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LES CORONAVIRIDAE
Dr T.DJERBOUA
Pharmacien maitre assistant en microbiologie
CHEF DE SERVICE DU LABORATOIRE DE BIOLOGIE MEDICALE
HOPITAL BELLOUA-CHU TIZI-OUZOU
Année universitaire : 2016-2017
Email : drtaoufik123@hotmail.fr
UNIVERSITE MOULOU-MAAMERI DE TIZI-OUZOU
FACULTE DE MEDECINE
DEPARTEMENT DE PHARMACIE
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MODULE DE MICROBIOLOGIE
PLAN
• GENERALITES SUR LES CORONAVIRIDAE
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• ASPECTS CLINIQUES
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Virus peu étudiés jusqu’à l’épidémie
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Petit virus , enveloppés , a ARN simple
brun , polarité positive, le plus gros
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Regroupe plusieurs genres de virus
pouvant atteindre l’homme et l’animal
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Cette slide a été présentée lors de la journée de sensibilisation a la résistance bactérienne aux antimicrobiens. l'objectif principal est de remettre les informations de l'audience en matière de résistance aux antibiotiques dans le contexte actuel du pays et de démontrer la complexité du processus de lutte qui ne se limite pas seulement a l'exes de prescription des antibiotiques. This slide was presented during the antimicrobial resistance awarness day held in Nedir mohammed university hospital in 2018. my aim through this presentation was to update and most importantly o reorganise the audience's knowledge on this opic and to put in the country's contexte. also to demonstrate that fighting this global threat is more complexe then limiting antibiotic prescription.

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• NOTION DE FACTEUR DE RISQUE OU CO-MORBIDITE (la plupart des
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• DONNES CLINIQUES LIMITES , la plupart des symptomes étant décrits
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Famille des Coronaviridae : Rhume, SRAS et MERScoV

  • 1. LES CORONAVIRIDAE Dr T.DJERBOUA Pharmacien maitre assistant en microbiologie CHEF DE SERVICE DU LABORATOIRE DE BIOLOGIE MEDICALE HOPITAL BELLOUA-CHU TIZI-OUZOU Année universitaire : 2016-2017 Email : drtaoufik123@hotmail.fr UNIVERSITE MOULOU-MAAMERI DE TIZI-OUZOU FACULTE DE MEDECINE DEPARTEMENT DE PHARMACIE COURS DE 4ème ANNEE PHARMACIE MODULE DE MICROBIOLOGIE
  • 2. PLAN • GENERALITES SUR LES CORONAVIRIDAE • LES CORONAVIRUS : DES VIRUS EMERGEANTS (cas du SRAS-CoV et du MERS-CoV) • ASPECTS CLINIQUES • DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE • PREVENTION ET SURVEILLANCE
  • 3. LES CORONAVIRIDAE GENERALITES Virus peu étudiés jusqu’à l’épidémie SRAS Petit virus , enveloppés , a ARN simple brun , polarité positive, le plus gros génome des virus a ARN Regroupe plusieurs genres de virus pouvant atteindre l’homme et l’animal (large spectre d’hote : mammifères , oiseaux …) Infection le plus souvent bénignes , entériques et respiratoires , possibles cas sévères. Potentiel épidémique et de
  • 4. LES CORONAVIRIDAE :CLASSIFICATION  la famille regroupe plusieurs genres dont le GCornavirus est le plus interessant actuellement chez l’homme GCoronvirus regroupe plusieurs espèces capables d’infecter l’homme EH- Cov (la lettre ou le préfixe indique l’hote) Capacité de franchissement de barrière d’espèce
  • 5. LES CORONAVIRIDAE :Structure  virus pléomorphes, surtout sphérique , capside a symétrie hélicoïdale, l’enveloppe est hérissée de larges spicules lui donnant un aspect caractéristique en couronne Le virus compte 4 protéines structurales: *S (spike) : attachement et fusion *M : membrane (assemblage) *N : protéine de la nucléocapside E : enveloppe Le génome code aussi pour des protéines non-structurals dont le rôle n’est pas complètement élucidé
  • 6. Expression cellulaire du CD13) selon le type de tissus 2 récepteurs identifiés chez l’homme * L’amino-peptidase N (APN=CD-13) *Enzyme de conversion de l’angiotensine II (ACE II) =) large spectre de cellules hôte LES CORONAVIRIDAE : cibles cellulaires
  • 7. Le cycle viral complet dure 3 a 4h Apres pénétration par fusion des membranes le génome est directement traduit en protéines (phase précoce) Parmi les protéines traduites on trouve les réplicases (ARN polymérase/ARN dépendantes) qui répliquent l’ ARN+ en ARN- Les ARN – seront répliqués en ARN+ qui serviront soit a *Amplifier la synthèse protéique *synthèse de nouveaux virions après assemblage et libération LES CORONAVIRIDAE : réplication
  • 8. Pouvoir pathogène des H-CoV Les infections a H-CoV sont bénignes le plus souvent , d’ordre respiratoire essentiellement , puis d’ordre gastro- intestinal, l’implication dans les troubles neurologiques n’a pas été complètement établi L’infection respiratoire est dominé par le Rhume commun (2ème agent après le Rhinovirus) Les symptômes sont surtout dues a la réponse immunitaire s’expliquent par une atteinte de l’appreil respiratoire supérieur puis descendant vers les poumons Les formes sévères sont retrouvés chez le sujet fragilisé
  • 9. QUESTION : j’ai un rhume ou une Grippe :’( ?
