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La sélection des ovins pour
la résistance au parasitisme
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résistants aux strongles digestifs?
• Strongles digestifs acquis uniquement au pâturage avec l’ingestion
d’herbe
• Pertes économiques substantielles : mortalité, pertes de production
laitière / de croissance + coût des traitements anthelminthiques
• Écotoxicité de certains antiparasitaires : effets néfastes sur la faune
non-cible, insectes coprophages des prairies en particulier.
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permis de développer des résistances aux antiparasitaires =>
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 un objectif de
sélection pertinent
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Utiliser le contexte du DGF et les
résultats de recherche acquis
• Les OPG sont le critère communément utilisé pour mesurer la résistance.
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• Existence de schémas collectifs en France avec centres de rassemblement de
béliers dont les retenus ont un impact significatif sur la population (IA > MN).
 Définition d’un protocole d’épreuve des béliers
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• Haemonchus contortus est un strongle pathogène, thermophile, répandu en
France, toujours concerné dans les cas de résistance aux anthelminthiques.
• Très forte corrélation génétique (≈ 1) entre les résistances à différentes
espèces de strongles gastro-intestinaux.
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Un protocole standardisé de
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Ovins allaitants : gérer la
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Manech tête rousse et
Basco-Béarnaise :
15 ans de phénotypage
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De quels index dispose-t-on
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résistance au parasitisme dans l’étape principale de sélection des
jeunes agneaux, simultanément aux autres caractères
o Index diffusés à l’OS :
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Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 12
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Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 15
La lutte intégrée du parasitisme
gastro-intestinal chez les ovins =
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Tarir les sources
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Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 16
Enseignements et
perspectives
 La résistance au parasitisme : une expérience concrète de travail
collectif - R&D (vétérinaires, généticiens)  OS/ES  éleveurs
 La plateforme PHENOPASTO (implantation CDEO) assure un service de
phénotypage de la résistance au parasitisme pour toute race ovine.
 La résistance au parasitisme peut être un argument vertueux pour
le soutien à la sélection des petits ruminants
 La race Lacaune lait s’engage dans
le processus de sélection à partir
de 2024. Prise en compte dans
ISOL attendu dans 4 ans
Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 17
LA SÉLECTION DES OVINS
POUR LA RÉSISTANCE AU
PARASITISME
Jean-Michel Astruc - IDELE
ANTHERIN
Financeurs:
Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 18
La résistance des béliers mesurés et
sélectionnés en centre se transmet-
elle à leurs filles en ferme?
HT hématocrite
OPG œufs / gramme Source : Aguerre
et al, 2018
OPG 178 brebis nées de
béliers sensibles
OPG 222 brebis nées de
béliers résistants
OPG
OPG
Nb
de
brebis
Nb
de
brebis
Indexation
 Oui, La résistance d’un bélier
se transmet à ses filles en
ferme au pâturage (race MTR)
o Les filles issues de pères
résistants excrètent en
moyenne 2 fois moins d’œufs
que les filles des béliers
sensibles.
o La proportion de filles avec
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faibles est plus importante
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03-La sélection pour la résistance au parasitisme

  • 1. La sélection des ovins pour la résistance au parasitisme Webinaire génétique ovine – 28 mai 2024 Jean-Michel Astruc - IDELE
  • 2. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 2 Pourquoi sélectionner des ovins résistants aux strongles digestifs? • Strongles digestifs acquis uniquement au pâturage avec l’ingestion d’herbe • Pertes économiques substantielles : mortalité, pertes de production laitière / de croissance + coût des traitements anthelminthiques • Écotoxicité de certains antiparasitaires : effets néfastes sur la faune non-cible, insectes coprophages des prairies en particulier. • Les grandes capacités d’adaptation des strongles digestifs leur ont permis de développer des résistances aux antiparasitaires => RISQUE D’IMPASSE THERAPEUTIQUE  un objectif de sélection pertinent
  • 3. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 3 Utiliser le contexte du DGF et les résultats de recherche acquis • Les OPG sont le critère communément utilisé pour mesurer la résistance. Relativement lourd et coûteux => bélier = population cible. • Existence de schémas collectifs en France avec centres de rassemblement de béliers dont les retenus ont un impact significatif sur la population (IA > MN).  Définition d’un protocole d’épreuve des béliers visant à exhiber la variabilité de la réponse sans générer des effets néfastes sur les béliers • Haemonchus contortus est un strongle pathogène, thermophile, répandu en France, toujours concerné dans les cas de résistance aux anthelminthiques. • Très forte corrélation génétique (≈ 1) entre les résistances à différentes espèces de strongles gastro-intestinaux. • Très forte corrélation génétique (≈ 0,9) entre infestations naturelles et infestations expérimentales.
