences • publications gouvernementales • mémoires et de thèses de doctorat • Statistiques • etc. Schöpfel. 2015
  • 27. Littérature grise : le cas des thèses NDLTD, the Networked Digital Library of Theses and Dissertations (6,447,448 electronic theses and dissertations). http://search.ndltd.org/ OATD.org aims to be the best possible resource for finding open access graduate theses and dissertations published around the world. https://oatd.org/ DART-Europe. Access to 1,378,812 open access research theses from 584 Universities in 29 European countries. https://www.dart-europe.org/ Theses.fr est le moteur de recherche institutionnel dédié aux thèses de doctorat françaises, géré par l’Abes (Agence Bibliographique de l’Enseignement Supérieur). Comprend aussi les thèses en préparation. https://www.theses.fr/ The ProQuest Dissertations & Theses Global (PQDT) ™ database is the world's most comprehensive curated collection of multi-disciplinary dissertations and theses from around the world (Références + full text). Payant Le serveur HAL Thèses a pour objectif de promouvoir l'auto-archivage en ligne des thèses de doctorat et habilitations à diriger des recherches (HDR). https://theses.hal.science/
  • 28. Moteurs de recherche « académiques » https://core.ac.uk/ • contenus en open access • multidisciplinaire • sources spécifiées https://isidore.science/ • contenus en open access • disciplinaire : SHS • sources spécifiées • enrichissements sémantiques • profil, veille, listes de réf. https://scholar.google.fr/ • l’Entonnoir* ! • version bête depuis…2004 • un index de citation • opacité des sources https://www.base-search.net/ • contenus en open access • multidisciplinaire • sources spécifiées Des outils de recherche indexant le web « académique » et les grands réservoirs de littérature scientifique ouverts; certains sont spécialisés (disciplines, type de documents, types de sources), certains ont des partenariats avec des éditeurs, comme Google Scholar. + : couverture très large; permet une première approche d’un sujet, pour travailler ses requêtes, etc. - : opacité de la couverture, manque de fonctionnalités et de réplicabilité https://www.semanticscholar.org • contenus en open access • multidisciplinaire • une couche sémantique • services basés sur l’IA
  • 29. Les bases de données bibliographiques spécialisées Base de références bibliographiques qui indexe les articles de revues, les ouvrages, les rapports et les actes de conférence parus en sciences et technologies de l'information et des bibliothèques (à comparer avec Library & Information Science Source disponible à l’Enssib) Base de références bibliographiques qui indexe les articles de plus de 2000 revues scientifiques en psychologie et certaines disciplines connexes (psychiatrie, l'enseignement, la criminologie ou bien les sciences sociales) Exemples : Des bases de données bibliographiques en ligne (résultant souvent d’un passage au numérique d’un index bibliographique papier) couvrant un champ disciplinaire spécialisé. Portés souvent par des éditeurs spécialisés ou des sociétés savantes. + : couverture exhaustive de la discipline, faible bruit documentaire, repérage des revues & ressources, recherches poussées via des vocabulaires contrôlés - : transdisciplinarité impossible; mise à jour peut-être longue
  • 30. Les bases de données bibliographiques spécialisées
  • 31. https://v2.sherpa.ac.uk/opendoar/ Les archives ouvertes et HAL https://hal.science/ Inist-CNRS
  • 32. Les bases de données bibliographiques généralistes Les 2 titans : Les nouveaux arrivants : +13000 revues +44000 revues +77000 revues; orienté grants, clinical trials orienté patents, et data analysis
  • 33. Des bases bibliographiques…et des citations The clarivate time-line
  • 35. Couvertures et spécificités « The study shows that the three databases are at different extremes on the scale of exhaustivity and selectivity. Web of Science continues to be selective, whereas Dimensions provides a much wider and exhaustive coverage. One may like to use a particular database depending on the purpose of use. The Dimensions database, in particular, appears to be a promising source due to its exhaustive coverage and provision of data filters (which may limit the data to expertcurated or nationally recognized journal lists). » 1. Singh VK, Singh P, Karmakar M, Leta J, Mayr P. The journal coverage of Web of Science, Scopus and Dimensions: A comparative analysis. Scientometrics. juin 2021;126(6):5113-42.
