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Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le déploiement de la
génomique en bovin
viande
• UMT 3G (INRA, Institut de l’Elevage et Allice).
• APIS-GENE, Charolais France, France Limousin Sélection et France
Blonde d’Aquitaine Sélection.
• Sociétés d’exploitation des races Charolaise, Limousine et Blonde
d’Aquitaine : Herd-Book Charolais, Charolais Univers, Gènes Diffusion,
France Limousin Sélection et France GEN&BLOND.
1
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le déploiement de la
génomique en bovin
viande
Présentation de l’outil génomique
IBOVAL
UMT 3G :
• INRA : Thierry Tribout, Eric Venot
• Allice : Romain Saintilan, Marine Barbat, Laure Hugues
• Institut de l’Elevage : Philippe Boulesteix, Armelle Govignon-Gion,
Jean Guerrier
2
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Introduction
3
Depuis quelques années, nouvelle approche pour estimer
la valeur génétique des animaux :l’Evaluation Génomique
En place chez Bovins Laitiers depuis plusieurs années
Principe :
Index classiqueIndex
Génomique
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
4
Dans les populations allaitantes
françaises
Actions complémentaires
• GPSAB
• DEGERAM
• …
Programmes de recherche
• QUALVIGENE
• GEMBAL
Au cours des dernières années :
Génotypage de plusieurs
milliers d’individus dans
les populations allaitantes
mise en place d’évaluations génomiques
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
5
Les évaluations génomiques IBOVAL
Evaluations Génomiques IBOVAL :
 Phase d’études  mise en place officielle fin 2015
 dans populations Charolais, Limousin, Blonde
Index Génomiques :
• naissance & sevrage ferme
- IFNAIS, CRsev, DMsev, DSsev, FOSsev, ISEVR
- AVel, ALait, MERPsev, IVMAT
• croissance & conformation carcasse jeunes bovins
- ICRCjbf, CONFjbf, IABjbf
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
6
Les évaluations génomiques IBOVAL
1. Principe de l’évaluation génomique
2. Les index génomiques IBOVAL
- comment sont ils calculés en pratique ?
- gains de précision / index IBOVAL classiques
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
7
Principe de l’évaluation génomique
x x x
♂
♀
♂ ♀
♂
♀
Population (race)
Echantillon de la population :
performances et génotypes
= « Population de Référence »
1
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
8
Performance d’un
individu de la
Popul. de Référence
~ Moyenne
performance individuelle
&
performances des descendants
Génotypes : prélèvement de sang, poils, semence  extraction ADN
 en laboratoire, on regarde quelle
base est portée par l’individu
= « génotype » de l’individuMarqueur SNP
Performances et Génotypes
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
9
A quoi sert la Population de Référence ?
Génome de l’individu i
chr1 chr2 chr3
Génome de l’individu j
chr1 chr2 chr3
Génome de l’individu k
chr1 chr2 chr3
La position des QTL sur les chromosomes et
leurs effets sur les caractères sont inconnus !
Population de Référence
favorable
défavorable
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
10
A quoi sert la Population de Référence ?
Génome de l’individu i Génome de l’individu j Génome de l’individu k
chr1 chr2 chr3 chr1 chr2 chr3 chr1 chr2 chr3
marqueurs
SNP
Population de Référence
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
11
A quoi sert la Population de Référence ?
Génome de l’individu i Génome de l’individu j Génome de l’individu k
chr1 chr2 chr3 chr1 chr2 chr3 chr1 chr2 chr3
Population de Référence
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
12
A quoi sert la Population de Référence ?
estimation de l’effet de chaque marqueur
sur chacun des caractères évalués
Equation de prédiction de la Valeur Génomique Directe « DGV »
Utilisable sur n’importe quel animal génotypé, même s’il
n’appartient pas à la Population de Référence
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
13
Principe de l’évaluation génomique
x x x
♂
♀
♂ ♀
♂
♀
Population (race)
Echantillon de la population :
performances et génotypes
= « Population de Référence »
1
Equations de prédictions des
valeurs génomiques
(« effets marqueurs »)
2
Application des équations de
prédictions aux génotypes
des reproducteurs et
candidats à évaluer
 Valeur Génomique Directe
« DGV »
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
14
Qualités d’une bonne Population de
Référence
La Population de référence doit être de grande taille
en pratique : plusieurs milliers d’individus nécessaires
sinon, valeur génomique mal estimée pour certains individus
La Population de référence doit être représentative de la
population à évaluer
Les individus de la Population de Référence doivent
(idéalement) avoir un phénotype précis
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
15
Qualités d’une bonne Population de
Référence
Impact de la précision du phénotype des individus de la
Population de Référence :
0
0,2
0,4
0,6
0,8
1
h2=0,9
h2=0,3Individus avec 1
perf. individuelle
Taureaux avec 100
descendants contrôlés
h² = 0,30
Précision (CD)
des DGV
Taille de la Population de Référence
D’après Goddard, 2009
reproducteurs avec descendants contrôlés : très importants !
