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CLASE 3.
BIOMOLÉCULAS II.
Aminoacidos
Aminoácidos
Los aminoacidos son moléculas que se estructuran en base a Carbono,
Hidrogeno, oxigeno y nitrógeno. Tienen unidos un grupo funcional amino
y carboxilo a un átomo de carbono central o carbono alfa (azul). Las
proteínas son polímeros de aa, pueden contener azufre, hierro y otros
elementos.
-20
aminoácidos
se
encuentran
comúnmente en las proteínas. Se
estructuran sobre la base de los distintas
cadenas laterales o R (rosado).
Aminoácidos
En los aminoacidos se puede dar el fenómeno de isomería, al igual que en
monosacáridos.

En este caso L o D aminoácido se debe a la configuración del grupo amino
(NH3) en la molécula. En las proteínas encontramos los L-aa.
Aminoácidos
Los aminoácidos se agrupan en 5 categorías según sus características
químicas
Aminoácidos
Los aminoácidos se agrupan en 5 categorías según sus características
químicas
Aminoácidos
Los aminoácidos se agrupan en 5 categorías según sus características
químicas
Aminoácidos y Proteínas.
Dos moléculas de aminoacidos pueden ser covalentemente unidas
para formar péptidos. Este tipo de enlace es el enlace peptídico.

Oligopeptido: 2-10 Aminoácidos (aa)
Péptidos: 10 - 50 Aminoácidos (aa)
Proteínas > 50 Aminoácidos (aa)
Aminoácidos y Proteínas.
Aminoácidos y Proteínas.
Estructura primaria: Secuencia de unión de aa: enlace peptídico.
Estructura secundaria: Alfa y Beta Hélices: Puente de Hidrogeno.
Los puentes de hidrógeno
son paralelos al eje central
de la hélice
Las cadenas laterales van dirigidas
hacia afuera
Aminoácidos y Proteínas.
Estructura secundaria: Alfa y Beta Hélices: Puente de Hidrogeno.
Aminoácidos y Proteínas.
Estructura Terciaria
Estructura Terciaria: es la formación que resulta de la tendencia de plegarse de la
estructura secundaria. Resulta de la formación de enlaces entre los radicales R de
los aminoácidos.
PUENTE DE
HIDROGENO

INTERACCION
HIDROFOBICA

ENLACE IONICO

PUENTE DISULFURO
Lehninger Principios de Bioquímica David L. Nelson y Michael M. Cox .
Aminoácidos y Proteínas.
Estructura cuaternaria: Corresponde a la unión, mediante enlaces débiles (no
covalentes) de varias cadenas polipeptídicas con estructura terciaria (protómero),
para formar un complejo proteico.

HEMOGLOBINA
Tetrámero
Max Perutz 1959
Aminoácidos y Proteínas.
La conformación estructural de las
proteínas
esta
directamente
relacionada con su función.
Si estas pierden su conformación 3D
pueden perder su función. Esto pasa
cuando las proteínas se denaturan
(pierden su estado natural) por
agentes químicos que cambian el pH o
el calor.
Proteínas de Reconocimiento Celular.
Péptidos de
Histocompatibilidad:
Se disponen en la
superficie de los
Linfocitos T de defensa
para reconocer péptidos
extraños al cuerpo.
Región conservada y
región hipervariable.
Proteínas Contráctiles.
Miosina

-Dos cadenas pesadas
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Unión a ATP.
-Filamento grueso

Actina

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llamados G-Actina, se
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polímero de F-actina
Proteínas Contráctiles.
Aminoácidos y Proteínas: Enzimas.
Las enzimas son proteínas con capacidad catalizadora de reacciones
bioquímicas.
Sacarosa + O2
+ CO2

Agua

A pesar de que la conversión de azúcar en agua y CO2 en presencia de oxigeno es
favorable energéticamente, si dejamos un barril de azúcar en contacto con el aire,
este en cientos de años no sufrirá conversión apreciable en agua y CO2.
Esta velocidad de reacción no es apropiada a la vida.
Cuando un ser vivo consume sacarosa, ésta en segundos, se convierte en agua y
CO2, liberando energía. La diferencia es la catalisis enzimatica.
Aminoácidos y Proteínas: Enzimas.
La enzima confiere un sitio protegido y favorable en su interior para
que estas reacciones químicas se produzcan. Se llama sitio activo.

