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ENZIMAS
ENZIMAS
1.   Generalidades.
2.   Nomenclatura
3.   Propiedades: sitio activo, especificidad, eficiencia
     catalítica, holoenzimas.
4.   Como trabajan: energía de activación y sitio activo.
5.   Factores que afectan la velocidad de reacción:
     concentración de sustrato, pH y temperatura.
6.   Cinética enzimática: ecuación de Michaelis-Menten.
7.   Inhibidores de la actividad enzimática: inhibición
     competitiva, inhibición no competitiva, drogas
     (inhibodores enzimáticos).
8.   Regulación de la actividad enzimática: sitios de unión
     alostérica, regulación mediante modificación
     covalente, inducción/represión de síntesis de enzimas.
ENZIMAS
   Las enzimas son moléculas catalíticas (proteínas)
    que incrementan la velocidad de reacciones
    químicas que son energéticamente posibles.

   No son consumidas durante la reacción.

   Virtualmente todas las reacciones del organismo
    son mediadas por enzimas.
NOMENCLATURA
 Nombre   recomendado (es el más común):
  tienen el subfijo “asa” ligado al substrato de la
  reacción.
  Ejemplo: glucosidasa y ureasa.
 Nombre sistemático:
 las enzimas se dividen en 6 clases principales.
 se especifica el nombre del sustrato seguido de
  la reacción catalizada y el subfijo asa.
 Ejemplo:
D-glyceraldehído 3-fosfato NAD+
  oxidorreductasa
CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS
   Oxidorreductasa: enzimas que
    catalizan oxidorreducciones entre dos
    sustratos, S y S.




   Transferasas. Catalizan reacciones
    en las que hay transferencia de un
    grupo de una molécula a otra.
    Ejemplo: trasnaminasas y
    transmetilasas.
   Hidrolasas: catalizan la reacciones
    donde se prode la rotura de enlaces
    por la adición de agua. Ejemplos:
    estereasas, fosfatasas y pepetidasas.
   Liasas. Catalizan las reacciones en
    las que se eliminan grupos (H2O,
    NH3, CO2)



   Isomerasas. Catalizan
    reordenamientos intramoleculares
    ejemplo: epimerasas y mutasas.




   Ligasas. catalizan la reacción de un
    enlace entre dos moléculas de
    sustrato. Se requiere hidrólisis de
    ATP.
ISOENZIMAS (O ISOFORMAS)
   Enzimas que difieren en su secuencia de
    aminoácidos, pero que poseen la misma actividad
    catalítica, es decir catalizan la misma reacción.

   En general, las isoenzimas representan enzimas de
    diferentes genes cuyos productos catalizan la misma
    reacción.

   Estas enzimas generalmente tienen diferentes
    parámetros cinéticos (diferentes valores de KM) o
    diferentes propiedades reguladoras.
PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS


   Sitio activo
   Alta especificidad
   Alta eficiencia catalítica
   Sistema de regulación
   Localización específica dentro de la célula
    (compartamentalización)
COMPARTIMENTALIZACIÓN

• La mayoría de las enzimas
  están localizadas en
  organelos específicos, esta
  compartimentalización
  sirve para aislarlas de otras
  reacciones y tener un
  ambiente favorable para la
  reacción.
SITIO ACTIVO
• Esta constituido por cadenas laterales de
  aminoácidos que forman una superficie
  tridimencional (“hendidura”) donde se unen los
  substratos.

• La complementariedad entre la enzima y el sustrato
  depende de fuerzas no covalentes: grupos
  hidrófobos, puentes de hidrógeno, interacciones
  electrostáitcas, etc.

• Es el lugar en donde se lleva a cabo la catálisis
SITIO ACTIVO
• En el sitio activo se forma
  un complejo ES (enzima
  sustrato) que
  posteriormente se
  convierte en un complejo
  EP (enzima-producto) y
  finalmente se disocia en la
  E (enzima) y el P
  (producto).
EFICIENCIA CATALÍTICA
   Las reacciones catalizadas por las enzimas son altamente
    eficientes, ya que son de 103-108 más eficientes que las
    mismas reacciones no catalizadas.

   Cada enzima es capaz de transformar de 100-1,000
    sustratos a producto por segundo.

   Kcat = es el número de recambio que es el número de
    moléculas de sustrato convertidas en producto por una
    molécula de enzima en una unidad de tiempo cuando la
    enzima esta saturada con el sustrato.
ESPECIFICIDAD
   Son altamente específicas, ya que interaccionan
    con uno o unos cuantos substratos y sólo catalizan
    un tipo de reacción química.

   El conjunto de enzimas elaborado por una célula
    particular determina en que vía metabólica está
    involucrada.
GRUPOS NO PROTÉICOS: COFACTORES
   Algunas enzimas requieren de otras moléculas no protéicas para
    llevar a cabo su actividad enzimática a estos componentes se les
    llama cofactores.

   Los cofactores pueden ser iones metálicos → Zn2+, Fe2+ Cu2+

   Cuando el cofactor es una molécula orgánica pequeña, se le
    llama coenzima .

   Cosustrato : coenzima se asocia en forma transitoria con la
    enzima (ejemplo: NAD+ y NADP+).

   Grupo prostético: coenzima se asocia permanentemente a la
    enzima (ejemplo: FAD).
   Holoenzima→enzima activa con su componente
    no proteico.
   Apoenzima→enzima inactiva sin el cofactor.
MUCHAS VITAMINAS SON PRECURSORES
          DE COENZIMAS
CATÁLISIS
Es la aceleración o el incremento en la
velocidad de una reacción química por medio
de un catalizador.

El catalizador acelera la reacción. Reduce la
energía de activación, sin sufrir ningún
cambio permanente.

Las enzimas son catalizadores biológicos.
CINÉTICA ENZIMÁTICA
   El estudio cuantitativo de la catálisis enzimática se
    denomina     cinética    enzimática    y    proporciona
    información sobre las velocidad de la reacción, afinidad
    de las enzimas por los sustratos y efectos de los
    inhibidores.

   Este conocimiento mejora la comprensión de la
    regulación de las rutas metabólicas y posibilita la
    mejora de fármacos más adecuados.

   Hay dos puntos importantes de considerar:
   Los cambios de energía que ocurren durante la catálisis.
   Como el sitio activo facilita la catálisis.
ENERGÍA LIBRE DE ACTIVACIÓN
 En todos las reacciones hay una
 barrera energética entre los
 reactantes y los productos.

 Durante la conversión de una
 molécula A, a un producto B, hay
 cambios de energía, pasando por un
 estado de transición “T” :




La energía libre de activación, es la
diferencia entre la energía del reactante
y “T”.
ENERGÍA LIBRE DE ACTIVACIÓN
   McKee:

   Energía         libre   de
    activación ∆G≠ es la
    cantidad de energía que se
    requiere para convertir un
    mol de moléculas de
    sustrato (reactante) desde
    el estado basal (la forma
    estable de baja energía de
    la molécula) al estado de
    transición “T”.
EFECTO DE LAS ENZIMAS SOBRE LA ENERGÍA
                      DE ACTIVACIÓN
Las enzimas son catalizadores que
permiten que las reacciones se realicen
más rápidamente ya que disminuyen la
energía de activación requerida para la
reacción.