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
16
Taille des Population de Référence
Ensemble des individus disponibles 06/2016
Charolais Limousin Blonde
Indexations Naissance-Sevrage
Effet direct poids-conditions naissance 15 000 6 600 5 600
Effet direct croissance-morpho sevrage 12 500 5 600 2 800 – 3 900
Effet maternel conditions de naissance 5 200 3 300 3 000
Effet maternel croissance au sevrage 4 500 2 400 2 100
Indexations Croissance Conformation Carcasse jeunes bovins
AGA – CONF - PCAR 2 400 1 750 720
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
17
Taille des Population de Référence
Charolais Limousin Blonde
Indexations Naissance-Sevrage
Effet direct poids-conditions naissance ~1 800 ~2 700 ~1 200
Effet direct croissance-morpho sevrage ~1 500 ~2 400 ~1 000
Effet maternel conditions de naissance ~500 ~200 ~200
Effet maternel croissance au sevrage ~450 ~500 ~200
Indexations Croissance Conformation Carcasse jeunes bovins
AGA – CONF - PCAR ~600 ~400 ~300
Pour l’instant, précision modeste des DGV, mais va augmenter !
Taureaux avec nombreux descendants contrôlés 06/2016
Tous les animaux
sont utiles !
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
18
Production des Index Génomiques
Si parents connus & dans
base contrôlée :
Index IBOVAL classiques
Performances et
généalogies
Valeur Génomique Directe
DGV
Information de la
Population de
Référence
toute l’information
disponible est
valorisée
Index Génomique : GEBV = combinaison
Index IBOVAL classique
Valeur Génomique Directe
précision GEBV
> précision Index IBOVAL classique
> précision Valeur Génomique Directe DGV
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
19
Production des Valeurs Génomiques
En bref …
• Pour tout animal génotypé (veau, taureau, vache) :
Cas 1:
index IBOVAL classique disponible
(individuel ou sur ascendance)
index génomique GEBV,
accompagné d’un CD (précision)
Cas 2:
pas d’index IBOVAL classique
 DGV
= « indicateur génomique »
Plus de détails dans la présentation suivante …
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
20
Intérêts des Index Génomiques GEBV
Index Génomiques GEBV plus précis que Index IBOVAL
actuels
• estimation plus précise et plus précoce de la VG qu’avec
index IBOVAL classique, sans avoir à attendre la mise à la
reproduction et le contrôle des 1ers produits
jeune individu (♂ ou ♀) sans descendant contrôlé (veau,
embryon) :
Information de la
Population de
Référence
Performances
et généalogies
Information supplémentaire
contenue dans génotypes
 gain de précision (CD)
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
21
0,00
0,05
0,10
0,15
0,20
0,25
0,30
0,00 0,20 0,40 0,60 0,80 1,00
CD index IBOVAL classique
IFNAIS
ISEVR
IVMAT
MERPsev
Ex : Charolais
veau issu de MN
0,00
0,05
0,10
0,15
0,20
0,25
0,30
0,00 0,20 0,40 0,60 0,80 1,00
CD_GEBV-CD_EBVpoly
CD index IBOVAL classique
IABjbf
ICRCjbf
Gains de précision par rapport aux
index IBOVAL classiques
index CD de l’index
IBOVAL classique
CD de l’index
génomique GEBV
IFNAIS 0,30 0,40 (+33%)
ISEVR 0,27 0,33 (+22%)
IVMAT 0,25 0,34 (+36%)
MERPsev 0,20 0,29 (+45%)
+0,10
CD_GEBV–CD_IBOVALclassique
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
22
Intérêts de la Sélection Génomique
possibilité de mise à la reproduction plus précoce
 raccourcissement de l’intervalle entre générations
 progrès génétique plus rapide
Intérêt pour caractères exprimés - tardivement
- dans un seul sexe
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
23
Conclusions
 mise en place progressive pour autres caractères
et dans autres races
Génotyper des vaches (femelles) pour augmenter la
précision des index aptitudes maternelles !
