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CONCEPTOS BÁSICOS DE AMINOÁCIDOS Y PROTEÍNAS GLORIA BORDA GUERRA HUGO ROJAS  S DRS.  EN CIECIAS QUIMICAS
Aminoácidos
aNH3+ R R Carbon a Carboxilo L-Alanina D-Alanina
20 aminoácidos son los constituyentes de las proteínas. -amino y -carboxilo Son óptimamente activos, excepto la glicina Los a.a que conforman las proteinas, son L- a.a.  aminoácidos
Centro quiral o asimétrico
Quiral No Quiral
Imágenes que no se superponen
CLASIFICACION SEGUN SU RADICAL

Guanidinio (Arg) Indol (Trp) Imidazol (His) Grupos reactivos de algunos aminoácidos
Clasificación de Aminoácidos ,[object Object]
No esenciales:a.a que el organismo puede sintetizarPara la especie humana son esenciales los aminoácidos: treonina, metionina, lisina, valina, triptófano, leucina, isoleucina y fenilalanina, arginina e histidina que se concidera esencial durante el crecimiento, pero no para el adulto.
Clasificación de Aminoácidos
Ionización de aminoácidos
A que equivale el pK? Cuantos valores de pK tienen los aminoácidos?
Punto isoeléctrico pH en el cual la carga neta (suma de las cargas de los grupos ionizables) del aminoácido es 0
Punto isoeléctrico Histidina
Péptidos y Proteínas
Péptidos Se conocen como péptidos a los compuestos que se originan de la unión de a.a mediante enlaces peptídicos.  El enlace peptídico es un enlace covalente y coplanar que se establece entre el grupo carboxilo (-COOH) de un aminoácido y el grupo amino (-NH2) del amino-ácido contiguo inmediato, con desprendimiento de una molécula de agua.
Enlaces Peptídicos
Disposición espacial del péptido El carácter parcial de doble enlace del enlace peptídico (-C-N-) determina la disposición espacial de éste en un mismo plano, con distancias y ángulos fijos.  Presenta cierta rigidez e inmovilización en el plano de los átomos que lo forman.
Disposición espacial del péptido
Figure 3-3a  Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Clasificación  de péptidos Oligopéptido    < 10 aaPolipéptido 			10-100 aaProteína    			> 100 aa
Dipéptido
Cada polipéptido se escribe de izquierda a derecha, empezando por el extremo N-terminal que posee un grupo amino libre y finalizando por el extremo C-terminal en el que se encuentra un grupo carboxilo libre.
PROTEÍNAS Son polímeros formados por  monómeros llamados   aminoácidos. Hay  20 aminoácidos en la naturaleza, que se combinan para formar 	miles de proteínas. Son sustancias de elevado peso molecular. Se encuentran formando parte de todas las células animales y vegetales.
Cada proteína tiene una estructura funcional lógica y propia.  Características comunes a las demás proteínas. Son las macromoléculas más versátiles de los seres vivos.
Clasificación de las proteínas Según su conformación Según su composición química Según su función
[object Object]
Las histonas que forman parte de los cromosomas
El colágeno, del tejido conjuntivo fibroso.
La elastina, del tejido conjuntivo elástico.
