Magda BOU DAGHER KHARRAT, Professeur associé La génétique à la rescousse du cèdre du Liban
Cedrus libani  /Bcharre Lebanon
Coffre en bois de cèdre  (pharaons time) Sarcophage en bois de cèdre Temple d’ARTEMIS (Ephèse) 550 B.J.-C. Gravures de Kho...
Mont - Liban Vallée  de la Bekaa Anti - Liban 1000 m 1500 m 2000 m 3000 m Distribution en fonction de l’altitude de la vég...
 
 
 
 
 
 
1948   2007 Enclos relique des cèdres de Bcharré Jean Rolley L a situation forestière en Syrie et au Liban.  Unasylva Numé...
Zone reboisée Enclos relique des cèdres de Bcharré
 
 
 
Reforestation at Barouk (Lebanon)
De quelle espèce de cèdre s ’agit-il?
C. atlantica C. brevifolia C. deodara Localisation géographique des 4 espèces de cèdre C. libani
Taxonomie controversée C. brevifolia C. atlantica C. libani C. Libani var.brevifolia C. libani C. deodara
Identification des ressources génétiques Banque de graines Évaluation de la diversité génétique Conservation  Étiquetage g...
Espèces Origine  C. brevifolia C. deodara C. atlantica C. libani Populations étudiées Mirdeh  /  Afghanistan Srinagar /  I...
Catalan Arslankoy Sultandagi Elmaly Karaçay Tripylos Akkar Bcharre Barouk Ain Zhalta Slenfeh Méditerranée orientale
Ventoux Djurjura Tizi-Ifri Seheb Répartition de  Cedrus atlantica
1- Quelles sont les relations phylogénétiques des 4 espèces ? 2- Est ce que le processus de fragmentation a modifié la div...
Analyses génétiques effectuées sur  Cedrus Taille et composition du génome Marqueurs moléculaires:  AFLPs, RAPD, cpSSR, IT...
Ventoux (France) Paphos (Cyprus) Mirdeh (Afghanistan) Taille du génome des différentes espèces de cèdre Bou Dagher-Kharrat...
Taille du génome minimale et maximale dans la famille des Pinaceae Minimum 11.5 pg / 2C C-values database (release 1.0, Se...
AT % GC % Composition en AT & GC du génome des cèdres 0 20 40 60 80 100 59.3 59 59.1 59.5 40.3 C. atlantica 40.3 C. libani...
C. libani
Fluorochrome banding Chromomycine A 3 Hoechst 33258
 
C. atlantica C. libani 4  GC-rich bands 6  GC-rich bands
C. atlantica C. libani 22  AT-rich bands 24  AT-rich bands
18S-25S  : 8 sites  (4 interstitial, 2 centromeric) 5S  : minimum 2 sites  (2 on terminal region) C. libani FISH des gènes...
Identification des groupes taxonmiques à l’aide de marqueurs moléculaires
-  138  primer pairs only  5 / 6  primer pairs were useful to differentiate  C. atlantica  from  C. libani  and  C. atlant...
Marqueurs AFLP spécifiques d’espèces C. libani Liban Turquie C. libani C. brevifolia C. deodara C. atlantica
C. libani C. atlantica Croisement III ? LU03 LBA X Analyse des croisements interspécifiques C. atlantica C. brevifolia ? X...
C. atlantica C. libani AFLP  acrylamide gel showing the progeny of tree  C. atlantica  pollinated by C . libani
? ? C. libani C. libani Identification des plantules avant reboisement en utilisant les  cpSSR
Evaluation de la diversité génétique
Fragmentation des populations  & Faible densité   Perte de diversité génétique Les goulots d’étranglements sont typiquemen...
Population C. L. Elmaly C. brevifolia C. L. Arslankoy C. L. Çatalan C. L. Akkar C. L. Barouk C. L. Ain Zhalta C. A. Seheb ...
Différenciation génétique   des cèdres de la Méditerranée orientale 0.081 0.201 0.273 0.087 0.202
Axis 2 Axis 3 -0,5 -0,4 -0,3 -0,2 -0,1 0,0 0,1 0,2 0,3 0,4 -0,7 -0,5 -0,3 -1,00e-1 0,1 0,3 0,5 PCA Himalayan cedars Atlas ...
C. atlantica   Djurjura C. atlantica   Ventoux C. atlantica   Seheb C. atlantica  Tizi-Ifri C. libani  Ain Zhalta C. liban...
Caractérisation écophysiologique
 