Gain de précision, qui augmentera avec la taille des
Populations de Référence
 continuer à génotyper & mesurer performances !
Eval. Génomiques IBOVAL officielles : depuis fin 2015
Charolais, Limousin, Blonde d’Aquitaine
- Naissance – Sevrage
- Croissance et Conformation Carcasse JB
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le déploiement de la
génomique en bovin
viande
Valorisation de l’outil génomique
GeMBAL  IBOVAL génomique
• APIS-GENE
• Charolais France, France Limousin Sélection et France Blonde
d’Aquitaine Sélection
• Institut de l’Elevage
24
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
APIS-GENE mandataire de la
valorisation
• Représente les co-propriétaires
des 4 apports clés :
- Matériel biologique
- Données / BDD / Formules
25
Nouvelle
technologie
d'évaluation
génomique
GeMBAL
Formules
Base de
Données
Données
• Assure la diffusion de la technologie au travers d’une ou plusieurs
Sociétés d’Exploitation  contrat de licence
• Gère et perçoit, pour le compte des copropriétaires, les redevances
perçues au titre de l’exploitation et :
- les redistribue aux co-propriétaires
- réinvesti dans de nouveaux programmes de recherche
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Les bénéficiaires potentiels de
valeurs génomiques
26
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Populations ‘cibles’ retenues par chacun
des Organismes de Sélection raciaux
pour le calcul des index génomiques
27
Animaux
concernés
Charolaise Limousine
Blonde
d’Aquitaine
Mâles
Inscrits « race pure
certifiée » ou
inscriptibles de pères et
de mères inscrits « A »
au livre généalogique
(LG)
D’au moins 9 mois,
« certifiables » au LG
et soumis au Contrôle
des Performances
Viande (formule
complète VA4)
Soumis à la
Certification
de la Parenté
Bovine (CPB)
Femelles
Des adhérents au
Contrôle des
Performances Viande
(formule complète VA4)
Des adhérents à la
Certification de la
Parenté Bovine (CPB)
Toutes,
aucune
restriction
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Différés raciaux de publication
pour les mâles
• Âge minimal commun aux mâles de la race
Race Blonde d’Aquitaine : 18 mois d’âge, sauf pour les
veaux contrôlés en SE-CI
Race Limousine :
28
70 à 130
+ CD
- - -
à
+++
Rien
Moins de 9
mois
De 9 à 24
mois
Plus de 24
mois
Moins de 9
mois
De 9 à  10-
11 mois*
Plus de  10-
11 mois*
* : animal effectivement mis en contrôle (avec double pesée début)
Resté
en
ferme
Passé
en
SECI
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
SIG
Mise en œuvre pratique(1/3)
29
Client
Prélèvement/Génotypage
Résultat
IPVgéno
‘DGV’
Société d’Exploitation
♀ avec parenté
déclarée et
résultat de
génotypage
Parenté non
compatible
etc.
Parenté
non
démentie
etc.
Conformité demande
Hors
CPB
Pas de
calcul
Diffusion
privée
INRA-CTIGUMT 3G
* ** *** *********
Mauvais
Plutôt
mauvais
Moyen
Plutôt
bon
Bon
IPVgéno = Indicateur Précoce de Valeur génomique
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Mise en œuvre pratique(2/3)
30
Client
Prélèvement/Génotypage
Résultat
Parenté
compatible,
etc.
NOK
Pas de
calcul
Conformité demande
Société d’Exploitation
Parenté non
compatible
etc.
UMT 3G
Filiation pas
nécessairement
certifiée SIG
Index
‘poly’
pour le
caractère
+
DGV
♂/♀ avec
parenté
déclarée et
résultat de
génotypage
Diffusion
privée
‘DGV’ ‘GEBVprov’+CD
IPVgéno
INRA-CTIG
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Mise en œuvre pratique(3/3)
31
SIGClient
Prélèvement/Génotypage
Résultat
OK
GEBV
+CD
Parenté
compatible,
etc.
Pas de
calcul
Conformité demande
Société d’Exploitation
Parenté non
compatible
etc.
