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Ecologia de Populações




    Prof. Dr. Harold Gordon Fowler
      popecologia@hotmail.com
Doenças Infecciosas
Doenças microscópicas
  – Causadas por vírus e bactéria
  – O agente de infecção reproduz dentro do
    hospedeiro e é transmitido de um hospedeiro a
    outro hospedeiro
  – Exemplo: Influenza
Doenças macroscópicas
  – Causadas por lombrigas ou protozoas
  – Os agentes de infecção têm ciclos de vida
    complexos freqüentemente incluindo
    hospedeiros secundários ou vetores
  – Exemplo: Malaria
Pandemia de Influenza de 1957
O entendimento das epidemias
   grandes requer a modelagem da
    estrutura populacional global
Presume que o modelo padrão se aplica aos
  “contextos locais” (escolas, hospitais, prédios de
  apartamentos, povoados, ...)
Porém, esses contextos locais são embutidos numa
  serie de contextos sucessivamente maiores
  (vizinhanças, cidades, regiões, estados, países,
  continentes…)

As populações globais são “aninhadas”
Os indivíduos podem “escapar” o contexto local atual
  e se mudar a outro
A facilidade de mudar dos contextos “distantes”
  versus “próximos” depende da tecnologia
A Epidemiologia
         Matemática

Começou com a análise da epidemia de varíola
  de 1760 de Daniel Bernoulli
Se desenvolveu extensivamente desde 1920
  (Kermack e McKendrick)
Atualmente centenas de modelos lidam com
  variações de doenças humanas, animais e
  vegetais
Diversidade inacreditável dos modelos, que
  podem ser muito complexos, mas a maioria
  são variantes do original
Pergunta
Perguntas epidemiológicas
  – Ocorrerá uma epidemia?
  – Se ocorre uma epidemia,
     Quanta severa será?
     A doença eventualmente sumirá ou persistir
     na população?
     Quantos indivíduos pegarão a doença durante
     o curso da infecção?
Uma Pergunta Obvia
Quando um surto de uma doença infecciosa é
 constatado (SARS, Influenza Aviaria,
 Influenza Suína, Ebola, e outras.), uma das
 perguntas mais importantes é: “Que
 tamanho alcançará”?

Podemos também fazer uma uma pergunta
  análoga para as epidemias existentes (HIV,
  TB, Malaria)

Porém, a epidemiologia matemática não tem
  meios de responder essas perguntas?
Modelo dos Dados da
    Influenza
Em 1978, uma epidemia de influenza ocorreu
 numa escola de internos na norte da
 Inglaterra. Houve 763 internos, incluindo um
 indivíduo inicialmente infeccioso. A escola
 mantinha registros do número de internos
 confinados a cama, e pressupúnhamos que
 esses eram infecciosos. Os dados para as
 duas semanas podem ser ajustados ao modelo
 SIR.
Número de indivíduos infectados




Tempo
                                          Dados de Influenza
Variáveis
População Suscetível (S)
  – Indivíduos capazes de pegar a doença

População Infecciosa (I)
  – Indivíduos com a doença e podem
    transmite-a

População Retirada (R)
  – Indivíduos que se recuperaram e já não
    estão suscetíveis
  – Indivíduos naturalmente imunes ou isolados
Curva Epidêmica do Modelo SIR

                       S               R
Tamanho da População




                           I




                               Tempo
Curso Temporal da
Epidemia de Influenza

                                               S
Tempo da duração da infecção




                               R




                                           I




                                   Tempo
Modelo Esquemático


S       I      R
Epidemiologia Matemática
O modelo mais simples tem 3 compartimentos para
   agrupar os indivíduos
  –   S – suscetíveis
  –   I – infeccionados
  –   R – recuperados
Forma um modelo de compartimentos



           S              I         R
O Modelo Padrão (SIR)


(1) Os indivíduos passam entre
três estados: Susceptíveis,
Infectados, e Recuperados



(2) Mistura e uniformemente
aleatória
Analise por Compartimentos

Muitos processos complexos podem ser
   decompostos em estágios distintos e depois o
   sistema inteiro modelado ao descrever a
   interação entre os vários estágios
Modelo Esquemático

Exposto           Infecção        Doente, em recuperação
                                  Ou adquire imunidade




  S                   I                 R


             Recuperada mas sem imunidade
 Perda de                               Recuperação
 imunidade           Infecção
                                        (ou morte)
As Premissas do
           Modelo
Os indivíduos suscetíveis ficam infectados ao entrar em
  contato com os indivíduos infecciosos.

Cada indivíduo infectado tem um número fixo, r, de
  contatos por dia que são suficientes para disseminar a
  doença.
   – O parâmetro r contem informação sobre o número de
     contatos e a probabilidade da infecção

Os indivíduos infectados se recuperam da doença a uma
  taxa a
   – 1/a é o tempo médio de recuperação
As Premissas do
       Modelo
O período de incubação da doença é
 suficientemente curto para ignorar

Todas as classes populacionais são bem
 misturadas

Os nascimentos, mortes, imigração, e a
 emigração podem ser ignorados
 devido a escala temporal
Dinâmica de Doenças Infecciosas
 - taxa de natalidade
d – taxa natural de mortalidade
a – taxa de mortalidade induzida pela doença
 - taxa de infecção
 - taxa de recuperação
w – taxa de espera
r - contatos por dia que são suficientes para
    disseminar a doença.
O modelo SIR pode ser usado para modelagem de
    epidemias e doenças endêmicas
Se baseia nas pesquisas sobre a teoria de
    epidemias por Kermack e McKendrick (1927)
As Equações do Modelo
          dS
              rSI      S(0)  S0
          dt

         dI
             rSI  I   I(0)  I0
         dt    
  
            dR           R(0)  0
                I
            dt 
A taxa da transmissão da doença é
 proporcional taxa de encontro de
              a
 indivíduos suscetíveis e infectados.
Importante!
     O tamanho populacional constante é
      incorporado ao modelo:
                                               Constante
          dS dI dR
                 0           SIRN
          dt dt dt
     A equação R é decomposta.
       – R não aparece  equação de S ou I.
                       na

Uso do Modelo
Definição: Uma epidemia ocorre se o
 número de indivíduos infecciosos é
 maior do que o número inicial I0 para
 algum tempo t

Pergunta epidemiológica: Cada r, S0 ,
  I0, e , quando ocorrerá a epidemia?

