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Medline via l’interface
Pubmed
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BU Santé
Odontologie SO3 – septembr...
Ne pas confondre
Medline ≠ Pubmed
Le contenu
(la base de données)
L'interface
d'interrogation
Objectifs de la séance
 Connaître les principes de constitution de la
base Medline
 Se repérer dans Pubmed
 Savoir effe...
Medline, quelques principes
Spots – Loop_oh Flickr CC-BY-SA
Bases de données
 Un éditeur privé ou un
organisme institutionnel
 Un référencement humain
 Un thésaurus organisé
 Une...
Medline
 Qui?
 Quoi?
 Thésaurus MESH
 Interface PUBMED
(il en existe d'autres)
National Library of Medicine
Etats-Unis...
Pubmed, quelques repères
(interface web)
Compass Study – Calsidyrose – Flickr CC-BY
Vos premiers pas dans
Pubmed
 Recherche libre sur les anomalies des
dents temporaires
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
Présentation de la liste des
résultats
Quelques filtres
 Triez vos résultats pour n'afficher que
les articles écrits en anglais ou en
français
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Types d'articles : rappel
 Case report / étude de cas
 Clinical Trial / essai clinique
 Randomized Controlled Trial / e...
Pour des recherches fines : le Mesh
Needle and Thread – Incurable Hippie – Flickr CC-BY-NC
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...un thésaurus
Vocabulaire normalisé
Descripteurs
Hiérarchie
Plusieurs synonymes, un seul
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Teeth, Primary
Primary Tooth
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Le thésaurus de Medline :
le MeSH
Medical Subject Headings
Mots-clefs uniquement en anglais
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/me...
Le MESH
 Descripteurs (>25 000)
 Qualificatifs (83)
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Les opérateurs booléens
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Mesh anglais
=> « Portail terminologique de santé »
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http://pts.chu-rouen.fr/
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Exercices
1- Rechercher les affiliations
descripteurs/qualificatifs correspondant :
 le diagnostic de l'halitose
 les ca...
Réponses
1- Rechercher les affiliations
descripteurs/qualificatifs correspondant :
 au diagnostic de l'halitose
"halitosi...
1)À partir d'un mots-clef MESH ( boîte
d'équation de recherche et rebond)
3 façons d'entrer une
requête dans Pubmed
2) À partir du moteur de recherche
avancée (« Advanced »)
3 façons d'entrer une
requête dans Pubmed
3 façons d'entrer une
requête dans Pubmed
3) Directement dans la barre de
recherche simple
La veille dans Pubmed : services
personnalisés
Low-flying harrier – Wolfpix – CC-BY-SA flickr
My NCBI : votre Pubmed
personnalisé
 Ouvrir un compte sur My NCBI
 « Sign in »
 « Register for an account »
Paramétrer dans votre
compte les filtres suivants
 Anglais
 Français
 Texte intégral gratuit
 BU Santé Brest
Filtre « BU Santé Brest »
Icône UBO pour l'accès
direct au texte intégral
Exercice
2 – L'extraction des prémolaires
Limiter aux 5 dernières années de parution
Exercice
3. Le traitement de la carie radiculaire. Exclure la
prévention.
Limiter aux revues de la littérature publiées ce...
Du problème de la veille
équation de recherche ≠ équation de veille
Des mots MESH ?
.
Ne contient pas de
mots MESH
Contient des mots MESH
Exercice
4 - Trouvez les articles les plus récents
sur l'épulis congénitale du nouveau-
né
(sans utiliser les mots Mesh)
Solution : le champ
Title/abstract ou [tiab]
« gingival 
neoplasms/congenital »[Mesh] 
AND « infant, newborn »[Mesh]
Équat...
Créer une alerte dans MyNCBI
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Pubmed en odontologie - septembre 2013

  1. 1. 1 Medline via l’interface Pubmed Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBO BU Santé Odontologie SO3 – septembre 2013
  2. 2. Ne pas confondre Medline ≠ Pubmed Le contenu (la base de données) L'interface d'interrogation
  3. 3. Objectifs de la séance  Connaître les principes de constitution de la base Medline  Se repérer dans Pubmed  Savoir effectuer une requête pertinente dans la base  Savoir mettre en place des alertes sur un thème
  4. 4. Medline, quelques principes Spots – Loop_oh Flickr CC-BY-SA
  5. 5. Bases de données  Un éditeur privé ou un organisme institutionnel  Un référencement humain  Un thésaurus organisé  Une interface d'interrogation
  6. 6. Medline  Qui?  Quoi?  Thésaurus MESH  Interface PUBMED (il en existe d'autres) National Library of Medicine Etats-Unis) 20 M de références d'articles biomédicaux, issues de 5200 périodiques depuis 1948
  7. 7. Pubmed, quelques repères (interface web) Compass Study – Calsidyrose – Flickr CC-BY
  8. 8. Vos premiers pas dans Pubmed  Recherche libre sur les anomalies des dents temporaires http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
  9. 9. Présentation de la liste des résultats
  10. 10. Quelques filtres  Triez vos résultats pour n'afficher que les articles écrits en anglais ou en français  Précisez votre recherche en ne sélectionnant que les revues de la littérature
  11. 11. Types d'articles : rappel  Case report / étude de cas  Clinical Trial / essai clinique  Randomized Controlled Trial / essai clinique en aveugle avec groupe contrôle  Practice guideline / recommandation de bonne pratique  Review / revue de la littérature  Systematic Review / revue systématique  Meta-analysis / méta-analyse (Cochrane)
  12. 12. Pour des recherches fines : le Mesh Needle and Thread – Incurable Hippie – Flickr CC-BY-NC
  13. 13. S'il te plaît, dessine-moi... ...un thésaurus Vocabulaire normalisé Descripteurs Hiérarchie
  14. 14. Plusieurs synonymes, un seul descripteur officiel Deciduous Tooth Tooth, Primary Teeth, Primary Primary Tooth Teeth, Deciduous Deciduous Teeth Primary Teeth Tooth, deciduous
  15. 15. Le thésaurus de Medline : le MeSH Medical Subject Headings Mots-clefs uniquement en anglais http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh
  16. 16. Le MESH  Descripteurs (>25 000)  Qualificatifs (83)  « L'affiliation Descripteur / Qualificatif est la clé de l'interrogation de Medline »* *(citation de Philippe Eveillard dans « Comment faire ses premiers pas sur Pubmed » La Revue du praticien. Médecine générale A. 2007, n° 766-67, pp. 411-412)
  17. 17. Les opérateurs booléens .