La molécula que se une a la enzima en el sitio activo es el sustrato
Aminoácidos y Proteínas: Enzimas.

La catálisis mejora la
tasa de reacción entre
moléculas al disminuir
la energía de
activación necesaria.
Aminoácidos y Proteínas: Enzimas.

Lehninger Principios de Bioquímica David L. Nelson y Michael M. Cox .
Cofactores: cofactores no proteicos, que unidos a una
apoenzima constituyen la holoenzima o forma catalíticamente
activa de la enzima.

Lehninger Principios de Bioquímica David L. Nelson y Michael M. Cox .
Coenzimas: cofactores orgánicos no proteicos, que unidos
a una apoenzima constituyen la holoenzima o forma
catalíticamente activa de la enzima.

Lehninger Principios de Bioquímica David L. Nelson y Michael M. Cox .
Aminoácidos y Proteínas: Enzimas.
Regulación de la actividad enzimática: Inhibición competitiva.

Un Inhibidor de la
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Un Inhibidor se une
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Nucleótidos.
Las bases nitrogenadas pueden ser de dos naturalezas:
Pirimidinas y purinas
Nucleótidos.
Las pentosas, son azúcares de 5 átomos de carbono,
Pueden ser ribosas y desoxyribosas:

RNA

DNA
Nucleótidos.
Los nucleótidos al perder el fosfato se llaman nucleósidos.
Nucleótidos.
Los nucleótidos también pueden
unir mas de un grupo fosfato,
generando moléculas con
participación en distintos ciclos
energéticos.
Nucleótidos.
Los nucleótidos en el DNA o RNA se
unen por el enlace fosfodiester, entre
el carbono 3 de la pentosa que tiene
el grupo fosfato y el Hidroxilo del
carbono 5 de la pentosa siguiente.

El enlace entre la base nitrogenada y
la pentosa, es de tipo glicosídico,
N-glicosídico.
Ácidos Nucléicos.
Tipos de RNA:

-Mensajero, tiende a girar a
la derecha.
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-RNA Ribosomal
-Ribozimas cataliticas
Ácidos Nucléicos.

Puente de Hidrogeno!!!!
Ácidos Nucléicos: Modelo de Watson y Crick.
En 1953, Watson y Crick descubrieron el apareamiento de bases complementarias y
postularon al DNA como la molécula que mantiene la información genética a través
de la secuencia en que se unen los nucleótidos en ella, lo llamaron el código
genético.
Ácidos Nucléicos: Modelo de Watson y Crick.
Modelo de doble hélice
de DNA de Watson y
Crick.
Surco menor

Surco mayor
Ácidos Nucléicos: Modelo de Watson y Crick.

El DNA puede existir en otras
conformaciones distintas a la
planteada por Watson y Crick, la A y Z.
Estas podrían tener roles regulatorios.

Forma A

Forma B

Forma Z
Ácidos Nucléicos: Modelo de Watson y Crick.
Replicación del Material genético es
semi-conservativa:
La doble hebra hija tiene una copia
nueva y conserva una copia de la
hebra madre.
Ácidos Nucléicos: Leyes de Chargraff.
1.- La composición de
Bases del DNA varía entre
especies.

2.- Todas las células de un
organismo tienen la misma
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3.-La composición de bases de un organismo no varía con la edad, ambiente o
estado nutricional.

4.-En toda molécula de DNA, la suma de A=T y de C=G.
Organización de los Ácidos Nucléicos.
El DNA es una molécula MUY
larga, por lo que debe organizar
su empacamiento para poder
entrar a la célula.

Para esto, dentro de las células el
DNA se compacta y enrolla sobre
proteínas,
formando
los
nucleosomas.

