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ESJ62自由集会:オープンデータと生態学 2015/03/21
オープンデータから
オープンサイエンスへ
(独)農業環境技術研究所&
OSGeo財団日本支部
岩崎 亘典
今日の発表内容
• オープンサイエンスとは?
– オープンサイエンスの成立背景
• オープンサイエンスの実例
– データ提供型
– データ収集型
• オープンサイエンスの現状と問題点
– 特に日本国内の情勢
• まとめにかえて
2Agenda
ESJ62自由集会:オープンデータと生態学 2015/03/21
オープンサイエンスとは?
オープンデータの定義
• 共通見解がほぼできている。
– 共通ルールとしてのCreative Commonsや
Open Data Commons
4オープンサイエンスってなに?
オープンサイエンスの定義
• 明確な定義はまだない
– 考え方や運動といえる
• 17世紀に学術誌ができた時、第1次オープンサイ
エンス革命とする意見もあり
– 総じていえば科学の民主化と進展
5オープンサイエンスとは?
http://openscienceasap.org/ http://en.wikipedia.org/wiki/Open_science
“Open science is the idea that scientific
knowledge of all kinds should be openly shared
as early as is practical in the discovery
process.” Michael Nielsen
第1次オープンサイエンス革命以前
• 科学者は暗号で成果を発表
– ガレリオは土星の輪の発見をアナグラムで公開
• smaismrmilmepoetaleumibunenugttauiras
↓
• Altissimum planetam tergeminum observavi(「私
は、最も遠い惑星が三重星になっていることを観測し
た」) http://ja.wikipedia.org/wiki/土星の環
• それをケプラーが間違った解読をしたり
– SALVE UMBISTINEUM GEMINATUM MARTIA PROLES
(二つのノブ、火星の子どもたちにあいさつを) オープンサイエンス革命、
» しかも火星に衛星が2つあったというオチ
6オープンサイエンスとは?
オープンサイエンスの構成要素
• 以下のような特徴を持つ
– 背景としてのネットの普及
7オープンサイエンスとは?
"Open Science - Prinzipien" by Andreas E. Neuhold - Own work. Licensed under CC BY 3.0 via
Wikimedia Commons - http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Science_-
_Prinzipien.png#/media/File:Open_Science_-_Prinzipien.png
オープンサイエンスの成立背景
• Big Dataの生成
– 個人や研究チームだけでは分析できない、膨
大で多様なデータ
• 科学データ共有によるイノベーションの
期待と成果の還元
– 研究費の元はほとんど税金。国民のもの。
• 国際的にはデータ公開の義務化が進んでいる
– シリアルズ・クライシス(雑誌価格の高騰)
• ITC技術の発達
– データドリブン・サイエンスの進展
8オープンサイエンスとは?
OECDの動向
• 2004 年に、先進国を含む OECD 加盟国の全ての科学
担当大臣が、公的資金によるアーカイブデータは公的に
利用可能であるべきと宣言
– Science, Technology and Innovation for the 21st Century.
Meeting of the OECD Committee for Scientific and
Technological Policy at Ministerial Level, 29-30 January
2004 - Final Communique
» http://www.oecd.org/science/sci-
tech/sciencetechnologyandinnovationforthe21stcentur
ymeetingoftheoecdcommitteeforscientificandtechnolog
icalpolicyatministeriallevel29-30january2004-
finalcommunique.htm
9オープンサイエンスとは?
http://www8.cao.go.jp/cstp/sonota/openscience/3kai/3_openscience_shiryou_4_4.pdf
OECDの動向
• 2007 年にOECD Principles and Guidelines for Access
to Research Data from Public Funding as a soft-law
recommendation を発表
– http://www.oecd.org/sti/sci-tech/38500813.pdf
10オープンサイエンスとは?
http://www8.cao.go.jp/cstp/sonota/openscience/3kai/3_openscience_shiryou_4_4.pdf
G8 科学大臣会合(2013 年 6 月 12 日)における共同声明
• G8 Science Ministers Statement London UK 12
June 2013
– 科学的研究のオープンデータ、オープンアクセスに関する協力
と合意
• https://www.gov.uk/government/publications/g8-science-
ministers-statement-london-12-june-2013
11オープンサイエンスとは?
http://www8.cao.go.jp/cstp/sonota/openscience/3kai/3_openscience_shiryou_4_4.pdf
米国・NIH(国立衛生研究所)の取り組み
• 2003 年 10 月、NIH「Data Sharing Policy」を制定
– NIH のファンド申請時に「Data Sharing Plan」の作成を義務
化
» NIH Data Sharing Policy and Implementation
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• http://grants.nih.gov/grants/policy/data_sharing/data_shari
ng_guidance.Htm
12オープンサイエンスとは?
http://www8.cao.go.jp/cstp/sonota/openscience/3kai/3_openscience_shiryou_4_4.pdf
NSF(国立科学財団)の取り組み
• 2011 年 1 月、NSF のファンド申請者に「Data
Management Plan」の作成を義務化
– Data の範囲は研究データ、出版物(論文)、サンプル、収集
物、ソフトウェア、モデル等
» National Science Foundation. Dissemination and
Sharing of Research Results.
• http://www.nsf.gov/bfa/dias/policy/dmp.jsp
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この影響?
