Este documento presenta un curso de bioquímica. Su objetivo general es que los estudiantes identifiquen y valoren la importancia de las biomoléculas en los procesos metabólicos y funciones de los organismos vivos. Se enseñará a través de consultas bibliográficas, discusiones grupales, prácticas de laboratorio y la resolución de cuestionarios. La bioquímica es relevante para carreras relacionadas con las ciencias de la vida.
2. PRESENTACIÓN DEL CURSO Esta es una materia de formación básica particular obligatoria de importancia relevante para los estudiantes de las carreras relacionadas con las ciencias de la vida, en las que se estudian los principios básicos de la estructura molecular y el metabolismo de las diferentes biomoléculas componentes fundamentales de la materia viva.
3. OBJETIVO GENERAL Que el estudiante mediante el estudio de la bioquímica identifique y valore la importancia de las biomoléculas en las diversas vías metabólicas y funciones de los organismos vivos.
4.
5. ENSEÑANZA – APRENDIZAJE En un curso teórico practico como el presente, la transmisión del contenido de la materia, es responsabilidad del profesor, del alumno y de la literatura de consulta, así como de los materiales apropiadamente programados y la transmisión del método de la materia al laboratorio o al trabajo de campo. Se propone la idea de unificar el aula, el laboratorio y el campo, creando un curso con auxiliares didácticos bajo el siguiente esquema: consultas bibliograficas-lectura-investigación-discusión grupal; exposición-discusión grupal-equipos de trabajo; ejercicios-resúmenes-practicas de laboratorio; resolución de cuestionarios guía.
6. CARACTERISTÍCAS DE LA APLICACIÓN PROFESIONAL DE LA MATERIA Materia básica común relevante para Médicos, Veterinarios, Biólogos, Agrónomos e Ingenieros Bioquímicos. Se aplica en nutrición, abordando el campo relacionado con la calidad y asimilación de los alimentos Su aplicación incluye también áreas clínicas y biotecnológicas.
10. DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA La Bioquímica describe la estructura, organización y función de la materia viva en términos moleculares; tiene como objetivo el conocimiento de la materia viva y busca establecer las leyes que rigen los procesos vitales a nivel molecular para regularlos y posteriormente reproducirlos en condiciones artificiales. “ El estudio del metabolismo” En búsqueda de respuestas los Bioquímicos se han planteado una serie de preguntas: Que estructuras químicas componen la materia viva? De que forma estos componentes interactúan para dar origen a estructuras supramoleculares; organizadas en células, órganos y organismos? Como extrae la materia viva energía de su entorno para mantener su existencia? De que manera se almacena y se trasmite la infamación un organismo? Que cambios químicos acompañan la reproducción, el envejecimiento y la muerte de células y organismos? Como se controlan las reacciones químicas en el interior de las células vivas?
11.
12. DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA DIVISIÓN DE LA BIOQUÍMICA Química estructural de los componentes de la materia viva y la relación de la función biológica con la estructura química. El metabolismo , la totalidad de reacciones químicas que ocurren en la materia viva. Genética molecular: química de los procesos y las sustancias que almacenan y transmiten la información biológica. Esta área pretende conocer la herencia y la expresión de la información genética en términos moleculares.
13. ÁREAS DE LA BIOQUÍMICA Bioquímica cuantitativa : responde la pregunta: ¿ de que están hechos los organismos y cuanto hay de cada componente? Bioquímica dinámica: ¿en que procesos y en que transformaciones químicas participan los componentes encontrados en un determinado microorganismo? Bioquímica Funcional: ¿cómo las transformaciones y reacciones químicas se traducen en funciones?
14.
15.
16.
17. DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA ORIGENES DE LA BIOQUÍMICA A principios del siglo XIX, con los trabajos de F. Wöhler se inicia la Bioquímica como un campo científico diferenciado. Antes de Wöhler se creí a que las sustancias orgánicas se podrían formar solamente bajo influencia de la fuerza vital en los cuerpos de plantas y animales. En 1828 Wöhler demostró que la urea, una sustancia de origen biológico podía ser sintetizada a partir de materiales inorgánicos (cianato de amónico). La síntesis de la urea fue importante para la bioquímica , demostró que un compuesto producido por los organismos biológicos se podría producir en un laboratorio, bajo condiciones controladas, a partir de la materia inanimada. Wöhler fue además co-descubridor del berilio , titanio y del silicio, así como la síntesis del carburo de calcio, entre otros. Los descubrimientos de Wöhler's tuvieron gran influencia en la teoría de la química. FRIEDRICH W Ö HLER
18. Las reacciones de la materia viva sólo podían darse en las células vivas por acción de una fuerza vital misteriosa en vez de procesos físicos y químicos. Eduard y Hans Buchner observaron que los extractos de levaduras destruidas podían llevar a cabo todo el proceso de fermentación del azúcar hasta el etanol. Este descubrimiento abrió el camino al análisis de las reacciones y de los procesos bioquímicos in vitro. DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA ORIGENES DE LA BIOQUÍMICA “VITALISMO”
19. L a glucosa se oxida gradualmente en el ácido p i ruvic o para después dar origen al etanol. Los hermanos Eduard y Hans Buchner extrajeron las enzimas que catalizan la fermentación del alcohol a aprtir de extractos de levadura homogeneizados. 1897 EDUARD Y HANS BUCHNER DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA ORIGENES DE LA BIOQUÍMICA “ Catalizadores biológicos ”
20. La naturaleza de la catálisis biológica fue el último refugio de los vitalistas, que sostenían que las enzimas eran demasiado complejas para poder describirlas en términos químicos. James Batcheller Sumner en 1926 demostró que la proteína ureasa podía cristalizarse como cualquier otro compuesto orgánico. Aunque las proteínas tienes estructuras grandes y complejas, sólo son compuestos orgánicos y sus estructuras pueden determinarse con los métodos de la química. JAMES BATCHELLER SUMNER DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA ORIGENES DE LA BIOQUÍMICA “ Derrumbe del Vitalismo”
21. La idea del GEN como unidad de información hereditaria, fue propuesta por primera vez a mediados del siglo XIX por Gregor Mendel. El trabajo de Mendel se convirtió en la fundación para la genética moderna. En el año 1900, los biólogos celulares se dieron cuenta que los genes deben encontrarse en los cromosomas, que están formados por proteínas y ácidos nucleicos. DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA ORIGENES DE LA BIOQUÍMICA “Genética moderna”
22. Friedrich Miescher Hasta mediados del siglo XX nadie habia aislados un gen, ni habia determinado su composición química. En 1869 Friedrich Miescher logra aislar los ácidos nucleicos, pero sus estructuras químicas se conocian mal y a comienzos del siglo se pensaba que eran sustancias sencillas que cumplian una función estructural en la célula. Las proteínas eran lo suficientemente complejas desde el punto de vista estructural como para ser las portadoras de la informacion genética. DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA ORIGENES DE LA BIOQUÍMICA “ Aislamiento de Ácidos Nucleicos”
23. J. Watson y F Crick Uno de los avances mas importantes en la ciencia se produjo con el descubrimiento en 1953, cuando J. Watson y F Crick descubrieron la estructura de la doble hélice del DNA. Este concepto sugirió la forma en que podía codificarse la información en la estructura de las moléculas y transmitirse inalteradamente de una generación a otra. DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA ORIGENES DE LA BIOQUÍMICA “ Estructura de la doble hélice del DNA”
24. DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA La Bioquímica como disciplina y ciencia interdisciplinar BIOQUÍMICA Biología Celuar Génetica Fisiología Química Organica Biofísica Nutrición Investigación médica Microbiología La Bioquímica adquiere fuerza a partir de todas estas disciplinas, y las nutre tambien; se trata de una disciplina realmente interdisciplinar. Propiedaddes de las biomoléculas Técnicas físicas para las propiedades de las biomoléculas Procesos de la vida a nivel tisular y de organismos División bioquímica en el interior de la célula Mecanismo de identidad bioquímica Metabolismo y mantenimiento de la salud
25. DEFINICIÓN Y APLICACIÓN DE LA BIOQUÍMICA La Bioquímica como disciplina y ciencia interdisciplinar La química orgánica, que describe las propiedades de las biomoléculas. Biofísica, que aplica las técnicas de la física al estudio de la estructura de las biomoléculas. La investigación médica, que intenta conocer cada vez más los estados patológicos en términos moleculares. La nutrición, que ha aclarado el metabolismo mediante la descripción de las necesidades alimentarías para el mantenimiento de la salud. La microbiología, que ha demostrado que los organismos unicelulares y los virus son apropiados para la determinación de muchas rutas metabólicas. La fisiología, que investiga los procesos de la vida a nivel tisular y del organismo. Biología celular, que describe la división bioquímica del trabajo en el interior de la célula. Genética, describe el mecanismo que da a una determinada célula u organismo su identidad bioquímica.
26.
27.
28.
29.
30.
31.
32. 15,000 millones Big-Bang LA VIDA ES UN FENÓMENO DE LA SEGUNDA GENERACION DE ESTRELLAS. Primera generación de estrellas/elementos ligeros; Helio e Hidrogeno Fase temprana Maduración de las estrellas/millones de años Reacciones termonucleares Elementos mas pesados/inestabilidad de los elementos Origen: Novas y Supernovas Diseminación de elementos pesados Condensación y formación de estrellas de segunda generación con sistemas planetarios ricos en elementos pesados Formación de la tierra primitiva, Atmósfera reductora secundaria, Síntesis de moléculas orgánicas, Macromoléculas, Origen de las formas de vida actual. 4 500 millones
33. COMPONENTES PRINCIPALES DE LOS ORGANISMOS La Bioquímica como ciencia Química Elementos químicos de la materia viva La vida es un fenómeno de la segunda generación de estrellas. Universo formado por Hidrógeno y Helio (elementos ligeros producidos durante el “Bing-Bang”. Reacciones termonucleares que produjeron elementos mas pesados tales como; carbono, nitrógeno y oxigeno. Inestabilidad de las estrellas grandes, explotan y forman la segunda generación de estrellas, con sistemas planetarios ricos en elementos pesados.