  • 38. Recherche avec Scopus Une liste de sources connues Tutoriels Recherche d’une institution
  • 39. The news kids on the Block : les mapping tools Tay A, 2023 Connected Papers : un outil simple mais puissant à usage unique freemium part d’un unique “seed paper” Basé sur : principes de Co-citation and Bibliographic Coupling. Inciteful : outil personnalisable, utilisation de plusieurs documents de base dans le cadre d'un processus itératif. Très bien documenté Litmaps : combiner la recherche avec les relations entre les citations et la visualisation ResearchRabbit : un worklow séquentiel particulièrement puissant pour explorer en profondeur une recherche Tay A. 2021
  • 41. BDD spécialisées VS grands réservoirs ? • Dans certaines disciplines (Médecine, Psychologie, Chimie, etc.) des bases de références sont incontournables car « collent » aux usages des praticiens (PubMed, APA PsycInfo, CAS, etc) • Les bases dédiées à des domaines (biologie, médecine, brevets) très structurés (référentiels, nomenclatures) à fort tôt de publications, intègrent des outils de recherche indispensables à une recherche/analyse fine (ex : thesaurus MeSH, recherche par composés chimiques, CIB). Il est indispensable de les utiliser dans ce cas. • Selon le but de la recherche documentaire, son niveau d’exigence (ex : revue systématique en médecine), ou le caractère plus ou moins transdisciplinaire, il faudra mixer bases spécialisées et grands réservoirs bibliographiques Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 https://library.cumc.columbia.edu/kb/selecting-bibliographic-databases-search
  • 42. Un équilibre à trouver selon le besoin Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 La stratégie de recherche documentaire consistera - selon les contraintes de temps, moyens, exigence d’exhaustivité, de réplicabilité, etc. – à choisir les bonnes ressources et fonctionnalités afin de limiter bruit et silence documentaires tout en favorisant une certaine sérendipité
  • 43. Explorer et tester Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 https://coop-ist.cirad.fr/trouver-l-information/les-ressources https://www.enssib.fr/services-et-ressources/offre- documentaire/ressources-numeriques-sur-abonnement
  • 45. « L’âge de l’accès* » * L’accès au ressources numériques via les rubriques « bibliothèques électroniques » des sites web des bibliothèque peut être laborieux. Outillez votre navigateur web pour vous faciliter l’accès au texte intégral auquel vous pouvez accéder et gagner du temps, avec : https://addons.istex.fr https://addons.panist.fr https://unpaywall.org/products/extension https://openaccessbutton.org/ Zotero, et sa gestion des proxys, peut également vous faciliter grandement la vie : http://www.lazyscholar.org/
  • 46. « L’âge de l’accès* » * https://addons.istex.fr https://addons.panist.fr https://unpaywall.org/products/extension https://openaccessbutton.org/ Zotero, et sa gestion des proxys, peut également vous faciliter grandement la vie : Ressources des licences nat. ou backfiles « un peu de tout, on sait jamais… » http://www.lazyscholar.org/ Ressources en openaccess @amarois L’accès au ressources numériques via les rubriques « bibliothèques électroniques » des sites web des bibliothèque peut être laborieux. Outillez votre navigateur web pour vous faciliter l’accès au texte intégral auquel vous pouvez accéder et gagner du temps, avec :
  • 47. « L’âge de l’accès » Click&Read : une extension, pour les gouverner toutes..! https://clickandread.inist.fr/ Openaccess, et sinon, licences nat, backfiles….. et sinon Bibcnrs, etc. « elle consulte pour vous les fonds documentaires Unpaywall (qui contient les données de HAL...), Istex, Panist, BibCnrs, Insermbiblio, Lyon 1, Orléans, Rennes 1 et affiche le logo C&R lorsque l'accès a été détecté vers le texte intégral. » @amarois
  • 49. TD en groupes (4 ou 5 personnes) Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Padlet du TD : https://padlet.com/amarois_pro/TD_ISTBiblio_ MasterSIBoct2023 Sujets : 1. Impact psychologique du télé-enseignement pendant l’épidémie de COVID-19 2. Support de stockage informatique à base d’acides nucléiques (ADN, etc) et préservation numérique 3. Transe cognitive auto-induite en milieu hospitalier 4. Risques sanitaires liés au glyphosate (méta-analyses) 5. Ontologies, vocabulaires contrôlés et données de la recherche Consigne : réalisez une recherche en utilisant les outils présentés (un ou plusieurs) ; collectez une quinzaine de références de qualité sous la forme qui vous semble adéquate (bibliographie, liste, etc.) et illustrez à l’aide d’une capture d’écran (interface d’un outil avec équation de recherche, réseau, etc.). Déposez sur le Padlet