Filiation
certifiée
SIG
Index
poly. (EBV)
pour le
caractère
+
DGV
♂/♀ avec
parenté
déclarée et
résultat de
génotypage
Publication
officielle
‘immédiate’
ou différée
Publication
officielle
UMT 3G INRA-CTIG
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Refonte des règles de publication des
index avec l’arrivée de la génomique(1/2)
• Dans un souci de simplification et d’harmonisation
Un maximum de critères (CD) communs entre
évaluations
Déconnexion complète des index naissance-vêlage
de tout autre index pour publication
ISEVR demeure la « pierre angulaire » des diffusions
pour les éleveurs au moins au CPV en VA4
Dès qu’ISEVR est publiable les autres index de sélection
le sont s’ils respectent leurs propres règles de diffusion
Maintien de la différence d’expression des index en
fonction de leur  grande comparabilité au niveau racial
32
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Refonte des règles de publication des
index avec l’arrivée de la génomique(2/2)
• Plus particulièrement pour les index IBOVAL
enrichis d’informations du génome
Femelles
Aucune contrainte particulière de publication
Mâles
Aucune contrainte de performance de descendant prise
en compte dans les indexations mais une précision
minimale (CD) nécessaire pour chaque index
• Notion de différé ‘Client’
Le différé ‘Client’ consiste, au-delà du différé racial, à
pouvoir retarder la diffusion officielle des index, ceci
pendant un maximum de180 jours
Applicable pour les mâles et femelles
Peut être levé par le ‘Client’ à tout moment
33
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le déploiement de la
génomique en bovin
viande
Présentation de l’offre en Charolais
du Herd-Book Charolais
• Herd-Book Charolais
34
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
photo
photo
PERFORMANCES
SAVOIR-FAIRE
INNOVATION
35
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
UNE OFFRE RECONNUE
PAR TOUS LES ACTEURS
DU MONDE DE L’ÉLEVAGE
DEPUIS 2009, RÉALISÉE DE FAÇON COLLECTIVE :
FRANCE GÉNÉTIQUE ÉLEVAGE
LES RÉSULTATS SONT
CALCULÉS PAR
LES RÉGLES DE PUBLICATION
SONT DÉFINIES PAR
L’INRA
36
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
** si père et mère connus en SNP
Les Index
Génomiques
(GEBV)
La
Certificatio
n Race Pure
Certifiée*
La
Vérification de
Compatibilité
Génétique**
UNE OFFRE UNIQUE:
4 SERVICES INCLUS DANS LE
TARIF
1 2 3
Recherche
des caractères
culard et
sans corne
4
* Si animal inscriptible
37
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Index Génomique :
Combinant les valeurs polygéniques & génomique directe
NAISSANCE:
IFNAIS
LAIT:
ALAIT
VÊLAGE:
AVEL
MORPHOLOGIE CROISSANCE
IDENTIFIER LES MEILLEURS
REPRODUCTEURS
DEV MUSCULAIRE- DEV SQUELETTIQUE
POTENTIEL DE CROISSANCE
FINESSE D’OS
QUALITÉS MATERNELLES
+ le gène Culard + le gène Sans Corne la filiation+ + +
BVD proposé en option
38
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
l’éleveur reste
maître et libre
de sa génétique !
Pas d’obligation de
signer de contrat en
préambule.
Le résultat est
directement restitué et
l’éleveur en reste le
seul propriétaire.
Il décide de l’avenir de
l’animal sans aucune
clause exigée
par le HBC.
LES GARANTIES HBC
 LES RÉSULTATS
SONT LA PROPRIÉTÉ DE L’ÉLEVEUR
 OBTENTION DES RÉSULTATS SANS DIFFÉRÉ
EN MOINS DE DEUX MOIS
 L’INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS
PAR L’EXPERT HBC
39
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
UN PRÉLÈVEMENT À TOUT MOMENT...
PAR L’EXPERT RACIAL HBC
OU PAR L’ÉLEVEUR**
• Sous réserve de l’obtention d’un agrément auprès de son EDE.
COMMENT ?
40
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
LA TRANSMISSION DES RÉSULTATS
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
42
Prix * proposé à l’unité
Inscription incluse
pour les animaux inscriptibles
Prix groupé
MÂLE 120 €
FEMELLE
93 €
10 FAITES = 1 GRATUITE
(84.50€ /génotypage)
COUPLE
209 €
Meilleur Prix du Marché
LES TARIFS HBC
* En option BVD au tarif de 5 euros HT/ animal.