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GRC(Global Research Council)(JSPS、JSTが参画)
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論文のオープンアクセスを実施するアク ションプランを採択。
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• 2015 年は日本が議長国(JSPS)
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14オープンサイエンスとは?
http://www8.cao.go.jp/cstp/sonota/openscience/3kai/3_openscience_shiryou_4_4.pdf
ESJ62自由集会:オープンデータと生態学 2015/03/21
オープンサイエンスの実例
オープンサイエンスの類型
• データ提供型
– 研究者がデータを提供し、分類などを助けて
もらう
– Galaxy Zooなど
• http://www.galaxyzoo.org/
• データ収集型
– ユーザーにデータ提供を依頼し、その分析を
行う
– eBirdなど
• http://ebird.org/content/ebird/
16オープンサイエンスの実例
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• ボランティアによる銀河の分類
17データ提供型オープンサイエンス
SNAPSHOT SERENGET
• 自動撮影カメラ画像の分類
– http://www.snapshotserengeti.org/
18データ提供型オープンサイエンス
ZOONIVERSE
19データ提供型オープンサイエンス
eBird
• 鳥類に関するデータの提供と可視化
– 研究でも使われる
20データ収集型オープンサイエンス
iNaturalist
• 生物に関する情報の投稿と情報共有
– デフォルトライセンスはCC BY 3.0
• http://www.inaturalist.org/
21データ収集型オープンサイエンス
ESJ62自由集会:オープンデータと生態学 2015/03/21
オープンサイエンスの
現状と問題
オープンサイエンスの問題
• 上手くいかない事例も多々
– というか、そっちの方が多い
• qwiki(量子コンピューターのWiki)
– 誰も書かない
• Natureの公開ピアレビュー
– みんな読むだけ
• 理由→インセンティブが無い!
– 「データを公開することは、通常であれば自分の
キャリアにとって何の得にもならないどころか、
自分を不利にするのだ」
• マイケル・ニールセン オープンサイエンス革命、pp.16
– オープンサイエンスのツール開発も評価されない
23オープンサイエンスの現状と問題
日本におけるオープンサイエンスの現状
• データ収集型の試みが幾つかあるが、まだ黎明期
• 国としての“オープンサイエンス”の検討開始
– 3/23に報告が出される予定
• http://www8.cao.go.jp/cstp/sonota/openscience/index.html
24オープンサイエンスの現状と問題
国際的動向を踏まえたオープンサイエンスに関する検討会
• オープンデータ・オープンアクセスの推進
25オープンサイエンスの現状と問題
http://www8.cao.go.jp/cstp/sonota/openscience/2kai/2_openscience_shiryou_1_2.pdf
東さんの発表の例でいえば
オープンデータの世界では、
• 業者の著作権ではなく、発注者の著作権
になった。
オープンサイエンスの世界でも
• 科学者の著作権ではなく、資金提供団体の
著作権
になる?
26オープンサイエンスの現状と問題
日本におけるオープンサイエンスの今後
• “オープンサイエンス”は義務化される
– いわば黒船である
• だからといって上手くいくとは限らない
– 積極的にコミットするモチベーションがない
• “使いにくい”オープンデータ・・・。
• データと論文が公開されただけで “オープ
ンサイエンス”?
– 必要条件であっても十分条件ではない
27オープンサイエンスの現状と問題
ESJ62自由集会:オープンデータと生態学 2015/03/21
このままでオープンデータ・オープンアクセスに
なっても、オープンサイエンスが成り立つの?
(´・ω・`)
オープンデータは上手くやってるよね
29オープンサイエンの現状と問題
http://www.sapporosmile.com/projects/code-for-sapporo/
• モチベーションを上げる仕組みも必要
日本におけるオープンサイエンスの今後
• “オープンサイエンス”は義務化される
– いわば、黒船である
• だからといって上手くいくとは限らない
– 積極的にコミットするモチベーションがない
• “使いにくい”オープンデータ・・・。
• データと論文が公開されただけで “オープ
ンサイエンス”?
– 必要条件であっても十分条件ではない
“知の構築方法を変えるチャンスを目の前に
しているのだ” マイケル・ニールセン、オープンサイエンス革命 pp.324
30オープンサイエンの現状と問題
ESJ62自由集会:オープンデータと生態学 2015/03/21
まとめにかえて
オープンデータとオープンサイエンス
• オープンサイエンス
– オープンデータやオープンアクセスを基盤と
した”新しい科学”
• 黒船としての“オープンサイエンス”
– 国内でも、データの公開が推奨または義務づ
けられるだろう
• 今ならば先行者利得もある!
• “義務”では上手くいかない
– どの様にモチベーションを上げるか
• 中堅以上ががんばってほしい!
• “新しい科学”の発見のチャンス!!
32まとめ
ESJ62自由集会:オープンデータと生態学 2015/03/21
One more thing…
ESJ62自由集会:オープンデータと生態学 2015/03/21
で、おまえはどうするのだ?
言うからには自分もやらないと!
• 明治時代土地利用データをGitHubで公開
– https://github.com/wata909/habs_test
• 100m間隔の点データ
• 1/20万水戸の部分を先行公開
– 閲覧も可能
» http://wata909.github.io/habs_test/rapid544000.html
• ファイル形式はGeoJSON
– PostgreSQL形式も公開予定。shpは公開しません
• ライセンスは CC BY 2.1
– ただし暫定版
• 精度検証はこれからです。
本研究は科研費研究費25292213の助成を受けたものです
35まとめ
明治時代土地利用データをGitHubで公開
• 今ならやった者勝ち!(蟷螂の斧でもOK)
– 公開部分は一銭もかかってない(除く私の人件費)
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– これもオープンサイエンス!
36まとめ

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