Algunos seres vivos los organizan
en la unidad máxima de
compactación: los cromosomas.
Organización de los Ácidos Nucléicos.
Todos los Eucariontes tienen alta conservación de las proteínas histonas,
que son de naturaleza básica, ya que son ricas en aminoacidos básicos,
como Lisina y Arginina. De este modo, pueden unirse al DNA que tiene
naturaleza ácida.

Las Histonas al interactuar con el DNA, forman los nucleosomas, la unidad
de organización básica del material genético.
Organización de los Ácidos Nucléicos.
Existen proteínas que ayudan a
estructurar el DNA, ayudan a su
empacamiento.
Son las Histonas, que forman la
cromatina
Organización de los Ácidos Nucléicos.
Las Histonas al interactuar con el DNA, forman los nucleosomas, la unidad
de organización básica del material genético.
El Nucleosoma se forma
por 8 proteínas histonas: 2
Histonas H2A, 2 H2B, 2 H3
y 2 H4

El Nucleosoma se pliega sobre 6 proteinas Histonas H1m formando
un hexameno de nucleosomas: Esto da origen a la fibra de 30 nm
Organización de los Ácidos Nucléicos.
1 cromátida de un
cromosoma.
El DNA de una célula Humana mide 1 metro,
como muchas células son diploides, tenemos
2 metros de DNA por célula.
Un Humano adulto tiene en promedio 10 14
células.
Siendo el largo del DNA Humano de 2x10 11
Kilómetros!!!

Diámetro de la Tierra: 4x104 Km
Distancia al Sol: 1,5x108 Km

1 Bucle: 30 rosetas.
Roseta: 6 loops.
1 Loop: 75.000 pb
(pares de bases).
Fibra de 30 mn.
Nucleosoma: DNA
sobre las proteínas
Histonas.
DNA
DNA como Molécula de la información Genética
Las bacterias al igual que los humanos, son infectadas con virus, los
bacteriófagos.
Estos inyectan su material genético a las bacterias, el cual guía la
síntesis de mas partículas virales.
Experimento de Hershey & Chase

Es el DNA y no las proteínas, quien entra a la célula bacteriana y transporta toda
la información necesaria para que se generen mas bacteriofagos.
La información genética de un organismo esta
codificada en su genoma.

Los seres vivos tienen tamaños de genoma muy variados, lo que representa
un desafío a la organización del material genético.
Genomas, cromosomas y genes.
Una célula somática Humana tiene 46 cromosomas= 2n. Las células sexuales o
gametos, tienen un valor n de cromosomas, n=23 cromosomas.
Existen 24 tipos de cromosomas, los 22 somáticos, el X e Y.
Cada cromosoma alberga
un grupo particular de
genes…
¿Qué es un gen?
Gen: Unidad mínima de almacenamiento y
transferencia de la información.
Información

Funcional: genes codificantes para proteínas.
Regulatoria: Genes codificantes para RNAs regulatorios.

Estructura de un gen Eucarionte: Exón: Segmento que se traduce a proteína.
Intrón: Segmento que no se traduce a proteína.
Gen: Unidad mínima de almacenamiento y transferencia
de la información.
Información Funcional: genes codificantes para
proteínas.

La secuencia de nucleótidos en el DNA almacena
la información genética, esta es transferida a una
molécula que es capaz de viajar desde el núcleo
al citoplasma, el RNA. Esta molécula participa en
la etapa final de la expresión génica, la síntesis de
proteínas, quienes son finalmente, las que
realizan las diversas funciones celulares.
Genoma Humano: Rico en secuencias no codificantes.
Cerca del 30% del genoma son genes, de
estos el 1,5% son exónes, es decir,
secuencias que se traducirán a proteínas.

Transposones, en su mayoria son secuencias
de origen viral sin función aparente.
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biomoléculas.