  • 51. Ressources Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Boukacem-Zeghmouri C. La fin de la publication scientifique ? Une analyse entre légitimité, prédation et automatisation. Histoire de la recherche contemporaine La revue du Comité pour l’histoire du CNRS [Internet]. 31 déc 2021 [cité 11 oct 2023];(Tome X-n°2). https://journals.openedition.org/hrc/6184 Boukacem-Zeghmouri C. Les couleurs de la publication scientifique. Mutations dans la sous-filière de la revue scientifique STM, analysées par les industries culturelles. Les Enjeux de l’information et de la communication. 2014;15/1(1):49-65. https://www.cairn.info/revue-les-enjeux-de-l-information-et-de-la-communication-2014-1- page-49.htm Boukacem-Zeghmouri C. Les Data Papers dans les stratégies de publication des chercheurs. Semaine DATA SHS - Panorama et écriture de l’objet « Data papers »; 2020 déc 9. Breeding M. Clarivate completes the acquisition of ProQuest. Library Technology Newsletter. 15 janv 2022;1(01):3. Direction Générale de la Recherche et de l’Innovation. Deuxième Plan national pour la science ouverte. Généraliser la science ouverte 2021-2024 [Internet]. 2021 [cité 7 juill 2021]. https://www.ouvrirlascience.fr/deuxieme-plan-national-pour-la-science-ouverte Himmelstein DS, Romero AR, Levernier JG, Munro TA, McLaughlin SR, Greshake Tzovaras B, et al. Sci-Hub provides access to nearly all scholarly literature. Rodgers PA, éditeur. eLife. 9 févr 2018;7:e32822. Inrae. INRAE Institutionnel. 2023 [cité 17 oct 2023]. L’édition scientifique sous pression. https://www.inrae.fr/actualites/ledition-scientifique-pression Enjeux de l’IST
  • 52. Ressources Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Langlais PC. Synthèse sur la stratégie d’Elsevier - Eprist n°27 [Internet]. EPRIST; 2018 [cité 19 avr 2018]. http://www.eprist.fr/wp-content/uploads/2018/04/EPRIST_notes_analyse27avril2018.pdf Mérindol JY. Brève histoire de l’IST numérique. Histoire de la recherche contemporaine La revue du Comité pour l’histoire du CNRS [Internet]. 31 déc 2021 [cité 11 oct 2023];(Tome X-n°2). https://journals.openedition.org/hrc/6049 Pochet B. Comprendre et maîtriser la littérature scientifique [Internet]. Gembloux: Les Presses agronomiques de Gembloux; 2018 [cité 1 oct 2015]. https://hdl.handle.net/2268/186181 Pochet B. Science ouverte et littérature scientifique. Sources, processus, documents, accès… [Internet]. 2023 [cité 16 oct 2023]; Liège. https://infolit.be/fooa/#1 Posada A, Chen G. Inequality in Knowledge Production: The Integration of Academic Infrastructure by Big Publishers. In: Chan L, Mounier P, éditeurs. ELPUB 2018 [Internet]. Toronto, Canada; 2018 [cité 22 oct 2019]. https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01816707 Glarmet A. Choisir les sources d’information scientifique sur internet [Internet]. CopIST, éditeur. CIRAD; 2018 [cité 16 oct 2023]. https://coop-ist.cirad.fr/sources Guédon JC. A l’ombre d’Oldenburg : Bibliothécaires, chercheurs scientifiques, maisons d’édition et le contrôle des publications scientifiques. In Toronto, Canada; 2001. https://hal.archives-ouvertes.fr/halshs-00395366
  • 53. Ressources Master SIB – ENSSIB – CC BY @amarois oct. 2023 Harzing AW, Alakangas S. Google Scholar, Scopus and the Web of Science: a longitudinal and cross-disciplinary comparison. Scientometrics. 1 févr 2016;106(2):787-804. Schöpfel J. Comprendre la littérature grise. I2D - Information, données & documents. 2015;52(1):30-2. Schöpfel J. Vers une nouvelle définition de la littérature grise. 2012; Singh VK, Singh P, Karmakar M, Leta J, Mayr P. The journal coverage of Web of Science, Scopus and Dimensions: A comparative analysis. Scientometrics. juin 2021;126(6):5113-42. Tay A. 3 new tools to try for Literature mapping — Connected Papers, Inciteful and Litmaps [Internet]. Medium. 2021 [cité 16 avr 2021]. https://aarontay.medium.com/3-new-tools-to-try-for-literature-mapping- connected-papers-inciteful-and-litmaps-a399f27622a Tay A. List of Innovative Literature mapping tools | Aaron Tay’s Musings about librarianship [Internet]. Musing About Librarianship. 2023 [cité 3 oct 2023]. https://musingsaboutlibrarianship.blogspot.com/p/list-of- innovative-literature-mapping.html Tay A. ResearchRabbit is out of beta- my review of this new literature mapping tool [Internet]. Academic librarians and open access. 2021 [cité 3 oct 2023]. https://medium.com/a-academic-librarians-thoughts-on- open-access/researchrabbit-is-out-of-beta-my-review-of-this-new-literature-mapping-tool-3c593d061c63 Outils
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