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QUELLE GÉNÉTIQUE POUR
UN ÉLEVAGE DURABLE
DES PETITS RUMINANTS ?
Présentation
de l’UMT GPR
Gilles Lagriffoul
(Institut de l’Elevage)
Les programmes UMT en Génétique des Petits
Ruminants
2007
UMT
GENEpR
2012
Fin de la rénovation des SNIG en petits ruminants
Les bases de la génomique (stockage ADN, ingénierie…)
2012
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Développement de la génomique : sélection génomique (OL, C),
utilisation de gènes en sélection (OA)
Amplification des travaux génétique*santé et démarrage de
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UMT GPR :
Génétique pour un élevage durable
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Genetics for sustainable small ruminants
2017
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2022
Consolidation et amplification de la sélection génomique
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Sélection des petits ruminants pour un élevage durable
UMT GENEpR :
Amélioration génétique
des Petits Ruminants
UMT GGPR :
Gestion génétique
des Petits Ruminants
Méthode et modèle
d’évaluation génétique
et génomique
Axe 1
Intégration des
caractères dans les
élevages et les
populations
Axe 3
Déterminisme
génétique des
caractères pour un
élevage durable
Axe 2
Transfert, formation et appui aux acteurs des
dispositifs génétiques ovin et caprin
Axe 4
Animateurs :
Gilles Lagriffoul (Idele)
Dominique François (INRAE)
Structuration du programme de l’UMT GPR
agréée jusqu’en fin 2022
L’UMT GPR au cœur du dispositif génétique des PR
1. Participation des professionnels au Comité de Pilotage de l’UMT
2. Participation de l’UMT GPR aux commissions/comités (*)
3. Réunions de travail avec les ES et OS
L’UMT GPR,
une instance reconnue d’interface entre profession et R&D
une instance favorisant les échanges et les mutualisations entre filières
(*) Commission Filière caprine de FGE, instances Capgènes
Commission d’Orientation Génétique Ovine, Comité Technique Ovin Allaitant FGE,
Comité National Brebis Laitières
Axe1 - Evaluation
Transfert des évaluations vers
Déploiement de la sélection génomique (les 5 races ovines laitières, 2 races caprines
et projet pilote pour 2 races ovines allaitantes).
Evaluation génomique en single step
Nouvelles évaluations
Appui scientifique, optimisation des modèles, mutualisation de l’ingénierie
évaluation génomique (puces, clustering...), prédiction gènes majeurs, utilisation de
données de séquences, analyse de données longitudinales...
Interaction G x E, valorisation des effets élevages
Intérêt et faisabilité d’une évaluation multi-pays
Axe 2 – Caractères abordés
Résistance parasitisme
Mammites, CCS
Fertilité à l’IA
Production de semence
Mutations létales
Mutations prolificité
Vigueur des agneaux
Longévité fonctionnelle
Persistance laitière
Maturité
Morphologie, kystes
Cornage
Efficience alimentaire
Dynamique réserve corporelle
Thermo-tolérance
Qualité fine du lait - SMIR
Comportement, docilité
Axe 3 – Schémas et populations
Bilan et appui aux schémas de sélection
Gestion de la variabilité génétique : méthodologie (SPM G, données moléculaires...),
accompagnement des ES et OS
Modélisation et appui au déploiement des schémas génomiques
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Sélection génétique, économie, environnement... Objectifs de sélection
Stratégies de création et de diffusion du progrès génétique en fonction du mode de
reproduction
Coopération internationale
L’UMT GPR en quelques chiffres :
13,1 ETP en 2022
89 publications dans des revues à comité de lecture
108 communications à des congrès
23 communications à des journées techniques
11 stagiaires, 8 thèses
27 projets déposés (H2020, Interreg, Casdar, AI FGE, FAM, Apis Gene …)
L’UMT GPR en quelques réalisations majeures :
Le transfert des évaluations à GenEval en 2018
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  • 1. QUELLE GÉNÉTIQUE POUR UN ÉLEVAGE DURABLE DES PETITS RUMINANTS ? Présentation de l’UMT GPR Gilles Lagriffoul (Institut de l’Elevage)