* + 19€ par parent inconnu en SNP
• OFFRE DE LANCEMENT 2016
Nouvel Adhérent HBC et AJEC: lors de la 1ère commande, remise de 10% sur les 10ers génotypages
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le déploiement de la
génomique en bovin
viande
Présentation de l’offre en Charolais
de Charolais Univers
• Charolais Univers
43
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Offre génotypage Charolais Original
•Une marque pour une offre complète
•Du prélèvement aux résultats
•1er bilan 2016
44
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Une marque pour une offre complète
• Une marque Charolais Original utilisée par les
coopératives adhérentes et les distributeurs.
• Une offre complète
Filiation
Gènes d’intérêts
Indexation IBOVAL génomique utilisant la technologie
Gembal
45
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Une marque pour une offre complète
•Identification des gènes d’intérêts
Gène Culard
Gène Sans Cornes
Anomalies génétiques
 Ataxie progressive du charolais
 Blind
 DEA (sans poils et sans dents)
46
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Du prélèvement aux résultats
• Exemple de protocole pour un mâle *
47
Prélèvement
Génotypage
des GI
Mâle porteur
(homo ou hétéro)
sur au moins 1
anomalie
Pas de
génotypage
GEMBAL
Génotypage
GEMBAL
Mâle non
porteur
d’anomalies
Transmission des
résultats
(Filitaion +GI)
Transmission
des résultats
( Filiation + GI
+GEMBAL)
* : A compter du 1/11/2016
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Du prélèvement aux résultats
• Fiche résultats XPERF Manager
48
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Du prélèvement aux résultats
• Tarification 2016/2017 *
49
* : A compter du 1/11/2016
Quantité de génotypages (par commande) 1 à 9 10 à 24 25 et +
Gènes d'intérêts seuls + filitation
(Ataxie + Blind + DEA + SC + Mh)
47 € 47 € 47 €
Mâles (54 k) (GI + GEMBAL + filiation) 129 € 109 € 95 €
Femelles (10k) (GI + GEMBAL + filiation) 69 € 59 € 56 €
Si mâle vierge d'anomalie ou femelle non homozygote porteuse alors indexation GEMBAL automatique
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
1er bilan 2016
• 2744 génotypages réalisés à fin septembre 2016
50
752
431
335
1226
Mâles Femelles
Schéma CH UNIVERS Grands Comptes
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le déploiement de la
génomique en bovin
viande
Présentation de l’offre en Charolais
de Gènes Diffusion
• Gènes Diffusion
51
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
« L’évaluation
génomique pour tous »
• Historique
• Offre Génomique Gènes Diffusion
52
Juin-2009 Création de la plateforme Génomique GD Scan
Sept-2010 Démarrage du programme de recherche Vache/Veau
Juin-2014 Offre de Génotypage GD Scan 38
Oct-2015 Offre de Génotypage GD Scan 38 + Evaluation Génomique IBOVAL
Fev-2016 Offre VCG
Juin-2016 Nouveaux index GD Scan
11 969 animaux indexés
+ 4213 animaux indexés
VCG 1299 animaux filiés
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Offre
53
6 index
Production
9 index
Morphologie
au sevrage
2 index
Comportement
4 index
Morphologie
post-sevrage
21 index
génomiques
(dont 15 de
différenciation)
2 Gènes d’intérêts
Identification Génétique (200 SNP)
Gène Culard (Mh / +)
Gène Polled (P / +)
Population Cible:
Tous les animaux
CHAROLAIS
(code 38 )
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Offre
54
12 index génomiques
Population Cible définie
par
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Offres Complémentaires:
Identification Génétique, Vérification de Compatibilité Génétique, Gène Mh
55
Plateforme
Identification
Génétique
Vérification
de
Compatibilité
Génétique
Gène Culard
(Mh)
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Tarification des Offres
56
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
• Témoignage de Jean-Pierre LETHENET (Eleveur Charolais dans
l’Ain)
GAEC de l’ALLIANCE
80 vêlages d’automne
91 GDScan Femelles réalisés
57
Les 1ères confirmations
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
58
Questions ?
Merci de
votre
attention
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le déploiement de la
génomique en bovin
viande
Présentation de l’offre en Limousin
de France Limousin Sélection
• France Limousin Sélection et Ingenomix
59
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Une offre de service complète
Un seul échantillon pour un service complet :
• IngenomiX est officiellement habilitée par FGE pour réaliser
des profils ADN et rendre des VCG. Les données sont
transmises au SIG.
