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2016-04 Búsquedas PubMed etc

  • 1.
  • 2. BIBLIOGRAFÍA, GESTORES, REDES, APPS Dónde y cómo buscar la información Martín Lázaro Oncología Médica CHU Vigo
  • 3.
  • 4.
  • 5. J.S. Billings (1838-1913) Cirujano del ejército 1865: responsable de una pequeña biblioteca médica (1.800 a 50.000 ejemplares) Crea un catálogo de la biblioteca (Index Catalogue) y un índice periódico de la literatura biomédica de su época (Index Medicus) en 1879 Library of the Surgeon General’s Office en Washington (núcleo de la NLM)
  • 6. Index Medicus (1879-2004) Medlars 1964 Medline 1971 PubMed 1997- A. Gore: “PubMed puede hacer más para reformar y mejorar la calidad de la atención sanitaria en los EEUU que cualquier otra cosa que hayamos hecho en mucho tiempo”
  • 7. 1964: MEDLARS MEDical Literature Analysis and Retrieval System 1971: MEDLINE (MEDLARS Online) 1997: gratuita en la web Los bibliotecarios y especialistas en información buscaban por los investigadores y profesionales de la salud
  • 9. 25 millones de referencias Más de 6.000 revistas Carácter biomédico 83% con resumen >90% en inglés
  • 10. Algunas nociones Registro o asiento (record): el conjunto de información que se refiere a una misma publicación. Esta información está dividida en campos Lenguaje natural: el mismo lenguaje que usamos; inconvenientes: variabilidad sinonimia polisemia Palabras clave Lenguaje artificial: documental Descriptor: término escogido para designar a un único concepto
  • 11. CONTENIDOS Registros agrupados por materias Agrupados por su situación de registro Agrupados por la especialidad de la revista de procedencia SIDA (2.8%) Bioética (1.9%) Medicina alternativa y complementaria (3.7%) Historia de la Medicina (1.2%) MEDLINE (93.3%) Toxicología (13.6%) Revisiones sistemáticas (1.6%) Cáncer (26.6%) Proporcionados por el editor de la revista (2.5%) En catalogación e indización - in process (2.1%) Con proceso documental terminado (95.4%) A texto completo – PubMed Central (2.8%) Selección de revistas nucleares más importantes (9.6%) Odontología (1.7%) Enfermería (2.8%) SIDA/VIH (1.2%) Administración de salud (1.4%) Historia de la Medicina (0.5%) Bioética (0.6%)
  • 12. LA INFORMACIÓN SE ORGANIZA EN CAMPOS Etiquetas (tags) Nombre Descripción AB AD AU DP IS LA MH PL PS PT SB SH TA TI TT Abstract Affiliation Author Publication date ISSN Languaje MeSH Terms Place of Publication Personal Name Publication Type Subset Subheadings Title abbreviation Title Transliterated/Vernacular title Abstract. Resumen del artículo Dirección institucional del primer autor Apellidos e iniciales del nombre de los autores Fecha en que fue publicado el artículo International Standard Serial Number de la revista Idioma en que ha sido publicado el artículo Descriptores adjudicados para describir la temática del artículo País de la publicación de la revista Nombre de persona como materia Tipo de material que el artículo presenta Subconjunto/s en que ha sido incluido el artículo Subencabezamientos Nombre abreviado de la revista Título, en inglés, del artículo Título del artículo en el idioma original
  • 15.