En ausencia de la enzima, sólo una
pequeña proporción de las moléculas
reactantes posen suficiente energía para
alcanzar al estado “T”.

La combinación del sustrato y enzima
genera un nuevo camino de la reacción
donde la energía libre del estado de
transición es menor que aquél en la
ausencia de la enzima.
LA REACCIÓN SE ACELERA Y ESTABILIZA EL
ESTADOS DE TRANSICIÓN.

   …“La afinidad de la enzima por el sustrato conlleva
    a un decremento en su energía y por consiguiente
    a una reducción de la energía de activación de la
    reacción y a un aumento en la velocidad de la
    reacción”.



                                          Linus Pauling
                                                 (1948)
                                             1901-1994
                                          Premio Nóbel
                                       de Química 1954
PAPEL DEL SITIO ACTIVO EN LA CATÁLISIS

   El sitio activo además de ser el sitio de unión al
    substrato, también participa en            el proceso
    catalítico, ya que restringe los movimientos y las
    conformaciones del sustrato orientándolo en forma
    óptima para que se lleve a cabo la reacción.

   El sitio activo provee grupos catalíticos que aumentan
    la probabilidad de que se alcance el estado de
    transición lo que reduce la energía de activación
    necesaria para que se produzca la reacción hasta el
    producto.
PAPEL DEL SITIO ACTIVO EN LA
CATÁLISIS

    En las reacciones catalizadas por enzimas al
     disminuir la energía de activación se incrementa la
     velocidad de la reacción.

    Las enzimas no alteran el equilibrio de la
     reacción, sólo aumentan la velocidad hacia el
     equilibrio, el cual se alcanza en segundos o minutos.
FORMACIÓN DEL COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO.
 Aproximan el sustrato con una orientación
 favorable que promueven la formación del
 estado de transición: Complejo enzima-
 sustrato (ES).

 El sustrato se enlaza en el sitio activo de la
 enzima. El sitio activo es una hendidura
 tridimensional formada por grupos que
 provienen de diferentes partes de la
 secuencia de aminoácidos.

 La especificidad catalítica depende en parte
 a la especificidad de unión ES

                http://fig.cox.miami.edu/~cmallery/255/255enz/ES_complex.jpg
INTERACCIONES ES

El sustrato forma múltiples
interacciones no covalentes con
los residuos del sitio activo de la
enzima. Son interacciones
reversibles.

Puentes de hidrógeno,
Fuerzas de van der Waals
Interacciones hidrofóbicas
TAMAÑO DE LAS ENZIMAS
Los sitios activos ocupan un tamaño relativamente
pequeño comparado con el volumen de la enzima.
El resto de los aa:

     No está en contacto con el sustrato. Los residuos de
      aminoácidos extra sirven como una armazón para
      acomodar al sitio activo (la mayoría)

     También incluyen sitios de regulación, sitios de
      interacción con otras proteínas, o canales que
      aproximan los sustratos a los sitios activos.
MODELOS DE SITIOS ACTIVOS




Modelo de llave y cerrojo:             Modelo del ajuste inducido (induced fit):
El sitio activo es complementario en    La enzima cambia de forma cuando el
forma al del sustrato.                 sustrato se une a ésta, el sitio activo es
                                       complementario al sustrato sólo después
                                       de que el sustrato se une.

Animación del modelo inducido:
http://www.chem.ucsb.edu/~molvisual/ABLE/induced_fit/index.html
FACTORES QUE AFECTAN LA VELOCIDAD DE
                UNA REACCIÓN


 Concentración   del sustrato
 Temperatura
 pH
PH
   La concentración de H+, afecta la
    velocidad de la reacción.
    Usualmente se requiere que la
    enzima y el sustrato tengan
    grupos químicos específicos en
    estado ionizado o no ionizado
    para interactuar.

   Ejemplo: se puede requerir que
    el grupo amino de la enzima este
    protonado (-NH3+), y a pH
    alcalino este grupo es
    desprotonado, por lo que se
    requiere un pH básico.

   pH extremos pueden
    desnaturalizar las enzimas.

   El pH óptimo varía en las
    diferentes enzimas.
                                    •Ejemplo: pepsina   pH óptimo 2
TEMPERATURA
   La velocidad de la reacción
    se incrementa con la
    temperatura, hasta que se
    alcanza la máxima
    velocidad, aunque a mayor
    aumento suele degradarse.

   Este incremento se debe al
    aumento de el número de
    moléculas que tienen
    suficiente energía para pasar
    la barrera energética para
    formar los productos de la
    reacción.
CONCENTRACIÓN DEL SUSTRATO
   La velocidad (Vo) de una reacción es el número de
    moléculas de substrato convertidas en producto por
    unidad de tiempo (µmol/minuto).

   La velocidad se incrementa con la concentración del
    substrato hasta alcanzar una máxima velocidad
    (Vmax).

   La velocidad de la reacción se detiene a altas
    concentraciones de substrato y es el reflejo de la
    saturación de todos los sitios activos de las moléculas
    de enzima presentes en ese momento.
EFECTO DE LA CONCENTRACIÓN DEL SUSTRATO
           SOBRE LA VELOCIDAD DE REACCIÓN

• La mayoría de las
  enzimas muestran
  una cinética de
  Michaelis-Menten:

 Al graficar la
  velocidad inicial (Vo)
  de reacción contra la
  concentración de
  substrato se obtiene
  una curva hiperbólica.
MODELO DE MICHAELIS- MENTEN
 El
   modelo es válido solo cuando la
 concentración de la enzima es mucho
 menor que la concentración del sustrato (es
 decir, la enzima es un factor limitante) y
 cuando la enzima no es alostérica.

 Lasenzimas alostéricas no siguen la
 cinética de Michaelis-Menten ya que
 muestran una curva sigmoidea.
ENZIMAS ALOSTÉRICAS
 Son enzimas que s0n reguladas por moléculas llamadas
  efectores que se unen covalentemente a un sitio
  diferente del sitio activo.
 El efector alostérico puede alterar la afinidad de la
  enzima con su sustrato o/y modificar la actividad
  catalítica máxima de la enzima.
 Generalmente están formadas de varias subunidades.