Pergunta matemática: I(t) > I0 para
  qualquer intervalo de tempo, t?
Os modelos padrão implicam
 que os surtos são bi-modais
              Quando R0 < 1 as epidemias
               nunca acontecem

              Quando R0 > 1, somente
               existem dois resultados
               possíveis:
                 – O surto não chega a ser uma
                   “epidemia” (pico a esquerdo)
                 – O surto vira uma epidemia,
                   infectando uma fração
                   significante da população
                   intera (pico a direto)
O tamanho da epidemia deve ser
                           previsível
                                                   Juntos, R0 e N
Fração da população infectada




                                                   (tamanho
                                                   populacional)
       no estágio final




                                                   determinam
                                                   completamente o
                                                   número esperado
                                                   de casos


                                Taxa reprodutiva
Também, as epidemias devem
       ter somente um “pico”
                        Uma vez que
                         decola uma
Número de casos novos




                         epidemia,
                         segue a “curva
                         logística”
                         clássica (novos
                         casos por dia)
Previsões do Modelo SIR

A ocorrência de uma epidemia depende
 somente do número de indivíduos
 suscetíveis, a taxa de transmissão, e a
 taxa de recuperação.
  – O número inicial de indivíduos infecciosos
    não determina se ocorrerá uma epidemia.
  – Assim, independentemente do número de
    indivíduos infecciosos, não ocorrerá uma
    epidemia a menos que S0 > /r.
Quando ocorrerá a epidemia?
Considere a equação I
                                 I 0 rS   
                             dI
  dI              em t = 0
      rSI  I              dt
  dt

Por isso, a população I aumentara
  inicialmente se S0   r   ea
  população I decai. Assim, essa
  condição é suficiente para a
  ocorrência da epidemia.
Quando ocorrerá a epidemia?

   Considere a equação S
     dS                 dS
         rSI              0,t        S  S0,t
     dt                 dt
Então se   S0   r   sabemos
                                 dI
                                     I rS     0, t
                                 dt
                            
   Assim, 
          se S0   r não ocorrerá uma
    epidemia.
   Mas, se, S0   r ocorrerá uma
    epidemia.
Insight do Modelo
Pergunta epidemiológica: se ocorre uma
  epidemia, a doença eventualmente
  sumirá ou persistirá na população.

Pergunta matemática: Quais são os
  estados estáveis.
  – Especificamente, I = 0 é um estado estável,
    mas é estável?
Estados Estáveis
       dS          Observe: I = 0 torna as três
           rSI    equações iguais a zero.
       dt

      dI            Assim I = 0 representa uma
          rSI  I  linha inteira (ou plano) dos
      dt
                   estados estáveis
                   A análise tradicional de
         dR
             I     estabilidade resulta num
         dt          eigenvalor de zero.
Plano de Fase -
          Graficamente
Nullclines
  – Nullclines de S: S = 0 e I = 0
      Movimento é para acima/ para abaixo
  – Nullclines de I: I = 0 e S =  /r
observe: S0 +I0 = N
  – Todas as trajetórias originam dessa linha
Insight do Modelo
Quantos indivíduos pegarão a doença
 antes de que some?




            Itotal  I0  S0  S   *
Insight do Modelo
Pergunta epidemiológica: Quando ocorre
  uma epidemia, qual grau tomará?

Pergunta matemática: Qual é o número
  máximo de indivíduos infecciosos?
Grau da Epidemia
                          S
         I  N  S  r ln
                          S0

 I chega ao máximo quando
          S =  /r
                              
       I max  N  r  r ln
                              S0
Gravidade da infecção
                        Grau da Epidemia
Número Reprodutivo Básico
        S0 r
 R0           é um parâmetro importante.
         
É conhecido como o número de contatos
  infecciosos ou número reprodutivo
  básico da infecção.
Número Reprodutivo Básico
Um indivíduo infeccioso ficará infecciosa,
 na média, por 1/a unidades de tempo.

O número de indivíduos suscetíveis
 infectados por um indivíduo infeccioso
 por unidade de tempo é rS.

Assim, o número de infecções produzidas
 por um indivíduo infeccioso é rS/ .
Número Reprodutivo Básico

                    S0 r
             R0 
                     
R0 é o número esperado (médio) de
  casos infecciosos novos numa
  população inteiramente suscetível
  produzido por um único caso durante o
  período infeccioso intero.
Se R0>1, ocorrerá uma epidemia.
Importância de R0
R0 possua quatro componentes:
  – A duração do período infeccioso;
  – Quantos contatos um indivíduo infeccioso
    realiza num período de tempo;
  – A probabilidade de transmissão;
  – E a probabilidade de que um indivíduo que se
    infecta já estava infectado.
R0 não é uma característica atual da doença)
  mas do vírus numa população específica
 num tempo e local específicos. Ao alterar
 alguns ou todos os componentes também
 altera R0.
Insight das Equações
     do Modelo
Pergunta epidemiológica: Qual será o
  estado final da população após a
  infecção se apaga?

Pergunta matemática: Quais são os
  estados estáveis de S e R?
Plano de Fase --
            Analiticamente
 Lembra que R foi decomposta


           dS              dI
               rSI           1   rS
           dt              dS
     dI
         rSI  I                 
                          I   S  ln S  C
     dt                            r

                                 
          I  S  ln S  I 0  S0  ln S0
                 r                 r
Estados Estáveis de S e R

                          N S*
                      
                            
            S  S0e
             *



             R NS
                 *           *



 = o número de indivíduos que não
S*
 pegaram a doença.
 
Estados Estáveis da
População Suscetível



   Aumento
   De R

             Aumento
             De So
Número Reprodutivo Básico
As estimativas de R0 de pandemias
 anteriores de influenza:
  – Se baseiam no comportamento das
    pandemias de influenza de 1918, 1957, e
    1968.

  – E para a próxima pandemia:
      A população mundial aumentou várias vezes
      Viajes rápidos e freqüentes são comuns
      A próxima cepa de pandemia não e conhecida
Número Reprodutivo Básico
 – Mas:
     Registros de surtos prévios podem não ser
     confiáveis
     Os casos assintomáticos provavelmente não
     foram registrados
     Não todos os casos sintomáticos foram
     confirmados no laboratório,
    Mas ainda se foram confirmados como influenza
     A, nenhum seqüenciamento foi disponível para
     confirmar o número de casos secundários
     verdadeiros do mesmo caso de índice – podem
     ter compadecido de outra infecção de vírus

      – Por isso, as estimativas de R0 de
        pandemias anteriores de influenza
        provavelmente não são precisas – mas de
        que grau?
Número Reprodutivo Básico
   “Os
melhores
  dados                                 Caso de
                                         índice
   que           tosse                 infectado
                                        chega a
 temos”                                  escola

                           Entra numa
  R0 =                      população
                         suscetível (uma
                         sala de aula de
                            crianças)
Número Reprodutivo Básico
                   Exposto, infectado, assintomático
   “Os
melhores
  dados
   que
 temos”
 R0=5?
 (Estimativa
   normal)


 R0=11
(Estimada por
    Deus)
                Exposto, infectado, sintomático
Número Reprodutivo Básico
                       Exposto, infectado,
                  assintomático, não registrado
   “Os            como o segundo caso (somente
melhores         testes de laboratório para casos
                          sintomáticos)
  dados
   que
 temos”
 R0=5?
                       Exposto, infectado,
 (Estimativa
   normal)          sintomático, mas do caso
                       de índice do ônibus

 R0=10
                    escolar da mesma manhã

(Estimada por
    Deus)
                Exposto, infectado,
                   sintomático
R0=20
                   (2003)




Número Reprodutivo Básico
R0=20?
                   (2003)

                      R0<21?
                      (2004)




Número Reprodutivo Básico
R0=20?
                   (2003)

                      R0<21?
                      (2004)

                            R0<2-3?
                            (2004)




Número Reprodutivo Básico
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility
of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.


