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Francisco Llaneras Estrada Julio 2007 Departamento de Ingeniería de Sistemas y Automática Universidad Politécnica de Valencia Periodo de docencia y actividad investigadora
CONTENIDO ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
PERIODO DOCENTE ,[object Object],2005-2006: Otros cursos y seminarios: Applications of advance control. Valencia, 2007. Bioprocess Engineering Course. Supetar (Croacia), 2006. Modelling and control of system with dynamic friction.  Valencia, 2006. Graduate course on embedded control systems.  Valencia, 2005. Dynamical network systems. Valencia, 2005. Non linear control. Valencia, 2005. Robots control. Valencia, 2005. Optimization and optimum control of chemical and biotechnological processes. Valencia. 2005. Periodo Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis Asignatura Créditos Calificación Control Inteligente y No Lineal. 4 Excelente (9) Control Multivariable y Robusto. 4 Excelente (10) Control Predictivo Basado en Modelos y sus Aplicaciones. 4 Notable (8) Redes para Control de Sistemas Industriales. 4 Excelente (9) Temas Avanzados de Control automático. 4 Excelente (10)
ACTIVIDAD INVESTIGADORA ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
PUBLICACIONES ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
PUBLICACIONES Artículos en revista internacional [1]  Llaneras F , Picó J: An interval approach for dealing with flux distributions and elementary modes activity patterns.   Journal of Theoretical Biology 2007, 246(2): 290-308. Factor de impacto 2006:  2.264 , 15/65 en biología [2]  Llaneras F , Picó J: A procedure for the estimation over time of metabolic fluxes in scenarios where measurements are uncertain and/or insufficient .  BMC Bioinformatics. (En revisión). [7]  Llaneras F , Picó J: Stoichiometric modelling of the cell metabolism. .  Journal of Bioscience and Bioengineering. (En revisión). Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
TRABAJO DE INVESTIGACIÓN “ Modelado, Análisis y Monitorización de Bioprocesos basado en Propiedades Estructurales de Redes Metabólicas” Redes metabólicas  ... Propiedades estructurales  ...  ...  análisis y monitorización . Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
Contexto ,[object Object],[object Object],[object Object],s 1 s 2 p Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis Ingeniería de  Bio procesos Biología de  Sistemas Fi s p
Contexto. Ejemplo de red metabólica ,[object Object],16 metabolitos 22 flujos (reacciones) 6 grados de libertad Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
Etapas del Trabajo ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
c1. Estimación de flujos metabólicos Combinar conocimiento de la estructura y los flujos medidos para  estimar  el resto de flujos. ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
Flux-spectrum   midiendo 5 flujos:  v1 (G), v6 (L), v7 (A), v20 (Q), v21 (CO2) c1. Ejemplo Flux-spectrum   midiendo 4 fluxes:  v1 (G), v7 (A), v20 (Q), v21 (CO2) Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
c3.  Monitorización de flujos metabólicos ,[object Object],[object Object],[object Object],Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
c3. Ejemplo Comparativa: Metodo existente y  nuestra propuesta Midiendo 6 flujos y con incertidumbre (±5%) Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis Flujos medidos Flujos calculados ,[object Object],[object Object],[object Object]
Midiendo 7 flujos y considerando incertidumbre  (±5%) tradicional Midiendo 4/5 flujos y con incertidumbre (±5%) Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis ,[object Object]
CONCLUSIONES ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
PUBLICACIÓN DE RESULTADOS Contribuciones para análisis (c1 y c2) [1]  Llaneras F , Picó J: An interval approach for dealing with flux distributions and elementary  modes activity patterns.   Journal of Theoretical Biology 2007, 246(2): 290-308. ( Factor de impacto 2006:  2.264 ,  15/65 en biología) [3]  Llaneras F , Tortajada M, Picó J: Structural analysis of metabolic pathways applied to  heterologous protein production in P. pastoris. European Congress on Biotechnology 2007.  [4]  F. Llaneras , J. Picó. The linkage between flux distributions and elementary modes activity  patterns: An interval Approach. From genomes to in silico and back. 1st International Symposium  on Systems Biology, Ed: Canovas Diaz M, ISBN (10): 84-611-1135-4. 2006. Contribuciones para monitorización (c3) [2]  Llaneras F , Picó J: A procedure for the estimation over time of metabolic fluxes in scenarios  where measurements are uncertain and/or insufficient .  BMC Bioinformatics. (En revisión). (Factor de impacto 2006:  3.60 , 24/140 en biotecnología) Revisión del estado del arte [7]  Llaneras F , Picó J: Stoichiometric modelling of the cell metabolism. .  Journal of Bioscience  and Bioengineering. (En revisión). Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
PLAN DE TESIS ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Periodo  Docente Actividad  Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis

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Defensa del DEA: Francisco Llaneras

  • 1. Francisco Llaneras Estrada Julio 2007 Departamento de Ingeniería de Sistemas y Automática Universidad Politécnica de Valencia Periodo de docencia y actividad investigadora
  • 2.