La queratina de la epidermis. Son las más numerosas y especializadas. Actúan como biocatalizadores de las reacciones químicas. ,[object Object]
Calcitonina
Inmunoglobulina
Trombina y fibrinógeno
Citocromos
Ovoalbúmina, de la clara de huevo
Lactoalbúmina, de la lecheEstructural Enzimática Hormonal Defensiva Transporte Reserva Funciones de proteínas
Según su composición química Simples u homoproteínas   Hidrólisis genera solamente aminoácidos. Insulina, colágeno (globulares y fibrosas) Conjugadas o heteroproteínas Hidrólisis genera aminoácidos y otras moléculas no protéicas, (grupos prostéticos)
  Conjugadas holoproteína =  Apoproteína + grupo  prostético Apoproteína: parte proteica Glico-, lipo-, nucleo, metalo y fosfo     proteínas
Conjugadas o Heteroproteínas
Según su conformación Fibrosas Globulares
Fibrosas Estructurales y de sostén Cadenas polipeptídicas ordenadas paralelas a lo largo de un eje Insolubles en agua Colágeno, queratina, elastina
[object Object],Se encuentra en tejidos conjuntivos o   conectivos y cartilaginosos. Tienen alto contenido de glicina, hidroxiprolina e hidroxilisina.   No contiene a.a azufrados, ni triptofano ,[object Object],tejido epitelial:epidermis: cabello, uñas, plumas.   Tienen a.a con alto contenido de azufre y a.a. básicos como lisina, histidina y arginina. ,[object Object],En tendones y vasos sanguíneos (tejidos elásticos)   El 90% estan formadas por 5 a.a isoleucina, lisina, valina, prolina y glicina
Globulares Funcionales Cadenas plegadas, adoptan formas esféricas o globulares Solubles en agua (residuos hidrófobos en su interior) Responsables del trabajo químico de la célula: síntesis, transporte, metabolismo
Enzimática Hormonal Reconocimiento de señales Transporte Defensa Reserva Transducción de señales
Estructura de las Proteínas Estructura Primaria Determinada por el orden de colocación de los a.a de la cadena peptídica. Secuencia de a.a, clase, número de a.a Aminoácidos que componen la cadena polipeptídica La función de una proteína depende de su secuencia y de la forma que ésta adopte. Cada proteína tiene una única secuencia.
Estructura Secundaria Alordenamiento o disposición  de aminoácidos a lo largo de un eje en el espacio. Presenta enlaces Puente de Hidrógeno: Carbono carbonilo de un a.a y el nitrógeno amídico de otro a.a  ,[object Object]
Beta planar hoja ß plegada,[object Object]
alfa-hélice Se forma al enrollarse helicoidalmente sobre sí misma la estructura primaria. hélice o estructura geométrica en espiral En la que cada vuelta está constituida por 3,6 aminoácidos Dentro de este grupo se pueden mencionar proteínas como el colágeno, la queratina, elastína
Beta planar o hoja ß plegada En esta disposición se forma una cadena en forma de zig-zag llamada disposición en lámina plegada. Forma aplanada y extendida le da flexibilidad más no elasticidad Consta de varias cadenas peptídicas que permanecen enfrentadas y se mantienen juntas con enlaces de hidrógeno en un arreglo a manera de zig-zag.
hoja ß plegada paralela
hoja ß plegada antiparalela
Estructura Terciaria La disposición o conformación que toma la cadena peptídica producto de los dobleces condicionados por la interacción de las cadenas de los a.a ( radicales R de los a.a). Conformación globular y tridimensional.  La conf. globular facilita la solubilidad en agua y así realizar funciones de transporte, enzimáticas, hormonales, etc.  Se mantiene estable por los enlaces entre los radicales R de los a.a. .
Aparecen varios tipos de enlaces: Puentes de disulfuro:  dos residuos de cisteína (unión covalente)  puentes de hidrógeno:grupos hidroxilos alcohólicos y fenólicos o de los radicales R de a.a hidroxilos alcohólicos y grupos carboxilos Enlace iónico o salino:  grupo amino y carboxilo del R de los a.a Interacciones hifrófobas: Radicales apolares de los a.a
Los grupos apolares se reúnen en forma compacta logrando una conformación de mayor estabilididad y de menor energía Tiene muy pocos espacios libres en su interior Sobre la superficie de las proteínas abundan los grupos polares   Describe la conformación definitiva y específica de la proteína.