 Frecuentemente estas enzimas funcionan como
  reguladoras porque cataliza el paso limitante de una vía
  metabólica.
MODELO DE REACCIÓN GLOBAL
                      ENZIMÁTICA

   La enzima se combina reversiblemente con el
    substrato formando un complejo ES, posteriormente se
    libera un producto y la enzima



 La mayoría de las reacciones catalizadas por enzimas
  se rigen bajo este modelo .
 La medida de la velocidad de la reacción catalizada
  por una enzima es bajo las condiciones óptimas de la
  enzima (pH, temperatura, cofactores, etc).
MODELO DE REACCIÓN GLOBAL
                        ENZIMÁTICA



donde:
 k1= constante de velocidad de formación de ES
 k-1=constante de velocidad de disociación de ES
 k2= constante de velocidad de la formación y liberación del
  producto.
 suposiciones:
 K-1 es despreciable con respecto a k1
 K-1 y k2 son iguales→”suposición de estado estacionanario”



   Mckee →K2=k-1      k3=k2
ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN
   Describe como la velocidad de la reacción varía con la concentración del
    sustrato:

                                                       Km es la constante de
                                                       Michaelis-Menten


   Suposiciones:
   La concentración del sustrato [S], es mucho mayor que la concentración de
    la enzima [E], por lo que el porcentaje del sustrato unido a la enzima en
    cualquier momento es pequeño.

   [ES] no cambia con el tiempo, es decir, la velocidad de formación de ES es
    igual a la de su degradación (E+P), se le llama suposición de estado
    estacionario.

   Se utiliza la velocidad inicial de reacción (Vo), ya que la velocidad de la
    reacción se mide tan pronto como el substato y la enzima se mezclan, por lo
    que la concentración de producto es muy pequeño y la reacción de P → S
    puede ignorarse.
KM Y VMAX
   La acción catalítica de una
    enzima sobre un sustrato
    determinado se describe
    mediante dos parámetros Km y
    Vmax

   Los valores de km y Vmax
    aproximados de una enzima se
    determinan midiendo y
    graficando las velocidades
    iniciales de reacción a varias
    concentraciones de sustrato.
KM Y VMAX

   Km     (constante    de    Michaelis-
    Menten),         se        determina
    experimentalmente y se considera
    una constante, es característica de
    la enzima y el sustrato particular en
    condiciones específicas y refleja la
    afinidad enzima-sustrato.

   Km es la concentración de sustrato
    a la cual, la velocidad de la reacción
    es igual a ½ de la Vmax.

   Vmax mide la velocidad máxima de
    la reacción.
CONSTANTE DE MICHAELIS-MENTEN
              KM
 LaKm es una característica muy importante
 en una reacción catalizada por una enzima
 y es muy significativa para su función
 biológica.

 Siconocemos el valor de Km y
 Vmax, podemos calcular la velocidad de
 una reacción enzimática para cualquier
 concentración de substrato.
KM Y AFINIDAD ENZIMATICA
 Km es característica de una enzima
  y su sustrato particular, refleja la
  afinidad de la enzima por el
  substrato.

 Una Km pequeño refleja una alta
  afinidad de la enzima por el
  substrato, porque se requiere una
  baja concentración de substrato
  para saturar la enzima a la
  mitad, esto es para que alcance la
  velocidad ½ Vmax.

 Una Km grande refleja una baja
  afinidad de la enzima por el
  substrato porque se requiere una
  alta concentración de substrato para
  saturar la enzima a la mitad.
EFECTO DE LA CONCENTRACIÓN DE LA ENZIMA
       SOBRE LA VELOCIDAD DE REACCIÓN


 Lavelocidad de la reacción es directamente
 proporcional a la concentración de la enzima a
 cualquier concentración de substrato.

 Ejemplo:  si la concentración de la enzima se
 reduce a la mitad, la velocidad inicial de reacción
 (Vo), al igual que la velocidad máxima (Vmax) se
 reducen a la mitad.
ORDEN DE LA REACCIÓN

   Cuando [S] es mucho
    menor que la Km,la
    velocidad de la reacción es
    proporcional a la
    concentración del
    sustrato, se dice entonces
    que la velocidad de la
    reacción es de primer
    orden con respecto a la
    concentración de subtrato.
ORDEN DE LA REACCIÓN

   Cuando [S] es mucho
    mayor que la Km la
    velocidad es constante e
    igual a Vmax, entonces, la
    velocidad de la reacción es
    independiente de la
    concentración del sustrato y
    se dice que la velocidad de
    la reacción es de orden
    cero con respecto a la
    concentración del sustrato.
ECUACIÓN DE LINEWEAVER-BURK
• La ecuación de Lineweaver-
  Burk se utiliza para una
  detminación más esacta de
  Km y Vmax. Se transforman
  los datos, la ec de Michaelis-
  Menten (una hipérbola), se
  reordena beniendo su inversa:
  en su inversa:




• Cuando se grafica el inverso
  de Vo= 1/Vo contra el inverso
  de [S]= 1/ [S], se obtiene una
  linea recta llamada grafico de
  Lineweaver-Burk.
GRAFICA DE LINEWEAVER-BURK
• La      ecuación    de
  Lineweaver-Burk genera
  una línea recta:

            y= mx +b


•   donde:
•   x=1/V
•   y= 1/[S]
•   m y b son constantes:
•   m=pendiente=Km/Vmax
•   b=1/Vmax
GRAFICA DE LINEWEAVER-BURK
   Esta línea se puede usar para
    calcular Km y Vmax y para
    determinar el mecanismo de
    acción de los inhibidores
    enzimáticos.
              La intersección en el eje
              de las “x” es 1/Vmax




                La intersección en el eje
                de las “y” es 1/Km
INHIBIDORES ENZIMÁTICOS


   La función catalítica de las
    enzimas está regulada por
    inhibidores.
   Los inhibidores son
    esenciales en la regulación
    del metabolismo
   Algunas drogas y toxinas
    actúan como inhibidores y
    bloquean rutas metabólicas
    esenciales para las células



                          http://www.elmhurst.edu/~chm/vchembook/573inhibit.html
INHIBICIÓN IRREVERSIBLE

   Un inhibidor irreversible se disocia muy lentamente de su
    enzima diana porque está estrechamente unido a la enzima
    mediante enlaces covalente o no covalentes (toxinas, drogas,
    etc.)

   La inhibición reversible está caracterizada por una disociación
    rápida del complejo enzima-inhibidor (E-I). Típicamente, los
    inhibidores forman enlaces no covalentes.

La inhibición reversible se subdivide en:
    Inhibición competitiva
    Inhibición no-competitiva
    Acompetitiva
INHIBICIÓN COMPETITIVA


   Se presenta cuando el inhibidor se une irreversiblemente
    a la enzima en el mismo sitio que el sustrato
    normalmente ocuparía, por lo que compite con el
    substrato por este sitio.
INHIBICIÓN COMPETITIVA




   Efecto sobre Vmax. A una concentración de sustrato
    suficientemente alta, se alcanza la Vmax observada en
    auscencia del inhibidor.
   Efecto sobre la Km. La Km se incrementa en
    prescencia del inhibidor.
FÁRMACOS CON               INHIBICIÓN COMPETITIVA
• Las estatinas (fármacos que disminuyen el
colesterol) son drogas que inhiben un paso
limitante en la síntesis de colesterol, que es
catalizado por la HMG-CoA reductasa.


