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Primeiros Passos com o MNPS.
1. Copiar todas as imagens DICOM do paciente em uma pasta dentro de: c:MNPSdicom
exemplo: se o paciente tem nome “Fulano de Tal”, criar a pasta
c:MNPSdicomFulano_de_Tal. Criar uma sub pasta para cada tipo de imagens, CT, RM,
etc.
2. Se for uma biópsia simples, sem necessidade de fusão com RM, arrastar um (1) arquivo
da CT (estéreo-CT) e soltar sobre o ícone (atalho) do MNPShell no desktop:
3. Responder se o conjunto de imagens a que pertence esta imagem ‚ é ou não
estereotáxico.
Se abre o importador de imagens DICOM, que realizará o pré-processamento das imagens
para salvá-las no formato interno do MNPS (*.IMG).
4. Caso as imagens estejam dispersas por várias subpastas, utilize o terceiro ícone da barra
de ferramentas e navegue pelas pastas até ficar na base das subpastas que contém todas
as imagens DICOM. Depois clique em “File” e selecione “Scan Path in Depth”.
5. A qualquer momento, é possível mudar o número de imagens apresentadas na tela,
visualizando uma imagem de cada vez ou um mosaico com várias imagens de imagens.
Para isso pode-se clicar no quarto botão da barra de ferramentas ou na opção View do
menu principal. Isto é uma questão de preferência do usuário.
6. Ordenar as imagens utilizando Options / Sort images.
Será apresentada uma lista de opções “Select sort criteria”.
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As imagens axiais também chamadas transversais devem ordenar-se pelo Z . As coronais
pelo Y e as sagitais pelo X . Na CT sempre são axiais. Clicar na opção desejada. O
programa ordenará as imagens. A seguir, se a ordenação for satisfatória, clicar em “Exit
sort”.
7. As imagens inicialmente estão todas selecionadas para serem processadas e convertidas
ao formato IMG. Porém, pode ser necessário descartar algumas imagens, por diferentes
motivos. Em geral, recomenda-se descartar, sempre que possível, imagens com artefatos
causados pelo aro e imagens onde alguns dos fiducials estejam completamente unidos.
Para de-selecionar uma imagem, dar um clique nela e dar espaço (tecla Space). O Espaço
seleciona ou de-seleciona um frame. Também é possível de-selecionar fazendo click de
mouse no quadradinho azul no canto superior direito da imagem.
8. Para ajustar o FOV (Field Of View) clique no ícone do quadradinho com linha de pontos (o
quinto ícone da barra mostrada). Deixar o quadro vermelho um pouco maior que os
fiducials. Para aceitar o FOV, pressione ENTER.
O FOV selecionado se aplica a todas as imagens, por tanto, recomenda-se percorrer o
conjunto de imagens verificando se em todas elas os fiducials se encontram dentro do
FOV. O ajuste do FOV é muito importante, pois caso os fiducials fiquem muito afastados
das bordas da imagem o MNPS pode não achar os fiducials automaticamente.
9. Os arquivos de imagens IMG serão criados com nomes derivados do nome do paciente.
Caso seja necessário alterar este nome, utilize a opção Options / Rename.
10. Ao terminar de selecionar as imagens DICOM, ajustar FOV, etc., clique no ícone do
disquete, o sistema salvará as imagens (*.img) e perguntará se chama ao MNPS para
iniciar a busca dos fiducials: “Call MNPS with this patient?” Responder SIM (ou YES).
MNPS © MEVIS Informática Médica Ltda. – Guia rápido página 3 de 6
11. O MNPS abre perguntando a forma como foi feita a colocação dos fiducials, o tipo de
frame, etc. Responder tudo e clicar em OK. O sistema apresenta as respostas
selecionadas. Se estiverem corretas, confirmar com OK.
12. Começo da busca dos fiducials. O MNPS tenta achá-los automaticamente, mas o usuário
deve confirmar com <ENTER> que está certo ou com <ESC> se estiver errado. Observar
com muito cuidado cada imagem, até concluir. Depois que o MNPS tem registrados
fiducials de vários planos pode dar continuidade automaticamente, apenas pedirá
confirmação do operador quando apresentem algum desvio do modelo ideal para o
sistema.
13. O sistema solicita os dados para salvar o planejamento. Preencher os campos conforme
necessário e confirmar com OK.