  • 2. Les programmes UMT en Génétique des Petits Ruminants 2007 UMT GENEpR 2012 Fin de la rénovation des SNIG en petits ruminants Les bases de la génomique (stockage ADN, ingénierie…) 2012 UMT GGPR 2017 Développement de la génomique : sélection génomique (OL, C), utilisation de gènes en sélection (OA) Amplification des travaux génétique*santé et démarrage de programmes sur caractères de rusticité (caractères de production/caractères fonctionnels) UMT GPR : Génétique pour un élevage durable des Petits Ruminants Genetics for sustainable small ruminants 2017 UMT GPR 2022 Consolidation et amplification de la sélection génomique Développement des travaux sur les caractères fonctionnels (en fermes, en stations…) Sélection des petits ruminants pour un élevage durable UMT GENEpR : Amélioration génétique des Petits Ruminants UMT GGPR : Gestion génétique des Petits Ruminants
  • 3. Méthode et modèle d’évaluation génétique et génomique Axe 1 Intégration des caractères dans les élevages et les populations Axe 3 Déterminisme génétique des caractères pour un élevage durable Axe 2 Transfert, formation et appui aux acteurs des dispositifs génétiques ovin et caprin Axe 4 Animateurs : Gilles Lagriffoul (Idele) Dominique François (INRAE) Structuration du programme de l’UMT GPR agréée jusqu’en fin 2022
  • 4. L’UMT GPR au cœur du dispositif génétique des PR 1. Participation des professionnels au Comité de Pilotage de l’UMT 2. Participation de l’UMT GPR aux commissions/comités (*) 3. Réunions de travail avec les ES et OS L’UMT GPR, une instance reconnue d’interface entre profession et R&D une instance favorisant les échanges et les mutualisations entre filières (*) Commission Filière caprine de FGE, instances Capgènes Commission d’Orientation Génétique Ovine, Comité Technique Ovin Allaitant FGE, Comité National Brebis Laitières
  • 5. Axe1 - Evaluation Transfert des évaluations vers Déploiement de la sélection génomique (les 5 races ovines laitières, 2 races caprines et projet pilote pour 2 races ovines allaitantes). Evaluation génomique en single step Nouvelles évaluations Appui scientifique, optimisation des modèles, mutualisation de l’ingénierie évaluation génomique (puces, clustering...), prédiction gènes majeurs, utilisation de données de séquences, analyse de données longitudinales... Interaction G x E, valorisation des effets élevages Intérêt et faisabilité d’une évaluation multi-pays
  • 6. Axe 2 – Caractères abordés Résistance parasitisme Mammites, CCS Fertilité à l’IA Production de semence Mutations létales Mutations prolificité Vigueur des agneaux Longévité fonctionnelle Persistance laitière Maturité Morphologie, kystes Cornage Efficience alimentaire Dynamique réserve corporelle Thermo-tolérance Qualité fine du lait - SMIR Comportement, docilité
  • 7. Axe 3 – Schémas et populations Bilan et appui aux schémas de sélection Gestion de la variabilité génétique : méthodologie (SPM G, données moléculaires...), accompagnement des ES et OS Modélisation et appui au déploiement des schémas génomiques Gestion des gènes majeurs Préparer la création d’un observatoire des anomalies génétiques en petits ruminants Sélection génétique, économie, environnement... Objectifs de sélection Stratégies de création et de diffusion du progrès génétique en fonction du mode de reproduction Coopération internationale
  • 8. L’UMT GPR en quelques chiffres : 13,1 ETP en 2022 89 publications dans des revues à comité de lecture 108 communications à des congrès 23 communications à des journées techniques 11 stagiaires, 8 thèses 27 projets déposés (H2020, Interreg, Casdar, AI FGE, FAM, Apis Gene …) L’UMT GPR en quelques réalisations majeures : Le transfert des évaluations à GenEval en 2018 Une amplification de la génomique : sélection génomique, gènes majeurs... Un développement des travaux pluridisciplinaires autour de la durabilité Des projets structurants comme H2020 iSAGE, H2020 SMARTER, CASDAR PRESAGE... Pour conclure,