•Ejemplo: lovastatin (una estatina), es un
análogo de la HMG-CoA y compite por el sitio
activo de la HMG-CoA reductasa.


•Bajan los niveles plasmáticos de colesterol ya
que se inhibe su síntesis de novo.


HMG-CoA →hidroximetilglutaril CoA reductasa.
INHIBICIÓN NO COMPETITIVA


 El inhibidor y el sustrato se
  unen a sitios diferentes
  sobre la enzima.
 El inhibidor puede unirse
  sobre la enzima libre o bien
  en el complejo ES, evitando
  que la reacción ocurra.
 Tiene un efecto
  característico sobre la
  Vmax.
INHIBICIÓN NO COMPETITIVA.




   Efecto sobre Vmax: la inhibición no puede superarse por un
    incremento en la concentración del sustrato, por lo que estos
    inhibidores disminuyen la Vmax de la reacción.

   Efecto sobre Km: no afectan la unión del sustrato a la
    enzima, por lo que la enzima muestra la misma Km similar en
    presencia o ausencia del inhibidor.
INHIBIDORES NO COMPETITIVOS
   Ciertos insecticidas cuyo efecto neurotóxico es el
    resultado de su unión irreversible al sitio catalítico de la
    enzima.

   Ejemplo: insecticidas que actúan como inhibidores de la
    acetylcholinesterasa (enzima que degrada al
    neurotransmisor acetilcolina).
INHIBIDOR COMPETITIVO VS. NO
COMPETITIVO




Velocidad de reacción NO cambia   Velocidad de reacción disminuye
Km aumenta                        Km no varía
INHIBICIÓN ACOMPETITIVA

El I se une al complejo ES  EIS solamente, no a la enzima
libre
Esta inhibición es rara, decrecen los valores de Vmax y Km
El aumento de la [S] acelera la rxn pero nunca como sin
inhibidor
La rxn puede retrasarse pero no impedirse
Se presenta cuando hay mas de un sustrato en la reacción.
RESUMEN
    Tipo        Sitio de enlace con la Enzima             Efecto cinético
  inhibidor
Inhibición     Enlaza en el sitio catalítico          Vmax no cambia
Competitiva    específico. Compite por el S. Inh.     Km ([S] necesaria para
               Es reversible por el sustrato          alcanar ½ máx actividad)
                                                      aumenta
Inhibición     Enlaza al E o ES fuera del sitio       Vmax disminuye
No-            catalítico. El sitio de enlace no se   proporcional a la conc.
competitiva    altera. El complejo ESI no forma       del inhibidor
               producto. No puede ser reversible      Km no se altera
               por el S

Acompetitiva   Enlaza sólo al complejo ES en sitios Vmax aparente
               diferentes al catalítico. No puede disminuye
               ser reversible por el S              Km disminuye
RESUMEN




http://www.new-science-press.com/browse/protein/illustrations/ud
INHIBIDORES ENZIMÁTICOS
         UTILIZADOS COMO DROGAS

   Muchas medicinas actúan como inhibidores. Al menos la
    mitad de los medicamentos más comunes en USA.

   Ejemplo: penicilina y amoxicilina.

   Inhiben a las enzimas involucradas en la síntesis de la
    pared celular de las bacterias
REGULACIÓN ENZIMÁTICA

  La actividad enzimática puede regularse, activándose o
   inhibiéndose de acuerdo a las necesidades de la célula.
 Los principales mecanismos de regulación son:

1.   Control genético (síntesis de la enzima)
2.   Modificación covalente
3.   Efectos alostéricos
4.   Compartimentalización
CONTROL GENÉTICO
   La regulación de la cantidad de enzima se efectúa alterando
    la velocidad de su síntesis.

   Puede presentarse una inducción o una represión de la
    síntesis de la enzima, pero su eficiencia no se modifica.

   Principalmente son enzimas que se requieren en una etapa
    del desarrollo o bajo condiciones fisiológicas específicas
    (ejemplo: niveles altos de insulina en sangre como
    consecuencia de niveles muy altos de glucosa en sangre).

   Su efecto es lento, comparado con el efecto de los otros tipos
    de regulación.
MODIFICACIÓN COVALENTE
    Es una de las principales formas mediante las
     cuales se regulan los procesos celulares.
    Cambios en las enzimas por diversas
     modificaciones covalentes:
a)   Fosforilación y desfosforilación
b)   Metilación
c)   Acetilación
d)   Nucleotidilación (adición de nucleótido)
FOSFORILACIÓN Y DESFOSFORILACIÓN
• Es la principal modificación
  covalente. La adición o
  remoción de grupos fosfatos
  de la enzima se produce en
  los residuos de serina, tronina
  o tirosina.

• Dependiendo de la enzima, la
  forma fosforilada puede ser
  menos o más activa.

• Fosforilación      proteincinasas

• Desfosforilación      fosfatasas
MODIFICACIÓN COVALENTE
        (PROTEÓLISIS)




Varias enzimas se almacenan como precursores
 inactivos, denominados proenzimas o zimógenos.
 Esto se vuelven activos con la rotura irreversible de los
 elaces peptídicos
EFECTOS ALOSTÉRICOS
   Las enzimas alostéricas, generalmente están
    formadas por varias subunidades, con varios sitios
    activos los cuales presentan cooperatividad.

   Son reguladas por moléculas llamadas efectores,
    los cuales se les unen no covalentemente en un
    sitio diferente a su sitio activo.

   El efector alostético puede alterar la afinidad de la
    enzima por su substrato o afectar la máxima
    actividad catalítica de la enzima.

   Generalmente catalizan pasos iniciales limitantes
    de las vías metabólicas
REGULACIÓN
       ALOSTÉRICA.

   Las enzimas alostéricas
    pueden ser inhibidas o
    estimuladas       por     sus
    efectores o moduladores, es
    decir, los efectores pueden
    ser positivos (aceleran la
    reacción),    o    negativos
    (disminuyen la reacción).

   Con respecto a         su
    naturaleza los efectores
    pueden ser homotrópicos o
    heterotrópicos.
EFECTORES HOMOTRÓPICOS
   Efector homotrópico: el mismo sustrato funciona como
    efector (por ej. la unión de un sustrato influye sobre la unión
    de otra molécula sustrato), generalmente son efectores
    positivos.

   Al unirse a un sitio de la enzima, la molécula sustrato
    aumenta las propiedades catalíticas de otros sitios de unión a
    otros sutratos, esto es, presentan cooperatividad.

   Estas enzimas muestran una curva sigmoidea cuando la
    velocidad de reacción (Vo) se grafica contra la concentración
    de sustrato [S]
EFECTORES HETEROTRÓPICOS
   Efector heterotrópico: el efector
    es diferente del sustrato de la
    reacción.

   Los efectores heterotrópicos
    pueden ser negativos o
    positivos.

   Ejemplo: Inhibición por Feed-
    back.