Glutámico Valina Lisina Valina Alanina Figure 3-4  Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Puentes de H2
Estructura Cuaternaria Se establece por la unión, mediante enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas peptídicas con estructura terciaria, para formar un complejo proteico. Cada una de estas cadenas peptídicas recibe el nombre deprotómero. La unidad formada por varios protómeros se denominaoligómero Solamente la unidad es activa biológicamente
El número de protómeros varía: dos: hexoquinasa cuatro: hemoglobina cuatro: Aldolasa  seis: Glutamato deshidrogenas   60 unidades proteicas como la cápsula del virus de la poliomielitis
Desnaturalización Modificación de la conformación o nativa de una proteína por acción de agentes externos Pérdida de la estructura secundaria, terciaria y cuaternaria por ruptura de enlaces que forman dichas estructuras.  El nivel primario no se afecta por ser un enlace covalente
La desnaturalización lleva a: perdida de la estructura perdida de la actividad biológica modificación de las propiedades físicas y químicas
Agentes Desnaturalizantes: ,[object Object],                 radiaciones                   ultravioleta 				rayos x y    			Ultrasonido 				Agitación enérgica ,[object Object],				urea guanidina   			detergentes 				sales de metales pesados
Biosíntesis de Aminoácidos y Proteínas La mayoría de los aminoácidos que ingerimos se encuentran en forma de proteínas, sin embargo sólo los aminoácidos pueden incorporarse a las diferentes rutas metabólicas.  Las proteínas y péptidos ingeridos sufren un proceso de hidrolización por medio de enzimas proteolíticas (secretadas por el estómago, páncreas e intestino delgado) en el tracto gastrointestinal.
   Después de la acción de las enzimas los aminoácidos quedan libres, proceso de digestión de las proteínas. Son absorbidos por las paredes del intestino, conducidos  y transportados a la corriente sanguínea,  llegan al hígado (sistema porta-hepático) donde ocurre su metabolismo y distribución a las células para su posterior utilización.
Biosíntesis de Aminoácidos y Proteínas
Consideraciones en la dieta La carencia de proteínas causa una serie de problemas que incluyen: ,[object Object]
  Alteraciones intelectuales en niños
  Problemas de desarrollo en fetos
  Sistema inmunológico deficiente Se recomienda dietas bajas en proteínas a personas con: ,[object Object]
  Enfermedad de Parkinson
 Enfermedades en las que el cuerpo no puede   metabolizar las proteínas o sus componente,[object Object]
Disminución en la Energía de activación
Figure 3-46  Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Estado de transicion Estado de transicion Energía de  Activación Energía de  Activación Energia Sustrato Producto G - G + Producto Sustrato Reacción exergonica Reacción endergonica Energia Progreso de la reacción Progreso de la reacción G<0: reacción favorable      G>0: reacción no favorable
Figure 3-50a  Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Sitio activo  Figure 3-50b  Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Efecto del pH sobre la actividad enzimática pH extremos: desnaturalización o inactivación de la enzima
Efecto de la temperatura sobre la actividad enzimática Aumento de Temperatura induce aumento de Vm T>45°C: desnaturalización
Constante de Michaelis-Menten Vo depende de la concentración de sustrato ([S]) [E] es constante
Vm (velocidad máxima): velocidad en la cual los sitios activos están saturados. Velocidad ya no depende de [S] Km (constante de michaelis): concentración de sustrato a la cual la reacción se efectúa a la mitad de su velocidad máxima A menor Km, mayor afinidad de la enzima por el sustrato
Pendiente Intercepto
Inhibidores ,[object Object]
Actúan:	- Evitando formación del complejo ES   - Bloqueando la reacción de formación de    producto

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  • 3.
  • 4. aNH3+ R R Carbon a Carboxilo L-Alanina D-Alanina
  • 5. 20 aminoácidos son los constituyentes de las proteínas. -amino y -carboxilo Son óptimamente activos, excepto la glicina Los a.a que conforman las proteinas, son L- a.a. aminoácidos
  • 6.
  • 7. Centro quiral o asimétrico
  • 9. Imágenes que no se superponen
  • 10.
  • 11.