“Uma fonte de dados é um surto da influenza
A/H1N1 em janeiro e fevereiro de 1978 numa escola
de internados (27). O registro desse surto
proporciona o número de crianças “confinado a cama”
em cada dia da epidemia. Se interpretamos
“confinado a cama” como medida da prevalência de
infectividade”
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility
of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.


“Uma fonte de dados é um surto da influenza A/H1N1
em janeiro e fevereiro de 1978 numa escola de
internados (27). O registro desse surto proporciona o
número de crianças “confinado a cama” em cada dia
da epidemia. Se interpretamos “confinado a cama”
como medida da prevalência de infectividade”


- O que quer dizer - infectado? Se temos a
premissa que confinado a cama é sintomático da
“doença” em vez de razões de “controle de
infecção”?
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility
of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.


“e se usamos os períodos latentes e infecciosos do tipo de
premissa em nosso estudo, então precisamos inferir um R muito
grande (do ordem de 20) desses dados, porque o crescimento do
número “confinado a cama” tem um tempo inicial de dobrar de
menos de que 1 dia (versus ~3 dias em nossos dados). Sob essas
premissas, precisa inferir que a transmissibilidade da influenza
A/H1N1 nessa escola de internados (o ano da re-introdução do
sub-tipo) foi muito maior do que as estimativas que
registramos.”


- Como julgar se um conjunto de premissas é melhor do que
outro? Do ponto de vista biológica ou matemática?
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility
of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.
“Suspeitamos, porém, que uma explicação melhor do
aumento rápido do número de crianças “confinado a
cama” é o timing de acertos, porque o confinamento a
cama não é equivalente a infectividade biológica.”
 O confinamento a cama (para razões sintomáticas) implica um
estado sintomático. Isso pode ser variável na severidade e grau
de tolerância para cada indivíduo, assim o tempo gasto movível
quando sintomático, é variável para cada pessoa.
- Também, para todo vírus respiratório, aparente ser
infeccioso durante o período sintomático, mas possivelmente,
também por 12 a 24 horas antes do começo dos sintomas
(Fraser et al. 2004; Wu et a. 2006?)
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility
of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.

“Ainda mais, o confinamento a leito pode reduzir ou
aumentar a probabilidade de transmissão de um
indivíduo, dependendo das condições e higiene.”
- Verdade! Se amigos vem visitar (especialmente
em escolas de internados), a infecção secundária
continuará, e os visitantes precisam usar o
banheiro (contato? Duração do contato necessário
para transmissão?). A maioria dos indivíduos
assintomáticos nunca ficam deitados e caminham,
conversam etc porque é chato ficar deitado na
cama.
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility
of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.


“Uma hipótese alternativa (não mutuamente exclusiva)
é que a transmissão foi mais intensa nessa escola do
que na população em geral”

 – Outro vírus respiratório, adenovírus é mais
agressivo nos alojamentos militares de alta
densidade do que na população em geral. O
ambiente de uma escola de internos provavelmente
é similar. Seria surpreendente se uma cepa nova
de pandemia de influenza se comporta de forma
similar, mas sem nenhuma idéia qual vírus será.
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility
of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.

“ou (ainda mais especulativo) que a cepa introduzida
por um único aluno voltando de Hong Kong era
especialmente transmissível.”
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility
of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.

“ou (ainda mais especulativo) que a cepa introduzida
por um único aluno voltando de Hong Kong era
especialmente transmissível.”

– Assim, todo é especulação! Não é nada mais do
que outra interpretação do mesmo surto. Por
suposto, os fatores do hospedeiro podem ter
papeis na determinação do indivíduo infectado
virando um ‘super-disseminador’, ou somente um
disseminador ‘bom’ ou ‘acima da média’. Mas, o que
quer dizir ‘especialmente transmissível’?’ R >20, ou
R >3?
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M.
Transmissibility of 1918 pandemic influenza.
Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6.
“Acreditamos que a estimativa de R~20 desses
dados não é provável devido a outra razão: 251
das 763 crianças não foram infectadas nesse
surto, o que é inconsistente com uma R maior de
~3 (com premissa de uma população bem
misturada)”
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918
pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6.
“Acreditamos que a estimativa de R~20 desses dados não
é provável devido a outra razão: 251 das 763 crianças não
foram infectadas nesse surto, o que é inconsistente com
uma R maior de ~3 (com premissa de uma população bem
misturada)”
  Isso começa com a premissa que R não é 20 e procura uma
explicação! Sempre é possível existir indivíduos suscetíveis não
infectados, ainda num surto grande, talvez devido a distancia
social/ acaso/ variabilidade de dispor concentração, ou respostas
imunes únicas do hospedeiro.
- Por exemplo no caso do médico de Cingapura, seu mulher grávida
e sogra, sob quarentena no mesmo quarto por 2.5 semanas
(Frankfurt Março 2003), o medico e sua esposa apresentaram
sorologias de SARS em secreções (sangue, NPA, urina, fezes),
mas a sogra nunca mostrou resultados sorológicos.
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of
1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.
“Acreditamos que a estimativa de R~20 desses dados não
é provável devido a outra razão: 251 das 763 crianças não
foram infectadas nesse surto, o que é inconsistente com
uma R maior de ~3 (com premissa de uma população bem
misturada)”
     Mas, como sabem que os meninos não foram
infectados? Nenhuma sintoma? Houve confirmação de
laboratório dos sub-tipos específicos a influenza A para
todos os casos ‘infectados’ e ‘não infectados’? Podem
não aparentar sintomas, mas com um controle imune
bom. Também, o diagnostico nesse período era menos
preciso de que hoje, que poderia resultar numa
estimativa inferior do número de casos secundários.
As expectativas da epidemiologia
molecular e nível de prova para
demonstrar casos secundários
‘verdadeiros’.
Porem, ainda pode ser difícil se
fosse similar as cepas
contemporâneas do vírus
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of
1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.




“Porém, dada a descrição limitada disponível, essas
hipóteses ficam especulativas.”

- Justo como as razões para extrair um menor valor de
R desse registro de surto!
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of
1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.

“Em resumo, acreditamos que essas estimativas maiores
resultam da combinação da ambigüidade nas quantidades
mensuradas (no caso do surto na escola de internados) e da
interpretação dos parâmetros nos trabalhos anteriores.”