En un paso irreversible (limitante), una enzima convierte el producto D en E,
esta misma tiene un sitio alostérico que se une al producto final G.
Cuando G se incrementa (porque no se consume tan rápidamente), el
paso irreversible de la vía se inhibe.
EJEMPLO: GLUCÓLISIS

          Efector negativo.
          La fosfofructoquinasa-1 (FPK-1) tiene un
          sitio alostérico para ATP. En grandes
          concentraciones de ATP, la enzima se
          inhibe alostéricamente.

FPK-1

          Efector positivo:
          FPK-1 es alostéricamente activada por
          fructosa 2,6 bifosfato, siempre que
          aumente la concentración de AMP
          (condiciones de demanda energética).
FUENTES DE INFORMACIÓN



 Biochemistry. Lippincott´s Ilusrated Reviews. Pamela C.
  Champe, Richard Harvey. Cuarta edición.
 Fundamentos de Bioquímica. Voet -Voet -Pratt. Segunda
  edición.
 Bioquímica. La base Molecular de la Vida. Trudy McKee
  y James R Mackee. Tercera edición.

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Enzimas

  • 2. ENZIMAS 1. Generalidades. 2. Nomenclatura 3. Propiedades: sitio activo, especificidad, eficiencia catalítica, holoenzimas. 4. Como trabajan: energía de activación y sitio activo. 5. Factores que afectan la velocidad de reacción: concentración de sustrato, pH y temperatura. 6. Cinética enzimática: ecuación de Michaelis-Menten. 7. Inhibidores de la actividad enzimática: inhibición competitiva, inhibición no competitiva, drogas (inhibodores enzimáticos). 8. Regulación de la actividad enzimática: sitios de unión alostérica, regulación mediante modificación covalente, inducción/represión de síntesis de enzimas.
  • 3. ENZIMAS  Las enzimas son moléculas catalíticas (proteínas) que incrementan la velocidad de reacciones químicas que son energéticamente posibles.  No son consumidas durante la reacción.  Virtualmente todas las reacciones del organismo son mediadas por enzimas.
  • 4. NOMENCLATURA  Nombre recomendado (es el más común): tienen el subfijo “asa” ligado al substrato de la reacción. Ejemplo: glucosidasa y ureasa.  Nombre sistemático:  las enzimas se dividen en 6 clases principales.  se especifica el nombre del sustrato seguido de la reacción catalizada y el subfijo asa.  Ejemplo: D-glyceraldehído 3-fosfato NAD+ oxidorreductasa
  • 5. CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS  Oxidorreductasa: enzimas que catalizan oxidorreducciones entre dos sustratos, S y S.  Transferasas. Catalizan reacciones en las que hay transferencia de un grupo de una molécula a otra. Ejemplo: trasnaminasas y transmetilasas.  Hidrolasas: catalizan la reacciones donde se prode la rotura de enlaces por la adición de agua. Ejemplos: estereasas, fosfatasas y pepetidasas.
  • 6. Liasas. Catalizan las reacciones en las que se eliminan grupos (H2O, NH3, CO2)  Isomerasas. Catalizan reordenamientos intramoleculares ejemplo: epimerasas y mutasas.  Ligasas. catalizan la reacción de un enlace entre dos moléculas de sustrato. Se requiere hidrólisis de ATP.
  • 7. ISOENZIMAS (O ISOFORMAS)  Enzimas que difieren en su secuencia de aminoácidos, pero que poseen la misma actividad catalítica, es decir catalizan la misma reacción.  En general, las isoenzimas representan enzimas de diferentes genes cuyos productos catalizan la misma reacción.  Estas enzimas generalmente tienen diferentes parámetros cinéticos (diferentes valores de KM) o diferentes propiedades reguladoras.
  • 8. PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS  Sitio activo  Alta especificidad  Alta eficiencia catalítica  Sistema de regulación  Localización específica dentro de la célula (compartamentalización)
  • 9. COMPARTIMENTALIZACIÓN • La mayoría de las enzimas están localizadas en organelos específicos, esta compartimentalización sirve para aislarlas de otras reacciones y tener un ambiente favorable para la reacción.
  • 10. SITIO ACTIVO • Esta constituido por cadenas laterales de aminoácidos que forman una superficie tridimencional (“hendidura”) donde se unen los substratos. • La complementariedad entre la enzima y el sustrato depende de fuerzas no covalentes: grupos hidrófobos, puentes de hidrógeno, interacciones electrostáitcas, etc. • Es el lugar en donde se lleva a cabo la catálisis
  • 11. SITIO ACTIVO • En el sitio activo se forma un complejo ES (enzima sustrato) que posteriormente se convierte en un complejo EP (enzima-producto) y finalmente se disocia en la E (enzima) y el P (producto).
  • 12. EFICIENCIA CATALÍTICA  Las reacciones catalizadas por las enzimas son altamente eficientes, ya que son de 103-108 más eficientes que las mismas reacciones no catalizadas.  Cada enzima es capaz de transformar de 100-1,000 sustratos a producto por segundo.  Kcat = es el número de recambio que es el número de moléculas de sustrato convertidas en producto por una molécula de enzima en una unidad de tiempo cuando la enzima esta saturada con el sustrato.
  • 13. ESPECIFICIDAD  Son altamente específicas, ya que interaccionan con uno o unos cuantos substratos y sólo catalizan un tipo de reacción química.  El conjunto de enzimas elaborado por una célula particular determina en que vía metabólica está involucrada.
  • 14. GRUPOS NO PROTÉICOS: COFACTORES  Algunas enzimas requieren de otras moléculas no protéicas para llevar a cabo su actividad enzimática a estos componentes se les llama cofactores.  Los cofactores pueden ser iones metálicos → Zn2+, Fe2+ Cu2+  Cuando el cofactor es una molécula orgánica pequeña, se le llama coenzima .  Cosustrato : coenzima se asocia en forma transitoria con la enzima (ejemplo: NAD+ y NADP+).  Grupo prostético: coenzima se asocia permanentemente a la enzima (ejemplo: FAD).
  • 15. Holoenzima→enzima activa con su componente no proteico.  Apoenzima→enzima inactiva sin el cofactor.
  • 16. MUCHAS VITAMINAS SON PRECURSORES DE COENZIMAS
  • 17. CATÁLISIS Es la aceleración o el incremento en la velocidad de una reacción química por medio de un catalizador. El catalizador acelera la reacción. Reduce la energía de activación, sin sufrir ningún cambio permanente. Las enzimas son catalizadores biológicos.
  • 18. CINÉTICA ENZIMÁTICA  El estudio cuantitativo de la catálisis enzimática se denomina cinética enzimática y proporciona información sobre las velocidad de la reacción, afinidad de las enzimas por los sustratos y efectos de los inhibidores.  Este conocimiento mejora la comprensión de la regulación de las rutas metabólicas y posibilita la mejora de fármacos más adecuados.  Hay dos puntos importantes de considerar:  Los cambios de energía que ocurren durante la catálisis.  Como el sitio activo facilita la catálisis.