  • 3. Aminoácidos Los aminoacidos son moléculas que se estructuran en base a Carbono, Hidrogeno, oxigeno y nitrógeno. Tienen unidos un grupo funcional amino y carboxilo a un átomo de carbono central o carbono alfa (azul). Las proteínas son polímeros de aa, pueden contener azufre, hierro y otros elementos. -20 aminoácidos se encuentran comúnmente en las proteínas. Se estructuran sobre la base de los distintas cadenas laterales o R (rosado).
  • 4. Aminoácidos En los aminoacidos se puede dar el fenómeno de isomería, al igual que en monosacáridos. En este caso L o D aminoácido se debe a la configuración del grupo amino (NH3) en la molécula. En las proteínas encontramos los L-aa.
  • 5. Aminoácidos Los aminoácidos se agrupan en 5 categorías según sus características químicas
  • 6. Aminoácidos Los aminoácidos se agrupan en 5 categorías según sus características químicas
  • 7. Aminoácidos Los aminoácidos se agrupan en 5 categorías según sus características químicas
  • 8. Aminoácidos y Proteínas. Dos moléculas de aminoacidos pueden ser covalentemente unidas para formar péptidos. Este tipo de enlace es el enlace peptídico. Oligopeptido: 2-10 Aminoácidos (aa) Péptidos: 10 - 50 Aminoácidos (aa) Proteínas > 50 Aminoácidos (aa)
  • 10. Aminoácidos y Proteínas. Estructura primaria: Secuencia de unión de aa: enlace peptídico. Estructura secundaria: Alfa y Beta Hélices: Puente de Hidrogeno. Los puentes de hidrógeno son paralelos al eje central de la hélice Las cadenas laterales van dirigidas hacia afuera
  • 11. Aminoácidos y Proteínas. Estructura secundaria: Alfa y Beta Hélices: Puente de Hidrogeno.
  • 12. Aminoácidos y Proteínas. Estructura Terciaria Estructura Terciaria: es la formación que resulta de la tendencia de plegarse de la estructura secundaria. Resulta de la formación de enlaces entre los radicales R de los aminoácidos. PUENTE DE HIDROGENO INTERACCION HIDROFOBICA ENLACE IONICO PUENTE DISULFURO Lehninger Principios de Bioquímica David L. Nelson y Michael M. Cox .
  • 13. Aminoácidos y Proteínas. Estructura cuaternaria: Corresponde a la unión, mediante enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas polipeptídicas con estructura terciaria (protómero), para formar un complejo proteico. HEMOGLOBINA Tetrámero Max Perutz 1959
  • 14. Aminoácidos y Proteínas. La conformación estructural de las proteínas esta directamente relacionada con su función. Si estas pierden su conformación 3D pueden perder su función. Esto pasa cuando las proteínas se denaturan (pierden su estado natural) por agentes químicos que cambian el pH o el calor.
  • 15.
  • 16. Proteínas de Reconocimiento Celular. Péptidos de Histocompatibilidad: Se disponen en la superficie de los Linfocitos T de defensa para reconocer péptidos extraños al cuerpo. Región conservada y región hipervariable.
  • 17. Proteínas Contráctiles. Miosina -Dos cadenas pesadas -Cuatro cadenas livianas: Unión a ATP. -Filamento grueso Actina -Monómeros de actina llamados G-Actina, se unen para formar el polímero de F-actina
  • 19. Aminoácidos y Proteínas: Enzimas. Las enzimas son proteínas con capacidad catalizadora de reacciones bioquímicas. Sacarosa + O2 + CO2 Agua A pesar de que la conversión de azúcar en agua y CO2 en presencia de oxigeno es favorable energéticamente, si dejamos un barril de azúcar en contacto con el aire, este en cientos de años no sufrirá conversión apreciable en agua y CO2. Esta velocidad de reacción no es apropiada a la vida. Cuando un ser vivo consume sacarosa, ésta en segundos, se convierte en agua y CO2, liberando energía. La diferencia es la catalisis enzimatica.