  • 16. BÚSQUEDA EN LENGUAJE NATURAL Términos asociados al problema que nos preocupa: Cómo y con qué términos le pediríamos la información a un compañero
  • 17. BÚSQUEDA EN LENGUAJE NATURAL Términos asociados al problema que nos preocupa: Cómo y con qué términos le pediríamos la información a un compañero
  • 18. BÚSQUEDA DIRIGIDA A CAMPOS Y SUBGRUPOS ESPECÍFICOS DE REGISTROS: entrecomillado
  • 19. BÚSQUEDA DIRIGIDA A CAMPOS Y SUBGRUPOS ESPECÍFICOS DE REGISTROS: qué campo se ha de buscar
  • 20. USO DE OPERADORES BOOLEANOS AND, OR, NOT: Siempre en mayúsculas AND: seleccionará todos los registros OR: operador de inclusión Truncado de términos: Ej: pediatr* NOT: operador de exclusión Cuidado con el orden Se pueden combinar: A OR B* AND C NOT D AND...OR... hmm.. NOT? George Boole (1815-65)
  • 21. ACOTADO AUTOMÁTICO DE TÉRMINOS (ATM) Cancer OR pediatrics Cancer NOT pediatrics Cancer AND pediatrics Cancer Pediatrics Pediatrics NOT cancer
  • 22. USO DE OPERADORES BOOLEANOS A OR ((B* AND C) NOT D) Seleccionará los registros que cumplen B* De entre estos, seleccionará solo los que, además, cumplen C De los resultantes excluirá los que cumplen D Al grupo restante añadirá todos los que cumplen A, cumplan o no alguno de los B*, C o D
  • 25. Del lenguaje natural al documental: descriptores Búsqueda menos exhaustiva, pero más precisa Tesauro MeSH BÚSQUEDAS MESH
  • 26. PRIMER PASO: "TRADUCIR" LA PALABRA CLAVE AL DESCRIPTOR CORRESPONDIENTE
  • 27.
  • 28.
  • 29.
  • 30. x
  • 31.
  • 32.
  • 33.
  • 34.
  • 35.
  • 37.
  • 38.
  • 39.
  • 40.
  • 41.
  • 42. Problemas para almacenar la información • Inversión de tiempo para generar las referencias • Deficiencia en la identificación de datos necesarios para elaborar dichas referencias • Elección del estilo bibliográfico adecuado ¿Para qué nos van a servir? • Ayudar a la creación de un biblioteca personal • Recolección de referencias bibliográficas u otros tipos de reseñas • Creación bibliográficas • Facilitar la redacción de la lista de referencias bibliográficas • Imprescindibles para una revisión sistemática, tesis, investigación, artículo original • Nuestro archivo-biblioteca
  • 43.
  • 44.
  • 45.
  • 46.
  • 47.
  • 48.
  • 49.
  • 50.
  • 51.
  • 52.
  • 53.
  • 54.
  • 55.
  • 56.
  • 57.
  • 58.

Notes de l'éditeur

  1. John Shaw Billings nació en Indiana el 12 de abril de 1838 y murió el 11 de marzo de 1913. Ha sido el bibliotecario y cirujano más conocido como el renovador de la Biblioteca de la Oficina General del Ejército de Estados Unidos (Library of the Surgeon General's Office of the Army) y como el primer director de la Biblioteca Pública de Nueva York. Durante la Guerra Civil americana, llegó ser jefe de la Library of the Surgeon General's Office en Washington, que más tarde sería el núcleo de la NLM (National Library of Medicine). Fue el responsable de la creación del Index Medicus y del Index Catalogue of the Surgeon General's Office.
  2. Como ya hemos dicho, el El Index Medicus comenzó a editarse en 1879 por John Shaw Billings. Tenía una periodicidad mensual. Existió otra versión acumulada anual, el CUMULATED INDEX MEDICUS, publicada en papel desde 1960 hasta 2004. También existió una versión reducida desde 1970 hasta 1997 llamada ABRIGDE INDEX MEDICUS con la indización de revistas nucleares. En su comienzo, el enorme volumen de citas bibliográficas se recopilaron manualmente. En 1957 el personal de la NLM comenzó a planificar la mecanización del Index Medicus, dado que lo que se necesitaba era una manera de manipular toda esta información para producir productos auxiliares como índices impresos, catálogos y bibliografías temáticas. En 1960 se preparó un pliego de condiciones detalladas, y para la primavera de 1961 se envió a 72 empresas una solicitud de propuestas para desarrollar el sistema. Como resultado, se adjudicó un contrato a la empresa General Electric. Así nació MEDLARS® en 1964. MEDLARS® (MEDical Literature Analysis and Retrieval System), etimológicamente significa “Análisis de la literatura médica y Sistemas de Recuperación de Datos”. MEDLARS® tuvo un coste de $ 3 millones para su desarrollo y en el momento de su conclusión no permitía el