     Mas, poderia ser o oposto? Todos temos a
tendência de ver ou acreditar o que queremos? Pode
ser uma conseqüência de matemáticos tentando
interpretar dados clínicos de um surto, sem a
experiência prática cotidiana que regem os problemas e
limitações inerentes da coleta e divulgação desses
dados.
Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of
1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec
16;432(7019):904-6.
Não podemos excluir a possibilidade de que o surto na
escola atualmente representa uma disseminação mais veloz
(e por isso, um valor maior de R) do que de outros estudos
que estudamos. “


-Não, por suposto não pode! Mas o valor de R menor é
geralmente aceito como real! Se há incerteza, por que
usar uma estimativa específica menor em vez de usar a
amplitude de valores de R, (Fraser et al. 2004)? Por
razões práticas, políticas e econômicas? Talvez, mas o
vírus não liga!
As populações aninhadas geram
 distribuições “chatas”de tamanhos
            de epidemias
Distribuições similares para valores diferentes
                      de R0
Número de casos novos




A mesma doença pode ter trajetórias diferentes
Resultados muito diferentes possíveis para o mesmo valor de R0
Resurgência pode ser causada por “eventos raros”
Número Reprodutivo Básico
Número Reprodutivo Básico




                            Proporção de infecções que ocorrem antes das
                                sintomas ou por infecção assintomática
      Estimativas dos parâmetros. Amplitudes plausíveis do R0 para quatro
      infecções de vírus. O tamanho do sombreamento indica as incertezas nas
      estimativas dos parâmetros. Dados re-analisados da fonte original: Fraser
      C, Riley S, Anderson RM, Ferguson NM. Factors that make an infectious
      disease outbreak controllable. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Apr
      20;101(16):6146-51.
Problema
Uma faculdade tem um fluxo diário de 8342
  funcionários. Um indivíduo que volta de
  férias fica doente e é diagnosticado com a
  febre de Jade – um variedade exótica,
  perigosa e altamente contagiosa da
  influenza.
Todos os indivíduos que pegam essa influenza
  precisam ser hospitalizados. O hospital de
  base tem 240 leitos. O parâmetro de
  transmissão para essa influenza nesse local
  é r = 5x10-5 por dia e a taxa de
  recuperação é  = .32 por dia.
Perguntas
A condição para desencadear uma
 epidemia foi satisfeita?

O hospital de base tem leitos
 suficientes?

Quantos funcionários pegarão a
 influenza?
Respostas
A condição para desencadear uma
 epidemia foi satisfeita?
  – S0 =8341,       I0 = 1,   R0 = 0

                                        S0 r
               0.32
             5  6,400        R0            1.3  1
  –          r 5e                         

  – Por isso, ocorrerá uma epidemia.
Respostas
O hospital tem leitos suficientes?


                                    
             I max  N  r  r ln         268
                                    S0

Por isso, se o hospital tem 245 leitos,
  precisa mais.
Respostas
 Quantos funcionários pegarão a influenza?


          Itotal  I0  S0  S   *


 S* = 4783, ou aproximadamente 3649
  pessoas (43% da população) pegarão a
  doença.

Curso Temporal da
Epidemia da febre de Jade
  Tempo da duração da infecção




                                              R




                                                      S



                                                  I

                                 Tempo dias
Por que as Epidemias
são tão imprevisíveis?
Resultado é imprevisível
As distribuições multi-modais de tamanho
 implicam qualquer surto da mesma
 doença pode ter resultados
 dramaticamente distintos
O reaparecimento implica que ainda para
 epidemias que aparente estão se
 apagando podem se regenerar ao invadir
 populações novas
As Epidemias Aparentem Ser
       “multi-modais”
Distribuição de tamanhos das epidemias de (A) sarampo
e (B) pertusa na Islândia, 1888-1990
As Epidemias Reais também
                             são “Resurgentes”
                        Casos Diários Globais para a Epidemia de
                        SARS em 2003: a epidemia tinha vários picos,
                        separados por incidências baixas
Número de casos novos




                                         Data do começo
O que torna imprevisíveis
      as epidemias?
Insight chave da literatura sobre redes
  sociais:
           populações exibem estrutura
Que tipo de estrutura?
  – A distribuição não homogênea da população
  – Redes de transporte e infra-estrutura
  – Redes sociais, organizacionais, e sexuais

O resultado é
  – A mistura uniforme ocorre somente em
    contextos pequenos e relativamente confinados
    (onde o modelo padrão se aplica)
  – As epidemias grandes não são eventos únicos:
    são resultados de várias epidemias pequenas
Um modelo aninhado
simples de população
Importância de Redes
As populações grandes exibem estruturas de redes
   – Social, sexual, infra-estrutura, transporte
As epidemias grandes precisam ser compreendidas
  como várias epidemias pequenas ligadas por redes
Incorporando uma estrutura “multi-escala” do mundo
  em modelos de epidemias pode explicar a multi-
  modalidade e a resurgencia das epidemias
Conhecimento de uma doença (R0) não ajuda prever o
  tamanho ou duração de uma epidemia
Razão é que os “eventos raros” (como uma pessoa num
  avião) podem ter conseqüências imensas
A estrutura populacional pode ser usada como medida
  de controle (como fechamento de escolas)
O tamanho da epidemia depende da
    freqüência e amplitude de viagens

O tamanho médio da epidemia
versus P0 (o número esperado   O tamanho médio da
de infecciosos “escapando” o   epidemia versus x
contexto local)                (“distancia típica viajada)
As epidemias reais, porém…
Diferem dramaticamente em tamanho
  –   1918-19 “Gripe Espanhola”
  –   1957-58 “Gripe Asiática”
  –   1968-69 “Gripe de Hong Kong”
  –   2003 SARS Epidemia
Todas essas doenças tem valores quase iguais
  de R0!
Quanto diferencia em tamanhos as epidemias
  de tamanho parecido têm?
Desafortunadamente, os dados históricos
  sobre epidemias grandes são difíceis
  coletar.. Por isso, as distribuições
  verdadeiras do tamanho são desconhecidas
Modificações do Modelo SIR

Outras considerações, como a dinâmica
 vital (nascimentos e mortes), duração
 da imunidade, o período de incubação
 da doença, e a mortalidade induzida
 pela doença podem ter influencias
 enormes sobre o desencadeamento da
 doença.
Conclusões
Somos humanos e as vezes vemos o que queremos ver.
Para dados ambíguos, é ainda mais fácil ver o que queremos ver.
O fato de que o mesmo registro de surto foi usado em dois
trabalhos diferentes por dois grupos diferentes de
pesquisadores, e foi interpretado para produzir valores muito
diferentes de R (1-3 versus >20) por cada grupo, o que sugere
que a interpretação ainda não fecho.

Os dados ambíguos são úteis ou errados? Qualquer surto novo
que aconteça terá os mesmos problemas, e provavelmente nenhum
apresentará uma prova definitiva (usando critérios científicos) de
uma ligação epidemiológica.

