DE L’ADN A LA PROTEINEBA OusmaneLaboratoire de Parasitologie et Mycologie MédicaleInstitut Nationale de Recherches en Sant...
PlanIntroductionGénome du Plasmodium falciparumTranscriptionProtéinesConclusion
Introduction
Génome du Plasmodium falciparumTrois types de génomes: nucléaire, mitochondrial,apicoplasteTaille: 25 méga base14 chromoso...
Transcription (1)
Transcription (2)Transcriptome: ensemble des ARNm issude l’expression d’une partie du génomed’une celluleIntérêt: identifi...
Transcription (3)P. falciparum: transcription en fonction dela demandeSuivant les trois phases du cycle chezl’Homme: proté...
Protéines (1)
Protéines (2)PfEMP1( Erythrocyte Membrane Protein 1 )Exprimée/parasite et transporté à la surfacedes globules rouges grâce...
Protéine (3)Variation Tropisme (répartition récepteurendothéliaux non homogène)CS (Circum Sporozoïtes)Adhésion des sporozo...
Conclusion (1)Application thérapeutique: CQrésistanceEtude du polymorphisme de séquences répétéesassociées aux mutations:o...
Conclusion (2)Moitié des protéines du P. falciparum ontune fonction inconnueEt sont spécifiques du parasiteDonc ces protéi...
Bibliographie (1)Anonyme, visite le 07 Mars 2006http://ludwig-sun1.unil.ch/~vjongene/molbio/chapt_1.htmBerthier A.L. (1997...
Bibliographie (2)MCINTOSH MT, SRIVASTAVA R & VAIDYA AB- Divergent evolutionaryconstraints on mitochondrial and nuclear gen...
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De l'ADN à la protéine

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De l'ADN à la protéine - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Ousmane BA - Parasitologue/Chercheur - Institut Natinal de Recherches en Santé Publique - Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Médicale - Mauritanie.ba4@caramail.com

