Presentación para el IV Simposio Estudiantil ¿Cómo se enseña a investigar? de Facultad de Medicina de la Universidad de Antioquia. Mayo, 2018.

1. Ciencia abierta y
gestión de datos de
investigación
Paola Andrea Ramírez
Bibliotecóloga
paolandrea@gmail.com

2. Ciencia abierta
(el nombre nuevo de una idea vieja)
Cuando la internet empezó a ser usada en la
comunicación entre académicos y apropiada en los
sistemas de información científica, se asumío su
potencial para dinamizar el ciclo de transferencia de
la información en general y la científica en particular.
Muchas barreras pudieron superarse y rápidamente
aparecieron recursos para compartir información
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

3. 1991 – ArXiv. Ucornell – preprints
1996 – Internet Public Library
Acceso Abierto
PUBLICACIONES
1997 – Hindwai, El Cairo – preprints
1997 – Scielo Brasil
1998 – SPARC Scholary Publishing and Academics
Resource Coallition de la ARL
2000 – PudMed / Medline Biblioteca Nacional de Medicina
2000 – Creative Commons Licences
2000 – Wikipedia
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

4. La información
como bien comercial
En paralelo al desarrollo de la www/http, las bases de datos
comerciales aumentaron imperativamente su mercado,
redujeron las condiciones de acceso y suprimieron la
adquisición de colecciones propias para las bibliotecas.
Al final de la primera década del 2000, dos empresas
(Springer y Elsevier) dominaban las suscripciones a las
publicaciones seriadas científicas y académicas.
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

5. La bibliometria no es un
método para evaluar la ciencia
(y la cienciometria es un negocio más rentable que BMW)
La eficiencia de los métodos aplicados por la bibliometria para
la gestión de colecciones ha sido aprovechada y explotada
hasta el absurdo como medio de la evaluación científica;
promovida y patrocinada por los sistemas comerciales de
rankings universitarios, ha dado visos de rigurosidad a un
sistema fraudulento de evaluación de la calidad académica del
cual debemos salir tan pronto como nos sea posible.
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

6. Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

7. http://www.bpeasia.com/news/161003-thomson-reuters/
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

8. Los rankings universitarios
y el negocio de la medición
ó ¿Cómo permitimos que esto pasara?
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

9. Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

10. El efecto…
… demerita lo avanzado
ante el publico no
especializado.
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

11. Para saber más…
((Publications[MeSH] OR Publishing[MeSH] OR publi*[ti] OR Biomedical
Research[MeSH] OR Periodicals as Topic[MeSH] OR journal[ti]) AND (Duplicate
Publication as Topic[MeSH] OR Retraction of Publication as Topic[MeSH] OR
retraction[tiab] OR Plagiarism[MeSH] OR plagiarism[tiab] OR Scientific
Misconduct[MeSH] OR fraud[tiab] OR misconduct[tiab])) AND systematic[sb]
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

12. Los investigadores están pagando por producir el conocmiento,
por publicar los artículos (traducciones, acceso abierto)
y también por acceder a las publicaciones.
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

13. Entonces empezamos a
reacionar… 2002 – Budapest Open Access Innitiative
2003 – Declaración de Berlín. Max Plank Institute
2003 – Declaración de San Franciso on Research Assessment
American Society for Cell Biology (ASCB)
2015 – Manifiesto de Leiden. 10 Principles to guide research evaluation
2014 - Horizon 2020 EU Research and Innovation Programme
La Ciencia Abierta como
iniciativa internacional
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

14. https://www.fosteropenscience.eu/
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

15. Gestión de datos
de investigación
O ¿cómo hacer que los datos
estén y sean
Image CC 4.0 SangyaPundir
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

16. 0. Responsabilidades
¿De quién son los datos?
¿Quiénes son los creadores de datos?
¿Quiénes pueden modificarlos/usarlos?
 Asignar roles en el equipo de investigación
 Definir las responsabilidades sobre los datos
 Identificar los vacíos/necesidades para la gestión
 Establecer formación continua para el grupo
 Hacer plan de seguimiento/mejoramiento
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

17. Plan de Gestión de Datos
Data
Management
Plans
http://www.dcc.ac.uk/resources/curation-lifecycle-model
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

18. Plan de Gestión de Datos
Documento/Guía que incluye todas las etapas
del ciclo de vida de los datos para:
• Facilitar su gestión durante la investigación
• Establecer las condiciones de uso y reuso
• Garantizar la preservación y conservación a
mediano y largo plazo
Debe conformarse según las condiciones de las
instituciones financiadoras y las características
propias del tipo de investigación
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