  • 20. Aminoácidos y Proteínas: Enzimas. La enzima confiere un sitio protegido y favorable en su interior para que estas reacciones químicas se produzcan. Se llama sitio activo. La molécula que se une a la enzima en el sitio activo es el sustrato
  • 21. Aminoácidos y Proteínas: Enzimas. La catálisis mejora la tasa de reacción entre moléculas al disminuir la energía de activación necesaria.
  • 22. Aminoácidos y Proteínas: Enzimas. Lehninger Principios de Bioquímica David L. Nelson y Michael M. Cox .
  • 23. Cofactores: cofactores no proteicos, que unidos a una apoenzima constituyen la holoenzima o forma catalíticamente activa de la enzima. Lehninger Principios de Bioquímica David L. Nelson y Michael M. Cox .
  • 24. Coenzimas: cofactores orgánicos no proteicos, que unidos a una apoenzima constituyen la holoenzima o forma catalíticamente activa de la enzima. Lehninger Principios de Bioquímica David L. Nelson y Michael M. Cox .
  • 25. Aminoácidos y Proteínas: Enzimas. Regulación de la actividad enzimática: Inhibición competitiva. Un Inhibidor de la reacción se une al sitio activo de la enzima, imposibilitando la unión del sustrato.
  • 26. Aminoácidos y Proteínas: Enzimas. Regulación de la actividad enzimática: Inhibición no-competitiva. Un Inhibidor se une a otro sitio de la enzima, imposibilitando que proceda la reacción en presencia del sustrato.
  • 27. Nucleótidos y Ácidos Nucléicos.
  • 29. Nucleótidos. Las bases nitrogenadas pueden ser de dos naturalezas: Pirimidinas y purinas
  • 30. Nucleótidos. Las pentosas, son azúcares de 5 átomos de carbono, Pueden ser ribosas y desoxyribosas: RNA DNA
  • 31. Nucleótidos. Los nucleótidos al perder el fosfato se llaman nucleósidos.
  • 32. Nucleótidos. Los nucleótidos también pueden unir mas de un grupo fosfato, generando moléculas con participación en distintos ciclos energéticos.
  • 33. Nucleótidos. Los nucleótidos en el DNA o RNA se unen por el enlace fosfodiester, entre el carbono 3 de la pentosa que tiene el grupo fosfato y el Hidroxilo del carbono 5 de la pentosa siguiente. El enlace entre la base nitrogenada y la pentosa, es de tipo glicosídico, N-glicosídico.
  • 34. Ácidos Nucléicos. Tipos de RNA: -Mensajero, tiende a girar a la derecha. -RNA Transferencia tRNA. -RNA Ribosomal -Ribozimas cataliticas
  • 36. Ácidos Nucléicos: Modelo de Watson y Crick. En 1953, Watson y Crick descubrieron el apareamiento de bases complementarias y postularon al DNA como la molécula que mantiene la información genética a través de la secuencia en que se unen los nucleótidos en ella, lo llamaron el código genético.
  • 37. Ácidos Nucléicos: Modelo de Watson y Crick. Modelo de doble hélice de DNA de Watson y Crick. Surco menor Surco mayor
  • 38. Ácidos Nucléicos: Modelo de Watson y Crick. El DNA puede existir en otras conformaciones distintas a la planteada por Watson y Crick, la A y Z. Estas podrían tener roles regulatorios. Forma A Forma B Forma Z
  • 39. Ácidos Nucléicos: Modelo de Watson y Crick. Replicación del Material genético es semi-conservativa: La doble hebra hija tiene una copia nueva y conserva una copia de la hebra madre.
  • 40. Ácidos Nucléicos: Leyes de Chargraff. 1.- La composición de Bases del DNA varía entre especies. 2.- Todas las células de un organismo tienen la misma composición de bases en su DNA. 3.-La composición de bases de un organismo no varía con la edad, ambiente o estado nutricional. 4.-En toda molécula de DNA, la suma de A=T y de C=G.
  • 41. Organización de los Ácidos Nucléicos. El DNA es una molécula MUY larga, por lo que debe organizar su empacamiento para poder entrar a la célula. Para esto, dentro de las células el DNA se compacta y enrolla sobre proteínas, formando los nucleosomas. Algunos seres vivos los organizan en la unidad máxima de compactación: los cromosomas.