Uma R elevada seria difícil lidar em qualquer planejamento
prático e otimista de pandemias.

Por isso, talvez uma R baixa foi interpretada desse surto para
que todo o mundo fica feliz, e, também, talvez porque nós da um
sentido (falso) de segurança. Somente o Tempo nós dará
A performance anterior indica a performance
    futura de uma pandemia de influenza?
Provavelmente não, porque:
  – Muitos parâmetros mudaram, como a população mundial,
    aumento de densidade, maior freqüência e volume de
    transporte aéreo que fica ainda mais rápido, entre outros,

  – Outra pandemia de influenza não necessariamente provável
    baseado nos eventos das pandemias prévias, e por que
    deve ser?

  – Se ocorra outra pandemia pode não ser de um
    vírus H5, mas independente disso, não há razão
    que as estimativas de R do vírus das pandemias
    previas de influenza pandêmica deve ter qualquer
    significância sobre a R do vírus da nova
    pandemia de influenza
       Mas o vírus ainda será influenza A, tanto o ambiente
       como os sub-tipos de vírus serão diferentes dos das
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Epidemiologia Matemática e Modelo SIR

  • 1. Ecologia de Populações Prof. Dr. Harold Gordon Fowler popecologia@hotmail.com
  • 2. Doenças Infecciosas Doenças microscópicas – Causadas por vírus e bactéria – O agente de infecção reproduz dentro do hospedeiro e é transmitido de um hospedeiro a outro hospedeiro – Exemplo: Influenza Doenças macroscópicas – Causadas por lombrigas ou protozoas – Os agentes de infecção têm ciclos de vida complexos freqüentemente incluindo hospedeiros secundários ou vetores – Exemplo: Malaria
  • 4. O entendimento das epidemias grandes requer a modelagem da estrutura populacional global Presume que o modelo padrão se aplica aos “contextos locais” (escolas, hospitais, prédios de apartamentos, povoados, ...) Porém, esses contextos locais são embutidos numa serie de contextos sucessivamente maiores (vizinhanças, cidades, regiões, estados, países, continentes…) As populações globais são “aninhadas” Os indivíduos podem “escapar” o contexto local atual e se mudar a outro A facilidade de mudar dos contextos “distantes” versus “próximos” depende da tecnologia
  • 5. A Epidemiologia Matemática Começou com a análise da epidemia de varíola de 1760 de Daniel Bernoulli Se desenvolveu extensivamente desde 1920 (Kermack e McKendrick) Atualmente centenas de modelos lidam com variações de doenças humanas, animais e vegetais Diversidade inacreditável dos modelos, que podem ser muito complexos, mas a maioria são variantes do original
  • 6. Pergunta Perguntas epidemiológicas – Ocorrerá uma epidemia? – Se ocorre uma epidemia, Quanta severa será? A doença eventualmente sumirá ou persistir na população? Quantos indivíduos pegarão a doença durante o curso da infecção?
  • 7. Uma Pergunta Obvia Quando um surto de uma doença infecciosa é constatado (SARS, Influenza Aviaria, Influenza Suína, Ebola, e outras.), uma das perguntas mais importantes é: “Que tamanho alcançará”? Podemos também fazer uma uma pergunta análoga para as epidemias existentes (HIV, TB, Malaria) Porém, a epidemiologia matemática não tem meios de responder essas perguntas?
  • 8. Modelo dos Dados da Influenza Em 1978, uma epidemia de influenza ocorreu numa escola de internos na norte da Inglaterra. Houve 763 internos, incluindo um indivíduo inicialmente infeccioso. A escola mantinha registros do número de internos confinados a cama, e pressupúnhamos que esses eram infecciosos. Os dados para as duas semanas podem ser ajustados ao modelo SIR.
  • 9. Número de indivíduos infectados Tempo Dados de Influenza
  • 10. Variáveis População Suscetível (S) – Indivíduos capazes de pegar a doença População Infecciosa (I) – Indivíduos com a doença e podem transmite-a População Retirada (R) – Indivíduos que se recuperaram e já não estão suscetíveis – Indivíduos naturalmente imunes ou isolados
  • 11. Curva Epidêmica do Modelo SIR S R Tamanho da População I Tempo
  • 12. Curso Temporal da Epidemia de Influenza S Tempo da duração da infecção R I Tempo
  • 14. Epidemiologia Matemática O modelo mais simples tem 3 compartimentos para agrupar os indivíduos – S – suscetíveis – I – infeccionados – R – recuperados Forma um modelo de compartimentos S I R
  • 15. O Modelo Padrão (SIR) (1) Os indivíduos passam entre três estados: Susceptíveis, Infectados, e Recuperados (2) Mistura e uniformemente aleatória
  • 16. Analise por Compartimentos Muitos processos complexos podem ser decompostos em estágios distintos e depois o sistema inteiro modelado ao descrever a interação entre os vários estágios
  • 17. Modelo Esquemático Exposto Infecção Doente, em recuperação Ou adquire imunidade S I R Recuperada mas sem imunidade Perda de Recuperação imunidade Infecção (ou morte)
  • 18. As Premissas do Modelo Os indivíduos suscetíveis ficam infectados ao entrar em contato com os indivíduos infecciosos. Cada indivíduo infectado tem um número fixo, r, de contatos por dia que são suficientes para disseminar a doença. – O parâmetro r contem informação sobre o número de contatos e a probabilidade da infecção Os indivíduos infectados se recuperam da doença a uma taxa a – 1/a é o tempo médio de recuperação
  • 19. As Premissas do Modelo O período de incubação da doença é suficientemente curto para ignorar Todas as classes populacionais são bem misturadas Os nascimentos, mortes, imigração, e a emigração podem ser ignorados devido a escala temporal
  • 20. Dinâmica de Doenças Infecciosas  - taxa de natalidade d – taxa natural de mortalidade a – taxa de mortalidade induzida pela doença  - taxa de infecção  - taxa de recuperação w – taxa de espera r - contatos por dia que são suficientes para disseminar a doença. O modelo SIR pode ser usado para modelagem de epidemias e doenças endêmicas Se baseia nas pesquisas sobre a teoria de epidemias por Kermack e McKendrick (1927)
  • 21. As Equações do Modelo dS  rSI S(0)  S0 dt dI  rSI  I I(0)  I0 dt   dR R(0)  0  I dt  A taxa da transmissão da doença é proporcional taxa de encontro de a indivíduos suscetíveis e infectados.
  • 22. Importante! O tamanho populacional constante é incorporado ao modelo: Constante dS dI dR   0 SIRN dt dt dt A equação R é decomposta. – R não aparece  equação de S ou I. na 
  • 23. Uso do Modelo Definição: Uma epidemia ocorre se o número de indivíduos infecciosos é maior do que o número inicial I0 para algum tempo t Pergunta epidemiológica: Cada r, S0 , I0, e , quando ocorrerá a epidemia? Pergunta matemática: I(t) > I0 para qualquer intervalo de tempo, t?