• Calcul des index génomiques officiels par l’INRA.
• Evaluation de la valeur génomique pour 7 caractères : FN,
CR, DM, DS, FOS, AL, AV.
• Recherche du gène culard : mh.
• Recherche du gène sans corne en option.
60
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Une offre de service complète
61
FEMELLEMÂLE
Résultat IBOVAL
génomique selon
éligibilité.
G
E
M
B
A
L
D
G
V
Score génomique
sur 10.
FN
CR
DM
DS
FOS
AL
AV
MH
Gène culard inclus
+/- HP
Sans corne en option
Profil ADN
+ Filiation incluse
7 Caractères inclus dans
l’outil
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Une offre originale
62
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Une offre originale
63
Scores
génomiques de
l’animal, de 1 à 10
Scores pour lesquels les animaux sont en
moyenne à 100 en IBOVAL
=> Déterminez si l’animal sera améliorateur ou
non sur ce caractère
Visualisation
graphique des
résultats
=> Repérez en un
coup d’œil les
points forts et les
points faibles de
votre animal
Informations sur
l’animal
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le meilleur rapport
qualité / prix
64
Evaluations génomiques Filiation Mutations
EVALIM complet
7 caractères.
EVALIM Modulo
2 caractères.
+ Recherche mutations
en option.
Recherche culard et
sans corne
Evaluations
génomiques
Test mâle 199 € -
Test femelle 89 € 55 €
1 caract. supp - + 8 € - -
Filiation
Filiation Inclus - 5 € -
Profil ADN Inclus + 10 € 20 € -
Profil ADN + Filiation inclus + 15 € 25 € -
Mutations
Caractère "Culard" inclus + 8 € +5 € 22 €
Caractère "Sans corne" + 10 € + 10 € +5 € 22 €
Culard + "Sans corne" - + 15 € 10 € 27 €
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Un service opérationnel
• Un service de qualité :
Une équipe disponible à votre écoute pour toutes questions
concernant :
- les VCG : les prélèvements, le profil ADN, les filiations
incompatibles,
- les évaluations génomiques, l’interprétation des résultats…
• Un service efficace :
Des résultats depuis 2011 avec des délais de traitement de 2
à 3 mois.
• Un service accessible à tous :
Un réseau de distributeurs sur tout le territoire.
Pour nous contacter : www.ingenomix.fr
65
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le déploiement de la
génomique en bovin
viande
Présentation du service de
génotypage BLOND
• SAS France GEN&BLOND – France Blonde d’Aquitaine Sélection -
AURIVA
66
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
67
Offre raciale au service des éleveurs
•Outil à la disposition de tous :
Population cible large
•Diffusion d’un outil génomique au plus près des
préoccupations des éleveurs :
Intégration de la Filiation et des Gènes d’Intérêt
•Valorisation de la participation au phénotypage :
Remise aux éleveurs en VA4
•Des précautions techniques :
Différé racial pour les mâles jusqu’à 18 mois
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
68
Constitution de l’offre
• Mâles (Puce MD):
Kit de base : VCG + Tests : 90€
 Réduc de 30€ pour les mâles filiés + résultat de transloc 1/29
connu + en VA4 (=> “Rattrapage Axono” possible si participe à la
pop de rèf) – Valable jusqu’au 31/05/2017
Option indexation (à partir de 18 mois) : +160€ (réduc
40€ si VA4)
• Femelles (Puce LD):
VCG + Tests + Index : 90€ (réduc 20€ si VA4)
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
69
Tests kit BlondoTyp
• Tests sur haplotypes :
Axonopathie
Translocation 1/29
• Tests sur mutation :
Gène de Muscularité Blonde
Gène de coloration de robe
Gène Polled
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
70
Service de Génotypage
• Piloté par SAS Gen&Blond
• Exclut les mâles candidats au programme de sélection
• S’appuie sur un réseau de distributeurs locaux ou
vendeurs “agréés”
• Contact : gen-blond@gmail.com, France Blonde
d’Aquitaine Sélection, AURIVA
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
71
Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Merci de votre attention
Venez échanger avec nos
ingénieurs
Hall 1, stand C77
Retrouvez les diaporamas de nos
conférences sur
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