14. A partir daqui cada imagem está devidamente registrada ao sistema estereotáxico
(calibrada). O MNPS abre o Mosaico de imagens. Dar duplo clique em uma imagem.
15. Se for para uma biópsia e somente necessita coordenadas do alvo, basta procurar a
imagem com o ponto para biópsia e clicar no sítio desejado. As coordenadas do cursor
estarão na esquina inferior direita como X, Y, Z. Para navegar pelas imagens utilizar os
botões de setas ou as teclas PgUp / PgDn do teclado.
16. Para criar um ponto de interesse no sítio da biópsia criaremos um POI. Dê um clique no
alvo desejado e clique no botão “POI” que está do lado direito da barra de ferramentas. Se
abre uma janelinha para dar nome ao POI. O nome do POI pode conter até 7 letras e/ou
números.
Dê um nome para o POI.
17. Para consultar as coordenadas dos POIs abra a tabela de POIs no ícone que fica do lado
direito do ícone POI. Para imprimir a tabela de POIs clique no ícone da impressora que
fica embaixo do ícone antes mencionado, selecionar "POI Table".
18. Para criar um POI no final de uma trajetória de agulha clique no ícone que parece um
trajeto, do lado do ícone de tabela de POIs. O sistema pede selecionar o POI de entrada e
depois solicita o nome do POI destino.
19. Salvar o planejamento clicando no ícone que parece um disquete.
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Como fundir o planejamento anterior de CT com um conjunto de RM do paciente:
20. Arrastar um (1) arquivo DICOM da RM e soltar sobre o ícone do MNPShell .
21. Este caso não configura um conjunto estereotáxico de imagens, pois elas foram feitas sem
os fiducials. É possível utilizar o modo de estereotaxia virtual selecionando “For Virtual
Fiducials Mode” ou simplesmente “Non-Stereotactic Image Set”. O “Virtual Fiducials Mode”
é executado pelo próprio MNPS enquanto o “Non-stereotactic Image Set” é processado
pelo CAT3D. A vantagem do modo estereotáxico virtual é ter disponibilidade de recursos
exclusivos do MNPS tais como atlas, recursos de DBS, tractografias, dosimetria para
cones de radiocirurgia, etc.
22. O sistema mostrará as imagens da primeira sequência encontrada. Como na RM pode
haver várias sequências, deve-se utilizar na opção File / Open ou clicar no botão
correspondente na barra de ferramentas, para exibir a lista de sequências disponíveis para
o paciente e selecionar as que serão utilizadas na fusão. Na lista, clicar na sequência
desejada. As imagens da mesma serão exibidas.
23. Na RM sempre é necessário ordenar as imagens utilizando Options / Sort images,
selecionando a opção em “Select sort criteria”, conforme o tipo de plano, seja sagital,
coronal ou transversal.
24. Selecionar ou de-selecionar imagens, com espaço. Ajustar o FOV se for necessário.
25. Terminar salvando as alterações com clique no ícone de disquete.
26. Se for selecionado “Virtual Fiducials Mode”, MNPS continuará. Se for selecionado “Non-
stereotactic Image Set” será chamado o programa CAT3D. Responder SIM ou YES à
pergunta "Call CAT3D with this patient?" ou "Call MNPS with this patient?"
27. O CAT3D ou o MNPS (no “Virtual Fiducilals Mode”) será iniciado.
28. O sistema solicita os dados para salvar o planejamento. Preencher os campos conforme
necessário e confirmar com OK.
29. O CAT3D ou MNPS inicia pelo Mosaico. Faça duplo clique em uma imagem para entrar na
janela de planejamento, onde é possível marcar POIs e desenhar ROIs, se necessário.
Clicar no ícone EXIT ou apertar tecla <ESC>.
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30. Ir ao menu inicial do sistema, selecionar File e selecionar "Export for Fusion" ou clicar no
botão indicado na figura que segue:
31. Voltar ao MNPS com a sequência estereotáxica. Clicar no ícone que parece uma imagem
axial dividida ou tecla <F5>. Aparecerá a lista das sequências previamente importadas.
Selecionar a sequência que será utilizada na fusão.