  • 19. ENERGÍA LIBRE DE ACTIVACIÓN En todos las reacciones hay una barrera energética entre los reactantes y los productos. Durante la conversión de una molécula A, a un producto B, hay cambios de energía, pasando por un estado de transición “T” : La energía libre de activación, es la diferencia entre la energía del reactante y “T”.
  • 20. ENERGÍA LIBRE DE ACTIVACIÓN  McKee:  Energía libre de activación ∆G≠ es la cantidad de energía que se requiere para convertir un mol de moléculas de sustrato (reactante) desde el estado basal (la forma estable de baja energía de la molécula) al estado de transición “T”.
  • 21. EFECTO DE LAS ENZIMAS SOBRE LA ENERGÍA DE ACTIVACIÓN Las enzimas son catalizadores que permiten que las reacciones se realicen más rápidamente ya que disminuyen la energía de activación requerida para la reacción. En ausencia de la enzima, sólo una pequeña proporción de las moléculas reactantes posen suficiente energía para alcanzar al estado “T”. La combinación del sustrato y enzima genera un nuevo camino de la reacción donde la energía libre del estado de transición es menor que aquél en la ausencia de la enzima.
  • 22. LA REACCIÓN SE ACELERA Y ESTABILIZA EL ESTADOS DE TRANSICIÓN.  …“La afinidad de la enzima por el sustrato conlleva a un decremento en su energía y por consiguiente a una reducción de la energía de activación de la reacción y a un aumento en la velocidad de la reacción”. Linus Pauling (1948) 1901-1994 Premio Nóbel de Química 1954
  • 23. PAPEL DEL SITIO ACTIVO EN LA CATÁLISIS  El sitio activo además de ser el sitio de unión al substrato, también participa en el proceso catalítico, ya que restringe los movimientos y las conformaciones del sustrato orientándolo en forma óptima para que se lleve a cabo la reacción.  El sitio activo provee grupos catalíticos que aumentan la probabilidad de que se alcance el estado de transición lo que reduce la energía de activación necesaria para que se produzca la reacción hasta el producto.
  • 24. PAPEL DEL SITIO ACTIVO EN LA CATÁLISIS  En las reacciones catalizadas por enzimas al disminuir la energía de activación se incrementa la velocidad de la reacción.  Las enzimas no alteran el equilibrio de la reacción, sólo aumentan la velocidad hacia el equilibrio, el cual se alcanza en segundos o minutos.
  • 25. FORMACIÓN DEL COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO. Aproximan el sustrato con una orientación favorable que promueven la formación del estado de transición: Complejo enzima- sustrato (ES). El sustrato se enlaza en el sitio activo de la enzima. El sitio activo es una hendidura tridimensional formada por grupos que provienen de diferentes partes de la secuencia de aminoácidos. La especificidad catalítica depende en parte a la especificidad de unión ES http://fig.cox.miami.edu/~cmallery/255/255enz/ES_complex.jpg
  • 26. INTERACCIONES ES El sustrato forma múltiples interacciones no covalentes con los residuos del sitio activo de la enzima. Son interacciones reversibles. Puentes de hidrógeno, Fuerzas de van der Waals Interacciones hidrofóbicas
  • 27. TAMAÑO DE LAS ENZIMAS Los sitios activos ocupan un tamaño relativamente pequeño comparado con el volumen de la enzima. El resto de los aa:  No está en contacto con el sustrato. Los residuos de aminoácidos extra sirven como una armazón para acomodar al sitio activo (la mayoría)  También incluyen sitios de regulación, sitios de interacción con otras proteínas, o canales que aproximan los sustratos a los sitios activos.
  • 28. MODELOS DE SITIOS ACTIVOS Modelo de llave y cerrojo: Modelo del ajuste inducido (induced fit): El sitio activo es complementario en La enzima cambia de forma cuando el forma al del sustrato. sustrato se une a ésta, el sitio activo es complementario al sustrato sólo después de que el sustrato se une. Animación del modelo inducido: http://www.chem.ucsb.edu/~molvisual/ABLE/induced_fit/index.html
  • 29. FACTORES QUE AFECTAN LA VELOCIDAD DE UNA REACCIÓN  Concentración del sustrato  Temperatura  pH
  • 30. PH  La concentración de H+, afecta la velocidad de la reacción. Usualmente se requiere que la enzima y el sustrato tengan grupos químicos específicos en estado ionizado o no ionizado para interactuar.  Ejemplo: se puede requerir que el grupo amino de la enzima este protonado (-NH3+), y a pH alcalino este grupo es desprotonado, por lo que se requiere un pH básico.  pH extremos pueden desnaturalizar las enzimas.  El pH óptimo varía en las diferentes enzimas. •Ejemplo: pepsina pH óptimo 2
  • 31. TEMPERATURA  La velocidad de la reacción se incrementa con la temperatura, hasta que se alcanza la máxima velocidad, aunque a mayor aumento suele degradarse.  Este incremento se debe al aumento de el número de moléculas que tienen suficiente energía para pasar la barrera energética para formar los productos de la reacción.
  • 32. CONCENTRACIÓN DEL SUSTRATO  La velocidad (Vo) de una reacción es el número de moléculas de substrato convertidas en producto por unidad de tiempo (µmol/minuto).  La velocidad se incrementa con la concentración del substrato hasta alcanzar una máxima velocidad (Vmax).  La velocidad de la reacción se detiene a altas concentraciones de substrato y es el reflejo de la saturación de todos los sitios activos de las moléculas de enzima presentes en ese momento.
  • 33. EFECTO DE LA CONCENTRACIÓN DEL SUSTRATO SOBRE LA VELOCIDAD DE REACCIÓN • La mayoría de las enzimas muestran una cinética de Michaelis-Menten:  Al graficar la velocidad inicial (Vo) de reacción contra la concentración de substrato se obtiene una curva hiperbólica.
  • 34. MODELO DE MICHAELIS- MENTEN  El modelo es válido solo cuando la concentración de la enzima es mucho menor que la concentración del sustrato (es decir, la enzima es un factor limitante) y cuando la enzima no es alostérica.  Lasenzimas alostéricas no siguen la cinética de Michaelis-Menten ya que muestran una curva sigmoidea.
  • 35. ENZIMAS ALOSTÉRICAS  Son enzimas que s0n reguladas por moléculas llamadas efectores que se unen covalentemente a un sitio diferente del sitio activo.  El efector alostérico puede alterar la afinidad de la enzima con su sustrato o/y modificar la actividad catalítica máxima de la enzima.  Generalmente están formadas de varias subunidades.  Frecuentemente estas enzimas funcionan como reguladoras porque cataliza el paso limitante de una vía metabólica.