  • 11. CORONAVIRIDAE : DES VIRUS EMERGEANTS LA PANDEMIE SRAS • 2002-2003 • 8,098 cas probables, 774 morts • Pertes economiques>$30B • Facteurs de propagation accélérée ont aidé a la pandémisation de l’évenement (voyage autour de la terre ne prend que 2h) • Stratégies de controle : - Surveillance clinique et screening des symptomes - Isolation des cas potentials - Quarantaine des cas exposés - INFECTION BIEN CONTROLEE
  • 13. CHAINE EPIDEMIOLOGIQUE DE L’INFECTION MERS-CoV Middle East Respiratory Syndrome Reservoir : animal ? (Camélidae , Chauves souris … ) Transmission : non complètement élucidée , probablement par contacte étroite avec une personne infectée (famille , personnel soignant )
  • 14. CHAINE EPIDEMIOLOGIQUE DE L’INFECTION MERS-CoV Middle East Respiratory Syndrome • Premier cas identifié en Arabie Saoudite en Septembre 2012 • L’épidémie aurait commencé en Jordanie (Avril 2012) • 1980 confirmés ,693 décés , 27 pays touchés • Gender: sex ratio de 1.5 prédominance masculine (63%) • Age médian 52 ans , avec des extremes de moins de 1 ans a 92 ans . • NOTION DE FACTEUR DE RISQUE OU CO-MORBIDITE (la plupart des malades ) • plusieurs des malades sont du corps médical exposé. • Les cas algériens : deux hommes algériens, âgés de 66 et 59 ans, ayant séjourné en Arabie saoudite pour l’accomplissement de la Omra, selon la même source. Les deux cas ont été enregistrés à Tipasa et Tlemcen (2014 , pas de nouveaux chiffre depuis !)
  • 16. CLINIQUE DE L’INFECTION MERS-CoV Middle East Respiratory Syndrome • DONNES CLINIQUES LIMITES , la plupart des symptomes étant décrits chez des patients en état critique. • De l’asymptomatique a la pneumonie aigue severe (DRA , choc septique et defaillance multiviscerale) • Peut toucher toutes les catégories d’age. • Prédominance des formes associés a une tarre sous jacente • Mortalité de 30% • A l’admission : les symptomes communs sont fievre,frissons , céphalés , myalgies ,toux non productive, dyspnée, • Plus rarement douleurs de la gorge , coryza, , toux productive nausées , vomissements , diarrhées , douleurs abdominales ,étourdissement • Les présentations atypiques incluent une gastro-entérite précédant une pneumonie , , ceux ayant necessité une hospitalisation en USI ont présenté une pneumonie aigue rapidement progressive.
  • 17. Coronavirus : Diagnostic 1) Indications : -Diagnostic d’une infection respiratore haute ou basse de symptomatology compatible (si forms sévères, épidémique) - Diagnostic d’une gastro-entérite virale 2) Prélèvements : Diagnostic direct : secretions respiratoires, LBA , Selles ,sang (sérologie a but épidemiologique, pas d’interet diagnostic) 3) Techniques : IFI, RT-PCR, microscopie électronique (selles+++), culture cellulaire trés difficile reserve aux laboratoires spécialisés
  • 18. PREVENTION • Pas de traitement spécifique (corticoides- Ribavirine Dans les formes sévères ?) • Bien aérer les locaux • Port de masque ou de bavette en cas de symptômes respiratoires • Hygiène des mains (virus fragile) • Hygiène des locaux • Education du personnel et des patients