 
Caracterisation  génétique et écophysiologique Effet du génotye Environnement Physiologie Sélection des peuplements porte ...
Sur le terrain! Cellule Reforestation http://www.usj.edu.lb/7ejour/08ref.html
 
Campagnes de  reforestation Bois de Boulogne Aana Kfardebian Kfardebian Tarchich
Valorisation et utilisation des espèces indigènes pour le reboisement et restauration des montagnes libanaises <ul><ul><ul...
L aboratoire  C aractérisation  G énomique   des  P lantes Évaluation de la biodiversité des plantes indigènes du Liban Ca...
http:// fs.usj.edu.lb/flore_du_liban /
http:// fs.usj.edu.lb/flore_du_liban /
http:// fs.usj.edu.lb/flore_du_liban /
Bouchra Farah Nour Dana
Prochain SlideShare
Chargement dans…5
×

La génétique à la rescousse du cèdre du Liban

2 909 vues

Publié le

3ème conférence CORACUS Dr. Magda Bou Dagher Kharrat est professeur associé et responsable du cycle Master au département des Sciences de la vie et de la terre de la Faculé des sciences de l’Université Saint Joseph. Titulaire d’un doctorat en biologie moléculaire des plantes, elle a mené un travail de recherche sur la génétique et l’écologie des arbres forestiers. Elle a reçu le prix UNESCO - L’Oréal pour les femmes et la science 2008 pour son projet portant sur l’évaluation et la valorisation de la flore du Liban.