19. http://www.databaseanswers.org/data_models/research_lifecycle/print_version.htm
Good Practice in
Research Data
Management
from Oxford
University
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

20. 1. Información general
Descripción suscinta de la investigación
• Investigación – Convocatoria - Financiador
• Objetivos, metodología, resultados esperados
• Cronograma y recursos
• Investigadores y responsables
Establece el marco del DMP
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

21. 2. Datos de la Investigación
Caracterización de los datos a producir/reproducer
durante la investigación
• Tipología, formatos, protocolos
• Software, bases de datos
• Condiciones de recolección
• Criterios de calidad
Define el conjunto de datos para el desarrollo de
la investigación y sus usos posteriores
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

22. 4. Sistema de Metadatos
Caracterización de los datos a producir
durante la investigación
• Taxonomías por áreas del conocmiento
• Campos definidos para tipos de datos
• Protocolos internacionales de comunicación
• Códigos y normas de identificación
Información legible para las máquinas
permite la integración de los datos a los
sistemas automatizados
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

23. Información pertinente para los humanos
permite la comprensión y valoración de los datos
• Condiciones de creación, síntesis y análisis
• Identificación de variables, parámetros de captura
• Características de los programas/software usados
• Estructura del sistema de archivo
3. Documentación
Descripción de los datos según las
condiciones de la investigación que los crea
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

24. • Legislación nacional e internacional aplicable
• Condiciones de los financiadores y creadores
• Requisitos de acceso, uso y reuso
• Tiempos y plazos de acceso, uso y reuso
5. Aspectos éticos y legales
Condiciones de privacidad y propiedad para el
uso y reuso de los datos
Derechos y deberes éticos y legales
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

25. • Organización/Estructura del archivo
• Denominación de archivos y sets de datos
• Procedimientos/Permisos de creación y modificación
• Responsables y roles de uso y acceso
6. Gestión del archivo de la
investigación
Procesos, rutinas y protocolos de gestión
durante la investigación
Crear el sistema de archivo y
favorecer el proceso de investigación
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

26. • Procedimiento de almacenamiento y actualización
• Responsabilidades y roles de acceso y uso
• Riesgos de seguridad y conservación
• Protocolos para copias de respaldo
7. Almacenamiento y
Respaldo (backup)
Condiciones y recursos de conservación
durante la investigación
Garantizar la existencia y preservación
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

27. • Identificación de repositorios o publicaciones
• Condiciones de acceso y publicación de datos
• Definición de tiempos y recursos de preservación
8. Selección y Preservación
Definición de los set de datos a
publicar/repositar y criterios de conservación
a mediano y largo plazo
Garantizar la preservación y facilitar la reutilización
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

28. • Quién, cuándo y cómo puede acceder a los datos
• Condiciones y permisos de reutilización
• Riesgos y restricciones de acceso y reuso
9. Datos a Compartir
Establece las condiciones para el uso
posterior de los datos
Garantizar el acceso y facilitar la reutilización
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

29. • Personas/Dependencias/Instituciones con sus roles
• Sofware/Hardware y servicios técnicos
• Costos y pagos relacionados
10. Responsabilidades y
Recursos
Establece los roles y las necesidades del Plan
Facilitar el cumplimiento, seguimiento y
evaluación del Plan
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

30. OPEN SCIENCE PRIZE
https://datascience.nih.gov/community/engagement/openscienceprize
OS Prize 2017 winner
https://nextstrain.org/zika
Para saber más…
EBI RDF Platform
https://www.ebi.ac.uk/rdf/
BIO 2R DF
http://bio2rdf.org/
HyQue
http://hyque.semanticscience.org/learn
BioPortal
https://bioportal.bioontology.org/
Fairsharing
https://fairsharing.org/
Semantic Web in Systems Chemical Biology
https://chem2bio2rdf.wikispaces.com/
Linking Open Drug Data (LODD)
https://www.w3.org/wiki/HCLSIG/LODD
(open data[ti]) OR (open science[ti]) OR (data
sharing[ti]) OR (dataset[ti]) AND systematic[sb]
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez

31. Table 1. A list of the 16 Funding Opportunity Announcements (FOAs), organized according to goal and the specific
activity used to achieve the goal.
Dunn MC, Bourne PE (2017) Building the biomedical data science workforce. PLOS Biology 15(7): e2003082.
https://doi.org/10.1371/journal.pbio.2003082
http://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.2003082

32. Ciencia abierta y
gestión de datos de
investigación
Paola Andrea Ramírez
ORCID 0000-0002-6845-8224
Bibliotecóloga
paolandrea@gmail.com
Ciencia Abierta y Gestión de Datos de Investigación. Paola Andrea Ramírez