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1  sur  22
L'identification de l'espèce d'arbres individuels par
lidar aérien mono- ou multipectral
Benoît St-Onge, Brindusa Cristina Budei, Rachel Perron, Jean-François
Prieur
Départment de géographie
Université du Québec à Montréal
st-onge.benoit@uqam.ca
27 mars 2018
Vue sur le lidar
Introduction
• L’information sur l’espèce à l’échelle de
l’arbre individuel est cruciale pour
étudier:
– la biodiversité et les écosystèmes ;
– la dynamique des forêts ;
– la biomasse forestière ;
– la ressource ligneuse et la qualité du bois ;
– la répartition des arbres urbains.
2
Photo : Udaya Vepakomma, FPInnovations
Espèces communes de l’est du Canada
Introduction
• À partir des airs, les espèces peuvent être identifiées selon:
– l’architecture des couronnes
– la réflectance du feuillage: r / couleur : r (l)
• Le lidar standard fournit la 3D et une seule l pour l’intensité.
4
Réflectance
5
• Sources de données sur la réflectance :
Imagerie aérienne (passive) I : Intensité lidar (active)
 = 
  
Normalisation de l’intensité lidar
6
R1
R2
• La portée (R) est variable dans la
fauchée.
• On normalise l’intensité selon
une portée de référence (Rref)
Rref
Lidar multispectral
• Le système Titan de Teledyne Optech balaye en 3 l
– 1064 nm (PIR = C2) sur un plan à 0.0o
– 1550 nm (IROC = C1) sur un plan à 3.5o
– 532 nm (vert = C3) sur un plan à 7.0o
7
Image d’intensité à 3 l (Titan)
Parc Angrignon 2017
données Titan, V. de M.
Identification d’espèces (1 ou 3 l)
• Le lidar multispectral
améliore les résultats
9
r
C3 C2 C1
Adapté de : Hovi et al, 2017. Silva Fennica, vol.
57 (4), article ID 7753
Procédé d’identification des espèces
10
Nuages de points LAS
Carte des espèces
r
l
Délinéation sur le MHC
Extraction
Caractéristiques
Classificateur
Données d’entraînement
Eb
Eb Eb
Eb
Eb
Entraînement
3D +
int.
• Caractéristiques (par couronne)
– Moyenne, médiane, etc.
– Écart-type
– Coefficient de variation
– Dans le cas du lidar MS , NDVIs:
11
Sélection du type de retour
– tous les retours
– tous les premiers retours
– retours uniques seulement
– 1er et 2ème retours correspondants
(1064 nm - 532 nm) / (1064 nm + 532 nm)
(1550 nm - 532 nm) / (1550 nm + 532 nm)
(1550 nm - 1064 nm) / (1550 nm + 1064 nm)
and et ratios simples (par ex. 532 nm / 1064 nm )
Caractéristiques d’intensité (variables de classification)
Exactitude de l’identification d’espèces
• Résultats basés sur les données du Titan (1 et 3 l)
– Budei, St-Onge et al, 2018. Identifying the genus or species of individual trees using a
three-wavelength airborne lidar system. Rem. Sens. Env., v. 204, pp. 632-647.
12
13
Matrice de confusion en % (YRF, 3 l, 10 espèces, exactitude = 76%)
14
Matrice de confusion en % (PRF, 3 l, 18 espèces, exactitude = 57%)
Feuillus
Identification des espèces en milieu urbain
• Extraire les points-arbres, donc se
débarrasser :
– des bâtiments ;
– des points parasites (fils !).
• Nombreuses espèces, variétés, et
cultivars.
• Architectures modifiées par l’élagage
15
SEGMA v. 0.2.0
16
SEGMA v. 0.2.0
• Performance: >150 arbres/seconde
17
SEGMA v. 0.2.0
18
• Propriétés des arbres
SEGMA v. 0.2.0
• Score de qualité de délinéation
19
Score : 89.7% Score : 76.3%
Réseau neuronal convolutif (apprentissage profond)
• Les RNC peuvent « créer » des caractéristiques automatiquement.
20
Adapté de MathWorks
Apprentissage autonome des caractéristiques Classification
Frêne
Érable
Épinette
Défolié
Conclusions
• L’identification de l’espèce d’arbres individuels est
automatisable, donc réalisable sur de grands territoires.
• L’intensité lidar apporte une information utile.
• Le lidar multispectral améliorer sensiblement l’exactitude,
surtout dans les cas de classifications à nombreuses
essences.
• Les NDVIs, seulement possibles avec le lidar MS, sont parmi
les caractéristiques les plus utiles.
• De nombreux progrès sont à venir !
21
Remerciements
• Projet AWARE, dirigé par N. Coops (UBC)
• Pour obtenir SEGMA: googler “SEGMA 0.2.0”
ou écrire à st-onge.benoit@uqam.ca
• DESS en SIG de l’UQAM : admissions -> 1er mai
22