32. MNPS irá perguntar se são necessários “Registrations Points”
Os “Registration Points” são muito úteis em casos com conjuntos sagitais ou coronais de
MRI, porque eles são usados como aproximações iniciais no processo de registro
automático. Porém, para manter simples este primeiro exemplo, clique em “NO”, para que
seja feito o registro totalmente automático.
33. Deixar o MNPS otimizar a fusão por um tempo até que informe que rodou até 8 vezes sem
melhoras, e observando na janela lateral que a coerência das fronteiras entre ambas
modalidades seja satisfatória. Para finalizar a otimização usar tecla <ESC>. Aparecerá
uma janela informativa com os resultados da fusão. Pressione ESC para fechá-la.
34. Caso o resultado do registro e fusão não seja satisfatório no modo automático existem
outros métodos implementados no MNPS, como registro por POIs e registro iniciado por
pontos de referência definidos pelo operador. Existe também um modo de fusão elástica.
Estes recursos avançados estão fora do objetivo deste guia básico, recomendamos
consultar outros documentos do sistema.
35. Para definir a região em que será exibida a ressonância, utilize Ctrl+F5. Aparecerá um
retângulo vermelho que define a região onde a imagem de RM será fundida com a imagem
de CT. Este retângulo pode ser arrastado com o mouse clicando no círculo no centro do
mesmo, e redimensionado arrastando o canto inferior direito.
36. Redimensionar e posicionar o retângulo até que o mesmo corresponda à região onde se
deseja que seja exibida a ressonância e pressionar ENTER. Na região definida aparecerá
a imagem da RM fundida com a tomografia.
MNPS © MEVIS Informática Médica Ltda. – Guia rápido página 6 de 6
37. Na imagem fundida é possível criar POIs, desenhar ROIs, sobrepor atlas e visualizar as
coordenadas relativas ao sistema estereotáxico, da forma já explicada anteriormente.
Este documento mostra as operações mais básicas do MNPS. Para informações detalhadas, por
favor, leia os manuais e outros documentos publicados que cobrem o conjunto completo de
ferramentas que o MNPS oferece. Você também pode entrar em contato com a Mevis sobre o
próximo curso de MNPS disponível.

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Primeiros passos com o MNPS

  • 1. MNPS © MEVIS Informática Médica Ltda. – Guia rápido página 1 de 6 Primeiros Passos com o MNPS. 1. Copiar todas as imagens DICOM do paciente em uma pasta dentro de: c:MNPSdicom exemplo: se o paciente tem nome “Fulano de Tal”, criar a pasta c:MNPSdicomFulano_de_Tal. Criar uma sub pasta para cada tipo de imagens, CT, RM, etc. 2. Se for uma biópsia simples, sem necessidade de fusão com RM, arrastar um (1) arquivo da CT (estéreo-CT) e soltar sobre o ícone (atalho) do MNPShell no desktop: 3. Responder se o conjunto de imagens a que pertence esta imagem ‚ é ou não estereotáxico. Se abre o importador de imagens DICOM, que realizará o pré-processamento das imagens para salvá-las no formato interno do MNPS (*.IMG). 4. Caso as imagens estejam dispersas por várias subpastas, utilize o terceiro ícone da barra de ferramentas e navegue pelas pastas até ficar na base das subpastas que contém todas as imagens DICOM. Depois clique em “File” e selecione “Scan Path in Depth”. 5. A qualquer momento, é possível mudar o número de imagens apresentadas na tela, visualizando uma imagem de cada vez ou um mosaico com várias imagens de imagens. Para isso pode-se clicar no quarto botão da barra de ferramentas ou na opção View do menu principal. Isto é uma questão de preferência do usuário. 6. Ordenar as imagens utilizando Options / Sort images. Será apresentada uma lista de opções “Select sort criteria”.
