1) El documento describe varios equipos y materiales utilizados en electroforesis de ADN, incluyendo una centrifuga, fotodocumentador, cuba horizontal y el procedimiento para electroforesis en gel de agarosa. 2) Identifica las partes y especificaciones de cada equipo, como la cámara, rotor y controles de la centrifuga y la pantalla táctil y detectores del fotodocumentador. 3) Explica cómo usar cada equipo, como cargar la centrifuga, tomar fotografías con el fotodocumentador y realizar electroforesis en la cuba horizontal
ANALISIS Y DISEÑO POR VIENTO, DE EDIFICIOS ALTOS, SEGUN ASCE-2016, LAURA RAMIREZ
PRACTICA 1 RECONOCIMIENTO DE EQUIPOS DE BIOLOGIA MOLECULAR.pdf
1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA ESCUELA
PROFESIONAL DE INGENERIA AMBIENTAL
“AÑO DEL FORTALECIMIENTO DE LA SOBERANÍA NACIONAL”
TEMA:
Reconocimiento de equipos
de biología molecular
INTEGRANTES:
-Sanchez Javier Angela
-Panta Auris Fabriccio
CURSO:
Biotecnología
CICLO:
VII
DOCENTE:
Blgo. Herbert Hernan Soto Gonzales
2. CONTENIDO
1.INTRODUCCION ...................................................................................................3
2.OBJETIVOS ............................................................................................................3
3.MATERIALES Y METODOS ................................................................................3
3.1.CENTRIFUGA ..................................................................................................3
3.1.1.PARTES DE LA CENTRIFUGA ...............................................................4
3.1.2.CARGA DE LA CENTRIFUGA ................................................................5
3.1.3.EPPENDORF 5425R...................................................................................6
3.2.FOTODOCUMENTADOR: .................................................................................7
3.2.1.ESPECIFICACIONES DEL PRODUCTO................................................7
..............................................................................................................................8
3.2.2.PARTES DEL FOTODOCUMENTADOR................................................8
3.3. CUBA....................................................................................................................8
3.3.1.CUBA HORIZONTAL LABNET ENDURO 7 X 10CM......................... 10
3.4. ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA............................................ 10
3.4.1.PROCEDIMIENTO.................................................................................. 10
4.CONCLUSIONES..................................................................................................11
5.BIBLIOGRAFIA....................................................................................................12
3. 1.INTRODUCCION
El laboratorio es un lugar de investigación. Para ello se tendrán siempre presentes los
diferentes equipos y materiales que nos permitan analizar e identificar muestras. Por eso
es necesario que antes de comenzar cualquier trabajo experimental, se conozca el material
y equipos que se utiliza.
En el siguiente informe identificaremos cada uno de los materiales y equipos que se
utilizan para la electroforesis de ADN en gel de agarosa y conocer su uso adecuado para
posteriormente realizar una práctica de ello.
Además, que se indagara más profundamente en los equipos mostrados en el laboratorio
añadiendo una mayor base para conocerlos mejor.
2.OBJETIVOS
Identificar materiales y equipos para la electroforesis de ADN en gel de agarosa.
Conocer uso y función de los equipos (centrifuga, foto documentador, cuba)
3.MATERIALES Y METODOS
3.1.CENTRIFUGA
La centrífuga es un equipo de laboratorio que genera movimientos de rotación, tiene el
objetivo de separar los componentes que constituyen una sustancia. Hoy en día hay existe
una diversidad de centrifugas que tiene diferentes objetivos.
Por lo general, la centrifuga es utilizada para la separación de la sedimentación de los
componentes líquidos y sólidos. Hay diferentes tipos de centrifuga, como centrifugas de
baja velocidad, centrifugas para micro hematocritos, y ultracentrífugas, este último tipo
generalmente se utiliza para la separación de las proteínas. Pero cada uno de ellos tiene
diferentes velocidades:
Macro centrífuga que va desde los 2.000 y 6.000 R.P.M.
Micro centrifugas entre 10.000 y 18.000 R.P.M
Ultracentrífugas que va desde 20.000 y 75.000 R.P.M.
Dependiendo del tipo de centrifuga cada una tendrá diferente funcionamiento y
características (tipo de rotor y tipo tubo porta muestras). En el caso de su control eléctrico,
siempre va a disponer de diferentes elementos como el control del tiempo, el control de
temperatura, control de refrigeración, velocidad de rotación, entre otras.
4. Figura 1: Centrifuga de laboratorio
3.1.1.PARTES DE LA CENTRIFUGA
Componente Descripción
Tapa
Impide el acceso a las muestras mientras
estas se encuentran bajo acción de la
centrifuga.