  • 24. Os modelos padrão implicam que os surtos são bi-modais Quando R0 < 1 as epidemias nunca acontecem Quando R0 > 1, somente existem dois resultados possíveis: – O surto não chega a ser uma “epidemia” (pico a esquerdo) – O surto vira uma epidemia, infectando uma fração significante da população intera (pico a direto)
  • 25. O tamanho da epidemia deve ser previsível Juntos, R0 e N Fração da população infectada (tamanho populacional) no estágio final determinam completamente o número esperado de casos Taxa reprodutiva
  • 26. Também, as epidemias devem ter somente um “pico” Uma vez que decola uma Número de casos novos epidemia, segue a “curva logística” clássica (novos casos por dia)
  • 27. Previsões do Modelo SIR A ocorrência de uma epidemia depende somente do número de indivíduos suscetíveis, a taxa de transmissão, e a taxa de recuperação. – O número inicial de indivíduos infecciosos não determina se ocorrerá uma epidemia. – Assim, independentemente do número de indivíduos infecciosos, não ocorrerá uma epidemia a menos que S0 > /r.
  • 28. Quando ocorrerá a epidemia? Considere a equação I  I 0 rS    dI dI em t = 0  rSI  I dt dt Por isso, a população I aumentara inicialmente se S0   r ea população I decai. Assim, essa condição é suficiente para a ocorrência da epidemia.
  • 29. Quando ocorrerá a epidemia? Considere a equação S dS dS  rSI  0,t S  S0,t dt dt Então se S0   r sabemos dI  I rS     0, t dt  Assim,  se S0   r não ocorrerá uma epidemia. Mas, se, S0   r ocorrerá uma epidemia.
  • 30. Insight do Modelo Pergunta epidemiológica: se ocorre uma epidemia, a doença eventualmente sumirá ou persistirá na população. Pergunta matemática: Quais são os estados estáveis. – Especificamente, I = 0 é um estado estável, mas é estável?
  • 31. Estados Estáveis dS Observe: I = 0 torna as três  rSI equações iguais a zero. dt dI Assim I = 0 representa uma  rSI  I linha inteira (ou plano) dos dt  estados estáveis A análise tradicional de dR  I estabilidade resulta num dt eigenvalor de zero.
  • 32. Plano de Fase - Graficamente Nullclines – Nullclines de S: S = 0 e I = 0 Movimento é para acima/ para abaixo – Nullclines de I: I = 0 e S =  /r observe: S0 +I0 = N – Todas as trajetórias originam dessa linha
  • 33. Insight do Modelo Quantos indivíduos pegarão a doença antes de que some? Itotal  I0  S0  S *
  • 34. Insight do Modelo Pergunta epidemiológica: Quando ocorre uma epidemia, qual grau tomará? Pergunta matemática: Qual é o número máximo de indivíduos infecciosos?
  • 35. Grau da Epidemia S I  N  S  r ln S0 I chega ao máximo quando S =  /r  I max  N  r  r ln S0
  • 36. Gravidade da infecção Grau da Epidemia
  • 37. Número Reprodutivo Básico S0 r R0  é um parâmetro importante.  É conhecido como o número de contatos infecciosos ou número reprodutivo básico da infecção.
  • 38. Número Reprodutivo Básico Um indivíduo infeccioso ficará infecciosa, na média, por 1/a unidades de tempo. O número de indivíduos suscetíveis infectados por um indivíduo infeccioso por unidade de tempo é rS. Assim, o número de infecções produzidas por um indivíduo infeccioso é rS/ .
  • 39. Número Reprodutivo Básico S0 r R0   R0 é o número esperado (médio) de casos infecciosos novos numa população inteiramente suscetível produzido por um único caso durante o período infeccioso intero. Se R0>1, ocorrerá uma epidemia.
  • 40. Importância de R0 R0 possua quatro componentes: – A duração do período infeccioso; – Quantos contatos um indivíduo infeccioso realiza num período de tempo; – A probabilidade de transmissão; – E a probabilidade de que um indivíduo que se infecta já estava infectado. R0 não é uma característica atual da doença) mas do vírus numa população específica num tempo e local específicos. Ao alterar alguns ou todos os componentes também altera R0.
  • 41. Insight das Equações do Modelo Pergunta epidemiológica: Qual será o estado final da população após a infecção se apaga? Pergunta matemática: Quais são os estados estáveis de S e R?
  • 42. Plano de Fase -- Analiticamente Lembra que R foi decomposta dS dI  rSI  1   rS dt dS dI  rSI  I  I   S  ln S  C dt r    I  S  ln S  I 0  S0  ln S0 r r
  • 43. Estados Estáveis de S e R N S*   S  S0e * R NS * * = o número de indivíduos que não S* pegaram a doença. 
  • 44. Estados Estáveis da População Suscetível Aumento De R Aumento De So
  • 45. Número Reprodutivo Básico As estimativas de R0 de pandemias anteriores de influenza: – Se baseiam no comportamento das pandemias de influenza de 1918, 1957, e 1968. – E para a próxima pandemia: A população mundial aumentou várias vezes Viajes rápidos e freqüentes são comuns A próxima cepa de pandemia não e conhecida
  • 46. Número Reprodutivo Básico – Mas: Registros de surtos prévios podem não ser confiáveis Os casos assintomáticos provavelmente não foram registrados Não todos os casos sintomáticos foram confirmados no laboratório, Mas ainda se foram confirmados como influenza A, nenhum seqüenciamento foi disponível para confirmar o número de casos secundários verdadeiros do mesmo caso de índice – podem ter compadecido de outra infecção de vírus – Por isso, as estimativas de R0 de pandemias anteriores de influenza provavelmente não são precisas – mas de que grau?
  • 47. Número Reprodutivo Básico “Os melhores dados Caso de índice que tosse infectado chega a temos” escola Entra numa R0 = população suscetível (uma sala de aula de crianças)
  • 48. Número Reprodutivo Básico Exposto, infectado, assintomático “Os melhores dados que temos” R0=5? (Estimativa normal) R0=11 (Estimada por Deus) Exposto, infectado, sintomático
  • 49. Número Reprodutivo Básico Exposto, infectado, assintomático, não registrado “Os como o segundo caso (somente melhores testes de laboratório para casos sintomáticos) dados que temos” R0=5? Exposto, infectado, (Estimativa normal) sintomático, mas do caso de índice do ônibus R0=10 escolar da mesma manhã (Estimada por Deus) Exposto, infectado, sintomático
  • 50. R0=20 (2003) Número Reprodutivo Básico
  • 51. R0=20? (2003) R0<21? (2004) Número Reprodutivo Básico
  • 52. R0=20? (2003) R0<21? (2004) R0<2-3? (2004) Número Reprodutivo Básico
  • 53. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Uma fonte de dados é um surto da influenza A/H1N1 em janeiro e fevereiro de 1978 numa escola de internados (27). O registro desse surto proporciona o número de crianças “confinado a cama” em cada dia da epidemia. Se interpretamos “confinado a cama” como medida da prevalência de infectividade”
  • 54.
  • 55. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Uma fonte de dados é um surto da influenza A/H1N1 em janeiro e fevereiro de 1978 numa escola de internados (27). O registro desse surto proporciona o número de crianças “confinado a cama” em cada dia da epidemia. Se interpretamos “confinado a cama” como medida da prevalência de infectividade” - O que quer dizer - infectado? Se temos a premissa que confinado a cama é sintomático da “doença” em vez de razões de “controle de infecção”?