  • 4. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 4 Un protocole standardisé de phénotypage J-15 Protocole d’infestation expérimentale avec Haemonchus contortus J0 Infestation 1 HT1début ΔHT1 J30 OPG1 HT1fin J45 Infestation 2 HT2début ΔHT2 J75 OPG2 HT2fin Primo- infestation Seconde infestation Traitements (T) Infestations (doses de L3 à adapter à la race et l’âge) Mesures de l’excrétion d’œufs dans les fèces : OPG Mesures de l’hématocrite : HT Mâles naïfs, jamais exposé aux parasites Objectif : exprimer les différences entre les béliers sans perturber les béliers (âge béliers, dose larves, etc) T T T RESISTANCE RESILIENCE
  • 5. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 5 Un protocole déjà utilisé dans plusieurs populations ovines Charmois OS GEODE Roussin OS CAR MTR, BB, MTN CDEO/OS ROLP OS BMC FEDATEST Infestations expérimentales Infestations naturelles 2006 2008 Causse du Lot OS Causse du Lot Rouge Ouest, Berr. Indre OS GEODE Lacaune viande Ovitest Romane OS Romane
  • 6. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 6 Quand réaliser le protocole de phénotypage ? 18 mois 1ères IA 4 mois pré-sélection génomique (candidats à l’IA) 18 mois 2èmes IA 8 mois 1ères IA 3-5 mois SCI 6 mois Sortie de SCI 3-5.5 mois phénotypage « parasitisme » Ovin lait Ovin allaitant => SCI : lieu privilégié pour réaliser le phénotypage. Mais limiter les interactions entre les 2 protocoles 1 an Phénotypage « parasitisme »
  • 7. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 7 Ovins allaitants : gérer la juxtaposition des 2 protocoles SCI et parasitisme • La seconde infestation ne doit pas coïncider avec le protocole SCI • La fin des deux protocoles ne doit pas être trop tardive • Pour corriger les effets des infestations sur les caractères bouchers : prise en compte du protocole parasitisme dans l’évaluation génétique
  • 8. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 8 Manech tête rousse et Basco-Béarnaise : 15 ans de phénotypage 0 50 100 150 200 250 300 350 400 2008 2009 2011 2013 2015 2016 2017 2018 2019 2020 2021 2022 2023 Nombre de béliers par bande de phénotypage 1826 MTR & 520 BB MTR Basco-Béarnaise
  • 9. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 9 Des caractères héritables (OPG > variation d’HT) 0 0.05 0.1 0.15 0.2 0.25 0.3 0.35 0.4 Estimation héritabilité en MANECH TETE ROUSSE et BASCO- BEARNAISE Un déterminisme essentiellement polygénique
  • 10. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 10 Corrélations entre caractères de résistance / résilience parasitisme 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1 OPG2 x ΔHT1 OPG1 x ΔHT2 OPG1 x ΔHT1 OPG2 x ΔHT2 ΔHT1 x ΔHT2 OPG1 x OPG2 Corrélations génétiques entre caractères de RESISTANCE et RESILIENCE en Manech tête rousse  Les animaux les plus résistants sont aussi les plus résilients  Corrélations élevées entre les 2 infestations
  • 11. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 11 De quels index dispose-t-on en MTR et BB ? o 2017-2022 : évaluation génétique polygénique (fondée sur phénotypes et pedigree). o Depuis 2023 : évaluation génomique => permet d’inclure la résistance au parasitisme dans l’étape principale de sélection des jeunes agneaux, simultanément aux autres caractères o Index diffusés à l’OS : • OPG1 et OPG2 • ΔHT1 et ΔHT2 • Synthèse OPG = ¼ OPG1 + ¾ OPG2 • Synthèse HT = ½ (ΔHT1 + ΔHT2) • Synthèse parasitisme = ¾ synth. OPG + ¼ synth. HT Question clé : quel critère pour quel objectif de sélection (pondérations) ?