  • 2. MNPS © MEVIS Informática Médica Ltda. – Guia rápido página 2 de 6 As imagens axiais também chamadas transversais devem ordenar-se pelo Z . As coronais pelo Y e as sagitais pelo X . Na CT sempre são axiais. Clicar na opção desejada. O programa ordenará as imagens. A seguir, se a ordenação for satisfatória, clicar em “Exit sort”. 7. As imagens inicialmente estão todas selecionadas para serem processadas e convertidas ao formato IMG. Porém, pode ser necessário descartar algumas imagens, por diferentes motivos. Em geral, recomenda-se descartar, sempre que possível, imagens com artefatos causados pelo aro e imagens onde alguns dos fiducials estejam completamente unidos. Para de-selecionar uma imagem, dar um clique nela e dar espaço (tecla Space). O Espaço seleciona ou de-seleciona um frame. Também é possível de-selecionar fazendo click de mouse no quadradinho azul no canto superior direito da imagem. 8. Para ajustar o FOV (Field Of View) clique no ícone do quadradinho com linha de pontos (o quinto ícone da barra mostrada). Deixar o quadro vermelho um pouco maior que os fiducials. Para aceitar o FOV, pressione ENTER. O FOV selecionado se aplica a todas as imagens, por tanto, recomenda-se percorrer o conjunto de imagens verificando se em todas elas os fiducials se encontram dentro do FOV. O ajuste do FOV é muito importante, pois caso os fiducials fiquem muito afastados das bordas da imagem o MNPS pode não achar os fiducials automaticamente. 9. Os arquivos de imagens IMG serão criados com nomes derivados do nome do paciente. Caso seja necessário alterar este nome, utilize a opção Options / Rename. 10. Ao terminar de selecionar as imagens DICOM, ajustar FOV, etc., clique no ícone do disquete, o sistema salvará as imagens (*.img) e perguntará se chama ao MNPS para iniciar a busca dos fiducials: “Call MNPS with this patient?” Responder SIM (ou YES).
  • 3. MNPS © MEVIS Informática Médica Ltda. – Guia rápido página 3 de 6 11. O MNPS abre perguntando a forma como foi feita a colocação dos fiducials, o tipo de frame, etc. Responder tudo e clicar em OK. O sistema apresenta as respostas selecionadas. Se estiverem corretas, confirmar com OK. 12. Começo da busca dos fiducials. O MNPS tenta achá-los automaticamente, mas o usuário deve confirmar com <ENTER> que está certo ou com <ESC> se estiver errado. Observar com muito cuidado cada imagem, até concluir. Depois que o MNPS tem registrados fiducials de vários planos pode dar continuidade automaticamente, apenas pedirá confirmação do operador quando apresentem algum desvio do modelo ideal para o sistema. 13. O sistema solicita os dados para salvar o planejamento. Preencher os campos conforme necessário e confirmar com OK. 14. A partir daqui cada imagem está devidamente registrada ao sistema estereotáxico (calibrada). O MNPS abre o Mosaico de imagens. Dar duplo clique em uma imagem. 15. Se for para uma biópsia e somente necessita coordenadas do alvo, basta procurar a imagem com o ponto para biópsia e clicar no sítio desejado. As coordenadas do cursor estarão na esquina inferior direita como X, Y, Z. Para navegar pelas imagens utilizar os botões de setas ou as teclas PgUp / PgDn do teclado. 16. Para criar um ponto de interesse no sítio da biópsia criaremos um POI. Dê um clique no alvo desejado e clique no botão “POI” que está do lado direito da barra de ferramentas. Se abre uma janelinha para dar nome ao POI. O nome do POI pode conter até 7 letras e/ou números. Dê um nome para o POI. 17. Para consultar as coordenadas dos POIs abra a tabela de POIs no ícone que fica do lado direito do ícone POI. Para imprimir a tabela de POIs clique no ícone da impressora que fica embaixo do ícone antes mencionado, selecionar "POI Table". 18. Para criar um POI no final de uma trajetória de agulha clique no ícone que parece um trajeto, do lado do ícone de tabela de POIs. O sistema pede selecionar o POI de entrada e depois solicita o nome do POI destino. 19. Salvar o planejamento clicando no ícone que parece um disquete.