  • 56. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “e se usamos os períodos latentes e infecciosos do tipo de premissa em nosso estudo, então precisamos inferir um R muito grande (do ordem de 20) desses dados, porque o crescimento do número “confinado a cama” tem um tempo inicial de dobrar de menos de que 1 dia (versus ~3 dias em nossos dados). Sob essas premissas, precisa inferir que a transmissibilidade da influenza A/H1N1 nessa escola de internados (o ano da re-introdução do sub-tipo) foi muito maior do que as estimativas que registramos.” - Como julgar se um conjunto de premissas é melhor do que outro? Do ponto de vista biológica ou matemática?
  • 57. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Suspeitamos, porém, que uma explicação melhor do aumento rápido do número de crianças “confinado a cama” é o timing de acertos, porque o confinamento a cama não é equivalente a infectividade biológica.” O confinamento a cama (para razões sintomáticas) implica um estado sintomático. Isso pode ser variável na severidade e grau de tolerância para cada indivíduo, assim o tempo gasto movível quando sintomático, é variável para cada pessoa. - Também, para todo vírus respiratório, aparente ser infeccioso durante o período sintomático, mas possivelmente, também por 12 a 24 horas antes do começo dos sintomas (Fraser et al. 2004; Wu et a. 2006?)
  • 58. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Ainda mais, o confinamento a leito pode reduzir ou aumentar a probabilidade de transmissão de um indivíduo, dependendo das condições e higiene.” - Verdade! Se amigos vem visitar (especialmente em escolas de internados), a infecção secundária continuará, e os visitantes precisam usar o banheiro (contato? Duração do contato necessário para transmissão?). A maioria dos indivíduos assintomáticos nunca ficam deitados e caminham, conversam etc porque é chato ficar deitado na cama.
  • 59. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Uma hipótese alternativa (não mutuamente exclusiva) é que a transmissão foi mais intensa nessa escola do que na população em geral” – Outro vírus respiratório, adenovírus é mais agressivo nos alojamentos militares de alta densidade do que na população em geral. O ambiente de uma escola de internos provavelmente é similar. Seria surpreendente se uma cepa nova de pandemia de influenza se comporta de forma similar, mas sem nenhuma idéia qual vírus será.
  • 60.
  • 61. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “ou (ainda mais especulativo) que a cepa introduzida por um único aluno voltando de Hong Kong era especialmente transmissível.”
  • 62.
  • 63. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “ou (ainda mais especulativo) que a cepa introduzida por um único aluno voltando de Hong Kong era especialmente transmissível.” – Assim, todo é especulação! Não é nada mais do que outra interpretação do mesmo surto. Por suposto, os fatores do hospedeiro podem ter papeis na determinação do indivíduo infectado virando um ‘super-disseminador’, ou somente um disseminador ‘bom’ ou ‘acima da média’. Mas, o que quer dizir ‘especialmente transmissível’?’ R >20, ou R >3?
  • 64. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Acreditamos que a estimativa de R~20 desses dados não é provável devido a outra razão: 251 das 763 crianças não foram infectadas nesse surto, o que é inconsistente com uma R maior de ~3 (com premissa de uma população bem misturada)”
  • 65.
  • 66. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Acreditamos que a estimativa de R~20 desses dados não é provável devido a outra razão: 251 das 763 crianças não foram infectadas nesse surto, o que é inconsistente com uma R maior de ~3 (com premissa de uma população bem misturada)” Isso começa com a premissa que R não é 20 e procura uma explicação! Sempre é possível existir indivíduos suscetíveis não infectados, ainda num surto grande, talvez devido a distancia social/ acaso/ variabilidade de dispor concentração, ou respostas imunes únicas do hospedeiro. - Por exemplo no caso do médico de Cingapura, seu mulher grávida e sogra, sob quarentena no mesmo quarto por 2.5 semanas (Frankfurt Março 2003), o medico e sua esposa apresentaram sorologias de SARS em secreções (sangue, NPA, urina, fezes), mas a sogra nunca mostrou resultados sorológicos.
  • 67. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Acreditamos que a estimativa de R~20 desses dados não é provável devido a outra razão: 251 das 763 crianças não foram infectadas nesse surto, o que é inconsistente com uma R maior de ~3 (com premissa de uma população bem misturada)” Mas, como sabem que os meninos não foram infectados? Nenhuma sintoma? Houve confirmação de laboratório dos sub-tipos específicos a influenza A para todos os casos ‘infectados’ e ‘não infectados’? Podem não aparentar sintomas, mas com um controle imune bom. Também, o diagnostico nesse período era menos preciso de que hoje, que poderia resultar numa estimativa inferior do número de casos secundários.
  • 68.
  • 69. As expectativas da epidemiologia molecular e nível de prova para demonstrar casos secundários ‘verdadeiros’. Porem, ainda pode ser difícil se fosse similar as cepas contemporâneas do vírus
  • 70.
  • 71. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Porém, dada a descrição limitada disponível, essas hipóteses ficam especulativas.” - Justo como as razões para extrair um menor valor de R desse registro de surto!
  • 72. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. “Em resumo, acreditamos que essas estimativas maiores resultam da combinação da ambigüidade nas quantidades mensuradas (no caso do surto na escola de internados) e da interpretação dos parâmetros nos trabalhos anteriores.” Mas, poderia ser o oposto? Todos temos a tendência de ver ou acreditar o que queremos? Pode ser uma conseqüência de matemáticos tentando interpretar dados clínicos de um surto, sem a experiência prática cotidiana que regem os problemas e limitações inerentes da coleta e divulgação desses dados.
  • 73. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M. Transmissibility of 1918 pandemic influenza. Nature. 2004 Dec 16;432(7019):904-6. Não podemos excluir a possibilidade de que o surto na escola atualmente representa uma disseminação mais veloz (e por isso, um valor maior de R) do que de outros estudos que estudamos. “ -Não, por suposto não pode! Mas o valor de R menor é geralmente aceito como real! Se há incerteza, por que usar uma estimativa específica menor em vez de usar a amplitude de valores de R, (Fraser et al. 2004)? Por razões práticas, políticas e econômicas? Talvez, mas o vírus não liga!
