Este informe describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa de 13 cepas bacterianas aisladas de muestras de agua y suelo contaminadas con petróleo en Perú usando el programa SnapGene. Las cepas pertenecen a los géneros Klebsiella, Enterobacter, Pseudomonas, Serratia, Acinetobacter, Proteus y Morganella. El procedimiento incluyó descargar las secuencias de las cepas del NCBI y colocarlas en las celdas del gel simulado en SnapGene para su análisis.

1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
FACULTAD DE INGENIERÍA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
INFORME DE PRACTICA
Aplicación de las técnicas moleculares - electroforesis
Uso de un programa bioinformático SnapGene
CURSO:
Biotecnología
INTEGRANTES:
Segura Arias Renato Dylan
DOCENTE:
Msc. Soto Gonzales, Hebert Hernan
Ilo, 2 de junio del 2023

2. ÍNDICE
1. RESUMEN
2. INTRODUCCIÓN
3. OBJETIVOS
3.1 OBJETIVO GENERAL
3.2 OBJETIVO ESPECÍFICO
4. MATERIALES/EQUIPOS
4.1. Materiales.
4.2. Equipos.
5. PROCEDIMIENTO/METODOLOGÍA
5.1 Métodos
6. RESULTADOS
7. ANÁLISIS DE RESULTADOS/DISCUSIÓN
8. CONCLUSIÓN

3. RESUMEN
SnapGene es la herramienta de clonación más popular, es rápida, inteligente y
extremadamente fácil de usar. Permite ver automáticamente las características del plásmido,
sitios de enzimas, características, cebadores, clonación molecular, PCR y mutagénesis.
En el presente trabajo se hará una simulación realista de gel de agarosa con el uso de
moléculas de las cepas bacterianas aisladas de agua contaminada y suelo contaminado con
potencial de biorremediación.
INTRODUCCIÓN
Se aislaron siete cepas bacterianas a partir de las muestras de agua y seis de las
muestras de suelo, la identificación por caracterización del gen ARNr 16S mostró que
pertenecen a los géneros Klebsiella, Enteobacter, Pseudomonas, Serratia, Acinetobacter,
Proteus y Morganella.
Son comunidades bacterianas de zona impactada por derrame de petróleo en
Condorcanqui – Amazonas – Perú.
Se hará una simulación realista de electroforesis de estas cepas en gel de agarosa que
tiene el programa SnapGene.
OBJETIVOS
● Evaluar las cepas bacterianas con ayuda del programa Snap Gene
● Realizar una simulación realista con gel de agarosa, registrar e identificar las cepas.
● Realizar la electroforesis en gel de agarosa.
MATERIALES/EQUIPOS
● Instalar el programa de Snapgene y registrarse con el correo electrónico.

4. ● Usar el NCBI para buscar y descargar los archivos de las cepas a evaluar en el
formato adecuado.
● Cepas que se evaluaran.
Figura 01. SnapGene
Figura 02. NCBI

5. Tabla 01. Cepas que se evaluaran
PROCEDIMIENTO/METODOLOGÍA
1. Buscamos cada cepa con su N° de accesión en el NCBI.
Figura 04. buscamos la secuencia de la cepa
Figura 05. Descargamos la secuencia en el formato “rápido” para su ejecución en
SnapGene
Hacemos esto para las otras cepas, descargando su secuencia.
2. Descargamos el archivo en un formato compatible con el SnapGene.
Figura 06. Guardamos el archivo con el nombre de la cepa

6. Figura 07. Descarga de todas las cepas
Figura 08. Le damos check a la casilla para tener una buena lectura
Figura 09. Ejecución del SnapGene

7. 3. Lo abrimos y verificamos el formato para su lectura en el gel de agarosa.
Figura 10. La secuencia debe estar en doble fila y no en ARN
4. Abrimos la simulación en gel de agarosa y vamos colocando en cada celda una cepa.
Figura 11. Hacemos click en Tools y abrimos la simulación en gel de agarosa
RESULTADOS

8. Figura 12. Colocamos la cepa en un casilla de gel de agarosa y hacemos así con las demás
cepas
Figura 13. Colocación de todas las cepas
ANÁLISIS DE RESULTADOS
Se aislaron 13 cepas bacterianas de los géneros Klebsiella, Enterobacter,
Pseudomonas, Serratia, Acinetobacter, Proteus y Morganella, en gel de agarosa, estas
presentan un gran potencial degradador de hidrocarburos a partir de zonas contaminadas con
crudo de petróleo, que pueden ser utilizadas para la biorremediación de estos ambientes.
CONCLUSIONES

9. Se demostró la importancia de la metagenómica como herramienta para la
investigación de ambientes impactados con hidrocarburos de petróleo, permitiendo un mejor
conocimiento de los microorganismos para el aislamiento dirigido a aquellos de interés para
la biorremediación, se sugiere el uso de las cepas aisladas en estudios futuros de
biorremediación aplicada.