Cámara
Impide el acceso a las muestras mientras
estas se encuentran bajo acción de la
centrifuga.
Interruptor de encendido
Impide el acceso a las muestras mientras
estas se encuentran bajo acción de la
centrifuga.
Marcador de tiempo
permite controlar el tiempo de la
centrifugación.
Tacómetro
Muestra la velocidad a la que gira el rotor,
es decir, la velocidad de la centrifugación.
Freno
Permite regular la detención de la
centrífuga.
Control de velocidad
Permite regular la velocidad de
centrifugado.
Figura 2: Partes de la centrifuga
5. 3.1.2.CARGA DE LA CENTRIFUGA
Colocar las cargas que tienen la misma masa o peso de forma opuesta en el rotor. Además
de tener la misma masa, deben tener el mismo centro de gravedad, no coloque tubos y
recipientes como pares contrapuestos. Se debe tener especial cuidado con las cargas
porque si no están equilibradas el equipo se malograría y en el caso de no tener muestras
pares se puede llenar un tubo con agua destilada de igual volumen a las muestras para
equilibrar la centrifuga
Utilización
Es importante tomar en cuenta estas recomendaciones para mantener la centrifuga en
condiciones adecuadas:
Mantener cerrada la tapa en el proceso de centrifugado
Compruebe que la superficie donde se encuentre la centrifuga este nivelada.
Reemplazar los recipientes metálicos que se encuentre en mal estado
No utilice equipo de vidrio en mal estado
Reemplazar los tapones amortiguadores de los porta muestras.
Mantener la centrifuga libre de restos de muestras, vidrio y polvo
Los pasos generales para el uso de la centrifugadora son los siguientes
Abra la centrifuga correctamente y coloque los tubos teniendo en cuenta el
nivelado
Proceda a cerrar la tapa correctamente y calibre la temperatura, RPM y el tiempo
que se necesite para la muestra
De inicio al ciclo de la centrifuga y espere que termine.
Una vez terminado el ciclo abra la tapa retire la muestra y vuelva a cerrar la tapa
de la centrifuga.
6. 3.1.3.EPPENDORF 5425R
Marca de centrifuga enseñada en clase, la información viene de su manual.
Generalidades:
La Centrifuge 5425 R versátil tiene una capacidad máxima de 10 x 5 ml y alcanza una
velocidad máx. de 21.300 x g / 15.060 rpm. Puede elegir entre seis rotores diferentes para
centrifugar los siguientes tubos y recipientes para sus diversas aplicaciones:
Tubos de reacción (0,2 a 5,0 mL)
Tiras PCR
Microtainer (0,6 mL)
Columnas de centrifugación (1,5/2,0 mL)
Tubos criogénicos
La Centrifuge 5425 R también tiene una función de control de temperatura para la
centrifugación a temperaturas de -10 °C a +40 °C. Con la función fast temp se inicia un
ciclo de calentamiento/enfriamiento sin muestras para llevar la cámara del rotor
rápidamente a la temperatura ajustada.
La Centrifuge 5425 R puede conectarse al sistema Eppendorf VisioNize. El sistema
Eppendorf VisioNize ofrece la posibilidad de conectar la centrífuga a un software central
de monitorización y gestión de datos.
3.1.4.PARTES
Figura 3: Partes de centrifugadora
1. Tapa de la centrífuga
2. Tubito de control
3. Indicador
4. Panel de control
5. Desbloqueo de emergencia
6. Placa de características
7. Interruptor de la red de distribución
8. Conexión de la red de distribución
7. 9. Portafusibles
10. Interfaz para actualizaciones de software
11. Recipiente colector de agua condensada
12. Figura 5: Centrifugadora
3.2.FOTODOCUMENTADOR:
Este equipo permite la digitalización de todo tipo de geles de ADN, proteínas y
transferencias Western, con el fotodocumentador podrá guardar imágenes de gel en el
sistema o en una unidad USB y, a continuación, conéctese a la red para facilitar la
transferencia de imágenes a una computadora.
El fotodocumentador que se tiene en el laboratorio es el sistema GelDoc Go que cuenta
con el intuitivo software Image Lab Touch integrado, con capacidades como la captura
automática de imágenes, el análisis automático, las preferencias del usuario y muchas
otras funciones, lo que hace que el análisis y la creación de imágenes en gel sean
increíblemente fáciles.