acceso al público. Rápidamente, la NLM puso a disposición de determinadas instituciones las cintas magnéticas con los datos del sistema disponible para establecer servicios descentralizados de búsqueda en todo el país. En 1971 pasó a llamarse MEDLINE  (MEDLARS Online). Para la búsqueda eficaz en los primeros MEDLINE hacía falta un entrenamiento especial en los encabezamientos de materia, los comandos de búsqueda y la lógica booleana. Además, la consulta era muy costosa pues se realizaba a través de módem telefónico. Por esto los bibliotecarios y especialistas en información buscaban por los investigadores y profesionales de la salud (búsquedas mediadas, con intermediario). Las cintas de datos MEDLINE llegó a estar disponible en la suscripción a las universidades y centros de MEDLARS internacionales. Con posterioridad se comercializó MEDLINE en CD-ROM, lo que posibilitó la búsqueda directa de los usuarios, pues el coste ya no estaba ligado a una conferencia telefónica. El 26 de junio de 1997, MEDLINE estuvo disponible de forma gratuita en la Web. La NLM inauguró el acceso gratuito a nivel mundial a MEDLINE a través de PubMed, un nuevo sistema de acceso creado por la NCBI de la NLM.  El vicepresidente Gore, quien participó en el anuncio, dijo que este avance "puede hacer más para reformar y mejorar la calidad de la atención sanitaria en los Estados Unidos que cualquier otra cosa que hemos hecho en mucho tiempo."  Su uso ha aumentado de manera exponencial.
  3. Como ya hemos dicho, el El Index Medicus comenzó a editarse en 1879 por John Shaw Billings. Tenía una periodicidad mensual. Existió otra versión acumulada anual, el CUMULATED INDEX MEDICUS, publicada en papel desde 1960 hasta 2004. También existió una versión reducida desde 1970 hasta 1997 llamada ABRIGDE INDEX MEDICUS con la indización de revistas nucleares. En su comienzo, el enorme volumen de citas bibliográficas se recopilaron manualmente. En 1957 el personal de la NLM comenzó a planificar la mecanización del Index Medicus, dado que lo que se necesitaba era una manera de manipular toda esta información para producir productos auxiliares como índices impresos, catálogos y bibliografías temáticas. En 1960 se preparó un pliego de condiciones detalladas, y para la primavera de 1961 se envió a 72 empresas una solicitud de propuestas para desarrollar el sistema. Como resultado, se adjudicó un contrato a la empresa General Electric. Así nació MEDLARS® en 1964. MEDLARS® (MEDical Literature Analysis and Retrieval System), etimológicamente significa “Análisis de la literatura médica y Sistemas de Recuperación de Datos”. MEDLARS® tuvo un coste de $ 3 millones para su desarrollo y en el momento de su conclusión no permitía el acceso al público. Rápidamente, la NLM puso a disposición de determinadas instituciones las cintas magnéticas con los datos del sistema disponible para establecer servicios descentralizados de búsqueda en todo el país. En 1971 pasó a llamarse MEDLINE  (MEDLARS Online). Para la búsqueda eficaz en los primeros MEDLINE hacía falta un entrenamiento especial en los encabezamientos de materia, los comandos de búsqueda y la lógica booleana. Además, la consulta era muy costosa pues se realizaba a través de módem telefónico. Por esto los bibliotecarios y especialistas en información buscaban por los investigadores y profesionales de la salud (búsquedas mediadas, con intermediario). Las cintas de datos MEDLINE llegó a estar disponible en la suscripción a las universidades y centros de MEDLARS internacionales. Con posterioridad se comercializó MEDLINE en CD-ROM, lo que posibilitó la búsqueda directa de los usuarios, pues el coste ya no estaba ligado a una conferencia telefónica. El 26 de junio de 1997, MEDLINE estuvo disponible de forma gratuita en la Web. La NLM inauguró el acceso gratuito a nivel mundial a MEDLINE a través de PubMed, un nuevo sistema de acceso creado por la NCBI de la NLM.  El vicepresidente Gore, quien participó en el anuncio, dijo que este avance "puede hacer más para reformar y mejorar la calidad de la atención sanitaria en los Estados Unidos que cualquier otra cosa que hemos hecho en mucho tiempo."  Su uso ha aumentado de manera exponencial.