  • 3.
  • 4.
  • 5.
  • 6. PUBLICACIONES Artículos en revista internacional [1] Llaneras F , Picó J: An interval approach for dealing with flux distributions and elementary modes activity patterns. Journal of Theoretical Biology 2007, 246(2): 290-308. Factor de impacto 2006: 2.264 , 15/65 en biología [2] Llaneras F , Picó J: A procedure for the estimation over time of metabolic fluxes in scenarios where measurements are uncertain and/or insufficient . BMC Bioinformatics. (En revisión). [7] Llaneras F , Picó J: Stoichiometric modelling of the cell metabolism. . Journal of Bioscience and Bioengineering. (En revisión). Periodo Docente Actividad Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
  • 7. TRABAJO DE INVESTIGACIÓN “ Modelado, Análisis y Monitorización de Bioprocesos basado en Propiedades Estructurales de Redes Metabólicas” Redes metabólicas ... Propiedades estructurales ... ... análisis y monitorización . Periodo Docente Actividad Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
  • 8.
  • 9.
  • 10.
  • 11.
  • 12. Flux-spectrum midiendo 5 flujos: v1 (G), v6 (L), v7 (A), v20 (Q), v21 (CO2) c1. Ejemplo Flux-spectrum midiendo 4 fluxes: v1 (G), v7 (A), v20 (Q), v21 (CO2) Periodo Docente Actividad Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
  • 13.
  • 14.
  • 15.
  • 16.
  • 17. PUBLICACIÓN DE RESULTADOS Contribuciones para análisis (c1 y c2) [1] Llaneras F , Picó J: An interval approach for dealing with flux distributions and elementary modes activity patterns. Journal of Theoretical Biology 2007, 246(2): 290-308. ( Factor de impacto 2006: 2.264 , 15/65 en biología) [3] Llaneras F , Tortajada M, Picó J: Structural analysis of metabolic pathways applied to heterologous protein production in P. pastoris. European Congress on Biotechnology 2007. [4] F. Llaneras , J. Picó. The linkage between flux distributions and elementary modes activity patterns: An interval Approach. From genomes to in silico and back. 1st International Symposium on Systems Biology, Ed: Canovas Diaz M, ISBN (10): 84-611-1135-4. 2006. Contribuciones para monitorización (c3) [2] Llaneras F , Picó J: A procedure for the estimation over time of metabolic fluxes in scenarios where measurements are uncertain and/or insufficient . BMC Bioinformatics. (En revisión). (Factor de impacto 2006: 3.60 , 24/140 en biotecnología) Revisión del estado del arte [7] Llaneras F , Picó J: Stoichiometric modelling of the cell metabolism. . Journal of Bioscience and Bioengineering. (En revisión). Periodo Docente Actividad Investigadora Publicaciones Trabajo de Investigación Plan de tesis
  • 18.