34. COMPONENTES PRINCIPALES DE LOS ORGANISMOS La Bioquímica como ciencia Química Composcición del universo, la corteza terrestre y el cuerpo humano
35. COMPONENTES PRINCIPALES DE LOS ORGANISMOS La Bioquímica como ciencia Química Elementos químicos de la materia viva Por que son esenciales los elementos pesados para la vida? Carbono (C) Hidrógeno (H) Oxígeno (O) Nitrógeno (N) Dichos elementos son importantes para la vida, debido a la fuerte tendencia a formar enlaces covalentes.
36. COMPONENTES PRINCIPALES DE LOS ORGANISMOS La Bioquímica como ciencia Química Elementos que se encuentran en los organismos vivos Primer nivel Carbono, Hidrógeno, Nitrógeno y Oxígeno; los mas abundantes en todos los organismos. Segundo nivel Calcio (Ca), Cloro (Cl), Magnesio (Mg), Fosfóro (P), Potasio (K), Sodio (Na) y Azufre (S); menos abundantes pero se encuentran en todos los organismos . Tercer nivel Cobalto (Co), Cobre (Cu), Hierro (Fe), Manganeso (Mn) y Zinc (Zn). Cuarto nivel Aluminio (Al), Arsénico (As), Boro (Br), Cromo (Cr), Flúor (F), Galio (Ga), Yodo (I), Molibdeno (Mo), Níquel (Ni), Selenio (Se), Sílice (Si), Tungsteno (W) y Vanadio (V). Los elementos del tercer y cuarto nivel son en su mayoría metales que actúan como colaboradores de las catálisis de las reacciones bioquímicas.
37. COMPONENTES PRINCIPALES DE LOS ORGANISMOS La Bioquímica como ciencia Biológica EL ESCENARIO DE ACCIÓN: LA CÉLULA
39. Estudia al ente biológico, es decir a la célula viva o sus componentes que se utilizan en los diferentes procesos, a través de una descripción cuantitativa de las relaciones cinéticas, estequiométricas y termodinámicas que rigen el crecimiento celular, el consumo de nutrimentos, la generación y transformación de productos, las dinámicas poblacionales y demás transformaciones características de los procesos celulares . Así mismo, estudia tanto al entorno fisicoquímico donde el ente biológico se desarrolla, como a los fenómenos de transporte mediante los cuales se determinan diversas variables fisicoquímicas que afectarán el desempeño del ente biológico. QUE ESTUDIA LA INGENIERÍA BIOQUÍMICA (IBI)
40. Estudia los procesos de materiales de origen biológico ( microorganismos, células o sus partes ) para generar bienes o servicios; cuya aplicación de principios físicos y químicos logra la comprensión cuantitativa de las transformaciones biológicas. Diseño y operación de bioprocesos eficientes y reproducibles. ¿QUE HACE UN INGENIERO BIOQUÍMICO?
42. La IBI también trata con el ente mecánico, es decir, el diseño de equipos, sistemas, materiales y accesorios que contienen e interaccionan con el ente biológico. El ente mecánico determina los fenómenos de transporte, y se necesita para establecer mediciones y acciones de control para operar adecuadamente un bioproceso. Finalmente, la IBI estudia la interrelación entre las distintas facetas mencionadas para así poder escalar a nivel comercial un bioproceso que cumpla con exigencias tanto técnicas como económicas y de seguridad ambiental y humana.
43. Todas las fases se encuentran estrechamente relacionadas entre sí y es necesario integrarlas durante el desarrollo de un bioproceso. Ámbitos de estudio de la IBI
44. 2000 J. Craig Venter y sus colegas publican la secuencia completa del genoma de Drosophila melanogaster. 2000 André Rosenthal y Yoshiyuki Sakaki , quienes encabezan el Proyecto del Genoma Humano, mapean la secuencia completa del cromosoma 21, el más pequeño de los cromosomas humanos. 2000 Arvid Carlsson , Paul Greengard y Eric Kandel reciben el premio Nobel por sus descubrimientos sobre la transducción de señales en el sistema nervioso y en especial por la caracterización de la transmisión sináptica lenta y la memoria de corto plazo a través de fosforilación y defosforilación de proteínas. 1885 Oscar Hertwig y Eduard Strasburger desarrollan la idea de que en el núcleo se localiza la base de la herencia. 1855 Claude Bernard aísla glucógeno del hígado, muestra que se convierte en glucosa y descubre el proceso de gluconeogénesis. 1815 Jean-Baptiste Biot descubre la actividad óptica de poseen algunos compuestos orgánicos. 1810 Louis Joseph Gay-Lussac deduce la ecuación de la fermentación alcohólica.