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L'identification de l'espèce d'arbres individuels par lidar aérien mono- ou multipectral

  • 1. L'identification de l'espèce d'arbres individuels par lidar aérien mono- ou multipectral Benoît St-Onge, Brindusa Cristina Budei, Rachel Perron, Jean-François Prieur Départment de géographie Université du Québec à Montréal st-onge.benoit@uqam.ca 27 mars 2018 Vue sur le lidar
  • 2. Introduction • L’information sur l’espèce à l’échelle de l’arbre individuel est cruciale pour étudier: – la biodiversité et les écosystèmes ; – la dynamique des forêts ; – la biomasse forestière ; – la ressource ligneuse et la qualité du bois ; – la répartition des arbres urbains. 2 Photo : Udaya Vepakomma, FPInnovations
  • 3. Espèces communes de l’est du Canada
  • 4. Introduction • À partir des airs, les espèces peuvent être identifiées selon: – l’architecture des couronnes – la réflectance du feuillage: r / couleur : r (l) • Le lidar standard fournit la 3D et une seule l pour l’intensité. 4
  • 5. Réflectance 5 • Sources de données sur la réflectance : Imagerie aérienne (passive) I : Intensité lidar (active)  =    
  • 6. Normalisation de l’intensité lidar 6 R1 R2 • La portée (R) est variable dans la fauchée. • On normalise l’intensité selon une portée de référence (Rref) Rref
  • 7. Lidar multispectral • Le système Titan de Teledyne Optech balaye en 3 l – 1064 nm (PIR = C2) sur un plan à 0.0o – 1550 nm (IROC = C1) sur un plan à 3.5o – 532 nm (vert = C3) sur un plan à 7.0o 7
  • 8. Image d’intensité à 3 l (Titan) Parc Angrignon 2017 données Titan, V. de M.
  • 9. Identification d’espèces (1 ou 3 l) • Le lidar multispectral améliore les résultats 9 r C3 C2 C1 Adapté de : Hovi et al, 2017. Silva Fennica, vol. 57 (4), article ID 7753
  • 10. Procédé d’identification des espèces 10 Nuages de points LAS Carte des espèces r l Délinéation sur le MHC Extraction Caractéristiques Classificateur Données d’entraînement Eb Eb Eb Eb Eb Entraînement 3D + int.
  • 11. • Caractéristiques (par couronne) – Moyenne, médiane, etc. – Écart-type – Coefficient de variation – Dans le cas du lidar MS , NDVIs: 11 Sélection du type de retour – tous les retours – tous les premiers retours – retours uniques seulement – 1er et 2ème retours correspondants (1064 nm - 532 nm) / (1064 nm + 532 nm) (1550 nm - 532 nm) / (1550 nm + 532 nm) (1550 nm - 1064 nm) / (1550 nm + 1064 nm) and et ratios simples (par ex. 532 nm / 1064 nm ) Caractéristiques d’intensité (variables de classification)
  • 12. Exactitude de l’identification d’espèces • Résultats basés sur les données du Titan (1 et 3 l) – Budei, St-Onge et al, 2018. Identifying the genus or species of individual trees using a three-wavelength airborne lidar system. Rem. Sens. Env., v. 204, pp. 632-647. 12
  • 13. 13 Matrice de confusion en % (YRF, 3 l, 10 espèces, exactitude = 76%)
  • 14. 14 Matrice de confusion en % (PRF, 3 l, 18 espèces, exactitude = 57%) Feuillus
  • 15. Identification des espèces en milieu urbain • Extraire les points-arbres, donc se débarrasser : – des bâtiments ; – des points parasites (fils !). • Nombreuses espèces, variétés, et cultivars. • Architectures modifiées par l’élagage 15
  • 17. SEGMA v. 0.2.0 • Performance: >150 arbres/seconde 17
  • 18. SEGMA v. 0.2.0 18 • Propriétés des arbres
  • 19. SEGMA v. 0.2.0 • Score de qualité de délinéation 19 Score : 89.7% Score : 76.3%
  • 20. Réseau neuronal convolutif (apprentissage profond) • Les RNC peuvent « créer » des caractéristiques automatiquement. 20 Adapté de MathWorks Apprentissage autonome des caractéristiques Classification Frêne Érable Épinette Défolié
  • 21. Conclusions • L’identification de l’espèce d’arbres individuels est automatisable, donc réalisable sur de grands territoires. • L’intensité lidar apporte une information utile. • Le lidar multispectral améliorer sensiblement l’exactitude, surtout dans les cas de classifications à nombreuses essences. • Les NDVIs, seulement possibles avec le lidar MS, sont parmi les caractéristiques les plus utiles. • De nombreux progrès sont à venir ! 21
  • 22. Remerciements • Projet AWARE, dirigé par N. Coops (UBC) • Pour obtenir SEGMA: googler “SEGMA 0.2.0” ou écrire à st-onge.benoit@uqam.ca • DESS en SIG de l’UQAM : admissions -> 1er mai 22