  • 74. As populações aninhadas geram distribuições “chatas”de tamanhos de epidemias Distribuições similares para valores diferentes de R0
  • 75. Número de casos novos A mesma doença pode ter trajetórias diferentes Resultados muito diferentes possíveis para o mesmo valor de R0 Resurgência pode ser causada por “eventos raros”
  • 76. Número Reprodutivo Básico Número Reprodutivo Básico Proporção de infecções que ocorrem antes das sintomas ou por infecção assintomática Estimativas dos parâmetros. Amplitudes plausíveis do R0 para quatro infecções de vírus. O tamanho do sombreamento indica as incertezas nas estimativas dos parâmetros. Dados re-analisados da fonte original: Fraser C, Riley S, Anderson RM, Ferguson NM. Factors that make an infectious disease outbreak controllable. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Apr 20;101(16):6146-51.
  • 77. Problema Uma faculdade tem um fluxo diário de 8342 funcionários. Um indivíduo que volta de férias fica doente e é diagnosticado com a febre de Jade – um variedade exótica, perigosa e altamente contagiosa da influenza. Todos os indivíduos que pegam essa influenza precisam ser hospitalizados. O hospital de base tem 240 leitos. O parâmetro de transmissão para essa influenza nesse local é r = 5x10-5 por dia e a taxa de recuperação é  = .32 por dia.
  • 78. Perguntas A condição para desencadear uma epidemia foi satisfeita? O hospital de base tem leitos suficientes? Quantos funcionários pegarão a influenza?
  • 79. Respostas A condição para desencadear uma epidemia foi satisfeita? – S0 =8341, I0 = 1, R0 = 0  S0 r 0.32    5  6,400 R0   1.3  1 – r 5e  – Por isso, ocorrerá uma epidemia.
  • 80. Respostas O hospital tem leitos suficientes?  I max  N  r  r ln  268 S0 Por isso, se o hospital tem 245 leitos, precisa mais.
  • 81. Respostas Quantos funcionários pegarão a influenza? Itotal  I0  S0  S * S* = 4783, ou aproximadamente 3649 pessoas (43% da população) pegarão a doença. 
  • 82. Curso Temporal da Epidemia da febre de Jade Tempo da duração da infecção R S I Tempo dias
  • 83. Por que as Epidemias são tão imprevisíveis?
  • 84. Resultado é imprevisível As distribuições multi-modais de tamanho implicam qualquer surto da mesma doença pode ter resultados dramaticamente distintos O reaparecimento implica que ainda para epidemias que aparente estão se apagando podem se regenerar ao invadir populações novas
  • 85. As Epidemias Aparentem Ser “multi-modais” Distribuição de tamanhos das epidemias de (A) sarampo e (B) pertusa na Islândia, 1888-1990
  • 86. As Epidemias Reais também são “Resurgentes” Casos Diários Globais para a Epidemia de SARS em 2003: a epidemia tinha vários picos, separados por incidências baixas Número de casos novos Data do começo
  • 87. O que torna imprevisíveis as epidemias? Insight chave da literatura sobre redes sociais: populações exibem estrutura Que tipo de estrutura? – A distribuição não homogênea da população – Redes de transporte e infra-estrutura – Redes sociais, organizacionais, e sexuais O resultado é – A mistura uniforme ocorre somente em contextos pequenos e relativamente confinados (onde o modelo padrão se aplica) – As epidemias grandes não são eventos únicos: são resultados de várias epidemias pequenas
  • 88. Um modelo aninhado simples de população
  • 89. Importância de Redes As populações grandes exibem estruturas de redes – Social, sexual, infra-estrutura, transporte As epidemias grandes precisam ser compreendidas como várias epidemias pequenas ligadas por redes Incorporando uma estrutura “multi-escala” do mundo em modelos de epidemias pode explicar a multi- modalidade e a resurgencia das epidemias Conhecimento de uma doença (R0) não ajuda prever o tamanho ou duração de uma epidemia Razão é que os “eventos raros” (como uma pessoa num avião) podem ter conseqüências imensas A estrutura populacional pode ser usada como medida de controle (como fechamento de escolas)
  • 90. O tamanho da epidemia depende da freqüência e amplitude de viagens O tamanho médio da epidemia versus P0 (o número esperado O tamanho médio da de infecciosos “escapando” o epidemia versus x contexto local) (“distancia típica viajada)
  • 91. As epidemias reais, porém… Diferem dramaticamente em tamanho – 1918-19 “Gripe Espanhola” – 1957-58 “Gripe Asiática” – 1968-69 “Gripe de Hong Kong” – 2003 SARS Epidemia Todas essas doenças tem valores quase iguais de R0! Quanto diferencia em tamanhos as epidemias de tamanho parecido têm? Desafortunadamente, os dados históricos sobre epidemias grandes são difíceis coletar.. Por isso, as distribuições verdadeiras do tamanho são desconhecidas
  • 92. Modificações do Modelo SIR Outras considerações, como a dinâmica vital (nascimentos e mortes), duração da imunidade, o período de incubação da doença, e a mortalidade induzida pela doença podem ter influencias enormes sobre o desencadeamento da doença.
  • 93. Conclusões Somos humanos e as vezes vemos o que queremos ver. Para dados ambíguos, é ainda mais fácil ver o que queremos ver. O fato de que o mesmo registro de surto foi usado em dois trabalhos diferentes por dois grupos diferentes de pesquisadores, e foi interpretado para produzir valores muito diferentes de R (1-3 versus >20) por cada grupo, o que sugere que a interpretação ainda não fecho. Os dados ambíguos são úteis ou errados? Qualquer surto novo que aconteça terá os mesmos problemas, e provavelmente nenhum apresentará uma prova definitiva (usando critérios científicos) de uma ligação epidemiológica. Uma R elevada seria difícil lidar em qualquer planejamento prático e otimista de pandemias. Por isso, talvez uma R baixa foi interpretada desse surto para que todo o mundo fica feliz, e, também, talvez porque nós da um sentido (falso) de segurança. Somente o Tempo nós dará
  • 94. A performance anterior indica a performance futura de uma pandemia de influenza? Provavelmente não, porque: – Muitos parâmetros mudaram, como a população mundial, aumento de densidade, maior freqüência e volume de transporte aéreo que fica ainda mais rápido, entre outros, – Outra pandemia de influenza não necessariamente provável baseado nos eventos das pandemias prévias, e por que deve ser? – Se ocorra outra pandemia pode não ser de um vírus H5, mas independente disso, não há razão que as estimativas de R do vírus das pandemias previas de influenza pandêmica deve ter qualquer significância sobre a R do vírus da nova pandemia de influenza Mas o vírus ainda será influenza A, tanto o ambiente como os sub-tipos de vírus serão diferentes dos das pandemias previas