  • 13.
  • 14.
  • 15.
  • 16.
  • 17.
  • 18.
  • 19. Guanidinio (Arg) Indol (Trp) Imidazol (His) Grupos reactivos de algunos aminoácidos
  • 20.
  • 21. No esenciales:a.a que el organismo puede sintetizarPara la especie humana son esenciales los aminoácidos: treonina, metionina, lisina, valina, triptófano, leucina, isoleucina y fenilalanina, arginina e histidina que se concidera esencial durante el crecimiento, pero no para el adulto.
  • 24.
  • 25.
  • 26. A que equivale el pK? Cuantos valores de pK tienen los aminoácidos?
  • 27. Punto isoeléctrico pH en el cual la carga neta (suma de las cargas de los grupos ionizables) del aminoácido es 0
  • 29.
  • 30.
  • 31.
  • 33. Péptidos Se conocen como péptidos a los compuestos que se originan de la unión de a.a mediante enlaces peptídicos. El enlace peptídico es un enlace covalente y coplanar que se establece entre el grupo carboxilo (-COOH) de un aminoácido y el grupo amino (-NH2) del amino-ácido contiguo inmediato, con desprendimiento de una molécula de agua.
  • 35. Disposición espacial del péptido El carácter parcial de doble enlace del enlace peptídico (-C-N-) determina la disposición espacial de éste en un mismo plano, con distancias y ángulos fijos. Presenta cierta rigidez e inmovilización en el plano de los átomos que lo forman.
  • 37. Figure 3-3a Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
  • 38. Clasificación de péptidos Oligopéptido < 10 aaPolipéptido 10-100 aaProteína > 100 aa
  • 40. Cada polipéptido se escribe de izquierda a derecha, empezando por el extremo N-terminal que posee un grupo amino libre y finalizando por el extremo C-terminal en el que se encuentra un grupo carboxilo libre.
  • 41. PROTEÍNAS Son polímeros formados por monómeros llamados aminoácidos. Hay 20 aminoácidos en la naturaleza, que se combinan para formar miles de proteínas. Son sustancias de elevado peso molecular. Se encuentran formando parte de todas las células animales y vegetales.
  • 42. Cada proteína tiene una estructura funcional lógica y propia. Características comunes a las demás proteínas. Son las macromoléculas más versátiles de los seres vivos.
  • 43. Clasificación de las proteínas Según su conformación Según su composición química Según su función
  • 44.
  • 45. Las histonas que forman parte de los cromosomas
  • 46. El colágeno, del tejido conjuntivo fibroso.
  • 47. La elastina, del tejido conjuntivo elástico.
  • 48.
  • 53. Ovoalbúmina, de la clara de huevo
  • 54. Lactoalbúmina, de la lecheEstructural Enzimática Hormonal Defensiva Transporte Reserva Funciones de proteínas
  • 55. Según su composición química Simples u homoproteínas Hidrólisis genera solamente aminoácidos. Insulina, colágeno (globulares y fibrosas) Conjugadas o heteroproteínas Hidrólisis genera aminoácidos y otras moléculas no protéicas, (grupos prostéticos)
  • 56. Conjugadas holoproteína = Apoproteína + grupo prostético Apoproteína: parte proteica Glico-, lipo-, nucleo, metalo y fosfo proteínas
  • 58. Según su conformación Fibrosas Globulares
  • 59. Fibrosas Estructurales y de sostén Cadenas polipeptídicas ordenadas paralelas a lo largo de un eje Insolubles en agua Colágeno, queratina, elastina
  • 60.
  • 61. Globulares Funcionales Cadenas plegadas, adoptan formas esféricas o globulares Solubles en agua (residuos hidrófobos en su interior) Responsables del trabajo químico de la célula: síntesis, transporte, metabolismo
  • 62. Enzimática Hormonal Reconocimiento de señales Transporte Defensa Reserva Transducción de señales
  • 63. Estructura de las Proteínas Estructura Primaria Determinada por el orden de colocación de los a.a de la cadena peptídica. Secuencia de a.a, clase, número de a.a Aminoácidos que componen la cadena polipeptídica La función de una proteína depende de su secuencia y de la forma que ésta adopte. Cada proteína tiene una única secuencia.