  18. 18. Recherche libre vs. Équation de recherche Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques multiple sclerosis environmental factors 1320 résultats – pas tous pertinents « Multiple Sclerosis/etiology"[Mesh] AND environment[Mesh] 387 résultats pertinents
  19. 19. Exemple de résultat non- pertinent : la requête a porté indifféremment sur toutes les parties de la notice Source : Georges Beuzet, BU Santé Brest
  20. 20. Un exemple de recherche Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné publiés les 10 dernières années
  21. 21. Un exemple de recherche Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant- soigné publiés les 10 dernières années "Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient Relations"[Mesh] + Filters : English, French, published in the last 10 years
  22. 22. Exemple de résultat pertinent: la requête a porté exclusivement sur la partie « mots MESH » de la notice
  23. 23. Bref « Une recherche bibliographique ne se fait pas dans les couloirs de l’hôpital ou entre 2 stations de métro avec son smartphone ou sa tablette. » Philippe Eveillard Love & Mathematics – Lost Archetype – CC BY-NC-SA sur Flickr
  24. 24. Correspondances Mesh français – Mesh anglais => « Portail terminologique de santé » (CISMEF) http://pts.chu-rouen.fr/ Ou bien => « Mesh bilingue  de l’INSERM » : http://mesh.inserm.fr/mesh/
  25. 25. Exercices 1- Rechercher les affiliations descripteurs/qualificatifs correspondant :  le diagnostic de l'halitose  les causes du bruxisme
  26. 26. Réponses 1- Rechercher les affiliations descripteurs/qualificatifs correspondant :  au diagnostic de l'halitose "halitosis/diagnosis"[Mesh]  aux causes du bruxisme "bruxism/etiology"[Mesh]
  27. 27. 1)À partir d'un mots-clef MESH ( boîte d'équation de recherche et rebond) 3 façons d'entrer une requête dans Pubmed
  28. 28. 2) À partir du moteur de recherche avancée (« Advanced ») 3 façons d'entrer une requête dans Pubmed
  29. 29. 3 façons d'entrer une requête dans Pubmed 3) Directement dans la barre de recherche simple
  30. 30. La veille dans Pubmed : services personnalisés Low-flying harrier – Wolfpix – CC-BY-SA flickr
  31. 31. My NCBI : votre Pubmed personnalisé  Ouvrir un compte sur My NCBI  « Sign in »  « Register for an account »
  32. 32. Paramétrer dans votre compte les filtres suivants  Anglais  Français  Texte intégral gratuit  BU Santé Brest
  33. 33. Filtre « BU Santé Brest »
  34. 34. Icône UBO pour l'accès direct au texte intégral
  35. 35. Exercice 2 – L'extraction des prémolaires Limiter aux 5 dernières années de parution
  36. 36. Exercice 3. Le traitement de la carie radiculaire. Exclure la prévention. Limiter aux revues de la littérature publiées ces 5 dernières années
  37. 37. Du problème de la veille équation de recherche ≠ équation de veille
  38. 38. Des mots MESH ? . Ne contient pas de mots MESH Contient des mots MESH
  39. 39. Exercice 4 - Trouvez les articles les plus récents sur l'épulis congénitale du nouveau- né (sans utiliser les mots Mesh)
  40. 40. Solution : le champ Title/abstract ou [tiab] « gingival  neoplasms/congenital »[Mesh]  AND « infant, newborn »[Mesh] Équation de recherche (pour des résultats les plus pertinents possibles) ("gingival neoplasms"[TIAB]  OR "congenital epulis"[TIAB])  AND newborn[TIAB] Équation de veille (pour des articles récents / pas forcément aussi pertinents)
  41. 41. Créer une alerte dans MyNCBI
  42. 42. Retrouvez le support en ligne sur http://formation.scd.univ-brest.fr/so3

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