3.2.1.ESPECIFICACIONES DEL PRODUCTO
Marca: Bio Rad
Uso/Aplicación: Fluorescencia, Colorimetría, Documentación en Gel
Nombre del modelo: Geldoc
Características: Sistemas de imágenes habilitados sin manchas cuando se usan con geles
sin manchas.
Área de imagen máxima: 14x21cm
Funcionalidad de pantalla táctil: Pantalla con capacidad multitáctil de 9,7" (24,64 cm)
Resolución de pantalla: 1024 x 768 píxeles
8. Sistema informático a bordo: 2 GB de RAM, 32 GB de espacio en disco, 4 puertos USB
Espesor de la muestra: Espesor máximo soportado 5 mm
Detector: CMOS de 6,3 megapíxeles
Tamaño de pixel: 2.4 Micro mx 2.4 Micro m
Filtros de emisión: 535-645 nm (estándar)
Gama dinámica: Más de 3,5 órdenes de magnitud
Figura 5: Fotodocumentador
3.2.2.PARTES DEL FOTODOCUMENTADOR
Pantalla táctil
Almohadilla de goteo
Puerto USB
Botón de encendido y apagado
Bandeja de entrada
Cajón transiluminador
Fusibles
Puerto Ethernet
Receptáculo de alimentación CA
Puerto USB B
Etapa de imagen
Puerto USB 2.0A
3.3. CUBA
Es un dispositivo capaz de obtener energía eléctrica a partir de reacciones químicas (o
bien, de producir reacciones químicas a través de la introducción de energía eléctrica,
cuando se esté cargando la celda).
9. Figura 6: Cuba o celda electroquímica
Modos de disposición del soporte
Horizontal: Se aplica la muestra depositándola (con pipeta o un aplicador específico)
como una gota sobre el soporte (papel, acetato de celulosa) o dentro de un “pocillo”
creado en el gel.
Figura 7: Cuba horizontal
Vertical: La muestra se deposita con micropipeta llenando un “pocillo” creado al
polimerizar el gel.
Figura 8: Cuba vertical
10. 3.3.1.CUBA HORIZONTAL LABNET ENDURO 7 X 10CM
Diseñadas para maximizar su durabilidad, tiempo de uso y seguridad, las cubas
horizontales Labnet Enduro son una excelente opción al momento de realizar análisis de
proteínas, RNA y DNA sobre gel de agarosa. Construidas en acrílico transparente UV.
Características:
Dimensiones: 9x21x9cm
Medidas del gel: 7x10cm
Cantidad máxima de muestras: 64
Volumen de buffer: 225 ml
Incluye 3 peines de 8 dientes.
3.4. ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA
Es una de las metodologías más utilizadas en el laboratorio en todo lo relacionado con el
trabajo con ácidos nucleicos. A través de la electroforesis podemos separar fragmentos
de ADN y ARN en función de su tamaño, visualizarlos mediante una sencilla tinción, y
de esta forma determinar el contenido de ácidos nucleicos de una muestra, teniendo una
estimación de su concentración y grado de entereza. Además, se puede extraer del gel los
fragmentos de ADN que sean de interés, para posteriormente utilizarlos en diferentes
aplicaciones. La electroforesis de ADN fue, y sigue siendo, una herramienta de
importancia primordial en el desarrollo de las técnicas del ADN recombinante o
ingeniería genética.
La idea de utilizar la técnica de electroforesis por medio de una matriz para analizar
muestras de ADN corresponde a Vin Thorne, un bioquímico del Instituto de Virología de
Glasgow, quien a mediados de los años 60 del pasado siglo estaba interesado en
caracterizar las distintas formas de ADN que se obtenían de partículas purificadas de
polyomavirus. Su razonamiento era que una combinación de fuerzas eléctricas y de
fricción toleraría el desplazamiento y separación en función del tamaño o topología de
diferentes moléculas de ADN.
3.4.1.PROCEDIMIENTO
1. Preparación del gel de agarosa
1.1. Pesar la cantidad de agarosa necesaria para obtener la concentración deseada (ver
Tabla 1) en función del volumen de gel.
1.2. Añadir la agarosa al buffer (TAE 1x o TBE 0.5x) en un matraz.
1.3. Calentar la mezcla en un horno de microondas hasta que se observe que toda la
agarosa se ha fundido. 1.4. Dejar enfriar la solución de agarosa hasta una temperatura de
unos 50 °C (Nota: si se opta por añadir el BrEt al gel debe realizarse en este momento, a
una concentración final de 0.5 µg/ml).
1.5. Mientras la solución de agarosa se enfría, preparar el molde en el que se va a hacer
el gel sellando los bordes con cinta masking, o colocándolo en el dispositivo previsto para
ello, y colocando el peine en la posición deseada.
