Diapos de l'atelier manipulation de graphes avec Gephi

1. Simon Le Bayon25/09/2012
ANF Fréjus, 23-26 sept 2013
Visualiser les données de la recherche en SHS : un
nouvel horizon pour les humanités numériques !
Simon Le Bayon
simon.lebayon@mychefcom.com
http://slebayon.blogspot.com
Atelier traitement de graphes

2. Simon Le Bayon25/09/2012
Myself
Simon Le Bayon
• IT project manager for 7 years
• Phd in Sociology (2010)
• Community Manager at MYCHEFCOM

3. Simon Le Bayon25/09/2012
Déroulé
1.Témoignage pratique de l'usage de la
visualisation de données
1.activité de recherche
2.activité professionnelle
2.Illustrations (x8)
3.Mise en garde & prudence méthodologique
4.Atelier / démo

4. Simon Le Bayon25/09/2012
Cartographie
• Recolter des traces numériques
• Manipuler des objets hétérogènes
• Explorer de données
• Générer des hypothèses
• Démonstration
• Preuve

5. Analyse d'échanges de mails

6. Approche dyachronique d'une
plateforme de blogs

7. Dynamique des posts sur un hub

8. Analyse lexicale des profils d'un
groupe

9. Simon Le Bayon25/09/2012
4) cartographie (Web)
Corpus web de la diaspora Bretonne

10. Simon Le Bayon25/09/2012
Géolocalisation des collectifs bretons

11. Cartographie web du Café

12. “Tour des galeries” Nicolas Thély

13. Simon Le Bayon25/09/2012
Prudence
• Quelle est la nature des traces collectées ?
• Comment sont-elles produites ?
• Quels traitements subis ?

14. Simon Le Bayon25/09/2012
Méthode générale
Data Graphe PrésentationTable
Exploration InterprétationContrôleCollecte
Terrain Information ConnaissancesFiltre

15. Simon Le Bayon25/09/2012
Méthode générale

16. Simon Le Bayon25/09/2012
Méthode générale

17. Simon Le Bayon25/09/2012
Méthode générale

18. Simon Le Bayon25/09/2012
Quelques outils
Data Graphe PrésentationTable

19. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : jeux de rôles
• Base de données commerciale
• Vous disposez des info suivantes :
– Identifiant unique par compte
– Type (2050 client- 3342 prospects)
– Code postal / Ville / Pays
– Assistant | Commercial en charge du compte
– Catégorie métier (segmentation)
– Chiffre d'affaires pour l'année en cours

20. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : jeux de rôles
●
Représenter l'organisation du suivi
commercial
●
Représenter le chiffre d'affaires de chaque
client
●
Vous représenterez la zone géographique
des comptes

21. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : méthode
Fichier de
graphe
Cartographie
relationnelle
Consolidation
des données

22. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : méthode
Fichier de
graphe
Cartographie
relationnelle
Consolidation
des données

23. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : sources
• Récupérer les sourcesHttp://slebayon.blogspot.com

24. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier

25. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier
• Controler l'intégrité des données
• Nettoyer et mettre en forme

26. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier
• Fusionner les valeurs de colonnes

27. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier
• Fusionner et mettre en forme

28. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier
• Regrouper les catégories

29. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier
• Transformer un tableau en un fichier lisible
par Gephi
– Table des noeuds
– Table des liens

30. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : méthode
Fichier de
graphe
Cartographie
relationnelle
Consolidation
des données

31. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : méthode
Fichier de
graphe
Cartographie
relationnelle
Consolidation
des données

32. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier
• Construction du fichier de graphe avec
table2net
– Comma Separated Value
– Unicode UTF-8
– Valeur multiples pour commerce

33. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : table2net

34. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : table2net

35. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : table2net

36. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : table2net

37. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : méthode
Fichier de
graphe
Cartographie
relationnelle
Consolidation
des données

38. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : méthode
Fichier de
graphe
Cartographie
relationnelle
Consolidation
des données

39. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : sources
• Télécharger le fichier gexf fourni par
Table2net
• Ouvrir le fichier avec Gephi
– Spacialisation (algorithme Force Atlas 2)
– Classement (diametre des noeuds = CA)
– Segmentation (couleurs par pays)

40. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi
http://www-igm.univ-mlv.fr/~dr/XPOSE2012/visualisation_de_graphes/index.html

41. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

42. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

43. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi
• Spacialisation
– algorithme Force Atlas 2
– Empécher le recouvrement

44. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

45. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

46. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

47. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

48. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

49. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

50. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

51. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

52. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

53. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Gephi

54. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : exercice avancé
• Enrichir la table des données
– onglet laboratoire de données
• exporter la table des noeuds au format CSV
– Ouvrir le fichier CSV
• sous Excel/OpenOffice
– Enrichir la table (distinction client / prospect)
corriger les erreurs
– Réimporter la table dans Gephi
• Vérifier encoding
• Vérifier le format CSV
• Décocher l'option de création

55. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : méthode
Fichier de
graphe
Cartographie
relationnelle
Consolidation
des données

56. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : méthode
Fichier de
graphe
Cartographie
relationnelle
Consolidation
des données

57. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Open Refine

58. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Open Refine

59. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Import

60. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Open Refine

61. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : exercice avancé
• Optimisation de la lisibilité
– Une fois le graphe stabilisé, il est possible de
l'optimiser manuellement pour la lecture
– Déplacement et édition des noeuds
– Homogénéisation des couleurs
– Ajustement des labels

62. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : Open Refine

63. Simon Le Bayon25/09/2012
Atelier : partage des résultats
1. Export au format image (png/svg)
– PNG image statique
– SVG éditable avec Illustrator ou Inkscape, etc.
2. Export au format Web
– Ajouter le plug-in sigma.js
– Exporter la carte sous la forme d'un dossier qui
peut-être publié sur un serveur web