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Estudio comparativo de dos
técnicas para la detección y
  tipificación del Virus del
     Papiloma Humano



Genómica Clart Papillomavirus 2 y
      Cervista™ HPV HR
EL VIRUS DEL PAPILOMA HUMANO (HPV)




De la família de los Papovirus: virus pequeños de 55nm de diámetro,
sin envoltura de DNA y con una cápside icosaédrica compuesta de 72
capsómeros que envuelven el genoma. Poseen doble cadena circular
que puede integrarse en el material genético de las células a las que
infecta.
La infección por HPV puede




  NO SER                       FORMAR                    CONDUCIR A
 EVIDENTE                    CONDILOMAS                  NEOPLASIAS

La infección por
                                                        El cáncer de cuello
HPV no ocasiona
                            Los HPV tipos 6 y 11        uterino está provocado
ninguna reacción
                            producen un intenso         por una infección
celular inflamatoria
                            ensanchamiento de la        persistente del HPV de
en la citología, pero
                            zona de cornificación
es posible que exista                                   alto riesgo,
                            superficial que no tienen
una reacción                                            especialmente de los
                            ningún potencial
simultánea de este                                      tipos 16 y 18.
                            precanceroso.
tipo por otras
razones.
Carcinogénesis controlada
Carcinogénesis descontrolada
Tipos de virus
Tipos de virus




- La actual clasificación se basa en la comparación de la
secuencia de ADN de E6, E7 y L1 con la misma de todos los
VPH conocidos. Una homología inferior al 90% supone un nuevo
tipo, mientras que una superior al 90%, un subtipo del tipo
anteriormente descrito.
CAMBIOS CITOLÓGICOS ASOCIADOS

La infección por el HPV suele asociarse a los cambios o
anomalías de las células escamosas de bajo grado (L-SIL):


   - Células escamosas maduras con forma poligonal

   - Núcleos aumentados 3-4 veces el tamaño del núcleo de una célula intermedia con
   ligera variación en tamaño y forma.

   - Una interpretación de LSIL/HPV requiere cavitaciones citoplasmáticas
   acompañadas de la morfología atípica descrita anteriormente.
Las células basales infectadas maduran durante su migración transepidérmica hasta formar células superficiales.
En el estadio de células intermedias y superficiales son segregados fuera del núcleo productos metabólicos virales
que dañan el citoplasma, por lo que se forman halos perinucleares irregulares.
Protocolo de cribaje del HPV


Las directrices para el diagnóstico precoz del cáncer de cuello
uterino recomiendan analizar la presencia de tipos HPV de alto
riesgo junto con la citología.

Las recomendaciones principales de las directrices de práctica
profesional incluyen:

1) el diagnóstico precoz de mujeres de más de 30 años

2) tratamiento de mujeres de más de 20 años con ASC-US.
CERVISTA HPV HR
El Cervista TM HPV HR es una prueba de diagnóstico cualitativo in vitro para
    la detección de ADN de los 14 tipos de HPV de alto riesgo basada en la
                           amplificación de señal.
Finalidad de la prueba




1. Guiar el tratamiento de la paciente junto con la citología cervical en mujeres mayores
de 30 años.

2. Determinar la necesidad de realizar una colposcopia en pacientes cuyos resultados de
la prueba de Papanicolaou son células escamosas atípicas de significado indeterminado
(ASC-US).
Principios del protocolo

Cervista TM HPV HR es una prueba de diagnóstico cualitativo in
vitro para la detección de ADN de los 14 tipos de HPV de alto
riesgo, entre los que se encuentran los siguientes: 16, 18, 31, 33,
35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 y 68.

