BioSEPLN 2010 Workshop on Language Technology applied to biomedical and health documents, Valencia, España (September 6, 2010) BioSEPLN 2010 Workshop on Language Technology applied to biomedical and health documents

1. BioSEPLN 2010
Workshop on Language
Technology applied to biomedical
and health documents.
Valencia, 6 de septiembre de
2010

2. Trabajos Aceptados
• Drug-Drug Interaction Detection: A New Approach Based on Maximal
Frequent Sequences. Sandra García Blasco, Roxana M. Danger
Mercaderes and Paolo Rosso.
• Semantic annotation of biomedical texts through concept retrieval.
Rafael Berlanga-Llavori, Victoria Nebot and Ernesto Jiménez-Ruíz.
• Using Wikipedia for term extraction in the biomedical domain: first
experiences. Jorge Vivaldi and Horacio Rodriguez.
• Improving an automatically extracted corpus for UMLS Metathesaurus
word sense disambiguation. Antonio Jimeno and Alan R. Aronson.
• Complementary Methods for De-identifying Sensitive Data with a focus
on Clinical Discourse. Dimitrios Kokkinaris.
• A Biomedical Information Retrieval System based on Clustering for
Mobile Devices. Manuel de La Villa Cordero, Alejandro Muñoz, Manuel
Millán and Manuel Maña.
• First Steps in The Manual and Automatic Annotation of a Corpus of
Clinical Notes in Spanish. Maite Oronoz Anchordoqui, Arantza Diaz de
Ilarraza and Ortzi Torices.

3. Envío de trabajos
• 13 envíos, 7 artículos aceptados.
• Temas:
– Aplicación IE
– Aplicación IR (dispositivos móviles)
– Aplicación Anonimización
– Corpora y anotación
– Sobre inglés/español

4. Otros Workshops con temas
similares
• 3rd Critical Assessment for Information Extraction in
Biology challenge, BioCreative III , September 2010,
Maryland, USA, www.biocreative.org
• ACL BioNLP, Julio 2010, Suecia
(http://compbio.uchsc.edu/BioNLP2009/index.shtml)
• CALBC challenge (Collaborative Annotation of a Large-
Scale Biomedical Corpus), June 2010, Cambridge, U.K.,
http://www.ebi.ac.uk/Rebholz-srv/CALBC/
• Fourth International Symposium on Semantic Mining in
Biomedicine (SMBM 2010), Octubre 2010, European
Bioinformatics Institute, UK, http://www.smbm.eu/

5. Otros Workshops con temas
similares
• 1st ACM International Conference on Health Informatics,
IHI 2010, November 11-12, Washington, DC,
http://ihi2010.sighi.org
• ACM International Workshop on Data and Text Mining in
BioInformatics (DTMBIO),
http://biosoft.kaist.ac.kr/dtmbio2009/home.html
• Workshop on Advances in Bio Text Mining (BioTM), May
2010, Gante B´elgica,
http://www.clips.ua.ac.be/BioTM2010/
• LREC Workshop on Building and evaluating resources
for biomedical text, http://www.nactem.ac.uk/biotxtm/
• International Symposium on Languages in Biology and
Medicine (LBM), http://lbm2009.biopathway.org/.

6. Idoneidad Workshop BioSEPLN
• A la vista del interés del tema ¿Propuesta de una segunda
edición?
• Buscar diferenciación de otros workshops:
• ¿centrado en el tratamiento de textos en español? (leer nota)
• ¿Marco de evaluación para nuevas tareas no cubiertas por
BioCreative, por ejemplo, anonimización de notas cl´inicas,
extracción de DDI, BNER en español, etc.?
• ¿Otros temas de interés considerando la oferta existente?
• Combinación presentación trabajos de investigación +
charla+ formación (¿algún tutorial?) mayor audiencia
• ¿Organizar otro tipo de reuniones?
• ¿otros?
• ¿Interés por parte de los Grupos de Investigación
nacionales para ampliación?

7. Muchas gracias!!!.
Hasta Pronto!!!
(¿BioSEPLN 2011?)