Publié dans : Formation, Business, Technologie
  • Soyez le premier à commenter

La génétique à la rescousse du cèdre du Liban

  1. 1. Magda BOU DAGHER KHARRAT, Professeur associé La génétique à la rescousse du cèdre du Liban
  2. 2. Cedrus libani /Bcharre Lebanon
  3. 3. Coffre en bois de cèdre (pharaons time) Sarcophage en bois de cèdre Temple d’ARTEMIS (Ephèse) 550 B.J.-C. Gravures de Khorsabad (Assyria, VIIIème B. J.C.)
  4. 4. Mont - Liban Vallée de la Bekaa Anti - Liban 1000 m 1500 m 2000 m 3000 m Distribution en fonction de l’altitude de la végétation au Liban
  5. 11. 1948   2007 Enclos relique des cèdres de Bcharré Jean Rolley L a situation forestière en Syrie et au Liban. Unasylva Numéro: Vol. 2, No. 2 1948  
  6. 12. Zone reboisée Enclos relique des cèdres de Bcharré
  7. 16. Reforestation at Barouk (Lebanon)
  8. 17. De quelle espèce de cèdre s ’agit-il?
  9. 18. C. atlantica C. brevifolia C. deodara Localisation géographique des 4 espèces de cèdre C. libani
  10. 19. Taxonomie controversée C. brevifolia C. atlantica C. libani C. Libani var.brevifolia C. libani C. deodara
  11. 20. Identification des ressources génétiques Banque de graines Évaluation de la diversité génétique Conservation Étiquetage génétique
  12. 21. Espèces Origine C. brevifolia C. deodara C. atlantica C. libani Populations étudiées Mirdeh / Afghanistan Srinagar / Inde Akkar; Ain-Zhalta; Barouk; Bcharre/ Liban Djurdjura / Algérie Seheb / Maroc Tizi-Ifri / Maroc Ventoux / France Paphos / Chypre Slenfeh / Syrie Arslankoy; Sultandagi; Çamkuyusu; Çatalan; Karaçay/ Turquie 17 POPULATIONS
  13. 22. Catalan Arslankoy Sultandagi Elmaly Karaçay Tripylos Akkar Bcharre Barouk Ain Zhalta Slenfeh Méditerranée orientale
  14. 23. Ventoux Djurjura Tizi-Ifri Seheb Répartition de Cedrus atlantica
  15. 24. 1- Quelles sont les relations phylogénétiques des 4 espèces ? 2- Est ce que le processus de fragmentation a modifié la diversité génétique inter- et intra- populations ? But de l’étude
  16. 25. Analyses génétiques effectuées sur Cedrus Taille et composition du génome Marqueurs moléculaires: AFLPs, RAPD, cpSSR, ITS Caryotype et localisation des gènes ribosomiques
  17. 26. Ventoux (France) Paphos (Cyprus) Mirdeh (Afghanistan) Taille du génome des différentes espèces de cèdre Bou Dagher-Kharrat et al. 1999. Genome size and Karyotype investigations in Cedrus genus . C ytogenetics and Cell Genetics . 85 - 134. Seheb (Morocco) Tizi-Ifri (Morocco) Provenance Ouled-Yacoub (Algeria) Karaçay (Turkey) Çatalan (Turkey) Elmali (Turkey) Barouk (Lebanon) Bcharre (Lebanon) Espèce C. brevifolia C. deodara C. atlantica C. libani N 6 5 6 8 C V ( % ) 0 . 52 1 . 08 1 . 84 1 . 58 2C pg 32.5 32.2 32.4 32.5 S D ( p g) 0 . 17 0 . 35 0 . 60 0 . 52 1 0 2 . 01 31.8 0.64 6 1 . 22 32.6 0.40 6 1 8 2 0 1 2 6 1 . 34 1 . 92 1 . 17 1 . 30 0 . 50 32.0 32.7 32.7 32.9 32.9 0 . 43 0 . 63 0 . 38 0 . 43 0 . 16 32.5 0.41 32.4 0.20
  18. 27. Taille du génome minimale et maximale dans la famille des Pinaceae Minimum 11.5 pg / 2C C-values database (release 1.0, Sept. 2001) http://www.rbgkew.org.uk/cval/homepage.html Maximum 64.4 pg / 2C 32.5 pg / 2C Cedrus sp. Pinus caribaea Pinus lambertiana
  19. 28. AT % GC % Composition en AT & GC du génome des cèdres 0 20 40 60 80 100 59.3 59 59.1 59.5 40.3 C. atlantica 40.3 C. libani 40.4 C. deodara 40.4 C. brevifolia
  20. 29. C. libani
  21. 30. Fluorochrome banding Chromomycine A 3 Hoechst 33258
  22. 32. C. atlantica C. libani 4 GC-rich bands 6 GC-rich bands
  23. 33. C. atlantica C. libani 22 AT-rich bands 24 AT-rich bands
  24. 34. 18S-25S : 8 sites (4 interstitial, 2 centromeric) 5S : minimum 2 sites (2 on terminal region) C. libani FISH des gènes ribosomiques
  25. 35. Identification des groupes taxonmiques à l’aide de marqueurs moléculaires
  26. 36. - 138 primer pairs only 5 / 6 primer pairs were useful to differentiate C. atlantica from C. libani and C. atlantica from C. brevifolia respectively. RAPD - 20 primer pairs, 4 primer pairs were useful to differentiate C. atlantica from C. libani. AFLP - 7 primer pairs, 3 primer pairs were useful to differentiate C. atlantica from C. libani and C. brevifolia cpSSR - Séquençage des ITS des 4 espèces ITS