  • 64.
  • 65.
  • 66.
  • 67. alfa-hélice Se forma al enrollarse helicoidalmente sobre sí misma la estructura primaria. hélice o estructura geométrica en espiral En la que cada vuelta está constituida por 3,6 aminoácidos Dentro de este grupo se pueden mencionar proteínas como el colágeno, la queratina, elastína
  • 68.
  • 69.
  • 70. Beta planar o hoja ß plegada En esta disposición se forma una cadena en forma de zig-zag llamada disposición en lámina plegada. Forma aplanada y extendida le da flexibilidad más no elasticidad Consta de varias cadenas peptídicas que permanecen enfrentadas y se mantienen juntas con enlaces de hidrógeno en un arreglo a manera de zig-zag.
  • 71. hoja ß plegada paralela
  • 72.
  • 73. hoja ß plegada antiparalela
  • 74.
  • 75.
  • 76. Estructura Terciaria La disposición o conformación que toma la cadena peptídica producto de los dobleces condicionados por la interacción de las cadenas de los a.a ( radicales R de los a.a). Conformación globular y tridimensional. La conf. globular facilita la solubilidad en agua y así realizar funciones de transporte, enzimáticas, hormonales, etc. Se mantiene estable por los enlaces entre los radicales R de los a.a. .
  • 77. Aparecen varios tipos de enlaces: Puentes de disulfuro: dos residuos de cisteína (unión covalente) puentes de hidrógeno:grupos hidroxilos alcohólicos y fenólicos o de los radicales R de a.a hidroxilos alcohólicos y grupos carboxilos Enlace iónico o salino: grupo amino y carboxilo del R de los a.a Interacciones hifrófobas: Radicales apolares de los a.a
  • 78. Los grupos apolares se reúnen en forma compacta logrando una conformación de mayor estabilididad y de menor energía Tiene muy pocos espacios libres en su interior Sobre la superficie de las proteínas abundan los grupos polares Describe la conformación definitiva y específica de la proteína.
  • 79. Glutámico Valina Lisina Valina Alanina Figure 3-4 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
  • 81. Estructura Cuaternaria Se establece por la unión, mediante enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas peptídicas con estructura terciaria, para formar un complejo proteico. Cada una de estas cadenas peptídicas recibe el nombre deprotómero. La unidad formada por varios protómeros se denominaoligómero Solamente la unidad es activa biológicamente
  • 82. El número de protómeros varía: dos: hexoquinasa cuatro: hemoglobina cuatro: Aldolasa seis: Glutamato deshidrogenas 60 unidades proteicas como la cápsula del virus de la poliomielitis
  • 83.
  • 84.
  • 85.
  • 86.
  • 87.
  • 88. Desnaturalización Modificación de la conformación o nativa de una proteína por acción de agentes externos Pérdida de la estructura secundaria, terciaria y cuaternaria por ruptura de enlaces que forman dichas estructuras. El nivel primario no se afecta por ser un enlace covalente
  • 89. La desnaturalización lleva a: perdida de la estructura perdida de la actividad biológica modificación de las propiedades físicas y químicas
  • 90.
  • 91. Biosíntesis de Aminoácidos y Proteínas La mayoría de los aminoácidos que ingerimos se encuentran en forma de proteínas, sin embargo sólo los aminoácidos pueden incorporarse a las diferentes rutas metabólicas. Las proteínas y péptidos ingeridos sufren un proceso de hidrolización por medio de enzimas proteolíticas (secretadas por el estómago, páncreas e intestino delgado) en el tracto gastrointestinal.