  • 4. MNPS © MEVIS Informática Médica Ltda. – Guia rápido página 4 de 6 Como fundir o planejamento anterior de CT com um conjunto de RM do paciente: 20. Arrastar um (1) arquivo DICOM da RM e soltar sobre o ícone do MNPShell . 21. Este caso não configura um conjunto estereotáxico de imagens, pois elas foram feitas sem os fiducials. É possível utilizar o modo de estereotaxia virtual selecionando “For Virtual Fiducials Mode” ou simplesmente “Non-Stereotactic Image Set”. O “Virtual Fiducials Mode” é executado pelo próprio MNPS enquanto o “Non-stereotactic Image Set” é processado pelo CAT3D. A vantagem do modo estereotáxico virtual é ter disponibilidade de recursos exclusivos do MNPS tais como atlas, recursos de DBS, tractografias, dosimetria para cones de radiocirurgia, etc. 22. O sistema mostrará as imagens da primeira sequência encontrada. Como na RM pode haver várias sequências, deve-se utilizar na opção File / Open ou clicar no botão correspondente na barra de ferramentas, para exibir a lista de sequências disponíveis para o paciente e selecionar as que serão utilizadas na fusão. Na lista, clicar na sequência desejada. As imagens da mesma serão exibidas. 23. Na RM sempre é necessário ordenar as imagens utilizando Options / Sort images, selecionando a opção em “Select sort criteria”, conforme o tipo de plano, seja sagital, coronal ou transversal. 24. Selecionar ou de-selecionar imagens, com espaço. Ajustar o FOV se for necessário. 25. Terminar salvando as alterações com clique no ícone de disquete. 26. Se for selecionado “Virtual Fiducials Mode”, MNPS continuará. Se for selecionado “Non- stereotactic Image Set” será chamado o programa CAT3D. Responder SIM ou YES à pergunta "Call CAT3D with this patient?" ou "Call MNPS with this patient?" 27. O CAT3D ou o MNPS (no “Virtual Fiducilals Mode”) será iniciado. 28. O sistema solicita os dados para salvar o planejamento. Preencher os campos conforme necessário e confirmar com OK. 29. O CAT3D ou MNPS inicia pelo Mosaico. Faça duplo clique em uma imagem para entrar na janela de planejamento, onde é possível marcar POIs e desenhar ROIs, se necessário. Clicar no ícone EXIT ou apertar tecla <ESC>.
  • 5. MNPS © MEVIS Informática Médica Ltda. – Guia rápido página 5 de 6 30. Ir ao menu inicial do sistema, selecionar File e selecionar "Export for Fusion" ou clicar no botão indicado na figura que segue: 31. Voltar ao MNPS com a sequência estereotáxica. Clicar no ícone que parece uma imagem axial dividida ou tecla <F5>. Aparecerá a lista das sequências previamente importadas. Selecionar a sequência que será utilizada na fusão. 32. MNPS irá perguntar se são necessários “Registrations Points” Os “Registration Points” são muito úteis em casos com conjuntos sagitais ou coronais de MRI, porque eles são usados como aproximações iniciais no processo de registro automático. Porém, para manter simples este primeiro exemplo, clique em “NO”, para que seja feito o registro totalmente automático. 33. Deixar o MNPS otimizar a fusão por um tempo até que informe que rodou até 8 vezes sem melhoras, e observando na janela lateral que a coerência das fronteiras entre ambas modalidades seja satisfatória. Para finalizar a otimização usar tecla <ESC>. Aparecerá uma janela informativa com os resultados da fusão. Pressione ESC para fechá-la. 34. Caso o resultado do registro e fusão não seja satisfatório no modo automático existem outros métodos implementados no MNPS, como registro por POIs e registro iniciado por pontos de referência definidos pelo operador. Existe também um modo de fusão elástica. Estes recursos avançados estão fora do objetivo deste guia básico, recomendamos consultar outros documentos do sistema. 35. Para definir a região em que será exibida a ressonância, utilize Ctrl+F5. Aparecerá um retângulo vermelho que define a região onde a imagem de RM será fundida com a imagem de CT. Este retângulo pode ser arrastado com o mouse clicando no círculo no centro do mesmo, e redimensionado arrastando o canto inferior direito. 36. Redimensionar e posicionar o retângulo até que o mesmo corresponda à região onde se deseja que seja exibida a ressonância e pressionar ENTER. Na região definida aparecerá a imagem da RM fundida com a tomografia.
  • 6. MNPS © MEVIS Informática Médica Ltda. – Guia rápido página 6 de 6 37. Na imagem fundida é possível criar POIs, desenhar ROIs, sobrepor atlas e visualizar as coordenadas relativas ao sistema estereotáxico, da forma já explicada anteriormente. Este documento mostra as operações mais básicas do MNPS. Para informações detalhadas, por favor, leia os manuais e outros documentos publicados que cobrem o conjunto completo de ferramentas que o MNPS oferece. Você também pode entrar em contato com a Mevis sobre o próximo curso de MNPS disponível.