  27. 37. Marqueurs AFLP spécifiques d’espèces C. libani Liban Turquie C. libani C. brevifolia C. deodara C. atlantica
  28. 38. C. libani C. atlantica Croisement III ? LU03 LBA X Analyse des croisements interspécifiques C. atlantica C. brevifolia ? X B 1 B 2 Croisement I LB02 C. atlantica C. brevifolia ? LU01 B 1 B 2 Croisement II X
  29. 39. C. atlantica C. libani AFLP acrylamide gel showing the progeny of tree C. atlantica pollinated by C . libani
  30. 40. ? ? C. libani C. libani Identification des plantules avant reboisement en utilisant les cpSSR
  31. 41. Evaluation de la diversité génétique
  32. 42. Fragmentation des populations & Faible densité Perte de diversité génétique Les goulots d’étranglements sont typiquement associés avec la fragmentation, ceci emmène à une perte de la diversité génétique comme résultat de lé dérive génétique et des autofécondations.
  33. 43. Population C. L. Elmaly C. brevifolia C. L. Arslankoy C. L. Çatalan C. L. Akkar C. L. Barouk C. L. Ain Zhalta C. A. Seheb C. L. Bcharré C. A. Djurjura C. L. Karaçay C. L. Sultandagi C. A. Ventoux C. D Srinagar C. A. Tizi Ifri H i 0,29 0.27 0,27 0,26 0,24 0,24 0,22 0,18 0,17 0,17 0,17 0,17 0,16 0,15 0,11 Diversité gtgénétique de Nei (1973) N 20 20 20 10 6 7 6 20 20 20 20 20 20 20 9 C. L. Slenfeh 0,35 20 0,16 C. D. Mirdeh 20 0.00 0.05 0.10 0.15 0.20 0.25 0.30 0.35 0.40 C. A. Djurjura C. A. Seheb C. A. Tizi Ifri C. A. Ventoux C. brevifolia C. deodara C. L. Ain Zhalta C. L. Akkar C. L. Arslankoy C. L. Barouk C. L. Elmaly C. L. Sultandagi C. L. Bcharre C. L. Catalan C. L. Karaçay C. L. Slenfeh C. deodara
  34. 44. Différenciation génétique des cèdres de la Méditerranée orientale 0.081 0.201 0.273 0.087 0.202
  35. 45. Axis 2 Axis 3 -0,5 -0,4 -0,3 -0,2 -0,1 0,0 0,1 0,2 0,3 0,4 -0,7 -0,5 -0,3 -1,00e-1 0,1 0,3 0,5 PCA Himalayan cedars Atlas cedars Oriental mediterranean cedars Genetic distances
  36. 46. C. atlantica Djurjura C. atlantica Ventoux C. atlantica Seheb C. atlantica Tizi-Ifri C. libani Ain Zhalta C. libani Bcharré C. libani Akkar C. libani Barouk C. libani Karaçay C. libani Sultandagi C. libani Arslankoy C. libani Elmaly C. brevifolia C. libani Catalan C. deodara Himalaya C. deodara Inde C. libani Latquiya (Syrie) UPGMA cluster using Nei (1978) unbiased minimum distance using AFLP data Bou Dagher-Kharrat et al. 2006. Geographical diversity and genetic relationships among Cedrus species estimated by AFLP. Tree Genetics & Genomes DOI 10.1007/s11295-006-0065-x.
  37. 47. Caractérisation écophysiologique
  38. 50. Caracterisation génétique et écophysiologique Effet du génotye Environnement Physiologie Sélection des peuplements porte graines
  39. 51. Sur le terrain! Cellule Reforestation http://www.usj.edu.lb/7ejour/08ref.html
  40. 53. Campagnes de reforestation Bois de Boulogne Aana Kfardebian Kfardebian Tarchich
  41. 54. Valorisation et utilisation des espèces indigènes pour le reboisement et restauration des montagnes libanaises <ul><ul><ul><ul><li>Cedrus libani </li></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><li>Juniperus (plusieurs espèces) </li></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><li>Abies silicica </li></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><li>Pinus brutia, pinea, halepensis </li></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><li>Espèces accessoires: Malus triolabata, Quercus pennatifida, Q. brantii, Q. calliprinos, Styrax officinalis, Pyrus syriaca,… . </li></ul></ul></ul></ul>Établissement d’un laboratoire/pépinière à l’USJ
  42. 55. L aboratoire C aractérisation G énomique des P lantes Évaluation de la biodiversité des plantes indigènes du Liban Caractérisation écogéographique et génétique de Juniperus excelsa au Liban Caractérisation écogéographique et génétique du genre Astragalus au Liban Bouchra DOUAIHY Farah ABDEL SAMAD
  43. 56. http:// fs.usj.edu.lb/flore_du_liban /
  44. 57. http:// fs.usj.edu.lb/flore_du_liban /
  45. 58. http:// fs.usj.edu.lb/flore_du_liban /
  46. 59. Bouchra Farah Nour Dana

×