  • 36. MODELO DE REACCIÓN GLOBAL ENZIMÁTICA  La enzima se combina reversiblemente con el substrato formando un complejo ES, posteriormente se libera un producto y la enzima  La mayoría de las reacciones catalizadas por enzimas se rigen bajo este modelo .  La medida de la velocidad de la reacción catalizada por una enzima es bajo las condiciones óptimas de la enzima (pH, temperatura, cofactores, etc).
  • 37. MODELO DE REACCIÓN GLOBAL ENZIMÁTICA donde:  k1= constante de velocidad de formación de ES  k-1=constante de velocidad de disociación de ES  k2= constante de velocidad de la formación y liberación del producto.  suposiciones:  K-1 es despreciable con respecto a k1  K-1 y k2 son iguales→”suposición de estado estacionanario”  Mckee →K2=k-1 k3=k2
  • 38. ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN  Describe como la velocidad de la reacción varía con la concentración del sustrato: Km es la constante de Michaelis-Menten  Suposiciones:  La concentración del sustrato [S], es mucho mayor que la concentración de la enzima [E], por lo que el porcentaje del sustrato unido a la enzima en cualquier momento es pequeño.  [ES] no cambia con el tiempo, es decir, la velocidad de formación de ES es igual a la de su degradación (E+P), se le llama suposición de estado estacionario.  Se utiliza la velocidad inicial de reacción (Vo), ya que la velocidad de la reacción se mide tan pronto como el substato y la enzima se mezclan, por lo que la concentración de producto es muy pequeño y la reacción de P → S puede ignorarse.
  • 39. KM Y VMAX  La acción catalítica de una enzima sobre un sustrato determinado se describe mediante dos parámetros Km y Vmax  Los valores de km y Vmax aproximados de una enzima se determinan midiendo y graficando las velocidades iniciales de reacción a varias concentraciones de sustrato.
  • 40. KM Y VMAX  Km (constante de Michaelis- Menten), se determina experimentalmente y se considera una constante, es característica de la enzima y el sustrato particular en condiciones específicas y refleja la afinidad enzima-sustrato.  Km es la concentración de sustrato a la cual, la velocidad de la reacción es igual a ½ de la Vmax.  Vmax mide la velocidad máxima de la reacción.
  • 41. CONSTANTE DE MICHAELIS-MENTEN KM  LaKm es una característica muy importante en una reacción catalizada por una enzima y es muy significativa para su función biológica.  Siconocemos el valor de Km y Vmax, podemos calcular la velocidad de una reacción enzimática para cualquier concentración de substrato.
  • 42. KM Y AFINIDAD ENZIMATICA  Km es característica de una enzima y su sustrato particular, refleja la afinidad de la enzima por el substrato.  Una Km pequeño refleja una alta afinidad de la enzima por el substrato, porque se requiere una baja concentración de substrato para saturar la enzima a la mitad, esto es para que alcance la velocidad ½ Vmax.  Una Km grande refleja una baja afinidad de la enzima por el substrato porque se requiere una alta concentración de substrato para saturar la enzima a la mitad.
  • 43. EFECTO DE LA CONCENTRACIÓN DE LA ENZIMA SOBRE LA VELOCIDAD DE REACCIÓN  Lavelocidad de la reacción es directamente proporcional a la concentración de la enzima a cualquier concentración de substrato.  Ejemplo: si la concentración de la enzima se reduce a la mitad, la velocidad inicial de reacción (Vo), al igual que la velocidad máxima (Vmax) se reducen a la mitad.
  • 44. ORDEN DE LA REACCIÓN  Cuando [S] es mucho menor que la Km,la velocidad de la reacción es proporcional a la concentración del sustrato, se dice entonces que la velocidad de la reacción es de primer orden con respecto a la concentración de subtrato.
  • 45. ORDEN DE LA REACCIÓN  Cuando [S] es mucho mayor que la Km la velocidad es constante e igual a Vmax, entonces, la velocidad de la reacción es independiente de la concentración del sustrato y se dice que la velocidad de la reacción es de orden cero con respecto a la concentración del sustrato.
  • 46. ECUACIÓN DE LINEWEAVER-BURK • La ecuación de Lineweaver- Burk se utiliza para una detminación más esacta de Km y Vmax. Se transforman los datos, la ec de Michaelis- Menten (una hipérbola), se reordena beniendo su inversa: en su inversa: • Cuando se grafica el inverso de Vo= 1/Vo contra el inverso de [S]= 1/ [S], se obtiene una linea recta llamada grafico de Lineweaver-Burk.
  • 47. GRAFICA DE LINEWEAVER-BURK • La ecuación de Lineweaver-Burk genera una línea recta: y= mx +b • donde: • x=1/V • y= 1/[S] • m y b son constantes: • m=pendiente=Km/Vmax • b=1/Vmax
  • 48. GRAFICA DE LINEWEAVER-BURK  Esta línea se puede usar para calcular Km y Vmax y para determinar el mecanismo de acción de los inhibidores enzimáticos. La intersección en el eje de las “x” es 1/Vmax La intersección en el eje de las “y” es 1/Km
  • 49. INHIBIDORES ENZIMÁTICOS  La función catalítica de las enzimas está regulada por inhibidores.  Los inhibidores son esenciales en la regulación del metabolismo  Algunas drogas y toxinas actúan como inhibidores y bloquean rutas metabólicas esenciales para las células http://www.elmhurst.edu/~chm/vchembook/573inhibit.html
  • 50. INHIBICIÓN IRREVERSIBLE  Un inhibidor irreversible se disocia muy lentamente de su enzima diana porque está estrechamente unido a la enzima mediante enlaces covalente o no covalentes (toxinas, drogas, etc.)  La inhibición reversible está caracterizada por una disociación rápida del complejo enzima-inhibidor (E-I). Típicamente, los inhibidores forman enlaces no covalentes. La inhibición reversible se subdivide en:  Inhibición competitiva  Inhibición no-competitiva  Acompetitiva
  • 51. INHIBICIÓN COMPETITIVA  Se presenta cuando el inhibidor se une irreversiblemente a la enzima en el mismo sitio que el sustrato normalmente ocuparía, por lo que compite con el substrato por este sitio.
  • 52. INHIBICIÓN COMPETITIVA  Efecto sobre Vmax. A una concentración de sustrato suficientemente alta, se alcanza la Vmax observada en auscencia del inhibidor.  Efecto sobre la Km. La Km se incrementa en prescencia del inhibidor.
  • 53. FÁRMACOS CON INHIBICIÓN COMPETITIVA • Las estatinas (fármacos que disminuyen el colesterol) son drogas que inhiben un paso limitante en la síntesis de colesterol, que es catalizado por la HMG-CoA reductasa. •Ejemplo: lovastatin (una estatina), es un análogo de la HMG-CoA y compite por el sitio activo de la HMG-CoA reductasa. •Bajan los niveles plasmáticos de colesterol ya que se inhibe su síntesis de novo. HMG-CoA →hidroximetilglutaril CoA reductasa.