11. 1.6. Verter cuidadosamente la solución de agarosa sobre el molde nivelado y dejar que
solidifique durante al menos 30 min.
2. Preparación de las muestras
2.1. Mezclar tanto las muestras de ADN como el marcador de tamaño con 0.2 volúmenes
del buffer de carga 6x. El volumen total estará determinado por el tamaño de los pocillos,
habitualmente 15-30 µl.
3. Carga de las muestras y corrida del gel
3.1. Una vez que el gel ha solidificado retirar el sellado de los bordes y colocar el molde
con el gel en la cámara de electroforesis.
3.2. Añadir buffer de electroforesis (TAE 1x o TBE 0.5x) hasta que cubra el gel unos 3-
5 mm.
3.3. Retirar cuidadosamente el peine para que queden libres los pocillos para las muestras.
3.4. Cargar en los pocillos las muestras que se prepararon en el paso 7. Nota: Dependiendo
del tipo de muestra y del marcador, frecuentemente es conveniente calentar a 65°C las
muestras durante 3-5 min y enfriarlas en hielo antes de cargarlas.
3.5. Conectar los cables a la fuente alimentación y aplicar un voltaje de 20-150 V (1-5
V/cm de acuerdo a la distancia entre los electrodos). El ajuste del voltaje es muy variable
dependiendo de la cámara y de los tamaños que se pretenden separar, se recomienda
voltajes no muy altos para tamaños muy grandes del ADN. Nota: Debe tenerse en cuenta
que el ADN migra hacia el ánodo, por lo que debe disponerse correctamente la orientación
del gel y de los cables.
3.6. Correr el gel hasta que el colorante azul de bromofenol esté a una distancia del borde
de aproximadamente un 25% de la longitud total del gel. En ese momento debe detenerse
la electroforesis.
4. Tinción del gel y visualización del ADN
4.1. Si no se añadió el BrEt al gel (paso 1.4), éste debe teñirse una vez finalizada la
electroforesis. Para ello se saca el gel de su molde y se sumerge en una solución de BrEt
(0.5 µg/ml) durante al menos 15 min. Nota: Ambas formas de tinción rinden resultados
similares, pero se recomienda la tinción una vez finalizada la electroforesis para mantener
el molde, peine y cámara libres de BrEt.
4.2. Colocar el gel sobre un transiluminador y encender la lámpara de luz ultravioleta (λ
≈ 300 nm), el ADN se visualizará como bandas de color anaranjado.
4.3. (Opcional) Si hay bandas de tamaño pequeño que no se visualizan bien puede hacerse
una etapa de desteñido con H2O o 1 mM MgSO4 durante 20 min.
4.4. Fotografiar el gel con el sistema fotográfico disponible.
4.CONCLUSIONES
En el presente informe se aprendió el uso de los diferentes equipos del laboratorio
de biotecnología para la identificación de ADN. El uso principal de la centrifuga
12. es para la separación de los sólidos y líquidos mediante la fuerza centrífuga. El
correcto uso de la centrifuga es mantener el peso equilibrado para que al momento
de iniciarlo no se malogre, cabe recalcar que se debe cerrar bien la tapa y tener
una limpieza con el equipo.
El fotodocumentador nos permite guardar imágenes de gel en el sistema, en un
USB o nos permite la fácil transferencia de imágenes a la computadora.Lo cual
permite que sea más sencillo realizar la técnica de electrolisis en gel de agarosa lo
cual sirve para separar el ADN, ARN, proteínas o moléculas dependiendo de su
tamaño y carga eléctrica.
5.BIBLIOGRAFIA
BIOMODEL. (s. f.). BIOMODEL. Recuperado 28 de abril de 2022, de
https://biomodel.uah.es/tecnicas/elfo/inicio.htm
Electroforesis. (s. f.). inecc.gob. Recuperado 28 de abril de 2022, de
http://www2.inecc.gob.mx/publicaciones2/libros/710/electroforesis.pdf
GelDoc Go. (s. f.). Bio rad. Recuperado 28 de abril de 2022, de
https://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_7284.pdf
FOTODOCUMENTADOR | Viresa. (s. f.). Viresa. Recuperado 28 de abril de
2022, de https://viresa.com.mx/fotodocumentador-dg--7568e
W. (2021, 12 abril). Centrifuga de Laboratorio para separación de muestras. ».
ARTILAB. Recuperado 28 de abril de 2022, de
https://artilab.com.co/noticias/centrifuga-para-laboratorio/