La prueba utiliza la química Invader, un método de amplificación
de señal para la detección de secuencias de ácido nucleico
específicas. El método usa dos reacciones isotérmicas: una
reacción primaria que se realiza en la secuencia de ADN diana y
una reacción secundaria que produce una señal fluorescente.
Tipos de muestra



                   La técnica de Cervista
                   se realiza con las
                   muestras
                   cervicouterinas que se
                   recogen en el vial con
                   la solución
                   PreservCyt, el sistema
                   de conservación de
                   ThinPrep para
                   pruebas de
                   Papanicolaou.
Materiales
Reactivos no suministrados
Equipos
Equipos
Equipos
Equipos
PROTOCOLO
 Extracción de DNA
Reactivos del kit Genfind
PROTOCOLO
 Reacción invader
Reactivos para la reacción invader
HPV Oligo Mix



Tres mezclas de oligonucleótidos, que detectan los 14 tipos de
HPV agrupados según tipos víricos con secuencias de ADN
semejantes concretamente en las regiones L1, E5 y E6.

    - HPV Oligo Mix 1: Oligonucleótidos con afinidad por los tipos HPV 51, 56 y 66


     - HPV Oligo Mix 2 : Oligonucleótidos con afinidad por los tipos HPV 18, 39, 45,
59 y 68

     -HPV Oligo Mix 3 : Oligonucleótidos con afinidad por los tipos HPV 16, 31, 33,
35, 52 y 58
Control interno y control negativo



- Los controles internos son oligonucleótidos que se unen al gen
histona humano 2 (H2be, HIST2H2BE) y producen una señal
semicualitativa del ADN genómico presente en la muestra.

-El control sin molde o control negativo está compuesto por
tRNA de levadura.
Colocación de los controles positivos y negativos, y de las
muestras, en una placa de 96 pocillos.
RESULTADOS
 Lectura de la placa
GENÓMICA CLART
           PAPILOMAVIRUS 2
El kit está basado en la amplificación de fragmentos específicos del genoma
vírico y su posterior hibridación con sondas específicas para cada tipo de HPV.
Principios del protocolo



- Detecta la presencia de 35 virus de HPV (6, 11, 16, 18, 26, 31, 33, 35, 39, 40, 42, 43,
44, 45, 51, 52, 53, 54, 56, 58, 59, 61, 62, 66, 68, 70, 71, 72, 73, 81, 82, 83, 84, 85 y 89)

- Amplificación de un fragmento de unos 450 pb dentro de la región L1 del virus por
tratarse de una secuencia que está altamente conservada entre los distintos tipos de
HPV

- Visualización del producto amplificado por PCR mediante microarrays de baja
densidad
Tipos de muestra



                   - Torundas o cepillos

                   - Suspensiones celulares en
                   viales de ThinPrep

                   - Tejido fijado en formol e
                   incluido en parafina.
Materiales
Equipos
Equipos
Equipos
PROTOCOLO
  Pretratamiento
Pretratamiento
PROTOCOLO
Extracción, purificación y amplificación
Reactivos
PROTOCOLO
  Visualización
Reactivos
Hibridación y conjugado
Revelado
Resultados




- El análisis de los microarrays se realiza de forma automatizada con SAICLART, el
software de procesamiento de microarrays de GENOMICA.

- Se detectan e interpretan automáticamente los genotipos presentes en la imagen.

- Los resultados del análisis son procesados por un lector con un software específico
que automáticamente detecta e interpreta los genotipos presentes, obteniendo un
informe de cada una de las pruebas.
Controles de calidad



Introducción de dos controles internos en el mismo tubo de reacción donde se analiza la muestra para eliminar
falsos negativos:

            - Oligos que amplifican un fragmento del gen CFTR como control del ADN de la muestra .

            - Oligos que amplifican un plásmido modificado como control de la reacción de amplificación.


Los dos controles internos se amplifican simultáneamente junto con el HPV en un único tubo de reacción.