  • 92. Después de la acción de las enzimas los aminoácidos quedan libres, proceso de digestión de las proteínas. Son absorbidos por las paredes del intestino, conducidos y transportados a la corriente sanguínea, llegan al hígado (sistema porta-hepático) donde ocurre su metabolismo y distribución a las células para su posterior utilización.
  • 94.
  • 95. Alteraciones intelectuales en niños
  • 96. Problemas de desarrollo en fetos
  • 97.
  • 98. Enfermedad de Parkinson
  • 99.
  • 100. Disminución en la Energía de activación
  • 101.
  • 102.
  • 103. Figure 3-46 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
  • 104. Estado de transicion Estado de transicion Energía de Activación Energía de Activación Energia Sustrato Producto G - G + Producto Sustrato Reacción exergonica Reacción endergonica Energia Progreso de la reacción Progreso de la reacción G<0: reacción favorable G>0: reacción no favorable
  • 105.
  • 106. Figure 3-50a Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
  • 107.
  • 108. Sitio activo Figure 3-50b Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
  • 109. Efecto del pH sobre la actividad enzimática pH extremos: desnaturalización o inactivación de la enzima
  • 110. Efecto de la temperatura sobre la actividad enzimática Aumento de Temperatura induce aumento de Vm T>45°C: desnaturalización
  • 111. Constante de Michaelis-Menten Vo depende de la concentración de sustrato ([S]) [E] es constante
  • 112. Vm (velocidad máxima): velocidad en la cual los sitios activos están saturados. Velocidad ya no depende de [S] Km (constante de michaelis): concentración de sustrato a la cual la reacción se efectúa a la mitad de su velocidad máxima A menor Km, mayor afinidad de la enzima por el sustrato
  • 114.
  • 115. Actúan: - Evitando formación del complejo ES - Bloqueando la reacción de formación de producto
  • 116.
  • 117. I y S se unen al mismo sitio
  • 118.
  • 119.
  • 120.
  • 121.
  • 122.
  • 123. Clasificación de las enzimas De acuerdo a la clase general de reacción orgánica que es catalizada 1.Oxidoreductasas 2.Transferasas 3.Hidrolasa 4.Liasas 5.Isomerasas 6.Ligasas
  • 124. 1. Oxidoreductasas Catalizan reacciones de oxidación-reducción Oxidasas, deshidrogenasas, oxigenasas, peroxidasas
  • 125. 2. Transferasas Catalizan reacciones de transferencia de un grupo. Pueden necesitar la presencia de co-enzimas. Amino transferasas, quinasas, fosforilasas
  • 126. 3. Hidrolasas Catalizan reacciones de hidrólisis Fosfatasas, fosfodiestearasas, peptidasas
  • 127. 4. Liasas(sintasas) Catalizan lisis de un sustrato. Adición de un sustrato a un doble enlace se un segundo sustrato Decarboxilasas, aldolasas
  • 128. 5. Isomerasas Catalizan cambios estructurales dentro de una misma molécula Mutasas
  • 129. 6.Ligasaso (sintetasas) Catalizan unión de dos sustratos. Necesitan ATP Carboxilasas, sintetasas
  • 130. Especificidad Cada una lleva a cabo una determinada función porque posee una determinada estructura primaria y una conformación espacial propia. No todas las proteínas son iguales en todos los organismos, se pone de manifiesto en el rechazo de órganos transplantados. La semejanza entre proteínas son un grado de parentesco
  • 131. 1. Especificidad sobre el Sustrato que actúa 2. Especificidad sobre la acción que realiza 1. Especificidad sobre el sustrato: a.Absoluta b. Relativa a. Absoluta: la enzima actúa sobre uno y solo un sustrato b. Relativa: Actúa sobre un grupo de sustratos con estructuras similares Aminoácido oxidasa, produce la desaminación de varios a.a.
  • 132. 2. Especificidad sobre La acción: Capacidad que tiene la enzima de catalizar una y solo una de las posibles transformaciones que tiene el sustrato.