  • 54. INHIBICIÓN NO COMPETITIVA  El inhibidor y el sustrato se unen a sitios diferentes sobre la enzima.  El inhibidor puede unirse sobre la enzima libre o bien en el complejo ES, evitando que la reacción ocurra.  Tiene un efecto característico sobre la Vmax.
  • 55. INHIBICIÓN NO COMPETITIVA.  Efecto sobre Vmax: la inhibición no puede superarse por un incremento en la concentración del sustrato, por lo que estos inhibidores disminuyen la Vmax de la reacción.  Efecto sobre Km: no afectan la unión del sustrato a la enzima, por lo que la enzima muestra la misma Km similar en presencia o ausencia del inhibidor.
  • 56. INHIBIDORES NO COMPETITIVOS  Ciertos insecticidas cuyo efecto neurotóxico es el resultado de su unión irreversible al sitio catalítico de la enzima.  Ejemplo: insecticidas que actúan como inhibidores de la acetylcholinesterasa (enzima que degrada al neurotransmisor acetilcolina).
  • 57. INHIBIDOR COMPETITIVO VS. NO COMPETITIVO Velocidad de reacción NO cambia Velocidad de reacción disminuye Km aumenta Km no varía
  • 58. INHIBICIÓN ACOMPETITIVA El I se une al complejo ES  EIS solamente, no a la enzima libre Esta inhibición es rara, decrecen los valores de Vmax y Km El aumento de la [S] acelera la rxn pero nunca como sin inhibidor La rxn puede retrasarse pero no impedirse Se presenta cuando hay mas de un sustrato en la reacción.
  • 59. RESUMEN Tipo Sitio de enlace con la Enzima Efecto cinético inhibidor Inhibición Enlaza en el sitio catalítico Vmax no cambia Competitiva específico. Compite por el S. Inh. Km ([S] necesaria para Es reversible por el sustrato alcanar ½ máx actividad) aumenta Inhibición Enlaza al E o ES fuera del sitio Vmax disminuye No- catalítico. El sitio de enlace no se proporcional a la conc. competitiva altera. El complejo ESI no forma del inhibidor producto. No puede ser reversible Km no se altera por el S Acompetitiva Enlaza sólo al complejo ES en sitios Vmax aparente diferentes al catalítico. No puede disminuye ser reversible por el S Km disminuye
  • 61. INHIBIDORES ENZIMÁTICOS UTILIZADOS COMO DROGAS  Muchas medicinas actúan como inhibidores. Al menos la mitad de los medicamentos más comunes en USA.  Ejemplo: penicilina y amoxicilina.  Inhiben a las enzimas involucradas en la síntesis de la pared celular de las bacterias
  • 62. REGULACIÓN ENZIMÁTICA  La actividad enzimática puede regularse, activándose o inhibiéndose de acuerdo a las necesidades de la célula.  Los principales mecanismos de regulación son: 1. Control genético (síntesis de la enzima) 2. Modificación covalente 3. Efectos alostéricos 4. Compartimentalización
  • 63. CONTROL GENÉTICO  La regulación de la cantidad de enzima se efectúa alterando la velocidad de su síntesis.  Puede presentarse una inducción o una represión de la síntesis de la enzima, pero su eficiencia no se modifica.  Principalmente son enzimas que se requieren en una etapa del desarrollo o bajo condiciones fisiológicas específicas (ejemplo: niveles altos de insulina en sangre como consecuencia de niveles muy altos de glucosa en sangre).  Su efecto es lento, comparado con el efecto de los otros tipos de regulación.
  • 64. MODIFICACIÓN COVALENTE  Es una de las principales formas mediante las cuales se regulan los procesos celulares.  Cambios en las enzimas por diversas modificaciones covalentes: a) Fosforilación y desfosforilación b) Metilación c) Acetilación d) Nucleotidilación (adición de nucleótido)
  • 65. FOSFORILACIÓN Y DESFOSFORILACIÓN • Es la principal modificación covalente. La adición o remoción de grupos fosfatos de la enzima se produce en los residuos de serina, tronina o tirosina. • Dependiendo de la enzima, la forma fosforilada puede ser menos o más activa. • Fosforilación proteincinasas • Desfosforilación fosfatasas
  • 66. MODIFICACIÓN COVALENTE (PROTEÓLISIS) Varias enzimas se almacenan como precursores inactivos, denominados proenzimas o zimógenos.  Esto se vuelven activos con la rotura irreversible de los elaces peptídicos
  • 67. EFECTOS ALOSTÉRICOS  Las enzimas alostéricas, generalmente están formadas por varias subunidades, con varios sitios activos los cuales presentan cooperatividad.  Son reguladas por moléculas llamadas efectores, los cuales se les unen no covalentemente en un sitio diferente a su sitio activo.  El efector alostético puede alterar la afinidad de la enzima por su substrato o afectar la máxima actividad catalítica de la enzima.  Generalmente catalizan pasos iniciales limitantes de las vías metabólicas
  • 68. REGULACIÓN ALOSTÉRICA.  Las enzimas alostéricas pueden ser inhibidas o estimuladas por sus efectores o moduladores, es decir, los efectores pueden ser positivos (aceleran la reacción), o negativos (disminuyen la reacción).  Con respecto a su naturaleza los efectores pueden ser homotrópicos o heterotrópicos.
  • 69. EFECTORES HOMOTRÓPICOS  Efector homotrópico: el mismo sustrato funciona como efector (por ej. la unión de un sustrato influye sobre la unión de otra molécula sustrato), generalmente son efectores positivos.  Al unirse a un sitio de la enzima, la molécula sustrato aumenta las propiedades catalíticas de otros sitios de unión a otros sutratos, esto es, presentan cooperatividad.  Estas enzimas muestran una curva sigmoidea cuando la velocidad de reacción (Vo) se grafica contra la concentración de sustrato [S]
  • 70. EFECTORES HETEROTRÓPICOS  Efector heterotrópico: el efector es diferente del sustrato de la reacción.   Los efectores heterotrópicos pueden ser negativos o positivos.  Ejemplo: Inhibición por Feed- back. En un paso irreversible (limitante), una enzima convierte el producto D en E, esta misma tiene un sitio alostérico que se une al producto final G. Cuando G se incrementa (porque no se consume tan rápidamente), el paso irreversible de la vía se inhibe.
  • 71. EJEMPLO: GLUCÓLISIS Efector negativo. La fosfofructoquinasa-1 (FPK-1) tiene un sitio alostérico para ATP. En grandes concentraciones de ATP, la enzima se inhibe alostéricamente. FPK-1 Efector positivo: FPK-1 es alostéricamente activada por fructosa 2,6 bifosfato, siempre que aumente la concentración de AMP (condiciones de demanda energética).
  • 72.
  • 73. FUENTES DE INFORMACIÓN  Biochemistry. Lippincott´s Ilusrated Reviews. Pamela C. Champe, Richard Harvey. Cuarta edición.  Fundamentos de Bioquímica. Voet -Voet -Pratt. Segunda edición.  Bioquímica. La base Molecular de la Vida. Trudy McKee y James R Mackee. Tercera edición.