      - Oligos específicos de HPV como control de calidad de la extracción. Se añade a cada experimento un
control externo. La muestra debe haber sido testada anteriormente para controlar la calidad del DNA genómico,
pero no necesariamente debe ser HPV positiva.
CASOS REALES
Comparación entre las dos técnicas
Caso 1
Caso 2
VENTAJAS E
INCONVENIENTES
   Cervista vs. Genómica
CERVISTA                   GENÓMICA

  VENTAJAS       - ELEVADA SENSIBILIDAD (L1,   - ALTA ESPECIFICIDAD
                 E5,E6)                        - DETECTA HPV DE ALTO
                 - VALOR PREDICTICO            Y BAJO RIESGO
                 NEGATIVO 99%                  - PUEDE HACERSE CON
                 - NO REACTIVIDAD CRUZADA      BIOPSIAS,
                 CON HPV BAJO RIESGO           SUSPENSIONES
                 - CONTROL HISTONA HUMANA      CELULARES, TORUNDAS
                 2                             O CEPILLOS
                 - ALTA REPRODUCTIBILIDAD
                 -RÁPIDA



INCONVENIENTES   - NO DETECTA HPV BAJO         - BAJA SENSIBILIDAD
                 RIESGO                        - FALSOS NEGATIVOS
                 - REACTIVIDAD CRUZADA CON
                 HPV RIESGO DESCONOCIDO
                 - FALSOS NEGATIVOS POR
                 NIVELES BAJOS DE INFECCIÓN
                 - CASOS "BORDERLINE"
                 - SOLO MUESTRAS THINPREP
CERVISTA                 GENÓMICA

  EXTRACCIÓN      PERLAS MAGNÉTICAS           COLUMNA

MARCAJE DEL DNA   REACCIÓN DE AMPLIFICACIÓN   PCR QUE MARCA EL
VÍRICO            QUE MARCA EL DNA VÍRICO     DNA VÍRICO CON
                  CON MOLÉCULAS               BIOTINA
                  FLUORESCENTES
 VISUALIZACIÓN    LECTOR DE FLUORESCENCIA     TUBOS DE ARRAY CON
                                              SONDAS
OTRAS TÉCNICAS DE
DETECCIÓN DEL HPV
-Pruebas de HPV (captura de híbridos II, PCR de consenso,
Amplicor Human Papillomavirus Test)
-Genotipado de HPV (genotipado con PCR de consenso,
microarrays, PCR específica, genotipado con captura híbrida)
- PCR a tiempo real
- Transcripción de ARNm
-Determinación de oncoproteínas por IHQ
-Determinación de p16INK4a
-Cribado con citología
-Cribado con prueba de HPV
CONCLUSIÓN
Estudio comparativo de dos técnicas para la detección y tipificación del VPH: Genómica Clart Papillomavirus 2 y CervistaTM HPV HR
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Estudio comparativo de dos técnicas para la detección y tipificación del VPH: Genómica Clart Papillomavirus 2 y CervistaTM HPV HR