  • 42. Organización de los Ácidos Nucléicos. Todos los Eucariontes tienen alta conservación de las proteínas histonas, que son de naturaleza básica, ya que son ricas en aminoacidos básicos, como Lisina y Arginina. De este modo, pueden unirse al DNA que tiene naturaleza ácida. Las Histonas al interactuar con el DNA, forman los nucleosomas, la unidad de organización básica del material genético.
  • 43. Organización de los Ácidos Nucléicos. Existen proteínas que ayudan a estructurar el DNA, ayudan a su empacamiento. Son las Histonas, que forman la cromatina
  • 44. Organización de los Ácidos Nucléicos. Las Histonas al interactuar con el DNA, forman los nucleosomas, la unidad de organización básica del material genético. El Nucleosoma se forma por 8 proteínas histonas: 2 Histonas H2A, 2 H2B, 2 H3 y 2 H4 El Nucleosoma se pliega sobre 6 proteinas Histonas H1m formando un hexameno de nucleosomas: Esto da origen a la fibra de 30 nm
  • 45. Organización de los Ácidos Nucléicos. 1 cromátida de un cromosoma. El DNA de una célula Humana mide 1 metro, como muchas células son diploides, tenemos 2 metros de DNA por célula. Un Humano adulto tiene en promedio 10 14 células. Siendo el largo del DNA Humano de 2x10 11 Kilómetros!!! Diámetro de la Tierra: 4x104 Km Distancia al Sol: 1,5x108 Km 1 Bucle: 30 rosetas. Roseta: 6 loops. 1 Loop: 75.000 pb (pares de bases). Fibra de 30 mn. Nucleosoma: DNA sobre las proteínas Histonas. DNA
  • 46. DNA como Molécula de la información Genética Las bacterias al igual que los humanos, son infectadas con virus, los bacteriófagos. Estos inyectan su material genético a las bacterias, el cual guía la síntesis de mas partículas virales.
  • 47. Experimento de Hershey & Chase Es el DNA y no las proteínas, quien entra a la célula bacteriana y transporta toda la información necesaria para que se generen mas bacteriofagos.
  • 48. La información genética de un organismo esta codificada en su genoma. Los seres vivos tienen tamaños de genoma muy variados, lo que representa un desafío a la organización del material genético.
  • 49. Genomas, cromosomas y genes. Una célula somática Humana tiene 46 cromosomas= 2n. Las células sexuales o gametos, tienen un valor n de cromosomas, n=23 cromosomas. Existen 24 tipos de cromosomas, los 22 somáticos, el X e Y. Cada cromosoma alberga un grupo particular de genes… ¿Qué es un gen?
  • 50. Gen: Unidad mínima de almacenamiento y transferencia de la información. Información Funcional: genes codificantes para proteínas. Regulatoria: Genes codificantes para RNAs regulatorios. Estructura de un gen Eucarionte: Exón: Segmento que se traduce a proteína. Intrón: Segmento que no se traduce a proteína.
  • 51. Gen: Unidad mínima de almacenamiento y transferencia de la información. Información Funcional: genes codificantes para proteínas. La secuencia de nucleótidos en el DNA almacena la información genética, esta es transferida a una molécula que es capaz de viajar desde el núcleo al citoplasma, el RNA. Esta molécula participa en la etapa final de la expresión génica, la síntesis de proteínas, quienes son finalmente, las que realizan las diversas funciones celulares.
  • 52. Genoma Humano: Rico en secuencias no codificantes. Cerca del 30% del genoma son genes, de estos el 1,5% son exónes, es decir, secuencias que se traducirán a proteínas. Transposones, en su mayoria son secuencias de origen viral sin función aparente. Contribuyen a la evolución de los genomas SSR y SD son secuencias repetidas sin función aparente. Están presentes en Centromeros y Telomeros
  • 53. Flujo de la información genética: Dogma central de la Biología Molecular.