  • 12. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 12 Faibles corrélations avec les caractères sélectionnés -0.03 0.1 -0.19 -0.12 0.04 0.04 -0.5 -0.3 -0.6 -0.4 -0.2 0 0.2 LAIT TB TP CELLULES ANGLE TRAYON PROF MAM LAIT x TP LAIT x Plancher-Jarret Corrélations génétiques entre OPG2 et caractères en sélection en Manech tête rousse Des corrélations génétiques plutôt faibles => La sélection de la résistance au parasitisme ne mettra pas en péril les autres caractères Résultats similaires pour les corrélations génétiques entre ΔHT2 (traduisant la RESILIENCE de l’ovin) et caractères en sélection Traduit la résistance de l’ovin
  • 13. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 13 Pas de corrélation entre index parasitisme et index de synthèse ISOL y = 0.0001x + 0.0231 -1.5 -1 -0.5 0 0.5 1 1.5 -400 -200 0 200 400 600 800 1000 1200 Index PARASITISME Index ISOL Corrélations entre index de synthèse parasitisme et index ISOL 663 agneaux MTR « 2023 » Corrélation 0.04 non significative
  • 14. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 14 Nouveau critère de sélection ISOL intégrant le parasitisme  La résistance au parasitisme a été incluse pour la première fois dans le critère global de sélection pour le choix des béliers.  Vers un objectif de sélection toujours plus équilibré. Critère de sélection en race MTR  Gain génétique attendu sur le moyen et long terme => approche intégrée du contrôle des strongles gastro-intestinaux est d’autant plus importante
  • 15. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 15 La lutte intégrée du parasitisme gastro-intestinal chez les ovins = optimiser la boîte à outils Éliminer les strongles gastro-intestinaux • Emploi raisonné des anthelminthiques (Traitement ciblé sélectif, nouvelles cibles / molécules) • Fourrages bio-actifs Augmenter la résistance résilience de l’hôte • Vaccination, apports protéiques • Résistance génétique Tarir les sources de contamination • Gestion agronomique (pâturage)
  • 16. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 16 Enseignements et perspectives  La résistance au parasitisme : une expérience concrète de travail collectif - R&D (vétérinaires, généticiens)  OS/ES  éleveurs  La plateforme PHENOPASTO (implantation CDEO) assure un service de phénotypage de la résistance au parasitisme pour toute race ovine.  La résistance au parasitisme peut être un argument vertueux pour le soutien à la sélection des petits ruminants  La race Lacaune lait s’engage dans le processus de sélection à partir de 2024. Prise en compte dans ISOL attendu dans 4 ans
  • 17. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 17 LA SÉLECTION DES OVINS POUR LA RÉSISTANCE AU PARASITISME Jean-Michel Astruc - IDELE ANTHERIN Financeurs:
  • 18. Génétique ovine - Webinaire 28 mai 2024 18 La résistance des béliers mesurés et sélectionnés en centre se transmet- elle à leurs filles en ferme? HT hématocrite OPG œufs / gramme Source : Aguerre et al, 2018 OPG 178 brebis nées de béliers sensibles OPG 222 brebis nées de béliers résistants OPG OPG Nb de brebis Nb de brebis Indexation  Oui, La résistance d’un bélier se transmet à ses filles en ferme au pâturage (race MTR) o Les filles issues de pères résistants excrètent en moyenne 2 fois moins d’œufs que les filles des béliers sensibles. o La proportion de filles avec des intensités d’excrétion faibles est plus importante chez les filles issues de béliers résistants que chez les filles issues de béliers sensibles.