  • 1. Estudio comparativo de dos técnicas para la detección y tipificación del Virus del Papiloma Humano Genómica Clart Papillomavirus 2 y Cervista™ HPV HR
  • 2. EL VIRUS DEL PAPILOMA HUMANO (HPV) De la família de los Papovirus: virus pequeños de 55nm de diámetro, sin envoltura de DNA y con una cápside icosaédrica compuesta de 72 capsómeros que envuelven el genoma. Poseen doble cadena circular que puede integrarse en el material genético de las células a las que infecta.
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  • 4. La infección por HPV puede NO SER FORMAR CONDUCIR A EVIDENTE CONDILOMAS NEOPLASIAS La infección por El cáncer de cuello HPV no ocasiona Los HPV tipos 6 y 11 uterino está provocado ninguna reacción producen un intenso por una infección celular inflamatoria ensanchamiento de la persistente del HPV de en la citología, pero zona de cornificación es posible que exista alto riesgo, superficial que no tienen una reacción especialmente de los ningún potencial simultánea de este tipos 16 y 18. precanceroso. tipo por otras razones.
  • 8. Tipos de virus - La actual clasificación se basa en la comparación de la secuencia de ADN de E6, E7 y L1 con la misma de todos los VPH conocidos. Una homología inferior al 90% supone un nuevo tipo, mientras que una superior al 90%, un subtipo del tipo anteriormente descrito.
  • 9. CAMBIOS CITOLÓGICOS ASOCIADOS La infección por el HPV suele asociarse a los cambios o anomalías de las células escamosas de bajo grado (L-SIL): - Células escamosas maduras con forma poligonal - Núcleos aumentados 3-4 veces el tamaño del núcleo de una célula intermedia con ligera variación en tamaño y forma. - Una interpretación de LSIL/HPV requiere cavitaciones citoplasmáticas acompañadas de la morfología atípica descrita anteriormente.
  • 10. Las células basales infectadas maduran durante su migración transepidérmica hasta formar células superficiales. En el estadio de células intermedias y superficiales son segregados fuera del núcleo productos metabólicos virales que dañan el citoplasma, por lo que se forman halos perinucleares irregulares.
  • 11. Protocolo de cribaje del HPV Las directrices para el diagnóstico precoz del cáncer de cuello uterino recomiendan analizar la presencia de tipos HPV de alto riesgo junto con la citología. Las recomendaciones principales de las directrices de práctica profesional incluyen: 1) el diagnóstico precoz de mujeres de más de 30 años 2) tratamiento de mujeres de más de 20 años con ASC-US.
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  • 13. CERVISTA HPV HR El Cervista TM HPV HR es una prueba de diagnóstico cualitativo in vitro para la detección de ADN de los 14 tipos de HPV de alto riesgo basada en la amplificación de señal.
  • 14. Finalidad de la prueba 1. Guiar el tratamiento de la paciente junto con la citología cervical en mujeres mayores de 30 años. 2. Determinar la necesidad de realizar una colposcopia en pacientes cuyos resultados de la prueba de Papanicolaou son células escamosas atípicas de significado indeterminado (ASC-US).
  • 15. Principios del protocolo Cervista TM HPV HR es una prueba de diagnóstico cualitativo in vitro para la detección de ADN de los 14 tipos de HPV de alto riesgo, entre los que se encuentran los siguientes: 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 y 68. La prueba utiliza la química Invader, un método de amplificación de señal para la detección de secuencias de ácido nucleico específicas. El método usa dos reacciones isotérmicas: una reacción primaria que se realiza en la secuencia de ADN diana y una reacción secundaria que produce una señal fluorescente.
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  • 18. Tipos de muestra La técnica de Cervista se realiza con las muestras cervicouterinas que se recogen en el vial con la solución PreservCyt, el sistema de conservación de ThinPrep para pruebas de Papanicolaou.
  • 26. Reactivos del kit Genfind
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  • 29. Reactivos para la reacción invader