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De l'ADN à la protéine

  1. 1. DE L’ADN A LA PROTEINEBA OusmaneLaboratoire de Parasitologie et Mycologie MédicaleInstitut Nationale de Recherches en Santé publiqueAtelier paludisme 2006EVALUATIONpar les FACILITATEURS
  2. 2. PlanIntroductionGénome du Plasmodium falciparumTranscriptionProtéinesConclusion
  3. 3. Introduction
  4. 4. Génome du Plasmodium falciparumTrois types de génomes: nucléaire, mitochondrial,apicoplasteTaille: 25 méga base14 chromosomes(séquençage terminé en octobre2002)5279 gènes identifiés, 60% de fonction inconnueComposition en A-T: 80%(90% dans les introns),différence P. vivax(67%)Polymorphisme élevé
  5. 5. Transcription (1)
  6. 6. Transcription (2)Transcriptome: ensemble des ARNm issude l’expression d’une partie du génomed’une celluleIntérêt: identifier gènes actifs, mécanismede régulation d’expression des gènes,définir les réseaux d’expression des gènesEnviron 40% des gènes du Plasmodiumfalciparum sont transcrits
  7. 7. Transcription (3)P. falciparum: transcription en fonction dela demandeSuivant les trois phases du cycle chezl’Homme: protéines intervenants dans lesstades : trophozoïtes, hypnozoïtes (saufPf), gamétocytesActif aussi chez le moustique: productiondes sporozoïtes
  8. 8. Protéines (1)
  9. 9. Protéines (2)PfEMP1( Erythrocyte Membrane Protein 1 )Exprimée/parasite et transporté à la surfacedes globules rouges grâce au réseautubulovésiculaire (Synthèse revues,M/S n°5,vol21,Mai 2005:523-9)Quasi-totalité de l’adhésionProduction sans cesse de nouveau variantsRôle: agglutination, variation antigénique,immunorégulation.
  10. 10. Protéine (3)Variation Tropisme (répartition récepteurendothéliaux non homogène)CS (Circum Sporozoïtes)Adhésion des sporozoïtes aux hépatocytesDéveloppement du parasite dans lemoustiqueFormation des sporozoïtes dans lesoocystes
  11. 11. Conclusion (1)Application thérapeutique: CQrésistanceEtude du polymorphisme de séquences répétéesassociées aux mutations:origine de lachloroquino-résistancePfCRT, sur chx7, proximité de PfCG2, mutationsponctuelles retrouvées dans échecsthérapeutiques de la chloroquine .PfMDR1, gène, sur chx5, mutations ponctuellessont liées à la chloroquino-résistance
  12. 12. Conclusion (2)Moitié des protéines du P. falciparum ontune fonction inconnueEt sont spécifiques du parasiteDonc ces protéines peuvent représenterdes cibles thérapeutiques originales
  13. 13. Bibliographie (1)Anonyme, visite le 07 Mars 2006http://ludwig-sun1.unil.ch/~vjongene/molbio/chapt_1.htmBerthier A.L. (1997). A la découverte du gène.Agro Performances, Hors série oct. 97, 8-9.http://www.gnis-pedagogie.org/pages/classbio/biblio.htmFrancoise Baunaure, Gordon Langsley. Trafic protéique dans le globule rouge infecté parPlasmodiumSynthèse revues,M/S n°5, vol21,Mai 2005:523-9http://disc.vjf.inserm.fr/basismedsci/2005/ms_5_2005/BAUNAURE_p523_529.pdfK. G. Le Roch, J. R. Johnson, L. Florens, Y. Zhou, A. Santrosyan, M. Grainger, S. F. Yan, K.C. Williamson, A. A. Holder, D. J. Carucci, J. R. Yates III, and E. A. WinzelerGlobal analysis of transcript and protein levels across the Plasmodium falciparum life cycleGenomeRes., November 1, 2004; 14(11): 2308 – 2318http://www.ajtmh.org/cgi/content/abstract/67/3/233L. H. Freitas-Junior, E. Bottius, L. A. Pirrit, K. W. Deitsch, C. Scheidig, F. Guinet, U.Nehrbass, T. E. Wellems and A. Scherf. Frequent ectopic recombination of virulence factorgenes in telomeric chromosome clusters of P. falciparum. Nature. vol. 407, october 2000, pp.1018-1022.http://www.cnrs.fr/Cnrspresse/n390/html/n390a09.htm
  14. 14. Bibliographie (2)MCINTOSH MT, SRIVASTAVA R & VAIDYA AB- Divergent evolutionaryconstraints on mitochondrial and nuclear genomes ofmalaria parasites. Mol Biochem Parasitol, 1998,95 , 69-80.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdfP. Collet, V.Derozier, G. Dray, F. Trousset, P. Poncelet, M. Crampes. Tendances dans lesexpressions degènes : Application à l’analyse du transcriptome de Plasmodium Falciparum. Actes du Congrès EGC2005, Paris,janvier 2005. Editions Cepaduès. ISBN : 2-85428-683-9.http://pbil.univ-lyon1.fr/events/jobim2005/proceedings/P60Collet.pdfR. MénardApproche génétique de l’étudedu cycle sporogonique de Plasmodium.Manuscrit n°1963/PLS12. Journée IP en hommage à Paul-Louis SIMOND.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n5b/Menard.pdfSU XZ, KIRKMAN LA, FUJIOKA H & WELLEMS TE - Complexpolymorphism’s in a 330-kDa protein are linked to chloroquineresistantP. falciparum in Southeast Asia and Africa. Cell, 1997.91, 593-603.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdfWATERS AP, THOMAS AW, VANDIJK MR & JANSE CJTransfectionof malaria parasites. Methods, 1997, 13, 134-147.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf
  15. 15. DE L’ADN A LA PROTEINEBA OusmaneLaboratoire de Parasitologie et Mycologie MédicaleInstitut Nationale de Recherches en Santé publiqueAtelier paludisme 2006

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