  • 30. HPV Oligo Mix Tres mezclas de oligonucleótidos, que detectan los 14 tipos de HPV agrupados según tipos víricos con secuencias de ADN semejantes concretamente en las regiones L1, E5 y E6. - HPV Oligo Mix 1: Oligonucleótidos con afinidad por los tipos HPV 51, 56 y 66 - HPV Oligo Mix 2 : Oligonucleótidos con afinidad por los tipos HPV 18, 39, 45, 59 y 68 -HPV Oligo Mix 3 : Oligonucleótidos con afinidad por los tipos HPV 16, 31, 33, 35, 52 y 58
  • 31. Control interno y control negativo - Los controles internos son oligonucleótidos que se unen al gen histona humano 2 (H2be, HIST2H2BE) y producen una señal semicualitativa del ADN genómico presente en la muestra. -El control sin molde o control negativo está compuesto por tRNA de levadura.
  • 32. Colocación de los controles positivos y negativos, y de las muestras, en una placa de 96 pocillos.
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  • 36. GENÓMICA CLART PAPILOMAVIRUS 2 El kit está basado en la amplificación de fragmentos específicos del genoma vírico y su posterior hibridación con sondas específicas para cada tipo de HPV.
  • 37. Principios del protocolo - Detecta la presencia de 35 virus de HPV (6, 11, 16, 18, 26, 31, 33, 35, 39, 40, 42, 43, 44, 45, 51, 52, 53, 54, 56, 58, 59, 61, 62, 66, 68, 70, 71, 72, 73, 81, 82, 83, 84, 85 y 89) - Amplificación de un fragmento de unos 450 pb dentro de la región L1 del virus por tratarse de una secuencia que está altamente conservada entre los distintos tipos de HPV - Visualización del producto amplificado por PCR mediante microarrays de baja densidad
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  • 40. Tipos de muestra - Torundas o cepillos - Suspensiones celulares en viales de ThinPrep - Tejido fijado en formol e incluido en parafina.
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  • 56. Resultados - El análisis de los microarrays se realiza de forma automatizada con SAICLART, el software de procesamiento de microarrays de GENOMICA. - Se detectan e interpretan automáticamente los genotipos presentes en la imagen. - Los resultados del análisis son procesados por un lector con un software específico que automáticamente detecta e interpreta los genotipos presentes, obteniendo un informe de cada una de las pruebas.
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  • 60. Controles de calidad Introducción de dos controles internos en el mismo tubo de reacción donde se analiza la muestra para eliminar falsos negativos: - Oligos que amplifican un fragmento del gen CFTR como control del ADN de la muestra . - Oligos que amplifican un plásmido modificado como control de la reacción de amplificación. Los dos controles internos se amplifican simultáneamente junto con el HPV en un único tubo de reacción. - Oligos específicos de HPV como control de calidad de la extracción. Se añade a cada experimento un control externo. La muestra debe haber sido testada anteriormente para controlar la calidad del DNA genómico, pero no necesariamente debe ser HPV positiva.
  • 61. CASOS REALES Comparación entre las dos técnicas
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  • 65. VENTAJAS E INCONVENIENTES Cervista vs. Genómica
  • 66. CERVISTA GENÓMICA VENTAJAS - ELEVADA SENSIBILIDAD (L1, - ALTA ESPECIFICIDAD E5,E6) - DETECTA HPV DE ALTO - VALOR PREDICTICO Y BAJO RIESGO NEGATIVO 99% - PUEDE HACERSE CON - NO REACTIVIDAD CRUZADA BIOPSIAS, CON HPV BAJO RIESGO SUSPENSIONES - CONTROL HISTONA HUMANA CELULARES, TORUNDAS 2 O CEPILLOS - ALTA REPRODUCTIBILIDAD -RÁPIDA INCONVENIENTES - NO DETECTA HPV BAJO - BAJA SENSIBILIDAD RIESGO - FALSOS NEGATIVOS - REACTIVIDAD CRUZADA CON HPV RIESGO DESCONOCIDO - FALSOS NEGATIVOS POR NIVELES BAJOS DE INFECCIÓN - CASOS "BORDERLINE" - SOLO MUESTRAS THINPREP
  • 67. CERVISTA GENÓMICA EXTRACCIÓN PERLAS MAGNÉTICAS COLUMNA MARCAJE DEL DNA REACCIÓN DE AMPLIFICACIÓN PCR QUE MARCA EL VÍRICO QUE MARCA EL DNA VÍRICO DNA VÍRICO CON CON MOLÉCULAS BIOTINA FLUORESCENTES VISUALIZACIÓN LECTOR DE FLUORESCENCIA TUBOS DE ARRAY CON SONDAS
  • 69. -Pruebas de HPV (captura de híbridos II, PCR de consenso, Amplicor Human Papillomavirus Test) -Genotipado de HPV (genotipado con PCR de consenso, microarrays, PCR específica, genotipado con captura híbrida) - PCR a tiempo real - Transcripción de ARNm -Determinación de oncoproteínas por IHQ -Determinación de p16INK4a -Cribado con citología -Cribado con prueba de HPV